单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39972 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-02 |
Coexistent alterations of BAFF and B cell phenotypes in complicated CVID course
2026-May-30, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.04.029
PMID:42219089
|
研究论文 | 本研究探讨了常见变异型免疫缺陷病（CVID）中BAFF及其受体与B细胞表型的共同改变，以及与复杂病程的关联。 | 首次通过联合应用光谱流式细胞术、配对BCR测序RNA-seq及BAFF相关蛋白测量，揭示了CVID伴自身免疫和淋巴增殖并发症时BAFF与B细胞亚群失调的共同特征。 | 研究样本量可能有限，且机制尚未完全阐明，需要进一步验证。 | 探究BAFF、其受体及B细胞亚群的共同改变如何影响CVID的病理过程。 | 常见变异型免疫缺陷病（CVID）患者，特别是伴有自身免疫性血细胞减少和淋巴组织增生的患者。 | 机器学习和生物信息学 | 原发性免疫缺陷病（常见变异型免疫缺陷病） | 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序、血浆蛋白测量 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、血浆蛋白测量数据 | CVID患者样本，包括有和无并发症的亚组，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2026-06-02 |
Erratum to: Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis
2026-May-30, MedScience
DOI:10.1007/s11684-026-1253-8
PMID:42223858
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2026-06-02 |
Empowering fungal infection research with single-cell RNA sequencing
2026-May-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10304-x
PMID:42215623
|
综述 | 概述单细胞RNA测序在真菌感染研究中的应用、关键发现及未来方向 | 系统总结了单细胞RNA测序在解析宿主-真菌病原体相互作用动态机制中的最新进展，并强调了该技术在真菌感染研究中的潜力 | 当前单细胞技术在真菌感染领域的应用仍不广泛，存在技术、样本和数据分析方面的局限 | 促进单细胞技术在真菌感染研究中的更广泛采用，以推动诊断和治疗进步 | 真菌病原体与宿主之间的相互作用 | 自然语言处理 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2026-06-02 |
Microenvironment T-Type calcium channels regulate neuronal and glial processes in tumor cells to promote glioblastoma growth
2026-May-29, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag131
PMID:42218829
|
研究论文 | 研究了微环境中T型钙通道（Cav3.2）对胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤生长的调控作用，发现其通过调节神经元和胶质细胞过程促进肿瘤进展 | 首次揭示微环境而非肿瘤细胞自身表达的T型钙通道（Cav3.2）在GBM生长中的关键作用，并发现其通过调节神经元/胶质细胞生物学过程及OPC细胞状态来影响肿瘤 | 未明确说明研究的局限性 | 阐明微环境T型钙通道（Cav3）在胶质母细胞瘤（GBM）中的功能和调控机制 | 胶质母细胞瘤细胞、Cav3.2基因敲除小鼠、神经元、胶质母细胞瘤干细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、电生理技术 | NA | 单细胞基因表达数据、电生理数据 | 使用了Cav3.2敲除小鼠和野生型小鼠的肿瘤样本进行单细胞RNA测序 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 45 | 2026-06-02 |
COUP-TFII promotes macrophage-myofibroblast transition by attenuating HIF-1α-mediated glycolysis
2026-05-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153640
PMID:41916009
|
研究论文 | 本研究揭示COUP-TFII通过抑制HIF-1α介导的糖酵解促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化，从而驱动糖尿病肾病纤维化 | 首次阐明COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化中通过负调控HIF-1α依赖性糖酵解促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的新机制 | NA | 探究COUP-TFII在糖尿病肾病肾纤维化中的调控机制 | TGF-β处理的巨噬细胞和22周龄DB/DB糖尿病肾病小鼠模型 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | Western blotting, 单细胞测序, GEO数据库分析, 基因敲减载体构建, 免疫荧光 | NA | 蛋白质表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-06-02 |
Pan-cancer spatial atlas of tertiary lymphoid structures
2026-May-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adz2742
PMID:42207882
|
研究论文 | 对12种癌症类型的空间转录组数据进行分析，构建了三级淋巴结构的全癌种空间图谱，并利用AI模型预测其成熟状态 | 首次构建了涵盖12种癌症类型的TLS全癌种空间图谱，结合超高多重单细胞空间分析和AI框架从H&E染色图像直接预测TLS成熟状态，提出了基于成熟度的复合评分策略 | NA | 系统表征TLS在多种癌症中的空间组织、成熟状态及其临床相关性 | 三级淋巴结构（TLS）及其在肿瘤微环境中的空间分布和成熟状态 | 数字病理学, 机器学习 | 多种癌症类型（12种） | 空间转录组学, 单细胞空间分析, 人工智能 | CNN（卷积神经网络） | 空间转录组数据, H&E染色图像, 超高多重单细胞空间图谱 | 12种癌症类型的空间转录组样本，TCGA及独立治疗队列 | NA | 空间转录组学, 单细胞空间分析 | NA | NA |
| 47 | 2026-06-02 |
Spatial transcriptomics and multi-omics approach to decipher age-related tissue microenvironments and therapeutics in neurodegeneration and aging
2026-May-28, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103189
PMID:42214504
|
综述 | 综述空间转录组学在多组学框架下揭示年龄相关神经退行性疾病中组织微环境的作用及治疗策略 | 强调了空间转录组学作为连接分子发现与临床应用的关键桥梁，并整合多组学数据以解析年龄相关病理的空间调控机制 | 文中未明确提及具体局限性，但可能涉及空间转录组学技术通量、成本及数据分析复杂性等挑战 | 阐述空间转录组学在理解神经退行性变与衰老过程中空间调控机制的应用，并推动精准治疗发展 | 年龄相关神经退行性病变中的组织微环境、细胞异质性及神经炎症网络 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 空间转录组学, 多组学 | NA | 转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 48 | 2026-06-02 |
Single-cell transcriptomics and multimodal molecular profiling revealed the oncogenesis and tumor microenvironment of cardiac myxoma
2026-May-27, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3299-0
PMID:42223569
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和多模态分子分析揭示了心脏黏液瘤的癌变机制及肿瘤微环境 | 首次利用单细胞RNA测序构建心脏黏液瘤细胞图谱，阐明内皮细胞向间充质转化是其细胞起源，并揭示肿瘤相关成纤维细胞和壁细胞亚型差异导致不同形态分化 | 样本量有限（仅5例肿瘤及5例正常组织），缺乏功能验证实验，未深入探讨信号通路调控机制 | 探究心脏黏液瘤的细胞组成、起源及肿瘤形态多样性的形成机制 | 心脏黏液瘤组织和正常房间隔组织 | 机器学习 | 心脏黏液瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例心脏黏液瘤组织样本和5例正常房间隔样本，共86,741个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 49 | 2026-06-02 |
From Multiomics Discovery to Clinical Validation: Identification of Novel Noninvasive Biomarkers for Liver Fibrosis
2026-May-26, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.5c01198
PMID:42192591
|
研究论文 | 通过多组学和单细胞测序发现并验证THBS2、GDF15和NFASC作为肝纤维化新型非侵入性生物标志物 | 首次通过整合多组学与单细胞测序发现并临床验证THBS2、GDF15和NFASC作为肝纤维化非侵入性生物标志物，并开发了结合临床变量的多变量模型，显著提高了风险分层准确性 | NA | 识别和验证肝纤维化的新型非侵入性生物标志物 | 肝纤维化患者样本中的生物标志物表达和诊断性能 | 机器学习 | 肝纤维化 | 多组学分析，单细胞测序 | 多变量模型 | 临床变量数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2026-06-02 |
Integrating bulk and single-cell sequencing reveals cellular heterogeneity between lung adenocarcinoma in smokers and never-smokers
2026-May-21, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.39.20250160
PMID:40878768
|
研究论文 | 整合单细胞和批量测序揭示吸烟与非吸烟肺腺癌患者的细胞异质性 | 首次通过整合单细胞RNA测序和批量测序数据，系统揭示了吸烟与非吸烟肺腺癌患者在细胞亚群、肿瘤微环境和免疫逃逸机制上的差异，并识别出潜在免疫治疗靶点 | NA | 探究吸烟与非吸烟肺腺癌患者的细胞异质性及其在肿瘤发展和免疫治疗中的差异 | 吸烟与非吸烟肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-06-02 |
Targeting noncanonical nuclear factor kappa B signalling in CYLD cutaneous syndrome by selective inhibition of IκB kinase alpha
2026-05-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag044
PMID:41779628
|
研究论文 | 通过选择性抑制IκB激酶α靶向CYLD皮肤综合征中的非经典核因子κB信号通路 | 首次发现非经典NF-κB信号在CYLD皮肤综合征肿瘤角质形成细胞中异常激活，并鉴定IKKα为候选治疗靶点 | 研究仅基于患者来源的肿瘤球体培养模型，缺乏体内实验验证 | 探究CYLD皮肤综合征肿瘤中NF-κB信号异常机制，寻找可药物靶点 | CYLD皮肤综合征患者来源的肿瘤细胞和正常皮肤细胞 | 数字病理学 | 皮肤病 | RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 患者来源的肿瘤细胞分群和单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序, 大量RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2026-06-02 |
PI3Kδ inhibition alters CD8 T cell differentiation and reprograms the tumor microenvironment following adoptive immunotherapy
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag108
PMID:42215073
|
研究论文 | 揭示PI3Kδ抑制剂CAL-101如何改变CD8 T细胞分化并重编程肿瘤微环境，从而提升过继免疫治疗效果 | 首次揭示PI3Kδ抑制在体外处理T细胞可增强其干性和代谢适应性，并在慢性抗原刺激下抵抗终末耗竭，维持干细胞样特性 | 未提及具体限制 | 探究PI3Kδ抑制对T细胞分化及肿瘤微环境的影响，以改善实体瘤过继细胞治疗 | CAL-101处理的和未处理的T细胞，包括人T细胞，以及B16黑色素瘤肿瘤模型 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | B16黑色素瘤肿瘤样本（未明确数量） | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 53 | 2026-06-02 |
Scalable genotyping in fixed transcriptomes resolves clonal heterogeneity via single-cell sequencing
2026-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.11.717967
PMID:41993258
|
研究论文 | 提出GIFT技术，用于在固定转录组中同时检测大量靶向遗传变异和全转录组图谱，实现单细胞水平的克隆异质性分析 | 创新性地设计了一种基于相邻ssDNA探针的间隙填充反应，通过条码化天然转录序列实现高特异性靶向突变检测，并可在福尔马林固定石蜡包埋组织中进行克隆谱系追踪 | 未提及具体局限性 | 开发一种可扩展的基因分型方法，用于在单细胞水平同时解析转录状态和体细胞突变，以研究克隆异质性 | 来自35名骨髓增殖性肿瘤（MPN）供体的超过70万个人类细胞 | 单细胞基因组学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序、靶向突变检测 | NA | 单细胞转录组数据、突变数据 | 超过70万个来自35名MPN供体的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2026-06-02 |
Myeloid compartment reprogramming through nanoparticle-delivered resiquimod blocks paracrine growth support and activates phagocytosis to slow tumor progression in endogenous mouse medulloblastoma and diffuse midline glioma models
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.714454
PMID:41993485
|
研究论文 | 通过纳米颗粒递送的瑞西奎莫德（ResiPOx）重新编程髓系区室，阻断旁分泌生长支持并激活吞噬作用，从而在小鼠髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤模型中减缓肿瘤进展 | 首次利用脑渗透性聚噁唑啉纳米颗粒制剂ResiPOx靶向TAMs的TLR7/8受体，逆转其促肿瘤表型，并在非人灵长类中验证了转化潜力 | NA | 研究通过刺激TAMs病原体受体以逆转肿瘤支持性表型的潜力，评估ResiPOx的抗肿瘤疗效和免疫重塑机制 | 肿瘤相关髓系细胞（TAMs）、小鼠髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤模型、恒河猴 | 机器学习 | 髓母细胞瘤, 弥漫性中线胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠髓母细胞瘤和弥漫性中线胶质瘤模型样本、恒河猴脑组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于scRNA-seq分析 |
| 55 | 2026-06-02 |
A diagnostic plasma omics-biomarker for Alzheimer's disease informed by microglial single-cell transcriptomics: A pilot study
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.721959
PMID:42146366
|
研究论文 | 基于小胶质细胞单细胞转录组学数据开发阿尔茨海默病血浆组学生物标志物的初步研究 | 利用单细胞核RNA测序数据中的小胶质细胞基因表达，通过多种统计方法筛选基因面板，并结合图基映射方法将基因面板从脑组织转录组转移到血液单核细胞转录组，创新性地建立了从早期阶段诊断阿尔茨海默病的血浆组学生物标志物框架 | 300基因面板在预测认知正常患者时准确性较低（53%），且整体AUC值仅为0.7，表明诊断性能仍有提升空间 | 开发基于组学信息的血液诊断生物标志物，用于阿尔茨海默病的早期诊断 | 小胶质细胞（来自单细胞核RNA测序数据）和血液单核细胞（来自活体受试者） | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核RNA测序，RNA测序 | 图基映射方法，最优传输统计 | 转录组数据 | NA（摘要未明确样本数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2026-06-02 |
T-cell distribution in the dorsal root ganglion across species, sex, and age
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.722027
PMID:42146464
|
研究论文 | 通过比较生物学方法，研究T细胞在哺乳动物背根神经节中的分布，涵盖人类、非人灵长类、猪和啮齿类，并分析性别和年龄的影响 | 首次系统比较多个物种间背根神经节T细胞的分布差异，并揭示人类绝经前女性T细胞增多现象及Trm表型 | 未深入探讨DRG驻留T细胞的功能机制及物种差异的进化原因 | 阐明不同物种、性别和年龄下背根神经节T细胞的分布特征及其进化意义 | 人类、非人灵长类、猪、大鼠和小鼠的背根神经节组织 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 空间转录组学、免疫荧光 | NA | 空间转录组数据、免疫荧光图像 | 人类样本包括不同性别和年龄组，非人灵长类、猪、大鼠和小鼠各物种样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于人类DRG组织分析 |
| 57 | 2026-06-02 |
Cross-assay RNA modeling reveals cancer biomarkers
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.722009
PMID:42146664
|
研究论文 | 跨平台RNA数据分析揭示了癌症生物标志物 | 系统评估了四种转录组学平台（bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、NanoString和微阵列）的整合方法，提出了结合RNA-seq和NanoString的预测模型，并验证了外部微阵列队列 | 微阵列和单细胞RNA-seq数据存在系统性偏差，仅靠基因表达倍数变化无法完全消除平台特异性偏差 | 研究如何整合不同转录组学平台的数据以改进癌症预测建模 | 高级别浆液性癌（HGSC）肿瘤样本 | 机器学习 | 卵巢癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, NanoString, 微阵列 | 预测模型（未具体说明，如CNN等） | 基因表达数据（RNA） | 包含匹配新辅助化疗前后样本的HGSC患者队列 | Illumina, NanoString Technologies | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, NanoString, 微阵列 | Illumina NovaSeq, NanoString nCounter | 研究使用RNA-seq和NanoString平台对HGSC肿瘤样本进行联合分析 |
| 58 | 2026-06-02 |
Deciphering the glioblastoma microenvironmental landscape with multi-modal radiogenomics to guide prognosis and personalized therapy
2026-May-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08226-7
PMID:42087207
|
研究论文 | 开发一种基于多模态放射基因组学的非侵入性框架，用于解析胶质母细胞瘤的肿瘤微环境异质性并指导个性化治疗 | 首次将MRI影像组学特征与单细胞转录组数据整合，建立非侵入性方法捕获肿瘤微环境异质性，并筛选靶向药物以实现个性化治疗 | 未提及 | 建立非侵入性框架表征胶质母细胞瘤异质性，连接影像组学特征与微环境组成，识别可靶向的脆弱点以用于个性化治疗 | 胶质母细胞瘤患者及肿瘤微环境中的细胞状态（如NPC-like/OPC-like亚类、巨噬细胞、髓源性抑制细胞） | 计算机视觉, 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 磁共振成像（MRI）, 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 功能富集分析 | NA | 图像（MRI）, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2026-06-02 |
Sinonasal biphasic seromucinous adenocarcinomas: a report of two morphologically distinct cases with multimodal omics characterization
2026-May-04, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-026-04562-7
PMID:42080922
|
研究论文 | 报告两例形态不同的双相型鼻窦浆液黏液腺癌，并通过多组学分析揭示其分子异质性 | 首次对双相型鼻窦腺癌进行多模态组学表征（包括空间转录组学），揭示肿瘤内和肿瘤间的转录组异质性 | 仅报告两例病例，样本量有限，无法全面代表该类肿瘤的遗传多样性 | 阐明双相型鼻窦浆液黏液腺癌的分子特征和生物学复杂性 | 两例双相型鼻窦腺癌（嗜酸性细胞型和基底样细胞型） | 数字病理学 | 鼻窦腺癌 | 空间转录组学, 多组学分析（如HRAS/AKT1突变检测和FGFR2::SORB3融合检测） | 不适用 | 转录组数据, 基因突变数据 | 2例患者肿瘤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组学平台用于分析肿瘤样本的转录组异质性 |
| 60 | 2026-06-02 |
Integration of Single-Cell and Spatial Transcriptomics With Experimental Validation Uncovers Macrophage Diversity and Spatial Landscape in Carotid Atherosclerosis
2026-05, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70105
PMID:42052790
|
研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学与实验验证，揭示巨噬细胞多样性和空间景观在颈动脉粥样硬化中的作用 | 首次整合单细胞RNA测序、体外模型和空间转录组学，系统揭示颈动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的功能特征、分化轨迹及空间信号通路网络 | 未提及 | 研究颈动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的功能特征和调控机制 | 颈动脉粥样硬化组织中的巨噬细胞 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, 空间转录组学, 体外模型 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组, 体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |