单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32540 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-14 |
Repurposing antimicrobials, disulfiram, and metformin for cancer therapy: Bridging mechanistic gaps through RNA sequencing
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178258
PMID:41101682
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综述 | 探讨抗菌药物、双硫仑和二甲双胍通过RNA测序技术在癌症治疗中的再利用潜力 | 系统阐述RNA测序在药物重定位中的作用机制，整合单细胞和空间转录组学提升治疗精准性 | 临床转化结果不一致，存在药物相互作用、亚治疗浓度、耐药机制和肿瘤微环境等挑战 | 通过转录组学指导药物重定位以改善癌症治疗效果 | 抗菌药物（阿奇霉素、克拉霉素等）、双硫仑和二甲双胍 | 自然语言处理 | 癌症 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-11-14 |
Spatially organized cellular communities shape functional tissue architecture in the pancreas
2025-Nov-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx5791
PMID:41223257
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术，揭示了胰腺中细胞群体如何通过空间组织形成功能性组织结构 | 首次结合单细胞和空间转录组学解析胰腺从胚胎发育到成年稳态的空间细胞组织模式，发现上皮-间充质单元作为基本组织微环境 | 研究主要基于小鼠模型，人类模型验证相对有限 | 探索胰腺组织中细胞空间组织和相互作用的机制 | 小鼠和人类胰腺组织，从胚胎发育到成年阶段 | 空间转录组学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | 小鼠胚胎到成年多个发育阶段的胰腺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 43 | 2025-11-14 |
Deciphering neutrophil dynamics in the focal lesion tumor microenvironment to overcome immunosuppression in multiple myeloma
2025-Nov-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025028963
PMID:40758944
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研究论文 | 通过分析多发性骨髓瘤病灶微环境中的中性粒细胞动态，揭示其免疫抑制机制并探索治疗新策略 | 首次在多发性骨髓瘤中鉴定出三个不同的CXCR2+成熟中性粒细胞亚群，并发现TREM1+CD10+亚群在病灶中高度富集且具有强免疫抑制功能 | 临床前模型研究，需要进一步临床验证 | 阐明中性粒细胞在多发性骨髓瘤肿瘤微环境中的免疫抑制机制并开发治疗策略 | 多发性骨髓瘤患者的配对病灶和骨髓样本中的髓系细胞 | 单细胞生物学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，免疫荧光成像，功能分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 多发性骨髓瘤患者配对样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-11-14 |
XIAP-ULK1-mediated mitophagy modulates carnitine metabolism to mitigate diabetic kidney disease
2025-Nov-13, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2581214
PMID:41139215
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研究论文 | 本研究揭示了XIAP-ULK1介导的线粒体自噬通过调节肉碱代谢缓解糖尿病肾病的分子机制 | 首次发现XIAP通过K48连接的多聚泛素化导致ULK1降解，从而损害线粒体自噬并破坏肉碱代谢的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，需要进一步临床验证 | 探讨XIAP-ULK1介导的线粒体自噬在糖尿病肾病中的作用及治疗潜力 | 糖尿病肾病患者肾活检组织、糖尿病小鼠模型、高糖处理的肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 糖尿病肾病 | 分子对接、免疫组织化学、免疫荧光、液相色谱-质谱联用、单细胞RNA测序、透射电子显微镜 | NA | 分子互作数据、基因表达数据、代谢组学数据、组织病理学数据 | 糖尿病肾病患者肾活检组织、糖尿病小鼠模型、体外培养的肾小管上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-11-14 |
Destruction of VISTA by TRIM25 ablation in T cells potentiates cancer immunotherapy
2025-Nov-13, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-025-01186-5
PMID:41225152
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研究论文 | 本研究揭示了TRIM25通过稳定VISTA蛋白调控T细胞功能的新机制，并证明靶向TRIM25-VISTA可增强癌症免疫治疗效果 | 首次发现TRIM25是VISTA的正向调控因子，阐明了ERK介导的VISTA磷酸化增强其与TRIM25互作的分子机制，并开发了可破坏该互作的磷酸肽抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索VISTA免疫检查点的调控机制并开发增强癌症免疫治疗的新策略 | T细胞中的VISTA蛋白及其调控因子TRIM25 | 免疫学 | 癌症 | CRISPR基因敲除筛选、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | 多种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-11-14 |
Endothelial Heterogeneity in Pulmonary Hypertension
2025-Nov-13, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322482
PMID:41230600
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综述 | 本文总结了肺高血压中内皮细胞异质性的最新研究进展，重点关注特定内皮细胞亚群的作用及靶向内皮功能障碍的新型治疗策略 | 整合前沿技术揭示内皮异质性如何塑造肺高血压的疾病轨迹，为未来治疗创新开辟新途径 | NA | 探讨肺高血压中内皮细胞异质性对血管重塑的影响及治疗靶点识别 | 肺内皮细胞及其在肺高血压中的不同亚群 | 单细胞生物学 | 肺高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-11-14 |
Association of neuronal autoantibodies with overall survival in gastric cancer patients
2025-Nov-13, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0495
PMID:41230722
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研究论文 | 本研究探讨胃癌患者中神经元自身抗体与总体生存期的关联 | 首次在无副肿瘤综合征的胃癌患者中发现神经元自身抗体，并揭示其与生存期缩短和肿瘤免疫抑制微环境的关联 | 单中心队列研究，样本量有限，需要进一步机制研究验证 | 探究胃癌患者神经元自身抗体与临床预后的关系 | 胃癌患者血清样本和肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 免疫荧光，组织基础检测，细胞基础检测，单细胞测序 | NA | 血清学数据，单细胞测序数据，临床预后数据 | 323例胃癌患者（TBA阳性144例，TBA阴性179例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-11-14 |
Pan-cancer single-cell RNA sequencing analysis refines multi-origin monocyte and macrophage lineages
2025-Nov-13, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-1255
PMID:41231218
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析构建泛癌骨髓细胞图谱，揭示肿瘤相关巨噬细胞的双重起源模型及其与临床预后的关联 | 提出肿瘤相关巨噬细胞的双重起源模型：C1QC+ TAMs来源于组织驻留巨噬细胞，SPP1+和ISG15+ TAMs来源于循环单核细胞 | NA | 解析肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 健康组织和泛癌组织中的骨髓细胞群体 | 单细胞组学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-11-14 |
PPARα Activation-Mediated Testosterone Reduction as the Key Adverse Outcome Pathway for Cd-Induced Male Infertility: A Novel Integrated Approach
2025-Nov-13, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c09190
PMID:41231235
|
研究论文 | 本研究通过整合多种方法识别镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 首次系统构建镉诱导男性不育的AOP网络并识别PPARα激活介导睾酮减少为关键通路 | 未明确说明样本规模和研究人群的局限性 | 识别镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 镉暴露的男性生殖系统 | 环境毒理学 | 男性不育 | 单细胞测序,网络毒理学,分子建模,动物实验 | NA | 单细胞测序数据,NHANES流行病学数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-11-14 |
CanSig Benchmarks Methods for Reproducible Cancer Cell State Discovery from Single-Cell Transcriptomic Data
2025-Nov-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0940
PMID:41231245
|
研究论文 | 开发了CanSig基准测试工具，用于评估单细胞转录组数据分析方法的可重复性 | 开发了首个综合评估单细胞转录组特征发现方法可重复性的基准测试框架 | 仅评估了13种方法在12个数据集上的表现，覆盖的癌症类型和方法数量有限 | 建立标准化框架评估单细胞转录组数据分析方法的可重复性 | 单细胞RNA测序数据和癌症细胞状态发现方法 | 生物信息学 | 多癌种（胶质母细胞瘤、乳腺癌、肺腺癌、横纹肌肉瘤、皮肤鳞状细胞癌） | 单细胞RNA测序 | 多种整合方法（包括Harmony、BBKNN、fastMNN等） | 单细胞转录组数据 | 185名患者的174,000个恶性细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-11-14 |
Insulin production is sustained during DNA damage-mediated senescence in adult human beta cells
2025-Nov-13, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06603-3
PMID:41231256
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研究论文 | 本研究探讨DNA损伤介导的衰老对成人胰岛β细胞胰岛素产生的影响 | 首次证明在DNA损伤介导的衰老过程中，成人胰岛β细胞仍能维持胰岛素产生能力 | 研究主要使用体外诱导的衰老模型，体内验证仍需进一步研究 | 阐明DNA损伤相关衰老对胰岛β细胞胰岛素产生的影响机制 | 人类供体胰岛、EndoC-βH5人β细胞系 | 细胞生物学 | 1型糖尿病 | Western blot, ELISA, 流式细胞术, FACS, 免疫荧光染色 | NA | 蛋白质印迹数据, 酶联免疫数据, 流式细胞数据, 免疫荧光图像 | 人类供体胰岛、EndoC-βH5细胞系及公共数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | Humanislets.com蛋白质组学数据库和Human Pancreas Analysis Program单细胞RNA测序数据库 |
| 52 | 2025-11-14 |
Single-cell RNA sequencing in osteosarcoma: applications in diagnosis, prognosis, and treatment
2025-Nov-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03121-5
PMID:41231422
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综述 | 本文通过文献综述探讨单细胞RNA测序技术在骨肉瘤诊断、预后和治疗中的应用 | 首次系统评估scRNA-seq在骨肉瘤研究中的综合应用，识别了新的细胞亚群和潜在治疗靶点 | 存在单细胞方案的技术偏差和非英语文献的排除，可能影响结果的普适性 | 评估单细胞RNA测序对骨肉瘤发生发展的贡献 | 骨肉瘤肿瘤微环境中的细胞亚群 | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于107项研究的分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-11-14 |
Single-cell analysis of human airway epithelium identifies cell-type-specific responses to Aspergillus and Coccidioides
2025-Nov-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02121-25
PMID:41081505
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析人类气道上皮细胞对曲霉菌和球孢子菌感染的细胞类型特异性反应 | 首次报告了人类气道上皮细胞感染曲霉菌和球孢子菌的单细胞转录分析，揭示了不同真菌诱导的细胞亚型特异性应激反应 | 使用体外模型可能无法完全模拟体内肺部环境，研究样本量有限 | 研究人类气道上皮细胞对不同真菌病原体的早期发病机制和细胞反应 | 原代人类气道上皮细胞(hAECs) | 单细胞转录组学 | 呼吸道真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 原代人类气道上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-11-14 |
Anti-diuretic hormone ITP signals via a guanylate cyclase receptor to modulate systemic homeostasis in Drosophila
2025-Nov-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97043
PMID:41222455
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研究论文 | 本研究系统表征了果蝇中离子转运肽(ITP)信号系统及其通过鸟苷酸环化酶受体Gyc76C调节全身稳态的机制 | 首次鉴定Gyc76C为ITPa的受体，揭示了ITP信号系统在渗透调节和代谢稳态中的整合作用 | 研究主要基于果蝇模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 解析果蝇中神经激素信号系统如何协调全身稳态 | 果蝇(Drosophila)的ITP信号系统和Gyc76C受体 | 分子生物学 | NA | 系统发育分析、离体分泌实验、异源哺乳动物细胞实验、连接组学、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、生理功能数据、行为数据 | 果蝇幼虫和成虫组织 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2025-11-14 |
Integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome data reveals age-related immune cell alterations in primary glioblastoma associated with prognosis
2025-Nov-12, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04206-w
PMID:41222641
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据分析，揭示原发性胶质母细胞瘤中与年龄相关的免疫细胞变化及其与预后的关联 | 首次系统比较原发性和复发性胶质母细胞瘤中年龄相关的免疫细胞差异，发现小胶质细胞在原发性胶质母细胞瘤中随年龄发生显著状态变化 | 样本量相对有限（13例原发性GBM和12例复发性GBM），需要在更大队列中验证发现 | 探究衰老对胶质母细胞瘤进展的影响机制 | 胶质母细胞瘤患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，细胞通讯分析，轨迹分析 | NA | 转录组数据，临床数据 | 88,908个细胞来自13例原发性GBM和12例复发性GBM患者，TCGA和CGGA数据库临床数据 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2025-11-14 |
An Extracellular Matrix-Producing Subset of Cancer-Associated Fibroblasts Drives Chemoresistance in Breast Cancer via SRC Activation and G0S2 Upregulation
2025-Nov-12, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0966
PMID:41223328
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和肿瘤芯片技术，识别出一种产生细胞外基质的癌症相关成纤维细胞亚群(ECM-myCAFs)，该亚群通过激活SRC激酶和上调G0S2驱动三阴性乳腺癌化疗耐药 | 首次识别出特定的ECM-myCAF亚群在化疗耐药中的关键作用，并揭示SRC激活和G0S2上调是介导耐药的新机制 | 研究主要基于体外模型，需要进一步体内验证；机制细节如ECM-myCAFs分泌的具体因子尚未完全阐明 | 解析三阴性乳腺癌化疗耐药机制，识别驱动耐药的关键CAF亚群 | 三阴性乳腺癌患者样本和肿瘤芯片模型中的癌细胞与癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 肿瘤芯片技术, 高级细胞成像, 功能分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 三阴性乳腺癌患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-11-14 |
Deep-Learning Tool ScVital Enables Species-Agnostic Integration of Cancer Cell States
2025-Nov-12, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4889
PMID:41223329
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研究论文 | 开发了跨物种整合癌症细胞状态的深度学习工具scVital | 使用变分自编码器和判别器创建物种无关的潜在空间，并开发了潜在空间相似性评分新指标 | NA | 克服物种间比较的生物批次效应，识别跨物种共享的细胞状态 | 基因工程小鼠模型和原发性患者样本中的癌细胞状态 | 机器学习 | 胰腺癌,肺癌,肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2025-11-14 |
Label-free selection of marker genes in single-cell and spatial transcriptomics with geneCover
2025-Nov-12, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280539.125
PMID:41224531
|
研究论文 | 介绍了一种名为geneCover的无标记组合方法，用于在单细胞和空间转录组学中选择最优标记基因面板 | 提出首个基于基因-基因相关性的无标记组合方法，能够有效识别稀有细胞类型和细微空间模式，并具有优秀的大数据集扩展性 | 未提及方法在特定数据类型或实验条件下的潜在限制 | 开发无需预定义细胞类型标签的标记基因选择方法，以更好地捕捉细胞和空间异质性 | 单细胞RNA测序和空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 组合优化方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2025-11-14 |
Age-impaired remyelination is associated with dysregulated microglial transitions
2025-Nov-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64906-w
PMID:41224757
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠模型中髓鞘再生过程中的小胶质细胞反应，发现年龄相关的髓鞘再生障碍与小胶质细胞状态转换失调相关 | 首次在单细胞水平揭示了髓鞘再生过程中小胶质细胞的多种状态转变，并发现这些状态在衰老过程中出现延迟 | 研究基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究年龄相关的髓鞘再生障碍与小胶质细胞反应的关系 | 小鼠模型中的小胶质细胞和多发性硬化症患者脑组织 | 单细胞生物学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2025-11-14 |
HPCAL1 as a novel prognostic biomarker in acute myeloid leukemia and its correlation with immune infiltrates
2025-Nov-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23386-0
PMID:41224963
|
研究论文 | 本研究探讨HPCAL1作为急性髓系白血病新型预后生物标志物的潜力及其与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 首次将钙结合蛋白HPCAL1确立为AML的新型预后指标，并揭示其通过免疫微环境调节和单核细胞群体动态介导不良预后的机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要后续实验验证HPCAL1在AML发病机制中的具体作用 | 探索AML中改进的预后生物标志物和治疗靶点 | 急性髓系白血病患者样本和多个独立队列数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA测序，单细胞RNA测序，生物信息学分析 | ESTIMATE分析，GSEA/GSVA，共表达网络分析，蛋白质相互作用分析 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 多个独立队列（GSE13159，GSE34184，GSE24395，机构数据和GSE130756单细胞数据集） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |