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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-05 |
Early events marking lung fibroblast transition to profibrotic state in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Apr-21, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02419-0
PMID:37085855
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学识别了特发性肺纤维化中成纤维细胞向促纤维化状态转变的早期事件 | 首次发现核糖体蛋白全局下调和铜结合蛋白显著上调标志着IPF转变,并识别了新的过渡性成纤维细胞亚群 | 研究样本量有限,且主要关注成纤维细胞而忽略了其他细胞类型在疾病进展中的作用 | 探究特发性肺纤维化中成纤维细胞从正常向促纤维化状态转变的早期分子事件 | 健康对照和IPF患者肺组织中的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序,免疫荧光检测 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫荧光图像 | 健康对照和IPF患者肺组织样本(上下肺叶) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-11-04 |
Short-chain fatty acids regulate T cell heterogeneity to alleviate recurrent spontaneous abortion
2025-Dec, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70155
PMID:40759431
|
研究论文 | 本研究探讨肠道微生物源性短链脂肪酸通过调节T细胞异质性改善复发性流产的机制 | 首次揭示短链脂肪酸通过GPR43受体调控CD4+ T细胞分化在复发性流产中的作用机制,并开发了结肠靶向短链脂肪酸纳米递送系统 | 动物模型与人类病理生理存在差异,临床转化需要进一步验证 | 探究肠道微生物代谢产物短链脂肪酸在复发性流产免疫耐受中的作用 | 复发性流产患者和小鼠模型 | 免疫学 | 复发性流产 | 单细胞测序, 16S rDNA测序, 粪便微生物移植, 分子生物学方法 | NA | 单细胞数据, 微生物组数据 | 复发性流产患者和小鼠模型 | NA | 单细胞测序, 16S rDNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-11-04 |
Single-cell aneuploidy and chromosomal arm imbalances define subclones with divergent transcriptomic phenotypes
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf138
PMID:41179709
|
研究论文 | 开发了一种整合单细胞RNA测序和DNA测序的计算框架scAlign,用于在单个细胞分辨率下定义亚克隆细胞表型 | 开发了scAlign计算框架,首次实现了在单个细胞水平上整合scRNA-seq和scDNA-seq数据,通过基因剂量分析将细胞分配到特定亚克隆 | 仅使用G0/G1期细胞进行分析,可能忽略了其他细胞周期阶段的亚克隆特征 | 研究癌症中亚克隆的转录组表型差异 | 原发性和转移性癌症样本 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序, 多组学整合分析 | scAlign计算框架 | 单细胞基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell DNA-seq, single-cell multi-omics | NA | NA |
| 44 | 2025-11-04 |
Spatial Multiomics Defines a Shared Tumor Infiltrative Signature at the Resection Margin in High-Grade Gliomas
2025-Nov-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4708
PMID:40759029
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术定义了高级别胶质瘤切除边缘共享的肿瘤浸润特征 | 首次结合单核RNA测序、单核ATAC测序和空间转录组学技术,系统分析高级别胶质瘤核心区与边缘区的分子特征差异 | 样本数量有限(4例单核测序+2例空间转录组学),需要更大规模验证 | 揭示高级别胶质瘤切除边缘残留疾病的生物学特征 | 高级别胶质瘤患者手术切除的核心区和边缘区组织 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, CRISPR/Cas9基因编辑, 染色质免疫共沉淀测序 | 计算分析包括功能富集、差异分析、RNA速度和伪时间分析 | 基因组学数据, 表观基因组学数据, 空间转录组数据 | 4例不同分子亚型的4级高级别胶质瘤(36,811个单核RNA测序和30,705个单核ATAC测序核), 外加2例空间转录组学样本 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, 多组学整合 | NA | NA |
| 45 | 2025-11-04 |
Neoadjuvant Immunotherapy Promotes the Formation of Mature Tertiary Lymphoid Structures in a Remodeled Pancreatic Tumor Microenvironment
2025-Nov-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0387
PMID:40815230
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学分析揭示了新辅助免疫治疗在胰腺癌中促进成熟三级淋巴结构形成及肿瘤微环境重塑的机制 | 首次构建了接受新辅助免疫治疗的胰腺癌患者肿瘤和淋巴结的空间多组学图谱,并发现三级淋巴结构特异性空间基因表达特征与患者生存改善显著相关 | 研究样本量有限,且主要关注特定免疫治疗方案下的反应机制 | 探究三级淋巴结构在胰腺癌免疫治疗中的作用及其在肿瘤微环境中的空间关系 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织和肿瘤邻近淋巴结 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 成像质谱流式技术, 空间转录组学 | 机器学习分类模型, 无监督学习 | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2025-11-04 |
Cytotoxic CD8+ T Cells Downregulate GPX4 to Promote Ferroptosis in Melanoma That Drives Antitumor Immunity
2025-Nov-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1952
PMID:40828991
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD8+ T细胞通过下调GPX4促进黑色素瘤铁死亡,从而驱动抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示CD8+ T细胞通过直接接触下调GPX4表达诱导肿瘤细胞铁死亡的新机制 | 主要基于小鼠模型,人类数据验证仍需进一步研究 | 探究铁死亡在抗肿瘤免疫中的作用机制 | 小鼠黑色素瘤模型和人类黑色素瘤样本 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成功和不成功免疫反应的小鼠黑色素瘤样本及人类黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-11-04 |
Evaluation of Proton Minibeam Radiotherapy on Antitumor Immune Responses in a Rat Model of Glioblastoma
2025-Nov-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0902
PMID:40833465
|
研究论文 | 评估质子微束放疗在胶质母细胞瘤大鼠模型中对抗肿瘤免疫反应的影响 | 首次在临床前胶质母细胞瘤模型中系统研究质子微束放疗的免疫调节作用,发现其比传统质子疗法更能有效增加肿瘤内淋巴细胞密度 | 研究基于大鼠模型,结果向人类临床应用的转化需进一步验证 | 探索质子微束放疗对抗肿瘤免疫反应的影响机制 | 胶质母细胞瘤大鼠模型 | 放射肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 临床前大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-11-04 |
Identification of a CD138-Negative Therapy-Resistant Subpopulation in Multiple Myeloma with Vulnerability to Splicing Factor Inhibition
2025-Nov-03, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-24-0340
PMID:40890913
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别多发性骨髓瘤中CD138阴性的耐药亚群及其对剪接因子抑制的敏感性 | 发现CD138阴性多发性骨髓瘤细胞中存在耐药亚群,并首次揭示该亚群对剪接通路抑制具有特异性脆弱性 | 研究样本量有限,耐药机制需进一步验证 | 探索多发性骨髓瘤治疗抵抗的分子机制 | 从患者骨髓中纯化的原代多发性骨髓瘤细胞 | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, VDJ靶向测序, CRISPR/Cas9筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-11-04 |
Depletion of Sorcs3 Activates Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells by Modulating Key Signaling Pathways
2025-Nov-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509151
PMID:41178446
|
研究论文 | 通过敲除Sorcs3基因激活小鼠胚胎干细胞全能性并揭示相关信号通路机制 | 首次发现Sorcs3缺失可诱导胚胎干细胞获得全能性状态,并阐明Tfap2c基因和特定信号通路在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞模型,尚未在人类细胞中验证 | 建立可持续的全能性干细胞并研究其调控机制 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 基因敲除、单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-11-04 |
Vasculogenic Precedes Neurogenic Differentiation in Dental Pulp Stem Cells
2025-Nov-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251379776
PMID:41178677
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了牙髓干细胞分化过程中血管生成先于神经生成的时间顺序 | 首次在单细胞水平证明牙髓干细胞在体内分化时血管生成先于神经生成的时间顺序 | 研究样本量有限,且仅在免疫缺陷小鼠模型中进行验证 | 探究人牙髓干细胞的分化机制和时序 | 人牙髓干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 动物移植模型 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-11-04 |
Adipocyte death promotes hepatic infiltration of S100A8+ macrophages and steatotic liver disease progression in mice
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190635
PMID:41178716
|
研究论文 | 本研究揭示脂肪细胞死亡通过诱导S100A8+巨噬细胞肝脏浸润促进代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 | 首次发现脂肪细胞死亡通过释放细胞外囊泡和脂肪酸诱导S100A8+巨噬细胞在肝脏积累,并通过CCN3-CD36通路促进肝细胞脂质储存 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床样本中验证 | 探究脂肪细胞死亡后促进肝细胞脂肪积累和MASLD进展的分子机制 | 基因修饰小鼠模型 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-11-04 |
Integrative Multi-Omics Analysis Prioritizes Candidate Genes for Essential Tremor and Reveals a Gap Between Computational Prediction and Experimental Validation
2025-Nov-03, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.70101
PMID:41178806
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研究论文 | 本研究通过多阶段计算框架识别原发性震颤的高置信度候选基因,并评估计算预测与实验验证之间的差异 | 开发了整合多组学数据的计算框架,提出了原发性震颤的皮质假说,揭示了计算预测与实验验证之间的关键差距 | 在死后小脑组织中未发现显著差异表达,计算预测与实验验证存在不一致 | 识别原发性震颤的效应基因以阐明疾病机制并开发靶向治疗 | 原发性震颤患者和对照组的基因组和转录组数据 | 生物信息学 | 原发性震颤 | GWAS, TWAS, 孟德尔随机化, 共表达网络分析, 空间转录组学 | 多阶段计算框架 | 基因组数据, 转录组数据 | 两个独立的死后脑组织数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 53 | 2025-11-04 |
New advances on the interaction between internal and external factors in the tumor microenvironment of solid tumors
2025-Nov-02, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2585349
PMID:41177968
|
综述 | 本文综述了实体瘤微环境中内外因素相互作用的最新研究进展,重点关注肿瘤免疫逃逸、代谢重编程和神经免疫等领域 | 整合单细胞测序和空间肿瘤学技术揭示肿瘤微环境中细胞间相互作用的复杂细节,为联合免疫治疗提供新思路 | NA | 寻求突破实体瘤免疫治疗瓶颈的联合治疗方案设计 | 实体瘤肿瘤微环境 | 空间肿瘤学 | 实体瘤 | 单细胞测序, 空间肿瘤学技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-11-04 |
Molecular and cellular morphology of placenta unveils new mechanisms of reproductive immunology
2025-Nov, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.01.025
PMID:39842636
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研究论文 | 通过空间转录组学和多色免疫组化等技术研究胎盘分子和细胞形态,揭示生殖免疫新机制 | 发现胚胎滋养细胞在植入前就表达免疫检查点蛋白,揭示母胎界面存在免疫排斥与抑制的平衡机制 | NA | 研究人类生殖过程中胎盘细胞和分子特征的免疫调控机制 | 正常和异位妊娠胎盘组织及动物模型 | 生殖免疫学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学,多重免疫组织化学,免疫组化-荧光原位杂交双标记 | NA | 空间转录组数据,组织图像,蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2025-11-04 |
Improving predictive accuracy in multiple myeloma using a plasma cell profile derived from single-cell RNA sequencing
2025-Nov-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.287586
PMID:40438979
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序开发多发性骨髓瘤血浆细胞特征谱,建立集成风险分层模型以提高预后预测准确性 | 首次在单细胞分辨率识别出具有染色体不稳定、高耐药性和高危基因特征的侵袭性骨髓瘤细胞亚群,并基于此开发七基因特征评分 | 样本量较小(12例新诊断患者),需要在更大队列中进一步验证 | 改善多发性骨髓瘤的风险分层和预后预测 | 多发性骨髓瘤患者及其肿瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,数字PCR | Cox比例风险模型,集成风险分层模型 | 单细胞RNA测序数据,临床数据 | 12例新诊断多发性骨髓瘤患者,并在5个独立数据集中验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-11-04 |
Clinical application of single-cell RNA sequencing in disease and therapy
2025-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70512
PMID:41169094
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综述 | 系统概述单细胞RNA测序技术在疾病机制研究和临床应用中的进展 | 整合单细胞与空间转录组技术,结合人工智能和机器学习算法分析大数据 | 存在技术挑战和数据分析障碍 | 探讨单细胞RNA测序在疾病研究和精准医疗中的应用 | 人类疾病中的体细胞进化、生物标志物发现和药物开发 | 自然语言处理 | 多种疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 57 | 2025-11-02 |
Parental Specific Expression by scRNA-Seq Reveals HaWRKY40 Contributing to Heterosis of Sunflower
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70266
PMID:41170640
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2025-11-04 |
Integrated analysis identifies CD276 in fibroblasts as a malignancy predictor and regulator of neutrophil infiltration in hepatoblastoma
2025-Nov-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000826
PMID:41171428
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研究论文 | 本研究通过整合分析发现成纤维细胞中的CD276是肝母细胞瘤恶性程度的预测因子和中性粒细胞浸润的调节因子 | 首次系统表征CD276在肝母细胞瘤中的表达谱,发现其在癌相关成纤维细胞中高表达,并揭示其通过调节CXCL2调控中性粒细胞浸润的新机制 | 研究样本量有限,机制研究主要在动物模型中进行,需要更多临床验证 | 探究免疫检查点配体CD276在肝母细胞瘤中的临床意义及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 肝母细胞瘤患者组织和细胞,小鼠模型 | 生物信息学,肿瘤免疫学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,多重免疫组织化学,去卷积分析,相关性分析 | 逻辑回归模型,风险评分模型,列线图 | RNA-seq数据,单细胞RNA-seq数据,图像数据 | 肝母细胞瘤患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-11-04 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals a metastasis-associated PCSK1+ neuroendocrine subpopulation in pancreatic neuroendocrine tumors
2025-Nov, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70084
PMID:40817830
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现胰腺神经内分泌肿瘤中与转移相关的PCSK1+神经内分泌亚群 | 首次在胰腺神经内分泌肿瘤中鉴定出富含于肝转移灶的PCSK1+神经内分泌亚群,并揭示其高拷贝数变异负荷、低分化潜能和独特的转录调控特征 | 基于公开数据库的回顾性分析,样本量有限(27个样本),需要后续实验验证机制 | 探索胰腺神经内分泌肿瘤中神经内分泌细胞的异质性及其与转移的关系 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者组织样本(包括癌旁正常组织、原发肿瘤和肝转移灶) | 单细胞组学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 拷贝数变异分析, 伪时间轨迹分析, 转录调控网络分析, 细胞间通讯分析 | CytoTRACE2, Monocle3, SCENIC, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 27个样本(包括正常组织、原发肿瘤和肝转移灶) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-11-04 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies a Novel OLR1+ SLC7A7+ Liver-Enriched Metastatic Subset With Immunometabolic Rewiring in Pancreatic Cancer
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71345
PMID:41176774
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定胰腺癌肝转移中具有免疫代谢重编程特征的新型OLR1+SLC7A7+肝脏富集转移亚群 | 首次发现并表征了胰腺癌肝转移中独特的终末分化恶性细胞亚群LEMS,揭示了其代谢重编程和免疫抑制通路超活化特征 | 需要扩大临床队列和建立体内模型来全面阐明LEMS与巨噬细胞之间的具体机制性相互作用 | 识别驱动PDAC肝转移的关键细胞亚群,阐明其与转移微环境的相互作用,定义肝脏定植的潜在机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)原发肿瘤和肝转移患者的临床样本 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PDAC原发肿瘤和肝转移患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |