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当前共找到 39345 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-05-12 |
Unannotated noncoding transcripts as a source of intratumor heterogeneity in malignant cell states
2026-May, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3273-6
PMID:41870780
|
research paper | 本研究通过分析12种常见癌症类型的单细胞RNA-seq数据，发现了大量未被注释的非编码转录本，这些转录本的表达与恶性细胞状态及肿瘤内异质性密切相关 | 首次系统性地揭示了未注释非编码转录本作为肿瘤内异质性新来源的机制，并通过功能实验验证了其促进肺癌细胞增殖和迁移的作用 | 未明确说明，需进一步阅读全文 | 探究未注释非编码转录本在恶性细胞状态中作为肿瘤内异质性来源的作用 | 12种常见癌症类型的肿瘤样本及癌细胞系 | machine learning | lung cancer | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, multi-omics | NA | gene expression data, epigenetic data | 12种癌症类型的单细胞RNA-seq数据及多区域采样的bulk RNA-seq数据 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 3' tag-based single-cell RNA-seq |
| 42 | 2026-05-12 |
Endothelial cells recruit pro-inflammatory macrophage clusters via App-Cd74 exacerbating ICI-associated myocarditis
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111238
PMID:41905617
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究ICI相关心肌炎中内皮细胞通过App-Cd74轴招募促炎性巨噬细胞簇的机制 | 首次揭示App-Cd74信号轴在ICI相关心肌炎中内皮细胞与促炎性巨噬细胞簇之间的相互作用，并利用深度学习框架scTenifoldXct验证该配体-受体互作 | 未明确提及，但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异及研究样本量有限 | 阐明ICI相关心肌炎的免疫病理机制，探索潜在治疗靶点 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架scTenifoldXct | 单细胞转录组数据 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织样本，具体数量未提及 | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 43 | 2026-05-12 |
COVARE for modeling latent random effect correlations to detect genes with specific spatial expression patterns
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111242
PMID:41941898
|
研究论文 | 提出COVARE方法，基于线性混合效应模型检测具有特定空间表达模式的基因 | 通过线性混合效应模型纳入多种预设生物学信息并考虑协变量间的潜在相互作用，实现对基因空间表达的多因素共调控精确分析，弥补现有方法中协变量独立假设的不足 | 未明确提及局限性 | 检测空间可变基因并解析基因表达的复杂空间模式 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序 | 线性混合效应模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 44 | 2026-05-12 |
OMICX: An AI-powered web platform for integrative analysis of multi-condition single-cell transcriptomics data
2026-May, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111243
PMID:41941899
|
研究论文 | 介绍了一个由大型语言模型助力的无代码交互式网络平台OMICX，用于多条件单细胞转录组数据的综合分析 | 集成大型语言模型助手，通过自然语言对话实现单细胞数据分析，无需编程，提高了可及性和易用性 | 未在摘要中明确提及局限性 | 提供一个交互式无代码平台，简化多条件单细胞转录组数据的综合分析流程 | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据和GWAS汇总统计数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, bulk RNA-seq, GWAS | 大型语言模型 | 文本，基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-05-12 |
GatorST: A Versatile Contrastive Meta-Learning Framework for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2026-May, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202600006
PMID:41947710
|
研究论文 | 提出GatorST框架，整合图建模与元学习策略以生成空间转录数据的空间感知表示 | 创新地结合局部邻域拓扑（两跳子图）与全局基因表达伪标签监督，采用元学习情景训练策略增强跨空间情景泛化能力 | 未提及局限性 | 开发通用空间转录组数据分析框架，实现空间域识别、基因表达插补、批次效应去除及空间轨迹推断 | 空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 元学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-05-12 |
Single-cell transcriptomics reveals the impact of sex and age in the healthy human liver
2026-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101773
PMID:41990579
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析了37个健康人肝脏样本，揭示性别和年龄对肝脏细胞类型基因表达和细胞间相互作用的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了性别和年龄对人肝脏所有细胞类型基因表达谱、信号通路和细胞间通讯的影响 | 未说明具体限制 | 通过单细胞测序技术研究性别和年龄如何影响健康人肝脏的基因表达和细胞功能 | 37个健康人肝脏样本，包含女性和男性捐赠者，年龄跨度超过七十年 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序, 差异表达分析, 通路富集分析, 配体-受体和蛋白-蛋白相互作用预测 | NA | 基因表达数据 | 37个健康人肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-05-12 |
Multiomics and multi-region spatial transcriptome analysis reveal cellular networks and pathways associated with HCC recurrence
2026-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101790
PMID:41950768
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研究论文 | 通过多组学和多区域空间转录组分析，揭示与肝细胞癌复发相关的细胞网络和信号通路 | 发现了INTS6+内皮细胞亚群，其在复发患者的肿瘤中富集并与肿瘤细胞空间共定位，且与微血管侵犯区域相关 | 研究样本量有限，仅涉及4名患者和17个组织样本 | 研究肝细胞癌复杂肿瘤微环境中不同细胞类型间的相互作用及其在疾病复发中的作用 | 肝细胞癌手术切除后的多区域组织样本 | 机器学习和数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学，批量RNA测序，免疫荧光，多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 4名患者的17个组织样本（空间转录组），90名患者的329个分区（批量RNA测序） | NA | 空间转录组学，批量RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-05-12 |
Tocilizumab Mitigates Immune Checkpoint Inhibitor-Induced Colitis and Inhibits Tumor Growth by Targeting the IL-6-JAK2-STAT3 Signaling Pathway
2026-May, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.70293
PMID:42051049
|
研究论文 | 该研究通过建立PD-1抑制剂诱导的结肠炎小鼠模型，探究IL-6-JAK2-STAT3信号通路在免疫检查点抑制剂相关结肠炎中的作用，并验证托珠单抗通过靶向该通路缓解结肠炎症并抑制肿瘤生长的治疗效果 | 首次揭示托珠单抗通过靶向IL-6-JAK2-STAT3通路同时缓解PD-1抑制剂诱导的结肠炎和抑制肿瘤生长，为临床治疗提供了新思路 | 仅基于小鼠模型验证，尚需临床试验进一步评估托珠单抗在人类患者中的安全性和有效性 | 阐明免疫检查点抑制剂相关结肠炎的发病机制并探索潜在治疗策略 | PD-1抑制剂诱导的结肠炎小鼠模型 | 机器学习 | 结肠炎 | RNA测序，单细胞RNA测序，HE染色，免疫组化，ELISA，Western blot，小动物活体成像，肿瘤细胞功能分析 | NA | 基因表达数据，图像 | 小鼠模型（具体数量未说明） | Illumina | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 49 | 2026-05-12 |
Exceptional Longevity Modifying Allele APOE2 Promotes DNA Signaling Pathways Resisting Cellular Senescence in Human Neurons
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70494
PMID:42103698
|
研究论文 | 研究发现长寿相关APOE2等位基因通过促进DNA修复和抑制细胞衰老途径，增强人类神经元的抗衰老能力 | 首次揭示APOE2通过促进DNA修复和信号通路而非单纯脂质代谢来抵抗神经元衰老，并在两种神经元亚型中验证了该机制 | 未提供 | 探究APOE2等位基因如何促进神经元长寿并提供神经保护 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）来源的GABA能神经元和谷氨酸能神经元，以及APOE靶向替换小鼠 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类iPSC来源的GABA能神经元和谷氨酸能神经元，以及APOE靶向替换小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2026-05-12 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals APOE genotype-dependent sex differences in Alzheimer's disease
2026-May, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71463
PMID:42108391
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示APOE基因型依赖的阿尔茨海默病性别差异 | 首次在单细胞水平系统研究了性别与APOE基因型在阿尔茨海默病中的相互作用 | 未提及具体局限性 | 探索阿尔茨海默病中性别和APOE基因型相关的单细胞转录组差异 | 阿尔茨海默病患者的大脑细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 54种高分辨率细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-05-12 |
Integrated Bulk and Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Transcriptional Activation of PTGS2 by FOS in Progression From T2DM to T2DM-Associated NAFLD
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71182
PMID:42108421
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研究论文 | 通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示FOS介导的PTGS2转录激活在2型糖尿病进展为非酒精性脂肪性肝病中的作用 | 首次通过批量与单细胞转录组整合分析，揭示FOS直接结合PTGS2启动子并驱动其转录在T2DM向NAFLD进展中的机制 | 未提及体内实验验证，缺乏更大样本量的临床验证 | 探究T2DM向T2DM相关NAFLD进展过程中FOS介导的PTGS2激活的调控机制 | T2DM相关NAFLD患者的批量RNA-seq数据、单细胞转录组数据及临床样本 | 机器学习 | 2型糖尿病，非酒精性脂肪性肝病 | RNA-seq | LASSO回归，随机森林 | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-05-12 |
SLA2 is Associated With Immune evasion and Exhaustion of CD8+ T Cells in Gastric Cancer
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71164
PMID:42108520
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研究论文 | 本研究探讨了Src样适配蛋白2（SLA2）在胃癌组织中高表达及其与CD8+T细胞耗竭和免疫逃逸的关系 | 首次揭示了SLA2在胃癌肿瘤微环境中通过负调控T细胞受体信号导致CD8+T细胞功能耗竭的机制，并发现启动子甲基化和组蛋白修饰可能调控其表达 | 具体实验数据和样本量未在摘要中明确说明，机制研究主要基于体外实验 | 探索SLA2在胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞功能的影响及其分子机制 | 胃癌组织样本、CD8+T细胞 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-05-12 |
Microenvironmentally derived fatty acid-binding proteins 4 and 5 are novel therapeutic vulnerabilities in multiple myeloma
2026-May, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2026.100229
PMID:42109313
|
研究论文 | 研究发现微环境来源的脂肪酸结合蛋白4和5是多发性骨髓瘤的新型治疗靶点 | 首次揭示微环境来源的FABP4/5支持多发性骨髓瘤进展，并提出双重靶向策略 | 未明确说明研究的局限性 | 验证微环境来源的FABP4/5促进多发性骨髓瘤进展的假设 | 多发性骨髓瘤患者和老鼠模型 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 多发性骨髓瘤患者数据和老鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2026-05-12 |
Single-nucleus transcriptome profiling unveils cell-type-specific ethylene and TOR signaling in tomato
2026-May, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhag044
PMID:42111481
|
研究论文 | 利用单核转录组图谱解析番茄黄化过程中细胞类型特异的乙烯和TOR信号调控机制 | 首次在单核分辨率下整合乙烯和TOR信号通路对番茄黄化过程的调控，并鉴定出表皮细胞中JA1转录因子作为乙烯负调控因子 | 未在摘要中说明实验重复次数或统计验证的详细方法 | 阐明番茄黄化过程中乙烯和TOR信号通路的细胞类型特异性调控机制 | 番茄幼苗的黄化顶钩和下胚轴组织 | 植物单细胞转录组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 单核转录组表达谱 | 117,929个细胞核，来自三种处理（ACC、Torin2、对照）的顶钩和下胚轴组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-05-12 |
Ginsenosides exhibit potential therapeutic potential in photoaging by regulating keratinocyte ferroptosis
2026-May, Journal of ginseng research
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.jgr.2025.11.002
PMID:42112127
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研究论文 | 本研究探讨人参皂苷通过调节角质细胞铁死亡来缓解皮肤光老化的潜在治疗机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示UVB照射后角质细胞铁死亡信号变化，并发现人参皂苷C-K和C-Mc靶向铁死亡调节蛋白SLC7A11/GPX4轴和HMGB1表达的机制 | 尚未提及具体研究局限，但可能包含动物模型与人体差异、样本量有限、机制细节未完全阐明等 | 探索人参皂苷调节角质细胞铁死亡在皮肤光老化治疗中的作用机制 | 小鼠UVB照射后的皮肤组织及培养的角质细胞 | 分子生物学与皮肤药理学 | 皮肤光老化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接、Western blot、RT-qPCR、斑马鱼胚胎毒性实验 | NA（未明确使用特定深度学习模型） | 基因表达数据 | 小鼠皮肤组织样本（具体数量未给出）及斑马鱼胚胎样本 | NA（未明确平台公司） | 单细胞RNA测序 | NA（未明确具体平台或试剂盒） | NA（未提供具体平台配置细节） |
| 56 | 2026-05-12 |
Multi omics and mechanistic investigation reveals CBFB as a prognostic biomarker in gastric cancer
2026-Apr-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05131-9
PMID:42056631
|
研究论文 | 该研究通过多组学分析发现CBFB是胃癌预后生物标志物，并探究其作用机制 | 首次系统性地利用多组学分析揭示CBFB在胃癌中的预后价值及功能机制，包括单细胞RNA测序和分子对接验证 | 未提及明显的局限性 | 探究CBFB在胃癌中的预后意义和潜在作用机制 | 胃癌患者的转录组数据及细胞样本 | 机器学习 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | CNN（机器学习） | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-05-12 |
CSsingle: a unified tool for robust decomposition of bulk and spatial transcriptomic data across diverse single-cell references
2026-Apr-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag410
PMID:42080261
|
研究论文 | 提出了统一框架CSsingle，鲁棒地从多种单细胞参考中解卷积bulk和空间转录组数据 | 引入细胞大小校正和跨平台数据整合，通过External RNA Controls Consortium (ERCC) spike-ins或计算估计器明确校正细胞类型特异性RNA含量差异 | 未明确讨论 | 准确解卷积bulk和空间转录组数据，以研究组织架构和疾病 | bulk转录组和空间转录组数据 | 自然语言处理 | 肺癌 | NA | 重复加权最小二乘模型 | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2026-05-12 |
Systems genetics reveals ITIH5 as a key mediator of adipocyte-Endothelial crosstalk
2026-Apr-21, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2026.102373
PMID:42025695
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研究论文 | 使用系统遗传学方法揭示ITIH5作为脂肪细胞与内皮细胞交互的关键调节因子，影响脂肪组织稳态和全身代谢 | 通过无偏倚系统遗传学分析发现ITIH5在脂肪组织稳态和全身代谢中的中心调控作用，并结合急性重组蛋白处理、时空调控的脂肪细胞特异性过表达模型和空间转录组学揭示其通过调节内皮-免疫相互作用的机制 | 未明确提及具体限制，但可能包括动物模型向人类转化、不同饮食条件下的效应差异及潜在的混杂遗传因素 | 探索脂肪组织稳态的遗传调控机制，特别是ITIH5在脂肪细胞-内皮细胞交互和全身代谢中的作用 | 小鼠和人类脂肪组织、内皮细胞 | 系统遗传学 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 空间转录组学数据 | 未明确提供具体样本量，涉及小鼠模型和人类细胞实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2026-05-12 |
Mapping breast cancer lineage in radiation and immunotherapy using the REMAP mouse
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.15.718689
PMID:42039427
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研究论文 | 介绍REMAP小鼠模型，用于在放射和免疫治疗中绘制乳腺癌谱系，揭示肿瘤进化、转移及治疗反应由可遗传的谱系程序调控 | 首次将诱导型CRISPR记录与MMTV-PyMT小鼠模型结合，实现体内乳腺肿瘤克隆谱系的高分辨率追踪，并揭示可遗传的EMT程序在转移和治疗反应中的作用 | NA | 研究放射与抗PD1免疫治疗联合作用下激素受体阳性乳腺癌的肿瘤进化、转移及肿瘤微环境重塑机制 | REMAP小鼠模型中的激素受体阳性乳腺癌肿瘤及肿瘤微环境 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | REMAP小鼠模型中的多个肿瘤和转移灶样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达系统 |
| 60 | 2026-05-12 |
Distinct gene signatures of human intermuscular adipose tissue expansion visualized by spatial transcriptomics in mice
2026-Apr-17, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.04.16.26351017
PMID:42064925
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示小鼠及人类肌间脂肪组织扩张的独特基因特征 | 首次结合人类大块转录组学与小鼠空间转录组学，跨物种比较揭示肌间脂肪组织扩张的局部化、上下文依赖性谱系转变机制，并鉴定到EBF2作为关键成脂转录因子 | 仅在小鼠模型中验证空间转录组数据，人类样本大块转录组缺乏空间分辨率；未完全解析人类与小鼠间物种特异性调控网络的差异 | 阐明肌间脂肪组织扩张的细胞组织及调控机制，以揭示其与心血管代谢疾病的关联 | 人类肌间脂肪组织样本及心血管代谢疾病模型的SAM小鼠肌间脂肪组织 | 空间转录组学 | 心血管代谢疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类肌间脂肪组织样本（具体数量未提供）、SAM小鼠（具体数量未提供） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |