单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing technology in renal cancer: insights into tumor biology and clinical application
2025-Oct-01, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00811-0
PMID:41035074
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在肾癌研究中的应用及其对肿瘤生物学和临床诊疗的推动作用 | 整合单细胞测序与空间组学技术，在单细胞水平解析肾癌异质性及肿瘤微环境的空间相互作用 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于现有文献综述 | 探讨单细胞测序技术对肾癌生物学机制研究和临床应用的贡献 | 肾癌（特别是透明细胞肾细胞癌）及其肿瘤微环境 | 数字病理 | 肾癌 | 单细胞测序（SCS）、空间组学 | NA | 单细胞测序数据、空间组学数据 | NA |
| 42 | 2025-10-05 |
Functional diversity of disorder-specific macrophages involved in various diseases
2025-Oct-01, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00390-5
PMID:41035106
|
综述 | 本文综述了疾病特异性巨噬细胞的功能多样性及其在不同疾病中的作用机制 | 突破了传统的M1/M2极化模型，基于单细胞RNA测序技术揭示了疾病特异性巨噬细胞的连续转录状态和功能多样性 | NA | 探讨疾病特异性巨噬细胞的起源、转录调控和空间异质性，推动精准医疗发展 | 巨噬细胞亚群及其在慢性感染、肿瘤、肥胖和神经退行性疾病等病理环境中的功能特性 | 免疫学 | 多种疾病（结核病、肿瘤、肥胖症、神经退行性疾病等） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多组学整合分析 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | NA |
| 43 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis reveals an important role of CD137L+ macrophages in the host response to uropathogenic Escherichia coli infection in the bladder
2025-Oct, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013543
PMID:41042739
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示CD137L+巨噬细胞在膀胱UPEC感染宿主反应中的关键保护作用 | 首次发现CD137L+巨噬细胞通过调节Tregs在膀胱UPEC感染中发挥关键保护作用 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探究宿主对尿路致病性大肠杆菌感染的免疫反应机制 | 小鼠膀胱免疫细胞 | 免疫学 | 尿路感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠膀胱组织 |
| 44 | 2025-10-05 |
Targeting cell-state plasticity driven by FOXM1/CEBPB axis disrupts developmental heterogeneity and therapeutic resistance in hepatocellular carcinoma
2025-Oct-01, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.09.022
PMID:41043722
|
研究论文 | 本研究揭示了FOXM1/CEBPB轴通过驱动细胞状态可塑性诱导肝细胞癌发育异质性和治疗耐药性的机制 | 首次发现FOXM1/CEBPB轴作为主调控开关控制肝细胞癌发育异质性，并开发了靶向肝FOXM1的GalNAc偶联化学修饰siRNA先导化合物 | 研究主要基于临床前模型，需要进一步临床验证 | 探索肝细胞癌发育异质性和治疗耐药性的分子机制并开发新的治疗策略 | 肝细胞癌患者样本、体外和体内模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 自调控网络分析, RNAi | NA | RNA测序数据 | 来自肝细胞癌患者的公共数据集和自建肝细胞分化模型 |
| 45 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the regulation of bco1 and bco2 genes in the carotenoid metabolism of koi carp
2025-Oct-01, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147965
PMID:41043743
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了锦鲤皮肤色素细胞发育及类胡萝卜素代谢的分子机制 | 首次构建锦鲤红白皮肤的单细胞图谱，发现色素细胞从白皮向红皮发育的轨迹，揭示bco1和bco2基因通过钙离子信号通路协同调控类胡萝卜素代谢 | 研究仅针对锦鲤特定品种，结论在其他鱼类中的普适性有待验证 | 探究锦鲤皮肤颜色形成的分子基础及类胡萝卜素代谢调控机制 | 锦鲤的红白皮肤组织及色素细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、透射电镜、高效液相色谱、原位杂交、免疫荧光、RNA干扰、细胞培养、基因编辑、RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 锦鲤红白皮肤组织样本 |
| 46 | 2025-10-05 |
DUSP6 is upregulated in metastasis and influences migration and metabolism in pancreatic cancer cells
2025-Sep-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-12967-8
PMID:41028058
|
研究论文 | 本研究探讨DUSP6在胰腺癌转移中的作用及其对细胞迁移和代谢的调控机制 | 首次揭示DUSP6在胰腺癌转移中独立调控细胞迁移和代谢的双重功能，并发现其与糖酵解变化无关的迁移行为改变 | 未明确说明研究使用的具体细胞系数量和实验重复次数 | 探究DUSP6在胰腺导管腺癌转移过程中的作用机制及其对细胞行为的影响 | 胰腺导管腺癌细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 转录组分析、单细胞RNA-seq、基因集富集分析、代谢分析 | NA | 基因表达数据、代谢数据 | NA |
| 47 | 2025-10-05 |
Crosstalk between the microbiota and intestinal dendritic cells in IBD
2025-Sep-30, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-025-01062-9
PMID:41028655
|
综述 | 总结肠道常规树突状细胞在炎症性肠病中的功能及其与微生物群的相互作用 | 整合单细胞测序技术新进展，探讨微生物群对树突状细胞功能的调控机制 | 肠道常规树突状细胞数量有限且与其他髓系细胞表型重叠，其确切作用机制仍不明确 | 阐明微生物群与肠道树突状细胞在炎症性肠病中的相互作用机制 | 肠道常规树突状细胞(cDCs)和肠道微生物群 | 免疫学 | 炎症性肠病(IBD) | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 48 | 2025-10-05 |
Single-nucleus transcriptomics reveal the morphogenesis and artemisinin biosynthesis in Artemisia annua glandular trichomes
2025-Sep-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63770-y
PMID:41028755
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学系统解析青蒿腺毛发育过程及青蒿素生物合成的细胞机制 | 首次构建青蒿腺毛发育的高分辨率细胞图谱，发现10细胞腺毛结构中6个特定分泌细胞是青蒿素主要合成位点 | NA | 阐明青蒿腺毛发育过程及青蒿素生物合成的细胞起源和空间机制 | 青蒿腺毛分泌细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 49 | 2025-10-05 |
Fatty acid metabolism in ischemic stroke: multi-omics biomarker discovery and therapeutic potential of GPR84
2025-Sep-30, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02212-6
PMID:41029687
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索脂肪酸代谢在缺血性脑卒中中的作用，发现新型诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次整合外周血转录组数据识别脂肪酸代谢相关差异表达基因，发现VIM、G0S2和GPR84作为新型诊断生物标志物，并确定GPR84为潜在治疗靶点 | 研究基于公共数据库和有限样本，需要更大规模临床验证 | 探索脂肪酸代谢在缺血性脑卒中中的生物标志物发现和治疗潜力 | 缺血性脑卒中患者的外周血样本 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 转录组测序、单细胞RNA测序、实时定量PCR、分子对接 | 广义线性模型、LASSO、支持向量机、随机森林 | 基因表达数据 | 多个公共数据集(GSE22255、GSE58294、GSE16561、GSE174574)的外周血样本 |
| 50 | 2025-10-05 |
MOADE: a multimodal autoencoder for dissociating bulk multi-omics data
2025-Sep-30, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03805-1
PMID:41029754
|
研究论文 | 提出一种多模态自编码器MOADE，用于解离批量多组学数据并联合预测个性化多组学谱和细胞组成 | 通过结合内部非转录组参考和外部scRNA-seq数据构建伪批量数据，首次实现多维度特征关联的多组学解卷积 | NA | 开发能够解离批量多组学数据并预测细胞组成的计算方法 | 多组织类型的批量多组学数据 | 计算生物学 | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | 多模态自编码器 | 多组学数据、转录组数据 | 多种组织类型的真实多组学数据 |
| 51 | 2025-10-05 |
EnsembleRegNet: Interpretable deep learning for transcriptional network inference from single-cell RNA-seq
2025-Sep-30, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出EnsembleRegNet深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 集成编码器-解码器和多层感知机架构，结合HLE二值化、case-deletion分析、RcisTarget基序富集和AUCell调控子活性评分，提高鲁棒性和生物学可解释性 | NA | 从单细胞RNA测序数据准确推断转录因子-靶基因关系 | 基因调控网络和转录调控关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 集成编码器-解码器、多层感知机(MLP) | 单细胞RNA测序数据 | 模拟和真实scRNA-seq数据集 |
| 52 | 2025-10-05 |
Crocin inhibits neutrophil migration and activation to treat hypoxic pulmonary hypertension through targeting HCK
2025-Sep-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157334
PMID:41043333
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研究论文 | 本研究揭示藏红花素通过靶向HCK抑制中性粒细胞迁移和激活，从而治疗缺氧性肺动脉高压 | 首次发现藏红花素直接靶向HCK蛋白，并通过单细胞RNA测序系统阐明其抑制中性粒细胞迁移和激活的分子机制 | 研究主要基于大鼠模型和体外实验，尚未进行人体临床试验验证 | 探究藏红花素治疗缺氧性肺动脉高压的药理机制 | 缺氧性肺动脉高压大鼠模型、中性粒细胞、肺动脉平滑肌细胞 | 病理生理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、分子对接、CETSA、DARTS、共培养系统 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、细胞功能数据 | 缺氧性肺动脉高压大鼠模型及相关细胞实验 |
| 53 | 2025-10-05 |
Urine proteomic signatures of kidney function decline after hospitalization
2025-Sep-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195577
PMID:40794429
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研究论文 | 通过尿液蛋白质组学分析住院后患者肾功能下降的分子机制 | 首次系统鉴定与eGFR下降相关的387种尿液蛋白，并通过单细胞和空间转录组学揭示其在肾脏细胞中的空间分布特征 | 样本量相对有限（174例），需要在更大规模队列中验证 | 探索住院后肾功能下降的尿液蛋白质组学标志物及其生物学机制 | 急性肾损伤（AKI）患者及非AKI住院患者 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | Olink蛋白质组学、单细胞转录组学、空间转录组学、加权相关网络分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、临床随访数据 | 174例住院患者（来自ASSESS-AKI队列），并在4个独立队列中验证 |
| 54 | 2025-10-05 |
Th17 cells with regulatory phenotype are the main IL-17F and IL-26 producers in palmoplantar pustulosis
2025-Sep-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193038
PMID:40985896
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间分析揭示了掌跖脓疱病中具有调节表型的Th17细胞是IL-17F和IL-26的主要生产者 | 首次在PPP中发现具有调节表型的杂交Th17细胞群(regTh17)，并揭示其与IL-36G+角质形成细胞的相互作用机制 | 研究样本量有限，需要进一步验证这些发现 | 解析掌跖脓疱病的细胞和空间结构特征 | 掌跖脓疱病患者和健康人的肢端皮肤组织 | 单细胞基因组学 | 掌跖脓疱病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 来自病变、非病变和健康肢端皮肤的样本 |
| 55 | 2025-10-05 |
A cross model spatial and single-cell atlas reveals the conserved involvement of osteopontin in polycystic kidney disease
2025-Sep-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.676846
PMID:41000888
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研究论文 | 通过构建跨模型单细胞和空间转录组图谱，揭示骨桥蛋白在多囊肾病中的保守作用机制 | 首次建立跨PKD小鼠模型的整合单细胞与空间转录组图谱，发现骨桥蛋白信号通路在疾病进展中的保守作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明多囊肾病异质性进展的细胞和分子机制 | 多囊肾病小鼠模型 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 多个PKD小鼠模型（具体数量未明确说明） |
| 56 | 2025-10-05 |
Lipoxin B4 Mitigates TRPV4-Activated Müller Cell Gliosis During Ocular Hypertension
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.673801
PMID:41000836
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研究论文 | 本研究探讨了脂氧素B4在眼高压条件下通过调节TRPV4通道减轻Müller细胞胶质增生的作用机制 | 首次发现Müller细胞是视网膜中脂氧素B4的重要来源，并揭示了TRPV4激活同时触发胶质增生和保护性脂质信号的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，需要进一步验证在人类青光眼患者中的适用性 | 研究脂氧素B4是否调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞激活和炎症反应 | 小鼠Müller胶质细胞、原代和永生化Müller细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 流式细胞术、免疫染色、qPCR、western blotting、LC-MS/MS脂质组学、单细胞RNA-seq、免疫组织化学 | 小鼠硅油模型诱导的眼高压模型 | 转录组数据、蛋白质表达数据、脂质代谢物数据 | 小鼠模型和体外培养的Müller细胞 |
| 57 | 2025-10-05 |
Clonal dynamics shaped by diverse drug-tolerant persister states in melanoma resistance
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.16.676608
PMID:41000875
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研究论文 | 开发MeRLin平台研究黑色素瘤靶向治疗中药物耐受持久细胞的克隆动态和转录调控机制 | 整合细胞条形码、单细胞转录组、RNA-FISH和计算分析的高分辨率谱系追踪平台 | 基于患者来源的黑色素瘤模型研究，临床转化需进一步验证 | 解析黑色素瘤靶向治疗耐药机制和药物耐受持久细胞的异质性 | 患者来源的黑色素瘤模型和药物耐受持久细胞 | 计算生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序、RNA-FISH、空间转录组、细胞条形码 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像数据 | NA |
| 58 | 2025-10-05 |
Integrative Spatial Omics for Systems-Level Mapping of Pathological Niches
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.12.675904
PMID:41000710
|
研究论文 | 开发了一种整合空间组学的多模态分析流程，用于系统级绘制病理微环境 | 首次整合MALDI成像质谱脂质组学、空间转录组学、多重免疫荧光显微镜和组织病理学染色，实现跨分子类别的空间分子分析 | NA | 开发空间组学整合方法以揭示疾病微环境中的空间分子特征 | 阿尔茨海默病的人脑组织和2型糖尿病的人胰腺组织 | 空间组学 | 阿尔茨海默病, 2型糖尿病 | MALDI成像质谱, 空间转录组学, 多重免疫荧光显微镜, 组织病理学染色 | NA | 质谱数据, 转录组数据, 图像数据 | NA |
| 59 | 2025-10-05 |
Reference-Informed Spatial Domain Detection Using Weak Supervision for Spatial Transcriptomics
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.11.675689
PMID:41000972
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研究论文 | 提出一种参考信息引导的弱监督对比学习模型GraphScrDom，用于空间转录组数据的组织区域分割 | 首次将专家标注的涂鸦注释与参考单细胞RNA-seq数据中的细胞类型特异性基因表达谱相结合，实现弱监督下的空间域检测 | 需要依赖专家提供的有限涂鸦标注 | 开发空间转录组数据的组织分割方法 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术、单细胞RNA-seq、对比学习 | GraphScrDom（图对比学习模型） | 空间网格数据、组织学图像、基因表达数据 | 多种ST平台和分辨率下的数据集 |
| 60 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis reveals the attenuation of the interferon pathway as a driver of chemo-refractory ovarian cancer
2025-Sep-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102316
PMID:40885189
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研究论文 | 通过多组学分析揭示干扰素通路减弱是卵巢癌化疗耐药的关键驱动因素 | 首次发现化疗耐药卵巢癌中I型干扰素通路活性降低与缺氧通路活性增强的特征，并证实干扰素信号可自主增强癌细胞对铂类药物的敏感性 | 样本来源于观察性临床试验，需要进一步验证 | 揭示卵巢高级别浆液性癌化疗耐药的分子机制 | 化疗耐药卵巢癌患者的治疗前活检组织 | 多组学分析 | 卵巢癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、空间蛋白质分析、体外实验 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据 | DECIDER观察性试验中化疗耐药卵巢癌患者的治疗前活检样本 |