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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-03-17 |
Targeting LUM-mediated inflammatory cell communication and fibroblast apoptosis with SFI in Heart Failure
2026-Mar, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100399
PMID:41621719
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量转录组学和机器学习,揭示了心力衰竭中LUM介导的炎症细胞通讯和成纤维细胞凋亡机制,并验证了参附注射液的保护作用 | 首次将LUM识别为心力衰竭中连接凋亡、炎症和细胞通讯的关键枢纽基因,并阐明了参附注射液通过调控LUM/p38/p53轴发挥心脏保护作用的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限;单细胞测序数据可能受技术偏差影响 | 探究心力衰竭的分子机制及参附注射液的心脏保护作用 | 心力衰竭小鼠模型中的心脏细胞(特别是成纤维细胞和免疫细胞) | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,批量转录组学 | LASSO回归 | RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠心力衰竭模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-03-17 |
Targeting pre-existing club-like cells in prostate cancer potentiates androgen deprivation therapy
2026-Mar, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00375-y
PMID:41629661
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了前列腺癌中类Club细胞的去势耐受性源于转录重编程,并提出了靶向FOSL1/AP-1和PIM激酶的双重靶向治疗策略 | 首次证明小鼠LSC前体细胞的去势耐受性由转录重编程而非内在特性驱动,并识别FOSL1/AP-1作为关键转录因子,同时将Pten LSC特征与人类侵袭性双阴性前列腺癌亚型相关联 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限,且双重靶向药物的临床转化潜力需进一步评估 | 探究去势耐受性前体样细胞在前列腺癌治疗抵抗和肿瘤进展中的作用,并开发靶向治疗策略 | 小鼠LSC前体细胞(类人前列腺Club细胞)、人类双阴性前列腺癌亚型及体外和体内模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-03-17 |
Dextrorotatory kynurenine suppresses acute rejection through inhibiting M1 macrophage-mediated inflammation
2026-Mar, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00377-w
PMID:41644740
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研究论文 | 本研究揭示了右旋犬尿氨酸(D-Kyn)通过抑制M1巨噬细胞介导的炎症来减轻急性排斥反应,并阐明了其作用机制 | 首次发现右旋氨基酸D-Kyn在移植排斥中的关键免疫抑制作用,并揭示其通过PHGDH/TLR4/Caspase-1通路抑制M1巨噬细胞炎症活性的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本分析规模有限,需要更大规模的临床试验验证 | 探索右旋氨基酸在器官移植急性排斥反应中的免疫调节作用及治疗潜力 | 肾移植受者血清样本、小鼠皮肤和肾脏移植模型、M1巨噬细胞 | 免疫学 | 器官移植排斥 | 离子淌度质谱(IM-MS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 质谱数据、单细胞转录组数据 | 肾移植受者血清样本(具体数量未明确)、小鼠移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-03-17 |
Integrated Multi-omics and Experimental Validation Reveal FDX1/LIAS-Mediated Cuproptosis as a Potential Driver of Diabetic Kidney Disease
2026-Mar, Biological trace element research
IF:3.4Q2
DOI:10.1007/s12011-025-04798-5
PMID:41100003
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和实验验证,揭示了FDX1/LIAS介导的铜死亡可能是糖尿病肾病的一个潜在驱动因素 | 首次将铜死亡相关基因与糖尿病肾病联系起来,并利用多组学整合分析(包括bulk RNA-seq、单细胞RNA测序和空间转录组学)结合临床样本验证,系统性地阐明了铜过载和铜死亡通路激活在糖尿病肾病肾小管损伤中的作用 | 研究主要基于动物模型和临床样本的相关性分析,铜死亡在糖尿病肾病中的直接因果机制和具体信号通路仍需进一步的功能实验验证 | 探究铜死亡相关基因在糖尿病肾病中的作用和机制 | 糖尿病肾病患者的临床样本、db/db糖尿病小鼠的肾脏组织 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、临床生化数据 | 糖尿病小鼠模型和糖尿病肾病患者临床样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2026-03-17 |
Organization of mouse prefrontal cortex subnetwork revealed by spatial single-cell multi-omic analysis of SPIDER-Seq
2026-Mar, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwag004
PMID:41835227
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研究论文 | 本研究开发了SPIDER-Seq技术,结合病毒条形码追踪与单细胞测序及空间组学,构建了小鼠前额叶皮层的单细胞空间分子、细胞、解剖和投射组学图谱 | 创新点在于整合了单细胞空间分子、细胞、解剖和投射组学数据,揭示了前额叶皮层投射神经元和转录组细胞簇的模块化组织原则,并利用机器学习预测神经元投射 | 研究局限于小鼠前额叶皮层,未涉及其他脑区或物种,且技术应用可能受样本处理和数据分析复杂性限制 | 研究目标是解析大脑连接组、解剖结构、转录组和空间组学整合的多模态图谱及其组织原则 | 研究对象是小鼠前额叶皮层 | 空间组学 | NA | 单细胞测序,空间组学,病毒条形码追踪 | 机器学习 | 单细胞空间分子数据,转录组数据,投射组数据 | NA | NA | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-03-17 |
Single-Cell Multi-Omics Identifies Measurable Residual Disease Targets Among Myelodysplasia- and Clonal Hematopoiesis-Related Genes in Acute Myeloid Leukemia
2026-Feb-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18050787
PMID:41827722
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析,在缺乏常规可测量残留病标志物的急性髓系白血病患者中,识别出可用于个性化疾病监测的可靠MRD靶点 | 结合单细胞测序和免疫表型分析,首次在骨髓增生异常相关基因和克隆性造血相关基因中识别出适用于MRD监测的特定标志物,并开发了患者特异性ddPCR或EC-NGS检测方法 | 研究样本量较小(仅6名患者),且仅针对缺乏AML定义变异的特定患者群体,可能限制了结果的普遍适用性 | 开发适用于缺乏常规MRD标志物的急性髓系白血病患者的个性化可测量残留病监测方法 | 急性髓系白血病患者的诊断期和首次缓解期样本 | 单细胞多组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞多组学分析、ddPCR、EC-NGS、免疫表型分析 | NA | 单细胞多组学数据、免疫表型数据 | 6名AML患者的诊断期和首次缓解期样本 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 47 | 2026-03-17 |
The Role of Senescence in the Step-by-Step Development of Endometrial Cancer
2026-Feb-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27052309
PMID:41828534
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析,探讨了衰老在子宫内膜癌发展中的作用,发现衰老是癌前和恶性阶段的普遍应激反应,而非大规模逃逸机制 | 首次在单细胞水平上验证了子宫内膜癌发展中的“逃逸衰老”概念,揭示了衰老细胞在癌前和恶性阶段的相似性及免疫调节差异 | 研究基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究衰老在子宫内膜癌从非典型增生到恶性进展中的作用机制 | 正常子宫内膜、非典型子宫内膜增生(AEH)和子宫内膜样子宫内膜癌(EEC)组织中的未纤毛上皮细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-03-17 |
Angiogenesis-Informed Preoperative CT Radiogenomics Predicts Overall Survival in Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Development and External Validation
2026-Feb-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18050768
PMID:41827703
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种基于血管生成信息的术前CT影像组学模型,用于预测肾透明细胞癌患者的总生存期 | 整合多组学数据(包括bulk转录组、微阵列和单细胞RNA测序)来识别血管生成相关的预后基因,并首次构建了连接影像组学特征与转录组风险模式的影像组学模型 | 研究为回顾性设计,需要在更大规模的前瞻性队列中进行进一步验证 | 识别肾透明细胞癌的血管生成相关预后生物标志物,并开发预测总生存期的影像组学模型,以支持风险分层和潜在治疗靶点发现 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理 | 肾癌 | bulk转录组测序, 微阵列, 单细胞RNA测序, 影像组学特征提取, 蛋白质水平验证, Matrigel管形成实验 | XGBoost, 机器学习模型 | 图像, 转录组数据, 蛋白质数据 | 来自TCGA-KIRC队列、7个GEO微阵列数据集、一个scRNA-seq数据集以及TCIA-KIRC影像档案的患者数据,并包含一个独立的外部回顾性队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-03-17 |
Transcriptional Remodeling of Microglia After Experimental Myocardial Infarction
2026-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27052257
PMID:41828478
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索心肌梗死后小胶质细胞的转录组重塑及其代谢调控变化 | 首次在心肌梗死模型中系统分析小胶质细胞的区域特异性转录组变化,并关联代谢功能改变 | 样本量较小,部分功能指标未达统计学显著性,需更大规模研究验证 | 探究心肌梗死后中枢神经系统中小胶质细胞的转录组和代谢适应机制 | 雄性C57BL/6J小鼠的皮质和皮质下区域小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞分选,代谢功能检测 | NA | 单细胞转录组数据,代谢功能数据 | 雄性C57BL/6J小鼠(实验组和假手术组),具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-03-17 |
Advantages of Allogeneic Mesenchymal Stem Cells as an Innovative Therapy in Patients with Endometrium Dysfunction
2026-Feb-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15050400
PMID:41827834
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综述 | 本文综述了异体间充质干细胞在治疗子宫内膜功能障碍(如薄型子宫内膜和反复种植失败)中的创新应用潜力 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了子宫内膜功能障碍的细胞功能损伤机制,并提出了异体间充质干细胞作为治疗候选的创新性 | 现有临床数据有限且异质性高,主要基于非随机化研究,需要进一步的机制研究和临床验证 | 探讨异体间充质干细胞作为子宫内膜功能障碍创新疗法的合理性和潜力 | 薄型子宫内膜和反复种植失败患者的子宫内膜组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-03-17 |
Endogenous Multilayer Control of Cambial Stem Cells and Its Consequences for Wood Formation
2026-Feb-26, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15050710
PMID:41829741
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综述 | 本文综述了维管形成层作为木材形成基本分生组织的调控机制,包括多肽、转录因子和植物激素等复杂网络,以及染色质状态、蛋白质稳定性和非编码RNA等附加调控层 | 整合了单细胞和空间转录组学与定量建模,以解析形成层异质性并预测木材形成的动态特征 | NA | 综述维管形成层的调控网络,以理解其如何协调干细胞活性、细胞分裂和分化,从而改善木材形成潜力 | 维管形成层及其干细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 定量建模 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2026-03-17 |
Accelerating Resistance Breeding: Emerging Methods to Identify and Validate Plant Immunity Genes
2026-Feb-25, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15050685
PMID:41829717
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综述 | 本文综述了加速植物抗病育种的新兴方法,重点介绍了识别和验证植物免疫基因的技术 | 讨论了超越传统遗传关联的新策略,如MutRenSeq和单细胞RNA测序,这些方法能加速实验时间线、减少实验规模并提供抗病机制见解 | NA | 加速植物抗病育种,通过新兴技术更有效地识别和验证植物免疫基因 | 植物免疫基因,如NLR、PRR和易感基因 | 自然语言处理 | NA | MutRenSeq, 单细胞RNA测序, 空间组学, 邻近标记, 计算预测, CRISPR筛选, 细胞死亡检测 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-03-17 |
The ubiquitin-proteasome system is an important driver of EBV-associated nasopharyngeal carcinoma progression: a meta-analysis of transcriptomic data
2026-Feb-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34808-4
PMID:41735356
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荟萃分析 | 本研究通过荟萃分析转录组数据,揭示了泛素-蛋白酶体系统(UPS)是EBV相关鼻咽癌进展的重要驱动因素 | 首次在单细胞分辨率下系统性地将EBV-宿主基因相互作用与鼻咽癌的转录组变化联系起来,并识别出UPS作为关键的调控枢纽和预后标志物 | NPC数据集样本量较小,导致预后关联性仅达到边缘显著水平;研究主要基于公共数据集分析,需要进一步的实验验证和功能研究 | 识别EBV相关鼻咽癌中EBV与宿主基因的相互作用,并探究其在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用 | EBV相关鼻咽癌的转录组数据、单细胞RNA测序数据以及相关的EBV-宿主相互作用数据 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 转录组数据分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、荟萃分析、通路富集分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 基于多个公开数据集,具体样本数量未明确说明,但提及NPC数据集样本量较小 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2026-03-17 |
Reconstructing multi-scale tissue spatial architecture from single-cell RNA-seq with REMAP
2026-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.21.707167
PMID:41756915
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研究论文 | 提出了一种名为REMAP的深度学习框架,通过整合基因表达与邻域级基因-基因协方差,利用单细胞RNA-seq数据和空间转录组学参考,重建组织的多尺度空间结构 | 首次开发了能够整合基因表达与邻域级基因-基因协方差来重建单细胞RNA-seq数据多尺度空间组织的深度学习框架,并在多种组织和疾病类型中验证了其优越性能 | 需要依赖一个或多个空间转录组学参考数据,可能受到参考数据质量和覆盖范围的限制 | 开发一种能够从单细胞RNA-seq数据重建组织空间结构的方法,以克服当前空间转录组学技术的成本与基因覆盖限制 | 小鼠大脑(2D和3D)、人类胎儿皮层、七种人类癌症类型以及人类多发性硬化症图谱 | 计算生物学/生物信息学 | 多发性硬化症、多种癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST) | 深度学习框架 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 多种组织和疾病类型的数据集,包括小鼠大脑、人类胎儿皮层、七种癌症类型和多发性硬化症图谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2026-03-17 |
TAZ (Wwtr1) deficiency leads to ER stress and mitochondrial dysfunction in a mouse model of Fuchs' endothelial corneal dystrophy
2026-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.17.706456
PMID:41756894
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研究论文 | 本研究通过TAZ基因敲除小鼠模型,揭示了Fuchs角膜内皮营养不良的发病机制,涉及内质网应激和线粒体功能障碍 | 首次结合单细胞转录组学、透射电镜和免疫荧光染色,系统阐明了TAZ缺失导致角膜内皮细胞退行性变的机制,并明确了年轻与老年小鼠在细胞反应上的年龄相关差异 | 研究基于小鼠模型,其病理机制向人类疾病的直接转化仍需进一步验证 | 探究Fuchs角膜内皮营养不良的发病机制,并评估TAZ敲除小鼠作为非手术治疗策略测试平台的潜力 | TAZ敲除小鼠的角膜内皮细胞 | 数字病理学 | Fuchs角膜内皮营养不良 | 单细胞RNA-seq, 透射电子显微镜, 免疫荧光染色 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 年轻(2月龄)和老年(11月龄)TAZ敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-03-17 |
Vitamin D deficiency alters prostate epithelial differentiation and increases prostate cancer aggressiveness in ex vivo and in vivo models
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.700850
PMID:41756925
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研究论文 | 本研究通过体外和体内模型探讨维生素D缺乏对前列腺上皮分化和前列腺癌侵袭性的影响 | 首次结合单细胞RNA测序技术,在器官样和动物模型中系统验证维生素D缺乏如何通过干扰雄激素信号通路促进前列腺癌侵袭性 | 研究主要基于小鼠模型和特定人类癌细胞系,临床样本验证有限 | 探究维生素D缺乏作为前列腺癌侵袭性风险因素的作用机制 | 小鼠前列腺器官样、MDA-PCa-2b人类前列腺癌细胞系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-03-17 |
Antibiotic Persistence Emerges from Cell-State-Driven Transcriptional Reprogramming
2026-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.705191
PMID:41756826
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研究论文 | 本研究利用细菌单细胞RNA测序技术,揭示了抗生素持久性形成的转录异质性机制,表明细胞预处理转录状态通过塑造应激反应的冗余性共同决定生存结果 | 首次在细菌系统中应用单细胞RNA测序解析持久性形成的动态过程,建立了生长阶段作为转录变异轴的系统框架,证明预处理细胞状态对持久性频率的决定性作用 | 研究主要关注特定生长阶段和抗生素类型,尚未全面涵盖所有环境压力条件,单细胞测序技术可能遗漏低表达基因 | 阐明抗生素持久性现象的分子机制,探索通过调控细胞状态增强抗生素疗效的策略 | 细菌细胞(具体菌株未明确说明) | 单细胞组学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-02-10 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics with pan-cancer bulk sequencing identifies OSR2 as a multifaceted biomarker for prognosis and tumor immunity
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04595-z
PMID:41661456
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2026-03-17 |
JAG1 expression in papillary thyroid cancer stem-like cells predicts poor prognosis and implicates angiogenesis
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04601-4
PMID:41663780
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,探讨了甲状腺癌干细胞样细胞的特性及其与肿瘤组织中其他细胞的相互作用,特别是JAG1基因在预测预后中的作用 | 利用单细胞RNA测序数据识别甲状腺癌干细胞样细胞,并揭示JAG1与NOTCH1/4在血管生成中的关键相互作用及其对预后的影响 | 研究基于两个独立的数据集,样本量可能有限,且未进行实验验证 | 探索甲状腺癌干细胞样细胞的基因表达谱、细胞间相互作用及其与预后的关联 | 甲状腺癌干细胞样细胞、内皮细胞及临床患者数据 | 单细胞测序分析 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat R包、CytoTRACE、STRING、cytoHubba、clusterProfiler、CellChat | 单细胞RNA测序数据、临床数据 | 两个独立数据集(GSE191288和GSE250521),具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-03-17 |
Melanocyte loss dominates the vitiligo transcriptome: a rank-based meta-analysis of six independent studies
2026-Feb-09, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.02.07.26345817
PMID:41728299
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研究论文 | 通过对六项独立的转录组学研究进行基于排序的荟萃分析,揭示了白癜风皮损中黑色素细胞显著缺失的共识性特征 | 首次采用基于排序的荟萃分析方法整合多种平台(微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq)的白癜风转录组数据,识别出跨平台一致的黑色素细胞缺失特征,并发现了新的候选黑色素细胞标记物 | 免疫激活信号在不同数据集中存在异质性,可能受采样方法和疾病特征的影响 | 识别白癜风皮损的共识性转录组特征 | 白癜风患者的皮损组织 | 数字病理学 | 白癜风 | 微阵列,bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | 稳健排序聚合 | 转录组数据 | 115个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |