单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38549 篇文献,本页显示第 5861 - 5880 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5861 2026-01-14
Disruption of Pre-Bötzinger Complex neuropeptidergic tonality controls fear and metabolic response
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文识别了preBötzinger复合体作为协调应激与代谢适应的关键中枢,揭示了PACAP信号在此回路中的调控作用 首次将脑干呼吸节律生成器preBötzinger复合体定义为整合应激、呼吸和代谢的神经肽能脑干-外周回路的关键枢纽 NA 探索连接应激反应与外围代谢调节的中枢神经回路 preBötzinger复合体神经元、棕色脂肪组织和肝脏 神经科学 NA 病毒追踪、全脑c-Fos映射、空间转录组学 NA 神经解剖学数据、转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
5862 2026-01-14
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies a Nucleotide Metabolism-Related Signature Predicting Prognosis and Immunotherapy Response in LUAD
2026-Jan-02, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和机器学习算法,构建了一个核苷酸代谢相关特征(NMRS),用于预测肺腺癌(LUAD)的预后和免疫治疗反应 首次在单细胞水平上系统描绘了肺腺癌中核苷酸代谢的异质性,并构建了一个跨队列稳健的预后和免疫治疗反应预测特征(NMRS),同时通过实验验证了关键基因ENO1的功能 研究主要基于公开的回顾性数据集,需要前瞻性临床队列进一步验证NMRS的预测效能;体外实验仅初步验证了ENO1的功能,缺乏体内模型和机制深入探索 探究肺腺癌中核苷酸代谢的细胞异质性及其对肿瘤进展、免疫微环境和治疗反应的影响,并开发相关的预后和预测标志物 肺腺癌(LUAD)患者肿瘤组织中的细胞,特别是恶性上皮细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),机器学习算法组合 多种机器学习算法组合(共101种组合),inferCNV,Monocle2,CellChat 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 来自独立LUAD患者的公开scRNA-seq数据集,TCGA-LUAD队列和多个GEO队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5863 2026-01-14
CausalGenDiff: Generative causal diffusion bridges scRNA-seq and spatial transcriptomics
2026-Jan, Journal of biomedical informatics IF:4.0Q2
研究论文 提出了一种名为CausalGenDiff的生成因果扩散模型,用于有效整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据 首次将扩散和自回归过程相结合以利用基因间的因果依赖关系,并将原本用于图像生成的因果注意力变换器扩展应用于高维基因表达数据,无需依赖预定义关系即可捕捉基因调控机制 未明确说明模型的计算复杂度或对计算资源的需求,也未讨论模型在更广泛组织类型或疾病状态下的泛化能力 提高单细胞RNA测序和空间转录组学数据整合的性能,以更好地理解空间背景下的基因表达 基因表达数据 计算生物学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 扩散模型,自回归模型,因果注意力变换器,VAE 基因表达数据 10个组织数据集 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
5864 2026-01-14
Optimization of Brain Tissue Preservation for Nucleic Acid Stability
2026 Jan-Feb, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
研究论文 本文通过优化脑组织保存方案,旨在提高空间转录组学研究中核酸稳定性与细胞结构完整性 首次系统比较了不同保存条件对羊脑组织RNA质量和细胞结构的影响,为空间转录组学样本制备提供实证指导 研究基于羊脑模型,尚未在人类样本中验证;冷冻方案仍需改进以达到FFPE组织的细胞结构水平 优化脑组织保存方法以提升空间转录组学研究的样本质量 羊脑组织(n=16)的FFPE和冷冻样本 空间转录组学 NA 空间转录组学、RNA完整性分析、组织形态学分析 NA RNA质量数据、组织切片图像 16个羊脑样本 NA 空间转录组学 NA NA
5865 2026-01-14
Transcriptional Heterogeneity Reveals a Synaptic Gene Program in Developing and Adult Human Oligodendrocyte Precursor Cells
2026-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类胚胎和成年大脑皮层中少突胶质前体细胞(OPCs)的转录异质性,并鉴定出一个表达突触相关基因的新型亚群 首次在人类胚胎大脑皮层中鉴定出一个表达突触发育、突触信号传导和神经调节相关基因的新型少突胶质前体细胞亚群(eSyn-OPCs),并在成年大脑中发现了其转录相似的对应亚群(aSyn-OPCs) 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;样本主要来自孕周12-22周的胚胎组织,成年样本来自公开数据集 揭示人类少突胶质前体细胞在发育过程中的异质性及其在神经元-胶质细胞通讯中的潜在作用 人类胚胎和成年大脑皮层中的少突胶质前体细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学分析 无监督聚类分析 单细胞转录组数据,空间转录组数据,组织学图像 超过2300个纯化的少突胶质前体细胞,来自孕周17的人类大脑皮层;孕周12-22的胚胎组织样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
5866 2026-01-14
KCNV2-Deficient Retinal Organoid Model of Cone Dystrophy-In Vitro Screening for AAV Gene Replacement Therapy
2025-Dec-31, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究建立了KCNV2缺陷的人视网膜类器官模型,用于评估AAV基因替代疗法的载体效力 首次利用患者来源和基因编辑的视网膜类器官作为生理相关模型,在体外评估AAV基因治疗载体的效力,并通过单细胞RNA测序在单细胞分辨率下验证治疗效果 研究为体外模型,仍需动物实验和临床试验进一步验证;类器官模型可能无法完全模拟体内视网膜的复杂微环境 开发用于评估基因治疗载体效力的视网膜疾病模型,并筛选先导治疗候选物 KCNV2基因缺陷的人视网膜类器官 基因治疗 视网膜锥细胞营养不良 单细胞RNA测序,基因编辑,AAV载体构建 视网膜类器官模型 基因表达数据,蛋白质定量数据 来自两个独立来源的视网膜类器官:患者血液来源的iPSCs和对照细胞系的基因编辑产物 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5867 2026-01-14
MFAP5 Activates ITGA5 to Drive Tooth Germ Mineralization Through the MAPK/ERK Pathway: Insights from Single-Cell Transcriptomics
2025-Dec-30, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术构建了小型猪牙胚的高分辨率细胞图谱,揭示了MFAP5通过激活ITGA5并驱动MAPK/ERK通路来调控牙胚矿化的新机制 首次在牙胚发育中识别出MFAP5作为牙源性程序的新调控因子,并阐明其通过MFAP5-ITGA5-ERK/MAPK信号轴以细胞状态特异性方式驱动矿化的机制 研究主要基于体外功能实验和小型猪模型,其在人类牙胚发育中的直接适用性及体内功能验证仍需进一步探索 探究牙胚矿化的分子调控机制 小型猪的牙胚组织 单细胞转录组学 牙科发育与再生 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x单细胞RNA测序平台
5868 2026-01-14
Primordial cardiomyocytes orchestrate myocardial morphogenesis and vascularization but are dispensable for regeneration
2025-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序在成年斑马鱼心脏中发现了一个独特的、表达特定标记物的心肌细胞亚群,并揭示了其在心脏形态发生中的关键作用及其在再生过程中的非必要性 首次在成年斑马鱼心脏中鉴定出一个独特的原始心肌细胞亚群,并明确其在心脏发育(形态发生和血管化)中起关键组织者作用,但在心脏再生中并非必需,揭示了发育与再生程序之间的根本差异 研究主要基于斑马鱼模型,结论在哺乳动物或人类中的普适性尚需验证;原始心肌细胞再生能力有限的分子机制尚未完全阐明 探究脊椎动物心脏中不同心肌细胞亚群在心脏发育和修复中的具体作用 成年斑马鱼心脏中的心肌细胞亚群 发育生物学、心脏再生 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、遗传消融技术 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
5869 2026-01-14
Macrophage-Dendritic Cell-T-Cell Tetrads Orchestrate Antitumor Immunity and Response to Checkpoint Blockade
2025-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文识别了一种由巨噬细胞、cDC1s、CD4 T细胞和CD8 T细胞组成的空间组织多细胞免疫单元,称为“四联体”,它协调抗肿瘤免疫和对检查点阻断的反应 首次发现并定义了“四联体”这一多细胞免疫单元,揭示了其在抗肿瘤免疫和检查点阻断反应中的关键作用,并明确了ICOS-ICOSL通路的重要性 研究主要基于小鼠和人类肿瘤的成像与转录组学数据,可能未涵盖所有肿瘤类型或治疗场景,且临床样本量有限 定义调控有效抗肿瘤免疫的细胞结构,以解释免疫检查点抑制剂仅对部分患者有效的机制 小鼠和人类肿瘤中的免疫细胞,包括巨噬细胞、cDC1s、CD4 T细胞和CD8 T细胞 数字病理学 膀胱癌 多重成像和空间转录组学 NA 图像和转录组数据 小鼠和人类肿瘤样本,具体数量未明确 NA 空间转录组学 NA NA
5870 2026-01-14
Multi-Omics Integration Identifies TNFRSF1A as a Causal Mediator of Immune Microenvironment Reprogramming in Diabetic Kidney Disease
2025-Dec-26, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过多组学整合方法,揭示了TNFRSF1A在糖尿病肾病免疫微环境重编程中的因果中介作用 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学、伪时间轨迹分析、细胞间通讯分析和孟德尔随机化等多种技术,系统性地鉴定了TNFRSF1A作为糖尿病肾病进展的因果驱动因子 研究未排除其他调控通路的参与,且斑马鱼模型与人类疾病存在物种差异 探究糖尿病肾病进展中的炎症介质及其因果驱动机制 糖尿病肾病患者的肾脏组织及斑马鱼胚胎模型 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析, 孟德尔随机化 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 未明确说明人类样本数量,使用斑马鱼胚胎模型进行验证 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
5871 2026-01-14
Eurotium cristatum-Fermented White Tea Ameliorates DSS-Induced Colitis by Multi-Scale
2025-Dec-25, Foods (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究探讨了冠突散囊菌发酵白茶(FWT)通过多尺度机制改善DSS诱导的小鼠结肠炎 首次结合单细胞/空间转录组学揭示FWT通过增强肠上皮细胞、杯状细胞和干细胞群,优化功能并诱导抗菌和免疫调节因子,修复肠道屏障 研究基于小鼠模型,人类应用需进一步验证;机制涉及多因素,具体因果关联需深入探究 探究FWT对结肠炎的治疗效果及其多尺度作用机制 DSS诱导的结肠炎小鼠模型 NA 结肠炎 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
5872 2026-01-14
DUSP5 Downregulation in Nucleus Accumbens Core Correlates with Cocaine-Induced Maladaptive Synaptic Plasticity
2025-Dec-23, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究探讨了双特异性磷酸酶5(DUSP5)在可卡因诱导的伏隔核核心区(NAcore)突触可塑性中的作用 首次探索DUSP5在可卡因成瘾中的具体作用,揭示了其与可卡因诱导的突触可塑性及行为适应的关联 研究主要基于大鼠模型和公开数据库,尚未在人体中进行验证 探究可卡因成瘾中NAcore突触可塑性的分子机制 大鼠可卡因自我给药模型、可卡因处理的NAcore单细胞RNA测序数据 神经科学 药物成瘾 单细胞RNA测序、分子分析 大鼠可卡因自我给药模型 RNA测序数据、行为数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5873 2026-01-14
Hypoxia Affects Stem Cell Fate in Patient-Derived Ileum Enteroids in a HIF-1α-Dependent Manner
2025-Dec-23, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过培养患者来源的回肠类器官,探究了缺氧环境如何通过HIF-1α依赖的方式影响肠道干细胞命运 首次在患者来源的回肠类器官模型中,明确了生理性缺氧通过稳定HIF-1α直接调控干细胞命运的机制 研究主要基于体外类器官模型,体内生理环境的复杂性可能未被完全模拟 探究氧气可用性如何影响肠道干细胞增殖与分化 患者来源的人回肠类器官(enteroids) NA NA bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
5874 2026-01-14
Effects of TGFBR1 on Proliferation of Dermal Papilla Cells in Fine-Wool Sheep
2025-Dec-23, Animals : an open access journal from MDPI IF:2.7Q1
研究论文 本研究探讨了TGFBR1基因对细毛羊真皮乳头细胞增殖的影响及其分子机制 首次通过单细胞转录组测序在细毛羊真皮乳头细胞中鉴定出TGFBR1为差异表达基因,并验证其通过调控Wnt/β-catenin、BMP和Notch等多条信号通路抑制细胞增殖 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型的验证,且信号通路调控的具体分子机制有待进一步阐明 探究TGFBR1在细毛羊毛囊发育和周期性生长中的生物学功能及分子机制 细毛羊的真皮乳头细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组测序、RT-qPCR、EDU染色、CCK-8检测 NA 基因表达数据、细胞增殖数据 未明确说明具体样本数量,但涉及细毛羊真皮乳头细胞的原代分离培养 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5875 2026-01-14
Emerging Technologies for Exploring the Cellular Mechanisms in Vascular Diseases
2025-Dec-23, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了用于探索血管疾病细胞机制的新兴技术,包括单细胞与空间转录组学、超分辨率成像、微流控器官芯片、CRISPR基因编辑和人工智能等 整合多种前沿技术(如单细胞多组学、器官芯片和人工智能)来系统评估其在血管疾病研究中的转化准备度、局限性和临床应用潜力 现有技术仍需要多中心大规模验证研究、实验协议标准化以及与临床数据和人类样本的进一步整合 评估新兴技术在揭示血管疾病细胞分子机制、促进靶向治疗和精准诊断发展方面的应用 血管疾病(VDs)和心血管疾病(CVDs)的细胞与分子基础 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学、空间转录组学、超分辨率成像、光声成像、微流控器官芯片、CRISPR/Cas9基因编辑、人工智能 NA 多组学数据、成像数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
5876 2026-01-14
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces wide-spread changes in gene expression across diverse cell types
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过感染5xFAD小鼠与野生型小鼠,探讨了小鼠适应型SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病神经病理学的影响,发现感染未改变Aβ斑块但广泛改变了中枢神经系统细胞类型的基因表达 首次在小鼠模型中结合bulk RNA测序和空间转录组学技术,系统评估了SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病模型小鼠神经病理和基因表达的影响,揭示了感染虽不改变Aβ斑块但引起广泛基因表达变化的新机制 研究仅使用小鼠模型,可能无法完全模拟人类疾病;未检测长期感染效应;病毒RNA未在中枢神经系统检测到,限制了直接神经病理影响的评估 探究SARS-CoV-2感染如何影响阿尔茨海默病神经病理学的潜在机制 5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠和野生型C57BL/6小鼠 神经科学 阿尔茨海默病 bulk RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据 10-14月龄的5xFAD和野生型C57BL/6小鼠 NA bulk RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
5877 2026-01-14
scANMF: Prior Knowledge and Graph-Regularized NMF for Accurate Cell Type Annotation in scRNA-seq
2025-Dec-22, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本文介绍了一种名为scANMF的细胞类型注释框架,它通过整合先验知识和图正则化非负矩阵分解来提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性 scANMF创新性地将标记基因信息、部分标签监督和局部流形结构整合到一个统一的注释模型中,解决了现有工具依赖单一先验知识的局限性 方法在高质量先验知识受限的应用中表现突出,但未明确讨论其在完全无先验知识情况下的性能 开发一个准确且稳健的单细胞RNA测序数据细胞类型注释框架 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 非负矩阵分解 基因表达数据 多个真实scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5878 2026-01-14
Integrative Multi-Omics and Machine Learning Reveal Shared Biomarkers in Type 2 Diabetes and Atherosclerosis
2025-Dec-22, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,揭示了2型糖尿病与动脉粥样硬化之间的共享生物标志物和分子机制 结合多组学分析、机器学习算法(包括人工神经网络)和单细胞RNA测序数据,识别了IL1B、MMP9和P2RY13作为共享枢纽基因,并强调了巨噬细胞极化失衡在两种疾病中的核心作用 研究结果具有初步性,受限于现有数据和方法,需要进一步的实验和临床研究来验证其有效性 阐明2型糖尿病与动脉粥样硬化之间的共享分子机制,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 基因表达谱数据,包括来自GEO数据库的动脉粥样硬化和2型糖尿病相关基因表达数据,以及单细胞RNA测序数据 机器学习 心血管疾病 基因表达分析,功能富集分析(GO/KEGG),蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,机器学习方法,单细胞RNA测序 人工神经网络(ANN) 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5879 2026-01-14
From Genes to Malformations: Molecular Mechanisms Driving the Pathogenesis of Congenital Anomalies of the Kidney and Urinary Tract
2025-Dec-19, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了先天性肾脏和尿路畸形(CAKUT)的分子机制,包括基因变异、信号通路、纤毛功能及细胞外基质异常在疾病发生中的作用 整合了全外显子组和全基因组测序、拷贝数变异分析的最新发现,并强调了人类肾脏类器官、基因编辑及单细胞或空间转录组学等新兴工具在机制探索中的应用 CAKUT具有高度异质性,其临床表现受遗传背景、表观遗传调控及环境因素(如母体糖尿病和胎儿缺氧)的复杂影响,机制尚未完全阐明 阐明CAKUT的分子发病机制,以改善诊断、加深生物学理解并支持靶向治疗策略的开发 先天性肾脏和尿路畸形(CAKUT) 数字病理学 肾脏疾病 全外显子组测序、全基因组测序、拷贝数变异分析、单细胞转录组学、空间转录组学 NA 基因组数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
5880 2026-01-14
APOBEC3 promotes squamous differentiation via IL-1A/AP-1 signaling
2025-Dec-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过基因工程小鼠模型和转录组学分析,揭示了APOBEC3家族在膀胱尿路上皮癌中促进鳞状分化的机制 首次建立了结合Pten和Trp53条件性敲除及小鼠Apobec3过表达的UPPA小鼠模型,并发现APOBEC3通过IL-1α/AP-1信号通路促进鳞状分化 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限,且未深入探讨APOBEC3A在其他癌症类型中的作用 探究APOBEC3在膀胱尿路上皮癌中的功能作用及其促进鳞状分化的分子机制 膀胱尿路上皮癌(UC) 癌症生物学 膀胱癌 基因工程小鼠模型、bulk RNA-seq、单细胞转录组学、空间转录组学 UPPA小鼠模型(条件性敲除Pten和Trp53并过表达小鼠Apobec3) RNA-seq数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 UPPA小鼠膀胱肿瘤样本及人类UC样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
回到顶部