单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-05-12	The Hypoxia-Associated High-Risk Cell Subpopulation Distinctly Enhances the Progression of Glioma 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202416231 PMID:40047299	研究论文	本研究通过单细胞测序技术识别了一个与胶质瘤进展相关的独特细胞亚群，并探讨了其在胶质瘤从低级别向高级别转化中的作用	首次聚焦于低级别胶质瘤(LGG)起源的高风险细胞亚群，发现CDC20KIF20APTTG1标记的细胞亚群与胶质瘤进展密切相关	研究主要基于体外和动物实验，临床转化应用仍需进一步验证	探究胶质瘤从低级别向高级别转化的关键细胞亚群及其治疗策略	低级别胶质瘤(LGG)和胶质母细胞瘤(GBM)	肿瘤生物学	胶质瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)和多重免疫荧光染色	NA	单细胞转录组数据	多个队列的低级别胶质瘤样本
42	2025-05-12	Single-cell RNA-seq reveals the immune response of Co-infection with streptococcus pneumoniae after influenza A virus by a lung-on-chip: The molecular structure and mechanism of tight junction protein ZO-1 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.141815 PMID:40057081	研究论文	本研究利用人肺芯片模型和单细胞RNA测序技术，探讨了甲型流感病毒和肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响，重点关注紧密连接蛋白ZO-1的分子结构及作用机制	首次结合人肺芯片模型和单细胞RNA测序技术研究共感染的免疫反应，揭示了ZO-1蛋白在维持肺屏障完整性中的关键作用	研究仅使用体外模型，可能无法完全模拟体内复杂的免疫环境	探究甲型流感病毒和肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响机制	人肺芯片模型中的肺细胞和免疫细胞	数字病理学	肺炎	单细胞RNA测序、多重微球免疫分析	人肺芯片模型	基因表达数据、图像数据	未明确说明样本数量
43	2025-05-12	CO-Releasing Polyoxometalates Nanozyme with Gut Mucosal Immunity and Microbiota Homeostasis Remodeling Effects for Restoring Intestinal Barrier Integrity 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202500116 PMID:40079617	研究论文	本研究介绍了一种释放CO的多金属氧酸盐纳米酶（PMC），用于修复炎症性肠病（IBD）中的肠道屏障完整性	PMC通过协调五羰基锰溴化物与钼基POM纳米簇合成，具有靶向积累、高效清除活性氧（ROS）和响应性CO释放的多重治疗效果	NA	开发一种多功能治疗剂，用于修复IBD中的肠道屏障完整性	炎症性肠病（IBD）患者	纳米医学	炎症性肠病	16S rRNA测序、单细胞RNA测序	NA	测序数据	NA
44	2025-05-12	CCL20/CXCL5 Drives Crosstalk Between Anaplastic Thyroid Cancer Stem Cells and Tumor-Associated Macrophages to Promote Tumor Progression 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405399 PMID:40091357	研究论文	探讨肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）与未分化甲状腺癌干细胞（ATCSCs）之间的相互作用及其在肿瘤进展中的作用	揭示了CCL20/CXCL5轴在TAMs与ATCSCs之间的关键作用及其通过IRAK-1/NF-κB1/2信号通路调控肿瘤干细胞特性的机制	研究主要基于体外实验和异种移植模型，临床样本验证不足	阐明TAMs与ATCSCs之间的互作机制及其对肿瘤微环境的调控作用	未分化甲状腺癌（ATC）中的肿瘤相关巨噬细胞和癌症干细胞	肿瘤生物学	甲状腺癌	单细胞RNA测序、细胞因子/趋化因子阵列、蛋白质组学、mRNA表达数据集分析	异种移植模型	基因表达数据、蛋白质数据	未明确说明具体样本数量，但使用了THP-1-M2细胞和ATCSCs
45	2025-05-12	Integrated single-cell transcriptome and comparative genome analysis reveals the origin of intermuscular bones in zebrafish 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142397 PMID:40127795	研究论文	通过整合单细胞转录组和比较基因组分析，揭示了斑马鱼肌间骨的起源	首次结合单细胞转录组和比较基因组分析，揭示了肌间骨发育的分子调控机制和进化过程	研究仅针对斑马鱼，未在其他鱼类中进行验证	探究肌间骨的分子调控机制和进化过程	斑马鱼肌间骨	基因组学	NA	单细胞转录组测序、比较基因组分析	NA	基因组数据、转录组数据	15种鱼类（4种有肌间骨，11种无肌间骨）以及斑马鱼肌间骨组织
46	2025-05-12	Integration of bulk and single-cell RNA sequencing reveals dynamic changes in epidermal cells 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142601 PMID:40158578	研究论文	通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，研究了牦牛表皮细胞在毛囊周期中的动态变化和分子调控机制	首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，揭示了牦牛毛囊周期中14种不同细胞群体的时空动态变化，并重构了表皮细胞分化轨迹	研究仅针对牦牛表皮细胞，结果在其他物种中的普适性有待验证	探究毛囊周期中表皮细胞行为的分子调控机制	牦牛表皮细胞	单细胞组学	NA	批量RNA测序, 单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
47	2025-05-12	Roles of innate immune system and receptor Dectin-1 in synovium and cartilage homeostasis of osteoarthritis 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142669 PMID:40164261	研究论文	本研究探讨了先天免疫系统及其受体Dectin-1在骨关节炎（OA）滑膜和软骨稳态中的作用	揭示了先天免疫相关基因和通路在OA滑膜中的表达模式，并强调了Dectin-1在巨噬细胞中的作用	需要进一步探索先天免疫在OA中的具体机制	研究先天免疫在OA滑膜炎中的机制	OA患者的滑膜组织和巨噬细胞	免疫学	骨关节炎	RNA测序、单细胞测序、STRING数据库、机器学习算法	机器学习模型	RNA测序数据、单细胞测序数据	113种机器学习算法组合
48	2025-05-12	Characterising Shared and Specific Cell-Cell Communication in Cardiomyopathy Subtypes From Single-Cell Transcriptomics Data 2025-May, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70554 PMID:40344498	研究论文	通过单细胞转录组数据分析心肌病亚型中细胞间通讯的共同和特异性特征	揭示了心肌病亚型中细胞间通讯的共同和特异性通路，为靶向治疗提供了新见解	研究仅基于转录组数据，未考虑蛋白质水平和功能验证	解析心肌病亚型中细胞间通讯的分子机制	心律失常性心肌病(ACM)、扩张型心肌病(DCM)、肥厚型心肌病(HCM)和缺血性心肌病(ICM)患者的单细胞转录组数据	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	来自ACM、DCM、HCM、ICM患者和健康供体的心室区域样本
49	2025-05-12	Single-Cell Profiling of Mononuclear Cells Identifies Transcriptomics Signatures Differentiating Prostate Cancer From Benign Prostatic Hyperplasia 2025-May, Genes, chromosomes & cancer DOI:10.1002/gcc.70051 PMID:40346907	研究论文	通过单细胞RNA测序技术分析前列腺癌和良性前列腺增生患者的单核细胞转录组特征，揭示两者在免疫微环境和转录异质性上的差异	首次使用单细胞RNA测序技术比较前列腺癌和良性前列腺增生患者的单核细胞转录组特征，并鉴定出与肿瘤进展相关的差异表达基因	样本量较小（4例前列腺癌和3例良性前列腺增生患者），可能影响结果的普遍性	探索前列腺癌和良性前列腺增生在免疫微环境和转录组水平的差异	前列腺癌和良性前列腺增生患者的单核细胞	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	4例前列腺癌患者和3例良性前列腺增生患者
50	2025-05-12	DSG2 attenuates gemcitabine efficacy through PTX3 in lung adenocarcinoma 2025-Apr-30, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167881 PMID:40316058	研究论文	本研究探讨了DSG2在肺腺癌中对吉西他滨疗效的影响及其通过PTX3介导的机制	首次揭示了DSG2通过PTX3/NFκB/STAT3通路调控吉西他滨耐药性的机制	研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证	探索DSG2在肺腺癌中对吉西他滨疗效的影响及其分子机制	肺腺癌组织和细胞	肿瘤学	肺腺癌	单细胞测序、KEGG、GSEA多组学数据库分析、体外实验	NA	基因表达数据、蛋白质数据	TCGA数据库中的肺腺癌组织样本
51	2025-05-12	Mycoplasma ovipnuemoniae impairs the immune response of sheep and suppresses neutrophil function by inhibiting S100A9 2025-Apr, Veterinary microbiology IF:2.4Q1 DOI:10.1016/j.vetmic.2025.110446 PMID:40022823	研究论文	研究羊支原体肺炎如何通过抑制S100A9损害绵羊的免疫反应和中性粒细胞功能	首次使用单细胞RNA测序技术系统分析了羊肺组织中11种细胞类型的转录组变化，并构建了细胞间通讯模型和关键调控基因的差异表达图谱	研究主要基于体外实验，体内验证不足	探究羊支原体肺炎对宿主肺部的损害机制	绵羊及其肺组织细胞	免疫学	肺炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA-seq数据	感染28天的绵羊肺组织样本
52	2025-05-12	Cancer-associated fibroblasts in breast cancer in the single-cell era: Opportunities and challenges 2025-Apr, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189291 PMID:40024607	综述	本文综述了乳腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）在单细胞时代的研究机遇与挑战	利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）对CAFs进行高分辨率分析，揭示其异质性及在乳腺癌进展中的作用	未提及具体实验数据或样本量，主要依赖现有文献综述	探讨乳腺癌中CAFs的亚群分类、生物标志物及其在疾病进展和治疗中的作用	乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
53	2025-05-12	Temporal dynamics of immune cell transcriptomics in brain metastasis progression influenced by gut microbiome dysbiosis 2025-Mar-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115356 PMID:40023843	research paper	研究肠道微生物失调对脑转移进展中免疫细胞转录组学时间动态的影响	揭示了肠道微生物组多样性作为脑转移调节因子的作用，并展示了单细胞测序在解析免疫景观动态变化中的应用	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探讨肠道微生物组在脑转移进展中调节免疫反应动态的作用	脑转移小鼠模型中的免疫细胞和肠道微生物组	digital pathology	brain metastasis	single-cell sequencing	NA	transcriptomics data	小鼠模型（具体数量未提及）
54	2025-05-12	Integrated computational analysis identifies therapeutic targets with dual action in cancer cells and T cells 2025-Mar-11, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.007 PMID:40023158	研究论文	开发了一个计算目标发现平台ICRAFT，用于识别既能抑制肿瘤进展又能增强抗肿瘤免疫力的通路	整合了多种功能基因组学和临床数据集，提供了一个交互式资源，用于深入理解抗肿瘤免疫和免疫肿瘤药物开发	未明确提及具体的技术或数据限制	识别既能增强癌细胞对免疫攻击的敏感性又能激活T细胞的治疗靶点	癌细胞和T细胞	免疫肿瘤学	癌症	CRISPR筛选、scRNA-seq、RNA-seq	ICRAFT平台	基因组数据、转录组数据	NA
55	2025-05-12	Splenic TNF-α signaling potentiates the innate-to-adaptive transition of antiviral NK cells 2025-Mar-11, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.012 PMID:40023159	研究论文	研究自然杀伤（NK）细胞在巨细胞病毒感染期间的组织激活及其向适应性免疫细胞的转变	揭示了脾脏中TNF-α信号通过不同NF-κB信号通路促进NK细胞从先天免疫向适应性免疫转变的机制	研究主要基于小鼠模型，人类NK细胞中类似机制尚需验证	探索NK细胞在病毒感染中从先天免疫向适应性免疫转变的分子机制	自然杀伤（NK）细胞	免疫学	病毒感染	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
56	2025-05-12	[Comprehensive analysis of the structural phenotypes and functional characteristics of B cells in oral lichen planus and oral lichenoid lesions through single-cell and spatial transcriptomics] 2025-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology DOI:10.3760/cma.j.cn112144-20241220-00500 PMID:40015701	研究论文	通过单细胞和空间转录组学技术，全面分析口腔扁平苔藓（OLP）和相关口腔苔藓样病变（OLL）中B细胞的结构表型和功能特征	首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统研究了OLP/OLL中B细胞的表型、空间分布及其在三级淋巴结构（TLS）形成中的作用	样本量较小（仅6例患者和4例对照），且B细胞参与的具体功能机制仍需进一步研究	揭示B细胞介导的口腔黏膜微环境免疫调节的表观遗传机制	口腔扁平苔藓（OLP）和相关口腔苔藓样病变（OLL）患者的B细胞	数字病理	口腔疾病	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	转录组数据, 空间基因表达数据	6例患者（2例EOLP, 3例NEOLP, 1例OLL）和4例健康对照
57	2025-05-12	Adipose-derived stem cells attenuate rheumatoid arthritis by restoring CX3CR1+ synovial lining macrophage barrier 2025-Mar-05, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-025-04144-5 PMID:40038808	research paper	研究探讨了脂肪来源干细胞（ADSCs）通过恢复CX3CR1+滑膜巨噬细胞屏障来缓解类风湿性关节炎（RA）的机制	揭示了ADSCs通过线粒体转移改善CX3CR1+巨噬细胞的能量代谢特征，并促进屏障恢复的新机制	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究ADSCs治疗RA的潜在机制及其与CX3CR1+巨噬细胞的相互作用	血清转移诱导的关节炎模型小鼠及CX3CR1+滑膜巨噬细胞	细胞治疗	类风湿性关节炎	scRNA-seq, bulk RNA-seq	血清转移诱导的关节炎小鼠模型	基因表达数据	未明确说明具体样本数量，但涉及多个时间点（0、2、4、7天）的ADSCs及CX3CR1+巨噬细胞
58	2025-05-12	AcImpute: a constraint-enhancing smooth-based approach for imputing single-cell RNA sequencing data 2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btae711 PMID:40037523	research paper	提出了一种名为AcImpute的无监督方法，用于提高单细胞RNA测序数据的插补准确性	通过约束不同表达水平基因间的平滑权重，有效防止过平滑现象，提高聚类和轨迹推断性能	未提及与其他方法在计算效率上的比较	解决单细胞RNA测序数据中由于丢失事件导致的下游分析准确性问题	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	scRNA-seq	无监督学习	基因表达数据	NA
59	2025-05-12	Benchmarking copy number aberrations inference tools using single-cell multi-omics datasets 2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbaf076 PMID:40037644	research paper	该研究通过单细胞多组学数据集对五种最先进的拷贝数变异推断工具进行了基准测试	首次全面评估了从单细胞RNA测序数据推断拷贝数变异的计算方法的性能	研究仅评估了五种工具，可能未涵盖所有可用方法	评估和比较不同计算工具在推断拷贝数变异方面的性能	单细胞多组学数据集	基因组学	癌症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因组数据	NA
60	2025-05-12	Single cell immunoprofile of synovial fluid in rheumatoid arthritis with TNF/JAK inhibitor treatment 2025-Mar-04, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-57361-0 PMID:40038288	研究论文	通过单细胞RNA测序技术分析类风湿性关节炎患者滑膜液中免疫细胞的特征及其对TNF/JAK抑制剂的反应	首次在单细胞水平上揭示了滑膜液中致病性细胞（如SPP1巨噬细胞和CXCL13CD4 T细胞）的功能及其在药物治疗后的变化	研究样本量有限，且仅针对特定药物（阿达木单抗/托法替尼）进行了分析	探究类风湿性关节炎患者滑膜液中致病性细胞的功能及其对药物治疗的反应	类风湿性关节炎患者的滑膜液样本	单细胞测序	类风湿性关节炎	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	类风湿性关节炎患者的滑膜液样本（未明确具体数量）