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当前共找到 40164 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-06 |
Mitochondrial-impaired ductal epithelium fuels TLS formation in Sjögren's disease
2026-Jun-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.05.014
PMID:42243007
|
研究论文 | 发现线粒体功能受损的导管上皮细胞在干燥综合征中促进三级淋巴结构形成 | 首次揭示干燥综合征中纹状导管上皮细胞线粒体功能障碍是三级淋巴结构形成的关键触发因素，并识别出SD-C1亚型作为潜在治疗靶点 | 研究未明确线粒体功能障碍直接导致三级淋巴结构形成的具体分子机制，且动物模型验证主要基于NOD/ShiLtj小鼠，结果外推至人类可能有限 | 探究干燥综合征进展中三级淋巴结构形成的初始驱动因素 | 干燥综合征患者和非干燥综合征患者的唇腺活检组织 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 批量转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、透射电子显微镜 | NA | 转录组数据、空间转录数据、超微结构图像、组织学图像 | 848例唇腺活检样本（668例干燥综合征，180例非干燥综合征） | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 透射电子显微镜用于超微结构分析 |
| 42 | 2026-06-06 |
Integrative genomic analysis of 21 orofacial diseases identifies shared genetic architecture with systemic diseases
2026-Jun-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73925-0
PMID:42243103
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研究论文 | 通过对英国生物银行中21种口面部疾病的整合基因组分析，发现48个新基因座并优先筛选出160个推定致病基因，揭示了口面部疾病与全身疾病之间的遗传结构和因果关系 | 首次系统性地对21种口面部疾病进行全基因组、全转录组、罕见变异关联研究和孟德尔随机化的整合分析，发现了ALDH1A2基因同义变异通过影响翻译效率与牙周炎相关，并利用单细胞RNA测序揭示了牙周炎组织中视黄酸信号受损及Th17偏斜的免疫表型 | 未明确提及局限性，但可能包括因果关系验证的样本选择偏差或UK Biobank人群代表性不足等问题 | 探究口面部疾病与全身疾病的遗传结构和因果关系 | 21种口面部疾病（如牙周炎、龋齿、舍格伦综合征等）及全身疾病（如肺癌、脑卒中） | 机器学习 | 老年性疾病 | 全基因组关联分析、全转录组关联分析、罕见变异关联研究、孟德尔随机化、CRISPR-Cas9编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、遗传变异数据、单细胞表达数据 | 英国生物银行（UK Biobank）中21种口面部疾病患者及对照组数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2026-06-06 |
Inference of spatial chromatin accessibility via integration of spatial transcriptomics and single-cell multi-omics data
2026-Jun-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73948-7
PMID:42243114
|
研究论文 | 提出了一个统一的计算方法ISON，通过整合空间转录组学和单细胞多组学数据，推断空间染色质可及性 | ISON能够准确预测空间位点的染色质可及性图谱，并重建空间分辨的基因调控网络，且在时间和内存上具有可扩展性；其预测的染色质可及性可捕捉顺式和反式调控信息，并能估计位点水平的转录因子活性，区分同一家族内的转录因子，这是仅依靠染色质可及性数据的方法所不具备的特点 | 当前尚无商用试剂盒可同时进行空间多组学分析，阻碍了广泛数据生成 | 开发一种统一的计算方法，通过整合空间转录组学和单细胞多组学数据，实现空间多组学分析 | 空间转录组数据和单细胞多组学数据（基因表达和染色质可及性） | 计算生物学、机器学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞多组学、空间转录组学、计算建模 | 深度学习模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 阿尔茨海默病数据（样本数量未在摘要中明确） | 不适用 | 空间转录组学、单细胞多组学（单细胞RNA-seq与单细胞ATAC-seq联合分析） | 不适用 | 不适用 |
| 44 | 2026-06-06 |
Insights gained from single-cell transcriptomics on the cellular identity and plasticity of prostate epithelial cells
2026-Jun-04, Prostate cancer and prostatic diseases
IF:5.1Q1
DOI:10.1038/s41391-026-01127-2
PMID:42243465
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2026-06-06 |
Microglia and neuroinflammation: function, heterogeneity, and crosstalk
2026-Jun-04, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-026-01438-3
PMID:42243476
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综述 | 综述了小胶质细胞在中枢神经系统中介导神经炎症的功能、异质性及其与其他细胞间的相互作用 | 整合了单细胞测序揭示的小胶质细胞激活状态谱（如DAMs、IRMs、LDAMs），超越了传统的促炎/抗炎二分法，并突出了小胶质细胞在神经炎症网络中的核心通信枢纽作用 | 未说明 | 综述小胶质细胞的起源、发育、分类及其在神经炎症中的动态细胞状态，以及其与其他中枢神经系统细胞的相互作用机制 | 小胶质细胞及其与神经元、星形胶质细胞、少突胶质细胞和外周免疫细胞的相互作用 | 机器学习 | 神经炎症疾病 | 单细胞测序 | 未说明 | 未说明 | 未说明 | 未说明 | 单细胞RNA测序 | 未说明 | 未说明 |
| 46 | 2026-06-06 |
Human microglial transitions at the Aβ-tau inflection point associate with divergent pathways to dementia and resilience
2026-Jun-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-026-04393-8
PMID:42243549
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研究论文 | 结合空间转录组学和单核RNA测序，研究人类小胶质细胞在Aβ-tau拐点处的转变与痴呆和韧性不同路径的关联 | 首次在人类大脑中识别出Aβ-tau拐点，并发现小胶质细胞状态转变是该拐点的关键特征，同时揭示了老年痴呆患者与认知健康百岁老人不同的韧性机制 | 研究样本量有限，仅来自高龄人群，可能无法代表更广泛的AD患者群体 | 解析大脑细胞对淀粉样蛋白-β和tau蛋白的反应，理解阿尔茨海默病的动态过程及韧性机制 | 老年痴呆患者、无痴呆的八旬老人以及认知健康的百岁老人 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 转录组数据,组织图像数据 | 来自老年痴呆患者、无痴呆八旬老人和认知健康百岁老人的样本 | 10x Genomics | 空间转录组学,单核RNA测序 | 10x Visium,10x Chromium | 10x Visium空间转录组学平台和10x Chromium单核RNA测序平台 |
| 47 | 2026-06-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing reveals regulated necrosis-associated heterogeneity in pancreatic cancer
2026-Jun-04, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-026-04437-y
PMID:42243587
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序，揭示了胰腺癌中调控性坏死相关的异质性 | 首次在单细胞分辨率下发现非恶性细胞的调控性坏死状态对胰腺癌异质性有显著贡献，并识别出免疫抑制功能的免疫细胞表现出更高的调控性坏死活性 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在批次效应和样本选择偏差；候选基因A2ML1的功能验证尚未在实验中进行 | 确定调控性坏死相关基因在胰腺癌中的异质性及其预后价值 | 胰腺癌患者样本的单细胞RNA测序数据、转录组数据、体细胞突变和拷贝数变异数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和ICGC数据库的胰腺癌样本 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 从GEO数据库下载的单细胞RNA测序数据，TCGA和ICGC数据库的批量RNA测序数据 |
| 48 | 2026-06-06 |
scKSFD: federated distillation model with knowledge sharing for cell type classification of clinical transcriptome data
2026-Jun-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06508-x
PMID:42243648
|
研究论文 | 提出一个联邦蒸馏框架scKSFD，通过知识共享进行隐私保护的细胞类型分类，适用于临床转录组数据 | 在预测空间通过共享参考数据集的概率级软标签输出实现知识聚合，降低隐私风险；集成分层代理采样以保留稀有细胞群体，并使用概率级聚合缓解批次特异表达偏移 | 依赖参考数据集的质量和代表性；概率级知识共享可能在某些极端异质性场景下性能有限 | 开发一种保护隐私的细胞类型分类方法，解决跨机构单细胞转录组数据协作中的隐私和分布异质性挑战 | 42个临床单细胞转录组数据集 | 机器学习 | 新型冠状病毒病 | scRNA-seq | CNN | 基因表达数据 | 42个临床单细胞转录组数据集 | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 49 | 2026-06-06 |
Tissueformer: extending single-cell foundation models to predict population-level phenotypes
2026-Jun-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06490-4
PMID:42243667
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研究论文 | 介绍Tissueformer，一种基于Transformer的神经网络，通过整合单细胞RNA谱来预测群体水平表型 | 提出Tissueformer模型，结合单细胞分辨率与群体水平标签推理，超越传统的单细胞基础模型和伪批量及细胞类型组成方法 | 未明确提及，但可能受限于样本大小和领域特异性数据需求 | 扩展单细胞基础模型以预测群体水平表型，并提升诊断和组织注释的准确性 | COVID-19患者的血液样本和小鼠大脑的空间转录组数据 | 机器学学习 | COVID-19，神经疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | Transformer | 单细胞RNA谱，空间转录组数据 | COVID-19血液样本和小鼠大脑样本（具体数量未给出） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 50 | 2026-06-06 |
Disease-dependent airway epithelial responses to acute electronic cigarette aerosol exposure: a pilot single-cell analysis
2026-Jun-04, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfag068
PMID:42244142
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析急性和电子烟暴露对健康和哮喘供体气道上皮细胞的细胞类型特异性反应 | 首次在单细胞水平揭示哮喘相关的气道上皮细胞状态如何决定急性电子烟暴露后的炎症、应激和衰老相关转录反应差异 | 该研究为试点研究，样本量较小（来自健康和哮喘供体的细胞培养），且仅分析了急性暴露后的单时间点反应 | 探究电子烟暴露在哮喘和非哮喘气道中引发的细胞类型特异性上皮反应 | 人原代气道上皮细胞（取自健康供体和哮喘供体），在气液界面分化培养 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康供体和哮喘供体来源的细胞培养物，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-06-06 |
Jinhuang San Alleviates Plasma Cell Mastitis by Restoring Th17/Treg Balance through the HTR7/IL-6/JAK2/STAT3 Axis
2026-Jun-03, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121965
PMID:42242601
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研究论文 | 本研究通过化学成分表征、免疫微环境分析和实验验证，探讨金黄散通过HTR7/IL-6/JAK2/STAT3轴恢复Th17/Treg平衡以缓解浆细胞性乳腺炎的机制 | 首次结合单细胞转录组和转录组测序揭示浆细胞性乳腺炎的免疫微环境特征，并阐明金黄散通过巨噬细胞中HTR7/IL-6/JAK2/STAT3轴调节Th17/Treg平衡的新机制 | 未明确金黄散中具体活性成分的作用机制，且研究仅基于小鼠模型，缺乏临床样本质验证 | 探究金黄散治疗浆细胞性乳腺炎的免疫调节作用机制 | 金黄散化学成分、浆细胞性乳腺炎小鼠模型、巨噬细胞-CD4+ T细胞共培养体系 | 机器学习 | 乳腺炎 | UPLC-Q-Orbitrap-MS/MS, 转录组测序, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型诱导的浆细胞性乳腺炎样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 52 | 2026-06-06 |
Integrated Single-Cell Profiling Reveals Dichotomous NK Cell Populations Associated with Immunosuppression in Solid Tumors
2026-Jun-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1229
PMID:41758966
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序系统描绘肿瘤浸润NK细胞的表型和功能景观，发现两种对立的NK细胞群体与免疫抑制相关 | 首次揭示NK细胞中存在由IFNG和TGFB1信号驱动的二分类表型和功能景观，并发现组织驻留适应性NK细胞与免疫检查点阻断疗法响应相关 | 未提及具体局限性 | 研究肿瘤浸润NK细胞的异质性及其对免疫反应和临床预后的影响 | 肿瘤浸润自然杀伤细胞（NK细胞） | 自然语言处理 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种肿瘤类型的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 53 | 2026-06-06 |
A simple cell-cycle control system in Marchantia polymorpha provides a framework for understanding plant cell proliferation
2026-Jun-02, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag103
PMID:41967031
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研究论文 | 通过研究地钱简单细胞周期控制系统，为理解植物细胞增殖提供框架 | 发现非种子植物具有简单的细胞周期基因系统，揭示种子植物复杂性是衍生特征，并首次利用单细胞RNA-seq和活体成像详细表征了地钱细胞周期基因的时相特异性表达 | 主要聚焦于营养性配子体，未涵盖生殖细胞或胁迫条件下的细胞周期调控 | 揭示早期陆地植物祖先细胞周期控制的基本机制及其进化保守性 | 地钱（Marchantia polymorpha）的细胞周期基因系统 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序、活体成像、系统发育分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 地钱营养性配子体样本，未明确数量 | 未提及 | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-06-06 |
Spatiotemporal regulation of arbuscular mycorrhizal symbiosis at cellular resolution
2026-Jun-02, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag133
PMID:42108419
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研究论文 | 通过单细胞分辨率空间转录组学和翻译核糖体亲和纯化RNA测序，揭示水稻与丛枝菌根真菌共生过程中的时空调控机制 | 首次在单细胞水平解析AM共生中的植物与真菌基因空间转录组，并发现相似发育阶段的细胞存在转录异质性，暗示单细胞水平的隐藏功能多样性 | 未明确说明局限性 | 阐明丛枝菌根共生建立过程中植物和真菌在细胞水平的动态时空调控 | 水稻根系被根内球囊霉定殖后的细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、TRAP-seq | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 用于空间转录组学的10x Visium平台 |
| 55 | 2026-06-06 |
Neural crest cell signatures drive tumorigenesis in tuberous sclerosis complex and lymphangioleiomyomatosis
2026-Jun-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195013
PMID:42241577
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示TSC和LAM肿瘤来源于神经嵴细胞，并鉴定出新的生物标志物 | 首次提出TSC和LAM的神经嵴病理模型，发现肿瘤细胞亚群表达颅神经嵴基因特征，并鉴定SPP1、LCN2和KRT18等新型生物标志物 | 主要基于小鼠模型和有限的患者样本，Tsc2 KO对趋化性影响较小，需进一步验证生物标志物在更大临床队列中的价值 | 阐明TSC和LAM的细胞起源及其肿瘤发生机制 | Tsc2+/-小鼠肾囊腺瘤细胞、LAM患者病灶和血清样本 | 数字病理学 | 结节性硬化症、淋巴管平滑肌瘤病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | Tsc2+/-小鼠肾囊腺瘤样本及LAM患者病灶和血清 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2026-06-06 |
Thyroid hormone signaling causally influences pancreatic disease risk: Evidence from Mendelian randomization and multi-omics integration
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学整合分析揭示甲状腺激素信号因果影响胰腺疾病风险 | 首次利用双向孟德尔随机化建立甲状腺功能与胰腺疾病因果关联，并整合单细胞RNA测序和空间转录组学阐明细胞类型特异性机制 | 未提及具体局限性 | 确定甲状腺功能与胰腺疾病（急性胰腺炎、慢性胰腺炎、胰腺癌）的因果关系及其分子机制 | 超过50万例GWAS个体、172例胰腺腺癌、急性胰腺炎（32,830个细胞）、慢性胰腺炎（30,426个细胞）、胰腺癌（95,751个细胞）、253个空间转录组区域 | 机器学习 | 胰腺疾病 | 孟德尔随机化、全基因组关联研究、RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因型数据、转录组数据、单细胞表达数据、空间转录组数据 | 超过50万例个体、172例肿瘤、158,407个细胞、253个空间区域 | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, GeoMx Digital Spatial Profiler | 10x Chromium单细胞3'测序, NanoString GeoMx空间转录组学 |
| 57 | 2026-06-06 |
Automatic cell type identification methods for single-cell RNA sequencing based on coordinate convolutional neural network
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出了一种基于坐标卷积神经网络的自动细胞类型识别方法BP-Coord，用于单细胞RNA测序数据分析 | 通过引入坐标信息作为额外通道增强CNN的空间感知能力，并在CoordConv层前添加双三次插值上采样层以捕捉更精确的位置信息 | 未提及具体局限性 | 解决传统CNN在scRNA-seq数据中因平移不变性导致的细胞类型误分类问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN | 基因表达数据 | 5个公开scRNA-seq基准数据集，包括大规模PBMC数据集和小样本不平衡数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2026-06-06 |
Single-cell and haplotype-resolved transcriptomics reveal molecular signatures of orchid floral structures
2026-Jun-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.03.016
PMID:41928475
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研究论文 | 通过单细胞和单倍型分辨转录组学，揭示兰花花朵结构特化的细胞和分子特征 | 首次整合单细胞转录组与单倍型分辨基因组，揭示细胞类型特异性和等位基因特异性表达如何塑造种间杂交性状 | NA | 解析兰花花朵特化结构的细胞异质性和分子基础 | 石斛‘朝拜微笑’的花芽 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 单倍型分辨基因组 | NA | 基因表达数据, 基因组序列 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'基因表达 |
| 59 | 2026-06-06 |
Deep single-cell decoding of human pancreatic islets reveals T2D β-cell gene expression defects
2026-Jun, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00744-w
PMID:41986506
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研究论文 | 通过大规模单细胞转录组测序分析人类胰岛，揭示2型糖尿病β细胞基因表达缺陷 | 首次在多个供体（包括非糖尿病、前驱糖尿病和T2D状态）中生成245878个单细胞转录组图谱，识别出14种细胞类型，并发现T2D β细胞中511个差异表达基因，包括与维生素A代谢相关的基因，结合遗传、蛋白质组和小鼠模型数据，鉴定出58个候选因果T2D基因 | 未提供具体局限性描述 | 研究人类胰岛细胞在2型糖尿病中的特异性改变 | 来自48个供体的人类胰岛细胞，涵盖非糖尿病、前驱糖尿病和T2D状态 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 245878个人类胰岛细胞，来自48个供体 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 60 | 2026-06-06 |
LMCD1 aggravates cardiac fibrosis after myocardial infarction via activating STAT5A
2026-Jun, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2026.120153
PMID:42066818
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研究论文 | 本研究探索LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的作用，发现其通过激活STAT5A促进纤维化过程 | 首次揭示LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的促纤维化作用，并阐明其通过直接结合并激活STAT5A的分子机制 | 仅在小鼠模型和体外细胞实验中验证，缺乏人类样本验证；未探讨STAT5A下游具体靶基因 | 阐明LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的功能及分子机制，为抗纤维化治疗提供新靶点 | 小鼠心肌梗死模型、TGF-β1诱导的原代心脏成纤维细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫共沉淀、Western blot | NA | 单细胞测序数据、蛋白表达数据 | 小鼠心肌梗死模型（LAD结扎术）；原代心脏成纤维细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 利用公开的单细胞RNA测序数据集进行分析 |