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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-05-31
Identification and validation of a prognostic risk-scoring model in drug-resistant ALL and evaluation of immune micro-environment
2026-May-29, Annals of hematology IF:3.0Q2
研究论文 通过转录组数据构建并验证儿童耐药急性淋巴细胞白血病预后风险评分模型,并评估免疫微环境的作用 首次基于Lasso回归构建13基因耐药相关预后指数(RAPI-13)并验证其预后价值,发现CD40激动剂联合化疗及免疫检查点阻断可逆转耐药 尚需更大规模前瞻性临床队列验证模型及三重疗法的临床转化可行性 开发耐药儿童急性淋巴细胞白血病的预后分层工具并探索免疫靶向治疗策略 化疗敏感与耐药的儿童急性淋巴细胞白血病患者样本及其转录组数据 机器学习 儿童急性淋巴细胞白血病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq Lasso回归 转录组数据 来自GEO和TARGET数据集的多个队列样本(具体数量未提及) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
42 2026-05-31
Spatial transcriptomics of cervical cancer reveals microenvironment shaped the malignant epithelial programs and ECM-associated immune niches
2026-May-29, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 通过空间转录组学技术分析宫颈癌肿瘤微环境对恶性上皮程序和细胞外基质相关免疫生态位的影响 首次利用Stereo-seq空间转录组学在宫颈癌FFPE标本中定义恶性上皮亚型及其微环境生态位,发现ITGA6⁺上皮程序与基质相互作用和THBS1信号通路密切相关 NA 探究宫颈癌中恶性上皮亚型的多样性及其与免疫细胞的相互作用机制 宫颈癌FFPE标本及CIN III和浸润性癌组织 空间转录组学 宫颈癌 Stereo-seq空间转录组学 NA 空间基因表达数据 FFPE宫颈癌标本 华大基因 空间转录组学 Stereo-seq Stereo-seq空间转录组学用于FFPE标本
43 2026-05-31
scZGA: a novel model based on ZINB distribution and graph attention for scRNA-seq data clustering
2026-May-29, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 提出基于ZINB分布和图注意力网络的新模型scZGA,用于聚类单细胞RNA测序数据 scZGA结合ZINB模型和残差连接图自编码器,通过自优化嵌入算法提升聚类性能 未提及模型对大规模数据的计算效率及泛化到其他单细胞模态的适用性 解决scRNA-seq数据高丢失率和复杂细胞间关系导致的聚类难题 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 机器学习 NA scRNA-seq 图注意力网络, ZINB模型, 图自编码器 基因表达数据 6个scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
44 2026-05-31
A continuous DNA repairing system for alleviating intervertebral disc degeneration
2026-May-29, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究提出了一种持续DNA修复系统,通过清除ROS、修复DNA损伤、促进DNA复制和基质合成来缓解椎间盘退变 首次提出结合双金属-姜黄素纳米酶与脐带间充质干细胞来源囊泡的连续DNA修复策略,从源头清除ROS到促进组织修复的全链条干预 尚未在更大动物模型或临床试验中验证系统安全性和长期有效性;机制研究主要限于体外和鼠尾针刺模型,可能无法完全模拟人类椎间盘退变 开发一种连续调控DNA修复的系统以逆转氧化应激诱导的髓核细胞衰老并治疗椎间盘退变 临床椎间盘样本、大鼠髓核细胞、鼠尾针刺椎间盘退变模型 数字病理学 椎间盘退变 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 临床患者髓核样本(具体数量未提供)及大鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
45 2026-05-31
Single-cell transcriptomic analysis deciphers heterogeneity and transcriptional regulatory programs of sepsis with different prognosis
2026-May-29, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示不同预后脓毒症的细胞异质性和转录调控程序 首次整合两个外周血单细胞RNA-seq队列,利用pySCENIC推断调节子活性、通路富集和CellChat配体-受体推断,全面揭示存活者和非存活者之间的免疫重塑模式差异,并发现cDC2在不良预后中与AP-1转录因子和干扰素信号失调相关 初步八转录因子模型仅展示了初步的判别性能,独立批量转录组验证有限 探索与不同临床预后相关的脓毒症免疫重塑模式 脓毒症患者外周血中的免疫细胞(单核细胞、B细胞、NK细胞、CD4/CD8 T细胞、血小板、cDC2、浆母细胞) 单细胞转录组学、生物信息学 脓毒症 scRNA-seq、pySCENIC、CellChat NA 基因表达数据 两个外周血单细胞RNA-seq队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
46 2026-05-31
KRT6A derived from mesenchymal stem cells as a potential biomarker and therapeutic target for alopecia areata: insights from multi-omics analysis and experimental evidence
2026-May-29, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 通过多组学分析和实验验证,发现间充质干细胞来源的KRT6A是斑秃的潜在生物标志物和治疗靶点 首次整合多组学数据(转录组、蛋白质组、单细胞RNA测序和空间转录组学)结合机器学习算法,系统鉴定间充质干细胞衍生基因KRT6A在斑秃中的诊断和治疗价值,并通过体内外实验验证其功能 研究主要基于公共数据库和动物模型,临床样本验证不足;KRT6A在斑秃中的具体调控机制尚需进一步阐明 利用多组学方法鉴定间充质干细胞来源的斑秃关键治疗基因 斑秃患者和斑秃小鼠模型 机器学习 斑秃 RNA-seq, 蛋白质组测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 CNN, LSTM, GAN 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 公共数据库中的斑秃样本及斑秃小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
47 2026-05-31
DNA damage response signature-based prognostic genes for intrahepatic cholangiocarcinoma: a combined analysis of machine learning and biological experiments
2026-May-29, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 基于DNA损伤反应特征构建肝内胆管癌预后基因模型,整合机器学习与生物学实验验证SFN基因功能 首次通过10种机器学习算法构建101种组合模型优化DDR风险模型,并结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示SFN在恶性细胞中的特异性富集及其对化疗耐药的关键作用 标题和摘要未提及具体的局限性 构建稳健的DDR预后模型用于肝内胆管癌风险分层和治疗反应预测,并探索SFN基因作为潜在治疗靶点的机制 肝内胆管癌患者和细胞系(如ICC细胞系) 机器学习 肝内胆管癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 体外实验(SFN敲降) Lasso, 随机生存森林(RSF) 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据 6个独立的ICC队列 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
48 2026-05-31
A first-in-class bifunctional antibody targeting CD20 and CD37 remodels the immune microenvironment in relapsed or refractory B-cell malignancies
2026-May-29, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1
研究论文 介绍一种靶向CD20和CD37的首创双功能抗体PSB202,在复发或难治性B细胞恶性肿瘤中重塑免疫微环境 首次提出同时靶向CD20和CD37的双功能抗体,独立于T细胞参与实现B细胞耗竭,可能减轻与CD3相关的毒性 临床试验样本量较小(15例患者),MTD未达到,需要进一步研究验证疗效和安全性 评估PSB202在复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤中的安全性、药代动力学、药效学和初步疗效 复发或难治性CD20阳性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者 机器学习 B细胞恶性肿瘤 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 15例重度预处理患者,中位年龄67.7岁 NA 单细胞RNA-seq NA NA
49 2026-05-31
Decoding the role of H19 in cholestatic liver injury using snRNA-seq, spatial transcriptomics, and machine learning-based disease prediction
2026-May-29, Cell & bioscience
研究论文 利用单核RNA测序、空间转录组学和基于机器学习的疾病预测,解析H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用 首次结合snRNA-seq、空间转录组学和机器学习构建跨物种基因预测特征,揭示H19缺失通过抑制致病性胆管细胞状态和SPP1信号来减轻胆汁淤积损伤,并发现胆汁导管区域肝细胞的特异性转录程序改变 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据集仅用于交叉验证,需要更多临床样本验证跨物种转化的稳健性 探究长非编码RNA H19在原发性硬化性胆管炎(PSC)相关胆汁淤积性肝损伤中细胞和分子机制,并开发跨物种疾病预测特征 野生型、H19敲除、Mdr2敲除和双敲除小鼠的肝脏组织,以及人类患者数据集GSE243981 计算机视觉, 机器学习 肝硬化, 胆管疾病 snRNA-seq, GeoMx空间转录组学, 机器学习 机器学习预测模型(具体类型未明确) 基因表达数据, 空间转录组数据 小鼠:野生型、H19KO、Mdr2KO、DKO各若干(具体数量未提供);人类数据集GSE243981 NanoString 单核RNA测序, 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler GeoMx空间转录组学用于分析胆管区域空间特异性基因表达
50 2026-05-31
Vasoactive intestinal peptide associated 8-gene signature with prognostic and immune associations in melanoma
2026-May-29, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 构建血管活性肠肽相关8基因特征,评估其在黑色素瘤预后、免疫微环境和药物敏感性中的作用 首次系统构建VIP相关预后基因特征VIPsig,并整合免疫微环境分析和药物敏感性预测 药物敏感性分析仅为基于计算模拟的推断,缺乏实验验证;该特征对治疗反应预测的实际价值尚未在前瞻性队列中得到验证 探索VIP相关基因在黑色素瘤预后风险分层和免疫微环境关联中的作用 黑色素瘤患者(训练集TCGA-SKCM 477例;验证集GSE65904 209例)外加单细胞RNA-seq数据GSE115978 机器学习 黑色素瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 逐步Cox回归与梯度提升机(GBM) 转录组数据(批量RNA-seq和单细胞RNA-seq) 训练集477例黑色素瘤样本,验证集209例黑色素瘤样本 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
51 2026-05-31
THE molecular mechanisms underlying synovial fibroblast differentiation in knee osteoarthritis revealed by single-cell transcriptome sequencing
2026-May-29, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 通过单细胞转录组测序揭示膝骨关节炎滑膜成纤维细胞分化的分子机制 首次利用单细胞RNA测序数据系统分析了膝骨关节炎中滑膜成纤维细胞的异质性,鉴定出7条分化轨迹及关键标记基因SPP1、TYROBP、CD74等,为靶向治疗提供分子依据 样本量较小(仅3例KOA样本),缺乏功能验证实验,且未涉及其他细胞类型或临床队列验证 揭示膝骨关节炎中滑膜成纤维细胞分化的关键基因和分子机制,为靶向治疗提供理论支持 膝骨关节炎滑膜组织中的滑膜成纤维细胞 机器学习 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 3例膝骨关节炎样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2026-05-31
Association of DNA damage repair related genes with prostate cancer: A multi-omics Mendelian Randomization analysis
2026-May-29, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 利用孟德尔随机化方法探究DNA损伤修复相关基因与前列腺癌风险的因果关系 首次通过多组学孟德尔随机化分析整合DNA损伤修复相关基因的甲基化、表达和蛋白质丰度数据,系统评估其与前列腺癌的因果关联 研究样本局限于欧洲人群,可能限制结果向其他种族的推广;依赖公共数据库的定量性状位点数据,未能完全排除潜在混杂因素 阐明DNA损伤修复相关基因与前列腺癌风险之间的因果关系 前列腺癌患者组织中的基因表达及单细胞测序数据 机器学习 前列腺癌 NA NA 基因表达数据、蛋白质丰度数据、单细胞测序数据 来自多个欧洲队列的定量性状位点数据集及全基因组关联研究数据(具体样本量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
53 2026-05-31
The GATA1 N terminus coordinates metabolic reprogramming in erythropoiesis
2026-May-28, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示GATA1 N末端缺失导致红细胞生成缺陷及糖酵解基因异常上调 首次发现GATA1 N末端缺失通过组蛋白乳酸化修饰直接调控PKM表达,建立红细胞生成中代谢重编程的转录因子新机制 NA 阐明GATA1蛋白N末端区域在红细胞生成中的分子功能 Gata1突变胚胎的胎肝细胞、DBA患者样本 单细胞转录组学 唐氏综合征相关白血病、戴-布二氏贫血 单细胞RNA测序、精准核连缀测序、CUT&RUN NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据 Gata1突变胚胎胎肝细胞(数量未明确)、DBA患者(PKM表达分析) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
54 2026-05-31
Hyperinnervation inhibits organ-level regeneration in mammalian skin
2026-May-28, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究揭示了哺乳动物皮肤器官水平再生的抑制机制,发现过度神经支配是关键障碍,并通过减少神经支配实现了再生 首次发现产后伤口特异性成纤维细胞(PWF)及其富集基因Timp1、Cxcl12和Ccl7通过诱导过度神经支配抑制器官水平再生,并通过去除这一障碍成功解锁再生能力 研究尚未明确PWF细胞起源及调控其功能的完整信号通路,且再生能力仅在局部皮肤验证,未在大型动物模型中验证 探究哺乳动物皮肤从再生向非再生状态转变的机制,寻找抑制器官水平再生的关键因素 小鼠胚胎期和出生后全层皮肤伤口愈合过程中的细胞类型、基因表达及神经支配变化 数字病理学 皮肤损伤再生 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 胚胎期和出生后小鼠皮肤伤口样本,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
55 2026-05-31
Spatial and Single-Cell Mapping Reveals Valvular Interstitial Cell and Macrophage Sex Differences in Calcific Aortic Valve Disease
2026-May-28, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 通过空间和单细胞转录组学分析揭示钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞和巨噬细胞的性别差异 首次结合单细胞和空间转录组学技术,在人类主动脉瓣组织中解析性别依赖性细胞异质性和基因表达空间分布,发现男性偏向的AP-1转录因子复合体和女性偏向的ECM重塑基因 未提供实验验证的体内模型,且样本数量有限,可能无法完全反映人群异质性 探究钙化性主动脉瓣疾病中驱动性别依赖性纤维钙化的细胞机制 人类钙化性主动脉瓣和健康主动脉瓣组织中的瓣膜间质细胞和巨噬细胞 数字病理学 钙化性主动脉瓣疾病 单细胞转录组测序、空间转录组学、组织学分析、扫描电子显微镜、RNA原位杂交 NA 基因表达数据、组织图像 人类主动脉瓣组织样本(具体数量未在摘要中提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学
56 2026-05-31
Pan-cancer spatial atlas of tertiary lymphoid structures
2026-May-28, Science (New York, N.Y.)
研究论文 通过跨12种癌症类型的空间转录组学构建泛癌三级淋巴结构图谱,分析其空间组织与成熟状态 首次构建泛癌TLS空间图谱,结合超高通量单细胞空间分析揭示成熟过程中生态位细胞重构机制,并训练AI模型从HE染色图像直接预测TLS成熟状态 未提及具体局限性 系统解析三级淋巴结构在多种癌症中的空间组织、成熟过程及临床相关性 三级淋巴结构的空间分布、成熟状态及肿瘤微环境细胞互作 数字病理学 泛癌(12种癌症类型) 空间转录组学、超高通量单细胞空间分析、人工智能 CNN 图像(HE染色切片)、空间转录组数据 12种癌症类型的空间转录组样本 10x Genomics 空间转录组学、单细胞空间分析 10x Visium 10x Visium空间转录组平台及超高通量单细胞空间分析平台
57 2026-05-31
GDF15 Reprograms the Microenvironment to Drive Liver Metastasis of Uveal Melanoma
2026-May-28, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了GDF15在重编程微环境以驱动葡萄膜黑色素瘤肝转移中的关键作用 首次阐明GDF15通过TGF-β家族成员介导的血管生成和基质沉积机制,促进UM肝转移的微环境重塑 未明确提及研究局限性 探究UM细胞与肝星状细胞在肿瘤微环境中的相互作用,揭示肝转移的分子机制 葡萄膜黑色素瘤细胞、肝星状细胞、内皮细胞 自然语言处理 葡萄膜黑色素瘤 单细胞RNA测序 单细胞转录组数据 无明确样本量信息 NA 单细胞RNA测序 NA NA
58 2026-05-31
Sex-Dependent Fibroblast Signatures in Heart Failure: Toward Stratified Anti-Fibro-Inflammatory Therapies
2026-May-28, ESC heart failure IF:3.2Q2
研究论文 研究心力衰竭中性别依赖的成纤维细胞特征,旨在分层抗纤维炎症治疗 首次揭示人类心脏成纤维细胞在心力衰竭中具有性别特异性激活模式,男性以TGF-β驱动的广泛基质重塑为主,女性以IL-1相关的靶向炎症反应为特征 样本量较小(每组6例),可能限制发现的通用性;仅分析左心室心内膜心肌活检样本,未涵盖其他心脏区域 阐明性别如何影响人类心脏成纤维细胞激活及心力衰竭中的纤维炎症反应 心力衰竭患者(LVEF<50%)和年龄匹配对照(LVEF≥50%)的左心室心内膜心肌活检样本 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 12例患者(每组6例,男性和女性各3例) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
59 2026-05-31
Targeting CCR1 remodels the tumor microenvironment and relieves immune suppression in pancreatic cancer
2026-May-28, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序数据发现CCR1在胰腺癌髓系细胞中高表达,通过基因敲除小鼠模型和药理抑制实验表明,靶向CCR1可重塑肿瘤微环境、缓解免疫抑制并增强免疫治疗效果 首次揭示CCR1通过调节髓系细胞和成纤维细胞促进胰腺癌免疫抑制的机制,并验证其作为联合治疗靶点的潜力 研究仅基于小鼠模型和少数人类样本数据,临床转化仍需验证 探究CCR1在胰腺癌髓系细胞介导的免疫抑制中的作用及治疗潜力 人和小鼠胰腺癌肿瘤中的髓系细胞(包括巨噬细胞和粒细胞) 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序 基因工程小鼠模型(KC和KPC) 单细胞转录组数据 人类肿瘤样本和小鼠肿瘤样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
60 2026-05-31
MambaCell: A Self-Supervised Mamba Framework for Multi-Task Cell Representation Learning
2026-May-28, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 提出MambaCell,一个基于双向Mamba架构的多任务自监督学习框架,用于单细胞RNA测序数据的细胞表征学习 首次将双向Mamba架构应用于单细胞表征学习,整合掩码基因建模和对比学习两个互补的自监督任务,解决了Transformer模型在长序列处理中的二次计算复杂度问题 文中未明确提及局限性,但基于Mamba架构的方法可能在处理极高维稀疏数据时仍有优化空间 开发高效、可扩展的单细胞表征学习通用框架,提升下游任务的性能并降低计算成本 单细胞RNA测序数据中的细胞表征 机器学习 NA 单细胞RNA测序 Mamba, 双向Mamba架构 单细胞转录组数据 大规模未标注数据集,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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