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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5961 | 2026-03-21 |
Single-cell sequencing reveals unexpected genetic diversity among Bodo spp. flagellates and their bacterial endosymbionts
2026-Mar, Microbial genomics
IF:4.0Q2
DOI:10.1099/mgen.0.001642
PMID:41848149
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了Bodo属鞭毛虫及其细菌内共生体之间意想不到的遗传多样性 | 首次对未培养的Bodo属鞭毛虫进行单细胞测序,发现了三个潜在新物种,并揭示了宿主与内共生体之间协同进化的多样性模式 | 样本仅来自英国一处淡水地点,样本量较小(7个细胞),可能无法代表全球Bodo属的完整多样性 | 探究自由生活鞭毛虫Bodo属及其内共生体的遗传多样性和物种界定 | Bodo属鞭毛虫及其Holosporales目细菌内共生体 | 微生物基因组学 | NA | 单细胞测序、比较基因组学 | NA | 基因组序列数据 | 7个未培养的Bodo属细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5962 | 2026-03-21 |
Single-cell transcriptomics reveals pathogen-specific monocyte heterogeneity and potential biomarkers in gram-positive versus gram-negative bloodstream infections
2026-Mar-01, World journal of emergency medicine
IF:2.6Q1
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染中病原特异性的单细胞异质性,并鉴定了潜在的生物标志物 | 首次在单细胞水平上系统比较了革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染对宿主单核细胞转录组的特异性影响,并发现了S100A12与降钙素原联合作为鉴别诊断生物标志物的潜力 | 单细胞测序样本量较小(仅4名患者),临床验证队列规模有限,需要更大规模的前瞻性研究进行验证 | 阐明革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染在单细胞水平的宿主免疫反应差异,并寻找鉴别诊断的生物标志物 | 健康志愿者、革兰氏阴性菌血流感染脓毒症患者、革兰氏阳性菌血流感染脓毒症患者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 血流感染/脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 单细胞测序:4名患者(2名GNB-BSI,2名GPC-BSI)+健康志愿者;临床验证:85名患者(45名GNB-BSI,40名GPC-BSI) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5963 | 2026-03-21 |
Chronic inflammation promotes gastric cancer progression via ADAM10-mediated cleavage of CX3CL1
2026-Feb-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39743-6
PMID:41691064
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研究论文 | 本研究探讨了慢性炎症通过ADAM10介导的CX3CL1切割促进胃癌进展的分子机制 | 揭示了慢性炎症通过上调ADAM10表达,将膜结合型CX3CL1转化为可溶性形式,从而激活ADAM10/CX3CL1轴促进胃癌进展的新机制 | 研究主要基于小鼠皮下异种移植模型和体外细胞实验,缺乏更接近人体生理环境的体内模型验证 | 探究慢性炎症对胃癌进展的影响及其分子机制 | 胃癌细胞、615品系小鼠、胃癌组织样本 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、ELISA、qRT-PCR、Western blot、免疫荧光染色 | 小鼠皮下异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型、胃癌细胞系和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5964 | 2026-03-21 |
Development and validation of an oxidative phosphorylation based prognostic model revealing tumor progression and immune microenvironment in lung adenocarcinoma
2026-Feb-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04478-3
PMID:41670771
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于氧化磷酸化的预后模型,用于揭示肺腺癌的肿瘤进展和免疫微环境 | 首次构建了基于氧化磷酸化相关基因的预后模型,并揭示了UQCC3⁺和RAB5IF⁺上皮细胞通过TGF-β和Galectin信号通路促进恶性增殖和免疫抑制的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证 | 开发肺腺癌的预后模型并探索氧化磷酸化在肿瘤进展中的作用机制 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA数据集作为发现队列,多个GEO数据集作为独立验证队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5965 | 2026-02-13 |
Spatial transcriptomics and single-cell analyses reveal the role of the cisplatin-resistant gene panel in NSCLC progression and the tumor microenvironment, identifying LOXL2 as a potential therapeutic target
2026-Feb-11, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04170-0
PMID:41673658
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5966 | 2026-02-11 |
Mitochondrial DNA methylation predicts immunotherapy response and prognosis in lung adenocarcinoma: evidence from scRNA-Seq and machine learning
2026-Feb-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15648-5
PMID:41663976
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5967 | 2026-03-21 |
Hepatic stellate cell derived lipid droplets drive protumoral M2 macrophage polarization in hepatocellular carcinoma
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04626-9
PMID:41663693
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研究论文 | 本研究揭示了在慢性肝损伤中,活化的肝星状细胞通过释放脂滴被肝巨噬细胞内吞,诱导其M2极化,从而促进肝细胞癌发展的新机制 | 首次发现活化的肝星状细胞释放的脂滴可作为直接代谢信号诱导肝巨噬细胞M2极化,并促进肝细胞癌生长,提出了一种新的HSC-巨噬细胞串扰机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床相关性仅通过TCGA数据库分析验证,缺乏直接的患者样本功能验证 | 探究肝星状细胞脂滴在慢性肝损伤中的命运及其对肝巨噬细胞表型和肝细胞癌发展的影响 | 肝星状细胞、肝巨噬细胞、肝细胞癌 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、透射电子显微镜、流式细胞术、梯度离心、TCGA数据分析 | NA | 基因表达数据、图像数据、临床数据 | C57BL/6小鼠(慢性肝损伤模型)、TCGA-LIHC队列患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5968 | 2026-03-21 |
scLong: a billion-parameter foundation model for capturing long-range gene context in single-cell transcriptomics
2026-02-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69102-y
PMID:41639087
|
研究论文 | 本文介绍了scLong,一个基于48百万细胞预训练的十亿参数基础模型,旨在通过自注意力机制捕获单细胞转录组学中所有基因(包括低表达基因)的长程依赖关系,并整合基因本体知识以提升基因功能理解 | scLong是首个在单细胞转录组学中应用自注意力于全部28,000个人类基因的基础模型,能够处理包括低表达和未表达基因在内的长程基因依赖,并整合了基因本体知识以增强上下文理解 | 未明确提及模型的计算资源需求、泛化能力到其他物种或数据类型的限制,以及在实际临床应用中可能面临的挑战 | 开发一个能够捕获单细胞转录组数据中长程基因依赖关系并整合外部知识的基础模型,以提升对细胞异质性、基因调控和疾病响应的分析能力 | 单细胞RNA测序数据,涵盖48百万个细胞和28,000个人类基因 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 基础模型(基于自注意力和图卷积网络) | 基因表达数据 | 48百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5969 | 2026-03-21 |
FLASH-MM: fast and scalable single-cell differential expression analysis using linear mixed-effects models
2026-02-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69063-2
PMID:41644528
|
研究论文 | 本文介绍了一种快速且可扩展的线性混合效应模型估计算法FLASH-MM,用于单细胞RNA测序数据的差异表达分析 | 通过重新设计线性混合模型估计过程,降低了计算复杂度和内存使用,实现了快速且可扩展的差异表达分析 | NA | 解决单细胞差异表达分析中面临的样本相关性、个体变异和可扩展性等挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性混合效应模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5970 | 2026-03-21 |
Indolent primary cutaneous B-cell lymphomas resemble persistent antigen reactions without signs of dedifferentiation
2026-02-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69210-9
PMID:41639106
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析惰性原发性皮肤B细胞淋巴瘤(pcMZL和pcFCL)与侵袭性pcDLBCL-LT的差异,揭示其病理生理基础 | 首次在单细胞水平上比较惰性与侵袭性皮肤B细胞淋巴瘤,并发现惰性淋巴瘤中持续存在的生发中心反应 | 研究中未知抗原的具体身份尚未确定,样本来源可能有限 | 阐明原发性皮肤B细胞淋巴瘤的病理生理机制和分类依据 | 原发性皮肤滤泡中心淋巴瘤(pcFCL)、原发性皮肤边缘区淋巴瘤(pcMZL)、原发性皮肤弥漫大B细胞淋巴瘤腿型(pcDLBCL-LT)、反应性B细胞丰富淋巴增殖(rB-LP)和胃MALT淋巴瘤 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多种淋巴瘤类型样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5971 | 2026-03-21 |
HCMV infection disrupts barrier functions and promotes epithelial-mesenchymal transition in a cholangiocyte organoid model
2026-02-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68962-8
PMID:41634045
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研究论文 | 本研究建立了一个人iPSC来源的胆管样细胞类器官模型,用于探究人巨细胞病毒感染如何破坏胆管上皮屏障功能并促进上皮-间质转化 | 首次利用人iPSC来源的胆管样细胞类器官模型证明HCMV可直接感染胆管上皮,并通过TGF-β信号通路诱导上皮-间质转化 | 研究主要基于体外类器官模型,体内验证仅通过患者组织样本的有限分析,需要进一步在动物模型中验证 | 探究人巨细胞病毒感染对胆管上皮细胞的直接致病机制 | 人iPSC来源的胆管样细胞类器官 | 细胞生物学 | 胆管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 类器官模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量,包括类器官模型和胆道闭锁患者肝组织 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5972 | 2026-03-21 |
Molecular signatures of resilience to Alzheimer's disease in neocortical layer 4 neurons
2026-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68920-4
PMID:41620473
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研究论文 | 本研究通过单核和空间转录组学分析,识别了阿尔茨海默病中具有韧性的神经元亚群及其分子特征 | 首次在阿尔茨海默病中识别出初级视觉皮层第4层中表达RORB、CUX2和EYA4的韧性兴奋性神经元群体,并发现KCNIP4作为关键韧性因子在疾病早期上调 | 研究主要基于男性App小鼠模型,可能未完全反映人类疾病复杂性,且样本来源和数量未在摘要中详细说明 | 探究阿尔茨海默病中神经元韧性的分子基础 | 阿尔茨海默病患者和App小鼠模型中的新皮质神经元 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5973 | 2026-03-21 |
Innate Immune-Cloaked Microgel-Coated Mesenchymal Stromal Cells Reverse Persistent Pulmonary Fibrosis via Reparative Macrophages
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504590
PMID:40984773
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于先天免疫检查点材料的策略,通过微凝胶包被和CD47激动剂功能化的间充质基质细胞,有效逃避免疫清除并逆转肺纤维化损伤 | 结合免疫伪装与凝胶涂层局部信号呈现,设计分泌细胞用于长期组织重塑,实现慢性组织损伤的“活体药房” | NA | 治疗复杂慢性疾病如纤维化,通过逃避免疫清除并调节宿主免疫成分 | 间充质基质细胞、组织驻留巨噬细胞、肺纤维化模型 | 单细胞组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5974 | 2026-01-18 |
Molecular Improvement of IL-23 Inhibition Revealed by Single-Cell RNA Sequencing in Concurrent Psoriasis and Systemic Lupus Erythematosus
2026-Jan, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70209
PMID:41546169
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5975 | 2026-03-21 |
INPP5D/SHIP1-mediated immunometabolic remodeling of renal monocytes in idiopathic membranous nephropathy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755723
PMID:41853261
|
研究论文 | 本研究通过分析公共数据集和动物模型,揭示了INPP5D/SHIP1介导的肾脏单核细胞免疫代谢重编程在特发性膜性肾病中的作用 | 首次在IMN中系统描绘了以INPP5D/SHIP1为中心的肾脏单核细胞免疫代谢程序,并发现其通过SPP1介导的单核细胞-足细胞通讯参与疾病进程 | 主要依赖公共数据集和动物模型进行验证,缺乏来自IMN患者的前瞻性队列数据以直接证实临床相关性 | 阐明特发性膜性肾病中先天免疫细胞的免疫代谢调控机制及其与足细胞的病理交互作用 | 人类IMN肾脏转录组数据、被动Heymann肾炎大鼠模型、肾脏单核细胞与足细胞 | 计算生物学与免疫代谢研究 | 肾脏疾病(特发性膜性肾病) | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 生物信息学去卷积分析(CIBERSORT, ESTIMATE), 轨迹重建, 配体-受体互作推断 | NA | 转录组测序数据(bulk和单细胞)、组织病理学数据、蛋白质表达数据 | 来自公共数据库的人类IMN与对照肾脏转录组数据集、被动Heymann肾炎大鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5976 | 2026-03-21 |
Distinct landscapes of T-cell immunity and TCR repertoire between sepsis and pre-septic high-risk states
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1754842
PMID:41853277
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和单细胞T细胞受体测序技术,比较了尿源性脓毒症高风险患者与脓毒症患者的T细胞免疫状态和TCR库特征 | 首次在单细胞水平上系统比较了脓毒症高风险状态与确诊脓毒症患者的T细胞免疫图谱和TCR库差异,并发现了一个独特的CD4 T细胞亚群及其潜在调控靶点 | 研究样本量有限,且主要聚焦于尿源性脓毒症,结论在其他类型脓毒症中的普适性有待验证 | 探究脓毒症及其高风险状态下T细胞免疫应答和T细胞受体库的动态变化 | 尿源性脓毒症高风险患者和确诊脓毒症患者的外周血T细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及高风险患者和脓毒症患者 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 5977 | 2026-03-21 |
Sex-associated transcriptional changes to synovial macrophages in the aging joint
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1724385
PMID:41853281
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了年轻与老年雄性和雌性小鼠关节滑膜巨噬细胞的转录异质性,揭示了年龄和性别对巨噬细胞功能的影响 | 首次在关节滑膜巨噬细胞中系统比较了年龄和性别因素对转录谱的影响,并识别了五个主要亚群及其在衰老过程中的变化 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;样本量相对有限,且未深入探讨功能验证 | 探究年龄和性别如何影响关节滑膜巨噬细胞的转录异质性及其在关节炎等年龄相关疾病中的作用 | 雄性和雌性小鼠的关节滑膜巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序与细胞表面蛋白检测(CITE-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻与老年雄性和雌性小鼠的关节滑膜巨噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5978 | 2026-03-21 |
A single-cell immune atlas of primary and secondary lymphoid organs in pigs
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1704257
PMID:41859083
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研究论文 | 本研究应用单细胞RNA测序技术构建了猪主要和次级淋巴器官的免疫细胞图谱 | 首次创建了涵盖猪骨髓、胸腺、淋巴结和脾脏等多个关键免疫组织的单细胞免疫图谱,并识别出新的胸腺细胞群体,揭示了猪与人类在免疫细胞特征上的保守性 | 研究仅针对健康猪的特定淋巴器官,未涵盖所有免疫组织或疾病状态,且功能验证实验有限 | 建立猪淋巴器官的单细胞免疫图谱,以促进猪作为生物医学模型和农业食品源的相关研究 | 猪的初级淋巴器官(骨髓、胸腺)和次级淋巴器官(淋巴结、脾脏)中的免疫细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涵盖多个淋巴器官组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5979 | 2026-03-21 |
Integrated spatial transcriptomics and single-cell RNA sequencing reveal Lars2-mediated spatiotemporal dynamics of myocardial remodeling in a mouse model of transverse aortic constriction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1701776
PMID:41859105
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示了压力超负荷诱导的心肌肥大小鼠模型中Lars2介导的心肌重塑时空动态 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,在细胞和空间分辨率上全面表征了TAC小鼠模型中心肌重塑的时空动态,并识别出Lars2等关键基因 | 研究基于小鼠模型,结果向人类疾病的直接转化需进一步验证;样本量相对有限,可能影响统计效力 | 探究压力超负荷诱导的心肌肥大小鼠模型中,心肌重塑的时空动态和细胞特异性转录组特征 | 横向主动脉缩窄(TAC)小鼠模型的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | TAC小鼠模型在不同疾病进展阶段(TAC-2w、TAC-4w、TAC-6w)的心脏组织样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5980 | 2026-03-21 |
Macrophage-Derived Transcriptional Signatures Predict Prognosis and Drug Sensitivity in Thyroid Cancer: Integrative Analysis and Experimental Validation of SMYD3
2026, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S565624
PMID:41859299
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq分析识别甲状腺癌中肿瘤富集的巨噬细胞亚群,并利用机器学习模型构建预后风险分层模型,同时通过实验验证SMYD3在肿瘤进展和药物敏感性中的作用 | 首次整合单细胞RNA-seq、hdWGCNA和多种机器学习算法,识别甲状腺癌中与预后相关的肿瘤富集巨噬细胞亚群,并构建稳健的风险分层模型,同时通过体外实验验证SMYD3作为潜在生物标志物在肿瘤进展和药物敏感性中的调控作用 | 研究主要基于公共数据集(如TCGA和GDSC2)和体外实验,缺乏大规模临床队列验证和体内动物模型实验,可能限制结果的普适性和转化应用 | 探究巨噬细胞异质性在甲状腺癌中的预后意义,并开发基于机器学习的风险分层模型以预测患者预后和药物敏感性 | 甲状腺癌患者样本、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、SMYD3基因 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA-seq, hdWGCNA, 机器学习算法组合, Kaplan-Meier分析, 体外功能实验 | 机器学习模型(具体算法未指定) | 单细胞RNA-seq数据, 基因组数据, 临床数据 | 未明确指定样本数量,但使用了TCGA和GDSC2公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |