单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5901 - 5920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5901 | 2025-10-06 |
Clofarabine Enhances the Transduction Efficiency of Recombinant AAV2 in the Retina
2025-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.42
PMID:40434346
|
研究论文 | 本研究探讨了核糖核苷酸还原酶抑制剂氯法拉滨如何安全增强重组腺相关病毒血清型2在视网膜中的转导效率 | 首次发现氯法拉滨通过诱导S期阻滞和重编程转录景观的双重机制增强rAAV2转导效率 | 研究仅限于小鼠模型和ARPE-19细胞系，尚未在人类临床试验中验证 | 开发提高眼部基因治疗中rAAV2转导效率的辅助策略 | 小鼠视网膜和ARPE-19人视网膜色素上皮细胞 | 基因治疗 | 眼科疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞活力数据 | 细胞系和动物模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5902 | 2025-10-06 |
Recent Advances in Stem Cells of Corneal Epithelia
2025-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.45
PMID:40440164
|
综述 | 本文综述了角膜上皮干细胞研究的最新进展，包括其定位、群体维持机制和异质性特征 | 整合了角膜上皮谱系追踪、活体成像和单细胞RNA测序等最新技术发现，揭示了角膜上皮干细胞的新特性 | 当前研究存在局限性，领域内仍有亟待解决的关键问题 | 阐明角膜上皮干细胞的基本特性及其在再生医学中的应用潜力 | 角膜上皮干细胞 | 再生医学 | 角膜疾病 | 谱系追踪, 活体成像, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5903 | 2025-10-06 |
Multi-Omic Insight Into the Molecular Networks in the Pathogenesis of Coronary Artery Disease
2025-Apr, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.037203
PMID:40135555
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据识别与冠状动脉疾病风险相关的关键基因 | 首次通过整合基因甲基化、表达和蛋白质水平的多组学数据，结合孟德尔随机化和共定位分析，识别出TAGLN2等与CAD风险相关的关键基因 | 潜在因果基因仍未完全识别，缺乏因果治疗验证 | 探索冠状动脉疾病的分子网络发病机制 | 冠状动脉疾病相关基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析 | NA | 基因组数据, 甲基化数据, 表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5904 | 2025-10-06 |
BubR1 Controls Heart Development by Promoting Expression of Cardiogenesis Regulators
2025-Mar-18, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.038286
PMID:40055864
|
研究论文 | 本研究通过心脏特异性敲除BubR1基因，揭示了其在心脏发育中的关键调控作用 | 首次发现BubR1通过调控关键心脏发育基因表达和Wnt信号通路来确保心脏形态发生的正常时序 | 研究仅限于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究BubR1基因突变导致先天性心脏缺陷的分子机制 | 小鼠胚胎心脏发育过程 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序，轨迹分析，CellChat信号通路分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 条件性基因敲除小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5905 | 2025-10-06 |
Pharmacological activation of STAT1-GSDME pyroptotic circuitry reinforces epigenetic immunotherapy for hepatocellular carcinoma
2025-Mar-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332281
PMID:39486886
|
研究论文 | 本研究通过药理学激活STAT1-GSDME焦亡回路，开发了一种针对肝细胞癌的表观遗传免疫治疗新策略 | 首次揭示了选择性I类HDAC抑制剂CXD101通过STAT1-GSDME焦亡回路增强免疫检查点阻断治疗的机制 | 研究主要基于临床前模型，临床转化效果需进一步验证 | 开发克服肝细胞癌免疫检查点阻断耐药的新型联合疗法 | 肝细胞癌患者和ICB耐药原位及自发模型 | 表观遗传学与免疫治疗 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 免疫表型数据 | 来自pembrolizumab试验的肝细胞癌患者队列和4种ICB耐药模型 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5906 | 2025-10-06 |
Deep learning in single-cell and spatial transcriptomics data analysis: advances and challenges from a data science perspective
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf136
PMID:40185158
|
综述 | 系统回顾深度学习在单细胞和空间转录组数据分析中的进展与挑战 | 从数据科学角度系统评估58种计算方法在21个基准数据集上的性能表现，揭示模型性能在不同数据集和评估指标间的显著差异 | 高质量标注数据集仍然有限，生物组织复杂相关性使得准确重建细胞状态和空间背景存在困难 | 探讨深度学习在单细胞和空间转录组数据分析中的应用前景和发展方向 | 单细胞测序数据和空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序，空间转录组 | 深度学习 | 基因表达数据，表观遗传修饰数据，代谢物水平数据，空间位置数据 | 21个数据集来自9个基准测试 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组 | NA | NA |
| 5907 | 2025-10-06 |
JARID1D-dependent androgen receptor and JunD signaling activation of osteoclast differentiation inhibits prostate cancer bone metastasis through demethylating H3K4
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.104135
PMID:39816691
|
研究论文 | 本研究揭示了JARID1D通过去甲基化H3K4调控雄激素受体和JunD信号通路，抑制前列腺癌骨转移的分子机制 | 首次发现JARID1D通过H3K4me3去甲基化活性动态调控AR表达，并阐明其通过MAOA-RANKL信号轴影响破骨细胞分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索前列腺癌骨转移的表观遗传调控机制 | 前列腺癌细胞和破骨细胞 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 染色质免疫沉淀, 免疫荧光, 蛋白质印迹, 单细胞测序, 骨培养系统 | NA | 分子生物学数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5908 | 2025-10-06 |
Study on DNA Damage Gene in Spermatogonial Stem Cells from Idiopathic Nonobstructive Azoospermia: A Bioinformatics Investigation Based on scRNA-seq Data
2025, Cytogenetic and genome research
IF:1.7Q3
DOI:10.1159/000545275
PMID:40101697
|
研究论文 | 基于scRNA-seq数据通过生物信息学方法研究特发性非梗阻性无精子症中精原干细胞DNA损伤基因 | 首次结合单细胞RNA测序和生物信息学分析揭示ATRX、DOT1L和RUVBL2作为精原干细胞DNA损伤修复的关键诊断基因 | 研究结果为预测性机制，需要进一步实验验证预测的机制、通路和治疗靶点 | 探索DNA损伤与男性不育的机制关系 | 特发性非梗阻性无精子症患者和正常人的睾丸组织 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | WGCNA, LASSO回归, MNC计算算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5909 | 2025-10-06 |
Bulk and single-cell RNA-sequencing analyses revealed potential key genes and the role of CCL19/CCL21-CCR7 axis in hidradenitis suppurativa
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322565
PMID:40455785
|
研究论文 | 通过批量与单细胞RNA测序分析揭示化脓性汗腺炎中潜在关键基因及CCL19/CCL21-CCR7轴的作用机制 | 整合三种机器学习方法识别出AKR1B10等五个枢纽基因，首次系统阐明CCL19/CCL21-CCR7轴在招募免疫细胞中的关键作用 | 未明确说明样本规模及独立验证数据集的具体特征 | 解析化脓性汗腺炎的分子免疫机制并探索治疗靶点 | 化脓性汗腺炎病变组织及外周血样本 | 生物信息学 | 皮肤炎症性疾病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 集成机器学习方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5910 | 2025-10-06 |
Targeting myeloid cells in pancreatic ductal adenocarcinoma: from primary tumors to liver metastasis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1555036
PMID:40458409
|
综述 | 探讨胰腺导管腺癌中髓系细胞在不同疾病阶段的作用及靶向治疗策略 | 系统比较原发肿瘤与转移灶（特别是肝转移）中免疫微环境的差异，聚焦髓系细胞的免疫抑制机制 | NA | 分析PDAC中髓系细胞的免疫抑制作用及靶向治疗前景 | 胰腺导管腺癌的原发肿瘤、转移前微环境和转移灶 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5911 | 2025-10-06 |
CX3CR1+ Monocytes/Macrophages Promote Regional Immune Injury in Mesangial Proliferative Glomerulonephritis through Crosstalk with Activated Mesangial Cells
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0716
PMID:40458609
|
研究论文 | 本研究揭示了CX3CR1+单核细胞/巨噬细胞通过与活化系膜细胞相互作用促进MsPGN区域免疫损伤的机制 | 首次发现CX3CL1-CX3CR1轴在MsPGN区域免疫损伤中的关键作用，并验证CX3CL1单克隆抗体quetmolimab的治疗潜力 | 部分分子机制细节仍需进一步阐明，动物模型与人类疾病的差异需谨慎评估 | 探究系膜增生性肾小球肾炎区域免疫损伤的分子机制 | IgA肾病临床标本和MsPGN动物模型 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, Luminex多重免疫分析, 分子分析 | 动物模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | 临床标本和动物模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5912 | 2025-10-06 |
CD151 Promotes Cancer Progression in Triple-Negative Breast Cancer by Inducing EMT through the MAPK Signaling Pathway
2025, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S518760
PMID:40458675
|
研究论文 | 本研究探讨CD151通过MAPK信号通路诱导上皮间质转化促进三阴性乳腺癌进展的机制 | 首次揭示CD151与整合素α3β1形成复合物通过MAPK信号通路诱导EMT促进三阴性乳腺癌进展的新机制 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内动物模型验证；临床样本量有限 | 研究CD151在三阴性乳腺癌中的促肿瘤作用及其分子机制 | 三阴性乳腺癌临床样本和细胞系 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 免疫组织化学, Western blotting, RNA干扰, 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀 | NA | 蛋白质表达数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 三阴性乳腺癌临床样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5913 | 2025-10-06 |
Cellular Heterogeneity and IL-17 Pathway Dynamics Reveal Insights into the Transition from Ulcerative Colitis to Colorectal Cancer Through scRNA-Seq Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S505313
PMID:40458692
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示溃疡性结肠炎向结直肠癌转变过程中的细胞异质性和IL-17通路动态 | 首次在共存UC和CACRC病变的患者组织样本中通过scRNA-seq揭示疾病进展过程中的细胞异质性和IL-17信号通路动态 | 仅分析单个患者样本，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 研究溃疡性结肠炎向结直肠癌转变的分子和细胞机制 | UC和CACRC共存患者的正常结肠组织、UC病变组织和CACRC组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 细胞聚类分析, 差异基因表达分析, KEGG通路富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1例患者（包含正常结肠、UC病变和CACRC三种组织类型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5914 | 2025-10-06 |
[Donor T cell exhaustion and immune tolerance after allogeneic hematopoietic cell transplantation]
2025, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.66.339
PMID:40467463
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示钙调磷酸酶抑制剂在异基因造血细胞移植后对供体T细胞耗竭状态的影响机制 | 首次发现钙调磷酸酶抑制剂通过抑制供体T细胞耗竭同时诱导效应样耗竭T细胞，从而影响慢性移植物抗宿主病的发生 | 目前主要基于小鼠模型，人类患者样本验证仍在进行中 | 探究异基因造血细胞移植后慢性移植物抗宿主病的发生机制 | 供体T细胞 | 单细胞测序分析 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠移植模型，正在积累患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5915 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals aberrant skin-resident cell populations and identifies fibroblasts as a determinant in rosacea
2024-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52946-7
PMID:39384741
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示酒渣鼻患者皮肤中异常细胞群，并发现成纤维细胞是疾病发展的关键决定因素 | 首次构建酒渣鼻面部皮肤单细胞图谱，识别出特征性IFNγ介导的角质形成细胞亚群，并证实成纤维细胞是产生促炎和血管舒张信号的主要细胞类型 | 研究仅针对女性患者，样本来源局限于面部皮肤 | 解析酒渣鼻的细胞和分子机制 | 女性酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤样本 | 单细胞组学 | 酒渣鼻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5916 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the pro-inflammatory roles of liver-resident Th1-like cells in primary biliary cholangitis
2024-10-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53104-9
PMID:39375367
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示原发性胆汁性胆管炎中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用 | 首次在PBC患者和鼠类模型中鉴定出具有JAK-STAT通路活化的肝脏驻留Th1样细胞群，并证明阻断该通路可缓解肝脏炎症 | 传统检测方法的局限性导致对PBC局部肝脏免疫发病机制的认识不完整 | 解析原发性胆汁性胆管炎的免疫细胞图谱和分子机制 | 原发性胆汁性胆管炎患者和鼠类PBC模型 | 单细胞组学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PBC患者和鼠类PBC模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5917 | 2025-10-06 |
Distinctive CD39+CD9+ lung interstitial macrophages suppress IL-23/Th17-mediated neutrophilic asthma by inhibiting NETosis
2024-10-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53038-2
PMID:39366998
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD39+CD9+肺间质巨噬细胞亚群可通过抑制NETosis和Th17细胞活化来抑制中性粒细胞性哮喘 | 首次发现CD39+CD9+肺间质巨噬细胞亚群通过CD9依赖性附着和CD39依赖性ATP清除机制抑制NETosis和中性粒细胞炎症 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索抑制中性粒细胞性哮喘的潜在通路和治疗靶点 | 肺间质巨噬细胞、中性粒细胞、Th17细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 哮喘患者样本和小鼠NDA模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5918 | 2024-09-04 |
Hydatidiform mole identification using non-invasive single-cell sequencing of fetal circulating extravillous trophoblasts isolated from maternal blood
2024-09, Ultrasound in obstetrics & gynecology : the official journal of the International Society of Ultrasound in Obstetrics and Gynecology
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/uog.27615
PMID:38354218
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5919 | 2025-10-06 |
CYBB-Mediated Ferroptosis Associated with Immunosuppression in Mycobacterium leprae-Infected Monocyte-Derived Macrophages
2024-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.10.012
PMID:37925067
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示麻风分枝杆菌感染通过CYBB介导的铁死亡促进巨噬细胞M2极化，导致免疫逃逸的机制 | 首次发现CYBB介导的铁死亡在麻风分枝杆菌感染中促进巨噬细胞M2极化的新机制 | 研究样本量较小（4名健康个体），主要在体外实验验证 | 探究麻风分枝杆菌感染巨噬细胞后触发M2极化的分子机制 | 人单核细胞来源的巨噬细胞和麻风分枝杆菌 | 单细胞测序分析 | 麻风病 | 单细胞RNA测序, 多组学数据分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 多组学数据 | 4名健康个体的单核细胞来源巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5920 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveal neuron-astrocyte synergy in long-term memory
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07011-6
PMID:38326616
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学揭示了基底外侧杏仁核在长期记忆形成中神经元与星形胶质细胞的协同作用 | 首次结合单细胞RNA测序和单分子空间转录组学技术，在完整脑切片中绘制了长期记忆痕迹的空间图谱，发现特定神经元亚群与邻近星形胶质细胞的相互作用对长期记忆编码至关重要 | NA | 阐明基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的细胞和分子结构 | 小鼠基底外侧杏仁核的神经元和星形胶质细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |