单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 41230 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-07-05 |
Spatial transcriptomic atlas of aggressive osteosarcomas reveals shared immune landscape and targetable surface markers
2026-Jul-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74603-x
PMID:42399228
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2026-07-05 |
REG4 serves as a prognostic biomarker for pancreatic cancer with long-standing diabetes mellitus by modulating chemoresistance
2026-Jul-02, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102888
PMID:42398462
|
研究论文 | REG4在长期患有糖尿病的胰腺癌中作为预后生物标志物，通过调节化疗耐药性发挥作用 | 首次揭示REG4作为糖尿病持续时间依赖性预后和预测性生物标志物，并阐明其通过WNT/β-catenin信号通路介导化疗耐药的机制 | 需要在前瞻性队列中进行更大规模验证 | 探索REG4在糖尿病相关胰腺癌中的预后和预测价值 | 胰腺导管腺癌患者、胰腺癌细胞系、患者来源类器官 | 数字病理学 | 胰腺癌、糖尿病 | 单细胞RNA测序、循环REG4浓度检测、功能验证 | NA | 基因表达数据、血清生物标志物数据 | 多个PDAC独立队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 公共scRNA-seq数据集重分析，使用10x Chromium平台 |
| 43 | 2026-07-05 |
Single-cell profiling of paired nasal brushing and tissue samples reveals distinct cellular landscapes and immune phenotypes
2026-Jul, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.02.019
PMID:41759750
|
研究论文 | 通过配对鼻刷和鼻组织样本的单细胞分析，揭示了两者不同的细胞组成和免疫表型 | 首次直接比较鼻刷样本与鼻组织样本在细胞组成和免疫细胞应答方面的差异 | 鼻刷样本主要捕获上皮表面细胞，难以获取深层黏膜层的细胞，且T细胞效应谱和病毒特异性T细胞频率与组织样本存在显著差异 | 评估鼻刷样本是否能准确反映鼻组织的免疫景观 | 配对鼻刷样本和鼻组织样本 | 单细胞分析 | 新冠病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从同一解剖部位收集的配对鼻刷和鼻组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' v3试剂盒 |
| 44 | 2026-07-05 |
IL-31 blockade elevates thymus and activation-regulated chemokine by lifting LAMP3+CD1c+ mature dendritic cells from calcitonin gene-related peptide-calcitonin receptor-like neuroimmune suppression in atopic dermatitis
2026-Jul, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.02.044
PMID:41831623
|
研究论文 | 揭示了IL-31受体阻断后，通过解除CGRP-CALCRL神经免疫抑制，使LAMP3+CD1c+成熟树突状细胞释放胸腺和激活调节趋化因子（TARC）的机制 | 首次阐明IL-31依赖性CGRP-CALCRL神经免疫刹车机制，解释抗IL-31RA治疗后TARC升高的现象 | MC903小鼠模型与人类患者TARC反应强度存在差异，机制研究主要基于体外和动物实验 | 明确IL-31受体阻断后TARC升高的系统变化及其分子机制 | 特应性皮炎患者的血清、皮肤样本及小鼠模型 | 机器学习 | 特应性皮炎 | Olink蛋白质组学、单细胞RNA测序 | 转录组分析、配体-受体推断 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 特应性皮炎患者血清和皮肤样本，MC903小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台 |
| 45 | 2026-07-05 |
Androgen Receptor-Induced Lactoferrin Accelerates Prostate Tumorigenesis Through Modulating Ferroptosis
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520109
PMID:41945871
|
研究论文 | 揭示雄激素受体诱导的乳铁蛋白通过调节铁死亡促进前列腺肿瘤发生的机制 | 首次揭示乳铁蛋白在前列腺癌中的促癌作用，并建立AR-LF-铁死亡轴的新调控机制 | 未提及具体局限性 | 阐明乳铁蛋白在前列腺癌中的功能和潜在治疗策略 | 前列腺癌细胞的铁死亡调控机制 | 机器学习 | 前列腺癌 | RNA-seq，单细胞RNA-seq，蛋白质组学 | NA | 基因表达数据，蛋白质组数据 | TRAMP小鼠模型和TCGA-PARD数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 46 | 2026-07-05 |
Heterogeneity and clinical relevance of group 2 innate lymphoid cells subsets in nasal polyps
2026-Jul, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.03.021
PMID:41956382
|
研究论文 | 本研究探讨了鼻息肉中2型天然淋巴细胞亚群的异质性及其临床相关性 | 首次在鼻息肉中鉴定出四种不同激活状态的ILC2亚群（迁移型、过渡型、炎症型和耗竭型），并揭示其与临床严重程度的相关性 | 样本量较小（6个鼻息肉和4个外周血样本），需要更大规模研究验证 | 探究鼻息肉中ILC2的亚群异质性及其与临床严重程度的关系 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的鼻息肉组织和外周血中的ILC2细胞 | 免疫学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个鼻息肉样本和4个外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-07-05 |
Inhibition of Focal Adhesion Restricts Chemoresistance in Pancreatic Cancer by Targeting SLC7A11 Mediated Ferroptosis
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75216
PMID:42003743
|
研究论文 | 通过单细胞测序和批量测序分析，发现粘着斑激酶抑制剂IN10018可通过靶向SLC7A11介导的铁死亡来限制胰腺癌的化疗耐药性 | 首次揭示粘着斑信号激活与胰腺癌化疗耐药性的关联，并证明FAK抑制剂可通过PI3K-Akt通路靶向SLC7A11介导的铁死亡来克服耐药性 | 未明确说明具体局限性 | 寻找限制胰腺导管腺癌化疗耐药性的候选靶点 | 经化疗治疗的胰腺癌样本和吉西他滨耐药样本 | 机器学习 | 胰腺癌 | scRNA-seq, bulk-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-05-17 |
Corrigendum to 'Multiomic, Histologic, and scRNA-seq Profiling of Pleural Mesothelioma Reveals Negative Prognosis Associated With a Novel Uncommitted Molecular Phenotype' [Journal of Thoracic Oncology Volume 21 Issue 4 (2026) 103529]
2026-Jul, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2026.103915
PMID:42138664
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2026-07-05 |
Network Pharmacological Analysis of Lentinan in Regulating Intervertebral Disc Degeneration: Combined with Machine Learning-Based Screening and Molecular Dynamics Validation
2026-Jul, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100261454407
PMID:42212606
|
研究论文 | 结合网络药理学、机器学习、分子对接和分子动力学模拟，系统探究香菇多糖与椎间盘退变之间的分子机制 | 首次整合网络药理分析与三种机器学习方法筛选核心靶点，并利用单细胞转录组虚拟敲除评估基因扰动对细胞状态和信号网络的重塑作用 | 全部基于公共数据库和计算模拟，缺乏体外或体内实验验证结果 | 阐明香菇多糖治疗椎间盘退变的分子机制 | 香菇多糖与椎间盘退变相关的潜在靶基因及信号通路 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、单细胞转录组分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 三个独立椎间盘退变数据集（含GSE176205） | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2026-07-05 |
Neutrophil-Mimetic MRI Enables Ultra-Early Detection of Vascular Inflammation After Stroke
2026-Jul, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.71325
PMID:42260622
|
研究论文 | 开发了靶向E选择素的铁氧化物微粒作为MRI探针，在卒中后超早期检测血管炎症，实现快速成像 | 首次利用单细胞RNA测序数据识别E选择素作为早期内皮激活标志物，并设计中性粒细胞模拟磁共振探针实现卒中后数小时内炎症的超早期检测 | 未提供具体样本量或临床验证数据，研究基于小鼠模型，可能无法直接推广到人类 | 开发无创、实时的体内检测方法，用于识别可能受益于免疫调节治疗的脑卒中患者 | 小鼠脑缺血再灌注模型和脂多糖诱导神经炎症模型中的血管内皮细胞和中性粒细胞 | 机器学习、计算机视觉 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、磁共振成像 | NA | 单细胞转录组数据、磁共振成像图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-07-05 |
KIAA0101 in human cancers: From biomarker discovery to therapeutic targeting
2026-Jul-01, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189648
PMID:42385916
|
综述 | 综述KIAA0101在人类癌症中作为生物标志物和治疗靶点的作用 | 综合了来自批量转录组学、单细胞测序和空间分辨分析的新证据，揭示KIAA0101高表达的肿瘤状态与增殖、干细胞样、免疫排斥和治疗耐药生态系统相关，并强调其免疫相关效应主要通过NF-κB和Wnt/β-catenin等间接调控途径介导 | 该领域研究仍受限于描述性相关性、小型回顾性队列、亚型盲法检测和不完整的机制验证 | 综合当前关于KIAA0101在癌症中结构特征、调控网络、细胞功能、疾病特异性作用、免疫微环境关联及转化相关性的证据 | KIAA0101（也称PCLAF）蛋白及其在多种人类恶性肿瘤中的作用 | NA | 癌症 | 批量转录组学, 单细胞测序, 空间分辨分析, RNA干扰, CRISPR | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2026-07-05 |
Brain-derived neurotrophic factor (BDNF) signaling in respiratory disease: Mechanisms, neuroimmune crosstalk, and therapeutic implications
2026-Jul-01, Pulmonary pharmacology & therapeutics
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.pupt.2026.102435
PMID:42386036
|
综述 | 探讨脑源性神经营养因子(BDNF)在呼吸系统疾病中的信号机制、神经免疫互作及治疗意义 | 首次系统整合BDNF-TrkB信号在哮喘、COPD、肺纤维化及急性肺损伤等呼吸疾病中的双重调节作用，并揭示单细胞转录组学揭示的细胞异质性对疾病特异性BDNF反应的调控 | 目前对BDNF信号在急性肺损伤/ARDS中的双重作用机制尚未完全阐明，且缺乏针对BDNF-TrkB的靶向治疗临床转化研究 | 阐明BDNF信号在呼吸系统疾病病理生理中的调节作用及治疗潜力 | 呼吸系统疾病中的BDNF信号机制 | 机器学习 | 呼吸系统疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 53 | 2026-07-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts Promote Tumor Immunosuppression in Hepatocellular Carcinoma via the NNMT-ANGPTL4 Axis
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521418
PMID:41980209
|
研究论文 | 本研究揭示了肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞通过NNMT-ANGPTL4轴促进肿瘤免疫抑制的机制 | 首次阐明CAF中NNMT通过结合EZH2调控ANGPTL4分泌，进而诱导PD-L1介导的免疫逃逸的代谢-表观遗传级联反应 | NA | 探究肝细胞癌中CAF的代谢调控机制，特别是NNMT在免疫抑制中的作用 | 肝细胞癌患者来源的CAF、单细胞RNA-seq数据、患者来源类器官、成纤维细胞特异性NNMT敲除小鼠 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、代谢组学分析、蛋白质印迹、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、代谢组学数据 | 多个HCC患者样本、单细胞RNA-seq数据集GSE149614、患者来源类器官、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据来源于公共数据集GSE149614 |
| 54 | 2026-07-05 |
Integrative Multi-Omics Analysis Reveals the Tumor-Suppressive and Immunoregulatory Roles of SEMA5B in Prostate Cancer
2026 Jul-Aug, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.70133
PMID:42399103
|
研究论文 | 通过整合多组学分析揭示SEMA5B在前列腺癌中的肿瘤抑制和免疫调控作用 | 首次系统揭示SEMA5B在前列腺癌中由雄激素受体转录调控的肿瘤抑制功能及其与免疫炎症微环境的关联 | 未提及具体局限性 | 探究SEMA5B在前列腺癌中的功能、调控机制及其作为潜在生物标志物和免疫治疗靶点的可能性 | SEMA5B基因在前列腺癌中的表达、功能及与肿瘤微环境的关系 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序，空间转录组测序，批量RNA测序，ChIP，基因敲低，雄激素/恩杂鲁胺处理，异种移植模型 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据，蛋白质- DNA 结合数据 | 多个单细胞转录组数据集、空间转录组样本、前列腺癌细胞系及体内异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，批量RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-07-05 |
Prognostic and diagnostic evaluation of HSPG2 gene expression in oral squamous cell carcinoma: A case-control study
2026-Jun-30, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
|
研究论文 | 评估HSPG2基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及其诊断和预后价值 | 首次综合评估HSPG2在口腔鳞状细胞癌组织、血浆和唾液中的表达，并利用TCGA和单细胞数据集进行外部验证 | 样本量较小（25例病例和25例对照），唾液样本中HSPG2表达未显示显著差异 | 评估HSPG2在口腔鳞状细胞癌中的诊断和预后潜力 | 口腔鳞状细胞癌患者和健康对照者的组织、血浆和唾液样本 | 机器学习和生物信息学 | 口腔癌 | qRT-PCR, RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 25例OSCC患者和25例年龄、性别匹配的健康对照 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq (推断自TCGA数据) | NA |
| 56 | 2026-07-05 |
Single-cell eQTL and Mendelian randomization analyses of shared genetic architecture in major depressive disorder and schizophrenia
2026-Jun-29, Journal of affective disorders
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jad.2026.122166
PMID:42372879
|
研究论文 | 通过单细胞eQTL和孟德尔随机化分析，揭示精神分裂症和重度抑郁症共享的细胞类型特异性遗传机制 | 首次整合单细胞eQTL数据与大规模GWAS统计，通过孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析，在八种主要脑细胞类型中鉴定共享候选基因 | 未明确提及，但可能包括样本规模、细胞类型覆盖度及因果机制验证不足 | 阐明精神分裂症和重度抑郁症共有的细胞类型特异性遗传机制 | 精神分裂症和重度抑郁症患者脑组织的八种主要细胞类型 | 自然语言处理 | 精神分裂症, 重度抑郁症 | 单细胞eQTL, GWAS, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞RNA测序数据, GWAS汇总统计 | 未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-07-05 |
Integrated single-cell and Mendelian randomization analyses identify aging-induced brain endothelial SPARCL1 deficiency as a key driver of vascular dementia
2026-Jun-29, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2026.113221
PMID:42372928
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，发现脑内皮细胞中SPARCL1的年龄相关性缺乏是血管性痴呆的关键驱动因素 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞转录组学，系统鉴定出SPARCL1在脑内皮细胞衰老和血管性痴呆发病中的因果作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人脑样本，SPARCL1的治疗潜力需进一步在临床前模型中验证 | 阐明脑内皮细胞衰老导致血管性痴呆的分子机制，并识别潜在治疗靶点 | 小鼠脑内皮细胞及人死后脑组织中的内皮细胞 | 机器学习 | 血管性痴呆 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据, 基因组关联数据 | 年轻和老年小鼠脑内皮细胞样本、血管性痴呆患者和对照人死后脑组织 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2026-07-05 |
Yang-Xue-An-Tai Decoction Treats URSA by regulating the differentiation of proliferating decidual stromal cells through multiple targets
2026-Jun-27, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.122133
PMID:42364671
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，探讨养血安胎方通过多靶点调节增殖性蜕膜基质细胞分化来治疗不明原因复发性流产的机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术在URSA小鼠模型中揭示YXAT通过恢复增殖性蜕膜基质细胞的异常下调及其分化来改善妊娠结局，并鉴定Lgals1为关键调控基因 | 研究主要基于小鼠模型，临床验证仅限于人URSA样本中proDSC的异常下调，未进行更广泛的临床干预研究 | 阐明养血安胎方治疗不明原因复发性流产的药理机制，重点揭示其通过多靶点调节蜕膜基质细胞亚型分化的作用 | 不明原因复发性流产小鼠模型及临床样本中的蜕膜基质细胞 | 数字病理学 | 不明原因复发性流产 | 单细胞RNA测序, 伪时间分析, 细胞间通讯分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（孕第7.5天子宫样本）及人类URSA临床样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒 |
| 59 | 2026-07-05 |
Airway immune signatures of protection and disease progression in recent human tuberculosis household contacts
2026-Jun-24, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02544-0
PMID:42343006
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析近期结核病家庭接触者的气道免疫特征，揭示感染后保护与疾病进展的免疫机制 | 首次在单细胞分辨率下描绘结核病家庭接触者气道免疫反应，发现I型IFN依赖和非依赖的中性粒细胞特征，并识别保护性T细胞（调节、静止、干细胞样表型）与进展性T细胞（耗竭、细胞毒性、死亡）的相反关系 | 未明确说明局限性 | 定义局部免疫因素如何决定结核分枝杆菌感染者保持健康或发展为活动性结核 | 近期结核病家庭接触者（包括控制感染者和疾病进展者）以及诊断时活动性结核患者 | 机器学习和单细胞分析 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自支气管肺泡灌洗的近期结核病家庭接触者和活动性结核患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-07-05 |
Border-Associated Macrophages in CNS Health and Disease: A Comprehensive Review of Ontogeny, Heterogeneity, and Functional Plasticity at Neural Interfaces
2026-Jun-11, ASN neuro
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/17590914.2026.2687503
PMID:42397694
|
综述 | 全面综述中枢神经系统边界相关巨噬细胞在健康和疾病中的起源、异质性和功能可塑性 | 整合谱系追踪、单细胞RNA测序和空间转录组学等多维度数据，揭示BAM的区室特异性异质性和双重病理作用 | 缺乏针对BAM亚型的特异性工具，部分机制尚未在人类疾病中得到验证 | 综合理解BAM在健康和神经系统疾病中的生物学功能及治疗潜力 | 中枢神经系统边界相关巨噬细胞（BAM） | 机器学习 | 阿尔茨海默病，多发性硬化症，脑肿瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，谱系追踪 | NA | 图像，文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |