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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-31 |
SpateCV: cross-modality alignment regularization of cell types improves spatial gene imputation for spatial transcriptomics
2025-Oct-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07245-0
PMID:41162996
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2025-10-31 |
Cross-expression meta-analysis of mouse brain slices reveals coordinated gene expression across spatially adjacent cells
2025-Oct-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03747-8
PMID:41163012
|
研究论文 | 本研究通过跨表达分析探索空间相邻细胞间基因表达的协调机制 | 提出跨表达概念，避免使用人工注释数据库和细胞类型标签，同时控制细胞内在过程 | 仅需要基因表达和细胞位置矩阵，但未讨论特定技术平台的技术限制 | 研究空间相邻细胞间基因表达的协调机制 | 小鼠脑切片中的细胞 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组学，跨表达分析 | 跨表达网络 | 基因表达数据，空间位置数据 | 约2500万个细胞，695个切片，来自52个大脑 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-31 |
Systematic discovery of subcellular RNA patterns in the gut epithelium
2025-Oct-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03786-1
PMID:41163196
|
研究论文 | 本研究通过APEX-seq和MERFISH技术系统揭示了肠道上皮细胞中亚细胞RNA的定位模式 | 首次系统发现肠道上皮中亚细胞RNA定位模式，识别了影响这些模式形成的内在和环境因素，并揭示了翻译依赖和翻译独立的定位机制 | 研究主要基于小鼠肠道类器官和组织，在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 探索肠道上皮细胞中亚细胞RNA定位模式及其调控机制 | 小鼠肠道类器官和成年小鼠肠道组织 | 空间转录组学 | NA | APEX-seq, MERFISH, 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠肠道类器官和成年小鼠肠道组织 | NA | 邻近标记, 空间转录组学 | NA | APEX-seq用于邻近标记，MERFISH用于空间转录组分析 |
| 44 | 2025-10-31 |
Mapping disease-specific vascular cell populations responsible for obliterative arterial remodelling during the development of pulmonary arterial hypertension
2025-Oct-28, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf146
PMID:40875786
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别肺动脉高压发展中导致闭塞性动脉重构的疾病特异性血管细胞群 | 首次在肺动脉高压模型中通过多时间点单细胞转录组分析鉴定出两种疾病特异性内皮细胞群，并发现TM4SF1作为动脉重构的新治疗靶点 | 研究基于动物模型，在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 阐明肺动脉高压发展中闭塞性动脉病变形成的细胞机制 | 肺动脉高压大鼠模型和PAH患者的肺组织细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序，RNA velocity分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的肺动脉高压模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-31 |
Changes in neural progenitor lineage composition during astrocytic differentiation of human iPSCs
2025-Oct-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96423
PMID:41150379
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研究论文 | 本研究通过追踪人类iPSCs分化为星形胶质细胞的过程，揭示了神经祖细胞谱系组成的变化及其对星形胶质细胞区域特性的影响 | 首次证明iPSCs衍生的星形胶质细胞谱系组成不能准确反映原始祖细胞群体，并识别了LMX1A祖细胞来源星形胶质细胞的独特转录组特征 | 研究仅聚焦于LMX1A腹侧中脑祖细胞，未涵盖其他脑区祖细胞类型 | 探究人类iPSCs分化为星形胶质细胞过程中神经祖细胞谱系组成的变化规律 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs)及其分化的神经祖细胞和星形胶质细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序，细胞谱系追踪 | 人类iPSCs分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 深度单细胞RNA测序 |
| 46 | 2025-10-31 |
Spatial immune landscapes of the human placenta: Biomarkers and therapeutic insights in pregnancy disorders
2025-Oct-28, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118688
PMID:41160999
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研究论文 | 通过空间转录组学和蛋白质组学技术解析人类胎盘的免疫景观，揭示妊娠疾病中的生物标志物和治疗机会 | 首次利用空间分析技术揭示胎盘微环境中免疫检查点改变、滋养细胞侵袭模式和局部炎症反应的空间组织特征 | 需要与多组学和纵向分析进一步整合以验证空间发现 | 研究胎盘微环境中的免疫和滋养细胞失调机制，开发妊娠疾病的诊断和治疗策略 | 人类胎盘组织 | 空间转录组学 | 妊娠疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 47 | 2025-10-31 |
Systemic immune activity occurs during human immune system maturation
2025-Oct-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.10.003
PMID:41161316
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示人类胎儿免疫系统在妊娠中期存在系统性免疫活动 | 发现胎儿期存在广泛分布的活化T细胞和跨器官共享的组织驻留记忆克隆，挑战了胎儿免疫静息的主流范式 | NA | 研究人类免疫系统发育和耐受机制 | 321个样本中的2,868,420个免疫细胞，涵盖23个器官 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据，T细胞受体序列数据 | 321个样本，2,868,420个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-31 |
TBXAS1 deficiency causes autoinflammation responsive to IL-6 inhibitor
2025-Oct-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.09.014
PMID:41162285
|
研究论文 | 本研究揭示了TBXAS1缺陷通过花生四烯酸代谢异常导致自身炎症的新机制，并证实IL-6抑制剂治疗的有效性 | 首次发现TBXAS1缺陷通过PGE2-EP2/cAMP/CREB通路诱导IL-6表达引发自身炎症，并成功应用IL-6抑制剂治疗 | 研究仅纳入2例患者，样本量较小 | 探索TBXAS1缺陷引起自身炎症的分子机制并研究靶向治疗策略 | 2例TBXAS1缺陷患者及其外周血单个核细胞 | NA | Ghosal血骨发育不良 | 全外显子组测序, Sanger测序, qRT-PCR, Western blotting, 细胞因子珠阵列, ELISA, 质谱分析, 飞行时间流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质数据, 代谢物数据, 单细胞转录组数据 | 2例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-31 |
GZMK+CD8+ T cells target a specific acinar cell type in Sjögren's disease
2025-Oct-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.08.014
PMID:41162286
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了干燥综合征中特定腺泡细胞的选择性丢失和GZMK+CD8+ T细胞的致病机制 | 首次识别了PRR4⁺CST3⁺WFDC2⁻浆黏液腺泡细胞在干燥综合征中的选择性丢失，并发现GZMK⁺CD8⁺ T细胞通过亚溶细胞效应机制损害线粒体完整性和激活先天免疫信号 | 研究样本限于人类小唾液腺，需要进一步验证在其他组织和其他自身免疫疾病中的普适性 | 探索干燥综合征中不同细胞类型的复杂相互作用及其在疾病病理中的作用 | 人类小唾液腺组织、患者来源的原代上皮细胞和自体T细胞 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞转录组学、空间转录组学、空间免疫表型分析、体外细胞实验 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、空间定位数据 | 人类小唾液腺样本（包括干燥综合征患者和对照） | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-31 |
Multi-omics profiling uncovers paradoxical Epstein-Barr virus involvement in autoimmune liver disease pathogenesis
2025-Oct-27, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01975-6
PMID:41144108
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示EB病毒在自身免疫性肝病发病机制中的复杂作用 | 首次提供EB病毒与自身免疫性肝病关联的遗传学证据，发现EB病毒在疾病中可能扮演双重角色 | 基于观察性研究和数据库分析，因果关系仍需进一步验证 | 探究EB病毒与自身免疫性肝病之间的因果关系和分子机制 | 自身免疫性肝病患者群体和EB病毒相关抗体 | 生物信息学 | 自身免疫性肝病 | 双样本孟德尔随机化分析,GSMR,GWAS,转录组分析,单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞测序数据 | 基于FinnGen数据库的GWAS汇总统计数据 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-31 |
Deciphering splicing heterogeneity at single-cell resolution by SCSES
2025-Oct-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64517-5
PMID:41145486
|
研究论文 | 开发了一种名为SCSES的计算框架，用于在单细胞水平增强选择性剪接分析 | 通过数据扩散在相似细胞和事件间共享信息来推断和补全缺失的剪接变化 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序中准确表征剪接变化的挑战 | 单细胞剪接异质性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数据扩散算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2025-10-31 |
Hmox1 expression indicates distinct injury phenotypes of proximal tubule cells in sepsis-associated acute kidney injury
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05764-w
PMID:41145479
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，鉴定Hmox1作为脓毒症相关急性肾损伤中近端小管细胞损伤的特异性生物标志物 | 首次发现Hmox1高表达和低表达的近端小管细胞亚群在SAKI中表现出不同的表型特征 | NA | 识别SAKI诊断的特异性生物标志物并阐明其病理机制 | 肾组织中的近端小管细胞 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-31 |
SPP1+ macrophages promote colorectal cancer progression by activating JAK2/STAT3 signaling pathway
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21420-9
PMID:41145614
|
研究论文 | 本研究揭示SPP1+巨噬细胞通过激活JAK2/STAT3信号通路促进结直肠癌进展的机制 | 首次发现SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的极性改变通过JAK2/STAT3通路调控结直肠癌进展 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞极性改变对结直肠癌进展的影响及分子机制 | 结直肠癌细胞(MC38)和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞分选, 细胞共培养, CCK-8检测, TUNEL染色, 蛋白质印迹, 免疫荧光 | 小鼠结直肠癌模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-31 |
Intratumoral plasma cells predict patient prognosis and responsiveness to neoadjuvant immunotherapy in advanced gastric cancer
2025-Oct-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01071-9
PMID:41145683
|
研究论文 | 本研究通过多中心数据整合分析，开发了基于肿瘤内浆细胞的MZB1阳性评分系统，用于预测晚期胃癌患者对免疫治疗的预后和反应性 | 首次发现成熟三级淋巴结构是胃癌浸润浆细胞中体细胞超突变和克隆选择的关键位点，并建立了基于浆细胞浸润程度的MZB1阳性评分系统 | 研究依赖于胃镜活检组织，存在组织样本大小的固有局限性 | 开发新的生物标志物来预测胃癌患者对免疫治疗的反应和预后 | 晚期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,转录组测序 | NA | 组织样本,转录组数据,空间转录组数据 | 来自七个独立医疗中心的胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2025-10-31 |
KIAA1429-mediated M6A methylation inhibits osteoclast differentiation via stabilizing Lrp4 mRNA and protects against osteoporosis
2025-Oct-27, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00800-z
PMID:41146006
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研究论文 | 本研究探讨KIAA1429介导的m6A甲基化通过稳定Lrp4 mRNA抑制破骨细胞分化并预防骨质疏松的机制 | 首次揭示KIAA1429通过m6A-YTHDC1-LRP4-TNFAIP3轴抑制NF-κB信号通路的新机制 | 未明确说明样本规模及临床数据的具体来源 | 探究KIAA1429在骨质疏松及破骨细胞分化中的生物学功能及分子机制 | 骨质疏松患者临床样本、卵巢切除小鼠模型、破骨细胞 | 表观遗传学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, m6A甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2025-10-31 |
MX1 is a novel crucial prognostic and therapeutic target inducing chemoresistance in right-sided colon cancer: insights from machine learning-based multi-omics analysis
2025-Oct-27, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00840-8
PMID:41146251
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研究论文 | 本研究通过机器学习驱动的多组学分析，发现MX1是右侧结肠癌中诱导化疗耐药的关键预后和治疗靶点 | 首次将MX1鉴定为右侧结肠癌中与化疗耐药和肿瘤微环境失调密切相关的关键靶点，并揭示了其通过VEGFA-VEGFR2通路促进血管生成的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要更多体内实验和临床前研究来确认MX1的治疗潜力 | 识别和表征与右侧结肠癌进展和治疗反应相关的关键生物标志物 | 右侧结肠癌患者和结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结肠癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)，机器学习算法，单细胞RNA测序，qRT-PCR，免疫组化染色，CCK-8检测，transwell迁移实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，临床样本数据 | TCGA数据集和四个GEO数据集中的右侧结肠癌样本，临床样本验证 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-31 |
Integrative metaprogram analysis reveals transcriptional dysregulation of oxidative stress response in granulosa cells from polycystic ovary syndrome
2025-Oct-27, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01811-2
PMID:41146316
|
研究论文 | 通过整合元程序分析揭示多囊卵巢综合征颗粒细胞中氧化应激反应的转录失调 | 开发整合单细胞和批量RNA测序的元程序分析框架，首次在PCOS颗粒细胞中鉴定出10个转录元程序并发现GPX3作为连接氧化应激与代谢功能障碍的关键调控基因 | 研究依赖于公共数据集和实验室生成数据，需要进一步实验验证GPX3的功能机制 | 探究多囊卵巢综合征的分子机制，特别关注氧化应激相关通路 | 多囊卵巢综合征患者的颗粒细胞 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,微阵列 | 非负矩阵分解,加权基因共表达网络分析 | RNA测序数据,微阵列数据 | 包含GSE240688单细胞数据集、实验室批量RNA-seq数据集和GSE34526验证微阵列数据集，以及193个GTEx卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,微阵列 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-31 |
Osteopontin inhibitor alleviates neuroinflammation after subarachnoid hemorrhage in rats via TLR4/NF-κB pathway
2025-Oct-27, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究探讨骨桥蛋白抑制剂通过TLR4/NF-κB通路减轻大鼠蛛网膜下腔出血后神经炎症的作用 | 首次通过单细胞RNA测序发现SAH后颞叶组织SPP1(OPN)显著升高，并验证OPN抑制剂可通过TLR4/NF-κB通路改善神经炎症 | 研究仅使用大鼠模型，样本量未明确说明，缺乏临床验证 | 研究骨桥蛋白抑制剂对蛛网膜下腔出血后神经炎症的保护作用 | 蛛网膜下腔出血大鼠模型 | 神经科学 | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，脑立体定位注射 | 动物模型 | 基因表达数据，影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2025-10-31 |
scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations
2025-Oct-27, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.056
PMID:41161490
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研究论文 | 提出一种基于视觉迁移学习和表格到图像转换的标记基因细胞类型注释方法scMapNet | 结合掩码自编码器和视觉变换器，通过树状图转换利用细胞标记基因信息，并在大量未标记数据上进行预训练 | 未明确说明方法在特定细胞类型或组织中的局限性 | 开发能够充分学习细胞标记基因知识和未标记数据信息的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 掩码自编码器, 视觉变换器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2025-10-31 |
CAT1 modulates hepatic fibrosis via IL-6-mediated inflammatory and fibrogenic pathways in hepatic stellate cells
2025-Oct-27, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2025.120075
PMID:41161609
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研究论文 | 本研究探讨了阳离子氨基酸转运体1（CAT1）通过调控IL-6介导的炎症和纤维化通路在肝纤维化中的作用机制 | 首次揭示CAT1通过IL-6/JAK2/STAT3信号通路调控肝星状细胞活化，并证实CAT1-IL-6轴在肝纤维化中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未进行临床验证 | 阐明CAT1在肝纤维化中的作用机制及其与IL-6通路的关系 | 肝星状细胞（HSCs）、CCl4诱导的肝纤维化模型和非酒精性脂肪肝病（NAFLD）模型 | 生物信息学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、功能实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |