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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-15 |
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2026-Apr, Human immunology
IF:3.1Q3
DOI:10.1016/j.humimm.2026.111687
PMID:41690207
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研究论文 | 单细胞转录组学揭示SOCE阻断剂对炎症反应的靶向调控作用 | 通过单细胞RNA测序技术,首次在PHA驱动的T细胞激活模型中揭示SOCE阻断剂BTP2和CM4620对特定免疫细胞亚群(CD8效应T细胞和NK细胞)的差异性调控,在抑制细胞毒性程序的同时保留CD4调节性T细胞的免疫耐受特征 | 仅使用健康人外周血单核细胞和体外PHA刺激模型,缺乏体内验证实验及与传统免疫抑制剂的直接比较 | 探究SOCE阻断剂在特定激活背景下对不同免疫细胞亚群的细胞类型特异性影响 | 经PHA刺激的正常人外周血单核细胞(PBMCs) | 机器学习和数字病理学 | 移植和免疫介导疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康人PBMCs(具体样本量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2026-06-15 |
High-cholesterol-load-triggered pyroptosis of gingival fibroblasts promotes periodontitis
2026-Apr-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116259
PMID:41707588
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research paper | 该研究揭示了高胆固醇负荷通过溶酶体损伤和CTSB依赖的NLRP3激活诱导牙龈成纤维细胞焦亡,从而促进牙周炎的机制 | 首次阐明胆固醇通过溶酶体损伤和CTSB释放激活NLRP3/Caspase-1/GSDMD通路导致牙龈成纤维细胞焦亡,并验证靶向CTSB或NLRP3对牙周炎的治疗潜力 | 主要基于动物模型和体外实验,临床样本验证有限;未明确胆固醇诱导溶酶体损伤的具体分子机制 | 探讨高胆固醇如何加剧牙周组织损伤的分子机制 | 牙周炎患者的单细胞测序数据、高胆固醇饮食大鼠模型、体外培养的牙龈成纤维细胞 | machine learning, digital pathology | periodontitis | single-cell sequencing, RNA-seq | NA | single-cell sequencing data, transcriptomic data | 牙周炎患者单细胞数据集、高胆固醇饮食大鼠模型 | Illumina | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | Illumina NovaSeq | 单细胞测序和牙龈组织RNA测序 |
| 43 | 2026-06-15 |
Exploring estrogen synthesis and metabolism related markers and immune dynamics in osteoporosis-insights from single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization
2026-Apr, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2026.113070
PMID:41707912
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,探索骨质疏松中雌激素合成与代谢相关标志物及免疫动态 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,系统鉴定CCND1、SCGB1A1和DDIT4作为骨质疏松的潜在生物标志物,并验证DDIT4的风险作用 | 未具体说明样本量、验证队列的多样性以及单细胞测序技术的覆盖范围 | 探索骨质疏松中雌激素代谢相关基因标志物,以改善诊断和治疗方法 | 骨质疏松相关基因、雌激素合成与代谢相关基因 | 数字病理学 | 骨质疏松 | RNA测序、孟德尔随机化分析、qRT-PCR、Western blot | 机器学习模型、诺模图 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2026-06-15 |
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199818
PMID:41734021
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示炎症小体适配器ASC在轻度闭合性脑损伤后促进持续神经炎症和轻度认知障碍的作用 | 首次在轻度闭合性脑损伤模型中阐明ASC作为主要炎症小体适配器在微胶质细胞中特异性表达,并证明其缺失可减轻神经炎症和认知缺陷 | 未提及具体限制 | 探究轻度闭合性脑损伤后炎症小体相关基因的细胞表达及其功能意义 | 轻度闭合性脑损伤小鼠模型及其皮质组织 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠皮质组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 45 | 2026-06-15 |
Modified Shenlingbaizhu decoction suppresses colon cancer via enhancing memory-like Tfh differentiation and B cell responses
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158001
PMID:41763139
|
研究论文 | 探讨改良参苓白术散通过增强记忆样Tfh细胞分化和B细胞反应抑制结肠癌的机制 | 发现改良参苓白术散通过CCL20依赖方式促进肿瘤相关聚集形成,增强Tfh细胞与B细胞的合作,从而在微卫星稳定结直肠癌中发挥抗肿瘤免疫作用 | 未提及具体局限性 | 研究改良参苓白术散是否调节肿瘤微环境中的抗肿瘤免疫应答 | 微卫星稳定小鼠结肠腺癌模型中的Tfh细胞、B细胞、高内皮小静脉相关B细胞及肿瘤相关聚集 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、酶联免疫吸附测定、高效液相色谱 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠结肠腺癌模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-06-15 |
Uncovering Immune Niches in Health and Disease Using Spatial Transcriptomics
2026-Apr, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70185
PMID:41943872
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综述 | 利用空间转录组学技术揭示健康和疾病状态下的免疫微环境 | 首次系统性地回顾了空间转录组学在解析免疫微环境中的应用,特别是B细胞和T细胞克隆微环境的新兴研究 | 主要聚焦于肠道和肿瘤组织,未涵盖其他组织类型的免疫微环境;对技术未来发展的展望较为概括 | 探讨空间转录组学如何用于研究免疫微环境的细胞和分子结构 | 健康和疾病状态下的免疫微环境,特别是肠道和肿瘤组织 | 数字病理学 | 癌症, 炎症性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 47 | 2026-06-15 |
Prussian blue analogue-mineralized ginseng-derived vesicles promote PPARγ nuclear translocation to suppress tumor vasculogenic mimicry and reverse the immunosuppressive microenvironment
2026-Mar-18, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04263-y
PMID:41851872
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研究论文 | 开发了一种仿生纳米平台GDVs@CuPBA-iRGD,通过铜基普鲁士蓝类似物原位矿化人参来源囊泡并偶联肿瘤穿透肽iRGD,用于抑制肿瘤血管拟态并逆转免疫抑制微环境 | 首次利用人参来源囊泡与铜基普鲁士蓝类似物构建仿生纳米平台,通过诱导PPARγ核转位抑制血管拟态,并协同触发抗肿瘤免疫应答 | 未在标题和摘要中明确提及局限性 | 开发抑制肿瘤血管拟态和逆转免疫抑制微环境的创新治疗策略 | 肝细胞癌(HCC)细胞及小鼠模型 | 纳米医学,数字病理 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 48 | 2026-06-15 |
[Crosstalk of keratin 17-positive epithelial cells with CD8+ T cells in oral lichen planus and clinical relevance]
2026-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 探究口腔扁平苔藓中角蛋白17阳性上皮细胞与CD8+ T细胞的相互作用及临床相关性 | 首次揭示KRT17阳性上皮细胞在口腔扁平苔藓中通过HLA-A/B/C-CD8和MIF-CD74/CXCR4通路与CD8+ T细胞交互,并发现KRT17表达与临床严重程度正相关 | 样本量较小,仅涉及有限例数的单细胞和批量测序样本,且未深入机制验证 | 理解KRT17阳性上皮细胞在口腔扁平苔藓发病机制中的作用及其与CD8+ T细胞互作的临床意义 | KRT17阳性上皮细胞和CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫荧光染色 | CellChat, CIBERSORT, Pearson相关性分析 | 基因表达数据, 免疫荧光图像 | 单细胞RNA测序:5例(2例NEOLP、2例EOLP、1例HC);批量RNA测序:40例(27例NEOLP、13例EOLP);免疫荧光:45例(20例NEOLP、20例EOLP、5例HC) | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq, Illumina unnamed | 单细胞RNA测序数据来自10x Genomics平台(隐含);批量RNA测序数据来自GSE213346数据集(Illumina平台) |
| 49 | 2026-06-15 |
Perivascular mesenchymal cells instruct ST2+ reparative macrophages to promote endovascular injury-induced neointimal hyperplasia in mice
2026-Mar-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68587-x
PMID:41794821
|
研究论文 | 通过小鼠血管内损伤模型,发现血管周围间充质细胞通过IL33-ST2-OPN轴引导ST2+修复性巨噬细胞促进新生内膜增生 | 首次揭示血管周围间充质细胞与ST2+修复性巨噬细胞之间的IL33-ST2-OPN信号轴,并证明通过局部水凝胶递送靶向Il33或Spp1的siRNA可有效缓解损伤诱导的新生内膜增生 | 研究仅限于雄性小鼠模型,且未探讨此机制在人类血管疾病中的直接适用性 | 探究血管周围间充质细胞在血管内损伤后免疫-基质细胞相互作用中的免疫调节机制 | 雄性小鼠的血管损伤模型中的血管周围间充质细胞、ST2+修复性巨噬细胞、血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 时间分辨单细胞测序 |
| 50 | 2026-06-15 |
Epithelial plasticity shapes intratumoral heterogeneity and cell lineages in early-stage lung cancer
2026-Mar-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady8546
PMID:41790896
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析早期肺腺癌,系统定义肿瘤状态并揭示表型可塑性驱动的瘤内异质性和细胞谱系 | 首次在早期肺癌中通过单细胞和空间转录组学系统揭示表型可塑性(包括去分化和转分化)是瘤内异质性的关键维度,并识别出AT2向AT1转分化过程中的过渡态,发现KLF4和JDP2转录因子可重编程肿瘤进入过渡态并抑制进展 | 样本量较小(14例患者),需更多队列验证;未明确过渡态在肿瘤进展中的动态演变及治疗靶点转化潜力 | 阐明早期肺癌中瘤内异质性的起源和机制 | 早期肺腺癌患者(14例)的肿瘤细胞和组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、CUT&Tag、批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据和空间转录组图像数据 | 14例早期肺腺癌患者,共103,375个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 51 | 2026-06-15 |
Amino acid metabolism-related model for prognosis and immunity in gastric cancer
2026-Mar-05, Amino acids
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s00726-026-03507-3
PMID:41784817
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研究论文 | 构建基于氨基酸代谢相关基因的胃癌预后模型并分析其与免疫微环境的关联 | 首次系统整合TCGA和GEO数据构建氨基酸代谢相关基因(AAMRGs)预后模型,并结合单细胞RNA测序分析核心基因与免疫细胞的关系,通过PCR验证基因在胃癌细胞中的表达 | 未提及内部队列验证或外部多中心验证,以及模型在临床决策中的实际应用效果 | 系统研究胃癌中氨基酸代谢重编程并构建预后模型,验证基因标志物的预测价值和临床决策作用 | 胃癌患者样本数据及胃癌细胞系 | 机器学习 | 胃癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、PCR | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的胃癌样本,具体数量未提及 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | TCGA和GEO的bulk RNA-seq数据,以及scRNA-seq数据集分析 |
| 52 | 2026-06-15 |
Spatial and cellular composition of lung fibrosis induced by multi-walled carbon nanotubes
2026-Mar-04, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04135-5
PMID:41782027
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研究论文 | 整合空间转录组学等多组学方法研究多壁碳纳米管诱导肺纤维化的空间与细胞组成变化及其对肠道的影响 | 首次鉴定出Slamf7-Slamf7相互作用是巨噬细胞超活化的关键驱动因素,并提供了肺-肠轴关联的机制证据 | 研究主要基于小鼠模型,尚需在人类中验证;空间转录组学的分辨率有限 | 阐明多壁碳纳米管暴露如何影响肺部免疫反应和肠道稳态 | 小鼠(多壁碳纳米管暴露后) | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学、mRNA-seq、代谢组学、16S rRNA微生物组分析 | NA | 基因表达、代谢物、微生物序列 | 小鼠(具体数量未在摘要中明确提及) | NA | 空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-06-15 |
Interferon-γ-Responsive Microglia-Derived Extracellular Vesicles Inhibited Neurogenesis After Stroke via MicroRNA-199a-5p/SIRT1 Axis
2026-Mar-03, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.043532
PMID:41717953
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研究论文 | 本研究揭示干扰素-γ反应性小胶质细胞来源的细胞外囊泡通过miR-199a-5p/SIRT1轴抑制中风后神经发生 | 首次发现干扰素-γ反应性小胶质细胞通过细胞外囊泡中的miR-199a-5p靶向SIRT1,抑制神经干细胞存活和分化,为缺血性中风治疗提供新靶点 | 主要基于小鼠模型,缺乏人体样本验证;miRNA调控网络可能还有其他通路参与 | 探讨干扰素-γ反应性小胶质细胞在中风后神经功能恢复中的作用及分子机制 | 成年雄性小鼠、小胶质细胞BV2细胞系、神经干细胞 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序、miRNA测序、Western blot、实时定量PCR、荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据、miRNA表达数据 | 成年雄性小鼠(具体数量未在摘要中说明);scRNA-seq分析含多个脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2026-06-15 |
A Chromosome-level Assembly and Functional Genomic Resources for the Model Annelid Capitella teleta
2026-Mar-02, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag041
PMID:41732109
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研究论文 | 结合长读长和短读长测序与Hi-C染色质构象捕获技术,构建了环节动物模式物种Capitella teleta的染色体级别核基因组和线粒体基因组,并开发了功能基因组资源 | 首次实现C. teleta染色体级别基因组组装,发现核与线粒体基因组高度重排,揭示了基因家族库与染色体进化之间的解耦,并整合多组学数据显著提升基因标记鉴定质量 | 仅针对实验室品系进行组装,未涉及自然种群遗传多样性;基因组重排的机制和功能意义尚未深入探讨 | 为环节动物模式物种Capitella teleta提供现代化的基因组资源,支持进化发育生物学、比较基因组学和生态毒理学研究 | 环节动物Capitella teleta的实验室品系 | 基因组学 | NA | 长读长测序, 短读长测序, Hi-C染色质构象捕获, RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq | NA | 基因组序列, 染色质构象数据, 转录组数据, 表观组数据 | C. teleta实验室品系(单一个体或少量个体用于组装,具体数量未明确) | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2026-06-15 |
IFN signaling is associated with radiotherapy response in malignant peripheral nerve sheath tumors
2026-Mar-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI195652
PMID:41766654
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研究论文 | 该研究结合多种转录组学和功能基因组学方法,揭示IFN信号通路在恶性外周神经鞘瘤放疗反应中的关键作用 | 首次通过整合单细胞转录组、CRISPR筛选和多平台分析,阐明I型IFN信号介导的放疗反应机制,并证明宿主T细胞和肿瘤IFN受体信号对放疗疗效的必要性 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化仍需进一步验证 | 探究恶性外周神经鞘瘤放疗反应异质性的生物学机制 | 恶性外周神经鞘瘤细胞、小鼠同种移植模型及患者样本 | 机器学习 | 恶性外周神经鞘瘤 | CRISPR干扰筛选、单细胞转录组测序、批量转录组测序 | NA | 转录组数据、CRISPR筛选数据 | 涉及MPNST细胞系、小鼠同种移植模型及人类切除标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-06-15 |
Epitope-spanning antigenic variation reprograms immunodominance and broadens immunity in sequential influenza vaccination
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70202-y
PMID:41771913
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研究论文 | 本文展示了在连续流感疫苗接种中,跨血凝素头部位点的靶向抗原变异重新编程免疫优势,将回忆反应转向保守表位,从而拓宽免疫广度并增强交叉保护 | 首次揭示通过跨多个血凝素头部位点的靶向抗原变异,可重新塑造表位层级,将免疫记忆从显性表位转向保守的亚显性表位,为克服免疫印记限制提供新策略 | 仅使用雪貂模型模拟人类免疫印记样回忆反应,需要进一步在人类临床试验中验证其效果 | 探索通过靶向抗原变异重新编程流感疫苗免疫优势,拓宽免疫广度并增强跨保护 | 甲型H3N2流感病毒的血凝素蛋白,具体针对头部位点A/B/D进行抗原变异 | 机器学习 | 流感 | 单细胞转录组学、ELISpot检测 | NA | 组学数据、免疫学测定数据 | 雪貂模型,具体样本数量未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于生发中心B细胞转录组分析 |
| 57 | 2026-06-15 |
M[Formula: see text]DGAT: Multi-view multi-scale dynamic graph attention network(GAT) based prediction of Parkinson's disease(PD) progression using whole-blood RNA sequencing data
2026-Mar-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40636-x
PMID:41771960
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研究论文 | 提出了一种基于多视图多尺度动态图注意力网络的M³DGAT方法,利用全血RNA测序数据预测帕金森病进展 | 整合时空视图并通过计数草图双线性融合策略构建联合视图表示,动态图比静态图更有效编码疾病进展动态信息 | 未提及具体局限 | 利用多视图多尺度动态图注意力网络预测帕金森病进展轨迹 | 帕金森病患者 | 机器学习 | 帕金森病 | 全血RNA测序 | 动态图注意力网络 | RNA测序数据 | PPMI和PDBP队列样本 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-06-15 |
Multifunctional LepR⁺ skeletal stem/progenitor cells for bone and marrow homeostasis
2026-Mar, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-026-01698-z
PMID:41711875
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综述 | 综述了瘦素受体阳性骨骼干/祖细胞在骨与骨髓稳态中的多功能作用 | 总结了LepR+ SSPCs在发育、成年、衰老和骨折愈合过程中的功能与谱系可塑性,并结合遗传标记和单细胞转录组学的最新进展 | 未明确讨论手段的局限性和未来研究方向 | 全面回顾骨骼干/祖细胞研究的历史背景和最新进展,特别聚焦LepR+ SSPCs | LepR+ 骨骼干/祖细胞(LepR+ SSPCs) | 机器学习 | 骨骼疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-06-15 |
Phylogenomic Placement and Morphological Description of a Novel Phagotrophic Euglenid From Hawaii: Hokulea waialensis n. gen. et sp
2026 Mar-Apr, The Journal of eukaryotic microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1111/jeu.70069
PMID:41749340
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研究论文 | 描述了一种来自夏威夷的新型吞噬性眼虫藻Hokulea waialensis n. gen. et sp.,并通过系统基因组学分析确定了其系统发育位置 | 发现了眼虫藻新属新种Hokulea waialensis,利用单细胞测序和系统基因组学数据揭示了其与Lentomonas和Decastava等属的进化关系 | 未在摘要中明确说明 | 阐明吞噬性眼虫藻中深分支类群的系统发育关系,以理解眼虫藻的进化 | 一种来自夏威夷的新鲜水域吞噬性眼虫藻物种Hokulea waialensis | 机器学习 | NA | 单细胞测序、系统基因组学 | NA | 基因组序列、形态图像 | 一个单细胞培养的物种样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-06-15 |
Early-activated extracellular matrix proteins shape the metabolic and spatial dynamics of the kidney fibrotic microenvironment
2026-Mar, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-026-01458-3
PMID:41776110
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研究论文 | 本文揭示了早期激活的细胞外基质蛋白ECM1通过调控机械-代谢通路影响肾脏纤维化微环境的空间和代谢动态 | 首次发现ECM1作为早期肾脏重塑调节因子,通过整合素α2β1-RhoC轴影响YAP活性,进而解除TEAD4对Pgc1a的抑制,增强线粒体氧化磷酸化,促进修复,揭示了纤维化中基质-线粒体选择性串扰的机械-代谢通路 | NA | 探索早期激活的细胞外基质蛋白在肾脏纤维化微环境中的调控机制 | 肾脏纤维化微环境、细胞外基质蛋白ECM1 | NA | 慢性肾病、肾脏纤维化 | 空间转录组学、蛋白质组学、基因敲除小鼠模型、AAV9介导的基因沉默 | NA | 空间转录组数据、蛋白质组数据 | 全球Ecm1敲除小鼠、成纤维细胞特异性敲除小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |