单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-05-21	A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis 2025-May-14, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-09002-1 PMID:40369080	研究论文	研究人类特异性增强子HARE5如何通过调控神经前体细胞的增殖和神经发生能力来精细调节大脑皮层发育和连接	揭示了人类特异性增强子HARE5通过调控WNT信号通路影响大脑皮层发育的新机制	研究主要基于小鼠和灵长类动物模型，人类大脑发育的复杂性可能未被完全模拟	探索人类特异性DNA序列对人类大脑皮层发育和复杂性的影响	人类、小鼠和黑猩猩的神经前体细胞及大脑皮层	神经科学	NA	基因组编辑、单细胞RNA测序、活体成像	小鼠和灵长类动物模型、皮质类器官	基因组数据、RNA测序数据、影像数据	多种动物模型和细胞系
42	2025-05-21	Single-cell elderly blood-CSF atlas implicates peripherally influenced immune dysregulation in normal pressure hydrocephalus 2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2412159122 PMID:40324076	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，构建了特发性正常压力脑积水（iNPH）患者外周血和脑室脑脊液的细胞图谱，揭示了与认知功能下降相关的免疫失调现象	首次构建了iNPH患者的单细胞转录组图谱，发现了外周血和脑脊液单核细胞的促炎性改变以及可能代表神经胶质细胞脱落的脑脊液细胞群	样本量相对有限（140,207个单细胞转录组），且仅针对iNPH患者进行研究	探究特发性正常压力脑积水患者的免疫失调机制	特发性正常压力脑积水（iNPH）患者的外周血和脑室脑脊液细胞	单细胞组学	神经系统疾病/脑积水	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	140,207个单细胞转录组
43	2025-05-21	Hdac1 as an early determinant of intermediate-exhausted CD8+ T cell fate in chronic viral infection 2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2502256122 PMID:40333757	research paper	该研究探讨了组蛋白去乙酰化酶1（Hdac1）在慢性病毒感染中作为中间耗竭CD8+ T细胞命运早期决定因素的作用	揭示了Hdac1在促进T-int细胞命运和防止过度激活耗竭程序中的双重调节功能	T细胞亚群分化的表观遗传决定因素尚未完全阐明	研究慢性病毒感染中CD8+ T细胞耗竭亚群分化的表观遗传调控机制	抗原特异性T-int细胞	免疫学	慢性病毒感染	单细胞转录组学、染色质可及性分析	NA	转录组数据、表观遗传数据	NA
44	2025-05-21	Interferon-induced activation of dendritic cells and monocytes by yellow fever vaccination correlates with early antibody responses 2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2422236122 PMID:40333758	研究论文	研究黄热病疫苗接种后树突状细胞和单核细胞的干扰素诱导激活与早期抗体反应的关系	首次通过单细胞RNA测序揭示了黄热病疫苗接种后树突状细胞和单核细胞的激活状态及其与早期IgM抗体反应的关联	研究仅关注了疫苗接种后的早期免疫反应，未涉及长期免疫保护机制	阐明黄热病疫苗接种后早期先天免疫事件及其与保护性免疫生成的关系	人类血液中的树突状细胞和单核细胞亚群	免疫学	黄热病	转录组分析、单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	RNA测序数据、流式细胞数据	大量疫苗接种者的血液样本
45	2025-05-21	Circadian clock-gated cell renewal controls time-dependent changes in taste sensitivity 2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2421421122 PMID:40339128	研究论文	研究探讨了生物钟调控的细胞周期进程如何影响小鼠舌上皮细胞类型的昼夜变化，特别是味觉细胞的周期性更新及其对味觉敏感性的影响	揭示了生物钟通过调控味蕾干细胞的细胞周期进程，驱动味觉细胞群体的昼夜变化，进而影响味觉敏感性的时间依赖性调节	研究主要基于小鼠模型，结果是否适用于人类尚需进一步验证	探究生物钟调控的细胞更新如何影响味觉敏感性的时间依赖性变化	小鼠舌上皮细胞，特别是II型味觉细胞和味蕾干细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序，味蕾类器官培养	NA	基因表达数据，细胞表型数据	小鼠舌上皮细胞
46	2025-05-21	Smooth muscle cells and fibroblasts in the ascending aorta exhibit minor differences between embryonic origins in angiotensin II-driven transcriptional alterations 2025-May-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-99862-4 PMID:40360730	研究论文	研究探讨了升主动脉中平滑肌细胞和成纤维细胞在血管紧张素II驱动下的转录变化，比较了不同胚胎起源细胞的差异	发现了新的成纤维细胞亚群，其中SHF来源的成纤维细胞在细胞外基质相关基因表达上与nSHF来源的存在差异	研究仅关注了AngII诱导的胸主动脉病变前期阶段，未涉及疾病进展的后期变化	探究不同胚胎起源细胞对AngII的谱系特异性反应	升主动脉中的平滑肌细胞(SMCs)和成纤维细胞	心血管疾病研究	胸主动脉病变	单细胞RNA测序	Mef2c-Cre R26RmT/mG小鼠模型	转录组数据	AngII输注3天前后的升主动脉细胞
47	2025-05-21	Activity-dependent development of the body's touch receptors 2025-May-13, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2025.04.015 PMID:40381613	research paper	该研究揭示了神经元活动在体感神经元发育中的作用，特别是Piezo2和Na1.6通道对机械感觉终末器官形成的影响	首次证明了机械刺激引发的神经元活动在早期生命中塑造机械感觉终末器官成熟的作用	研究主要关注Piezo2和Na1.6通道，可能还有其他未被发现的机制参与这一过程	探究神经元活动在体感神经元发育中的作用机制	体感神经元和机械感觉终末器官	神经科学	NA	单细胞RNA测序、基因敲除	基因敲除模型	基因表达数据、电生理数据	使用基因敲除小鼠模型进行研究
48	2025-05-21	Molecular and genetic characterization of sex-linked orange coat color in the domestic cat 2025-May-12, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2025.04.055 PMID:40378841	研究论文	本研究揭示了家猫性连锁橙色被毛颜色的分子和遗传特征，发现其由ARHGAP36基因的异常表达引起	首次确定性连锁橙色被毛颜色由5-kb缺失导致ARHGAP36基因的异位表达，揭示了其在PKA通路中的抑制作用	研究局限于家猫模型，未在其他哺乳动物中验证该机制的普适性	解析家猫性连锁橙色被毛颜色的遗传机制	家猫性连锁橙色被毛颜色相关基因	遗传学	NA	单细胞RNA测序(RNA-seq)	NA	基因表达数据	胎儿猫皮肤样本（具体数量未说明）
49	2025-05-21	Paired mutation calling and spatial transcriptomics identify cellular neighbourhoods dictating the neoplastic outcome of colitis 2025-May-08, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-6401505/v1 PMID:40386410	研究论文	通过配对突变检测和空间转录组学技术，研究结肠炎相关肿瘤发生过程中细胞微环境对突变克隆选择和扩展的影响	结合体内谱系追踪、计算机模拟、突变分析和空间转录组学技术，揭示了修复性组织微环境促进促癌克隆选择和扩展的机制	研究基于小鼠模型，结果在人类疾病中的适用性需要进一步验证	探究结肠炎相关肿瘤发生过程中细胞微环境对突变克隆选择和扩展的影响机制	结肠炎相关肿瘤发生过程中的突变克隆和细胞微环境	空间转录组学	结肠炎相关癌症	体内谱系追踪、计算机模拟、突变分析、空间转录组学	小鼠模型	基因突变数据、空间转录组数据	NA
50	2025-05-21	Heterogeneous pericoerulear neurons tune arousal and exploratory behaviours 2025-May-07, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08952-w PMID:40335695	research paper	该研究揭示了蓝斑核周围异质性GABA能神经元如何调控觉醒和探索行为	首次在蓝斑核树突区发现转录、空间和功能多样的GABA能神经元群体，并阐明其通过调控蓝斑核放电模式来控制全局觉醒水平	研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证	探索局部神经调节输入如何控制蓝斑核功能及其在觉醒调控中的作用	蓝斑核(LC)及周围(peri-LC)的神经元	神经科学	神经精神疾病	病毒追踪技术、单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	基因表达数据、神经电生理数据	行为实验小鼠
51	2025-05-21	Oncogene aberrations drive medulloblastoma progression, not initiation 2025-May-07, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08973-5 PMID:40335697	研究论文	本研究利用单细胞技术探讨了3/4组髓母细胞瘤中癌基因畸变和拷贝数变异在肿瘤进化和治疗抵抗中的作用	揭示了大规模染色体畸变是肿瘤发生的早期事件，而单基因癌基因事件则发生在晚期，并且MYC在疾病进展中可成为克隆性驱动因素	研究仅针对已知MYC、MYCN和PRDM6改变的3/4组髓母细胞瘤病例	解析3/4组髓母细胞瘤中癌基因畸变和拷贝数变异在肿瘤进化和治疗抵抗中的相互作用	3/4组髓母细胞瘤	数字病理学	髓母细胞瘤	单核RNA测序（snRNA-seq）、单核转座酶可及染色质测序（snATAC-seq）和空间转录组学	群体遗传学模型	单细胞测序数据、空间转录组数据	一组已知MYC、MYCN和PRDM6改变的3/4组髓母细胞瘤病例
52	2025-05-21	Multi-Omics Biomarkers for Predicting Efficacy of Biologic and Small-Molecule Therapies in Adults With Inflammatory Bowel Disease: A Systematic Review 2025-May, United European gastroenterology journal IF:5.8Q1 DOI:10.1002/ueg2.12720 PMID:39656426	系统综述	本文系统综述了用于预测成人炎症性肠病生物制剂和小分子药物治疗效果的多组学生物标志物	整合多组学数据集模型，评估多种治疗干预反应的特定生物标志物	基于PubMed文献，可能存在发表偏倚	推动精准医学领域发展，优化炎症性肠病治疗方案选择	成人炎症性肠病患者	精准医学	炎症性肠病	多组学方法（基因组学、转录组学、蛋白质组学、微生物组学、代谢组学）	多组学整合模型	多组学数据	NA
53	2025-05-21	A STT3A-dependent PD-L1 glycosylation modification mediated by GMPS drives tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma 2025-May, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-024-01432-0 PMID:39690246	研究论文	本研究通过蛋白质组学和单细胞RNA测序分析，揭示了GMPS通过调控PD-L1的糖基化修饰促进肝细胞癌免疫逃逸的机制	首次发现GMPS通过连接Sec61通道复合体和STT3A来增强PD-L1与STT3A的结合，从而调控PD-L1的糖基化修饰和表达	研究主要基于实验室模型，尚未进行大规模临床验证	探索肝细胞癌中肿瘤快速生长和转移的调控机制	肝细胞癌组织和相关免疫细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	蛋白质组学分析、scRNA-Seq	NA	蛋白质组数据、单细胞转录组数据	晚期肝细胞癌组织样本
54	2025-05-21	Revealing VCAN as a Potential Common Diagnostic Biomarker of Renal Tubules and Glomerulus in Diabetic Kidney Disease Based on Machine Learning, Single-Cell Transcriptome Analysis and Mendelian Randomization 2025-May, Diabetes & metabolism journal IF:6.8Q1 DOI:10.4093/dmj.2024.0233 PMID:39849979	research paper	该研究通过机器学习、单细胞转录组分析和孟德尔随机化方法，揭示了VCAN作为糖尿病肾病肾小管和肾小球共同诊断生物标志物的潜力	首次将VCAN鉴定为糖尿病肾病肾小球和肾小管病变的共同诊断标志物，并证实其与免疫基因上调和免疫细胞浸润的相关性	未说明样本量大小，且仅基于转录组数据验证，缺乏蛋白质水平的功能验证	寻找糖尿病肾病肾小球和肾小管病变的共同诊断生物标志物	糖尿病肾病患者的肾小球壁上皮细胞和近曲小管细胞	machine learning	diabetic kidney disease	single-cell transcriptome, mendelian randomization	NA	transcriptome data	NA
55	2025-05-21	Impact of mechanotransduction on gene expression changes in periodontal ligament during orthodontic tooth movement 2025-May, Journal of bone and mineral metabolism IF:2.4Q3 DOI:10.1007/s00774-025-01581-3 PMID:39893595	研究论文	研究机械转导对正畸牙齿移动过程中牙周韧带基因表达变化的影响	首次通过单细胞RNA测序揭示了Mkx在机械刺激下的功能及细胞群变化，并发现Mkx可能对牙周韧带在机械刺激中具有保护作用	研究仅基于大鼠模型，人类样本仅进行了RT-qPCR验证，样本量和多样性有限	阐明Mkx在机械转导中的作用及牙周韧带在正畸牙齿移动中的细胞和分子变化	野生型大鼠牙周韧带及人类牙周韧带细胞	生物医学	牙科疾病	单细胞RNA测序, RT-qPCR	NA	基因表达数据	野生型大鼠牙周韧带在0天、1周和2周后的样本，人类牙周韧带细胞
56	2025-05-21	Integrating Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis to Investigate the Role of Ferroptosis in Ischemic Stroke and the Molecular Mechanisms of Immune Checkpoints 2025-May, World neurosurgery IF:1.9Q2 DOI:10.1016/j.wneu.2025.123908 PMID:40118372	研究论文	本研究通过整合单细胞测序和转录组分析，探讨了铁死亡在缺血性卒中中的作用及免疫检查点的分子机制	首次结合单细胞测序和机器学习算法识别了与缺血性卒中相关的关键铁死亡基因，并验证了其诊断价值	研究仅基于公开数据集GSE247474，未进行独立队列验证	探索铁死亡在缺血性卒中中的分子机制并寻找早期诊断标志物	缺血性卒中患者的星形胶质细胞和T细胞亚群	生物信息学	缺血性卒中	单细胞转录组测序	Lasso回归和支持向量机	基因表达数据	来自GSE247474数据集的样本（具体数量未说明）
57	2025-05-21	Glial changes and gene expression in Alzheimer's disease from snRNA-Seq and spatial transcriptomics 2025-May, Journal of Alzheimer's disease : JAD DOI:10.1177/13872877251330320 PMID:40267277	研究论文	该研究通过整合单核RNA测序数据和空间转录组学数据，量化了阿尔茨海默病(AD)中前额叶皮层和颞叶回中的细胞变化	首次整合SEA-AD的单核测序数据与空间转录组学来量化AD中的细胞变化，并揭示了胶质细胞在AD进展中的关键作用	研究仅关注前额叶皮层和颞叶回区域，可能无法完全代表AD在所有脑区的病理变化	理解阿尔茨海默病进展中的细胞动态变化	前额叶皮层和颞叶回中的神经元、胶质细胞和免疫细胞	数字病理学	阿尔茨海默病	单核RNA测序(snRNA-Seq)和空间转录组学	NA	基因表达数据	来自SEA-AD数据库的样本(具体数量未明确说明)
58	2025-05-21	The cell-intrinsic circadian clock is dispensable for lateral posterior clock neuron regulation of Drosophila rest-activity rhythms 2025-May, Neurobiology of sleep and circadian rhythms DOI:10.1016/j.nbscr.2025.100124 PMID:40386580	研究论文	研究果蝇休息-活动节律中侧后时钟神经元（LPNs）的分子钟功能和神经元活动的作用	使用遗传工具进行高度选择性的细胞特异性操作，发现LPNs在缺乏细胞内在分子钟的情况下仍能传递昼夜节律信息	研究仅针对果蝇的LPNs，结果可能不适用于其他物种或神经元类型	探究侧后时钟神经元在调节休息-活动节律中的作用	果蝇的侧后时钟神经元（LPNs）	神经科学	NA	基因沉默、CRISPR	NA	行为数据	果蝇的约240个大脑时钟神经元
59	2025-05-21	Inactivation of GSK3β by Ser389 phosphorylation prevents thymocyte necroptosis and impacts Tcr repertoire diversity 2025-May, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-024-01441-z PMID:39779909	研究论文	该研究通过高分辨率单细胞RNA测序分析，揭示了GSK3β通过Ser389磷酸化失活对胸腺细胞坏死性凋亡的抑制作用及其对Tcr多样性的影响	发现了GSK3β通过Ser389磷酸化失活的新机制，该机制在胸腺细胞V(D)J重组过程中对细胞周期检查点和生存途径具有关键作用	研究仅基于小鼠DN3和DN4胸腺细胞，未涉及其他细胞类型或人类样本	探究胸腺细胞在Tcrb和Tcra基因重组过程中细胞周期检查点和生存途径的调控机制	小鼠DN3和DN4胸腺细胞	分子生物学	NA	scRNA-seq	NA	RNA测序数据	个体分选的小鼠DN3和DN4胸腺细胞
60	2025-05-21	Identification of druggable genetic targets for prostate cancer risk based on mendelian randomization and single-cell RNA sequencing 2025-Apr-30, International urology and nephrology IF:1.8Q3 DOI:10.1007/s11255-025-04525-y PMID:40304996	研究论文	本研究通过孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序技术，识别与前列腺癌风险相关的可药物化遗传靶点	整合多种高级遗传分析技术（MR、共定位、单细胞RNA测序）进行靶点验证，首次发现BAK1等5个基因在前列腺癌T细胞/巨噬细胞中富集	BAK1靶点可能引起血小板计数增加的副作用，其他靶点的临床转化潜力需进一步验证	识别可作为治疗靶点或诊断标志物的前列腺癌相关可药物化基因	2608个可药物化基因（来自eQTLs与可药物基因组数据库交叉筛选）	生物信息学	前列腺癌	孟德尔随机化(MR)、共定位分析、单细胞RNA测序、表型全基因组关联研究(PheWAS)	NA	基因组数据（GWAS、eQTLs）、单细胞转录组数据	NA（基于公共GWAS数据库和单细胞测序数据）