单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
5781	2024-12-02	The prognostic genes model of breast cancer drug resistance based on single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis 2024-May-25, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s10238-024-01372-6 PMID:38795164	研究论文	本文通过转录组数据分析和单细胞测序，识别并验证了与乳腺癌药物抗性相关的预后基因，并构建了一个基于这些基因的预后模型	本文创新性地结合了转录组分析和单细胞测序数据，识别出与乳腺癌药物抗性相关的预后基因，并构建了一个新的预后模型	本文的局限性在于仅在细胞系中验证了部分基因，未来需要在更多临床样本中进一步验证	研究目的是识别与乳腺癌药物抗性相关的预后基因，并构建一个预测乳腺癌预后的模型	研究对象是乳腺癌及其药物抗性相关的预后基因	数字病理学	乳腺癌	单细胞测序	NA	转录组数据	细胞系和乳腺癌样本
5782	2024-12-02	Fibroblast expression of neurotransmitter receptor HTR2A associates with inflammation in rheumatoid arthritis joint 2024-Apr-25, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s10238-024-01352-w PMID:38662111	研究论文	研究神经递质受体HTR2A在类风湿性关节炎（RA）中的表达及其与炎症的关系	首次探讨了HTR2A在RA中的表达及其与炎症的关系，并发现miRNAs在调节HTR2A表达中的作用	研究主要基于scRNA-seq数据和免疫组化验证，样本量有限，需要进一步的大规模验证	探讨神经递质受体HTR2A在RA中的表达及其与炎症的关系，寻找潜在的治疗策略	类风湿性关节炎（RA）和骨关节炎（OA）患者的滑膜组织和滑液中的细胞	数字病理学	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化染色、qPCR	NA	单细胞RNA测序数据、免疫组化图像	RA和OA患者的滑膜组织样本，以及RA患者滑液中的外泌体样本
5783	2024-12-02	Single-Cell RNA Sequencing Identifies Crucial Genes Influencing the Polarization of Tumor-Associated Macrophages in Liver Cancer 2024, International journal of genomics IF:2.6Q2 DOI:10.1155/2024/7263358 PMID:38938448	研究论文	本研究利用单细胞转录组学技术，识别了影响肝癌中肿瘤相关巨噬细胞极化的关键基因	首次通过单细胞转录组学技术，揭示了PRDM1基因在肝癌肿瘤微环境中调控M2巨噬细胞极化的关键作用	研究主要基于公共数据库的数据，缺乏体内实验验证	探讨肝癌中肿瘤相关巨噬细胞的功能转变及其关键调控基因	肝癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其极化过程	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	74,742个细胞和23,110个基因
5784	2024-12-02	Deterministic evolution and stringent selection during preneoplasia 2023-Jun, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06102-8 PMID:37258665	研究论文	本文通过双等位基因失活TP53模拟胃癌前病变，研究了早期肿瘤发生过程中的确定性进化和严格选择	本文首次在胃器官模型中模拟了TP53失活后的实验进化过程，揭示了早期肿瘤发生中的选择压力和表型收敛现象	研究仅限于胃器官模型，可能无法完全代表人体内的复杂情况	研究早期肿瘤发生过程中的进化机制和选择压力	TP53失活的胃器官模型	数字病理学	胃癌	单细胞测序	NA	基因组数据	多个克隆来源的胃器官培养物，历时2年
5785	2024-12-01	Cancer-cell derived S100A11 promotes macrophage recruitment in ER+ breast cancer 2024-Dec-31, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2024.2429186 PMID:39587886	研究论文	研究揭示了S100A11在ER+乳腺癌中促进巨噬细胞招募的作用	首次发现S100A11在巨噬细胞与癌细胞相互作用中的作用，并证明其作为治疗靶点的潜力	研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证	探讨ER+乳腺癌中巨噬细胞与癌细胞的相互作用	ER+乳腺癌中的巨噬细胞和癌细胞	NA	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	25个ER+乳腺癌样本
5786	2024-12-01	Single-cell atlases reveal leaf cell-type-specific regulation of metal transporters in the hyperaccumulator Sedum alfredii under cadmium stress 2024-Dec-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136185 PMID:39418904	研究论文	研究了镉胁迫下超积累植物Sedum alfredii叶片细胞类型的金属转运蛋白特异性调控	首次生成了Sedum alfredii的全长转录组，并构建了其叶片的首个单细胞图谱	对镉超积累的细胞类型特异性转录调控机制的理解仍有限	探讨镉胁迫下Sedum alfredii叶片细胞类型的特异性转录调控	Sedum alfredii叶片在镉胁迫下的金属转运蛋白调控	NA	NA	PacBio Iso-Seq技术，单细胞RNA测序	NA	RNA	12,616个高质量单细胞样本
5787	2024-12-01	Diethylhexyl phthalate induces immune dysregulation and is an environmental immune disruptor 2024-Dec-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136244 PMID:39442302	研究论文	研究探讨了邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯（DEHP）对免疫系统的干扰作用	首次全面评估了DEHP对小鼠免疫系统的单细胞RNA测序影响，并建立了小鼠盲肠结扎和穿刺模型来研究DEHP对败血症诱导的免疫抑制和器官损伤的影响	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证DEHP的影响	探讨DEHP对免疫系统的干扰作用及其对急性感染和器官损伤的影响	小鼠的脾脏组织和免疫细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠脾脏组织样本
5788	2024-12-01	Pulmonary surfactant biogenesis blockage mediated polyhexamethylene guanidine disinfectant induced pulmonary fibrosis 2024-Dec-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136307 PMID:39488979	研究论文	研究了聚六亚甲基胍（PHMG）消毒剂吸入暴露对肺纤维化的影响及其机制	揭示了PHMG通过破坏自噬流和阻断肺表面活性物质生物合成导致肺纤维化的机制	NA	探讨PHMG消毒剂吸入暴露引起的肺纤维化机制	肺纤维化及其相关机制	NA	肺纤维化	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	NA
5789	2024-12-01	NOVEL ACTIVE PROTEINS FOR SEPSIS PROGNOSIS REVEALED THROUGH ScRNA-seq AND QUANTITATIVE PROTEOMICS 2024-Dec-01, Shock (Augusta, Ga.) DOI:10.1097/SHK.0000000000002408 PMID:38888471	研究论文	通过多组学分析揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白	本研究通过单细胞RNA测序和定量蛋白质组学技术，揭示了与脓毒症预后相关的四种关键蛋白，为靶向治疗策略提供了新的见解	样本量相对较小，可能影响结果的普适性	揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白	脓毒症患者的外周血样本	数字病理学	脓毒症	单细胞RNA测序和定量蛋白质组学	NA	基因表达数据和蛋白质表达数据	脓毒症患者53例，对照组16例
5790	2024-12-01	Huaier-induced suppression of cancer-associated fibroblasts confers immunotherapeutic sensitivity in triple-negative breast cancer 2024-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.156051 PMID:39299097	研究论文	研究探讨了中药华蟾素在三阴性乳腺癌中的治疗作用及其对肿瘤免疫微环境的影响	首次使用单细胞RNA测序系统分析华蟾素对三阴性乳腺癌微环境的影响，并揭示了华蟾素通过抑制癌症相关成纤维细胞向肌成纤维细胞的转变来增强免疫治疗效果	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证华蟾素的效果	探讨华蟾素在三阴性乳腺癌患者肿瘤免疫微环境中的治疗作用	三阴性乳腺癌及其肿瘤免疫微环境	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠模型
5791	2024-12-01	Single-cell RNA transcriptomics reveals Du-Zhong-Wan promotes osteoporotic fracture healing via YAP/β-catenin/VEGF axis in BMSCs 2024-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.155572 PMID:39366157	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了杜仲丸通过YAP/β-catenin/VEGF轴促进骨髓间充质干细胞（BMSCs）的成骨分化和血管生成，从而促进骨质疏松性骨折愈合	本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了杜仲丸在分子水平上促进骨质疏松性骨折愈合的具体机制，特别是YAP/β-catenin/VEGF轴的作用	本研究主要集中在小鼠模型上，未来需要在人体样本中验证这些发现	阐明杜仲丸在单细胞水平上促进骨质疏松性骨折愈合的机制	骨髓间充质干细胞（BMSCs）和内皮细胞（ECs）	数字病理学	骨质疏松症	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠股骨骨折模型样本
5792	2024-12-01	Wogonin mitigates microglia-mediated synaptic over-pruning and cognitive impairment following epilepsy 2024-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.156222 PMID:39547095	研究论文	研究黄酮类化合物Wogonin对癫痫后微胶质细胞介导的突触过度修剪和认知障碍的影响	首次探讨了Wogonin通过AKT/FoxO1通路抑制微胶质细胞的炎症反应和突触吞噬作用，从而减轻癫痫后的突触过度修剪和认知障碍	研究仅在动物模型上进行，尚未在人类中验证其效果	探讨Wogonin对癫痫后微胶质细胞介导的突触修剪和认知功能的影响	癫痫小鼠模型及其认知功能	神经科学	癫痫	单细胞测序	NA	图像	使用Pilocarpine诱导的癫痫小鼠模型，样本量为未知
5793	2024-12-01	Single-cell dissection reveals immunosuppressive F13A1+ macrophage as a hallmark for multiple primary lung cancers 2024-Dec, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70091 PMID:39601163	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了多发性原发性肺癌（MPLC）和单发性原发性肺癌（SPLC）的肿瘤及邻近组织，揭示了MPLC中特异性富集的免疫抑制性F13A1+巨噬细胞亚型	发现了MPLC中特异性富集的免疫抑制性F13A1+巨噬细胞亚型，并揭示了其在塑造免疫抑制性肿瘤微环境和促进肿瘤生长中的作用	NA	探讨多发性原发性肺癌（MPLC）与单发性原发性肺癌（SPLC）之间的分子机制差异	多发性原发性肺癌（MPLC）和单发性原发性肺癌（SPLC）的肿瘤及邻近组织	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	MPLC和SPLC患者的肿瘤及邻近组织样本
5794	2024-12-01	Granzyme K+CD8+ T cells interact with fibroblasts to promote neutrophilic inflammation in nasal polyps 2024-Nov-29, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54685-1 PMID:39614076	研究论文	研究了鼻息肉中GZMK+CD8+ T细胞与成纤维细胞的相互作用，揭示了其促进中性粒细胞炎症的机制	首次发现GZMK+CD8+ T细胞通过表达CXCR4与CXCL12分泌的成纤维细胞相互作用，诱导后者产生中性粒细胞趋化因子，从而促进中性粒细胞炎症	研究仅限于鼻息肉和相关炎症疾病，未探讨其他疾病中的潜在作用	探讨鼻息肉中中性粒细胞炎症的机制	GZMK+CD8+ T细胞与成纤维细胞的相互作用	免疫学	鼻窦炎	单细胞分析、空间转录组学、T细胞受体测序	NA	细胞	未明确提及具体样本数量
5795	2024-12-01	Single-cell multiomics reveals simvastatin inhibits pan-cancer epithelial-mesenchymal transition via the MEK/ERK pathway in XBP1+ mast cells 2024-Nov-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-80858-5 PMID:39604504	研究论文	研究通过单细胞多组学分析，揭示辛伐他汀通过MEK/ERK通路抑制泛癌种上皮-间质转化（EMT）在XBP1+肥大细胞中的作用	首次揭示辛伐他汀通过抑制XBP1+肥大细胞中的MEK/ERK信号通路，逆转泛癌种中的EMT过程	研究主要基于体外实验验证，缺乏体内实验数据支持	探讨肥大细胞在肿瘤微环境中的作用及其在系统治疗中的潜在靶点	肥大细胞及其在泛癌种转移中的作用	数字病理学	泛癌种	单细胞测序	WGCNA和12种机器学习算法	单细胞数据	泛癌种转移的单细胞测序数据
5796	2024-12-01	BOP1: A pivotal prognostic biomarker in clear cell renal cell carcinoma uncovered through integrated bulk and single-cell sequencing 2024-Nov-28, Asian journal of surgery IF:3.5Q1 DOI:10.1016/j.asjsur.2024.10.159 PMID:39613603	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
5797	2024-12-01	Advancing toward a unified eosinophil signature from transcriptional profiling 2024-Nov-27, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiae188 PMID:39213186	研究论文	本文总结了先前在血液和组织中对小鼠和人类嗜酸性粒细胞进行的转录组研究，并讨论了各种方法的优缺点	本文提出了一个统一的嗜酸性粒细胞转录特征，并讨论了未来研究的机会和知识空白	本文主要总结了现有研究，未提供新的实验数据	旨在推进嗜酸性粒细胞生物学研究，并促进跨研究比较	小鼠和人类的嗜酸性粒细胞	NA	NA	单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列	NA	转录组数据	涉及小鼠和人类样本，具体数量未提及
5798	2024-12-01	Functional profiling of murine glioma models highlights targetable immune evasion phenotypes 2024-Nov-27, Acta neuropathologica IF:9.3Q1 DOI:10.1007/s00401-024-02831-w PMID:39592459	研究论文	研究通过功能基因筛选和单细胞转录组学分析，揭示了小鼠胶质瘤模型中的免疫逃逸机制	通过CRISPR基因编辑和机器学习方法，识别了三种关键的癌症内在逃逸机制，并发现了与人类胶质母细胞瘤相似的依赖性	研究主要基于小鼠模型，需要进一步验证在人类患者中的适用性	探讨小鼠胶质瘤模型中的免疫逃逸机制，并寻找潜在的治疗靶点	小鼠胶质瘤模型GL261和CT2A，以及人类胶质母细胞瘤	数字病理学	脑癌	CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、机器学习	机器学习	基因数据、转录组数据	两个小鼠胶质瘤模型（GL261和CT2A），多种免疫细胞（细胞毒性T细胞、自然杀伤细胞、巨噬细胞）
5799	2024-12-01	Sele-targeted siRNA liposome nanoparticles inhibit pathological scars formation via blocking the cross-talk between monocyte and endothelial cells: a preclinical study based on a novel mice scar model 2024-Nov-27, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1 DOI:10.1186/s12951-024-03003-4 PMID:39593088	研究论文	研究开发了一种新型小鼠瘢痕模型，并通过RNA测序和单细胞测序分析，揭示了机械张力和慢性炎症在病理性瘢痕形成中的关键作用，同时开发了靶向E-选择素（Sele）的siRNA脂质体纳米颗粒（LNPs），有效抑制了瘢痕形成	首次开发了一种新型小鼠瘢痕模型（Retroflex Scar Model, RSM），并利用该模型揭示了机械张力和慢性炎症在病理性瘢痕形成中的关键作用，同时开发了靶向E-选择素的siRNA脂质体纳米颗粒（LNPs），为预防病理性瘢痕提供了新的治疗策略	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证其有效性和安全性	探讨病理性瘢痕形成机制，并开发新的治疗策略	小鼠瘢痕模型、E-选择素（Sele）、siRNA脂质体纳米颗粒（LNPs）	NA	创伤和烧伤并发症	RNA测序、单细胞测序、Western blotting、免疫荧光、共免疫沉淀	NA	RNA、蛋白质	小鼠模型、人类病理性瘢痕（Keloid）样本
5800	2024-12-01	Single-cell transcriptome analysis reveals CD34 as a marker of human sinoatrial node pacemaker cardiomyocytes 2024-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54337-4 PMID:39604360	研究论文	本文通过单细胞转录组分析揭示了CD34作为人类窦房结起搏心肌细胞的标志物	首次报道了CD34作为窦房结起搏细胞的细胞表面标志物，并展示了其在干细胞分化培养中对窦房结细胞的富集作用	NA	揭示人类窦房结的细胞和分子组成，特别是寻找窦房结起搏细胞的细胞表面标志物	人类窦房结起搏心肌细胞及其标志物	数字病理学	心血管疾病	单细胞/单核RNA测序	NA	转录组数据	胎儿和人类多能干细胞衍生的窦房结细胞