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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-05-29 |
Recurrence in the chemotherapy regimen of bladder carcinoma originates from quiescent epidermoid-like cells
2026-May-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73632-w
PMID:42203766
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研究论文 | 通过整合高分辨率CRISPR/Cas9进化谱系追踪与单细胞RNA测序,研究膀胱癌在化疗下的演化及复发机制 | 首次识别出类表皮样细胞状态群体作为化疗后复发的起源,并揭示其可塑性和进化动态 | 未提及局限性 | 解析膀胱癌在化疗过程中自然进展和复发的关键事件与进化动力学 | 膀胱癌小鼠模型的肿瘤细胞 | 机器学习 | 膀胱癌 | CRISPR/Cas9谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 42 | 2026-05-29 |
Molecular signatures and lineage diversification of neurogenic and gliogenic radial glia in the gyrencephalic ferret cortex
2026-May-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10366-x
PMID:42203905
|
研究论文 | 利用回皮层模型系统解析神经发生和胶质发生的放射状胶质细胞的分子特征与谱系分化 | 首次在回脑化雪貂皮层中发现ERK和PKA信号协同促进外放射状胶质细胞自我更新和神经发生,并鉴定YAP/TAZ和SHH信号对胶质发生区域特化的调控作用 | 未提供 | 阐明回脑化皮层中放射状胶质细胞的分子特征及其在神经发生和胶质发生中的谱系动态调控机制 | 雪貂和人类皮层放射状胶质细胞 | 机器学习 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 单细胞转录组数据 | 未提供样本量 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 43 | 2026-05-29 |
Scoring gene importance by interpreting single-cell foundation models
2026-May-27, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03112-5
PMID:42204361
|
研究论文 | 提出SIGnature框架,通过解释单细胞基础模型来评估基因功能重要性 | 首次利用单细胞RNA测序基础模型的归因评分来量化基因重要性,降低技术噪音、强调调控基因并实现跨数据集比较 | 未明确提及局限性 | 开发一种通过解释单细胞基础模型来评分基因重要性的方法,并展示其在跨疾病分析中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的基因及其功能重要性 | 机器学习 | COVID-19, 脓毒症, 川崎病 | 单细胞RNA测序 | 基础模型(foundation model) | 单细胞转录组数据 | 来自400项研究的单细胞RNA测序图谱数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2026-05-29 |
Microglial state transitions dominate the brain immune response in the subacute phase after cardiac arrest
2026-May-27, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03874-4
PMID:42204534
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示心脏骤停后亚急性期大脑免疫反应中小胶质细胞状态的转变 | 首次描绘了心脏骤停后年轻和老年大脑在第三天的免疫景观,发现了五类心脏骤停相关小胶质细胞状态,并揭示了SPP1阳性小胶质细胞的时空动态特征 | 未提及具体局限 | 探究心脏骤停后大脑免疫反应中不同免疫细胞群体的贡献 | 心脏骤停后小鼠大脑免疫细胞 | 单细胞组学 | 心脏骤停相关脑损伤 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年小鼠(未具体说明数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-05-29 |
Thyroid-stimulating hormone receptor mediates peripheral-central neuroimmune crosstalk in autoimmune thyroid diseases
2026-May-27, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04957-y
PMID:42204533
|
研究论文 | 通过多组学整合分析揭示促甲状腺激素受体在自身免疫性甲状腺疾病中介导外周-中枢神经免疫串扰的分子机制 | 首次从多组学层面系统证明TSHR作为分子枢纽连接外周与中枢神经免疫串扰,并鉴定出三种潜在的再利用化合物 | 样本量有限,缺乏纵向随访和体内验证,结果需谨慎解释并进一步研究 | 阐明促甲状腺激素受体如何连接外周自身免疫与中枢神经系统特征 | Graves病、Graves眼病患者及小鼠模型 | 自然语言处理 | 甲状腺疾病 | GWAS, RNA-seq, 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 脑影像数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-05-29 |
MicroRNA-7: a versatile player and core target in brain disorders
2026-May-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08313-9
PMID:42204625
|
review | 系统综述了MicroRNA-7在神经系统疾病中的生物特性、调控机制及作用 | 综合分析了miR-7在脑疾病中的多面性作用及临床转化潜力 | 机制复杂性、递送系统靶向性不足以及缺乏临床转化标准 | 探讨MicroRNA-7在脑疾病中的调控机制和临床转化潜力 | MicroRNA-7(miR-7)及其在脑疾病中的作用 | machine learning | 帕金森病、阿尔茨海默病、缺血性卒中、脑出血、胶质母细胞瘤 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 47 | 2026-05-29 |
Integrative single-cell and bulk analyses reveal ATF4-associated immune suppression and WNT/β-catenin signaling in osteosarcoma
2026-May-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00797-1
PMID:42204636
|
研究论文 | 整合单细胞和批量分析揭示骨肉瘤中ATF4相关的免疫抑制和WNT/β-catenin信号通路 | 首次通过整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据,系统揭示ATF4在骨肉瘤中连接应激相关肿瘤程序、免疫抑制和WNT/β-catenin激活的关键作用,并构建了ATF/CREB相关风险评分(ACS)用于预后分层 | 主要依赖公开数据集进行生物信息学分析,缺乏大规模前瞻性临床验证;ATF4在骨肉瘤中的具体分子机制和调控网络仍需进一步实验验证 | 探究ATF/CREB应激反应网络(特别是ATF4)在骨肉瘤免疫抑制微环境和预后的作用机制 | 骨肉瘤(OS)肿瘤样本的单细胞RNA-seq和批量转录组数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子动力学模拟 | NA | 单细胞基因表达数据, 批量转录组数据 | 多个公共数据集,包括TARGET和GEO队列,具体样本量未详细列出 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-05-29 |
A human corticospinal organoid-slice connectoid model informs enhancer strategies for post-injury axon regrowth
2026-May-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117399
PMID:42201810
|
研究论文 | 开发了一种人类皮质脊髓类器官-切片连接体平台,用于研究轴突再生策略 | 首次构建三维人类皮质脊髓运动类器官-切片连接体平台,模拟了发育性轴突延长程序及其在成熟过程中的限制,并结合单细胞转录组学和药物筛选发现可逆转轴突生长下降的化合物 | 未提及具体限制 | 研究哺乳动物中枢神经系统发育过程中轴突生长停止的时机和机制,并寻找促进损伤后轴突再生的策略 | 人类皮质脊髓运动类器官-切片连接体中的皮质投射神经元 | 机器学习和数字病理学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞转录组学, 活体成像 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2026-05-29 |
Syrosingopine enhances immune checkpoint blockade efficacy by inhibition of MCTs and metabolic reprogramming in triple-negative breast cancer
2026-May-26, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168308
PMID:42202910
|
研究论文 | 研究西罗辛平通过抑制MCTs和代谢重编程增强三阴性乳腺癌免疫检查点阻断疗效 | 首次证明双MCT1/MCT4抑制剂西罗辛平可通过阻断乳酸输出重新编程肿瘤微环境,增强抗肿瘤免疫,与抗PD-1协同抑制三阴性乳腺癌生长 | 基于模型和细胞系研究,临床验证尚需进一步开展 | 探索MCT抑制作为三阴性乳腺癌免疫治疗增敏策略的潜力 | 三阴性乳腺癌肿瘤细胞、CD8 T细胞、NK细胞、免疫活性小鼠模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 批量转录组学、单细胞转录组学、组织分析 | NA | 转录组数据、组织切片数据 | 多个三阴性乳腺癌模型和免疫活性小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2026-05-29 |
Plasma-Derived Exosomes from Graves' Orbitopathy: Pathogenic Entities Causing Tissue Lesions
2026-May-26, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.111088
PMID:42203012
|
研究论文 | 研究血浆衍生的外泌体在Graves眼眶病(GO)中通过miRNA递送驱动组织损伤的致病机制,并建立了实验性GO模型 | 首次表明循环外泌体是GO的新型致病驱动因子,能通过miR-221-5p/CACNG4/AMPK通路重编程眼眶成纤维细胞,且稳定期GO患者外泌体仍具有致病活性 | 未明确提及局限性 | 探究血浆外泌体在Graves眼眶病发病中的直接作用及其从系统性到局部疾病进展的机制 | Graves眼眶病患者和健康对照的血浆外泌体,以及原代人眼眶成纤维细胞和BALB/c小鼠 | 数字病理学 | Graves眼眶病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GO患者和健康对照的血浆样本,BALB/c小鼠(每周静脉注射外泌体,持续150天) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 用于分析外泌体介导的细胞重编程及免疫浸润 |
| 51 | 2026-05-29 |
Predicting neoadjuvant breast cancer therapy response using BRIDGE from tumor transcriptomics and histopathology
2026-May-26, Annals of oncology : official journal of the European Society for Medical Oncology
IF:56.7Q1
DOI:10.1016/j.annonc.2026.05.700
PMID:42203036
|
研究论文 | 开发BRIDGE框架,利用肿瘤转录组学和组织病理学预测乳腺癌新辅助治疗反应 | 首次整合转录组去卷积与组织病理学深度学习,实现低成本快速预测新辅助治疗病理完全缓解,并优于现有商业标志物 | 需在前瞻性队列中进一步验证,特别是免疫检查点抑制剂治疗场景的泛化性 | 利用预处理肿瘤转录组和组织病理学图像预测乳腺癌新辅助治疗反应 | 乳腺癌患者肿瘤样本的转录组数据和组织病理学H&E染色切片 | 数字病理学, 机器学习 | 乳腺癌 | RNA测序, 空间转录组学, 深度学习 | CNN | 转录组数据, 组织病理学图像 | 训练集10个转录组数据集,测试集24个数据集,6个含组织切片数据的独立数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2026-05-29 |
Characterization of natural killer (NK) cells in lung adenocarcinoma and construction of an NK risk signature based on single-cell and macromolecular RNA-seg data
2026-May-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04552-w
PMID:42184019
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研究论文 | 基于单细胞和大分子RNA测序数据,研究肺腺癌中自然杀伤细胞的特性并构建其风险特征 | 首次利用单细胞RNA测序数据识别肺腺癌中NK细胞亚群,并建立基于NK细胞相关基因的风险特征用于预后预测 | 该研究主要基于公共数据库的数据,尚未在独立外部队列中进行验证 | 分析肺腺癌中NK细胞特征并建立基于NK细胞的风险特征以预测患者预后 | 肺腺癌患者的NK细胞及其基因表达数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 微阵列 | Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-05-29 |
Targeting VEGF signaling and stromal remodeling enhances chemoimmunotherapy efficacy in esophageal cancer
2026-May-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014249
PMID:42173653
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、免疫组库分析和空间转录组学,揭示了靶向VEGF信号和基质重塑可增强食管癌化学免疫治疗疗效,并识别出关键的基质细胞亚群 | 首次通过多组学整合分析揭示化疗免疫治疗后食管鳞癌肿瘤微环境中基质细胞(如ACKR1+内皮细胞和CFD+癌症相关成纤维细胞)的动态变化及其与治疗反应的关系,并发现VGFA信号驱动RGCC+内皮细胞和MMP11+癌症相关成纤维细胞协同形成免疫抑制微环境 | 样本量较小(9例患者),主要依赖计算分析结果,功能验证仍需进一步扩展 | 阐明新辅助化学免疫疗法在食管鳞癌中疗效的微环境驱动机制,为优化治疗方案提供理论基础 | 食管鳞癌患者肿瘤组织样本 | 机器学习和数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、免疫组库分析、空间转录组学 | 集成聚类、基因集富集分析、T细胞受体库表征、拷贝数估计、细胞间通讯推断 | 单细胞转录组数据、免疫组库数据、空间转录组数据 | 9例食管鳞癌患者,共18个样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学 |
| 54 | 2026-05-29 |
Defining Clock Neurons Within Distributed Circadian Circuits Through Multiscale Technologies
2026-May-22, Journal of biological rhythms
IF:2.9Q2
DOI:10.1177/07487304261448254
PMID:42175567
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综述 | 通过整合多尺度技术,重新定义哺乳动物大脑中分布在多个脑区的昼夜节律时钟神经元 | 提出一个操作性框架,包含分子振荡、自主性、生理节律性和回路影响四个标准来识别时钟神经元,挑战传统的主时钟-外周模型 | 未提供具体实验数据验证框架,主要基于已有文献的综合分析 | 明确昼夜节律时钟神经元的定义,并绘制大脑中分布的昼夜节律回路 | 哺乳动物大脑中具有内在昼夜节律特性的神经元 | 神经科学 | 神经系统疾病、神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、回路追踪、神经元操控 | NA | 分子数据、细胞数据、系统生物学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2026-05-29 |
Aberrant p53 fuels macrophage immunoregulatory polarization and refractory clinical outcome in urothelial carcinoma
2026-May-20, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014408
PMID:42161402
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研究论文 | 研究异常p53状态如何驱动尿路上皮癌中肿瘤相关巨噬细胞的免疫调节极化和不良临床结局 | 首次整合单细胞RNA测序、免疫组化和流式细胞术,系统描绘p53突变与异常表达对巨噬细胞表型异质性和代谢重编程的影响,并揭示SPP1-CD44轴介导的协同免疫抑制网络 | 未提及具体不足之处 | 阐明异常p53状态(含TP53突变和p53异常表达)与肿瘤相关巨噬细胞表型和功能异质性之间的关联及其对免疫微环境的影响 | 尿路上皮癌患者肿瘤组织中的肿瘤相关巨噬细胞和CD4+ T细胞 | 机器学习 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、免疫组化图像、流式细胞术数据 | 962例尿路上皮癌患者的多队列数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 56 | 2026-05-29 |
The rituximab paradox in rheumatoid arthritis: Re-evaluating B-cell depletion depth and the synovial microenvironment
2026-May-19, Autoimmunity reviews
IF:9.2Q1
DOI:10.1016/j.autrev.2026.104089
PMID:42162633
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研究论文 | 重新评估类风湿关节炎中B细胞耗竭深度与滑膜微环境的关系,提出不完全耗竭策略 | 揭示类风湿关节炎无需完全系统性B细胞耗竭,不完全耗竭可保留组织驻留免疫的安全边际,降低感染风险 | 未详细讨论不完全耗竭对长期疗效和耐药性的影响,以及在不同RA亚型中的适用性 | 优化类风湿关节炎的B细胞靶向治疗策略,平衡疗效与感染风险 | 类风湿关节炎患者及滑膜微环境中的致病免疫相互作用(如ABC-FLS互动) | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | REDO试验的纵向数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-05-29 |
Smart Microneedles Regulate Reactive Oxygen Species and Deliver Matrix Metalloproteinases for Pathological Scar Treatment
2026-May-18, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c00171
PMID:42148523
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研究论文 | 本文开发了一种智能微针,能够调控活性氧并递送基质金属蛋白酶,用于病理性疤痕治疗 | 首次建立了结合病理信号解码与靶向干预的闭环治疗策略,将单细胞测序揭示的病理机制(氧化应激和胶原沉积)直接转化为微针材料设计 | 仅基于兔和猪动物模型验证,缺乏人体临床试验数据,且微针的长期降解和安全性有待进一步评估 | 开发一种调控氧化微环境并重塑细胞外基质的智能微针,用于治疗病理性疤痕 | 病理性疤痕组织(包括正常皮肤和瘢痕疙瘩样本) | 数字病理学 | 皮肤病(病理性疤痕) | 单细胞测序、组织学染色 | NA | 图像(组织学染色)、测序数据(单细胞) | 人类患者样本(具体数量未说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 58 | 2026-05-29 |
Identification of metabolism-associated molecular classification and prognostic genes for medulloblastoma based on bioinformatics analysis
2026-May-18, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2026.101003
PMID:42150480
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定与代谢相关的髓母细胞瘤分子分型和预后基因 | 基于代谢特征对髓母细胞瘤进行分子分型,补充了现有亚型分类的代谢视角,并建立了17基因代谢相关预后预测模型 | 17基因特征需要额外的多中心验证以确认其临床实用性 | 探究代谢相关基因在髓母细胞瘤病理生理机制中的作用,并建立代谢相关的分子分型和预后预测模型 | 髓母细胞瘤样本 | 机器学习 | 髓母细胞瘤 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解聚类 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、RNA测序数据 | 599个髓母细胞瘤样本(训练集400个,测试集199个),74个验证样本,8个单细胞RNA测序样本,37个RNA测序样本 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2026-05-29 |
SLC39A13 Defines Myofibroblastic Activation and Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-May-18, Current oncology (Toronto, Ont.)
DOI:10.3390/curroncol33050292
PMID:42187609
|
研究论文 | 探究锌转运蛋白SLC39A13在头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中调控肌成纤维细胞活化及免疫抑制的作用 | 首次揭示锌转运蛋白SLC39A13在头颈鳞癌肿瘤相关成纤维细胞中特异性高表达,并系统阐明其通过TGFβ信号促进基质重构及免疫逃逸的分子机制 | 主要基于公开单细胞转录组数据及体外原代成纤维细胞培养验证,缺乏体内动物模型功能验证及跨癌种比较分析 | 阐明锌转运蛋白在头颈鳞癌肿瘤微环境中成纤维细胞活化及免疫调控中的功能与临床意义 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本及成纤维细胞 | 生物信息学, 癌症生物学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 转录组分析, 生存分析 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据, 临床转录组与生存数据 | 大样本患者队列(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-05-29 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Early Transcriptional Heterogeneity of Cardiac-Associated Cell Populations During Zebrafish Embryogenesis
2026-May-15, Biology
DOI:10.3390/biology15100791
PMID:42187752
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示斑马鱼胚胎发生过程中心脏相关细胞群的早期转录异质性 | 首次在单细胞水平上描绘了斑马鱼早期心脏谱系特化的转录动态和时序层次,证明了心脏祖细胞的转录异质性及其通过持续调控过程获得心脏命运 | 未提及具体局限性 | 探索斑马鱼胚胎早期心脏谱系特化的单细胞转录动力学 | 斑马鱼胚胎在受精后4小时和6小时的心脏祖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类、子聚类、轨迹推断 | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎在4 hpf和6 hpf的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |