单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28588 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-06-10 |
sEV-mediated intercellular transformation from MGAT4AHigh to MGAT4ALow tumor cells via the HOTAIRM1/miR-196b-5p axis promotes apoptosis resistance in CTCL
2025-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03356-6
PMID:40155530
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研究论文 | 该研究揭示了sEV介导的MGAT4A高表达与低表达肿瘤细胞间通过HOTAIRM1/miR-196b-5p轴促进CTCL中凋亡抗性的机制 | 首次发现HOTAIRM1/miR-196b-5p/MGAT4A轴在CTCL中的调控作用，并开发了工程化sEVs用于靶向治疗 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究CTCL中凋亡抗性的分子机制并开发靶向治疗策略 | 皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)细胞和良性CD4+T细胞 | 肿瘤生物学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 全转录组测序、scRNA-Seq | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 |
| 42 | 2025-06-10 |
Mitochondrial genetic landscape and its correlation with immune cell infiltration in preeclampsia: Insights from bioinformatics
2025-Jun, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2025.104527
PMID:40203595
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研究论文 | 通过生物信息学方法研究线粒体相关基因与子痫前期（PE）的关联及其与免疫细胞浸润的相关性 | 识别了五个关键线粒体相关基因（MOCS1、CYP11A1、GATM、SFXN3和BCL2L11），并发现它们与PE的诊断准确性及免疫细胞浸润相关，其中CYP11A1可能是HELLP综合征的潜在生物标志物 | 研究依赖于公开的基因表达数据集，可能受限于样本量和数据质量 | 探索线粒体相关基因在子痫前期中的作用及其调控机制 | 子痫前期（PE）患者及其胎盘组织 | 生物信息学 | 子痫前期 | LASSO回归分析、基因集富集分析（GSEA）、单细胞测序分析、免疫荧光染色 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集（GSE114691、GSE190971、GSE75010、GSE25906） |
| 43 | 2025-06-10 |
The spatial and single-cell landscape of skin: Charting the multiscale regulation of skin immune function
2025-Jun, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2025.101958
PMID:40267702
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在揭示皮肤免疫功能的分子和细胞特征方面的应用 | 利用scRNA-seq和ST技术，系统性地研究了皮肤免疫功能的分子和细胞特征，揭示了细胞类型在维持稳态和疾病中的功能差异 | NA | 探讨皮肤免疫功能的分子和细胞特征及其在健康和疾病中的作用 | 皮肤免疫细胞及其空间组织 | 生物信息学 | 皮肤疾病 | scRNA-seq, ST | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA |
| 44 | 2025-05-10 |
Insights and perspectives on the role of APOC1 inhibition in modulating immunotherapy outcomes in HCC: Commentary on Inhibition of APOC1 promotes the transformation of M2 into M1 macrophages via the ferroptosis pathway and enhances anti-PD1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma based on single-cell RNA sequencing
2025-Jun, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103564
PMID:40339430
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2025-06-10 |
Spatial Transcriptomics Shows a Distinctive Tumour Microenvironment in the Invasive Versus Premalignant Portion of Early Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2025-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70125
PMID:40462294
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研究论文 | 通过空间转录组学技术研究早期皮肤鳞状细胞癌（SCC）侵袭部分与前恶性部分的肿瘤微环境差异 | 首次使用NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler（DSP）技术对早期皮肤SCC的侵袭和前恶性部分的基因表达模式进行空间转录组学比较 | 样本量较小（17例患者），且为回顾性研究 | 探究皮肤SCC从前期病变（AK）向恶性转变过程中肿瘤微环境的基因表达变化 | 早期皮肤SCC组织样本中的肿瘤细胞、免疫细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学（NanoString GeoMx DSP） | NA | 基因表达数据 | 17例早期皮肤SCC患者的组织样本 |
| 46 | 2025-06-10 |
DDR2-mediated autophagy inhibition contributes to angiotensin II-induced adventitial remodeling
2025-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70361
PMID:40468620
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研究论文 | 研究DDR2在血管紧张素II诱导的外膜重塑中通过抑制自噬促进成纤维细胞表型转换的作用 | 揭示了DDR2通过PI3K/Akt/mTOR通路抑制自噬，进而促进成纤维细胞表型转换和外膜重塑的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究DDR2在血管紧张素II诱导的外膜重塑中的作用机制 | 血管外膜成纤维细胞(AFs) | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 野生型小鼠(具体数量未明确说明) |
| 47 | 2025-06-10 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Defines N7-Methylguanosine (m7G)-Mediated Modifications' Role in Prognosis and the Tumor Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jun, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70992
PMID:40485623
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research paper | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据，研究N7-甲基鸟苷（m7G）修饰在肝细胞癌预后和肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次系统性地分析了m7G修饰在肝细胞癌中的临床特征、预后、肿瘤免疫微环境及免疫治疗敏感性方面的作用，并开发了m7Gscore评分系统 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分相对有限 | 探索m7G修饰在肝细胞癌中的作用及其临床意义 | 肝细胞癌患者 | digital pathology | hepatocellular carcinoma | scRNA-seq, RNA-seq, ssGSEA, GSVA, PCA, western blot, immunohistochemical assays, RT-qPCR | unsupervised clustering, principal component analysis | RNA sequencing data, protein and mRNA expression data | 来自GEO、TCGA和ICGC数据库的多个数据集，具体样本数量未明确说明 |
| 48 | 2025-06-10 |
Long Noncoding RNA Interleukin 6 Antisense RNA 1 Promotes Inflammatory Effects in Lung Macrophages via Exosomes Through the S100A9/TLR4 Pathway in Chronic Obstructive Pulmonary Disease Progression
2025-Jun, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70204
PMID:40487749
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研究论文 | 本研究探讨了长链非编码RNA IL6-AS1在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的作用及其通过外泌体介导的S100A9/TLR4通路促进肺部炎症的机制 | 首次揭示了IL6-AS1通过外泌体介导的S100A9/TLR4通路促进肺部炎症的新机制，并发现paquinimod可以阻断这一效应 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人类患者中进行验证 | 探究IL6-AS1在COPD发病机制中的作用及其潜在治疗靶点 | 小鼠COPD模型、COPD患者样本、肺成纤维细胞-巨噬细胞共培养系统 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、AAV介导的基因表达 | 小鼠COPD模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，包括小鼠模型和COPD患者样本 |
| 49 | 2025-06-10 |
Cardiac Fibroblasts regulate myocardium and coronary vasculature development via the collagen signaling pathway
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.11.612512
PMID:39314489
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研究论文 | 本研究通过RNA染色和单细胞mRNA测序技术，揭示了心脏成纤维细胞通过胶原信号通路调控心肌和冠状血管发育的机制 | 首次系统性地揭示了心脏成纤维细胞通过胶原信号通路调控心肌细胞和血管内皮细胞发育的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类心脏发育中进行验证 | 探究心脏成纤维细胞在心肌和冠状血管发育中的作用机制 | 心脏成纤维细胞、心肌细胞和血管内皮细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | RNA染色、单细胞mRNA测序(scRNA-seq)、Pdgfra-CreER控制的DTA系统 | NA | 基因表达数据 | 不同发育阶段的小鼠心脏组织 |
| 50 | 2025-06-10 |
Longitudinal scRNA-seq of retinal organoids derived from Stargardt disease patient with ABCA4 mutation
2025-May-27, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05079-5
PMID:40425564
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研究论文 | 本研究通过从携带ABCA4基因突变的Stargardt病患者诱导多能干细胞(iPSCs)生成视网膜类器官，并进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)，以研究Stargardt病的发病机制 | 使用患者来源的iPSCs生成视网膜类器官，并进行纵向scRNA-seq分析，为研究Stargardt病提供了新的模型和数据集 | 研究仅针对中国STGD患者中最常见的ABCA4变异，可能无法涵盖所有突变类型 | 研究Stargardt病(ABCA4基因突变相关)的发病机制和视网膜发育过程 | 从患者iPSCs生成的视网膜类器官 | 遗传病研究 | Stargardt病(遗传性视网膜变性) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 诱导多能干细胞(iPSCs)技术 | 视网膜类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 多个发育阶段(40, 90, 150, 200和260天)的视网膜类器官样本 |
| 51 | 2025-06-10 |
Selective GSK3α Inhibition Promotes Self-Renewal Across Different Stem Cell States
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.653860
PMID:40463072
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研究论文 | 本文研究了选择性抑制GSK3α如何通过BRD0705促进不同类型干细胞（包括小鼠胚胎干细胞、外胚层干细胞和神经干细胞）的长期自我更新 | 发现选择性抑制GSK3α（而非泛GSK3α/β抑制）能独立于β-catenin信号通路促进干细胞的自我更新，并开发了一种BRD0705/IWR1混合培养系统，可稳定共培养多种多能干细胞状态 | 研究主要基于小鼠干细胞模型，尚未在人类干细胞中验证 | 探索GSK3α选择性抑制对干细胞自我更新的调控机制 | 小鼠胚胎干细胞（ESCs）、外胚层干细胞（EpiSCs）和神经干细胞（NSCs） | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、表观基因组分析、功能实验 | NA | 转录组数据、表观基因组数据 | 多种小鼠干细胞系 |
| 52 | 2025-06-10 |
Simvastatin inhibits proliferation and migration, promotes oxidative stress and ferroptosis in colon cancer
2025-May-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i5.104522
PMID:40487942
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research paper | 本研究探讨了辛伐他汀对结肠癌细胞增殖、迁移、氧化应激和铁死亡的抑制作用及其机制 | 发现辛伐他汀通过下调SERPINE1和激活cGMP/PKG信号通路抑制结肠癌细胞增殖和迁移，为结肠癌治疗提供了新策略 | 研究仅基于体外细胞实验，未进行动物模型或临床试验验证 | 研究辛伐他汀对结肠癌细胞功能的影响及其作用机制 | 结肠癌细胞系NCM460、HCT-116和SW620 | 肿瘤学 | 结肠癌 | 细胞计数试剂盒-8、集落形成实验、Transwell实验、流式细胞术、实时聚合酶链反应、Western blotting | NA | 细胞实验数据 | 三种结肠癌细胞系 |
| 53 | 2025-06-10 |
Exploring the potential function of high expression of ANAPC1 in regulating ubiquitination in hepatocellular carcinoma
2025-May-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i5.103594
PMID:40487972
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research paper | 该研究探讨了ANAPC1在肝细胞癌（HCC）中通过泛素化途径调控细胞周期和代谢水平的潜在功能 | 首次全面研究了ANAPC1在HCC中的表达及其通过泛素化相关途径的调控机制 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 阐明ANAPC1在HCC中的表达及其与泛素化相关的潜在调控机制 | 肝细胞癌（HCC） | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序、微阵列、免疫组化（IHC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR分析 | NA | RNA测序数据、微阵列数据、免疫组化组织样本、单细胞RNA测序数据 | 包括大量RNA样本、IHC组织样本和恶性肝细胞样本 |
| 54 | 2025-06-10 |
Single-cell meta-analysis of T cells reveals clonal dynamics of response to checkpoint immunotherapy
2025-May-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100842
PMID:40187353
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research paper | 通过单细胞元分析揭示T细胞克隆在免疫检查点抑制剂治疗中的动态变化及其与临床结果的关联 | 发现了基于扩增的CD8克隆的响应特征，能够区分响应者与非响应者，并揭示了克隆转录状态与患者响应之间的差异 | 研究仅涉及6种癌症类型，样本量虽大但可能不足以覆盖所有癌症类型的T细胞克隆动态 | 探究T细胞克隆在免疫检查点抑制剂治疗中的动态变化及其与临床结果的关联 | 767,606个T细胞，来自460个样本，涵盖6种癌症类型 | digital pathology | cancer | single-cell RNA sequencing, T cell receptor sequencing | NA | RNA-seq data | 767,606个T细胞，460个样本，6种癌症类型 |
| 55 | 2025-06-10 |
Enhanced interpretation of immune cell phenotype and function through a rhesus macaque single-cell atlas
2025-May-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100849
PMID:40233746
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research paper | 该研究通过构建首个以免疫为重点的猕猴单细胞多组织图谱（RIRA），对比转录谱与免疫谱系，揭示了单细胞RNA测序在免疫细胞分类中的优势和局限性 | 首次构建猕猴免疫参考图谱（RIRA），并识别了具有高判别/诊断价值的基因程序，包括模拟T/NK细胞成熟的多基因特征 | 无监督聚类在功能不同的T细胞和NK细胞亚群中可能导致系统性混合，许多功能不同的亚群缺乏明确的标记基因 | 准确解读单细胞RNA测序数据，理解其与免疫细胞功能和谱系定义的差异和限制 | 猕猴免疫细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多组织猕猴样本（具体数量未提及） |
| 56 | 2025-06-10 |
Atlas-scale metabolic activities inferred from single-cell and spatial transcriptomics
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.09.653038
PMID:40463045
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research paper | 提出了一种名为scCellFie的计算框架，用于从人和小鼠的转录组数据中推断单细胞和空间分辨率的代谢活动 | 开发了scCellFie框架，能够从转录组数据中推断代谢活动，填补了直接测量单细胞和空间分辨率代谢活动的技术空白 | 依赖于转录组数据推断代谢活动，可能无法完全反映实际的代谢状态 | 开发一种计算工具，用于从转录组数据中推断代谢活动，以研究细胞功能和通讯 | 人和小鼠的细胞 | computational biology | endometriosis, endometrial carcinoma | single-cell transcriptomics, spatial transcriptomics | scCellFie | transcriptomic data | 约3000万个细胞图谱 |
| 57 | 2025-06-10 |
Molecular pathology of acute spinal cord injury in middle-aged mice
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.08.652873
PMID:40463189
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research paper | 该研究比较了年轻和中老年小鼠在脊髓损伤后的行为、组织病理学和转录组学结果 | 首次全面研究中老年小鼠脊髓损伤的转录组学特征，揭示了细胞亚群的变化可能影响修复机制 | 研究仅关注了中老年小鼠，未涵盖更老龄的动物模型 | 探究年龄对脊髓损伤病理生物学的影响 | 年轻(2-4个月)和中老年(10-12个月)小鼠 | 分子病理学 | 脊髓损伤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和中老年小鼠群体 |
| 58 | 2025-06-10 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct senotypes and a quiescence-senescence continuum at the transcriptome level following chemotherapy
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.13.653730
PMID:40463227
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research paper | 通过单细胞RNA测序揭示了化疗后转录组水平上不同的衰老类型和静止-衰老连续体 | 结合时间推移成像和单细胞RNA测序技术，区分了静止和衰老状态，并发现了两种不同的衰老途径 | 研究仅基于etoposide处理后的细胞，可能不适用于其他化疗药物 | 区分化疗后细胞的静止和衰老状态，并研究其转录组特征 | 化疗处理后的细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 时间推移成像 | 伪时间轨迹分析 | 转录组数据, 图像数据 | NA |
| 59 | 2025-06-10 |
Competing dynamic gene regulatory networks involved in fibroblast reprogramming to hematopoietic progenitor cells
2025-05-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102473
PMID:40185089
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research paper | 研究通过诱导系统将成纤维细胞重编程为造血祖细胞，并揭示了重编程过程中的基因调控网络 | 开发了通过表达SCL和LMO2转录因子诱导成纤维细胞重编程为造血祖细胞的系统，并识别了影响重编程效率的关键转录因子和信号通路 | 重编程过程的随机性限制了其效率，且研究仅针对特定转录因子和信号通路 | 提高体细胞直接重编程为造血细胞的效率 | 成纤维细胞和造血祖细胞 | 基因调控与细胞重编程 | NA | 转录组和表观基因组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 60 | 2025-06-10 |
Influenza A virus dissemination and infection leads to tissue resident cell injury and dysfunction in viral sepsis
2025-May-13, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105738
PMID:40367638
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠模型，探讨了H1N1流感病毒在病毒性脓毒症中如何通过血液传播并感染肺外器官，导致细胞死亡和器官功能障碍 | 揭示了H1N1流感病毒通过血液传播感染肺外器官的机制，并比较了病毒性脓毒症与细菌性脓毒症在细胞死亡和器官功能障碍上的差异 | 研究仅使用小鼠模型，结果可能无法完全反映人类疾病情况 | 阐明流感病毒在病毒性脓毒症中导致肺外器官损伤的病理机制 | C57BL/6J雄性小鼠 | 病毒学 | 病毒性脓毒症 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明小鼠数量，但涉及三个实验组 |