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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-04-04
HOX code-based stratification reveals RUNX1T1-HDAC reprogramming as a targetable driver of lineage plasticity across cancers
2026-Mar-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过分析多组学数据,发现HOX基因表达模式可稳健地分层谱系约束和谱系可塑性状态,并鉴定RUNX1T1为跨癌症谱系可塑性的关键调控因子,其通过HDAC3复合物重塑染色质,为靶向治疗提供了新策略 首次利用HOX代码作为跨癌症可扩展标记来识别谱系可塑性亚型,并揭示了RUNX1T1-HDAC轴作为可靶向的癌症谱系可塑性驱动机制 研究基于回顾性多组学数据分析,需进一步实验验证RUNX1T1-HDAC轴在不同癌症模型中的普适性和临床转化潜力 探索癌症谱系可塑性的分子驱动机制,并寻找可靶向的治疗脆弱性 涵盖23种癌症类型、114个亚型的超过80,000个RNA-seq样本,包括前列腺癌、肺癌和急性髓系白血病等代表性恶性肿瘤 计算生物学 多种癌症 RNA-seq、单细胞RNA-seq、CUT&RUN、AI结构建模、共免疫沉淀 AI结构模型 转录组数据、染色质图谱数据 超过80,000个RNA-seq样本 NA RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
42 2026-04-04
Pharmacologic targeting of the dopamine D2 receptor impacts the efficacy of immune checkpoint blockade in melanoma
2026-Mar-27, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了通过药物靶向多巴胺D2受体(D2R)来调节催乳素(PRL)水平,从而影响免疫检查点抑制剂(ICIs)在黑色素瘤治疗中的疗效 首次利用FDA批准的D2R激动剂和拮抗剂(溴隐亭和甲氧氯普胺)在体内调节PRL水平,并揭示了D2R靶向不仅通过PRL依赖途径,还通过增强肿瘤细胞MHC表达和调节巨噬细胞极化等独立机制来改善ICIs疗效 研究主要基于小鼠模型(B16F0和MEL11443),尚未在人类患者中进行验证,且机制探索虽涉及单细胞和批量RNA测序,但具体信号通路细节仍需进一步阐明 评估药物靶向D2R对免疫检查点抑制剂在黑色素瘤治疗中疗效的影响,并探索其潜在机制 小鼠黑色素瘤模型(B16F0和MEL11443)、PRL位点ICI应答和非应答动物模型 肿瘤免疫学 黑色素瘤 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学 NA RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组织化学图像 使用小鼠模型(具体数量未明确说明),涉及PRL位点ICI应答和非应答品系 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
43 2026-04-04
NetTracer3D Enables User-Friendly Analysis of Diverse Microscopic and Medical 3D Datasets
2026-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了NetTracer3D,一个用于简化多样化三维图像数据集分析的综合工具 开发了NetTracer3D工具,提供三种通用的网络分析模式(连接性网络、分支邻接与分支点网络、邻近性网络),并建立了可互操作的数据格式和分析工作流程 NA 解决三维组织图谱数据在整合、共享和分析方面的标准化挑战 多样化的显微和医学三维数据集,包括人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人脑血管造影、淋巴结、肿瘤微环境等 数字病理学 NA CODEX、无标记拉曼光谱、光片成像 NA 三维图像、空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
44 2026-04-04
Pluripotency Factors Modulate Interferon Signaling in Embryonic Stem Cells
2026-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了人类胚胎干细胞中多能性因子如何调控干扰素信号通路,以维持多能性并抵抗病毒感染 揭示了多能性因子通过转录控制干扰素信号负调控因子(如SOCS1和SPRY4)来抑制典型干扰素信号,从而在保持抗病毒能力的同时维护干细胞多能性 研究主要基于体外hESC模型,可能未完全反映体内胚胎发育的复杂环境 阐明多能性干细胞中干扰素信号与多能性维持之间的分子机制 人类胚胎干细胞 干细胞生物学 病毒感染 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
45 2026-04-04
Biology and preclinical models of colorectal cancer metastasis
2026-Mar-26, Intestinal research IF:3.4Q2
综述 本文总结了结直肠癌转移的生物学机制及当前用于研究转移性结直肠癌的临床前模型,并讨论了新兴技术如何整合以改进模型系统 系统性地比较了现有实验模型在模拟转移级联关键步骤和器官特异性微环境方面的优缺点,并提出了整合单细胞、空间转录组学和纵向追踪技术的新框架 现有模型在模拟免疫和基质影响方面存在概念性差距,且纵向采样和转移负荷的定量读出存在实际障碍 理解转移性结直肠癌的生物学机制并改进其临床前研究模型 转移性结直肠癌的生物学过程及其实验模型系统 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
46 2026-04-04
Molecularly defined subpopulations of leptin receptor neurons dissociate the control of food intake from blood pressure
2026-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过分子定义瘦素受体神经元亚群,揭示了其如何分离食物摄入与血压控制的机制 首次识别出瘦素受体神经元在弓状核和背内侧下丘脑核中的两个独特亚群,分别独立调控食物摄入和血压 研究主要基于小鼠模型,人类中的相关性需进一步验证 探究瘦素受体神经元在调控食物摄入和心血管功能中的特异性作用 瘦素受体和胰高血糖素样肽-1受体共表达的神经元亚群 神经科学 肥胖与心血管疾病 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
47 2026-04-04
Transcriptional regulation of the main olfactory epithelium by environmental olfactory exposures
2026-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序探究了环境嗅觉暴露对小鼠主嗅上皮细胞类型特异性转录反应的影响 首次在稳态条件下揭示了环境嗅觉暴露对主嗅上皮细胞类型特异性转录的影响 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类样本;环境暴露条件相对有限 探究环境嗅觉暴露如何影响主嗅上皮不同细胞类型的转录调控 小鼠主嗅上皮组织 单细胞转录组学 嗅觉功能障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
48 2026-04-04
Spatial multi-omics of multiple myeloma uncovers niche-dependent pro-myeloma and immunosuppressive signaling in the bone marrow and extramedullary lesions
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合空间多组学技术,揭示了多发性骨髓瘤在骨髓和髓外病变中依赖于微环境的促骨髓瘤和免疫抑制信号 开发了一个整合10x Genomics Visium HD、Xenium和单细胞RNA测序的多模态框架,首次在空间上解析了多发性骨髓瘤微环境中细胞类型特异性转录程序及其与临床结局的关联 NA 空间解析多发性骨髓瘤微环境中细胞间相互作用对肿瘤进展和免疫抑制的影响 多发性骨髓瘤患者样本中的骨髓瘤细胞和免疫微环境细胞 数字病理学 多发性骨髓瘤 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA 10x Genomics 空间转录组学,单细胞RNA测序 10x Visium HD, 10x Xenium 10x Visium HD(16微米分辨率全转录组空间发现),10x Xenium(单细胞分辨率正交验证)
49 2026-04-04
A single-cell atlas of Toxoplasma sexual development in the feline intestinal tract
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过单细胞转录组学技术,绘制了弓形虫在猫肠道内性发育过程的单细胞图谱,揭示了罕见细胞群如配子的特征,并利用CRISPR-Cas9 Perturb-seq技术鉴定出调控大配子体发育的关键基因AP2X6 首次在猫肠道内对弓形虫性发育过程进行单细胞转录组分析,识别出罕见配子细胞群,并通过功能筛选鉴定出调控大配子体发育的新基因AP2X6 研究仅基于两个实验的15,068个细胞,样本规模相对有限,且未全面探索所有基因调控网络 研究弓形虫在猫肠道内的性发育过程,揭示其基因调控网络,以促进配子发生、交配和卵囊生产的诱导 弓形虫寄生虫,特别是从猫肠道分离的寄生虫细胞 单细胞转录组学 弓形虫病 单细胞转录组学,CRISPR-Cas9 Perturb-seq,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 15,068个细胞,来自两个实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
50 2026-04-04
Spatially-resolved single cell atlas of liposarcoma reveals lineage hierarchies, immune niches, and regulatory circuits
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞多组学测序、表观基因组分析和空间转录组学,揭示了脂肪肉瘤亚型间的细胞和表观遗传异质性、谱系层次、免疫微环境及调控网络 首次在单细胞和空间分辨率上系统比较了WDLPS和DDLPS的细胞与表观遗传异质性,发现了新的基因调控环路,并提出了硬化型WDLPS可能是一个独特亚型的观点 未明确说明样本的具体数量或来源,且研究结果主要基于观察性数据,功能验证可能有限 揭示脂肪肉瘤亚型的细胞异质性、免疫微环境特征及驱动其分化状态的调控程序 高分化脂肪肉瘤(WDLPS)和去分化脂肪肉瘤(DDLPS)的肿瘤组织 数字病理学 脂肪肉瘤 单细胞多组学测序、表观基因组分析、空间转录组学 NA 单细胞多组学数据、表观基因组数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞多组学测序、空间转录组学 NA NA
51 2026-04-04
Cross-Species Multi-Omics Profiling Identifies Conserved Activated Valvular Interstitial Cell Population Driving Myxomatous Mitral Valve Degeneration
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组分析,构建了正常、散发性及马凡综合征相关二尖瓣脱垂的细胞组成和细胞外基质组织图谱,揭示了瓣膜间质细胞的异质性及其在疾病中的作用 首次跨物种(小鼠和人类)识别出一个保守的活化瓣膜间质细胞群,该细胞群在纤维化重塑中起关键作用,并定位在机械脆弱的瓣叶尖端区域 研究依赖于动物模型和有限的人类组织样本,可能无法完全反映所有临床变异;空间转录组的分辨率可能限制细胞亚群的精确空间定位 探究二尖瓣脱垂中瓣膜间质细胞的分子异质性及其在黏液样二尖瓣退化疾病发病机制中的贡献 小鼠模型(fibrillin-1缺陷型)和人类二尖瓣组织样本,包括正常、散发性二尖瓣脱垂及马凡综合征相关二尖瓣脱垂 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,空间转录组分析 NA RNA测序数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
52 2026-04-04
Developmental determinants of male bias in medulloblastoma
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了髓母细胞瘤中男性发病率偏高的发育决定因素 通过整合多组学数据、构建性别匹配的小鼠小脑单细胞转录组图谱,并结合基因工程小鼠模型和人小脑类器官,揭示了男性偏倚的遗传和神经发育机制,特别是雄性激素睾酮的主导作用 研究主要基于小鼠模型和类器官,其结论在人体中的普适性仍需进一步验证;对性染色体失活丢失的具体机制及其功能影响探讨有限 探究髓母细胞瘤(一种儿童小脑肿瘤)中男性发病率显著高于女性的生物学原因 儿童髓母细胞瘤患者样本、发育中小鼠的小脑细胞、基因工程小鼠模型、人小脑类器官 癌症生物学/发育神经生物学 髓母细胞瘤(儿童脑肿瘤) 多组学分析(基因组学、转录组学、表观基因组学)、单细胞转录组测序、染色质可及性分析、基因工程小鼠模型、类器官培养 NA 基因组数据、转录组数据、表观基因组数据、单细胞RNA-seq数据 大型多组学数据集(来自儿童髓母细胞瘤患者),具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2026-04-04
Heterogeneity and prognostic significance of mast cell subsets in the tumor microenvironment of prostate cancer
2026-Mar-24, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和生物信息学分析,揭示了前列腺癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其与预后的关联 首次在前列腺癌中通过单细胞RNA测序将肥大细胞分为两个功能相反的亚群,并鉴定出亚群特异性标记基因作为预后因子 研究样本量相对较小(39个肿瘤样本),且主要依赖生物信息学分析,缺乏实验验证 探究前列腺癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其对预后的影响 前列腺癌肿瘤微环境中的肥大细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 生物信息学分析 非负矩阵分解 RNA测序数据 39个前列腺癌肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
54 2026-04-04
CXCR6+ T cells promote apoptosis and necroptosis in proximal tubules during AKI-to-CKD transition
2026-Mar-24, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序等技术,揭示了CXCR6+ T细胞在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中通过促进近端肾小管细胞凋亡和坏死性凋亡的关键作用 首次明确了CXCR6+ T细胞在AKI向CKD转变过程中通过CXCL16-CXCR6轴介导免疫驱动的肾小管细胞死亡的具体机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中得到验证;对CXCL16-CXCR6轴下游信号通路的详细机制仍需进一步探索 探究急性肾损伤向慢性肾病转变过程中免疫细胞如何促进肾小管损伤和细胞死亡 小鼠肾脏组织、近端肾小管细胞、T细胞、巨噬细胞 单细胞组学 肾脏疾病 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 蛋白质分析 NA RNA测序数据, 图像数据, 蛋白质数据 小鼠模型样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
55 2026-04-04
ZMAP: A single-cell meta-atlas of zebrafish embryonic development reveals a consensus hierarchy of cell identities
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了ZMAP,一个整合了多个已发表斑马鱼胚胎单细胞RNA测序数据集的统一元图谱,旨在提供细胞身份的共识层次结构 通过整合8个已发表数据集,创建了一个包含近80万个细胞的统一参考图谱,并引入了共享嵌入、标准化标记基因发现流程和分层注释本体,以促进跨研究比较 数据整合可能受限于原始数据集在样本处理、映射和注释规范上的差异,且主要关注胚胎发育早期阶段 构建一个统一的斑马鱼胚胎发育单细胞元图谱,以解决跨数据集比较的挑战 斑马鱼胚胎发育过程中的细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 798,790个细胞,覆盖15个发育时间窗口 NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2026-04-04
Endometrial Hyperplasia Risk Is Increased by High-Fat Diet Via Estrogen-Driven Stromal Fibroblast Reprogramming Toward a Pro-Fibrotic State
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和组织表型分析,揭示了高脂饮食通过雌激素驱动的基质成纤维细胞重编程,增加子宫内膜增生风险的机制 首次在单细胞水平上阐明了高脂饮食如何通过雌激素信号通路重编程子宫内膜基质成纤维细胞,促进促纤维化状态,从而连接雌激素优势与子宫内膜增生风险 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证,且样本量相对有限 探究肥胖如何通过改变子宫内膜细胞状态增加子宫内膜增生风险 对照和高脂饮食喂养的小鼠子宫内膜组织 数字病理学 子宫内膜增生 单细胞RNA测序, 组织表型分析 NA 单细胞RNA测序数据, 组织表型数据 对照和高脂饮食喂养的小鼠子宫内膜组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
57 2026-04-04
Splicing variants in MYRF cause partial loss of function in the retinal pigment epithelium leading to nanophthalmos
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过体外和动物模型实验,揭示了MYRF基因剪接变异体导致其功能部分丧失,从而引发视网膜色素上皮功能缺陷,最终导致孤立性小眼症 首次将MYRF基因C末端变异与孤立性小眼症联系起来,并证明dG-MYRF是一种亚效等位基因,同时发现了两种导致非功能性异构体的MYRF剪接变异 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,人类临床样本数量有限,且胚胎致死表型限制了成年表型的全面分析 探究MYRF基因变异导致孤立性小眼症而非综合征性疾病的分子机制 MYRF基因变异、视网膜色素上皮细胞、小鼠模型、人类家族 分子遗传学 眼科疾病 单细胞RNA测序、体外细胞培养、动物模型构建 小鼠基因编辑模型 基因表达数据、测序数据 人类RPE细胞、原发性RPE细胞、MyrfhumdG/humdG和MyrfhumWT/humWT小鼠、RxCre;Myrffl/fl敲除小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
58 2026-04-04
Combined single-cell transcriptome and immune repertoire analysis reveals hepatic and renal immune injury by heat stroke
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学、T细胞受体测序和流式细胞术分析,揭示了热射病(特别是劳力性热射病)中肝脏和肾脏免疫损伤的机制 首次结合单细胞转录组和免疫受体分析,识别了热射病中富集的颗粒酶阳性T细胞、CD56dim NK细胞和IL-1B+NLRP3+单核细胞,并揭示了它们通过NLRP3炎症小体通路诱导肝、肾细胞焦亡的相互作用机制 样本量较小(仅27名参与者),且仅分析了外周血单个核细胞,未直接研究肝脏和肾脏组织 探索热射病(特别是劳力性热射病)的免疫病理学机制 热射病患者、热衰竭患者和健康对照者的外周血单个核细胞 数字病理学 热射病 单细胞转录组学、T细胞受体测序、流式细胞术 NA 单细胞RNA-seq数据、免疫受体序列数据、流式细胞数据 27名参与者(9名健康对照、9名热衰竭患者、9名劳力性热射病患者) NA 单细胞RNA-seq NA NA
59 2026-04-04
Hypothyroidism impairs skeletal muscle regeneration after injury by altering myogenic and nonmyogenic pathways
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和细胞周期报告小鼠模型,揭示了甲状腺功能减退通过改变肌源性及非肌源性通路损害骨骼肌损伤后再生过程 首次结合单细胞转录组测序与FUCCI细胞周期报告系统,系统阐明甲状腺功能减退对肌源性细胞多样性、细胞周期进程及非肌源性微环境(FAPs与巨噬细胞)的双重调控机制 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;未探讨甲状腺激素替代治疗的干预效果 探究甲状腺激素信号在骨骼肌损伤修复过程中的具体调控通路 小鼠胫骨前肌的骨骼肌干细胞、纤维脂肪祖细胞及巨噬细胞等 单细胞组学 甲状腺功能减退相关肌病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞周期荧光报告系统(FUCCI)、转录组分析 NA 单细胞转录组数据、细胞周期成像数据 小鼠胫骨前肌损伤模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
60 2026-04-04
Extracellular vesicle miR-93-5p cargo regulates glomerular endothelial cell damage in Alport syndrome
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了miR-93-5p在Alport综合征中调节肾小球内皮细胞损伤的作用,以及人羊水干细胞来源的细胞外囊泡通过其miR-93-5p货物介导疾病修饰活性的机制 揭示了miR-93-5p在Alport综合征肾小球内皮细胞中的特异性下调及其通过hAFSC-EVs传递调控VEGFR1和VEGFR2信号通路的机制,首次结合空间转录组学和空间分子成像验证了hAFSC-EVs在疾病中的治疗潜力 研究主要基于体外和动物模型,人类患者数据仅通过活检验证,样本量可能有限,且未详细探讨miR-93-5p在其他肾细胞类型中的作用 探究miR-93-5p在缓解Alport综合征肾小球损伤中的作用,以及hAFSC-EVs的疾病修饰活性是否由其miR-93-5p货物介导 肾小球内皮细胞、人羊水干细胞来源的细胞外囊泡、Alport综合征模型 分子生物学与细胞生物学 Alport综合征 空间转录组学、空间分子成像、转录组学分析、蛋白质组学分析 NA 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据、成像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
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