单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-19 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis identifies B-cell subpopulations and associated cancer subtypes with distinct clinical and molecular characteristics
2025-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01082-5
PMID:40526246
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据识别B细胞亚群及其与癌症预后的关联 | 首次在泛癌水平系统鉴定8个B细胞亚群并构建预后预测模型 | 样本来源和癌症类型仍有限，需要进一步实验验证 | 研究B细胞亚群在癌症中的临床意义和分子特征 | 424名患者的102,504个细胞，涵盖15种癌症类型 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，轨迹分析 | 无监督聚类，预测模型 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据，空间转录组数据 | 102,504个细胞来自424名患者，15种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，批量RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2025-10-19 |
Epidermal Resident Memory T Cell Fitness Requires Antigen Encounter in the Skin
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646438
PMID:40236062
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研究论文 | 本研究揭示了表皮组织驻留记忆T细胞(T)的适应性需要皮肤中抗原刺激的机制 | 发现表皮抗原经历通过TGFβRIII表达增强TGFβ受体亲和力，从而降低T细胞持久性对TGFβ的需求 | NA | 探究表皮组织驻留记忆T细胞适应性形成的分子机制 | 表皮CD8组织驻留记忆T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-19 |
Semaphorin 6A phase separation sustains a histone lactylation-dependent lactate buildup in pathological angiogenesis
2025-Apr-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423677122
PMID:40244673
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研究论文 | 本研究揭示了SEMA6A通过相分离机制维持组蛋白乳酸化修饰，促进病理性血管生成的新机制 | 首次发现SEMA6A的C端无序区域通过液-液相分离形成凝聚体，招募RHOA和P300促进组蛋白乳酸化循环 | 研究主要聚焦于视网膜病变模型，在其他血管疾病中的普适性需要进一步验证 | 探索病理性血管生成中组蛋白乳酸化修饰的调控机制 | 视网膜内皮细胞和氧诱导视网膜病变模型 | 表观遗传学 | 视网膜缺血性疾病 | CUT&Tag, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据，表观遗传学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-10-19 |
St3gal5-mediated sialylation of glyco-CD177 on neutrophils restricts neuroinflammation following CNS injury
2025-Apr-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426187122
PMID:40244680
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研究论文 | 本研究揭示了St3gal5介导的中性粒细胞CD177糖基化在限制中枢神经系统损伤后神经炎症中的关键作用 | 首次发现CD177中性粒细胞作为抗炎亚群通过St3gal5介导的唾液酸化调控神经炎症，并提出FDA批准的丙戊酸可作为靶向中性粒细胞糖生物学的治疗策略 | CD177糖生物学在神经炎症中的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究中性粒细胞CD177糖基化在中枢神经系统损伤后神经炎症中的调控作用 | 人类和小鼠的中性粒细胞 | 免疫学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序，糖蛋白组学，遗传学方法 | NA | 基因表达数据，蛋白质组学数据 | 人类和小鼠的中性粒细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-19 |
Multi-omics analysis to explore the molecular mechanisms related to keloid
2025-Apr, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2025.107396
PMID:39874886
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研究论文 | 通过多组学分析探索瘢痕疙瘩形成的分子机制 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞RNA测序鉴定瘢痕疙瘩关键基因DUSP1和HOXA5 | 研究样本量有限，机制验证实验不足 | 揭示瘢痕疙瘩的致病机制并寻找潜在治疗靶点 | 瘢痕疙瘩组织样本 | 生物信息学 | 皮肤肿瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫浸润分析 | 网络分析, GSEA, GSVA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-10-19 |
Smyd3-mediated immuno-modulation in HPV-negative head and neck squamous cell carcinoma mouse models
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110854
PMID:39310755
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Smyd3 ASOs治疗的小鼠口腔癌模型，揭示Smyd3在HPV阴性头颈鳞癌中的免疫调节功能及联合治疗耐药机制 | 首次在体内模型中证明Smyd3通过表观遗传调控I型IFN反应基因影响肿瘤免疫微环境，并系统解析了Smyd3 ASOs与抗PD-1联合治疗的耐药机制 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类患者中验证；耐药机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 探究Smyd3在HPV阴性头颈鳞癌免疫调节中的作用及联合治疗耐药机制 | 小鼠口腔癌模型MOC1肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，反义寡核苷酸技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-10-19 |
Integrated multi-omics analyses identify key anti-viral host factors and pathways controlling SARS-CoV-2 infection
2022-Aug-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-1910932/v1
PMID:36032971
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研究论文 | 通过整合多组学分析鉴定控制SARS-CoV-2感染的关键抗病毒宿主因子和通路 | 发现被先前研究遗漏的多个抗病毒宿主因子（如V-ATPases、ESCRT和N-糖基化通路组分），首次鉴定cohesin复合物作为新型抗病毒通路，并发现与重症COVID-19相关的转录因子KLF5 | 未明确说明研究样本规模和技术验证的局限性 | 系统鉴定控制SARS-CoV-2感染的宿主抗病毒因子和通路 | 宿主细胞因子、病毒-宿主相互作用网络 | 基因组学 | COVID-19 | CRISPR筛选、多组学整合分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、蛋白质/RNA相互作用组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-10-18 |
Single-cell transcriptomics reveals Sox6 positive interneurons enriched in the prefrontal cortex of female mice vulnerable to chronic social stress
2025-Nov, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03088-9
PMID:40581656
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示雌性小鼠前额叶皮层中Sox6阳性中间神经元在慢性社交应激易感性中的富集现象 | 首次在雌性小鼠中发现Sox6中间神经元在应激诱导抑郁中的特异性作用，并揭示其与炎症反应和突触功能的关联 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探究慢性社交应激下雌性小鼠前额叶皮层的细胞和分子变化机制 | 雌性小鼠的前额叶皮层细胞 | 神经科学 | 抑郁症 | 单核RNA测序,加权基因共表达网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性社交挫败应激模型的雌性小鼠 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-18 |
High-resolution spatial mapping of cell state and lineage dynamics in vivo with PEtracer
2025-Oct-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx3800
PMID:40705858
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研究论文 | 开发了一种基于基因编辑的空间谱系追踪技术PEtracer，用于在体内高分辨率绘制细胞状态和谱系动态 | 开发了基于prime editing的演化谱系追踪技术PEtracer，能够同时分析细胞状态和谱系关系，并兼容单细胞测序和多模态成像方法 | NA | 绘制发育和疾病过程中细胞命运决定的时空动态 | 小鼠肿瘤转移模型中的肿瘤细胞 | 空间转录组学 | 肿瘤转移 | prime editing, 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞测序 | NA | MERFISH空间转录组分析 |
| 50 | 2025-10-18 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Depletion and Dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-Specific Th1 and Th17 Cells Early After Acquisition of Human Immunodeficiency Virus
2025-Oct-15, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf354
PMID:40605619
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了HIV感染早期结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭与功能失调 | 首次在HIV感染前后纵向分析结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞的单细胞转录组特征，发现早期耗竭模式和干细胞样细胞的富集 | 样本量有限，仅对部分个体进行了纵向分析 | 探究HIV感染对结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞频率和功能的影响 | HIV感染者和未感染者的结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞 | 单细胞生物学 | 结核病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | HIV感染和未感染个体队列，部分个体纵向采样 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2025-10-18 |
Charting the single-cell and spatial landscape of IDH-wild-type glioblastoma with GBmap
2025-Oct-14, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf113
PMID:40312969
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研究论文 | 本研究构建了IDH野生型胶质母细胞瘤的单细胞和空间图谱GBmap，揭示了肿瘤异质性和空间组织结构 | 创建了首个整合26个数据集的胶质母细胞瘤单细胞图谱，开发了肿瘤结构评分(TSS)量化肿瘤组织程度，识别了7个不同的肿瘤生态位 | 研究主要基于现有数据集整合，缺乏前瞻性验证队列 | 构建胶质母细胞瘤综合单细胞和空间图谱，解析肿瘤微环境复杂性和空间组织 | IDH野生型胶质母细胞瘤患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 迁移学习 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 240名患者的110万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-18 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.12.623125
PMID:39605504
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示疟原虫在按蚊中肠内的发育转变过程与宿主-寄生虫相互作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序与共聚焦显微镜技术，系统解析疟原虫在蚊子体内的关键发育转变过程，发现寄生虫优先与中肠前体细胞相互作用的机制 | 研究中涉及的寄生虫-蚊子组合可能无法完全代表所有自然传播场景 | 阐明疟原虫在按蚊体内的发育转变机制和宿主-寄生虫相互作用 | 恶性疟原虫和按蚊的中肠组织细胞 | 单细胞组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，功能分析 | NA | 单细胞转录组数据，显微镜图像 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫与蚊子细胞样本，包括野外来源的寄生虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-18 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651101
PMID:40475445
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研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序方案，以增强胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 开发了优化的单细胞长读长测序方案，证明5'端文库制备优于3'端方案，并采用胰岛素转录本靶向去除策略提高信息读长检测 | 未明确说明样本数量和技术重复次数，长读长测序技术本身存在较高错误率的技术挑战 | 优化单细胞长读长测序技术以准确检测胰腺胰岛中的选择性剪接异构体 | 胰腺胰岛中的各种细胞类型，特别是产生高水平单一转录本的胰岛内分泌细胞 | 单细胞测序 | 糖尿病 | 单细胞长读长测序，转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，长读长测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-18 |
Variational inference of single cell time series
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610389
PMID:39257806
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研究论文 | 提出一种名为SNOW的深度学习算法，用于解卷积单细胞时间序列数据 | 开发了能够将单细胞时间序列分解为时间依赖和时间独立组件的深度学习算法 | NA | 解决单细胞RNA测序时间序列数据分析中的挑战 | 单细胞RNA测序时间序列数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-18 |
Targeting Liver Epsins Ameliorates Dyslipidemia in Atherosclerosis through Inhibition of Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 9-Mediated Low-density Lipoprotein Receptor Degradation
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609742
PMID:39253478
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研究论文 | 本研究揭示肝脏Epsins通过促进PCSK9介导的LDLR降解加剧动脉粥样硬化，并证明靶向Epsins可改善血脂异常 | 首次发现肝脏Epsins通过UIM结构域结合LDLR介导PCSK9依赖性降解，并开发纳米颗粒包裹siRNA靶向治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究肝脏Epsins在PCSK9介导的LDLR降解及动脉粥样硬化中的作用机制 | ApoE-/-和PCSK9-AAV8诱导的动脉粥样硬化小鼠模型，人动脉粥样硬化心血管疾病患者样本 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，分子/细胞/生化分析，纳米颗粒递送系统 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质互作数据，病理学数据 | 多种基因工程小鼠模型，人患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-18 |
High-resolution spatial mapping of cell state and lineage dynamics in vivo with PEtracer
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.15.659774
PMID:40661400
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研究论文 | 开发了一种基于prime editing的谱系追踪技术PEtracer，能够在高空间分辨率下同时分析细胞状态和谱系关系 | 结合prime editing和空间转录组学，首次实现了在完整组织中同时追踪细胞谱系和状态的高分辨率空间映射 | NA | 研究细胞命运决定的时空动态，特别是在发育和疾病过程中的细胞状态与谱系关系 | 小鼠肿瘤转移模型中的肿瘤细胞 | 空间转录组学 | 肿瘤转移 | prime editing, MERFISH空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据，成像数据 | NA | NA | 单细胞测序，空间转录组学，多模态成像 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-18 |
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts: diversity, topography, and perivascularity
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.15.628587
PMID:39763751
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和免疫组化分析视网膜神经节细胞的多样性和空间分布特征 | 首次结合MERFISH空间转录组学和免疫组化共染色技术，系统分析视网膜神经节细胞在二维空间中的分布模式及其与血管的邻近关系 | 研究主要基于小鼠模型，人类视网膜数据验证有限 | 探究视网膜神经节细胞的空间分布规律及其与局部微环境的关系 | 小鼠和人类视网膜神经节细胞 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | MERFISH空间转录组学, 免疫组化共染色 | 计算配准方法 | 空间转录组数据, 图像数据 | 45种小鼠视网膜神经节细胞类型 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 成像基础的空间转录组学技术 |
| 58 | 2025-10-18 |
Dysregulation of cell state dynamics during early stages of serous endometrial carcinogenesis
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.15.585274
PMID:38562813
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了浆液性子宫内膜癌发生早期阶段的细胞状态动态失调机制 | 首次在SEC小鼠模型中系统描述了正常、癌前和发育异常子宫内膜的细胞类型和状态变化，发现了44个潜在早期诊断标志基因 | 研究基于小鼠模型，在人类中的临床验证仍需进一步研究 | 探索浆液性子宫内膜癌发生早期的分子和细胞动力学机制 | 小鼠子宫内膜组织（正常、癌前和发育异常阶段） | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2025-10-17 |
Advances in single-cell DNA sequencing enable insights into human somatic mosaicism
2025-Nov, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00832-3
PMID:40281095
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综述 | 本文综述了单细胞DNA测序技术在揭示人类体细胞嵌合现象方面的最新进展 | 突破了传统单细胞DNA测序的技术瓶颈，能够解析复杂克隆模式组织的遗传景观、稀缺样本和非循环细胞的遗传特征 | NA | 探讨单细胞DNA测序技术在理解体细胞嵌合机制和疾病诊断中的应用 | 人类体细胞和组织样本 | 基因组学 | 癌症和非癌性疾病 | 单细胞DNA测序、全基因组扩增、全基因组测序 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-07-17 |
Mapping trait-associated cells with spatial transcriptomics
2025-Nov, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00877-4
PMID:40664743
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |