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当前共找到 32150 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 41 | 2025-11-05 |
Multi-omics integration reveals key miRNAs, immune inflammation, and signaling pathways in Alzheimer's disease: Implications for targeted therapy
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147874
PMID:41005404
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示阿尔茨海默病中关键miRNAs、免疫炎症和信号通路的作用机制 | 整合三种组学数据集识别出AD相关关键miRNAs和信号通路，并提出免疫调节与神经再生相结合的治疗框架 | 候选miRNAs对成熟神经元标志物作用有限，需要合适的神经元环境才能诱导神经元分化 | 阐明阿尔茨海默病的分子机制并探索靶向治疗策略 | 阿尔茨海默病患者的多组学数据及神经元细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | miRNA-seq, RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | 测序数据 | 三种组学数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2025-11-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals LGALS9+ epithelial and COMP+ stromal cell crosstalk driving keratoconus pathogenesis
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147969
PMID:41022233
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示圆锥角膜发病机制中LGALS9+上皮细胞与COMP+基质细胞的相互作用 | 首次识别出圆锥角膜特异性细胞亚群——LGALS9阳性角膜上皮细胞和COMP阳性角膜基质细胞，并发现它们通过LGALS9-CD44/CD45和血小板反应蛋白信号通路形成促纤维化和促炎症网络 | 样本量较小（5例患者和5例对照），需要更大规模研究验证发现 | 研究圆锥角膜的细胞景观，揭示导致疾病进展的关键病理细胞群和信号通路 | 圆锥角膜患者和健康对照者的角膜组织 | 单细胞组学 | 圆锥角膜 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 免疫荧光, 蛋白质印迹 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质数据 | 5例圆锥角膜患者和5例健康对照的角膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-11-05 |
Identifying candidate genes for spermatogenic failure and predicting ICSI outcomes using single-cell RNA sequencing and protein-protein interaction networks
2025-Nov-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf186
PMID:41033661
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和蛋白质-蛋白质相互作用网络的机器学习框架识别精子发生障碍候选基因并预测ICSI结局 | 首次整合单细胞转录组学和PPI网络，结合机器学习算法进行基因优先排序和临床结局预测 | 基于文献和数据库标注的基因标签可能存在误分类或注释偏差，缺乏实验验证，外部队列样本量有限且多样性不足 | 改进精子发生障碍的基因识别方法并预测ICSI治疗结局 | 精子发生障碍患者（无精子症、弱精子症、畸形精子症） | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 随机森林, Node2Vec | 单细胞转录组数据, 蛋白质相互作用数据, 临床数据 | 34名精子发生障碍亚型患者 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-11-05 |
COL8A1 regulates endothelial phenotype in inflammatory endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Nov-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00339.2025
PMID:41042748
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研究论文 | 本研究探讨COL8A1在炎症性内皮-间质转化中对内皮表型的调控作用 | 首次揭示COL8A1在内皮稳定性维持中的关键作用及其在EndMT过程中的双相表达模式 | 研究主要基于体外细胞实验，需要更多体内实验验证 | 探究COL8A1在炎症性内皮-间质转化中的调控机制 | 小鼠和人类内皮细胞，特别是人主动脉内皮细胞(HAECs) | 细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序，免疫荧光分析，慢病毒过表达，siRNA抑制 | NA | 基因表达数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-11-05 |
Intrinsic changes in cell differentiation and identity drive impaired wound healing in aged female murine skin
2025-Nov-01, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-025-10340-w
PMID:41175301
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了老年雌性小鼠皮肤中细胞内在变化如何导致伤口愈合受损 | 首次在老年雌性小鼠模型中系统分析皮肤驻留细胞在衰老过程中的内在变化及其对伤口愈合的影响 | 研究仅限于雌性小鼠模型，且仅观察了伤后3天的时间点 | 阐明衰老皮肤中细胞内在变化导致伤口愈合受损的机制 | 年轻和老年雌性小鼠的完整皮肤及伤后3天的伤口组织 | 单细胞转录组学 | 皮肤伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年雌性小鼠的皮肤和伤口组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-11-05 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Novel Prognostic Signatures in HNSCC Immunotherapy Response
2025-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70171
PMID:40791099
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析头颈鳞状细胞癌免疫治疗反应，开发预后风险分层模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据开发LASSO-Cox风险分层模型，识别治疗前后免疫细胞亚群变化 | 样本量较小（仅3例患者），需要更大规模验证 | 分析肿瘤免疫微环境变化并建立免疫治疗预后预测模型 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 数字病理 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 3例HNSCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-11-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies a Novel OLR1+ SLC7A7+ Liver-Enriched Metastatic Subset With Immunometabolic Rewiring in Pancreatic Cancer
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71345
PMID:41176774
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别胰腺癌肝转移中新型OLR1+SLC7A7+肝脏富集转移亚群及其免疫代谢重编程特征 | 首次发现具有OLR1和SLC7A7标志的终末分化恶性细胞亚群(LEMS)，揭示其与SPP1+巨噬细胞的配体-受体网络驱动免疫逃逸机制 | 需要扩大临床队列和体内模型来全面阐明LEMS与巨噬细胞的具体机制相互作用 | 识别驱动PDAC肝转移的关键细胞亚群，阐明其与转移微环境的相互作用及肝脏定植机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)原发肿瘤和肝转移患者的临床样本及单细胞转录组数据 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PDAC原发肿瘤和肝转移患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-11-05 |
Exploring the Therapeutic Potential of MIR-140-3p in Osteoarthritis: Targeting CILP and Ferroptosis for Novel Treatment Strategies
2025-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70018
PMID:40044625
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研究论文 | 本研究探讨miR-140-3p通过靶向CILP调控铁死亡在骨关节炎中的治疗潜力 | 首次揭示miR-140-3p/CILP轴通过调控铁死亡、炎症和氧化应激参与骨关节炎发病的新机制 | 铁死亡在OA中的具体参与机制仍不完全清楚，研究主要基于细胞实验 | 探索骨关节炎的新型治疗策略 | 骨关节炎发病机制，特别是铁死亡过程 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,hdWGCNA分析,生物信息学分析,qRT-PCR,双荧光素酶实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | C28/I2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-11-05 |
Current trends in single-cell RNA sequencing applications in diabetes mellitus
2025-Nov, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70061
PMID:40537978
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综述 | 总结单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的最新进展和应用 | 系统梳理了scRNA-seq技术在糖尿病研究中的最新应用趋势，特别是在人类胰岛单细胞和免疫细胞表征方面的突破 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的应用现状和发展趋势 | 糖尿病相关的分子通路、人类胰岛细胞和免疫细胞 | 自然语言处理 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-11-05 |
Comprehensive single-cell analysis reveals mast cells' roles in cancer immunity
2025-Nov, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03590-y
PMID:41073552
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示肥大细胞在肿瘤微环境中的功能多样性及其对癌症免疫的影响 | 首次在15种实体瘤中系统鉴定出10种肥大细胞状态，发现具有抗原呈递功能的C7-HLA-DR簇可增强免疫治疗效果 | 研究样本量相对有限（264名患者），未涉及所有癌症类型 | 探究肥大细胞在肿瘤微环境中的功能多样性及其对免疫治疗的影响 | 15种实体瘤中的肥大细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 264名患者的385个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2025-11-05 |
SLGCA: spatial cross-level graph contrastive autoencoder for multislice spatial domain identification and microenvironment exploration
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf574
PMID:41182757
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研究论文 | 提出一种基于跨层级图对比学习的空间转录组数据分析方法SLGCA，用于多切片空间域识别和微环境探索 | 采用双通道学习机制，结合基于空间邻域信息的局部对比学习和跨视图的全局信息对比学习，无需预对齐即可整合多组织切片 | NA | 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 肝癌 | 空间转录组技术 | 图对比自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2025-11-05 |
Vemurafenib Activates PSMB9 to Induce Ferroptosis via Free Iron Accumulation and Inhibits Melanoma Progression
2025-Nov, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70577
PMID:41183120
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研究论文 | 本研究揭示了威罗菲尼通过激活PSMB9诱导铁死亡并抑制黑色素瘤进展的新机制 | 首次发现威罗菲尼通过靶向PSMB9调节游离铁水平诱导铁死亡的抗黑色素瘤机制 | NA | 探索威罗菲尼在黑色素瘤治疗中的作用机制 | 黑色素瘤细胞 | 生物医学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学分析,网络药理学,功能实验 | NA | 转录组数据,实验数据 | TCGA数据库数据及体外实验样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2025-11-05 |
Combining Mendelian randomization and network toxicology to decipher the causal role and molecular mechanisms of environmental pollutants in breast cancer: A focus on Methyl-4-hydroxybenzoate
2025-Nov-01, Cancer epidemiology
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.canep.2025.102953
PMID:41183465
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研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化和网络毒理学方法，探讨环境污染物甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果作用和分子机制 | 首次结合遗传学证据和网络毒理学方法，提出MEP通过非雌激素受体依赖机制促进乳腺癌发生的新假说 | 研究主要基于遗传关联和计算预测，需要后续实验验证 | 探究甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果作用和分子机制 | 乳腺癌患者和甲基对羟基苯甲酸酯暴露人群 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 孟德尔随机化, 网络毒理学, 转录组分析, 单细胞RNA测序, 空间转录组, 分子对接 | NA | 遗传数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 尿液MEP硫酸盐数据n=8285, FinnGen联盟乳腺癌风险数据n=182,927 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 54 | 2025-11-05 |
Molecular, metabolic, and histological subtypes of pancreatic ductal adenocarcinoma and its tumor microenvironment: Insights into tumor heterogeneity and clinical implications
2025-Nov-01, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2025.108946
PMID:41183744
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综述 | 本文系统回顾了胰腺导管腺癌的分子、代谢和组织学亚型分类方法及其临床意义 | 整合单细胞转录组学、空间转录组学和深度学习技术，揭示PDAC肿瘤异质性和亚型可塑性 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证 | 建立胰腺导管腺癌的多层次亚型分类体系以指导精准医疗 | 胰腺导管腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 代谢组学, 深度学习 | 深度学习模型 | 转录组数据, 代谢组数据, 组织病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2025-11-05 |
Hidden network preserved in Slide-tags data allows reference-free spatial reconstruction
2025-Oct-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65295-w
PMID:41173855
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研究论文 | 通过重新分析Slide-tags数据发现隐藏的细胞-磁珠网络，实现无需参考的空间重建 | 发现Slide-tags数据中意外形成的空间信息细胞-磁珠网络，将其重新定义为基于网络的测序成像方法 | NA | 开发无需预索引阵列的空间组织重建方法 | Slide-tags空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 网络优化模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | Slide-tags | 基于预解码磁珠阵列的空间条形码标记技术 |
| 56 | 2025-11-05 |
The involvement of microglia and the CXCL16-CXCR6 axis in the recruitment of CD8+ T cells to an amyloidogenic mouse brain
2025-Oct-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22137-5
PMID:41174156
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研究论文 | 本研究探讨小胶质细胞和CXCL16-CXCR6轴在淀粉样蛋白小鼠脑中招募CD8+ T细胞的作用 | 首次揭示在APP/PS1小鼠模型中，小胶质细胞通过CXCL16-CXCR6轴参与CD8+ T细胞脑部招募的机制，并发现PLX5622敏感的小胶质细胞在此过程中并非必需 | 研究主要基于小鼠模型，未来需要体内分析进一步解析CD8+ T细胞招募机制 | 阐明阿尔茨海默病中CD8+ T细胞脑部招募的分子机制 | APP/PS1转基因小鼠和野生型小鼠的脑组织及细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，体外细胞实验 | NA | 基因表达数据，细胞计数数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集，永生化和原代小鼠细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-11-05 |
Transcriptomic response analysis of rubber tree saplings to water-deficit stress at single-cell resolution
2025-Oct-31, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09046-z
PMID:41174182
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了橡胶树幼苗在水分胁迫下的细胞和分子响应机制 | 首次构建了橡胶树树皮在水分胁迫下的高分辨率单细胞转录组图谱，系统揭示了不同细胞类型对干旱胁迫的响应特征 | 研究仅分析了4天和7天两个时间点的胁迫响应，未涵盖更长期的适应过程 | 探究橡胶树对水分胁迫的分子适应机制，为提升其抗旱性提供理论基础 | 橡胶树幼苗的树皮组织 | 植物生物学 | 非疾病研究（植物胁迫响应） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17,994个单个细胞，来自对照、4天和7天干旱胁迫的树皮组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴式单细胞RNA测序技术 |
| 58 | 2025-11-05 |
Pan-Cancer Landscape of Magnesium Homeostasis: Bulk Omics Research and Single-Cell Sequencing Validation
2025-Oct-31, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00294-1
PMID:41174507
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研究论文 | 本研究全面分析了33种癌症类型中镁稳态的作用，探索其在肿瘤发生、免疫调节和治疗潜力中的意义 | 首次在泛癌水平系统研究镁稳态，结合批量组学分析和单细胞测序验证，提出镁稳态评分作为预后生物标志物 | 需要进一步的临床验证来推进个性化癌症治疗 | 全面分析镁稳态在多种癌症类型中的作用机制 | 33种癌症类型的肿瘤样本和CD8+T细胞 | 生物信息学 | 多种癌症 | 批量组学分析, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 单细胞测序数据 | 33种癌症类型的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量组学分析 | NA | NA |
| 59 | 2025-11-05 |
From pixels to cell types: a comprehensive review of computational methods for spatial transcriptomics deconvolution
2025-Oct-31, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00055-2
PMID:41174717
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综述 | 本文全面回顾了空间转录组学反卷积的二十种计算方法，分析其方法论基础和技术特点 | 首次系统对比分析二十种空间转录组反卷积算法的方法论基础、计算原理和处理范式 | NA | 为研究人员提供空间转录组反卷积计算方法的全面理解和实践指导 | 空间转录组反卷积计算方法 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 60 | 2025-11-05 |
An integrative analysis of transcriptome, methylome and single-cell RNA sequencing data identifies UBE2H as a marker of oxaliplatin resistance in colorectal cancer
2025-Oct-31, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03996-4
PMID:41174727
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研究论文 | 通过整合转录组、甲基化组和单细胞RNA测序数据，识别出UBE2H作为结直肠癌奥沙利铂耐药性的生物标志物 | 首次通过多组学整合分析揭示UBE2H与奥沙利铂耐药性的关联，并发现其与免疫耗竭和增殖性未分化细胞的联系 | 研究主要基于细胞系和公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 识别结直肠癌奥沙利铂耐药性的预测生物标志物 | 结直肠癌细胞系和公共数据库中的结直肠癌样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组测序, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据集和五个GEO数据集中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, DNA甲基化分析 | NA | NA |