单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5861 - 5880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5861 | 2025-10-06 |
Defining mesenchymal stem/stromal cell-induced myeloid-derived suppressor cells using single-cell transcriptomics
2024-Jun-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.04.026
PMID:38627968
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析间充质干细胞诱导的髓源性抑制细胞特征 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析MSC诱导的MDSCs转录谱，并鉴定CSF-1R作为关键表面标志物 | RELM-γ在MDSCs免疫抑制功能中的具体作用机制尚未明确 | 阐明间充质干细胞诱导髓源性抑制细胞的分子特征和免疫调节功能 | 小鼠骨髓来源的CD11b+Ly6C+免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性葡萄膜视网膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5862 | 2025-10-06 |
Single-nucleus RNA sequencing demonstrates an autosomal dominant Alzheimer's disease profile and possible mechanisms of disease protection
2024-Jun-05, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.02.009
PMID:38417436
|
研究论文 | 通过单核RNA测序比较常染色体显性阿尔茨海默病与散发性阿尔茨海默病的细胞类型特异性差异 | 首次在单细胞水平揭示ADAD与散发性AD的转录组差异，发现自噬基因和分子伴侣在ADAD中的特异性激活 | 样本量较小（27例），需要更大规模研究验证发现 | 探索常染色体显性阿尔茨海默病与散发性阿尔茨海默病的分子机制差异 | 人脑组织样本 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 27例病例（包括PSEN1-E280A ADAD携带者、散发性AD患者和对照组） | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 5863 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics unveil a unique molecular profile of mesenchymal stem/stromal cell-induced myeloid-derived immune suppressor cells
2024-Jun-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.009
PMID:38795702
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5864 | 2025-10-06 |
The reparative immunologic consequences of stem cell transplantation as a cellular therapy for refractory Crohn's disease
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596699
PMID:38895305
|
研究论文 | 本研究探讨自体造血干细胞移植作为难治性克罗恩病细胞疗法的免疫修复机制 | 首次通过高维细胞表型分析和功能研究揭示干细胞移植通过重建肠道巨噬细胞促进黏膜愈合的机制 | 样本量有限，需要更大规模研究验证HSC异质性对移植结果的影响 | 阐明干细胞移植治疗难治性克罗恩病的免疫修复机制 | 难治性克罗恩病患者的外周血、肠道组织样本和干细胞移植物 | 免疫学 | 克罗恩病 | 质谱流式细胞技术(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), T细胞受体(TCR)测序, 流式细胞术 | 异种移植模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 基因组数据 | 难治性克罗恩病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞技术 | NA | NA |
| 5865 | 2025-10-06 |
Protocol to dissect and dissociate the mouse brainstem for single-cell RNA-seq applications
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102908
PMID:38461411
|
研究论文 | 提出一种用于小鼠脑干单细胞RNA测序的解剖、解离和冷冻保存实验方案 | 针对小脑干结构开发了允许异步样本收集和下游处理的实验流程 | 仅在新生小鼠和特定脑区进行验证，尚未在其他脑区广泛测试 | 开发适用于小脑结构单细胞RNA测序的样本制备方法 | 新生小鼠脑干组织，特别是preBötzinger复合体 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 新生小鼠脑干样本 | NA | 单细胞RNA-seq | SmartSeq3 | SmartSeq3 cDNA文库制备 |
| 5866 | 2025-10-06 |
Protocol for acquiring high-quality fresh mouse lung spatial transcriptomics data
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102825
PMID:38280199
|
研究论文 | 本文提出了一种获取高质量新鲜小鼠肺组织空间转录组数据的实验方案 | 针对肺组织肺泡空腔导致切片困难的问题，开发了专门的肺灌注和冷冻切片方法 | NA | 建立高质量小鼠肺组织空间转录组数据的获取方法 | 小鼠肺组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5867 | 2025-10-06 |
An optimized protocol for isolation of murine pancreatic single cells with high yield and purity
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102836
PMID:38219150
|
研究论文 | 介绍一种从小鼠胰腺快速分离高质量单细胞的优化方案 | 通过优化解剖顺序、酶组成和操作流程，显著减少消化酶对胰腺外分泌细胞的损伤 | NA | 开发高效的小鼠胰腺单细胞分离方法 | 小鼠胰腺组织 | 单细胞技术 | NA | 单细胞分离技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5868 | 2025-10-06 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
|
研究论文 | 开发了一种用于人和小鼠脂肪组织单核RNA测序的流程，整合流式细胞术进行质量控制 | 结合流式细胞术进行质量控制、计数和精确核池分配，可直接加载到10x Chromium控制器 | NA | 解决脂肪组织单细胞RNA测序中脂肪细胞大小、易碎性和商业试剂盒成本高的问题 | 人和小鼠的脂肪组织 | 单细胞测序 | NA | 单核RNA测序, 流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单核RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium控制器 |
| 5869 | 2025-10-06 |
Protocol for inferring epithelial-to-mesenchymal transition trajectories from single-cell RNA sequencing data using R
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102819
PMID:38183653
|
研究论文 | 介绍了一个名为COMET的R软件包，用于从单细胞RNA测序数据推断上皮-间质转化轨迹和状态间转换率 | 开发了首个专门用于推断EMT轨迹和计算状态间转换率的R软件包 | NA | 开发计算工具来研究上皮-间质转化过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 连续时间马尔可夫链 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5870 | 2025-10-06 |
Establishing a 3D culture system for early organogenesis of monkey embryos ex vivo and single-cell transcriptome analysis of cultured embryos
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102835
PMID:38224493
|
研究论文 | 建立食蟹猴胚胎体外3D培养系统并进行单细胞转录组分析 | 开发了能够在体外培养猴胚胎至受精后25天的3D培养系统，揭示了原肠胚形成和早期器官发生的关键发育事件 | NA | 建立灵长类胚胎体外培养平台以研究早期胚胎发育 | 食蟹猴胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫荧光分析，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5871 | 2025-10-06 |
Protocol for optimized dissociation of human scalp tissue for hair follicle transcriptomics by scRNA-seq
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102848
PMID:38319786
|
研究论文 | 本文介绍了一种优化的人头皮组织解离方案，用于通过单细胞RNA测序研究毛囊转录组学 | 开发了针对人类头皮组织的高质量单细胞悬液制备优化方案 | NA | 优化人类头皮组织解离方法以获得高质量单细胞悬液 | 人类头皮组织和毛囊 | 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5872 | 2025-10-06 |
Protocol for functional profiling of patient-derived organoids for precision oncology
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102887
PMID:38367233
|
研究论文 | 本文提出了一套用于功能精准肿瘤学的患者来源类器官功能分析方案 | 开发了涵盖患者来源结直肠类器官生成培养、肿瘤浸润淋巴细胞扩增和外周血单核细胞分离培养的完整实验流程 | NA | 建立用于精准肿瘤治疗的功能分析实验方案 | 结直肠癌患者来源的类器官、肿瘤浸润淋巴细胞和外周血单核细胞 | 精准医学 | 结直肠癌 | RNA测序、全外显子组测序、单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 5873 | 2025-10-06 |
BATF2 inhibits the stem cell-like properties and chemoresistance of gastric cancer cells through PTEN/AKT/β-catenin pathway
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.98389
PMID:39629124
|
研究论文 | 本研究探讨BATF2通过PTEN/AKT/β-catenin通路抑制胃癌干细胞特性和化疗耐药性的机制 | 首次揭示BATF2通过调控PTEN/AKT/ABCG2通路影响胃癌干细胞特性和化疗敏感性的新机制 | 样本量相对有限（9例胃癌样本），需在更大队列中验证 | 阐明BATF2在胃癌干细胞特性和化疗耐药性中的调控作用 | 胃癌细胞、肿瘤细胞球体、类器官和小鼠模型 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，细胞培养，肿瘤球体形成，类器官培养，免疫组化，免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据，体外实验数据，体内实验数据 | 9例胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5874 | 2025-10-06 |
Deciphering the effects of radiopharmaceutical therapy in the tumor microenvironment of prostate cancer: an in-silico exploration with spatial transcriptomics
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.99516
PMID:39629134
|
研究论文 | 结合空间转录组学和计算模型探索放射性药物治疗对前列腺癌肿瘤微环境的影响 | 首次将空间转录组学与计算建模相结合，系统评估不同靶向放射性药物治疗在前列腺癌肿瘤微环境中的剂量分布和疗效差异 | 仅基于两名患者的三组空间转录组学数据集，样本量有限；假设所有配体具有相似的药代动力学参数可能不够准确 | 探索放射性药物治疗在前列腺癌肿瘤微环境中的剂量学和生物学效应 | 前列腺癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学, 计算建模, 偏微分方程求解, 生理药代动力学模型 | 对流-反应-扩散模型, 线性二次模型, MIRD剂量学形式体系 | 空间转录组学数据 | 2名前列腺癌患者的3个空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5875 | 2025-10-06 |
Phosphoglycerate mutase 1-mediated dephosphorylation and degradation of Dusp1 disrupt mitochondrial quality control and exacerbate endotoxemia-induced myocardial dysfunction
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.102647
PMID:39659576
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研究论文 | 本研究揭示了Pgam1通过介导Dusp1去磷酸化和降解破坏线粒体质量控制，加剧内毒素血症诱导的心肌功能障碍的分子机制 | 首次发现Dusp1是内毒素血症诱导心肌功能障碍的新型生物标志物，并阐明Pgam1-Dusp1轴在调节线粒体质量控制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究Dusp1和Pgam1在内毒素血症诱导心肌功能障碍中的作用机制 | 心肌细胞特异性基因敲除和转基因小鼠、LPS诱导的内毒素血症模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、qPCR、Seahorse分析、分子对接、Western blot | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、功能成像数据 | 基因工程小鼠模型，人类样本数据库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5876 | 2025-10-06 |
Oral cavity infection by the SARS-CoV-2: emphasizing the essence of masking and peptide therapeutics
2022, The Egyptian journal of medical human genetics
DOI:10.1186/s43042-022-00213-z
PMID:37521842
|
研究论文 | 本研究基于TMPRSS2与PAI-1的结合界面设计治疗性肽以抑制SARS-CoV-2感染，并强调佩戴口罩的预防作用 | 首次利用TMPRSS2与PAI-1的结合界面信息设计特异性抑制TMPRSS2的治疗性肽 | NA | 开发抑制SARS-CoV-2感染的治疗方法并强调预防措施 | 口腔黏膜上皮细胞及SARS-CoV-2病毒入侵机制 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5877 | 2025-10-06 |
Neuroinflammation and EIF2 Signaling Persist despite Antiretroviral Treatment in an hiPSC Tri-culture Model of HIV Infection
2020-04-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.02.010
PMID:32220329
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研究论文 | 开发了一种基于hiPSC的三细胞共培养模型，用于研究HIV感染和抗逆转录病毒治疗对神经炎症的影响 | 首次建立包含神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞的hiPSC三细胞共培养模型，模拟HIV中枢神经系统感染 | 模型为体外培养系统，可能无法完全模拟体内复杂环境 | 研究HIV相关神经认知障碍的发病机制和治疗靶点 | 人诱导多能干细胞分化的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 神经科学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | hiPSC三细胞共培养模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5878 | 2025-10-06 |
Human microbiota influence the immune cell composition and gene expression in the tumor environment of a murine model of glioma
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2508432
PMID:40443227
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人源化微生物组小鼠，揭示肠道微生物群影响胶质瘤肿瘤微环境中免疫细胞组成和基因表达 | 首次在胶质瘤小鼠模型中证明人源肠道微生物群通过调节肿瘤微环境中M1型巨噬细胞比例和炎症标志物表达影响抗PD-1治疗效果 | 研究样本量有限，仅使用两种人源化微生物系；观察时间较短（仅14天）；机制研究不够深入 | 探究人源肠道微生物群对胶质瘤微环境免疫细胞组成和抗PD-1治疗反应的影响 | 人源化微生物组小鼠和GL261胶质瘤细胞系 | 单细胞测序分析 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 微生物组数据 | 两种人源化微生物系小鼠（HuM1和HuM2），在胶质瘤模型中分析肿瘤免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 5879 | 2025-10-06 |
SGTB: A graph representation learning model combining transformer and BERT for optimizing gene expression analysis in spatial transcriptomics data
2025-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出一种结合Transformer和BERT的图表示学习模型SGTB，用于优化空间转录组数据的基因表达分析 | 首次将图卷积网络、Transformer和BERT语言模型集成到空间转录组数据分析中，通过多尺度特征提取和语义表示优化数据表征能力 | NA | 优化空间转录组数据的表示学习，提高细胞类型分类和基因调控网络构建的准确性 | 空间转录组数据中的细胞和基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图卷积网络(GCN), Transformer, BERT | 基因表达矩阵, 空间分布数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5880 | 2025-10-06 |
Identification and validation of biomarkers in Alzheimer's disease based on machine learning algorithms and single-cell sequencing analysis
2025-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过机器学习算法和单细胞测序分析识别并验证阿尔茨海默病的生物标志物 | 结合三种机器学习算法和单细胞测序技术系统识别AD诊断标志物，首次发现SCG3作为早期诊断生物标志物的潜力 | 样本量相对有限（295个样本），需要进一步临床验证 | 识别和验证阿尔茨海默病的诊断生物标志物 | 阿尔茨海默病患者和正常对照的基因表达数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 免疫荧光检测 | LASSO, SVM-RFE, Random Forest | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 295个样本（153个AD患者和142个正常对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |