单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5801 - 5820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5801 | 2025-10-06 |
Expression and potential regulatory mechanism of cellular senescence-related genes in Alzheimer's disease based on single-cell and bulk RNA datasets
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1595847
PMID:40470298
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，识别了阿尔茨海默病中细胞衰老相关基因的表达模式和潜在调控机制 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据系统分析AD中细胞衰老相关基因的调控网络，并识别了关键细胞亚型和潜在治疗靶点 | 研究结果需要进一步实验验证，样本来源和数量未明确说明 | 阐明细胞衰老在阿尔茨海默病发病机制中的关键作用 | 阿尔茨海默病患者脑组织细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,基因富集分析 | UMAP聚类分析 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5802 | 2025-10-06 |
Biological and prognostic insights into the prostaglandin D2 signaling axis in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1562261
PMID:40474982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA数据分析揭示了肺腺癌肿瘤微环境中前列腺素D2信号轴的作用机制及其临床意义 | 首次系统性地揭示了前列腺素D2在肺腺癌肿瘤微环境中的细胞间通讯机制，并发现其与免疫细胞浸润和患者预后的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要进一步的功能性实验证实信号轴的具体作用机制 | 探索肺腺癌肿瘤微环境中代谢物介导的细胞间通讯机制，特别关注前列腺素D2信号轴 | 肺腺癌肿瘤微环境中的各种细胞类型，包括成纤维细胞、浆细胞样树突状细胞、肥大细胞、NK/T细胞和内皮细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 荧光原位杂交, ESTIMATE算法, ssGSEA算法 | MEBOCOST, Seurat | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | TCGA-LUAD数据集和两个GEO数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5803 | 2025-10-06 |
Single-cell and bulk transcriptome analyses reveal elevated amino acid metabolism promoting tumor-directed immune evasion in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1575829
PMID:40475762
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示结直肠癌中氨基酸代谢升高促进肿瘤导向的免疫逃逸 | 开发了基于AUCell算法的氨基酸代谢评分系统，首次系统揭示了肿瘤细胞氨基酸代谢与免疫检查点抑制剂耐药性的关联机制 | 样本量相对有限，需要更大规模队列验证；机制研究主要基于体外实验，缺乏体内验证 | 探究结直肠癌中肿瘤细胞代谢异质性对肿瘤免疫微环境的影响 | 结直肠癌患者肿瘤组织中的上皮细胞和肿瘤浸润免疫细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组分析，体外共培养实验 | LASSO回归，Cox回归，机器学习风险评分模型 | 基因表达数据 | 17例接受PD-1阻断治疗的CRC患者的46,374个上皮细胞，另加23例CRC患者的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序，批量转录组测序 | NA | NA |
| 5804 | 2025-10-06 |
Expression of PSMD14 in lung adenocarcinoma and its impact on immune cell infiltration and prognosis: a comprehensive analysis based on RNA and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560693
PMID:40475775
|
研究论文 | 通过RNA测序和单细胞RNA测序综合分析PSMD14在肺腺癌中的表达及其对免疫细胞浸润和预后的影响 | 首次系统揭示PSMD14在肺腺癌中高表达并与JAMM家族成员正相关，发现其与免疫细胞浸润和免疫检查点分子的关联 | 未明确PSMD14影响免疫细胞浸润的具体分子机制 | 探索PSMD14在肺腺癌中的表达特征及其对肿瘤免疫和临床预后的影响 | 肺腺癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 肺腺癌患者组织样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5805 | 2025-10-06 |
Metabolic profiles in laryngeal cancer defined two distinct molecular subtypes with divergent prognoses
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1512502
PMID:40475768
|
研究论文 | 通过多组学分析定义了喉癌的两种代谢相关分子亚型，并开发了诊断和预后预测模型 | 首次基于代谢特征对喉癌进行分子分型，并整合转录组、突变、甲基化和单细胞RNA测序数据进行综合验证 | 样本量相对有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 识别喉癌的代谢相关分子亚型并开发诊断预后模型 | 喉癌患者 | 生物信息学 | 喉癌 | 转录组测序, 突变分析, 甲基化分析, 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归, 随机森林 | 基因表达数据, 突变数据, 甲基化数据, 单细胞数据 | TCGA数据集114例患者，外加三个独立批量RNA数据集和一个单细胞RNA测序数据集验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5806 | 2025-10-06 |
Tumor-infiltrating lymphocytes in cancer immunotherapy: from chemotactic recruitment to translational modeling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1601773
PMID:40475782
|
综述 | 本文系统探讨肿瘤浸润淋巴细胞在癌症免疫治疗中的作用机制、临床价值及转化前景 | 整合TIL表型功能多样性、临床转化挑战及新兴技术应用，提供个性化免疫治疗综合框架 | 未涉及具体临床试验数据，主要基于现有研究进行理论整合 | 阐明肿瘤浸润淋巴细胞在肿瘤免疫微环境中的作用及免疫治疗应用策略 | 肿瘤浸润淋巴细胞（CD8+T细胞、CD4+T细胞、调节性T细胞、B细胞、NK细胞）及肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞测序、新抗原预测、生物材料平台 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5807 | 2025-10-06 |
stGuide advances label transfer in spatial transcriptomics through attention-based supervised graph representation learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1566675
PMID:40476268
|
研究论文 | 提出stGuide方法，通过基于注意力的监督图表示学习改进空间转录组学中的标签转移 | 开发了基于注意力的监督图学习模型，利用参考注释指导监督表示，将查询切片映射到共享嵌入空间 | NA | 解决空间转录组学数据中批次效应、不平衡参考注释和组织异质性带来的对齐分析挑战 | 人类背外侧前额叶皮层和乳腺癌数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 基于注意力的监督图学习模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5808 | 2025-10-06 |
Identifying genetic variants that influence the abundance of cell states in single-cell data
2024-Oct, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01909-1
PMID:39327486
|
研究论文 | 开发了一种名为GeNA的统计工具，用于识别单细胞数据中细胞状态丰度的数量性状位点 | 无需预定义细胞状态，灵活识别与遗传变异最相关的细胞状态丰度变化 | 仅基于969名个体的外周血单细胞RNA测序数据，样本规模相对有限 | 识别影响单细胞数据中细胞状态丰度的遗传变异 | 人类免疫细胞状态 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 单细胞RNA测序数据 | 969名个体的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5809 | 2025-10-06 |
Mapping the cellular biogeography of human bone marrow niches using single-cell transcriptomics and proteomic imaging
2024-Jun-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.04.013
PMID:38714197
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和蛋白质组学成像技术绘制人类骨髓微环境的细胞生物地理图谱 | 首次整合单细胞RNA测序和CODEX空间成像技术，系统揭示人类骨髓非造血细胞的异质性及其空间组织模式 | 样本数量有限，主要关注非造血细胞，对某些稀有细胞亚型的覆盖可能不足 | 解析人类骨髓微环境中非造血细胞的异质性和空间分布特征 | 人类骨髓中的非造血细胞和造血细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, CODEX成像 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质空间成像数据 | 82,742个单细胞（29,325个非造血细胞 + 53,417个造血细胞），超过120万个细胞的空间成像 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | CODEX（共检测索引）技术用于空间细胞分析 |
| 5810 | 2025-10-06 |
Metabolic regulator ERRγ governs gastric stem cell differentiation into acid-secreting parietal cells
2024-Jun-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.016
PMID:38733994
|
研究论文 | 本研究揭示了代谢调节因子ERRγ在胃干细胞分化为泌酸壁细胞过程中的关键调控作用 | 首次发现ERRγ作为壁细胞分化的关键调节因子，并系统描绘了壁细胞分化的分子、细胞和超微结构阶段 | 研究主要基于小鼠模型和人类胃细胞，临床转化需要进一步验证 | 阐明胃壁细胞分化的分子机制 | 小鼠模型和人类胃细胞 | 细胞生物学 | 胃部疾病 | scRNA-seq, 谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5811 | 2025-10-06 |
Interleukin-36γ-producing macrophages drive IL-17-mediated fibrosis
2019-10-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aax4783
PMID:31604843
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鉴定生物材料诱导的功能性巨噬细胞亚群及其在组织修复和纤维化中的作用 | 首次发现CD9IL-36γ巨噬细胞亚群驱动IL-17介导的纤维化过程 | 体内功能性巨噬细胞亚群的鉴定和表型特征描述仍有限 | 研究生物材料诱导的巨噬细胞亚群在免疫反应和组织修复中的功能 | 小鼠和人类组织样本中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | 无偏聚类和伪时间分析 | 单细胞RNA测序数据 | 从小鼠生物基质和合成生物材料中分选的巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5812 | 2025-10-06 |
Lifting the veil on macrophage diversity in tissue regeneration and fibrosis
2019-10-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aaz0749
PMID:31604845
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞在组织修复和纤维化过程中的多样性作用 | 首次通过单细胞RNA测序系统解析巨噬细胞在组织修复与纤维化中的异质性功能 | NA | 阐明巨噬细胞在组织再生和纤维化过程中的作用机制 | 巨噬细胞 | 单细胞组学 | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5813 | 2025-10-06 |
Identification of macrophage-associated diagnostic biomarkers and molecular subtypes in gestational diabetes mellitus based on machine learning
2025-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2025.2513893
PMID:40476676
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和RNA测序数据，探索巨噬细胞相关诊断基因和妊娠期糖尿病分子亚型 | 提出CB-DSNMF算法识别GDM亚型，构建基于机器学习集成的诊断模型，并通过孟德尔随机化分析确定ZEB2与GDM风险的因果关系 | NA | 识别巨噬细胞相关诊断生物标志物和妊娠期糖尿病的分子亚型 | 妊娠期糖尿病患者 | 机器学习 | 妊娠期糖尿病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 孟德尔随机化分析 | 机器学习集成算法, CB-DSNMF算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 5814 | 2025-10-06 |
The battle within: Discovering new insights into phytopathogen interactions and effector dynamics
2025-Sep, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128220
PMID:40398012
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综述 | 本文全面综述了植物病原体相互作用中效应蛋白动态及其对植物免疫系统的调控机制 | 整合了元种群动态、快速适应和环境变化对病原体效应蛋白进化的影响，并强调了单细胞转录组学等新技术在效应靶标鉴定中的应用 | 作为综述文章，未提供原始实验数据和新发现，主要基于现有文献进行整合分析 | 深入理解植物病原体相互作用中效应蛋白的功能机制和进化动态 | 植物病原体效应蛋白（细菌、真菌、卵菌和线虫）及其与植物免疫系统的相互作用 | 植物病理学 | 植物病害 | 生物信息学，单细胞转录组学，蛋白质结构研究，蛋白质建模 | NA | 文献数据，蛋白质结构数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5815 | 2025-10-06 |
Immune-endothelial cell crosstalk in hepatic endothelial injury of liver fibrotic mice
2025-Aug-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.177730
PMID:40374060
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肝纤维化中免疫细胞与内皮细胞之间的相互作用机制 | 首次在肝纤维化模型中系统分析免疫-内皮细胞互作，发现Ptprc-Mrc1和Sell-Podxl信号通路在细胞通讯中的关键作用 | 研究仅使用CCl4诱导的小鼠肝纤维化模型，样本量相对有限 | 探索肝纤维化中肝内皮细胞损伤机制及细胞间通讯的调控通路 | C57BL/6雄性小鼠肝纤维化模型中的非实质细胞 | 单细胞组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序,扫描电镜,PCR,Masson染色,免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 24,534个细胞分为10个主要细胞亚群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5816 | 2025-10-06 |
Transcriptional profile and quantitative proteomics revealed NGF-p75NTR-associated synaptic plasticity and heterogeneity for diabetic encephalopathy and the potential role of CoQ10 for diabetic induced cognitive deficits in mice
2025-Aug, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167823
PMID:40185338
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞测序探讨了CoQ10对糖尿病诱导认知缺陷中突触可塑性的调控作用及异质性 | 首次系统研究DICD相关及CoQ10治疗的蛋白质组变化及其异质性改变，发现NGF-p75NTR信号通路在突触可塑性调控中的重要作用 | 研究仅基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；样本量相对有限 | 探索CoQ10在糖尿病诱导认知缺陷中的细胞和分子特征及潜在作用 | 糖尿病诱导认知缺陷小鼠模型 | 生物医学 | 糖尿病脑病 | TMT定量蛋白质组学,单细胞RNA测序,Western blotting | NA | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据,蛋白质印迹数据 | 多组小鼠比较（对照组、DICD组、CoQ10治疗组） | NA | 单细胞RNA-seq,定量蛋白质组学 | NA | NA |
| 5817 | 2025-10-06 |
CTLA4 modulates B cell receptor signals to inhibit HBsAb secretion in chronic hepatitis B patients
2025-Aug, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167848
PMID:40279930
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研究论文 | 本研究揭示了CTLA4通过调节B细胞受体信号通路抑制慢性乙型肝炎患者HBsAb分泌的新机制 | 首次发现CTLA4在HBsAg特异性B细胞中高表达，并通过与SHP-1结合抑制Jak-STAT和B细胞受体信号通路 | 研究样本主要来自患者外周血和肝脏组织，需要更大规模验证 | 探索慢性乙型肝炎患者B细胞功能缺陷的机制及治疗靶点 | 慢性乙型肝炎患者的B细胞和HBV小鼠模型 | 免疫学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 慢性乙型肝炎患者的外周和肝脏B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5818 | 2025-10-06 |
DSG2 attenuates gemcitabine efficacy through PTX3 in lung adenocarcinoma
2025-Aug, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167881
PMID:40316058
|
研究论文 | 本研究揭示了DSG2通过PTX3介导的机制增强肺腺癌对吉西他滨的耐药性 | 首次发现DSG2通过调控PTX3/NFκB/STAT3信号轴介导肺腺癌对吉西他滨的耐药机制 | 研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探讨DSG2在肺腺癌吉西他滨耐药中的作用机制 | 肺腺癌细胞和组织 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞测序，KEGG分析，GSEA分析，体外实验 | NA | 基因组数据，转录组数据，实验数据 | TCGA数据库和多个组学数据库分析 | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 5819 | 2025-10-06 |
Fenofibrate inhibits activation of cGAS-STING pathway by alleviating mitochondrial damage to attenuate inflammatory response in diabetic dry eye
2025-Aug-01, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究探讨了cGAS-STING信号通路在糖尿病干眼症中的作用，并发现非诺贝特通过减轻线粒体损伤抑制该通路激活从而缓解炎症反应 | 首次揭示cGAS-STING信号通路在糖尿病干眼症发病机制中的关键作用，并发现非诺贝特通过保护线粒体功能抑制该通路的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未进行临床试验验证 | 探究cGAS-STING信号通路在糖尿病干眼症中的作用及非诺贝特的治疗机制 | 糖尿病干眼症小鼠模型和永生化人角膜上皮细胞 | 生物医学研究 | 糖尿病干眼症 | 单细胞RNA测序 | 动物疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5820 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing identifies cellular heterogeneity in endothelial and epithelial cells associated with nitrogen dioxide-induced acute lung injury
2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118385
PMID:40403690
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究二氧化氮诱导急性肺损伤中内皮细胞和上皮细胞的异质性变化 | 首次在二氧化氮诱导的急性肺损伤中鉴定出LRG1和UCP2在内皮细胞中显著上调，并发现新型Ly6a肺泡上皮细胞亚群 | 研究仅关注内皮和上皮细胞，未涉及其他可能参与急性肺损伤的细胞类型 | 探究二氧化氮诱导急性肺损伤的细胞分子机制 | 小鼠肺组织中的内皮细胞和上皮细胞 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |