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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5941 2025-12-25
Neutrophil-mediated immune dysregulation in recurrent miscarriage: implications of APP-CD74 signaling and CXCL1 as diagnostic biomarkers
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合转录组数据和单细胞RNA测序,揭示了中性粒细胞在复发性流产中的免疫失调作用,并识别了APP-CD74信号轴和CXCL1作为潜在诊断生物标志物 首次深入探索中性粒细胞在复发性流产中的先天免疫角色,并识别了TNF-α驱动的极化表型及APP-CD74信号轴作为关键通路 研究主要基于转录组和单细胞数据,实验验证主要在滋养层细胞中进行,缺乏体内模型验证 探究复发性流产中中性粒细胞介导的免疫失调机制,并寻找诊断生物标志物 复发性流产患者、自身免疫疾病数据、蜕膜组织单细胞数据、滋养层细胞 数字病理学 复发性流产 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5942 2025-12-25
Histone-related gene WDR77 promotes tumor progression through cell cycle regulation in skin cutaneous melanoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,识别了组蛋白相关基因WDR77作为皮肤黑色素瘤的关键预后生物标志物和功能调节因子 首次整合10种机器学习算法构建了101个预后模型,并识别出WDR77作为皮肤黑色素瘤中与细胞周期失调相关的关键组蛋白修饰基因 研究主要基于生物信息学分析,体外实验验证有限,缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 探索组蛋白相关基因在皮肤黑色素瘤中的预后价值和功能机制 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者样本和细胞系 机器学习 皮肤黑色素瘤 转录组测序,单细胞转录组学,空间转录组学 随机森林,多种机器学习算法集成 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 TCGA-SKCM数据集和五个GEO数据集中的样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
5943 2025-12-25
Integration of single-cell and bulk RNA-seq via machine learning to reveal ferroptosis- and lipid metabolism-driven immune landscape heterogeneity and predict immunotherapy response in colon cancer
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据,利用机器学习揭示了结肠癌中铁死亡和脂质代谢驱动的免疫景观异质性,并预测了免疫治疗反应 首次整合单细胞和批量RNA-seq数据,结合铁死亡和脂质代谢相关基因,通过多种机器学习算法构建预后模型,并预测免疫治疗反应 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型在临床中的实际应用效果 探索结肠癌中铁死亡与脂质代谢的相互作用,建立预后模型以阐明免疫微环境异质性,并评估免疫治疗前景 结肠癌患者 机器学习 结肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化 支持向量机, 随机森林, 极端梯度提升, LASSO回归 转录组测序数据, 单细胞转录组数据 来自TCGA和GEO数据库的转录组和单细胞数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
5944 2025-12-25
Identification of a ubiquitin-binding domain protein, CD2AP, in predicting the prognosis and treatment of lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学数据分析与实验验证,识别出CD2AP作为肺腺癌的关键预后生物标志物和潜在治疗靶点 首次系统性地将CD2AP鉴定为肺腺癌中与泛素化相关的关键致癌蛋白,并揭示了其通过调节肿瘤细胞与单核/巨噬细胞间通讯影响肿瘤进展的新机制 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,缺乏大规模临床队列验证和体内动物模型实验 识别肺腺癌中关键的泛素化相关调控因子并探究其临床意义 肺腺癌组织样本、A549细胞系 生物信息学 肺癌 转录组测序、蛋白质组学、单细胞RNA测序、qPCR、Western Blot、免疫荧光 分子对接模型 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞测序数据 TCGA和GEO数据库的肺腺癌样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5945 2025-12-25
Advancing breast cancer biomarkers: a centromere-related gene signature integrated with single-cell analysis for prognostic prediction
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合多组学数据,首次建立了一个基于着丝粒蛋白(CENP)的乳腺癌预后模型,用于风险分层并识别新的生物标志物和潜在治疗靶点 首次建立基于CENP家族的乳腺癌预后模型,结合单细胞RNA测序分析揭示了CENPA高表达亚群与增殖性肿瘤细胞及免疫抑制微环境的关联 NA 开发一个基于着丝粒相关基因特征的预后预测模型,以改善乳腺癌(特别是三阴性乳腺癌)的分子分层和个性化治疗 乳腺癌患者,重点关注三阴性乳腺癌亚型 数字病理学 乳腺癌 RNA转录组分析,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,Cox回归,LASSO算法 预后风险模型(基于Cox回归和LASSO) RNA转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5946 2025-12-25
SULF1's Role in Endothelial Senescence and Atherosclerosis: Insights from Single-Cell and Bulk Transcriptomics
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞和批量转录组学分析,揭示了SULF1在动脉粥样硬化内皮细胞衰老中的关键作用 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,首次在动脉粥样硬化背景下识别出SULF1作为内皮细胞衰老的关键基因,并通过体内外实验验证其功能 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类样本验证有限,且未深入探讨SULF1的具体作用机制 探究动脉粥样硬化中内皮细胞衰老的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 动脉粥样硬化斑块组织、ApoE-/-小鼠、人主动脉内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA敲低, Western印迹, RT-qPCR, β-半乳糖苷酶染色 NA 转录组数据, 图像数据 动脉粥样硬化斑块及邻近正常组织的单细胞RNA测序数据、早期和晚期斑块的批量RNA测序数据、ApoE-/-小鼠模型、ox-LDL处理的人主动脉内皮细胞 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
5947 2025-12-25
Single-cell analysis reveals XCL1+ CD8+ T cells as a therapeutic target in hepatocellular carcinoma
2025, Molecular & cellular oncology IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了XCL1+ CD8+ T细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的存在及其作为免疫治疗新靶点的潜力 首次在肝细胞癌中系统鉴定并表征了XCL1+ CD8+ T细胞亚群,揭示了其与良好预后的相关性及通过CD99/MIF通路与NK细胞/髓系细胞的互作机制 研究主要基于已有测序数据集的分析,需要进一步实验验证XCL1+ CD8+ T细胞的具体功能机制 探究肝细胞癌肿瘤微环境中CD8+ T细胞亚群的异质性及其免疫治疗意义 肝细胞癌患者的肿瘤微环境免疫细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 多重免疫组化, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据, 临床数据 多个独立数据集(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
5948 2025-12-25
BRAP Promotes the Tumorigenesis of Hepatocellular Carcinoma by Corrupting Cancer Cell Cycle Regulation and Enhancing Immune Evasion
2025, Journal of hepatocellular carcinoma IF:4.2Q2
研究论文 本研究揭示了BRAP通过促进细胞增殖和塑造免疫抑制微环境来驱动肝细胞癌进展的机制 首次系统阐明了BRAP在HCC肿瘤发生和免疫重塑中的双重作用机制,并提出了其作为新型预后标志物和免疫治疗靶点的潜力 研究主要基于体外和动物模型,临床验证仍需进一步开展;免疫微环境调控机制有待更深入探索 探究BRAP在肝细胞癌肿瘤发生和免疫微环境重塑中的具体作用机制 肝细胞癌组织、HCC细胞系、临床患者样本、CDX动物模型 癌症生物学 肝细胞癌 RNA-seq, scRNA-seq, 流式细胞术, Western blotting, mfIHC, qRT-PCR CDX模型 基因表达数据、单细胞测序数据、临床病理数据、蛋白质印迹数据 临床HCC组织样本、TCGA和ICGC公共数据集、GEO单细胞测序数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
5949 2025-12-25
Taurine-Modified Gossypol Exerts Dual Anti-Hepatocellular Carcinoma Effects by Inactivating PI3K/AKT Pathway and Targeting FASN-Mediated Lipid Metabolism in Regulatory T Cells
2025, Journal of hepatocellular carcinoma IF:4.2Q2
研究论文 本研究探讨了牛磺酸修饰的棉酚(GT)通过双重机制抑制肝细胞癌(HCC)的抗肿瘤效果 首次揭示了GT通过结合并抑制脂肪酸合成酶(FASN)来破坏调节性T细胞(Tregs)的脂质代谢,从而重塑肿瘤免疫微环境,同时直接抑制肿瘤细胞增殖 研究主要基于体外细胞系和患者来源的类器官模型,缺乏体内动物模型的验证,且临床相关性仅通过TCGA数据分析,未进行前瞻性临床试验 探究GT的抗肝细胞癌疗效及其作用机制 肝细胞癌细胞系(HepG2)、患者来源的HCC类器官、调节性T细胞(Tregs) 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多参数流式细胞术、分子对接、表面等离子体共振(SPR)、Western印迹 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 HepG2细胞系、患者来源的HCC类器官、TCGA数据库中的HCC患者数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5950 2025-12-24
Extracellular Vesicle-Packaged MIR4435-2HG Facilitates Cigarette Smoke-Induced Bladder Cancer Progression through Enolase 1-Dependent Glycolytic Reprogramming
2025-Dec-23, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本研究揭示了吸烟相关细胞外囊泡包装的lncRNA MIR4435-2HG通过促进糖酵解重编程驱动膀胱癌进展的机制 首次发现M2巨噬细胞在吸烟致癌物4-ABP刺激下分泌EV包装的MIR4435-2HG,通过ac4C修饰稳定ENO1和海绵miR-143-3p双重机制促进糖酵解 机制研究主要基于体外实验,临床样本验证需扩大队列;动物模型数据未在摘要中体现 阐明吸烟促进膀胱癌进展的分子机制 膀胱癌患者尿液/血浆样本、M2巨噬细胞、肿瘤细胞 肿瘤生物学 膀胱癌 RNA测序、组织芯片、单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9、Seahorse能量代谢分析、ac4C乙酰化实验 NA RNA测序数据、单细胞转录组数据、临床样本数据 有吸烟史的膀胱癌患者尿液和血浆样本(具体数量未说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5951 2025-12-24
CCR5 expression defines the functional heterogeneity of tumor-infiltrating CD8+ T cells and predicts enhanced antitumor immunity and favorable prognosis in non-small cell lung cancer
2025-Dec-23, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了CCR5+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤功能及其作为预后生物标志物的潜力 首次系统验证了CCR5+CD8+ T细胞作为功能异质性亚群在非小细胞肺癌中的抗肿瘤作用及独立预后价值 研究样本量相对有限,且主要基于回顾性队列分析,需要前瞻性研究进一步验证 探究CCR5+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌肿瘤微环境中的功能异质性及其临床意义 非小细胞肺癌患者肿瘤组织中的CD8+ T细胞 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序,转录组分析,多重免疫荧光染色,体外共培养杀伤实验 NA 转录组数据,单细胞RNA测序数据,组织图像数据 TCGA和GEO队列的批量转录组数据,15例非小细胞肺癌患者的单细胞RNA测序样本 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
5952 2025-12-24
CKAP5: Unraveling Its Crucial Function in Liver Hepatocellular Carcinoma Progression and Prognosis
2025-Dec-23, Digestive diseases and sciences IF:2.5Q2
研究论文 本研究通过多组学数据分析及功能验证,揭示了CKAP5在肝细胞癌进展及肿瘤免疫微环境中的关键作用 首次系统性地将CKAP5与肝细胞癌的肿瘤免疫微环境及免疫检查点分子关联,并通过CRISPR-Cas9功能实验验证其促癌功能 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,缺乏体内动物模型验证及临床样本的功能机制深入探索 探究CKAP5在肝细胞癌中的表达模式、临床意义、免疫微环境调控作用及分子机制 肝细胞癌患者样本数据及HepG2肝癌细胞系 生物信息学与肿瘤生物学 肝细胞癌 多组学数据分析、单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因敲除、细胞功能实验 Cox回归模型、Kaplan-Meier生存分析、ROC曲线分析 mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 基于TCGA、GEO等公共数据库的肝细胞癌样本,未明确具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5953 2025-12-24
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular heterogeneity and prognostic subtypes in colorectal cancer
2025-Dec-22, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了结直肠癌的细胞异质性,并整合批量RNA-seq数据识别了预后亚型 结合单细胞和批量转录组数据,首次系统描绘结直肠癌肿瘤微环境的细胞组成和轨迹,并基于此定义了新的预后分子亚型 需要进一步的功能验证来充分理解这些发现的临床意义 探索结直肠癌的细胞组成和肿瘤异质性,识别预后标志物 结直肠癌样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA RNA-seq数据 17个CRC样本用于scRNA-seq, 566个CRC样本用于批量RNA-seq NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
5954 2025-12-24
Differential Gene Expression Across Species Following Spinal Cord Injury: A Systematic Review and Meta-Analysis
2025-Dec-20, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
系统综述与荟萃分析 本文通过系统综述和荟萃分析,比较了不同物种在脊髓损伤后基因表达的差异,旨在揭示影响神经再生能力的分子机制 首次跨物种整合基因组范围的脊髓基因表达数据,通过荟萃分析识别了再生与非再生物种间共享的差异表达基因,并利用蛋白互作网络分析鉴定了关键枢纽基因 纳入研究的异质性较高,物种和损伤模型多样,且部分研究样本量较小,可能影响结果的普适性 探究脊髓损伤后不同物种的基因表达差异,以理解神经再生的分子基础 多物种的脊髓组织,包括再生能力强的非哺乳动物(如硬骨鱼、蝾螈)和再生能力有限的哺乳动物(如大鼠、小鼠) 生物信息学 脊髓损伤 微阵列,RNA测序,单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA 基因表达数据 来自42项研究的多个物种样本,其中约43%使用褐家鼠 NA 微阵列,bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,单核RNA-seq NA NA
5955 2025-12-24
Infusible Extracellular Matrix Biomaterial Enhances Cell-Specific Pro-Repair Responses Following Acute Myocardial Infarction
2025-Dec-18, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
研究论文 本研究开发了一种可血管内注射的脱细胞细胞外基质生物材料(iECM),并通过单细胞核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了其在急性心肌梗死后促进心脏修复的细胞与分子机制 首次利用单细胞核RNA测序技术,在急性时间点(1、3、7天)系统解析了iECM介导心脏修复过程中不同细胞类型的促修复反应,并通过空间转录组学验证了发现 研究依赖于动物模型,其结论向人类临床转化的有效性仍需进一步验证;研究时间点仅限于急性期(7天内),长期效应未知 探究可血管内注射的脱细胞细胞外基质生物材料(iECM)在急性心肌梗死后促进心脏修复的细胞与分子机制 急性心肌梗死模型中的心脏组织与细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞核RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞核RNA测序数据,空间转录组学数据 在急性心肌梗死后1、3、7天多个时间点采集的样本 NA 单细胞核RNA测序,空间转录组学 NA NA
5956 2025-12-24
HLA-DQB1*03:01 strongly affects age of onset of type 1 narcolepsy independently of DQA1 and ethnicity
2025-Dec-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过跨种族全基因组关联分析,首次发现HLA-DQB1*03:01是独立于DQA1和种族、显著影响1型发作性睡病发病年龄的主要遗传因素 首次进行跨种族GWAS研究,明确HLA-DQB1*03:01对发病年龄的独立影响,并发现其通过改变T细胞受体库发挥作用 未直接鉴定出致病的T细胞,病理生理机制的具体联系尚待进一步阐明 探究1型发作性睡病发病年龄的遗传决定因素 1型发作性睡病患者 遗传学 发作性睡病 全基因组关联研究(GWAS)、RNA测序 NA 基因组数据、RNA测序数据 5,339例来自中国、欧洲、韩国、日本和美国的病例 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
5957 2025-12-24
[Analyzing the impact of chemotherapy on cellular heterogeneity and identifying potential therapeutic targets in breast cancer patients via single-cell RNA sequencing]
2025-Dec-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了一名乳腺癌患者化疗前后肿瘤组织的细胞异质性,旨在描绘细胞进化轨迹并识别潜在的治疗靶点 在单细胞分辨率下,对同一患者化疗前后的肿瘤微环境进行纵向比较,描绘了细胞组成和发育轨迹的动态变化,并预测了APOD、ELN和F2R等基因在疾病进展中的关键作用 研究仅基于单一样本(一名患者),样本量小,限制了结果的普遍性和统计效力 分析化疗对乳腺癌肿瘤细胞异质性的影响,并识别潜在的治疗干预靶点 一名乳腺癌女性患者的化疗前活检组织和化疗后手术切除组织 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 1名患者,2个时间点(化疗前和化疗后)的肿瘤组织样本,共分析了8,599个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5958 2025-12-24
[Single-cell transcriptomic analysis of the impact of circadian rhythm disruption on immune function in zebrafish]
2025-Dec-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序,揭示了昼夜节律紊乱对斑马鱼免疫系统结构和功能的影响 首次在单细胞水平上系统解析了昼夜节律紊乱如何重塑斑马鱼免疫细胞组成、比例变化及发育轨迹,并识别了关键的免疫激活标记基因变化 研究基于斑马鱼幼虫模型,结果向高等脊椎动物或人类的直接外推需谨慎;且仅分析了短期(三天)恒定光照干扰,未探讨长期或不同模式节律紊乱的影响 探究昼夜节律紊乱在单细胞水平上调控免疫系统结构与功能的精确机制 斑马鱼幼虫的免疫细胞 单细胞转录组学 睡眠相关疾病 单细胞RNA测序 UMAP聚类、Monocle伪时间轨迹分析 单细胞转录组数据 对照组与昼夜节律紊乱组斑马鱼幼虫的免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5959 2025-12-24
DAP12 deletion reduces neuronal SLIT2 and demyelination and enhances brain resilience in female tauopathy mice
2025-Dec-02, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
研究论文 本研究探讨了在小鼠tau蛋白病模型中,删除DAP12基因如何通过影响神经元SLIT2信号和髓鞘形成,增强大脑对tau病理的耐受性 首次揭示了DAP12缺失通过抑制兴奋性神经元中SLIT2的上调,减轻tau蛋白病中的脱髓鞘,从而增强大脑耐受性的新机制 研究主要基于转基因小鼠模型,在人类中的直接相关性仍需进一步验证;性别差异的机制尚不完全清楚 探究DAP12在tau蛋白病中介导大脑耐受性的分子机制,为阿尔茨海默病提供新的治疗策略 携带人类Tau P301S突变的转基因小鼠模型,以及人类阿尔茨海默病脑组织 神经科学,单细胞组学 阿尔茨海默病,tau蛋白病 单核RNA测序,空间转录组学,细胞通讯分析 转基因小鼠模型 单细胞转录组数据,空间转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及转基因小鼠和人类脑组织 NA 单核RNA测序,空间转录组学 NA NA
5960 2025-12-24
Identification and validation of tricarboxylic acid cycle-related diagnostic biomarkers for diabetic nephropathy via weighted gene co-expression network analysis and single-cell transcriptome analysis
2025-Dec, Acta diabetologica IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过加权基因共表达网络分析和单细胞转录组分析,识别并验证了与三羧酸循环相关的糖尿病肾病诊断生物标志物 首次结合单细胞转录组数据和机器学习方法,从三羧酸循环相关基因中筛选出HPGD和G6PC作为糖尿病肾病的新型诊断标志物 研究主要基于公开数据集,缺乏独立的前瞻性临床队列验证 开发糖尿病肾病的早期诊断生物标志物 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本 生物信息学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),加权基因共表达网络分析(WGCNA),单样本基因集富集分析(ssGSEA) 机器学习模型(未指定具体类型) 基因表达数据 基于GSE131882和GSE30122数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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