单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5961 - 5980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5961 | 2025-10-06 |
RETRACTED: Deciphering the prognostic landscape of osteosarcoma: Integrating the roles of hippo pathway genes, programmed cell death, and the tumor immune microenvironment
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24280
PMID:38622820
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研究论文 | 本研究通过整合Hippo通路基因、程序性细胞死亡和肿瘤免疫微环境，揭示骨肉瘤的预后特征 | 首次系统整合Hippo通路基因与肿瘤免疫微环境在骨肉瘤预后中的作用，并通过单细胞测序揭示细胞异质性 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 探索骨肉瘤的分子基础并识别预后生物标志物 | 骨肉瘤患者样本 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 转录组分析, 单细胞测序 | Cox回归分析, 层次聚类, Kaplan-Meier分析 | 转录组数据 | TARGET-OS数据集和GTEx对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 5962 | 2025-10-06 |
RETRACTED: Single-cell transcriptome sequencing analysis reveals intra-tumor heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24243
PMID:38572681
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析揭示食管鳞状细胞癌的肿瘤内异质性 | 首次在食管鳞癌中应用单细胞转录组测序技术系统解析肿瘤微环境细胞组成和空间特征，并鉴定出关键基因UPF3A | 样本量相对有限（60个肿瘤样本和4个癌旁样本），研究结果需要更大样本验证 | 深入探究食管鳞癌的发病机制和关键分子事件 | 食管鳞状细胞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | COX回归模型, LASSO分析 | 单细胞转录组数据 | 60个肿瘤样本和4个癌旁样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5963 | 2025-10-06 |
RETRACTED: Prediction of potential targets and toxicological insights of Astragalus in liver cancer based on network pharmacology: Integrating systems biology, drug interaction networks, and toxicological perspectives
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24189
PMID:38476113
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研究论文 | 本研究通过网络药理学方法探讨黄芪在原发性肝癌治疗中的潜在靶点及其分子机制 | 整合系统生物学、单细胞分析和分子对接技术，首次在单细胞分辨率揭示黄芪对MT1E基因的调控作用及其细胞亚群特异性 | 研究主要基于计算预测和体外实验，缺乏临床验证数据 | 探索黄芪治疗原发性肝癌的分子靶点和作用机制 | 黄芪活性成分及其在肝癌细胞中的分子靶点 | 网络药理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 基因本体分析, KEGG通路分析, 基因集变异分析, 蛋白质相互作用网络, 分子对接, qPCR | UMAP, tSNE, SingleR | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5964 | 2025-10-06 |
Understanding psoriatic disease at single-cell resolution: an update
2025-Jul-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001085
PMID:40160177
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综述 | 本文综述了单细胞技术在银屑病研究中的最新进展，重点探讨了免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞在疾病中的作用机制 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示银屑病细胞多样性，发现IL-17/IL-36和PRSS3-F2R通路在成纤维细胞-角质形成细胞相互作用中的关键作用，以及代谢失调在慢性炎症中的新机制 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于已有研究进行总结分析 | 探讨单细胞技术在银屑病研究中的应用及其对疾病机制理解的贡献 | 银屑病患者皮肤组织中的免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5965 | 2025-10-06 |
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Sequencing Analysis Reveals Intra-Tumor Heterogeneity in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24542
PMID:40358431
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撤稿声明 | 本文宣布撤回一篇关于食管鳞状细胞癌肿瘤内异质性的单细胞转录组测序研究论文 | NA | 论文基于受损的投稿和同行评审流程被接受，且作者未能验证肿瘤样本和细胞系的来源 | NA | 食管鳞状细胞癌 | NA | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5966 | 2025-10-06 |
Malvidin Alleviates Lipopolysaccharide-Induced Acute Lung Injury by Modulating JAK2/STAT3 Signaling to Inhibit Macrophage M1 Polarization and Oxidative Stress
2025-Jun-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c00077
PMID:40397040
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研究论文 | 本研究探讨锦葵色素通过调节JAK2/STAT3信号通路抑制巨噬细胞M1极化和氧化应激，缓解脂多糖诱导的急性肺损伤 | 首次揭示锦葵色素通过靶向JAK2/STAT3信号通路调控巨噬细胞极化状态，并证实其结合JAK2的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行临床验证 | 评估锦葵色素对急性肺损伤的治疗效果并阐明其作用机制 | 小鼠急性肺损伤模型和巨噬细胞 | 分子生物学 | 急性肺损伤 | 单细胞转录组测序,RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,Western blot,DPPH/ABTS自由基清除实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,分子相互作用数据 | 小鼠模型和细胞实验样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 5967 | 2025-10-06 |
Analyzing the potential targets and mechanism of per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) on breast cancer by integrating network toxicology, single-cell sequencing, spatial transcriptomics, and molecular simulation
2025-Jun-04, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01616-y
PMID:40465018
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研究论文 | 通过整合网络毒理学、单细胞测序、空间转录组学和分子模拟，研究PFAS对乳腺癌的潜在靶点和作用机制 | 首次整合网络毒理学、单细胞测序、空间转录组学和分子模拟方法系统研究PFAS与乳腺癌的关联机制 | PFAS导致乳腺癌发展的具体分子机制仍需进一步研究 | 研究PFAS环境污染物对乳腺癌发展的分子机制 | 乳腺癌相关基因和蛋白质 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 网络毒理学,单细胞测序,空间转录组学,分子模拟 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络,分子对接模拟 | 基因表达数据,空间转录组数据,分子结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 5968 | 2025-10-06 |
Deciphering the temporal transcriptional landscape of human fetal leptomeninges
2025-Jun-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae397
PMID:39657259
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研究论文 | 通过单核RNA测序揭示人类胎儿软脑膜发育过程中的转录组动态和细胞异质性 | 首次系统描绘人类胎儿软脑膜发育的时间转录组图谱，发现人类特异性层标记物和衰老特异性蛛网膜细胞簇 | 样本数量有限（8个人类胚胎），仅通过免疫染色验证部分发现 | 解析人类胚胎发育过程中软脑膜的细胞发育和分子机制 | 人类胎儿软脑膜组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单核RNA测序，生物信息学分析，免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 8个人类胚胎（从早期胎儿到中晚期胎儿阶段） | NA | 单核RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5969 | 2025-10-06 |
The Application of Omics Technologies in Type II Diabetes Mellitus Research
2025-Jun-03, Current diabetes reviews
IF:2.4Q3
|
综述 | 本文探讨组学技术在2型糖尿病研究中的应用与进展 | 系统总结单细胞测序和LC-MS技术如何推动糖尿病精准医疗和生物标志物发现 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于文献综述 | 探索组学技术在2型糖尿病研究中的应用价值 | 2型糖尿病的分子机制和生物标志物 | 生物医学 | 2型糖尿病 | 基因组学,蛋白质组学,代谢组学,单细胞测序,液相色谱-质谱联用 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,代谢组学 | NA | NA |
| 5970 | 2025-10-06 |
A Genetic Perspective to Reveal the Impact of Mitochondrial Dysfunction-related Genes on Diabetic Kidney Disease: A Multi-omics Study
2025-Jun-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨线粒体功能障碍相关基因在糖尿病肾病中的作用，并确定ACTN1作为潜在治疗靶点 | 首次整合大规模数据库和单细胞RNA测序数据，识别出7个具有显著遗传因果效应的线粒体功能障碍相关基因，并预测了二氢麦角汀作为ACTN1的靶向化合物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 探究线粒体功能障碍在糖尿病肾病进展中的分子机制，识别关键致病基因 | 糖尿病肾病相关的线粒体功能障碍基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, SMR分析, MR分析, 共定位分析, PheWAS分析, 分子动力学分析, 免疫荧光 | 预测模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5971 | 2025-10-06 |
TFcomb identifies transcription factor combinations for cellular reprogramming based on single-cell multiomics data
2025-Jun-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279955.124
PMID:40210438
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞多组学数据识别细胞重编程转录因子及其组合的计算方法 | 将重编程转录因子识别建模为逆问题，使用Tikhonov正则化保证泛化能力，并设计图注意力网络增强基因调控网络 | NA | 识别能够指导细胞状态转变的重编程转录因子及其组合 | 细胞重编程过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 图注意力网络 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5972 | 2025-10-06 |
Dissecting multilayer cell-cell communications with signaling feedback loops from spatial transcriptomics data
2025-Jun-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279857.124
PMID:40262896
|
研究论文 | 开发了一种名为stMLnet的计算方法，用于从空间转录组数据中解析多层细胞间通讯及信号反馈环路 | 首次整合空间信息和多层信号调控机制来识别多层细胞通讯中的信号反馈环路 | NA | 开发能够整合空间信息和复杂信号机制来推断功能性细胞间通讯的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞间通讯网络 | 空间转录组学 | COVID-19感染 | 空间转录组学 | 基于扩散模型和质量作用模型的信号活动量化方法 | 空间转录组数据 | 多种空间转录组技术数据集 | NA | 空间转录组学, seqFISH+, Slide-seq v2, MERFISH, Stereo-seq | seqFISH+, Slide-seq v2, MERFISH, Stereo-seq | 具有不同空间分辨率和基因覆盖度的多种空间转录组技术 |
| 5973 | 2025-10-06 |
STCC enhances spatial domain detection through consensus clustering of spatial transcriptomics data
2025-Jun-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280031.124
PMID:40355284
|
研究论文 | 开发了一种用于空间转录组学数据的共识聚类框架STCC，通过整合多种先进工具的聚类结果来提高空间域检测的准确性 | 提出了首个专门针对空间转录组学数据的共识聚类框架，整合了四种不同的共识策略（Onehot-based、average-based、hypergraph-based和wNMF-based方法） | 在分析具有分散细胞类型分布模式的肿瘤样本时，仅整合单一基线方法才能获得满意性能 | 提高空间转录组学数据中空间域检测的准确性和稳定性 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 共识聚类框架 | 空间转录组数据 | 模拟数据和来自不同实验平台的真实数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5974 | 2025-10-06 |
Targeting INF2 with DiosMetin 7-O-β-D-Glucuronide: a new stratagem for colorectal cancer therapy
2025-Jun-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14357-9
PMID:40452021
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别INF2作为结直肠癌特异性生物标志物，并发现天然化合物DiosMetin 7-O-β-D-葡萄糖醛酸苷可作为INF2抑制剂用于靶向治疗 | 首次将INF2鉴定为结直肠癌特异性预后标志物，并发现天然化合物DiosMetin 7-O-β-D-葡萄糖醛酸苷作为选择性INF2抑制剂 | NA | 识别结直肠癌特异性生物标志物并开发靶向治疗方法 | 结直肠癌组织和细胞 | 生物医学研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 免疫组织化学, 细胞生物学实验, 计算对接 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5975 | 2025-10-06 |
Novel roles for CREG1 in hematopoiesis revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Jun-01, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01407-9
PMID:40452027
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示CREG1在斑马鱼造血过程中的新功能 | 首次在成年斑马鱼中利用单细胞RNA测序技术系统研究CREG1在造血过程中的作用，发现其对B细胞、T/NK细胞和红细胞谱系发育的关键调控功能 | 研究仅在斑马鱼模型中进行，尚未在哺乳动物系统中验证；具体的分子调控机制仍需进一步研究 | 探究CREG1在成年造血过程中的功能和机制 | 成年斑马鱼的肾脏骨髓造血组织 | 单细胞生物学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | creg1缺陷型斑马鱼肾脏骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5976 | 2025-10-06 |
Precision targeting of β-catenin induces tumor reprogramming and immunity in hepatocellular cancers
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60457-2
PMID:40442146
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向β-catenin的新型siRNA纳米颗粒疗法，可重塑肝细胞癌的肿瘤微环境并增强免疫治疗反应 | 首次证明靶向CTNNB1的siRNA纳米颗粒可重编程Wnt活性肝细胞癌的肿瘤微环境，激活干扰素信号通路并增强免疫检查点抑制剂疗效 | 研究主要基于临床前模型，临床疗效仍需进一步验证 | 开发针对β-catenin突变肝细胞癌的新型治疗策略并阐明其作用机制 | β-catenin突变的肝细胞癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, siRNA技术 | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 多个免疫活性肝细胞癌模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5977 | 2025-10-06 |
Bronchopulmonary dysplasia with pulmonary hypertension associates with semaphorin signaling loss and functionally decreased FOXF1 expression
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60371-7
PMID:40442177
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析早产儿肺组织，发现BPD合并PH与信号素信号通路缺失及FOXF1表达降低相关 | 首次在人类早产儿肺组织中鉴定出BPD+PH特有的ANKRD1表达异常毛细血管细胞状态，并揭示信号素引导通路缺陷与FOXF1表达降低的关联 | 样本量有限，主要基于观察性数据，需要进一步功能验证 | 探索支气管肺发育不良合并肺动脉高压的细胞和分子驱动机制 | 早产儿肺组织（包括BPD和BPD+PH患者）及足月婴儿肺组织 | 单细胞基因组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 早产儿和足月婴儿肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5978 | 2025-10-06 |
[Progress in investigating astrocyte heterogeneity after spinal cord injury based on single-cell sequencing technology]
2025-May-25, Zhongguo gu shang = China journal of orthopaedics and traumatology
|
综述 | 基于单细胞测序技术研究脊髓损伤后星形胶质细胞异质性的进展综述 | 利用单细胞测序技术揭示脊髓损伤后星形胶质细胞的异质性及其与神经再生修复的关联 | 目前所有发现仍需更多基础研究和足够临床试验验证 | 探讨单细胞测序技术在脊髓损伤后星形胶质细胞研究中的应用进展 | 脊髓损伤后的星形胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5979 | 2025-10-06 |
ICOS+CD4+ T cells define a high susceptibility to anti-PD-1 therapy-induced lung pathogenesis
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186483
PMID:40198121
|
研究论文 | 本研究揭示了ICOS+CD4+ T细胞在抗PD-1治疗诱导的肺毒性中的关键作用及其与衰老环境的关联 | 首次发现衰老环境中ICOS+CD4+ T细胞的活化是抗PD-(L)1治疗诱发肺毒性的关键机制，并证实ICOS-ICOSL相互作用是该过程的核心环节 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步扩大样本量 | 探索抗PD-(L)1免疫治疗引发免疫相关不良事件（irAEs）的细胞机制 | 荷瘤老年小鼠模型、肺癌患者样本 | 免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序、过继性T细胞转移 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 老年和年轻荷瘤小鼠、癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5980 | 2025-10-06 |
Characterization of a pathogenic nonmigratory fibroblast population in systemic sclerosis skin
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185618
PMID:40232859
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研究论文 | 本研究通过分离系统性硬化症皮肤中的非迁移性成纤维细胞群体，揭示了其在疾病不同阶段的致病机制 | 首次分离并表征了传统外植体培养方法无法获得的非迁移性成纤维细胞群体，发现其具有独特的致病特征 | 研究样本量有限，需要进一步验证在不同疾病亚组中的普适性 | 阐明系统性硬化症皮肤中不同成纤维细胞群体的致病机制和功能差异 | 系统性硬化症患者的皮肤成纤维细胞 | 病理生物学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多通道免疫荧光, 体外功能研究 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |