单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
5901	2024-11-29	Characterizing Fibroblast Heterogeneity in Diabetic Wounds Through Single-Cell RNA-Sequencing 2024-Nov-07, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines12112538 PMID:39595104	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNAseq）在糖尿病伤口愈合研究中的应用，特别是纤维母细胞分析的创新	介绍了单细胞测序技术在纤维母细胞分析中的创新应用，并探讨了其在糖尿病伤口愈合研究中的潜力	主要为综述性文章，未提供新的实验数据或模型	探讨单细胞RNA测序技术在糖尿病伤口愈合研究中的应用，特别是纤维母细胞的异质性	糖尿病伤口中的纤维母细胞及其在伤口愈合中的作用	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	基因表达数据	NA
5902	2024-11-29	From Genomic Exploration to Personalized Treatment: Next-Generation Sequencing in Oncology 2024-Nov-06, Current issues in molecular biology IF:2.8Q3 DOI:10.3390/cimb46110744 PMID:39590338	综述	本文综述了下一代测序（NGS）在肿瘤学中的应用，从基因组探索到个性化治疗	NGS提供了全面的癌症基因组分析，使临床医生和研究人员能够更好地理解癌症的分子基础，并根据基因组改变定制治疗策略	NGS在个性化肿瘤学中的全部潜力需要通过生物信息学分析来实现	探讨NGS技术在个性化肿瘤学中的应用，包括理解肿瘤异质性和识别驱动突变	NGS技术及其在癌症基因组和转录组分析中的应用	数字病理学	NA	下一代测序（NGS）	NA	基因组数据	NA
5903	2024-11-29	Deep Learning and Single-Cell Sequencing Analyses Unveiling Key Molecular Features in the Progression of Carotid Atherosclerotic Plaque 2024-Nov, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70220 PMID:39586797	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析，揭示了颈动脉粥样硬化斑块进展中的关键分子特征	本研究首次识别出在高级斑块中显著增加浸润的单核细胞亚群，并基于此开发了区分早期和高级斑块的机器学习模型	本研究主要基于单细胞RNA测序数据，未来需进一步验证这些发现在临床样本中的适用性	揭示颈动脉粥样硬化斑块进展中的免疫细胞特征和诊断标志物	颈动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞和分子特征	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	卷积神经网络	基因表达数据	未明确提及具体样本数量
5904	2024-11-29	Identification of a Novel Signature Based on Ferritinophagy-Related Genes to Predict Prognosis in Lung Adenocarcinoma: Focus on AHNAK2 2024-Oct-26, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering11111070 PMID:39593730	研究论文	研究构建了一个基于铁蛋白自噬相关基因的预测模型，用于预测肺腺癌的预后，并重点研究了AHNAK2的作用	首次提出基于铁蛋白自噬相关基因的预测模型，并发现AHNAK2在肺腺癌中的新调控作用	研究主要集中在体外实验，需要进一步的体内实验验证	探索铁蛋白自噬相关基因在肺腺癌预后预测中的潜力	肺腺癌患者的预后预测及AHNAK2在肺腺癌中的作用	数字病理学	肺癌	单细胞测序	NA	基因表达数据	三个独立基因表达数据集
5905	2024-11-29	Single‑cell RNA sequencing reveals heterogeneity in ovarian cancer and constructs a prognostic signature for prognostic prediction and immunotherapy 2024-Oct-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112855 PMID:39133955	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示卵巢癌的异质性，并构建了一个用于预测预后和免疫治疗的预后标志物	本研究首次基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了一个包含16个基因的GRG签名，为卵巢癌的预后预测和治疗策略提供了新的视角	NA	识别卵巢癌恶性上皮细胞的异质性，并构建有效的预后标志物以预测预后和免疫治疗	卵巢癌患者及其恶性上皮细胞	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和批量RNA测序 (bulk RNA-seq)	COX回归和最小绝对收缩与选择算子 (LASSO) 回归	RNA数据	NA
5906	2024-11-29	Single-Cell Analysis Reveals the Cellular and Molecular Changes of Liver Injury and Fibrosis in Mice During the Progression of Schistosoma japonicum Infection 2024-Oct-23, Current issues in molecular biology IF:2.8Q3 DOI:10.3390/cimb46110707 PMID:39590301	研究论文	研究使用单细胞RNA测序技术分析了血吸虫感染小鼠肝脏在感染进展过程中的细胞和分子变化	首次提供了血吸虫感染小鼠肝脏在感染进展过程中的全面单细胞转录组图谱，并揭示了关键的细胞和分子事件	NA	阐明血吸虫感染进展过程中的致病机制	血吸虫感染小鼠的肝脏细胞	数字病理学	寄生虫病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	转录组数据	31,847个肝脏细胞
5907	2024-11-29	Cell type-specific gene expression dynamics during human brain maturation 2024-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.09.29.560114 PMID:37808657	研究论文	研究了人类大脑发育过程中基因表达的动态变化，特别是细胞类型特异性的表达模式	使用单核RNA测序（snRNA-seq）和空间转录组学技术，构建了一个包含75种细胞亚型的儿童和成人联合图谱，揭示了大脑成熟过程中基因和通路的变化	NA	探讨人类大脑发育过程中基因表达的动态变化，特别是细胞类型特异性的表达模式	人类大脑的时间叶组织，包括非洲裔样本	数字病理学	NA	单核RNA测序（snRNA-seq），空间转录组学	NA	基因表达数据	包括儿童和成人的时间叶组织样本
5908	2024-11-29	Single-Cell Analysis of Rohon-Beard Neurons Implicates Fgf Signaling in Axon Maintenance and Cell Survival 2024-Apr-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience DOI:10.1523/JNEUROSCI.1600-23.2024 PMID:38423763	研究论文	通过单细胞RNA测序研究斑马鱼幼体阶段的Rohon-Beard感觉神经元，揭示了Fgf信号通路在轴突维持和细胞存活中的作用	首次通过单细胞RNA测序技术定义了斑马鱼幼体Rohon-Beard神经元的三个主要亚型，并发现Fgf信号通路在维持轴突和细胞存活中的关键作用	研究主要集中在斑马鱼模型上，尚未在哺乳动物中验证结果	探讨Rohon-Beard神经元的分子亚型及其在轴突维持和细胞存活中的调控机制	斑马鱼幼体阶段的Rohon-Beard感觉神经元	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	斑马鱼幼体阶段的Rohon-Beard神经元
5909	2024-11-29	JLONMFSC: Clustering scRNA-seq data based on joint learning of non-negative matrix factorization and subspace clustering 2024-02, Methods (San Diego, Calif.) DOI:10.1016/j.ymeth.2023.11.019 PMID:38128706	研究论文	提出了一种基于联合学习非负矩阵分解和子空间聚类的单细胞RNA测序数据聚类方法JLONMFSC	结合了图正则化矩阵分解和低秩表示子空间聚类，以学习局部和全局特征，从而提高聚类性能	未提及	解决单细胞RNA测序数据的高维、稀疏和噪声问题，提高聚类效果	单细胞RNA测序数据	机器学习	NA	非负矩阵分解、子空间聚类	JLONMFSC	单细胞RNA测序数据	六个数据集
5910	2024-11-29	Transcriptional profiling of zebrafish intestines identifies macrophages as host cells for human norovirus infection 2024 Jan-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1 DOI:10.1080/19490976.2024.2431167 PMID:39584740	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究斑马鱼肠道中的转录组，发现巨噬细胞是人诺如病毒的宿主细胞	首次在斑马鱼模型中验证了巨噬细胞是人诺如病毒的宿主细胞，并揭示了病毒在巨噬细胞中的复制机制	研究仅限于斑马鱼模型，尚未在人类中验证	探究人诺如病毒的宿主细胞及其在宿主细胞中的复制机制	斑马鱼肠道中的巨噬细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	斑马鱼幼体肠道样本
5911	2024-11-29	Tumor microenvironment and cancer metastasis: molecular mechanisms and therapeutic implications 2024, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2024.1442888 PMID:39600368	综述	本文综述了肿瘤微环境在癌症发展和转移中的重要作用，重点探讨了分子机制和治疗意义	本文通过多学科视角，强调了理解肿瘤微环境的分子基础对于开发更有效的癌症治疗方案的重要性，并指出了未来研究的方向	NA	探讨肿瘤微环境在癌症转移中的分子机制及其治疗意义	肿瘤微环境中的关键成分，如癌症相关成纤维细胞、免疫细胞、内皮细胞、细胞因子及细胞外基质	NA	癌症	单细胞分析、空间转录组学、表观遗传学分析	NA	NA	NA
5912	2024-11-29	Identification and Validation of Senescence-Related Signature by Combining Single Cell and Bulk Transcriptome Data Analysis to Predict the Prognosis and Identify the Key Gene CAV1 in Pancreatic Cancer 2024, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S489985 PMID:39600676	研究论文	本研究结合单细胞和批量转录组数据分析，识别和验证了与衰老相关的特征，用于预测胰腺癌的预后并鉴定关键基因CAV1	开发了一种新的衰老相关预后工具，用于胰腺癌患者分层，并识别了CAV1作为潜在的治疗靶点	NA	研究细胞衰老在胰腺癌肿瘤微环境中的作用，特别是其对预后和免疫治疗结果的影响	胰腺癌患者的单细胞和批量转录组数据	数字病理学	胰腺癌	单细胞测序、RNA-seq	COX比例风险模型、LASSO回归	基因表达数据	三个患者队列：TCGA队列、PAAD-AU队列和PAAD-CA队列
5913	2024-11-29	Applications of single-cell RNA sequencing in rheumatoid arthritis 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1491318 PMID:39600707	review	本文综述了单细胞RNA测序技术在类风湿性关节炎研究中的应用	单细胞RNA测序技术提供了前所未有的细胞异质性和功能的详细视图，有助于解析细胞和分子机制	该技术仍面临成本较高、低丰度转录本检测灵敏度较低以及数据分析流程相对复杂等挑战	探讨单细胞RNA测序技术在类风湿性关节炎研究中的应用，为创新和更有效的治疗策略铺平道路	类风湿性关节炎的细胞状态和过渡	数字病理学	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
5914	2024-11-29	Causal links of human serum metabolites on the risk of prostate cancer: insights from genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing, and metabolic pathway analysis 2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2024.1443330 PMID:39600951	研究论文	本文通过孟德尔随机化研究探讨了人类血清代谢物与前列腺癌风险之间的因果关系	首次通过孟德尔随机化方法结合单细胞RNA测序和代谢途径分析，揭示了三种血清代谢物与前列腺癌风险的因果关系	研究结果需要进一步的机制研究来阐明这些血清代谢物和代谢途径如何影响前列腺癌的发生和发展	探讨血清代谢物与前列腺癌风险之间的因果关系	血清代谢物与前列腺癌风险	生物信息学	前列腺癌	孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、代谢途径分析	NA	基因组数据、代谢组数据	7824名欧洲人
5915	2024-11-29	Transcriptional diversity and bioenergetic shift in human breast cancer metastasis revealed by single-cell RNA sequencing 2020-03, Nature cell biology IF:17.3Q1 DOI:10.1038/s41556-020-0477-0 PMID:32144411	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和患者来源的异种移植模型，揭示了乳腺癌转移过程中罕见的转移细胞在播种过程中的全局转录组变化	本文建立了识别转移细胞播种过程中全局转录组变化的稳健方法，并发现微转移灶具有一种跨患者来源异种移植模型保守的转录组程序，这与患者的不良生存高度相关	NA	揭示乳腺癌转移过程中罕见的转移细胞在播种过程中的全局转录组变化	乳腺癌转移细胞的转录组变化	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	患者来源的异种移植模型
5916	2024-11-28	Tumor expression of CD83 reduces glioma progression and is associated with reduced immunosuppression 2024-Nov-27, Cancer research communications IF:2.0Q3 DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0281 PMID:39601621	研究论文	研究探讨了CD83在胶质瘤细胞中的表达对肿瘤进展和免疫抑制的影响	首次揭示了CD83在胶质瘤细胞中的表达能够抑制肿瘤生长，并增强细胞毒性T细胞和CD8+ T细胞的活性	研究主要基于小鼠模型和人类样本的生物信息学分析，未来需进一步验证CD83表达在临床免疫治疗中的应用	探究CD83在胶质瘤中的表达对肿瘤进展和免疫抑制的影响	胶质瘤细胞和免疫微环境	数字病理学	脑癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	人类和小鼠的胶质瘤样本
5917	2024-11-27	Droplet-Based Single-Cell 3' mRNA Sequencing of Marburg Virus-Infected Samples 2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-4256-6_27 PMID:39585636	研究论文	描述了一种基于液滴的单细胞3' mRNA测序方法，用于研究马尔堡病毒感染的样本	使用10× Chromium Next GEM单细胞基因组学技术，首次在体内研究马尔堡病毒感染的非人灵长类血液样本	研究在BSL-4实验室进行，操作复杂且需要严格的生物安全措施	揭示病毒与宿主相互作用的转录组复杂性	马尔堡病毒感染的单细胞样本	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	mRNA	非人灵长类血液样本
5918	2024-11-27	FOS+ B cells: Key mediators of immunotherapy resistance in diverse cancer types 2024-Dec-19, Molecular therapy. Oncology DOI:10.1016/j.omton.2024.200895 PMID:39583007	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序数据分析免疫治疗患者，探讨了FOS B细胞在多种癌症类型中作为免疫治疗抵抗关键介质的作用	发现了FOS B细胞与免疫治疗抵抗的关联，并揭示了其潜在机制，为预测治疗反应提供了新的生物标志物	NA	探讨FOS B细胞在免疫治疗抵抗中的作用及其潜在机制	FOS B细胞在多种癌症类型中的作用	NA	多种癌症类型	单细胞RNA测序、空间转录组分析、免疫荧光分析	NA	RNA测序数据	25名免疫治疗患者和1,253例多癌症免疫治疗转录组分析
5919	2024-11-27	Analysis of population heterogeneity in CHO cells by genome-wide DNA methylation analysis and by multi-modal single-cell sequencing 2024-Dec-10, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.10.012 PMID:39488254	研究论文	通过全基因组DNA甲基化分析和多模态单细胞测序分析CHO细胞的群体异质性	首次通过全基因组亚硫酸氢盐测序建立了CHO细胞的单碱基甲基化图谱，并揭示了DNA甲基化模式在CHO进化中的集群现象	研究仅限于CHO细胞系，未涉及其他细胞类型	探讨CHO细胞的非遗传机制，特别是DNA甲基化在细胞异质性中的作用	CHO细胞的DNA甲基化和单细胞测序数据	数字病理学	NA	全基因组亚硫酸氢盐测序和多模态单细胞测序	NA	DNA甲基化数据和单细胞测序数据	8个独立的CHO细胞系和3个独立培养的9833个细胞核
5920	2024-11-27	Neutralization of the autophagy-repressive tissue hormone DBI/ACBP (diazepam binding inhibitor, acyl-CoA binding protein) enhances anticancer immunosurveillance 2024-Dec, Autophagy IF:14.6Q1 DOI:10.1080/15548627.2024.2411854 PMID:39419485	研究论文	研究探讨了组织激素DBI/ACBP对自噬的抑制作用及其在癌症免疫监视中的影响	首次发现DBI/ACBP的中和可以增强抗癌免疫监视，并改善化疗免疫疗法的效果	研究主要基于小鼠实验和临床观察，需要进一步的临床试验验证	探讨DBI/ACBP在癌症发展中的作用及其对免疫疗法的影响	DBI/ACBP、癌症患者、小鼠模型	癌症研究	NA	单细胞RNA测序	NA	基因数据	包括癌症患者和小鼠模型