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当前共找到 37491 篇文献，本页显示第 5781 - 5800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5781 | 2025-12-10 |
Long-read sequencing transcriptome quantification with lr-kallisto
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.19.604364
PMID:39071335
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研究论文 | 本文介绍了lr-kallisto方法，用于长读长测序数据的转录本定量分析，并展示了其在ONT数据上的应用和改进 | 开发了lr-kallisto方法，将kallisto的短读长RNA-seq定量技术适配到长读长测序平台，并证明外显子捕获能提高定量准确性 | 未提及具体样本量或数据集的局限性，可能依赖于特定长读长平台（如ONT） | 实现长读长测序数据中转录本异构体的快速准确定量 | RNA转录本，特别是全长转录本异构体 | 自然语言处理 | NA | 长读长测序，外显子捕获 | kallisto模型适配 | RNA测序数据 | NA | Oxford Nanopore Technologies | 长读长RNA测序 | ONT平台 | Oxford Nanopore长读长测序数据，结合外显子捕获技术 |
| 5782 | 2025-12-10 |
PI3 as a Common Hub Gene Linking Atopic Dermatitis and Ulcerative Colitis Through Immune Cell Recruitment Mechanisms
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S527507
PMID:40901026
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别了特应性皮炎和溃疡性结肠炎之间的共同枢纽基因PI3及其在免疫细胞招募机制中的作用 | 首次将PI3确定为连接AD和UC的枢纽基因，并揭示了其通过CCL和CXCL趋化因子招募M1巨噬细胞、CD4 T细胞和中性粒细胞的共同免疫机制 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，缺乏实验验证；样本量有限且可能受批次效应影响 | 识别AD和UC之间的共同枢纽基因和免疫学特征，阐明两种疾病的共享发病机制 | 特应性皮炎和溃疡性结肠炎患者组织样本 | 生物信息学 | 特应性皮炎,溃疡性结肠炎 | RNA-seq,单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GSE121212和GSE75214数据集的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5783 | 2025-12-10 |
Cannabidiol Reprograms Glucose Metabolism in Colorectal Adenocarcinoma by Targeting HIF-1α/LDHA Pathway
2025, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X25500958
PMID:41219135
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研究论文 | 本研究探讨了大麻二酚通过靶向HIF-1α/LDHA通路，重编程结直肠腺癌葡萄糖代谢的抗肿瘤机制 | 首次揭示大麻二酚通过抑制HIF-1α/LDHA通路来靶向肿瘤代谢重编程，并发现其与糖酵解抑制剂2-DG具有协同作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞转录组学分析，缺乏体内动物模型的全面验证 | 探究大麻二酚在结直肠腺癌中的抗肿瘤作用机制，特别是其对肿瘤代谢重编程的影响 | 结直肠腺癌细胞系及组织样本 | 肿瘤代谢研究 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、网络药理学、蛋白质组学、代谢测定 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、代谢数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5784 | 2025-12-10 |
Strain-specific tropism and transcriptional responses of enterovirus D68 infection in human spinal cord organoids
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1698639
PMID:41347238
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类脊髓类器官中肠道病毒D68感染的细胞嗜性和转录反应，揭示了不同病毒株在神经元和胶质细胞中的差异感染模式 | 首次在人类脊髓类器官模型中，通过单细胞分辨率揭示了EV-D68不同毒株（B2和B3）的细胞嗜性差异及其宿主转录响应，为急性弛缓性脊髓炎的发病机制提供了新见解 | 研究基于类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂的脊髓微环境；样本规模有限，且仅分析了两种病毒株 | 探究肠道病毒D68感染导致急性弛缓性脊髓炎的细胞嗜性和感染动力学机制 | 源自诱导多能干细胞的人类脊髓类器官 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及健康及感染两种EV-D68毒株（B2和B3）的脊髓类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5785 | 2025-12-10 |
Multi-Omics Analysis and Experimental Validation Identify RAD51 as a Key Biomarker in OSCC
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70048
PMID:41350246
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，识别RAD51作为口腔鳞状细胞癌的关键生物标志物 | 整合多组学数据（包括单细胞转录组学）和实验验证，首次系统阐明RAD51在OSCC中的功能及其与免疫浸润和化疗耐药性的关联 | 研究主要基于细胞系HSC-3进行实验验证，缺乏体内模型或临床样本的直接验证 | 阐明RAD51在口腔鳞状细胞癌中的具体功能和调控机制，评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）细胞系HSC-3及相关的多组学数据 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、siRNA敲低、功能测定（增殖、迁移、侵袭、ROS积累、化疗敏感性） | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、实验数据 | 使用OSCC细胞系HSC-3进行实验，多组学分析涉及多个癌症数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5786 | 2025-12-10 |
Identification of PHACTR4 as A New Biomarker for Diabetic Nephropathy and Its Correlation with Glomerular Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration
2023-11, Iranian journal of kidney diseases
IF:0.8Q4
DOI:10.52547/ijkd.7858
PMID:38043109
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研究论文 | 本研究通过整合微阵列和单细胞测序数据分析，鉴定出PHACTR4作为糖尿病肾病的新型生物标志物，并揭示了其与肾小球内皮功能障碍和免疫浸润的关联 | 首次将PHACTR4鉴定为糖尿病肾病中与肾小球内皮细胞功能障碍相关的关键生物标志物，并利用单细胞测序数据揭示了其在炎症反应中的调控作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏动物模型或临床样本的体内验证 | 鉴定与糖尿病肾病肾小球内皮细胞功能障碍相关的生物标志物 | 糖尿病肾病患者的基因表达数据、人肾小球内皮细胞 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 微阵列测序, 单细胞RNA-seq, RT-PCR | LASSO逻辑回归, WGCNA, ssGSEA | 基因表达数据 | GSE30528和GSE131882数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 5787 | 2025-12-09 |
Network toxicology and machine learning reveal the impact of acetyl tributyl citrate on erectile dysfunction and identify cathepsin S as a critical regulator
2026-Jan, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2025.109101
PMID:41187890
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研究论文 | 本研究结合网络毒理学和机器学习，揭示了乙酰柠檬酸三丁酯（ATBC）对勃起功能障碍（ED）的影响，并确定组织蛋白酶S（CTSS）为关键调控因子 | 首次整合网络毒理学、单细胞测序和多种机器学习算法，系统性地识别ATBC诱导ED的核心靶点CTSS，并通过分子对接和体外实验验证其结合及功能影响 | 研究主要基于计算分析和体外实验，缺乏体内动物模型或临床样本的直接验证，且环境暴露的剂量效应关系需进一步探究 | 探究环境内分泌干扰物ATBC在勃起功能障碍中的具体作用机制和分子靶点 | ATBC暴露下的潜在靶点基因、信号通路及阴茎海绵体组织中的细胞表达谱 | 机器学习 | 勃起功能障碍 | 网络毒理学分析、单细胞测序、分子对接、体外细胞实验 | EPC、MNC、Betweenness、Degree算法及五种机器学习算法 | 基因靶点数据、单细胞表达谱、蛋白质相互作用网络 | 未明确说明具体样本数量，涉及潜在靶点71个和关键基因11个 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5788 | 2025-12-09 |
SCD1 drives bladder cancer progression and trametinib sensitivity
2026-Jan, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156287
PMID:41319558
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和免疫组化验证，探讨了SCD1在膀胱癌中的表达及其与肿瘤进展和Trametinib敏感性的关系 | 揭示了SCD1在膀胱癌细胞中的特异性表达，并首次将其与Trametinib敏感性联系起来，为膀胱癌的早期诊断和个性化治疗提供了新靶点 | 研究主要基于公共数据集和体外验证，缺乏大规模临床队列验证和体内实验数据 | 识别膀胱癌的新治疗策略，特别是通过靶向脂肪酸代谢关键酶SCD1 | 膀胱癌组织和细胞，重点关注SCD1的表达和功能 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 生物信息学分析，免疫组化 | NA | RNA-seq数据，单细胞RNA-seq数据，组织图像 | 公共数据集中的膀胱癌样本，具体数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5789 | 2025-12-09 |
CD33 drives cutaneous melanoma: mendelian randomization confirms causality, multi-omics and in vitro experiments reveal M2 macrophage polarization-mediated progression
2025-Dec-08, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004100
PMID:41346267
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、多组学分析和体外实验，揭示了CD33通过促进M2巨噬细胞极化驱动皮肤黑色素瘤发展的因果机制 | 首次综合运用孟德尔随机化、多组学转录组分析和体外实验验证，系统证实了CD33与皮肤黑色素瘤之间的因果关系，并阐明了其通过M2巨噬细胞极化介导肿瘤进展的具体机制 | 研究主要基于公共数据库的汇总数据和体外实验，缺乏体内模型或临床样本的直接验证，且对CD33调控M2极化的具体信号通路尚未完全阐明 | 探索皮肤黑色素瘤的新型治疗靶点并阐明其作用机制 | 皮肤黑色素瘤及其肿瘤微环境中的免疫细胞（特别是巨噬细胞/树突状细胞） | 生物信息学与计算生物学 | 皮肤黑色素瘤 | 孟德尔随机化、基于汇总数据的孟德尔随机化、共定位分析、批量转录组测序、单细胞转录组测序、体外细胞实验 | NA | 基因组关联研究汇总数据、蛋白质数量性状位点数据、批量转录组数据、单细胞转录组数据 | FinnGen队列（皮肤黑色素瘤：3194病例/314193对照；原位黑色素瘤：980病例/313899对照；葡萄膜黑色素瘤：293病例/345118对照）、731个免疫细胞特征（N=3757）、TCGA/GTEx/GENT2数据库转录组数据、GEO单细胞数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5790 | 2025-12-09 |
[Novel progress in exploring drug resistance mechanisms of breast cancer by single-cell sequencing technology]
2025-Dec-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5791 | 2025-12-09 |
[Fibroblast heterogeneity and functional roles in interstitial lung diseases: insights from histopathology and single-cell transcriptomics analyses]
2025-Dec-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5792 | 2025-12-09 |
Glioblastoma-associated fibroblasts enhance vascular stiffness and confer to poor prognosis
2025-Dec-08, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004114
PMID:41355159
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，在胶质母细胞瘤中鉴定出一种独特的COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞亚群，并揭示了其通过COL6A3-ITGA1信号通路导致血管功能障碍和缺氧，从而促进肿瘤进展的机制 | 首次在胶质母细胞瘤中鉴定出COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞亚群，并阐明其通过介导内皮细胞硬度增加来驱动血管功能障碍和缺氧的新机制 | 未明确说明样本量大小及具体来源，且GAFs来源于髓系细胞的机制仍需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤中癌症相关成纤维细胞的功能及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 胶质母细胞瘤组织、COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞、血管内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学分析、CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5793 | 2025-12-09 |
MicroRNA-mediated neuronal detargeting alters astrocyte cell fate conversion trajectories in vivo
2025-Dec-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09169-3
PMID:41350397
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研究论文 | 本研究通过在GFAP微型启动子驱动的转录盒中引入microRNA-124靶序列，优化了体内星形胶质细胞向神经元重编程的特异性，并揭示了不同转录因子组合对细胞命运转换轨迹的调控作用 | 首次将microRNA-124靶序列整合到星形胶质细胞重编程系统中，有效避免了内源性神经元的脱靶转染，并通过单细胞转录组学揭示了重编程过程中细胞命运分叉的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类细胞或临床环境中验证；对长期重编程细胞的稳定性和功能整合评估有限 | 优化体内星形胶质细胞向神经元重编程的特异性，并探究细胞命运转换的分子机制 | 小鼠星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、假时间轨迹分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及谱系追踪和单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5794 | 2025-12-09 |
Genetic insights into drug targets for alzheimer's disease: integrative multi-omics analysis
2025-Dec-05, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-025-01901-9
PMID:41350740
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研究论文 | 本研究通过整合多组学孟德尔随机化分析，识别阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 克服了先前研究表型覆盖窄、多组学验证不足和机制探索不充分的限制，通过全面MR分析识别稳健治疗靶点 | NA | 识别阿尔茨海默病的遗传药物靶点 | 阿尔茨海默病及相关生物标志物、神经影像内表型、认知特征和风险因素 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组, 蛋白质组, 转录组 | 超过50个GWAS数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 5795 | 2025-12-09 |
Ptbp1 is not required for retinal neurogenesis and cell fate specification
2025-Dec-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108331
PMID:41342897
|
研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠视网膜前体细胞中的Ptbp1基因，评估其在发育性神经发生中的作用，发现Ptbp1对视网膜细胞命运决定并非必需 | 首次在体内条件下系统评估Ptbp1在视网膜神经发生中的功能，挑战了Ptbp1作为神经发生核心抑制因子的传统观点 | 研究仅聚焦于视网膜发育，未在其他神经系统或成年神经发生中验证Ptbp1的功能 | 探究RNA结合蛋白Ptbp1在发育性神经发生中的具体作用机制 | 小鼠视网膜前体细胞和Müller胶质细胞 | 发育神经生物学 | NA | 条件性基因敲除、免疫染色、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、剪接模式数据 | 突变型小鼠视网膜组织（具体数量未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5796 | 2025-12-09 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Molecular Mechanisms of Neutrophil Dysfunction in Chronic Bone Infection
2025-Dec-04, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了慢性骨感染中中性粒细胞功能障碍的分子机制 | 首次在MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型中，通过单细胞RNA测序识别出7个中性粒细胞亚群，并发现NeuP2ry10亚群变化最显著，揭示了中性粒细胞向N2抗炎表型极化的分子特征 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性有待验证；单细胞测序样本量可能有限 | 探究慢性骨感染中中性粒细胞功能异常的分子机制 | MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型中的骨髓细胞 | 单细胞组学 | 骨感染 | 单细胞RNA测序，基因本体论分析，通路富集分析，免疫荧光染色，活性氧定量 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5797 | 2025-12-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals a putative lncRNA-associated ceRNA network in high-grade serous ovarian cancer
2025-Dec, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01691-2
PMID:41099994
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了高级别浆液性卵巢癌中一个由长链非编码RNA MIR100HG、微小RNA mir-224-5p和EYA4基因组成的竞争性内源RNA网络，该网络可能通过调控Wnt信号通路促进肿瘤进展 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出癌细胞特异性的竞争性内源RNA网络，并揭示了MIR100HG可能作为mir-224-5p的分子海绵调控EYA4表达的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析和公共数据库验证，缺乏直接的实验功能验证来证实ceRNA网络的具体调控机制 | 识别高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境中活跃的长链非编码RNA相关竞争性内源RNA网络 | 高级别浆液性卵巢癌的癌细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了单细胞RNA测序和批量RNA测序数据集，并利用癌症基因组图谱数据进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5798 | 2025-12-09 |
Spatial Transcriptomics of Patients With Kaposi Sarcoma Identifies Mechanisms of Immune Evasion
2025-Dec, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70728
PMID:41342328
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析卡波西肉瘤（KS）皮肤病变，以识别KSHV感染的细胞类型和免疫相互作用 | 首次将空间转录组学与单细胞RNA测序参考数据集结合，对KS病变进行空间解析的细胞类型反卷积分析，并同时检测人类和KSHV基因表达 | 样本量较小（7个KS肿瘤和6个正常皮肤样本），且仅针对皮肤病变进行分析 | 阐明KSHV感染如何重塑皮肤组织、抑制免疫反应并导致抗癌治疗耐药的潜在机制 | 卡波西肉瘤（KS）患者的皮肤肿瘤组织 | 空间转录组学 | 卡波西肉瘤 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 空间解析的细胞类型反卷积方法 | 空间基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 7个KS皮肤肿瘤样本，6个正常皮肤样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5799 | 2025-12-09 |
Adaptive resampling for improved machine learning in imbalanced single-cell datasets
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.04.686583
PMID:41279118
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研究论文 | 本文提出了一种自适应的重采样方法，用于改善不平衡单细胞数据集中的机器学习性能 | 提出了一种通用的自适应重采样方法，能够基于学习到的潜在结构在线、自适应地重采样数据，以增强单细胞表示学习 | 未明确提及具体限制，可能包括方法在特定数据集或任务中的泛化能力需要进一步验证 | 旨在提高单细胞转录组学数据中机器学习模型的表示学习和预测性能 | 单细胞转录组学数据，特别是基因表达重建、细胞类型分类和扰动响应预测任务 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5800 | 2025-12-09 |
ResNet50 and Single-Cell Multi-Omics analysis identify key cellular and molecular features in pediatric acute lymphoblastic leukemia
2025-Nov, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06675-6
PMID:41125957
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研究论文 | 本研究通过整合基于深度学习的图像分析与单细胞转录组学和T细胞受体测序，揭示了儿童急性淋巴细胞白血病的细胞和分子特征 | 首次将ResNet50深度学习模型用于白血病单细胞图像分类，并与单细胞多组学数据整合，以阐明疾病机制并发现潜在的复发生物标志物 | 未明确说明样本的具体数量或来源，可能限制了结果的普遍适用性 | 解决儿童急性淋巴细胞白血病早期诊断、复发预测和个体化治疗的挑战 | 儿童急性淋巴细胞白血病（ALL） | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组测序, T细胞受体测序 | ResNet50, Grad-CAM | 图像, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |