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当前共找到 32055 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-02 |
From pixels to cell types: a comprehensive review of computational methods for spatial transcriptomics deconvolution
2025-Oct-31, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00055-2
PMID:41174717
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综述 | 对空间转录组学反卷积计算方法进行全面分析，涵盖20种算法的技术原理和应用特点 | 首次系统对比分析20种空间转录组反卷积算法的方法学基础和技术框架 | NA | 为研究人员提供空间转录组反卷积计算方法的全面理解和技术指导 | 空间转录组反卷积计算方法 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 42 | 2025-11-02 |
An integrative analysis of transcriptome, methylome and single-cell RNA sequencing data identifies UBE2H as a marker of oxaliplatin resistance in colorectal cancer
2025-Oct-31, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03996-4
PMID:41174727
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研究论文 | 通过整合转录组、甲基化组和单细胞RNA测序数据，识别出UBE2H作为结直肠癌奥沙利铂耐药性的生物标志物 | 首次整合多组学数据和单细胞RNA测序，系统揭示UBE2H在奥沙利铂耐药中的作用机制及其与免疫微环境的关联 | 研究主要基于细胞系和公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 寻找结直肠癌奥沙利铂耐药性的预测生物标志物 | 结直肠癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组测序,DNA甲基化测序,单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型,差异分析 | 基因表达数据,甲基化数据,单细胞数据 | TCGA数据集和五个GEO数据集中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-11-02 |
Clonally expanded effector CD4+ cytotoxic T lymphocytes are associated with severe neurological adverse events after immune checkpoint inhibitor therapy
2025-Oct-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012350
PMID:41167637
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组学分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗后严重神经系统不良事件与克隆扩增的CD4+细胞毒性T淋巴细胞的相关性 | 首次在单细胞水平上鉴定出与神经毒性相关的克隆扩增CD4+细胞毒性T淋巴细胞及其特异性效应基因表达谱 | 样本量较小（17例患者），且仅分析了外周血细胞而未直接研究中枢神经系统 | 探究免疫检查点抑制剂诱导的神经系统不良事件的免疫学机制和风险因素 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者，包括8例急性神经毒性患者 | 单细胞基因组学 | 癌症治疗相关神经系统不良事件 | 单细胞RNA测序，T细胞受体谱分析 | 拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 17例癌症患者（8例神经毒性，9例对照），共186,435个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-11-02 |
In vivo differentiation of embryonic cells devoid of key reprogramming factors
2025-Oct-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116498
PMID:41171758
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼胚胎中NPS突变细胞的命运，揭示关键重编程因子在发育重编程和分化中的作用 | 首次在野生型胚胎环境中分析NPS突变细胞的单细胞转录组，发现细胞可绕过短暂全能性获得中间发育状态 | 研究仅限于斑马鱼模型，需要在其他物种中验证普适性 | 探究NPS因子在发育重编程和细胞分化中的功能 | 斑马鱼胚胎中的NPS突变细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-11-02 |
Single-Cell and Machine Learning Analysis Reveal Novel Inflammatory Macrophage Subtypes and Biomarkers in Periodontitis
2025-Oct-30, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103983
PMID:41172679
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习分析牙周炎中新型炎症巨噬细胞亚型及其生物标志物 | 首次发现牙周炎相关的巨噬细胞新亚型，并构建了具有诊断价值的基因特征 | 研究样本量有限，主要基于体外实验验证 | 识别牙周炎相关巨噬细胞亚群并探索其诊断和预后意义 | 牙周炎患者和健康对照者的牙龈组织 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 牙周炎患者和健康对照者的牙龈组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-11-02 |
A Glycerophospholipid Metabolism-Based Prognostic Model Guides Osteosarcoma Therapy
2025-Oct-30, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102572
PMID:41172875
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研究论文 | 本研究基于甘油磷脂代谢构建了一个预后模型，用于指导骨肉瘤的治疗策略 | 首次将甘油磷脂代谢与骨肉瘤预后和免疫治疗反应相关联，开发了优于42个已发表特征的预后模型 | 样本量相对有限，需要进一步验证 | 探索甘油磷脂代谢在骨肉瘤进展、免疫和治疗中的作用 | 骨肉瘤患者和细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | Lasso-Cox模型 | 基因表达数据 | TARGET队列85例，GEO队列124例，单细胞RNA-seq数据6个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-11-02 |
Characterizing hypoxia-orchestrated post-stroke changes in oligodendrocyte precursor cells for optimized cell therapy
2025-Oct-30, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102687
PMID:41173004
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研究论文 | 本研究通过整合小鼠单细胞RNA测序数据与体外实验，揭示了缺血性脑卒中后少突胶质前体细胞在不同缺氧程度下的动态适应性变化 | 首次发现'氧张力'是调控OPC在脑卒中后动态适应的关键因素，并识别出两种新型OPC亚群：急性期的'血管生成型OPC'和慢性期的'少突胶质生成型OPC' | 研究主要基于小鼠模型，人类临床适用性需进一步验证 | 探索缺血性脑卒中后少突胶质前体细胞的功能适应性及其在细胞治疗中的优化策略 | 少突胶质前体细胞(OPCs)和小鼠脑卒中模型 | 单细胞生物学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, 细胞培养, 细胞移植 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-11-02 |
Cell-cell fusion and immunostimulatory cytokines significantly impact oncolytic vaccinia virus immunotherapeutic potential
2025-Oct-30, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.055
PMID:41174883
|
研究论文 | 本研究开发了一种携带IL-12和CCL21两种免疫刺激细胞因子的融合性溶瘤痘苗病毒，显著增强了对远端肿瘤的免疫治疗效果 | 首次将细胞融合特性与双细胞因子（IL-12和CCL21）武装相结合，通过单细胞转录组分析揭示了该疗法如何系统性地激活肿瘤免疫微环境 | 研究基于小鼠双侧肿瘤模型，临床转化效果需进一步验证；未详细探讨长期安全性和潜在毒副作用 | 提高溶瘤病毒对远端转移肿瘤的免疫治疗效果，克服病毒疗法在转移性肿瘤中的耐药性 | 小鼠双侧肿瘤模型、肿瘤免疫微环境、CD8 T细胞亚群 | 免疫治疗 | 转移性肿瘤 | 单细胞转录组分析、病毒工程改造、免疫细胞分析 | NA | 基因表达数据、免疫细胞表型数据 | 小鼠双侧肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-11-02 |
FLT3LG as an inflammatory hub bridging tumor immune surveillance to therapy response in breast cancer
2025-Oct-29, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01889-4
PMID:41152656
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现FLT3LG作为炎症枢纽在乳腺癌免疫监视和治疗反应中发挥关键保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序和炎症基因网络分析鉴定FLT3LG为乳腺癌的关键保护因子，并揭示其与不同突变谱和免疫治疗反应的关联 | NA | 探索乳腺癌中炎症驱动的免疫失调机制并寻找新的预后标志物和治疗靶点 | 乳腺癌患者队列和肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因网络分析, 功能分析, 遗传谱分析 | NA | 基因表达数据, 突变数据, 临床数据 | 多个患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-11-02 |
A spatial transcriptomics dataset of the endometrium from repeated implantation failure patients
2025-Oct-29, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05995-6
PMID:41162434
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术分析了正常个体和反复种植失败患者子宫内膜的组织特征 | 首次构建了正常和反复种植失败条件下子宫内膜组织的空间转录组图谱 | 样本量较小（8个组织样本），仅包含4名正常个体和4名RIF患者 | 深入理解反复种植失败患者子宫内膜的组织背景特征 | 人类子宫内膜组织 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 8个子宫内膜组织（4名正常个体和4名RIF患者） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium平台 |
| 51 | 2025-11-02 |
Implication of an exosome-based gene signature for estimating clinical outcomes of triple-negative breast cancer and assisting in individualized therapy
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-16751-6
PMID:41162433
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于外泌体基因特征的模型，用于评估三阴性乳腺癌的临床预后并指导个体化治疗 | 首次构建基于外泌体相关基因的预后特征模型，并发现FAM129B作为潜在治疗靶点 | 研究样本量未明确说明，需要进一步临床验证 | 开发三阴性乳腺癌预后预测模型并探索个体化治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者和MDA-MB-231、MDA-MB-468细胞系 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | LASSO分析、单细胞转录组学、基因突变分析、EdU检测、伤口愈合实验 | 基于外泌体基因特征的预后模型 | 转录组数据、基因突变数据、细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、批量转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2025-11-02 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomics identify RELB, S100A9, and SOCS1 as key autophagy-endoplasmic reticulum stress genes linking T2DM with MAFLD
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21641-y
PMID:41162503
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研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞转录组分析，鉴定出RELB、S100A9和SOCS1作为连接2型糖尿病与代谢相关脂肪肝病的关键自噬-内质网应激基因 | 首次整合批量转录组和单细胞转录组分析，结合机器学习方法鉴定出连接T2DM与MAFLD的关键基因，并通过动物实验验证 | 研究主要基于生物信息学分析，动物模型验证仍需进一步临床研究确认 | 揭示2型糖尿病与代谢相关脂肪肝病共同的分子机制 | 2型糖尿病和代谢相关脂肪肝病患者数据及大鼠模型 | 生物信息学 | 2型糖尿病, 代谢相关脂肪肝病 | 批量转录组测序, 单细胞转录组测序, qRT-PCR, 免疫组化 | 机器学习, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 四个GEO数据集 + 大鼠模型 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-11-02 |
The role of miR-21 in early-stage lung adenocarcinoma: clinical and bioinformatics insights
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21742-8
PMID:41162544
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研究论文 | 本研究探讨miR-21在早期肺腺癌中的作用，通过临床样本和生物信息学分析揭示其表达特征及分子机制 | 结合临床样本验证与多组学数据分析，系统阐明miR-21在肺腺癌中的调控网络和预后价值 | 样本量相对有限（50例患者），且主要依赖公共数据库的回顾性分析 | 识别肺腺癌发病机制中的关键miRNA和基因 | 早期肺腺癌患者和健康对照者的外周血样本及公共数据库数据 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 外泌体分离, 免疫组化, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | 50例早期肺腺癌患者和50例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-11-02 |
Targeting LAG3 to alter the tumor immune reactivity of CD8+T cells is a potential therapy for skin cutaneous melanoma
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22377-5
PMID:41162565
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析，揭示了CD8+T细胞在皮肤黑色素瘤中的功能异质性，并证明靶向LAG3可抑制肿瘤增殖和转移 | 首次通过整合scRNA-seq和Bulk RNA-seq分析将CD8+T细胞分为LAG3+和LAG3-亚群，并验证LAG3抑制剂在黑色素瘤治疗中的潜力 | 研究主要基于测序分析和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索CD8+T细胞在皮肤黑色素瘤免疫治疗中的作用机制和潜在治疗靶点 | 皮肤黑色素瘤( SKCM)中的CD8+T细胞亚群 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 细胞间通讯分析, 差异基因表达分析, 免疫浸润分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-11-02 |
A prognostic risk prediction model for gastric cancer based on the EFNA4 and ETS1 regulatory axis in tumor cells
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21728-6
PMID:41162582
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研究论文 | 基于EFNA4和ETS1调控轴构建胃癌预后风险预测模型 | 首次发现EFNA4在PI3K-Akt通路中的核心作用，并构建了基于EFNA4-ETS1轴的胃癌预后模型 | EFNA4高表达与良好预后的矛盾机制尚未阐明，需要进一步探索其与ETS1的拮抗作用 | 开发胃癌预后风险预测模型 | 胃癌肿瘤细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | 风险特征模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 373个TCGA-STAD数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-11-02 |
Translational framework linking perfluoroheptanoic acid (PFHpA) exposure to metabolic dysfunction associated steatotic liver disease in adolescents
2025-Oct-29, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-01168-z
PMID:41162609
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研究论文 | 本研究建立了一个连接全氟庚酸暴露与青少年代谢功能障碍相关脂肪性肝病的转化研究框架 | 首次整合人类队列数据和体外实验，揭示短链未受监管的全氟庚酸与青少年MASLD风险的关联 | 样本量相对有限(n=136)，且研究对象仅限于接受减肥手术的肥胖青少年 | 阐明全氟烷基物质对代谢功能障碍相关脂肪性肝病发展的影响 | 青少年肥胖患者(n=136，平均年龄16.8岁)和体外培养的人肝球体 | 生物医学研究 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学、LUCID模型 | LUCID模型 | 血浆样本、蛋白质组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 136名青少年肥胖患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2025-11-02 |
scGSDR: Harnessing gene semantics for single-cell pharmacological profiling
2025-Oct-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08788-0
PMID:41162674
|
研究论文 | 开发了一种整合基因语义学的单细胞药物反应预测模型scGSDR | 通过整合细胞状态和基因信号通路知识，结合基因语义学提升预测性能，并采用可解释性模块识别耐药表型相关通路 | NA | 提高单细胞水平药物反应预测的准确性，识别耐药相关通路和基因 | 单细胞药物反应数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2025-10-31 |
SpateCV: cross-modality alignment regularization of cell types improves spatial gene imputation for spatial transcriptomics
2025-Oct-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07245-0
PMID:41162996
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2025-11-02 |
Cross-expression meta-analysis of mouse brain slices reveals coordinated gene expression across spatially adjacent cells
2025-Oct-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03747-8
PMID:41163012
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为“交叉表达”的新方法，用于分析空间相邻细胞间的基因表达协调性 | 引入了“交叉表达”概念，避免使用人工注释数据库和细胞类型标签，同时控制细胞内在过程 | NA | 研究空间相邻细胞间基因表达的协调机制 | 小鼠脑切片中的空间相邻细胞 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组学, meta分析 | 交叉表达网络 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 约2500万个细胞, 695个切片, 52个大脑 | NA | 空间转录组学 | NA | 8种技术平台 |
| 60 | 2025-11-02 |
Systematic discovery of subcellular RNA patterns in the gut epithelium
2025-Oct-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03786-1
PMID:41163196
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研究论文 | 本研究通过APEX-seq和MERFISH技术系统绘制了肠道上皮细胞中亚细胞RNA定位图谱 | 首次系统发现肠道上皮中亚细胞RNA定位模式，揭示了转录本在顶端-基底轴上的不对称分布和颗粒状结构定位 | 研究主要基于小鼠肠道类器官和组织，在人类系统中的适用性有待验证 | 探索肠道上皮细胞中亚细胞RNA定位模式和形成机制 | 小鼠肠道类器官和成年小鼠肠道组织 | 空间转录组学 | NA | APEX-seq, MERFISH, 空间转录组学 | NA | RNA空间定位数据 | 小鼠肠道类器官和成年小鼠肠道组织 | NA | 邻近标记, 空间转录组学 | APEX-seq, MERFISH | APEX-seq用于邻近标记，MERFISH用于空间转录组学分析 |