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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-03-11
Identification of Key Genes via Integrated Multi-Omics and Machine Learning Uncovers Tumor Biological Features and Prognostic Biomarkers in Uterine Leiomyosarcoma
2026, International journal of medical sciences IF:3.2Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习算法,识别了子宫平滑肌肉瘤的关键基因,构建了诊断模型,并探索了这些基因与肿瘤免疫微环境的关系 首次整合多队列数据(包括单细胞测序)和113种机器学习算法来识别子宫平滑肌肉瘤的关键基因和构建诊断模型,并应用孟德尔随机化探索基因与疾病的因果关系 孟德尔随机化分析未发现关键基因与子宫平滑肌肉瘤之间存在遗传因果关系,且研究依赖于公共数据库数据 探索子宫平滑肌肉瘤的发病机制、识别诊断生物标志物,并阐明关键基因与肿瘤免疫微环境的关系 子宫平滑肌肉瘤患者的多组学数据 机器学习 子宫平滑肌肉瘤 单细胞测序, 多组学整合分析, 机器学习, 孟德尔随机化 GBM 基因表达数据, 单细胞数据 多个公共数据集(4个GEO数据集、TCGA-SARC、单细胞测序数据) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
42 2026-03-11
Single-cell transcriptomics reveals cellular and genetic mechanisms of alpine adaptation in Rosa sericea
2026, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学技术揭示了高山植物绢毛蔷薇(Rosa sericea)叶片在细胞和遗传水平上的高海拔适应机制 首次构建了绢毛蔷薇叶片的单细胞转录图谱,结合hdWGCNA、伪时间轨迹分析等多种方法,鉴定了与高海拔适应相关的细胞类型特异性基因模块和调控网络 研究仅针对叶片组织,未涵盖其他器官;功能验证实验相对有限;样本来自特定地理区域,普适性需进一步验证 探究高山植物在极端环境下的细胞与遗传适应机制 绢毛蔷薇(Rosa sericea)叶片细胞 植物生物学 NA 单细胞核RNA测序(snRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、基因本体富集分析、基因集富集分析(GSEA)、伪时间轨迹推断、基因过表达技术 NA 单细胞转录组数据 31,796个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
43 2026-03-11
The mechanism of Vicenin-2 in ameliorating skin photoaging: involvement of m6A-modified macrophage polarization
2026, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了天然黄酮类化合物Vicenin-2通过调节m6A修饰的巨噬细胞极化来改善皮肤光老化的机制 首次揭示了Vicenin-2通过上调m6A修饰调节因子KIAA1429,增强整体m6A RNA甲基化,并抑制NF-κB通路激活,从而促进巨噬细胞从促炎M1表型向抗炎M2表型转变,为光老化干预提供了新的潜在局部治疗剂 研究主要基于小鼠模型和RAW264.7细胞系,尚未在人体中进行验证;具体m6A修饰的靶基因及其在巨噬细胞极化中的详细作用机制有待进一步阐明 探究Vicenin-2改善皮肤光老化的作用机制,特别是其在调节巨噬细胞极化中的作用 皮肤光老化小鼠模型、LPS诱导的RAW264.7巨噬细胞 单细胞组学 皮肤光老化 单细胞测序、体内外实验 NA 单细胞测序数据、体内外实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
44 2026-03-11
scCNMF: an integrated analysis model for paired single-cell RNA sequencing and assay for transposase-accessible chromatin sequencing data leveraging cell similarity and cis-regulatory potential
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本文提出了一种名为scCNMF的新模型,用于整合分析配对的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,以提升细胞状态表征和基因调控网络重建的准确性 scCNMF模型首次在非负矩阵分解框架中同时考虑了细胞相似性结构和先验调控信息,有效解决了scATAC-seq数据高稀疏性和细胞水平调控交互的整合难题 未明确说明模型在超大规模数据集上的计算效率或对特定细胞类型的适用性限制 开发一种能够整合配对单细胞多组学数据的分析方法,以提高细胞聚类准确性和生物学可解释性 配对的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 非负矩阵分解 单细胞多组学数据 多个真实世界数据集(未指定具体数量) NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
45 2026-03-11
Neuro-immune-related gene signatures define molecular subtypes and prognostic score in bladder cancer with SERPINE2 as a potential therapeutic target
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过分析膀胱癌转录组数据,构建了神经免疫相关评分模型,识别了核心基因并验证了SERPINE2作为潜在治疗靶点的作用 首次在膀胱癌中系统研究了神经免疫相互作用的分子特征,构建了具有预测能力的神经免疫相关评分模型,并通过单细胞测序揭示了肿瘤微环境的异质性,同时通过功能实验和GWAS分析验证了SERPINE2的致癌作用和遗传易感性 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,功能验证仅在T24细胞系中进行,缺乏体内实验和更广泛的临床样本验证 探究膀胱癌中神经免疫相互作用的分子特征,构建预后模型并识别潜在治疗靶点 膀胱癌患者转录组数据、单细胞转录组数据、T24膀胱癌细胞系 生物信息学 膀胱癌 转录组分析、单细胞RNA-seq、shRNA敲低、功能实验、全基因组关联研究 预后评分模型 转录组数据、单细胞转录组数据 来自TCGA和UCSC Xena数据库的膀胱癌患者转录组数据,以及单细胞RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
46 2026-03-11
Itaconate Modulates Neutrophil Homeostasis to Ameliorate Airway Inflammation in Diesel Exhaust Particles-exacerbated Asthma via Inhibiting NETs Formation
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示了衣康酸通过抑制中性粒细胞胞外诱捕网形成,调节中性粒细胞稳态,从而改善柴油机尾气颗粒加剧的哮喘中的气道炎症 首次阐明了中性粒细胞在DEP诱导的皮质类固醇抵抗性哮喘中的双重免疫调节功能,即同时通过NETosis和Th17激活传播炎症,又通过ITA介导的代谢调节抑制免疫过度激活 研究主要基于小鼠模型,其在人体中的确切机制和疗效仍需进一步验证 探究柴油机尾气颗粒加剧的哮喘中皮质类固醇抵抗的生物学机制,并评估衣康酸的治疗潜力 哮喘小鼠模型、中性粒细胞 NA 哮喘 多组学分析、单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞测序 NA NA
47 2026-03-11
Targeting Macrophage-to-Myofibroblast Transition Mitigates Progression from Inflammation to Fibrosis in Rosacea
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示了酒渣鼻中巨噬细胞向肌成纤维细胞转化(MMT)是驱动纤维化重塑的关键机制,并发现天然化合物鸦胆子素A可通过靶向STAT3棕榈酰化抑制MMT和炎症 首次在酒渣鼻中鉴定出巨噬细胞向肌成纤维细胞转化(MMT)是连接炎症与纤维化的关键机制,并发现STAT3棕榈酰化是MMT的调控靶点,天然化合物鸦胆子素A具有双重抗炎抗纤维化作用 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本量有限,鸦胆子素A在人体中的疗效和安全性需进一步验证 探究酒渣鼻从炎症进展为纤维化的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 酒渣鼻患者皮肤组织、LL37诱导的小鼠酒渣鼻模型、巨噬细胞 数字病理学 皮肤疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST)、血清蛋白质组学、组织染色、谱系追踪 小鼠疾病模型 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、组织图像数据 酒渣鼻患者皮肤活检组织、LL37诱导的小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
48 2026-03-11
Metabolic Adaptation of CD8⁺ T Cells Limits the Efficacy of Fatty Acid Oxidation Inhibition in Type 1 Diabetes
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了脂肪酸氧化抑制剂曲美他嗪在1型糖尿病非肥胖糖尿病小鼠模型中对CD8⁺ T细胞的代谢适应和疾病进展的影响 揭示了CD8⁺ T细胞通过上调CPT1A来适应脂肪酸氧化抑制的代谢逃逸新机制,并验证了脂肪酸氧化作为1型糖尿病治疗靶点的重要性 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果尚需验证;长期治疗可能因代谢适应而降低疗效 评估脂肪酸氧化抑制剂曲美他嗪对1型糖尿病自身免疫反应的调控作用及潜在治疗价值 非肥胖糖尿病小鼠模型、人类CD8⁺ T细胞、胰岛浸润免疫细胞 免疫代谢学 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 非肥胖糖尿病小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
49 2026-03-11
ANXA1-mediated mTOR/FABP4 Inhibition Drives Antifibrotic Macrophage Reprogramming in Lupus Nephritis
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了ANXA1通过抑制mTOR/FABP4通路驱动巨噬细胞向抗纤维化表型重编程,从而减轻狼疮性肾炎中的纤维化过程 首次揭示ANXA1通过FPR2/ALX受体信号抑制mTOR/FABP4活性,增强脂肪酸氧化,促进巨噬细胞向抗纤维化表型极化,为狼疮性肾炎提供了新的治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据,人类样本验证有限,且ANXA1-mimetic肽Ac2-26的临床转化潜力需进一步评估 探究ANXA1在狼疮性肾炎纤维化中的作用机制,并寻找新的治疗策略 狼疮性肾炎患者样本、狼疮易感小鼠模型以及单细胞RNA测序鉴定的巨噬细胞亚群 数字病理学 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 狼疮性肾炎患者样本和狼疮易感小鼠模型,具体样本数量未明确 NA 单细胞RNA-seq NA NA
50 2026-03-11
CD44/POU2F2/BCL9L axis mediates MIF-driven SPP1+TAM activation in colorectal cancer metastasis
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示了在结直肠癌转移中,MIF/CD44/POU2F2/BCL9L信号轴介导SPP1+TAM激活的机制 首次发现MIF/CD44/POU2F2/BCL9L信号轴在SPP1+TAM激活和结直肠癌转移中的关键作用,并识别了潜在的治疗靶点 样本量相对较小(临床组织微阵列n=42),且机制研究主要在体外和动物模型中进行,需要进一步临床验证 探究SPP1+TAMs在结直肠癌转移中的激活机制并识别治疗靶点 结直肠癌细胞、SPP1+肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、临床结直肠癌患者组织 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据、临床组织微阵列数据 临床组织微阵列样本42例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
51 2026-03-11
Integrated Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveals the Diagnostic Value of Synovial Tissue Calprotectin and the MDSC-Associated Immune Microenvironment in Periprosthetic Joint Infection
2026, Infection and drug resistance IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序,揭示了钙卫蛋白在人工关节感染滑膜组织中的诊断价值及其与MDSC相关免疫微环境的关系 首次在PJI滑膜组织中全面表征S100A8和S100A9的细胞表达谱,并揭示其与MDSC介导的免疫抑制微环境的紧密关联 样本量相对有限,且主要依赖公共数据库数据,需要进一步独立队列验证 探究人工关节感染(PJI)的诊断生物标志物及其免疫微环境特征 人工关节感染(PJI)患者和对照组的滑膜组织及超声处理液样本 数字病理学 人工关节感染 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色 CellChat算法 RNA测序数据, 图像数据 93例样本(53例PJI患者, 40例无菌性失败对照) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
52 2026-03-11
Renal Cell Type and State Estimation in Brightfield Histology Images: A Pilot Study on Diabetic Nephropathy
2025-Feb, Proceedings of SPIE--the International Society for Optical Engineering
研究论文 本研究探索了基于机器学习的方法,利用深度学习模型从亮场组织学图像中预测细胞类型和状态,以提升糖尿病肾病的临床诊断和预后评估 提出了一种两阶段管道,结合图像到文本检索网络和视觉语言模型,利用CONCH模型从亮场图像中生成组织病理学文本提示,并预测细胞类型/状态比例,相比仅使用图像输入的模型有显著性能提升 研究为试点性质,样本量有限,仅基于印第安纳大学收集的糖尿病肾病样本,且依赖于10X Visium空间转录组学数据作为参考,可能限制了模型的泛化能力 开发一种从亮场组织学图像中预测细胞类型和状态的机器学习管道,以弥补传统组织病理学与分子诊断之间的差距 糖尿病肾病患者的肾组织样本,包括肾小球、肾小管、血管和间质等结构 数字病理学 糖尿病肾病 空间转录组学,深度学习 CONCH, ViT, ResNet 图像,文本 来自印第安纳大学的糖尿病肾病样本的10X Visium FFPE全玻片图像 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10X Visium formalin-fixed paraffin-embedded whole slides images
53 2026-03-11
Bayesian Sparse Gaussian Mixture Model for Clustering in High Dimensions
2025, Journal of machine learning research : JMLR IF:4.3Q2
PMID:41799364
研究论文 本文提出了一种贝叶斯稀疏高斯混合模型,用于高维数据聚类,特别是在单细胞RNA测序数据分析中应用 提出了一种计算可行的贝叶斯方法,使用连续尖峰-平板先验估计高维稀疏高斯混合模型,无需预先指定聚类数量,且后验收缩率达到了极小极大最优 未明确提及模型在处理极端高维或噪声数据时的具体限制,也未讨论计算复杂度随样本量增长的具体情况 开发一种在高维情况下能自适应估计聚类数量的计算可行聚类方法 高维数据,特别是单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 贝叶斯稀疏高斯混合模型 高维数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
54 2026-03-10
Immunotherapy impact of macrophage glycosylation on cholangiocarcinoma and its prognostic and immune microenvironment significance
2026-Dec-31, Human vaccines & immunotherapeutics IF:4.1Q2
研究论文 本研究基于糖基化相关基因构建了一个预测胆管癌预后和免疫治疗响应的风险模型 通过整合单细胞RNA测序数据识别巨噬细胞亚群中的糖基化模式,并开发了一个包含五个基因的风险模型来预测胆管癌的免疫治疗响应 研究主要基于生物信息学分析,体外实验验证仅限于PGK1基因,需要进一步体内实验和临床验证 开发一个基于糖基化相关基因的预后模型,以预测胆管癌的预后和免疫治疗响应 胆管癌的巨噬细胞亚群和糖基化相关基因 数字病理学 胆管癌 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO Cox回归 LASSO Cox回归模型 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
55 2026-03-10
ADAM12-programmed ECM-CAF remodeling activates PI3K-AKT and enforces an immune-excluded microenvironment to drive bladder cancer progression and therapy resistance
2026-Jun, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本文通过整合单细胞转录组、GWAS和TCGA等多组学数据,结合实验验证,揭示了ADAM12在膀胱癌中通过调控ECM-CAF重塑激活PI3K-AKT通路并促进免疫排斥微环境的机制 首次系统性地将ADAM12鉴定为连接基质重塑、PI3K-AKT信号通路和膀胱癌免疫抑制的核心驱动因子,并验证其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 研究主要基于膀胱癌模型,未在其他癌症类型中验证ADAM12的普适性,且体内外实验的样本规模相对有限 探究膀胱癌中肿瘤相关成纤维细胞介导的基质重塑的致病机制,并寻找潜在的治疗靶点 膀胱癌组织、细胞系(膀胱癌细胞)和动物模型(膀胱癌异种移植和肺转移模型) 数字病理学 膀胱癌 单细胞转录组测序、GWAS、TCGA和GEO数据反卷积、WGCNA、药物反应预测、多重免疫荧光、体外和体内验证实验 NA 转录组数据、基因组数据、图像数据(免疫荧光) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2026-03-10
Multi-omics reveals that CTHRC1 secreted by cancer-associated fibroblasts promotes EMT by ITGA5/PI3K/AKT signaling pathway in HNSCC
2026-Jun, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了癌症相关成纤维细胞分泌的CTHRC1通过ITGA5/PI3K/AKT信号通路促进头颈鳞状细胞癌的上皮-间质转化和血管生成 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,鉴定出CTHRC1+ CAFs亚群在HNSCC肿瘤微环境中的空间分布和功能,并阐明其通过ITGA5/PI3K/AKT轴促进肿瘤进展的具体分子机制 未明确提及研究的局限性 阐明癌症相关成纤维细胞在头颈鳞状细胞癌进展中的关键功能分子及其作用机制 头颈鳞状细胞癌的肿瘤微环境,特别是癌症相关成纤维细胞和肿瘤细胞 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,体外和体内功能实验 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,TCGA和GEO队列的转录组数据 基于TCGA和多个GEO队列,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
57 2026-03-10
Platycodin D3 protects against sepsis-associated acute lung injury through direct inhibition of the PKM2-NLRP3 axis
2026-Jun, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,发现桔梗皂苷D3通过直接靶向PKM2抑制NLRP3炎症小体激活,从而减轻脓毒症相关急性肺损伤 首次将桔梗皂苷D3鉴定为直接结合并稳定PKM2的天然产物,通过靶向PKM2-NLRP3轴治疗脓毒症相关急性肺损伤 研究主要基于LPS诱导的小鼠模型和RAW264.7巨噬细胞,临床转化潜力需进一步验证 探索靶向PKM2-NLRP3轴治疗脓毒症相关急性肺损伤的新治疗策略 脓毒症相关急性肺损伤患者样本、LPS诱导的小鼠模型、RAW264.7巨噬细胞 生物信息学与分子药理学 脓毒症相关急性肺损伤 差异表达谱分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、单细胞RNA测序、分子对接、微尺度热泳、表面等离子体共振、细胞热位移分析、Seahorse代谢分析 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞RNA测序数据、代谢数据 脓毒症相关急性肺损伤患者样本、LPS诱导的小鼠模型、RAW264.7巨噬细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
58 2026-03-10
PFKFB3 nuclear translocation improves diabetic retinopathy by attenuating endothelial cell senescence through inhibition of USP7-p53 axis
2026-May, Metabolism: clinical and experimental
研究论文 本研究揭示了PFKFB3核转位通过抑制USP7-p53轴减轻内皮细胞衰老,从而改善糖尿病视网膜病变的分子机制 首次阐明PFKFB3在糖尿病视网膜病变中通过核转位调控USP7-p53轴来抑制内皮细胞衰老的新功能 研究主要基于体外细胞模型和动物实验,尚未在临床患者中验证 探究PFKFB3在糖尿病视网膜病变内皮细胞衰老中的作用机制 糖尿病视网膜病变中的内皮细胞 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序, Western印迹, SA-β-gal染色, 免疫荧光, 细胞周期流式细胞术, 共免疫沉淀, 质谱分析 NA 单细胞RNA测序数据, 蛋白质数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
59 2026-03-10
Macrophage membrane-biomimetic DNA nanocages deliver taurine to reprogram trained immunity for periodontitis therapy
2026-Apr-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
研究论文 本研究开发了一种基于巨噬细胞膜仿生DNA纳米笼递送牛磺酸的新策略,用于重编程训练免疫以治疗牙周炎 开发了由M2极化巨噬细胞和训练免疫抑制巨噬细胞杂交膜伪装的DNA纳米笼,用于靶向递送牛磺酸至单核细胞,以精确纠正失调的训练免疫状态 未提及临床前或临床试验的具体结果,且牛磺酸的口服生物利用度低和靶向特异性缺乏的问题仅通过此递送系统部分解决 开发一种针对慢性牙周炎的新型精准免疫治疗策略 牙周炎患者的外周血单个核细胞、单核细胞、巨噬细胞及牙周膜细胞 NA 牙周炎 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
60 2026-03-10
Targeting CXCL16-expressing macrophages with a biomimetic nanocarrier system attenuates cartilage degeneration in osteoarthritis
2026-Apr-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序识别骨关节炎中表达CXCL16的巨噬细胞,并开发了一种仿生纳米载体系统靶向这些细胞以减轻软骨退变 首次利用单细胞RNA测序在骨关节炎中鉴定出CXCL16高表达的巨噬细胞亚群,并创新性地开发了基于CXCR6富集M1巨噬细胞膜的仿生纳米颗粒(MAP6)进行特异性靶向治疗 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化效果尚未验证;纳米颗粒的长期安全性和免疫原性需要进一步评估 开发靶向骨关节炎中特定巨噬细胞亚群的纳米治疗策略,以调节滑膜炎症并阻止疾病进展 人类和小鼠的滑膜组织,以及骨关节炎小鼠模型 单细胞测序与纳米医学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确具体样本数量,涉及人类和小鼠滑膜组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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