单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 5961 - 5980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5961 | 2024-11-27 |
A spatial human thymus cell atlas mapped to a continuous tissue axis
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.25.562925
PMID:37986877
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研究论文 | 本文通过空间解析分析，建立了一个新的定量形态学框架，用于描述胸腺的皮质-髓质轴，并展示了胸腺细胞和胸腺上皮细胞的高度组织性 | 本文创新性地结合了多模态单细胞、空间转录组学和高分辨率多重成像技术，构建了一个连续组织轴上的空间人类胸腺细胞图谱 | NA | 研究胸腺细胞在出生前和出生后的发育过程及其微解剖学基础 | 胸腺细胞和胸腺上皮细胞的发育轨迹及其组织结构 | NA | NA | 空间转录组学、高分辨率多重成像 | NA | 单细胞数据、空间转录组数据、图像数据 | NA |
| 5962 | 2024-11-27 |
Ras drives malignancy through stem cell crosstalk with the microenvironment
2022-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05475-6
PMID:36450983
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研究论文 | 研究了RAS激活后癌症干细胞与微环境之间的异常信号交流如何驱动恶性进展 | 揭示了癌症干细胞与微环境之间的动态交流如何促进从良性到恶性鳞状细胞癌的转变 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类癌症 | 探讨RAS激活后癌症干细胞与微环境之间的信号交流如何驱动恶性进展 | 癌症干细胞与微环境之间的信号交流 | 癌症生物学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞转录组学、染色质景观分析、慢病毒报告基因和谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 5963 | 2024-11-26 |
Identification of Nfel1a and Nfel3 as novel regulators for zebrafish thrombopoiesis
2025-Feb, Blood cells, molecules & diseases
DOI:10.1016/j.bcmd.2024.102897
PMID:39413675
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研究论文 | 研究揭示了Nfe2I1a和Nfe2l3作为斑马鱼血栓生成的新调控因子 | 发现Nfe2I1a和Nfe2l3是斑马鱼血栓生成的新型转录因子，并证明了它们在血栓生成中的正调控作用 | NA | 探讨斑马鱼血栓生成过程中Nfe2相关基因的作用 | 斑马鱼的血栓生成和Nfe2相关基因 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 5964 | 2024-11-26 |
Unraveling immune cell heterogeneity in autoimmune arthritis: insights from single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Immunological medicine
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/25785826.2024.2388343
PMID:39120105
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在自身免疫性关节炎（包括类风湿性关节炎和脊柱关节炎）发病机制和临床应用中的关键发现和进展 | 单细胞RNA测序揭示了炎症部位成纤维细胞和免疫细胞亚群的异质性，提供了对疾病机制和治疗反应差异的见解 | 成本和样本量限制是当前面临的挑战，但合作努力和利用公共数据库有望克服这些障碍 | 探讨单细胞RNA测序在自身免疫性关节炎中的应用，揭示细胞异质性并推动精准医学 | 类风湿性关节炎和脊柱关节炎中的成纤维细胞和免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本量未在摘要中提及 |
| 5965 | 2024-11-26 |
Integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing reveals sphingolipid metabolism and immune landscape in clear cell renal cell carcinoma
2024-Dec, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24319
PMID:39230203
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研究论文 | 本研究利用批量和单细胞RNA测序数据，全面分析了透明细胞肾细胞癌中的鞘脂代谢和免疫微环境 | 开发了一种风险评分模型，用于增强透明细胞肾细胞癌患者的预后预测 | 依赖于公共来源的观察数据，主要关注RNA测序数据，未涵盖蛋白质表达、翻译后修饰和全面代谢谱等关键方面 | 揭示透明细胞肾细胞癌中鞘脂代谢和肿瘤微环境的复杂性 | 透明细胞肾细胞癌样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序 | 风险评分模型 | RNA数据 | 来自公共数据库的透明细胞肾细胞癌样本 |
| 5966 | 2024-11-26 |
Ischemia-reperfusion responses in human lung transplants at the single-cell resolution
2024-Dec, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.08.019
PMID:39197591
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研究论文 | 研究了人类肺移植中缺血-再灌注反应在单细胞分辨率下的表现 | 首次在单细胞分辨率下分析了人类肺移植中的缺血-再灌注反应，揭示了不同细胞类型的炎症反应差异 | 样本量较小，仅包括6例肺移植病例 | 加速肺移植中肺损伤治疗的发展 | 人类肺移植中的缺血-再灌注反应 | 数字病理学 | 肺移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6例肺移植病例的供体肺活检样本 |
| 5967 | 2024-11-26 |
The contribution of the sphingosine 1-phosphate signaling pathway to chronic kidney diseases: recent findings and new perspectives
2024-Dec, Pflugers Archiv : European journal of physiology
DOI:10.1007/s00424-024-03029-5
PMID:39384640
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综述 | 本文深入分析了鞘氨醇-1-磷酸（S1P）信号通路在慢性肾脏疾病（CKD）发病机制和肾纤维化中的关键作用 | 强调了S1P信号通路作为CKD治疗策略的潜在靶点，并探讨了新兴技术如空间转录组学在S1P研究中的应用 | NA | 探讨S1P信号通路在慢性肾脏疾病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | S1P信号通路在不同类型慢性肾脏疾病中的作用，包括糖尿病肾病、狼疮性肾炎、局灶节段性肾小球硬化、法布里病和IgA肾病 | NA | 慢性肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 5968 | 2024-11-26 |
Upregulation of CD244 promotes CD8+ T cell exhaustion in patients with alveolar echinococcosis and a murine model
2024-Nov-23, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-024-06573-2
PMID:39578914
|
研究论文 | 研究CD244在肺吸虫病患者和鼠模型中促进CD8+ T细胞耗竭的作用 | 首次揭示了CD244在介导CD8+ T细胞耗竭中的作用，并探讨了其在肺吸虫病恶性进展中的机制 | 研究主要基于体外和体内模型，缺乏对人类患者的长期随访数据 | 探讨CD244在肺吸虫病患者中促进CD8+ T细胞耗竭的作用及其机制 | 肺吸虫病患者的CD8+ T细胞和鼠模型 | 免疫学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、流式细胞术 | NA | RNA序列、图像 | 肺吸虫病患者的肝组织样本和CD244缺陷小鼠 |
| 5969 | 2024-11-26 |
Single-cell sequencing reveals PTX3 involvement in ovarian cancer metastasis
2024-Nov-23, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01558-2
PMID:39580424
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化技术，揭示了PTX3在卵巢癌腹膜转移中的作用及其机制 | 首次证实PTX3在卵巢癌转移病灶中的表达高于原发病灶，并发现PTX3通过激活EMT和NF-κB信号通路促进卵巢癌细胞的转移能力 | NA | 探讨PTX3在卵巢癌腹膜转移中的作用及其分子机制 | 卵巢癌细胞、PTX3表达及其功能 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、共免疫沉淀 | NA | RNA | NA |
| 5970 | 2024-11-26 |
Single-cell analysis uncovers liver susceptibility to pancreatic cancer metastasis via myeloid cell characterization
2024-Nov-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01566-0
PMID:39578286
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析胰腺癌肝转移的肿瘤免疫微环境特征 | 发现了与胰腺癌肝转移相关的特定巨噬细胞亚群Mph_SPP1，并揭示了其在调节血管生成和肿瘤侵袭中的作用 | 研究仅限于单细胞RNA测序数据，未涉及其他类型的实验验证 | 探究胰腺癌肝转移的肿瘤免疫微环境特征 | 胰腺癌和结直肠癌的肝转移样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括胰腺癌肝转移、结直肠癌肝转移、原发性胰腺癌、原发性结直肠癌以及外周血单核细胞和邻近正常胰腺组织样本 |
| 5971 | 2024-11-26 |
Immunotherapy that improves response to chemotherapy in high-grade serous ovarian cancer
2024-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54295-x
PMID:39578450
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了高级别浆液性卵巢癌中的肿瘤浸润免疫细胞，发现了一些可以增强新辅助化疗反应的潜在靶点 | 本文首次在高级别浆液性卵巢癌中发现新辅助化疗诱导的stabilin-1和FOXP3表达上调，并通过体外实验和动物模型验证了这些靶点的有效性 | 本文主要基于体外实验和动物模型，尚未在临床试验中验证这些靶点的效果 | 研究如何通过免疫疗法增强高级别浆液性卵巢癌患者对化疗的反应 | 高级别浆液性卵巢癌中的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 64,097个细胞样本和69,781个细胞样本分别来自患者和同基因小鼠模型 |
| 5972 | 2024-11-26 |
VGAE-CCI: variational graph autoencoder-based construction of 3D spatial cell-cell communication network
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae619
PMID:39581873
|
研究论文 | 提出了一种基于变分图自编码器的深度学习框架VGAE-CCI，用于构建三维空间细胞间通信网络 | 该方法能够识别跨多层组织的细胞间通信，并适用于具有缺失或部分不完整数据的空间转录组数据 | 未提及 | 解决空间转录组数据中的不完整性和系统偏差问题，以及跨多层组织的细胞间通信分析 | 细胞间通信网络 | 生物信息学 | NA | 空间转录组测序 (ST-seq) | 变分图自编码器 (VGAE) | 空间转录组数据 | 六个数据集 |
| 5973 | 2024-11-26 |
BioDSNN: a dual-stream neural network with hybrid biological knowledge integration for multi-gene perturbation response prediction
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae617
PMID:39584702
|
研究论文 | 本文提出了一种双流神经网络架构BioDSNN，用于预测多基因扰动响应 | 结合生成模型和生物知识网络，实现了对单细胞RNA-seq数据的双模态深度理解 | NA | 研究基因扰动对细胞的影响，并提出一种新的计算模型来预测未见过的基因扰动组合 | 单细胞RNA-seq数据和基因扰动响应 | 机器学习 | NA | 生成模型、图网络、掩码变换器 | 双流神经网络 | 基因数据 | NA |
| 5974 | 2024-11-26 |
Tissue factor pathway inhibitor 2 (TFPI2) is a potential serum biomarker for clear cell renal carcinoma
2024-11-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-80248-x
PMID:39562727
|
研究论文 | 研究评估了组织因子途径抑制剂2（TFPI2）作为透明细胞肾细胞癌（RCC）的潜在血清生物标志物的有效性 | TFPI2作为透明细胞肾细胞癌的潜在血清生物标志物，提供了改进检测和预后评估的途径 | NA | 评估TFPI2作为透明细胞肾细胞癌的生物标志物的有效性 | 透明细胞肾细胞癌患者的血清样本和健康志愿者的血清样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血清 | 肾细胞癌患者和健康志愿者的血清样本 |
| 5975 | 2024-11-26 |
Sample multiplexing for retinal single-cell RNA sequencing
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111250
PMID:39569377
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于视网膜单细胞RNA测序的样本多重化方法 | 本文提出了一种样本多重化方法，通过使用胆固醇修饰的寡核苷酸对每个样本进行唯一序列条形码标记，从而在生物信息学上解析样本来源 | 本文未详细讨论该方法在其他细胞类型或物种中的适用性 | 研究目的是开发一种能够在单细胞RNA测序中解析样本来源的方法 | 研究对象是视网膜神经节细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠视网膜样本 |
| 5976 | 2024-11-26 |
Actin Dysregulation Induces Neuroendocrine Plasticity and Immune Evasion: A Vulnerability of Small Cell Lung Cancer
2024-Nov-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.15.528365
PMID:36824957
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研究论文 | 研究了CRACD在小细胞肺癌中的作用及其对肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸的影响 | 首次揭示了CRACD通过调节肌动蛋白聚合和EZH2介导的H3K27甲基化，影响小细胞肺癌的肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸 | 研究主要集中在CRACD和EZH2的作用，未全面探讨其他潜在的调控机制 | 探讨小细胞肺癌中肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸的机制 | 小细胞肺癌细胞及其相关基因和蛋白质 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及小细胞肺癌患者肿瘤样本 |
| 5977 | 2024-11-26 |
Cross-tissue organization of myeloid cells in scleroderma and related fibrotic diseases
2024-Nov-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001047
PMID:39171604
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综述 | 本文综述了硬皮病及相关纤维化疾病中髓系细胞在不同组织中的分布情况 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析，提出了一种统一的髓系细胞命名法，并发现了一种新的树突状细胞亚群DC3 | scRNA-Seq研究在髓系细胞类型的命名上存在不一致性 | 探讨硬皮病及相关纤维化疾病中髓系细胞的组织分布和命名统一 | 硬皮病、特发性肺纤维化、COVID-19肺纤维化、骨髓纤维化及肝、肾、心脏纤维化中的髓系细胞 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多种纤维化疾病的多个组织样本 |
| 5978 | 2024-11-26 |
Mapping intratumoral myeloid-T cell interactomes at single-cell resolution reveals targets for overcoming checkpoint inhibitor resistance
2024-Oct-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620093
PMID:39554094
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研究论文 | 本文开发了一种计算方法，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）衍生的单细胞分辨率细胞间相互作用图谱，并应用于研究CD40激动剂（CD40ag）如何改变免疫细胞间的对话，特别是在肿瘤模型中与免疫检查点阻断（ICB）联合使用时 | 本文创新性地开发了一种计算方法，能够有效分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用，并揭示了CD40ag在改善ICB反应中的作用 | 本文未详细讨论该计算方法在其他类型肿瘤或不同数据集上的适用性和泛化能力 | 研究如何通过分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用，揭示CD40ag在克服免疫检查点抑制剂耐药性中的作用 | 研究对象包括肿瘤微环境中的髓系细胞和T细胞，以及它们在CD40ag和ICB治疗下的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 5979 | 2024-11-26 |
Cell2Sentence: Teaching Large Language Models the Language of Biology
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.11.557287
PMID:39554079
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研究论文 | 介绍了一种名为Cell2Sentence的新方法，将大型语言模型直接适应于生物学背景，特别是单细胞转录组学 | 通过将基因表达数据转化为“细胞句子”，Cell2Sentence方法填补了自然语言处理与生物学之间的空白 | NA | 探索如何将大型语言模型应用于生物学领域，特别是单细胞转录组学 | 单细胞转录组学数据和大型语言模型 | 自然语言处理 | NA | NA | GPT-2 | 基因表达数据 | NA |
| 5980 | 2024-11-26 |
Cytokine-induced reprogramming of human macrophages toward Alzheimer's disease-relevant molecular and cellular phenotypes in vitro
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.619910
PMID:39554174
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研究论文 | 研究探讨了一种细胞因子混合物对人类巨噬细胞进行阿尔茨海默病相关分子和细胞表型的体外重编程能力 | 首次使用细胞因子混合物成功诱导人类巨噬细胞向阿尔茨海默病相关表型转变 | 研究仅限于体外实验，尚未在体内验证其效果 | 研究细胞因子对人类巨噬细胞重编程的能力，以模拟阿尔茨海默病相关表型 | 人类THP-1巨噬细胞 | 细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了细胞因子混合物处理的THP-1巨噬细胞样本 |