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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-16 |
Age-impaired remyelination is associated with dysregulated microglial transitions
2025-Nov-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64906-w
PMID:41224757
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脱髓鞘小鼠模型中微胶质细胞在髓鞘再生过程中的反应 | 发现髓鞘再生早期存在多种不同的微胶质细胞状态,这些状态最终汇聚为包含髓鞘转录物的解决状态,且该状态也存在于多发性硬化症患者大脑中 | 研究基于小鼠模型,结果向人类应用的转化需要进一步验证 | 探究年龄相关的髓鞘再生障碍与微胶质细胞状态转变失调的关联 | 小鼠模型中的微胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-11-16 |
HPCAL1 as a novel prognostic biomarker in acute myeloid leukemia and its correlation with immune infiltrates
2025-Nov-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23386-0
PMID:41224963
|
研究论文 | 本研究探讨HPCAL1作为急性髓系白血病新型预后生物标志物的潜力及其与免疫浸润的关联 | 首次将钙结合蛋白HPCAL1确立为AML的新型预后指标,并揭示其通过免疫微环境调节和单核细胞群体动态介导不良预后的机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来阐明HPCAL1在AML发病机制中的具体作用 | 探索HPCAL1在急性髓系白血病中的预后价值及其与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 急性髓系白血病患者样本和多个独立队列数据集 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA测序,单细胞RNA测序,ESTIMATE分析,GSEA/GSVA分析 | 共表达网络分析,蛋白质相互作用分析 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 多个独立队列(GSE13159,GSE34184,GSE24395,机构数据和GSE130756单细胞数据集) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-11-16 |
The landscape of dynamic tumor immunophenotyping on neoadjuvant chemotherapy combined with trastuzumab for the treatment of HER2-positive breast cancer
2025-Nov-12, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02483-8
PMID:41225463
|
研究论文 | 本研究通过空间表达谱分析探索HER2阳性乳腺癌新辅助化疗联合曲妥珠单抗治疗期间肿瘤微环境的动态免疫表型变化 | 首次在HER2阳性乳腺癌中建立与治疗疗效相关的动态免疫表型分类系统,并验证其在多个数据集中的可重复性 | 样本量相对有限(28例患者),需要更大规模研究验证 | 探索HER2阳性乳腺癌新辅助化疗联合靶向治疗期间肿瘤微环境动态变化与病理完全缓解的关系 | 28例HER2阳性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间表达谱分析,DSP技术 | NA | 空间转录组数据,单细胞数据 | 28例患者的94个感兴趣区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 44 | 2025-11-16 |
THBS1high macrophages promote aortic aneurysm formation by orchestrating an inflammatory and smooth muscle cell phenotypic transition program in vascular Behçet's disease
2025-Nov-12, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04434-y
PMID:41225543
|
研究论文 | 本研究揭示了THBS1高表达巨噬细胞通过协调炎症反应和平滑肌细胞表型转换促进白塞病血管动脉瘤形成的机制 | 首次鉴定出THBS1高表达巨噬细胞在血管白塞病中的关键作用,并阐明其通过ETS2和TNF-α介导的机制促进动脉瘤形成 | 研究样本量有限,动物模型为CaCl2诱导的人源化模型,与真实疾病环境存在差异 | 阐明血管白塞病动脉瘤形成的细胞分子机制 | 血管白塞病患者主动脉组织、巨噬细胞、平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 血管白塞病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色, 批量RNA测序, 共培养系统 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 基因表达数据 | 血管白塞病患者主动脉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-11-16 |
DAPK1 identified as a novel biomarker for colorectal cancer liver metastasis
2025-Nov-12, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04037-w
PMID:41225570
|
研究论文 | 本研究通过机器学习与多组学分析鉴定DAPK1作为结直肠癌肝转移的新型生物标志物 | 首次通过整合机器学习算法与单细胞多组学技术系统鉴定DAPK1在结直肠癌肝转移中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 发现结直肠癌肝转移的新型生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌肝转移组织和LoVo细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, CRISPR/Cas9基因编辑 | Lasso回归, SVM, 随机森林 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-11-16 |
Single-cell RNA sequencing and in vitro validation reveal risankizumab induces anti-inflammatory macrophage polarization in psoriasis
2025-Nov-12, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03346-0
PMID:41225578
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和体外实验验证瑞莎珠单抗在银屑病中诱导抗炎巨噬细胞极化的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和体外实验系统揭示瑞莎珠单抗通过调控巨噬细胞极化发挥治疗作用 | 研究主要基于公共数据库数据和体外细胞实验,缺乏体内实验验证 | 探索瑞莎珠单抗治疗银屑病的潜在治疗机制 | 银屑病患者单细胞测序数据和THP-1单核细胞分化的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, ELISA, CCK-8检测 | Seurat, Harmony, Monocle2 | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | 97,434个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-11-16 |
Neurogenic inducers inhibit the proliferation of pancreatic cancer by promoting tumor cell transdifferentiation
2025-Nov-12, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03563-9
PMID:41225636
|
研究论文 | 本研究通过诱导胰腺癌细胞转分化来降低其恶性程度 | 发现NeuroD1转录因子可促进胰腺癌细胞向神经元转分化并抑制增殖,鉴定出神经诱导剂Neuropathiazol通过MET-PI3K/Akt通路上调NeuroD1 | NA | 研究诱导胰腺癌细胞转分化是否能降低恶性肿瘤性 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞 | 单细胞测序分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,免疫共沉淀,质谱分析,分子对接 | NA | 单细胞RNA-seq数据,RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-11-16 |
Single-cell transcriptome analysis profiles the enlarged subsets of myeloid-biased HSPCs with preleukemic characters in disuse osteoporosis mice
2025-Nov-12, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01499-3
PMID:41225641
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了废用性骨质疏松小鼠中具有白血病前特征的髓系偏向造血干祖细胞亚群的扩增机制 | 首次发现骨质疏松可诱导髓系偏向造血并鉴定出具有染色质重塑增强、分化减少和凋亡抵抗特征的特异性HSPC亚群 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究骨质疏松条件下髓系偏向造血的发生机制及其与白血病发生的关系 | 废用性骨质疏松小鼠模型的造血干祖细胞 | 单细胞组学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 骨质疏松小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-11-16 |
Characteristics linking ischemia-reperfusion to chronic lung allograft dysfunction in lung transplantation: A single-cell bioinformatics analysis
2025-Nov-12, Transplant immunology
IF:1.6Q3
DOI:10.1016/j.trim.2025.102326
PMID:41232781
|
研究论文 | 通过单细胞生物信息学分析揭示肺移植中缺血再灌注损伤与慢性肺移植物功能障碍之间的细胞和分子联系 | 首次整合多个单细胞RNA-seq数据集,系统描绘了IRI向CLAD转变过程中细胞群体动态变化、铜死亡机制和巨噬细胞-肌成纤维细胞转分化 | 研究结果需要在动物模型和临床样本中进一步验证 | 探索肺移植中缺血再灌注损伤与慢性肺移植物功能障碍之间的分子机制 | 肺移植患者的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 肺移植相关并发症 | 单细胞RNA测序 | Louvain聚类,UMAP可视化,Augur方法,轨迹分析,pySCENIC | 单细胞转录组数据 | 整合GSE220797和GSE224210数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-11-16 |
scRNA-Sequencing Reveals Bu-Shen-Yi-Qi Formula (BSYQF) Ameliorates Airway Remodeling via Regulating Imbalanced M1/M2 Macrophage Subtypes in Chronic Asthmatic Mice
2025-Nov-12, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120883
PMID:41237867
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示补肾益气方通过调节M1/M2巨噬细胞亚型失衡改善慢性哮喘小鼠气道重塑的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示补肾益气方通过调节巨噬细胞极化平衡改善哮喘气道重塑的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证 | 探究补肾益气方治疗慢性哮喘的分子作用机制 | 慢性哮喘小鼠模型 | 单细胞测序分析 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, qRT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 组织图像数据 | 8个小鼠肺组织样本,超过60,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-11-16 |
Spatial transcriptomics and proteomics of mycosis fungoides biopsies from skin of color patients reveal biomarkers and potential treatment targets
2025-Nov-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.608
PMID:41237899
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2025-11-16 |
SIRT1 inhibits ferroptosis of granulosa cells in polycystic ovarian syndrome
2025-Nov-12, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148931
PMID:41237881
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证发现SIRT1通过Nrf2去乙酰化抑制多囊卵巢综合征中颗粒细胞的铁死亡 | 首次揭示SIRT1通过Nrf2去乙酰化途径抑制颗粒细胞铁死亡的新机制 | NA | 探究铁死亡相关基因在多囊卵巢综合征中的作用机制 | 多囊卵巢综合征患者的颗粒细胞 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序,分子对接,免疫共沉淀 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-11-16 |
SpatialFusion: A unified model for integrating spatial transcriptomics to unveil cell-type distribution, interaction, and functional heterogeneity in tissue microenvironments
2025-Nov-12, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169535
PMID:41237948
|
研究论文 | 提出了一种名为SpatialFusion的深度学习模型,通过整合基因表达和空间坐标来改进空间域识别和细胞类型反卷积 | 使用图神经网络和注意力机制通过空间数据的多维嵌入捕获复杂空间关系,采用双编码策略(空间图和特征图协同学习)和自监督对比学习 | NA | 提高空间转录组学中空间域识别和细胞类型反卷积的准确性、鲁棒性和计算效率 | 人类DLPFC数据集和乳腺癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图神经网络(GNN), 注意力机制, 深度学习 | 基因表达数据, 空间坐标数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 54 | 2025-11-16 |
SPINK1-Driven cellular heterogeneity and interaction Networks in intrahepatic cholangiocarcinoma revealed by integrated multi-omics analysis
2025-Nov-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.11.011
PMID:41238039
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示SPINK1驱动的肝内胆管癌细胞异质性和相互作用网络 | 发现SPINK1-CCL20-LAMs轴通过调节免疫细胞招募和代谢重编程促进肿瘤生长的新机制 | 研究样本量有限,需要进一步验证SPINK1作为治疗靶点的临床可行性 | 解析肝内胆管癌的细胞异质性和细胞间相互作用,重点关注SPINK1过表达上皮亚群的作用 | 人类肝内胆管癌肿瘤组织和癌旁正常组织 | 单细胞组学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析,Transwell实验,共培养系统,功能扰动实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | 人类ICC肿瘤和癌旁组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-11-16 |
Clinical and translational study of ivosidenib plus nivolumab in advanced solid tumors harboring IDH1 mutations
2025-Nov-11, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyaf362
PMID:41138165
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研究论文 | 本研究评估了ivosidenib联合nivolumab在携带IDH1突变的晚期实体瘤患者中的初步疗效和安全性 | 首次在临床试验中评估IDH1抑制剂与抗PD1抗体联合治疗在IDH1突变实体瘤中的应用,并采用空间转录组学等先进技术进行转化研究 | 样本量较小(仅15例患者),临床获益有限 | 评估ivosidenib联合nivolumab在IDH1突变晚期实体瘤中的疗效和安全性 | 携带IDH1突变的晚期或难治性实体瘤患者 | 临床肿瘤学 | 实体瘤 | 药效学、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 临床数据、蛋白质组数据、转录组数据 | 15例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 56 | 2025-11-16 |
Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.013
PMID:41175876
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肾细胞癌肿瘤免疫微环境中干扰素信号的作用机制 | 建立了推断细胞因子信号效应的推断模型框架,发现髓系细胞是干扰素驱动免疫治疗抵抗的关键介质 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证机制 | 研究干扰素信号在肾细胞癌免疫治疗抵抗中的作用机制 | 肾细胞癌患者的肿瘤免疫微环境细胞 | 单细胞分析 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞转录组数据 | 临床试验队列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-11-16 |
ELLA: modeling subcellular spatial variation of gene expression within cells in high-resolution spatial transcriptomics
2025-Nov-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64867-0
PMID:41219206
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研究论文 | 提出一种名为ELLA的统计框架,用于建模亚细胞mRNA定位并检测细胞内空间变异基因 | 使用过度分散的非均匀泊松过程建模空间计数数据,并采用统一细胞坐标系适应不同细胞形态 | NA | 开发用于高分辨率空间转录组学的亚细胞空间表达分析工具 | 亚细胞水平基因表达空间变异 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 过度分散非均匀泊松过程 | 空间计数数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2025-11-16 |
Characterizing stroke-related cellular changes in the surviving neurons of mouse ischemic stroke
2025-Nov-11, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106086
PMID:41223896
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研究论文 | 本研究通过单核和单细胞RNA测序技术,表征了小鼠缺血性中风后存活神经元的细胞和分子变化 | 首次结合snRNA-seq和scRNA-seq技术系统分析缺血性中风急性和亚急性期的细胞状态变化,揭示了SynGAP1-PSD-95解离在缺血损伤中的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,样本量相对有限,未在人类样本中验证 | 阐明缺血性中风后神经元存活和死亡的分子机制 | C57BL/6小鼠的脑组织细胞 | 单细胞基因组学 | 缺血性中风 | 单核RNA测序(snRNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫组织化学 | NA | RNA测序数据, 图像数据 | C57BL/6小鼠分组:对照组、假手术组、dMCAO 3天组、dMCAO 14天组 | NA | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2025-11-16 |
Unraveling the therapeutic potential of triptolide in glioma: Orchestrating apoptosis and immune landscape remodeling
2025-Nov-07, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2025.150039
PMID:41205732
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研究论文 | 本研究探讨雷公藤甲素通过调控凋亡相关基因和重塑免疫微环境发挥抗胶质瘤作用的机制 | 首次整合转录组学、免疫浸润分析和单细胞RNA测序系统揭示雷公藤甲素在胶质瘤中的双重作用机制 | 研究机制尚未完全阐明,需要更多体内实验验证 | 探索雷公藤甲素在胶质瘤治疗中的潜在作用机制 | 胶质瘤细胞和肿瘤免疫微环境 | 生物医学研究 | 胶质瘤 | 转录组分析,单细胞RNA测序,免疫组化,qPCR | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据,蛋白质表达数据 | GSE147352数据集和实验验证样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-11-16 |
Unveiling tissue heterogeneity through genomic interaction-encoded image representation of RNA-sequencing data
2025-Nov-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.08.021
PMID:40967222
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研究论文 | 提出一种基于基因组交互编码图像表示的RNA测序数据分析框架,用于改进组织异质性分析 | 利用基因组交互编码的图像表示方法,结合样本特异性基因表达变异性,通过卷积变分自编码器和高斯混合模型推导特征模式 | 未明确说明方法在特定组织类型或疾病中的适用性限制 | 开发改进的细胞组分分析方法,用于组织异质性研究和下游生物医学应用 | RNA测序数据,特别是批量RNA测序样本 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序,单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 卷积变分自编码器,高斯混合模型 | 基因表达数据,图像表示 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |