单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5861 - 5880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5861 | 2025-10-06 |
Protocol for inferring epithelial-to-mesenchymal transition trajectories from single-cell RNA sequencing data using R
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102819
PMID:38183653
|
研究论文 | 介绍了一个名为COMET的R软件包，用于从单细胞RNA测序数据推断上皮-间质转化轨迹和状态间转换率 | 开发了首个专门用于推断EMT轨迹和计算状态间转换率的R软件包 | NA | 开发计算工具来研究上皮-间质转化过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 连续时间马尔可夫链 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5862 | 2025-10-06 |
Establishing a 3D culture system for early organogenesis of monkey embryos ex vivo and single-cell transcriptome analysis of cultured embryos
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102835
PMID:38224493
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研究论文 | 建立食蟹猴胚胎体外3D培养系统并进行单细胞转录组分析 | 开发了能够在体外培养猴胚胎至受精后25天的3D培养系统，揭示了原肠胚形成和早期器官发生的关键发育事件 | NA | 建立灵长类胚胎体外培养平台以研究早期胚胎发育 | 食蟹猴胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫荧光分析，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5863 | 2025-10-06 |
Protocol for optimized dissociation of human scalp tissue for hair follicle transcriptomics by scRNA-seq
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102848
PMID:38319786
|
研究论文 | 本文介绍了一种优化的人头皮组织解离方案，用于通过单细胞RNA测序研究毛囊转录组学 | 开发了针对人类头皮组织的高质量单细胞悬液制备优化方案 | NA | 优化人类头皮组织解离方法以获得高质量单细胞悬液 | 人类头皮组织和毛囊 | 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5864 | 2025-10-06 |
Protocol for functional profiling of patient-derived organoids for precision oncology
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102887
PMID:38367233
|
研究论文 | 本文提出了一套用于功能精准肿瘤学的患者来源类器官功能分析方案 | 开发了涵盖患者来源结直肠类器官生成培养、肿瘤浸润淋巴细胞扩增和外周血单核细胞分离培养的完整实验流程 | NA | 建立用于精准肿瘤治疗的功能分析实验方案 | 结直肠癌患者来源的类器官、肿瘤浸润淋巴细胞和外周血单核细胞 | 精准医学 | 结直肠癌 | RNA测序、全外显子组测序、单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 5865 | 2025-10-06 |
BATF2 inhibits the stem cell-like properties and chemoresistance of gastric cancer cells through PTEN/AKT/β-catenin pathway
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.98389
PMID:39629124
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研究论文 | 本研究探讨BATF2通过PTEN/AKT/β-catenin通路抑制胃癌干细胞特性和化疗耐药性的机制 | 首次揭示BATF2通过调控PTEN/AKT/ABCG2通路影响胃癌干细胞特性和化疗敏感性的新机制 | 样本量相对有限（9例胃癌样本），需在更大队列中验证 | 阐明BATF2在胃癌干细胞特性和化疗耐药性中的调控作用 | 胃癌细胞、肿瘤细胞球体、类器官和小鼠模型 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，细胞培养，肿瘤球体形成，类器官培养，免疫组化，免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据，体外实验数据，体内实验数据 | 9例胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5866 | 2025-10-06 |
Deciphering the effects of radiopharmaceutical therapy in the tumor microenvironment of prostate cancer: an in-silico exploration with spatial transcriptomics
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.99516
PMID:39629134
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研究论文 | 结合空间转录组学和计算模型探索放射性药物治疗对前列腺癌肿瘤微环境的影响 | 首次将空间转录组学与计算建模相结合，系统评估不同靶向放射性药物治疗在前列腺癌肿瘤微环境中的剂量分布和疗效差异 | 仅基于两名患者的三组空间转录组学数据集，样本量有限；假设所有配体具有相似的药代动力学参数可能不够准确 | 探索放射性药物治疗在前列腺癌肿瘤微环境中的剂量学和生物学效应 | 前列腺癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学, 计算建模, 偏微分方程求解, 生理药代动力学模型 | 对流-反应-扩散模型, 线性二次模型, MIRD剂量学形式体系 | 空间转录组学数据 | 2名前列腺癌患者的3个空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5867 | 2025-10-06 |
Phosphoglycerate mutase 1-mediated dephosphorylation and degradation of Dusp1 disrupt mitochondrial quality control and exacerbate endotoxemia-induced myocardial dysfunction
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.102647
PMID:39659576
|
研究论文 | 本研究揭示了Pgam1通过介导Dusp1去磷酸化和降解破坏线粒体质量控制，加剧内毒素血症诱导的心肌功能障碍的分子机制 | 首次发现Dusp1是内毒素血症诱导心肌功能障碍的新型生物标志物，并阐明Pgam1-Dusp1轴在调节线粒体质量控制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究Dusp1和Pgam1在内毒素血症诱导心肌功能障碍中的作用机制 | 心肌细胞特异性基因敲除和转基因小鼠、LPS诱导的内毒素血症模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、qPCR、Seahorse分析、分子对接、Western blot | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、功能成像数据 | 基因工程小鼠模型，人类样本数据库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5868 | 2025-10-06 |
Oral cavity infection by the SARS-CoV-2: emphasizing the essence of masking and peptide therapeutics
2022, The Egyptian journal of medical human genetics
DOI:10.1186/s43042-022-00213-z
PMID:37521842
|
研究论文 | 本研究基于TMPRSS2与PAI-1的结合界面设计治疗性肽以抑制SARS-CoV-2感染，并强调佩戴口罩的预防作用 | 首次利用TMPRSS2与PAI-1的结合界面信息设计特异性抑制TMPRSS2的治疗性肽 | NA | 开发抑制SARS-CoV-2感染的治疗方法并强调预防措施 | 口腔黏膜上皮细胞及SARS-CoV-2病毒入侵机制 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5869 | 2025-10-06 |
Neuroinflammation and EIF2 Signaling Persist despite Antiretroviral Treatment in an hiPSC Tri-culture Model of HIV Infection
2020-04-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.02.010
PMID:32220329
|
研究论文 | 开发了一种基于hiPSC的三细胞共培养模型，用于研究HIV感染和抗逆转录病毒治疗对神经炎症的影响 | 首次建立包含神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞的hiPSC三细胞共培养模型，模拟HIV中枢神经系统感染 | 模型为体外培养系统，可能无法完全模拟体内复杂环境 | 研究HIV相关神经认知障碍的发病机制和治疗靶点 | 人诱导多能干细胞分化的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 神经科学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | hiPSC三细胞共培养模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5870 | 2025-10-06 |
Human microbiota influence the immune cell composition and gene expression in the tumor environment of a murine model of glioma
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2508432
PMID:40443227
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人源化微生物组小鼠，揭示肠道微生物群影响胶质瘤肿瘤微环境中免疫细胞组成和基因表达 | 首次在胶质瘤小鼠模型中证明人源肠道微生物群通过调节肿瘤微环境中M1型巨噬细胞比例和炎症标志物表达影响抗PD-1治疗效果 | 研究样本量有限，仅使用两种人源化微生物系；观察时间较短（仅14天）；机制研究不够深入 | 探究人源肠道微生物群对胶质瘤微环境免疫细胞组成和抗PD-1治疗反应的影响 | 人源化微生物组小鼠和GL261胶质瘤细胞系 | 单细胞测序分析 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 微生物组数据 | 两种人源化微生物系小鼠（HuM1和HuM2），在胶质瘤模型中分析肿瘤免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 5871 | 2025-10-06 |
SGTB: A graph representation learning model combining transformer and BERT for optimizing gene expression analysis in spatial transcriptomics data
2025-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出一种结合Transformer和BERT的图表示学习模型SGTB，用于优化空间转录组数据的基因表达分析 | 首次将图卷积网络、Transformer和BERT语言模型集成到空间转录组数据分析中，通过多尺度特征提取和语义表示优化数据表征能力 | NA | 优化空间转录组数据的表示学习，提高细胞类型分类和基因调控网络构建的准确性 | 空间转录组数据中的细胞和基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图卷积网络(GCN), Transformer, BERT | 基因表达矩阵, 空间分布数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5872 | 2025-10-06 |
Identification and validation of biomarkers in Alzheimer's disease based on machine learning algorithms and single-cell sequencing analysis
2025-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过机器学习算法和单细胞测序分析识别并验证阿尔茨海默病的生物标志物 | 结合三种机器学习算法和单细胞测序技术系统识别AD诊断标志物，首次发现SCG3作为早期诊断生物标志物的潜力 | 样本量相对有限（295个样本），需要进一步临床验证 | 识别和验证阿尔茨海默病的诊断生物标志物 | 阿尔茨海默病患者和正常对照的基因表达数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 免疫荧光检测 | LASSO, SVM-RFE, Random Forest | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 295个样本（153个AD患者和142个正常对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 5873 | 2025-10-06 |
scDGG: Dynamic gene graphs for enhancing clustering analysis of single-cell RNA sequencing data via spatiotemporal representations
2025-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出一种名为scDGG的多视图图学习架构，通过动态基因图增强单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 首次提出动态基因图概念，能够更全面地观察调控机制，相比静态基因图能更好地传达动态调控机制 | 未明确说明方法在特定疾病类型或复杂生物环境中的适用性限制 | 提高单细胞RNA测序数据聚类分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多视图图学习架构 | 基因表达数据 | 基准scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5874 | 2025-10-06 |
The analysis of X chromosome activity of porcine embryonic stem Cells: Study based on parthenogenetic embryonic stem cells with LCDM medium
2025-Sep-15, Theriogenology
IF:2.4Q1
|
研究论文 | 本研究通过建立猪孤雌生殖胚胎干细胞系并分析X染色体活性，探讨其与多能性状态的关系 | 首次在LCDM培养基中建立猪孤雌生殖胚胎干细胞系，并发现传代过程中出现X染色体侵蚀样状态与正常X染色体失活状态的异质性 | 猪 naïve ESCs尚未成功建立，缺乏标准化表征评估标准 | 建立猪胚胎干细胞系并分析X染色体活性特征 | 猪孤雌生殖胚胎干细胞(ppLCDM) | 干细胞生物学 | NA | XIST RNA-FISH, 免疫荧光染色, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 猪囊胚期胚胎来源的干细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5875 | 2025-10-06 |
Activated Schwann cells promote tumor growth in colon cancer
2025-Aug-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217791
PMID:40349909
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研究论文 | 本研究揭示了活化雪旺细胞通过c-Jun依赖性机制促进结肠癌生长的关键作用 | 首次发现肿瘤相关非髓鞘形成雪旺细胞在结肠癌中显著增加，并阐明其通过c-Jun激活和IL-6分泌促进肿瘤生长的机制 | 未明确雪旺细胞与其他肿瘤微环境成分相互作用的详细分子通路 | 探究雪旺细胞在结肠癌进展中的具体作用机制 | 结肠癌组织样本、雪旺细胞、肿瘤细胞、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤微环境研究 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、共培养实验、基因敲除 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 结肠癌组织样本与正常组织对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5876 | 2025-10-06 |
Decipher the single-cell level responses to chemotherapy in pancreatic ductal adenocarcinoma by a cross-time context graph model
2025-Aug-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217751
PMID:40294840
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研究论文 | 通过开发跨时间上下文图模型解析胰腺导管腺癌对化疗的单细胞水平响应机制 | 提出scConGraph可扩展双层图模型，能够有效整合跨时间上下文信息重构动态肿瘤细胞响应 | 基于静态单细胞RNA测序快照推断动态过程可能存在局限性 | 研究胰腺导管腺癌对吉西他滨化疗的耐药机制 | 胰腺导管腺癌患者来源异种移植模型 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 单细胞基因表达数据 | PDX模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5877 | 2025-10-06 |
Emergence of regulatory and matrix-producing stromal cells during adipogenic induction in human ceiling culture-derived preadipocytes
2025-Jul-22, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152012
PMID:40409116
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和表观遗传分析研究人源天花板培养来源前脂肪细胞在脂肪生成诱导早期的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示ccdPAs对脂肪生成诱导的异质性反应，发现ATOH8转录因子在ccdPAs中的特异性高表达 | 研究仅关注早期转录组变化，未涉及长期分化过程 | 探究人源前脂肪细胞在脂肪生成诱导过程中的细胞异质性和分子机制 | 人源天花板培养来源前脂肪细胞(ccdPAs)和脂肪来源干细胞(ASCs) | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 表观遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | 人源ccdPAs和ASCs细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5878 | 2025-10-06 |
CD105 blockade restores osimertinib sensitivity in drug-resistant EGFR-mutant non-small cell lung cancer
2025-Jul, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2025.101237
PMID:40090182
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研究论文 | 本研究探讨CD105在EGFR突变非小细胞肺癌中对奥希替尼耐药的作用机制 | 首次发现CD105阻断可恢复耐药EGFR突变非小细胞肺癌对奥希替尼的敏感性，并揭示其通过调节慢循环细胞群和代谢状态的机制 | 研究样本量有限（66例肿瘤样本），且主要依赖细胞系和小鼠模型验证 | 研究CD105在EGFR靶向治疗耐药中的作用机制 | 非小细胞肺癌肿瘤样本和EGFR突变细胞系 | 癌症生物学 | 非小细胞肺癌 | 成像质谱流式技术,单细胞RNA测序,ATAC测序,SCENITH代谢分析,质谱分析 | 细胞系模型,小鼠模型 | 图像,基因表达数据,表观遗传数据,代谢数据 | 66例NSCLC肿瘤样本（其中44例EGFR突变）和2种奥希替尼耐药EGFR突变细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,ATAC测序,代谢分析 | NA | NA |
| 5879 | 2025-10-06 |
Decoding Long-Distance Communication Under Mineral Stress: Advances in Vascular Signalling and Molecular Tools for Plant Resilience
2025-Jul, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15475
PMID:40091594
|
综述 | 本文探讨植物在矿物质胁迫下通过维管组织进行长距离信号传导的机制及其对植物抗逆性的影响 | 系统阐述维管组织作为信号传导枢纽的新功能，并介绍TRAP-Seq、单细胞RNA测序等新型分子工具在揭示长距离信号传导机制中的应用 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证相关假设 | 解析植物在矿物质缺乏条件下的长距离信号传导网络及其调控机制 | 植物维管组织（特别是伴胞）及信号分子（植物激素、小RNA、蛋白质、小肽、移动mRNA等） | 植物生物学 | 矿物质缺乏胁迫 | TRAP-Seq, 异源嫁接, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5880 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing indicates AP-1 as a potential therapeutic target for autoimmune uveitis
2025-Jul, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.116945
PMID:40228638
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型，发现AP-1是疾病关键分子并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序揭示AP-1在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的关键作用，并发现其通过GM-CSF/IL-23反馈环路支持Th17细胞致病性 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探索自身免疫性葡萄膜炎的发病机制并寻找新的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠的脾脏和颈引流淋巴结细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常和EAU小鼠的脾脏及颈引流淋巴结 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |