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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2025-11-07
USP2-mediated PPARγ stabilization promotes hepatocellular carcinoma progression and M2 macrophage polarization via oleic acid
2025-Nov-04, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示USP2通过稳定PPARγ促进肝癌进展和M2巨噬细胞极化的分子机制 首次发现USP2通过去泛素化稳定PPARγ,促进油酸合成并驱动M2巨噬细胞极化的新机制 NA 探索USP2在肝细胞癌进展和肿瘤微环境调控中的功能作用 肝癌患者来源类器官、肝癌细胞系、动物模型和巨噬细胞 癌症生物学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫共沉淀,CUT&RUN,ELISA,质谱分析 NA 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,代谢数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
42 2025-11-07
Adipocyte death promotes hepatic infiltration of S100A8+ macrophages and steatotic liver disease progression in mice
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究揭示脂肪细胞死亡通过诱导S100A8+巨噬细胞肝脏浸润促进肝细胞脂质积累和代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 首次发现脂肪细胞死亡通过S100A8+巨噬细胞-CCN3-CD36轴驱动肝脏脂肪变性的新机制 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 探究脂肪细胞死亡如何促进肝脏脂肪积累和MASLD进展 基因修饰小鼠模型 分子生物学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
43 2025-11-07
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing identifies GSTM4 as a tumor suppressor and prognostic biomarker in breast cancer
2025-Nov-03, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过整合单细胞和bulk RNA测序分析,鉴定GSTM4作为乳腺癌的肿瘤抑制因子和预后生物标志物 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序方法系统鉴定GSTM4在乳腺癌中的肿瘤抑制功能及其与肿瘤免疫微环境的关联 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要更多功能实验确认GSTM4的具体作用机制 探索乳腺癌的新型生物标志物和治疗靶点 乳腺癌组织、细胞系和患者样本 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,TWAS,WGCNA,PPI网络分析,ssGSEA,体外实验 NA 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,表观遗传数据 包含GSE148673单细胞RNA测序数据集和多个数据库的乳腺癌样本 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
44 2025-11-07
Tumor microenvironment remodeling across thyroid cancer differentiation states revealed by spatial transcriptomics
2025-Nov-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 通过空间转录组学揭示甲状腺癌分化状态转变过程中肿瘤微环境的动态重塑 首次利用空间转录组学技术系统描绘甲状腺癌分化状态转变过程中肿瘤微环境的时空动态变化 样本量较小(12例患者),需要更大队列研究验证发现 探究甲状腺癌分化状态与肿瘤微环境特征的关系 甲状腺癌患者肿瘤组织(包括PTC、FTC、PDTC和ATC) 空间转录组学 甲状腺癌 空间转录组学,免疫组织化学 CellDART算法,PROGENy和REACTOME分析 空间转录组数据,图像数据 12例患者甲状腺癌组织 10x Genomics 空间转录组学 Visium Visium CytAssist平台,FFPE组织
45 2025-11-07
Elucidating the role of SIRT2 in hepatocellular carcinoma through multi-omics and deep learning
2025-Nov-03, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过多组学分析和深度学习探讨SIRT2在肝细胞癌中的作用机制 首次结合铜死亡机制、单细胞测序、空间转录组和深度学习生存神经网络构建肝细胞癌预后模型 未明确说明样本量大小,机制研究仍需实验验证 阐明SIRT2在肝细胞癌发生发展中的作用机制 肝细胞癌组织样本和相关的基因表达数据 机器学习 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, RNA测序, 深度学习 DeepSurv神经网络 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 NA NA
46 2025-11-07
IGF1-mediated mesenchymal-endothelial transition as a potential regulatory target in calcific aortic valve disease
2025-Nov-03, BMC medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究首次证实主动脉瓣间质细胞在钙化条件下具有向内皮细胞转分化的能力,并揭示了IGF1-PI3K-AKT-HIF通路介导的间质-内皮转化在钙化性主动脉瓣疾病中的作用机制 首次发现主动脉瓣间质细胞具有向内皮细胞转分化的能力,揭示了间质-内皮转化现象在钙化性主动脉瓣疾病中的存在,并确定了IGF1-PI3K-AKT-HIF通路的关键调控作用 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本数量有限(16例),需要更大规模的临床研究验证 探究钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞向内皮细胞转分化的能力及其调控机制 人类钙化主动脉瓣样本、猪主动脉瓣原代细胞、Col1a2-CreERT:R26R-tdTomato转基因小鼠 心血管疾病研究 钙化性主动脉瓣疾病 免疫荧光分析、转录组测序、Western blot、qPCR、单细胞测序分析 NA 图像数据、基因表达数据、蛋白质数据 16例CAVD患者钙化主动脉瓣样本、猪主动脉瓣原代细胞、转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
47 2025-11-07
Neutrophil extracellular traps regulate LDHA expression to promote colorectal cancer liver metastasis
2025-Nov-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了中性粒细胞胞外诱捕网通过调控LDHA表达促进结直肠癌肝转移的机制 首次发现NETs通过PI3K/AKT通路调控LDHA表达促进结直肠癌转移,并证实抑制LDHA或NET形成可有效抑制肝转移 NA 探索中性粒细胞胞外诱捕网在结直肠癌肝转移中的作用机制 结直肠癌细胞、裸鼠肝脏异种移植模型 单细胞转录组学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
48 2025-11-07
Fragile X mental retardation 1 gene FMR1 promotes proliferation, migration, and invasion of gastric cancer cells via c-MYC
2025-Nov-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了FMR1基因通过调控c-MYC促进胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的分子机制 首次发现FMR1在胃癌中通过蛋白相互作用稳定c-MYC并抑制其蛋白酶体降解的新机制 研究主要基于体外实验和数据库分析,需要更多体内实验验证 探究FMR1基因在胃癌发生发展中的作用机制 胃癌细胞系和临床胃癌组织样本 癌症生物学 胃癌 qRT-PCR, Western blotting, 免疫组化, 单细胞转录组测序, 免疫共沉淀, 蛋白酶体抑制实验 NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞转录组数据 TCGA队列胃癌样本和临床样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
49 2025-11-07
PLIN2 exacerbates Allergic Rhinitis by inhibiting PINK1/Parkin-mediated mitophagy
2025-Nov-03, Immunology letters IF:3.3Q3
研究论文 本研究探讨了PLIN2通过抑制PINK1/Parkin介导的线粒体自噬加重变应性鼻炎发病机制的分子机制 首次揭示PLIN2通过抑制PINK1/Parkin介导的线粒体自噬在变应性鼻炎中的促炎作用机制 研究主要基于动物模型和细胞实验,需要进一步临床验证 探究PLIN2在变应性鼻炎中的促炎作用及其分子机制 小鼠变应性鼻炎模型和人鼻上皮细胞 单细胞测序分析 变应性鼻炎 单细胞RNA测序, Western blotting, qRT-PCR, 流式细胞术, ELISA, 免疫荧光/组织染色 动物疾病模型, 细胞模型 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 GEO数据库GSE261706数据集(AR患者和健康对照鼻黏膜样本) NA 单细胞RNA测序 NA NA
50 2025-11-07
Single-cell RNA sequencing reveals immune response dynamics and infection mechanisms in PRRSV-infected porcine alveolar macrophages
2025-Nov-03, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示PRRSV感染猪肺泡巨噬细胞的免疫应答动态和感染机制 首次在单细胞水平揭示PRRSV感染过程中Fc受体CD16介导病毒进入和SPP1-CD44信号通路抑制病毒感染的新机制 研究基于体外感染的猪肺泡巨噬细胞模型,未涉及体内复杂环境 解析PRRSV感染过程中宿主细胞的免疫应答机制 PRRSV感染的猪肺泡巨噬细胞 单细胞组学 猪繁殖与呼吸综合征 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
51 2025-11-07
Integrated Multi-omics Identifies GZMA Targeting NK Cells as a Novel Therapeutic Strategy for Hidradenitis Suppurativa
2025-Nov-03, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 通过整合多组学分析确定GZMA靶向NK细胞作为化脓性汗腺炎的新型治疗策略 首次通过整合批量转录组学、孟德尔随机化和单细胞转录组分析,揭示GZMA在NK细胞中的特异性表达及其在HS发病机制中的核心作用 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 阐明化脓性汗腺炎的发病机制并开发精准干预策略 化脓性汗腺炎患者样本和公共数据库数据 生物信息学 皮肤炎症性疾病 批量转录组学, 孟德尔随机化, 单细胞转录组分析, WGCNA, LASSO回归, 分子对接模拟 WGCNA, LASSO, 贝叶斯MR 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 发现队列和验证队列(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
52 2025-11-07
Network toxicology and machine learning reveal the impact of acetyl tributyl citrate on erectile dysfunction and identify cathepsin S as a critical regulator
2025-Nov-02, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
研究论文 本研究通过网络毒理学和机器学习方法揭示了乙酰柠檬酸三丁酯对勃起功能障碍的影响机制,并确定组织蛋白酶S为关键调控因子 首次结合网络毒理学、单细胞测序和多种机器学习算法系统阐明ATBC通过调控CTSS表达影响内皮功能导致勃起功能障碍的分子机制 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏动物模型验证 探究环境内分泌干扰物ATBC导致勃起功能障碍的分子机制 阴茎海绵体组织、内皮细胞 机器学习 勃起功能障碍 单细胞测序, 分子对接, 网络毒理学, 机器学习 EPC, MNC, Betweenness, Degree算法 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2025-11-07
Whole-cortex in situ sequencing reveals input-dependent area identity
2025-Nov, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过BARseq高通量原位测序技术研究小鼠大脑皮层神经元转录组特征与区域身份的关系 首次在全脑皮层范围应用高通量原位测序技术,揭示了输入依赖性皮层区域身份的形成机制 研究仅针对小鼠模型,尚未在其它物种验证 探索大脑皮层神经元转录组特征的空间组织及其发育机制 小鼠前脑半球皮层神经元 神经科学 NA 原位测序,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,空间转录组数据 1030万细胞,包括4194658个皮层神经元,覆盖9个小鼠前脑半球 NA 原位测序,单细胞RNA测序 BARseq 高通量原位测序技术,能够检测104种细胞类型标记基因
54 2025-11-07
Loss of 18q Alters TGFβ Signalling Affecting Anteroposterior Neuroectodermal Fate in Human Embryonic Stem Cells
2025-Nov, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究探讨了18q染色体缺失如何通过改变TGFβ信号通路影响人胚胎干细胞中前后神经外胚层命运决定 首次揭示了18q缺失通过干扰TGFβ信号通路导致前后神经外胚层命运决定失衡的具体机制 研究仅针对体外培养的干细胞模型,未验证在体内环境中的表现 探究染色体异常对人多能干细胞分化潜能的影响机制 人胚胎干细胞(hESCs)及其分化产物 发育生物学 NA 单细胞RNA测序,基因表达时序分析 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 具有复杂核型的人胚胎干细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
55 2025-11-07
GCNLA: Inferring Cell-Cell Interactions From Spatial Transcriptomics With Long Short-Term Memory and Graph Convolutional Networks
2025-Nov, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 提出一种基于图卷积网络和长短期记忆注意力模块的GCNLA网络架构,用于从空间转录组数据推断细胞间相互作用 结合图卷积层、长短期记忆网络、注意力模块和残差连接,不仅学习细胞空间结构,还能捕获远端细胞间的相互作用信息 NA 从空间转录组数据中推断细胞间相互作用 细胞间相互作用网络 空间转录组学 NA 空间转录组学 图卷积网络, 长短期记忆网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 seqFISH, MERFISH NA
56 2025-11-07
Long-read RNA sequencing of transposable elements from single cells using CELLO-seq
2025-Nov, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 开发了一种名为CELLO-seq的单细胞长读长RNA测序协议,用于精确映射转座元件的表达 通过整合50个核苷酸的独特分子标识符和高PCR重复数,实现了长读长的错误校正,能够将表达数据高保真地映射到高度序列相似的年轻转座元件 需要用户具备分子生物学和转录组分析经验 开发能够精确映射转座元件表达的单细胞测序方法 哺乳动物转座元件 单细胞测序 NA 长读长RNA测序,单细胞测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 CELLO-seq 整合50个核苷酸独特分子标识符和高PCR重复数的单细胞长读长RNA测序协议
57 2025-11-07
Emodin Alleviates Sepsis-Induced Multiorgan Damage by Inhibiting NETosis through Targeting Neutrophils BCL-10
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示大黄素通过靶向中性粒细胞BCL-10抑制NETosis,从而缓解脓毒症引起的多器官损伤 首次发现BCL-10是脓毒症中NETosis的关键促进因子,并证实大黄素通过调节BCL-10/MALT1复合物抑制NF-κB信号通路 NA 探究大黄素对脓毒症多器官损伤的保护机制 脓毒症模型中的中性粒细胞和NETosis过程 分子药理学 脓毒症 蛋白质微阵列,表面等离子共振,下拉实验,分子对接,单细胞测序 NA 实验数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
58 2025-11-07
HLA-A*02:01 Presents Penicillin-Modified Cysteinylated Peptides for T Cell Recognition
2025-Nov, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究揭示了HLA-A*02:01呈递青霉素修饰的半胱氨酸化肽段触发T细胞识别的分子机制 首次发现青霉素优先修饰HLA-A*02:01免疫肽组中的半胱氨酸残基,并通过半胱氨酸-药物缀合物形成及二硫键介导的肽修饰新机制 研究仅针对HLA-A*02:01单倍型和青霉素特异性反应,样本来源有限 阐明β-内酰胺抗生素引发T细胞介导超敏反应的分子机制 青霉素修饰的HLA肽配体及患者来源的药物反应性T细胞 免疫学 药物超敏反应 免疫肽组学,单细胞测序,报告细胞系检测 NA 蛋白质组数据,单细胞TCR序列数据 超敏患者来源的CD8+ T细胞 NA 单细胞测序,免疫肽组学 NA NA
59 2025-11-07
Retrospective transcriptomic analysis indicates temporal dysregulation of mitochondrial genes and metabolic pathways after volumetric muscle loss injury
2025-Nov, Physiological reports IF:2.2Q3
研究论文 通过回顾性转录组分析研究体积性肌肉损失损伤后线粒体基因和代谢通路的时序性失调 首次利用现有RNA-seq数据集系统分析VML损伤后不同时间点的线粒体基因表达和代谢通路变化 研究为回顾性分析,依赖公开数据集,缺乏实验验证 探究体积性肌肉损失损伤后线粒体和代谢转录组的变化规律 大鼠和小鼠的肌肉组织 转录组学 肌肉损伤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因集富集分析 NA 转录组数据 包含bulk RNA-seq数据集(大鼠)和单细胞RNA-seq数据集(小鼠) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
60 2025-11-07
Exploring the Therapeutic Potential of MIR-140-3p in Osteoarthritis: Targeting CILP and Ferroptosis for Novel Treatment Strategies
2025-Nov, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究探讨miR-140-3p通过靶向CILP调控铁死亡、炎症和氧化应激在骨关节炎中的作用机制 首次发现miR-140-3p/CILP轴通过调控铁死亡参与骨关节炎发病机制 铁死亡在OA中的具体作用和机制仍需进一步研究 探索骨关节炎的新型治疗策略 C28/I2细胞、miR-140-3p、CILP蛋白、铁死亡相关基因 分子生物学 骨关节炎 单细胞RNA测序,hdWGCNA分析,生物信息学分析,qRT-PCR,双荧光素酶实验 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 细胞系研究 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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