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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-06-07 |
Monocyte-derived macrophages promote retinal damage after ischemic stroke via IL-1β-dependent mechanism
2026-May, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115676
PMID:41621472
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研究论文 | 本研究利用小鼠模型证明单核细胞来源的巨噬细胞通过IL-1β依赖机制促进缺血性卒中后的视网膜损伤 | 首次阐明单核细胞来源的巨噬细胞在缺血性卒中后视网膜损伤中的关键作用及其IL-1β依赖机制 | 主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;可能未涵盖所有潜在的免疫细胞亚型 | 探究缺血性卒中后视网膜损伤的炎症机制 | 利用中脑动脉闭塞模型模拟缺血性卒中的小鼠视网膜 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, Luminex检测 | NA | RNA测序数据, 图像数据 | 涉及小鼠样本,具体数量未在摘要中说明 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 视网膜bulk RNA测序和单细胞RNA测序使用Illumina平台 |
| 562 | 2026-06-07 |
Mosaic variants in KRAS and STAT5B associated with a mixed phenotype of 2 acquired errors of immunity
2026-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.018
PMID:41628732
|
研究论文 | 该文章报告了一例18岁女性患者携带KRAS和STAT5B体细胞嵌合变异,导致混合性获得性免疫缺陷的病例 | 首次报道两种不同的获得性免疫缺陷(Ras相关自身免疫性白细胞增殖性疾病和非克隆性STAT5B功能获得性疾病)共同导致混合临床表型 | NA | 研究一例携带KRAS和STAT5B功能获得性嵌合变异的独特病例,探讨其与免疫缺陷疾病的关联 | 一名18岁女性患者,患有炎症性肠病、脾肿大、血小板减少、支气管扩张、单核细胞增多和嗜酸性粒细胞增多 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 全基因组测序、靶向扩增子测序、短读长单细胞RNA测序、长读长单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因序列数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 1例患者的纵向血液和组织样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 短读长和长读长单细胞RNA测序 |
| 563 | 2026-06-07 |
Multi-omics identifies an epithelial-B cell cross-talk that drives functional B cell diversion in breast cancer lymph node metastasis
2026-May, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112394
PMID:41610965
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研究论文 | 通过多组学分析揭示乳腺癌淋巴结转移中上皮细胞与B细胞间的相互作用,导致B细胞功能分化 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和体内功能模型,系统描绘乳腺癌转移过程中B细胞状态和相互作用 | NA | 阐明乳腺癌淋巴结转移中B细胞的功能异质性和作用机制 | 乳腺癌原发肿瘤和转移淋巴结中的B细胞 | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据, 图像数据 | 配对的原发肿瘤和转移淋巴结样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 564 | 2026-06-07 |
Depression-related chronic stress promotes ovarian cancer progression via metabolic dysfunction and IRF1-mediated immune suppression
2026-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106471
PMID:41605304
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研究论文 | 探讨抑郁相关慢性应激如何通过代谢功能障碍和IRF1介导的免疫抑制促进卵巢癌进展 | 首次揭示抑郁相关慢性应激通过下调IRF1表达、重塑免疫-代谢微环境促进卵巢癌进展的机制,并提出抗抑郁药联合化疗作为潜在治疗策略 | 未明确说明 | 研究抑郁与卵巢癌进展的关系及抗抑郁药物的潜在治疗价值 | 卵巢癌患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据 | 卵巢癌患者样本及小鼠慢性应激模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 565 | 2026-06-07 |
Spatial Multiomics Reveal Insights Into ADC Efficacy
2026-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70190
PMID:42083302
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综述 | 本文综述了空间多组学技术在抗体-药物偶联物疗效解析中的应用,提出了整合空间读数与机器学习驱动的分析框架 | 创新性在于提出将空间转录组学和蛋白质组学与机器学习/深度学习相结合的综合分析框架,用于预测ADC疗效、毒性和指导下一代ADC设计 | 未明确说明局限性,推测包括空间多组学技术的成本、通量和数据分析复杂性等挑战 | 探讨空间多组学技术在解析ADC作用机制和耐药性中的应用,提出整合分析框架以改善患者分层和治疗设计 | 转移性尿路上皮癌患者中的ADC治疗反应和耐药机制 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 多重蛋白成像, RNA测序 | 机器学习, 深度学习 | 空间转录组数据, 蛋白成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 566 | 2026-06-07 |
Mapping of Neutrophils in Cancers: Insights From Spatial Omics Technologies
2026-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70194
PMID:42095467
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综述 | 本文综述了空间组学技术在癌症中性粒细胞研究中的应用 | 首次系统总结了空间转录组学在肿瘤中性粒细胞研究中的技术进展和应用,并提出了优化测序策略和样本处理的建议 | 未详细讨论不同空间组学技术平台之间的具体性能比较 | 探讨空间组学技术如何深化对肿瘤中性粒细胞在肿瘤微环境中调控机制的理解 | 肿瘤中性粒细胞 | 数字病理学 | 多种癌症类型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 567 | 2026-06-07 |
TNBC Spatial Transcriptomic Analysis across Clinical States Reveals Subtype-Specific Networks and Immunosuppressive Niches
2026-May-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0808
PMID:42100798
|
研究论文 | 通过GeoMx空间转录组学分析不同临床状态的三阴性乳腺癌,揭示亚型特异性网络和免疫抑制微环境 | 首次整合分子亚型、免疫浸润和空间结构,提出免疫-空间分子亚型(ISMS)框架,揭示三阴性乳腺癌在疾病进展中的异质性和免疫-空间可塑性 | NA | 通过空间转录组学分析三阴性乳腺癌在非转移性原发肿瘤、转移性原发肿瘤和淋巴结转移中的转录组和免疫空间变化,以阐明疾病进展机制 | 三阴性乳腺癌患者的非转移性原发肿瘤、转移性原发肿瘤和淋巴结转移样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多个临床状态的肿瘤样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组平台 |
| 568 | 2026-06-07 |
scGHSOM: A Hierarchical Framework for Single-Cell Data Clustering and Visualization
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3593632
PMID:40811172
|
研究论文 | 开发了一个基于层次生长自组织映射的框架scGHSOM,用于单细胞数据的分层聚类和可视化 | 提出了显著属性识别算法以最小化簇内变异并最大化簇间变异,并引入簇特征图和簇分布图两种新可视化工具 | 仅在三个CyTOF数据集上验证性能,未在更多样化的单细胞RNA测序数据上测试 | 解决高维单细胞数据分析中的层次聚类和可视化挑战 | 单细胞数据集,包括CyTOF和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | CyTOF, 单细胞RNA测序 | 层次生长自组织映射 (GHSOM) | 高维单细胞数据 | 三个CyTOF数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 569 | 2026-06-07 |
Bufei formula attenuates airway mucus hypersecretion in COPD through inhibition of TRIM56-mediated ITGB4 ubiquitination
2026-Apr-24, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121215
PMID:41580166
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研究论文 | 研究补肺方通过抑制TRIM56介导的ITGB4泛素化减轻COPD气道黏液高分泌的机制 | 首次发现补肺方活性组分BFF-4通过靶向TRIM56并抑制其介导的ITGB4泛素化来减轻COPD气道黏液高分泌,并利用DARTS技术、单细胞测序和分子对接等先进方法阐明其作用机制 | 未提及具体局限性,可能包括实验动物模型与人体差异、BFF-4的临床转化可行性待验证 | 探究补肺方通过TRIM56介导的泛素化缓解COPD气道黏液高分泌的机制 | 香烟烟雾诱导的COPD小鼠及香烟烟雾提取物诱导的气道上皮细胞 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | DARTS技术、免疫共沉淀、质谱、单细胞测序、分子对接 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | COPD小鼠和体外气道上皮细胞(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 570 | 2026-06-07 |
SPP1+ macrophage-driven interactions shape the tumor microenvironment in lymph node metastatic acral melanoma
2026-Apr-22, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08755-5
PMID:42020397
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示SPP1+巨噬细胞驱动淋巴结节转移性肢端黑色素瘤的肿瘤微环境相互作用 | 首次识别出SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴与S100A8黑色素瘤细胞相互作用,并发现S100A8细胞在转移性肿瘤中为优势恶性亚群,以及抗SPP1疗法在体内可诱导巨噬细胞表型转换并减少肿瘤负荷 | 未明确说明研究局限性 | 研究肿瘤微环境在肢端黑色素瘤淋巴结转移进展中的作用 | 肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和匹配的相邻正常样本,分为淋巴结转移阳性与阴性组 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 治疗初治的肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和匹配正常样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 571 | 2026-06-07 |
SpaNiche: spatial niche analysis to explore colocalization patterns and cellular interactions in spatial transcriptomics data
2026-Apr-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04069-z
PMID:42015285
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研究论文 | 提出SpaNiche空间生态位分析框架,用于探索空间转录组数据中的共定位模式和细胞间相互作用 | 利用图正则化联合非负矩阵分解整合细胞丰度和配体-受体表达信息,并通过共识聚类定义“生态型”,增强多样本空间转录组数据分析的实用性 | 未明确说明 | 开发计算框架以揭示空间转录组中的细胞共定位模式和推断潜在配体-受体相互作用 | 结直肠癌、前列腺癌和早期阿尔茨海默病的脑皮层组织 | 数字病理学 | 结直肠癌, 前列腺癌, 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 572 | 2026-06-07 |
Deciphering the role of circulating inflammatory proteins in myocarditis: Novel strategies for targeted therapy
2026-Apr-15, International journal of cardiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.ijcard.2026.134198
PMID:41605333
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research paper | 使用孟德尔随机化和单细胞RNA测序解析循环炎症蛋白在心肌炎中的作用,为靶向治疗提供新策略 | 首次整合孟德尔随机化与单细胞转录组分析,鉴定了LIF作为心肌炎的因果性炎症蛋白和潜在治疗靶点 | 研究依赖公开数据集,可能受样本异质性和统计效力限制;LIF在心肌炎中的具体机制仍需实验验证 | 探究循环炎症蛋白与心肌炎的因果关系,并评估其作为治疗靶点的转化潜力 | 91种循环炎症蛋白与心肌炎之间的因果关系 | machine learning | cardiovascular disease | GWAS, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA(基于公开GWAS汇总统计数据和GEO数据集,具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 573 | 2026-06-07 |
DAPK2 Regulates PKM2 Phosphorylation at Threonine 45 to Facilitate Disturbed Flow-Induced Atherosclerosis
2026-Apr-14, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了DAPK2通过磷酸化PKM2的Thr45位点调控扰动流诱导的动脉粥样硬化 | 首次发现DAPK2直接磷酸化PKM2的Thr45位点,促进其二聚化和核转位,从而激活内皮炎症反应,为动脉粥样硬化提供新的治疗靶点 | 未在人类动脉粥样硬化样本中验证DAPK2-PKM2轴的临床相关性,且可能涉及其他未识别的下游效应因子 | 阐明DAPK2在振荡剪切应力诱导的内皮细胞活化和动脉粥样硬化中的作用机制 | 人脐静脉内皮细胞、小鼠动脉组织、EC特异性Dapk2敲除小鼠、EC特异性Pkm2突变体小鼠 | NA | 动脉粥样硬化 | 全基因组微阵列、RNA测序、单细胞RNA测序、质谱分析、免疫沉淀、邻近连接实验 | NA | 测序数据、质谱数据 | 人类动脉组织样本和小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 574 | 2026-06-07 |
Macrophage membrane-biomimetic DNA nanocages deliver taurine to reprogram trained immunity for periodontitis therapy
2026-Apr-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114664
PMID:41605382
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研究论文 | 本研究开发了一种巨噬细胞膜仿生DNA纳米笼递送牛磺酸的方法,通过重编程训练免疫来治疗牙周炎 | 首次利用巨噬细胞膜仿生DNA纳米笼精准靶向单核细胞,通过递送牛磺酸纠正牙周炎中失调的训练免疫状态,同时恢复牙周膜细胞的成骨分化和线粒体功能 | 未提及具体限制,但可能包括纳米笼的体内稳定性、长期安全性及临床转化挑战 | 开发一种基于DNA纳米笼的靶向递送系统,用于重编程训练免疫以治疗慢性牙周炎 | 牙周炎患者的外周血单核细胞、M2极化和训练免疫抑制巨噬细胞、牙周膜细胞 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 575 | 2026-06-07 |
Strategies for resolving cellular phylogenies from sequential lineage tracing data
2026-Apr, Theoretical population biology
IF:1.2Q4
DOI:10.1016/j.tpb.2026.01.001
PMID:41554460
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研究论文 | 本文通过模拟和分析顺序编辑的谱系示踪数据,研究在高概率下实现精确系统发育重建的条件 | 首次建模顺序编辑记录系统,并利用模拟和理论分析明确简化距离重建方法可准确解析细胞系统发育的参数范围 | 研究基于模拟和理论,实际实验条件可能与模型假设存在偏差 | 理解顺序编辑记录系统的信息内容并指导实验设计 | 顺序编辑记录系统及细胞系统发育重建方法 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 谱系示踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 576 | 2026-06-07 |
Repeated proliferative events ameliorate age-associated accumulation of DNA damage in HSPCs
2026-Apr, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503337
PMID:41611449
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研究论文 | 探讨反复失血诱导的造血干细胞和祖细胞增殖对年龄相关DNA损伤积累的影响 | 发现反复失血诱导的增殖事件能够激活体内DNA损伤反应并减少双链断裂,而不影响HSPC功能 | 可能未完全模拟自然衰老过程中HSPC增殖的复杂效应,研究主要基于小鼠模型 | 研究造血干细胞和祖细胞增殖率增加对造血系统衰老的影响 | 小鼠造血干细胞和祖细胞及人类scRNA-Seq数据 | 机器学习 | 老年病 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 小鼠样本及人类scRNA-Seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 577 | 2026-06-07 |
The vulnerabilities of chemotherapy resistant pancreatic cancer revealed by organoids of pre- and post-neoadjuvant therapy
2026-Mar-31, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218252
PMID:41565051
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研究论文 | 利用化疗前后的胰腺癌类器官揭示化疗耐药性机制,并发现AG化疗可激活KRAS/MAPK信号通路,为后续靶向治疗提供依据 | 首次建立配对的患者来源胰腺癌类器官模型(化疗前后),揭示AG化疗诱导的KRAS/MAPK信号激活可作为治疗新靶点 | NA | 探究胰腺导管腺癌化疗耐药性的机制及潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌患者的类器官及其异种移植模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、类器官表型数据 | AG治疗患者30例,未治疗患者60例;验证队列29例类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 578 | 2026-06-07 |
Ferroptosis in heart failure: from molecular insights to therapeutic implications
2026-Mar-26, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag019
PMID:41616804
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综述 | 本文综述了铁死亡在心力衰竭中的作用机制及其潜在治疗意义 | 提出了‘铁死亡连接’这一新的概念性机制框架,整合了铁动员、抗氧化崩溃、脂质启动和线粒体/钙放大器形成自我强化循环导致泵衰竭的观点 | 铁死亡与心力衰竭之间的明确因果关系尚未确立,且从基础研究向临床转化仍面临障碍 | 分析现有文献,讨论转化障碍,并提出新的机制框架以促进铁死亡调控在精确心脏保护中的应用 | 心力衰竭动物模型(慢性缺血、压力超负荷、糖尿病、脓毒症、肥胖相关和阿霉素诱导的心肌病模型)及人类心肌和心外膜脂肪组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、脂质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 579 | 2026-06-07 |
ADAMTS7 promotes smooth muscle foam cell expansion in atherosclerosis
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI187451
PMID:41609669
|
研究论文 | 本研究探讨ADAMTS7在动脉粥样硬化中促进平滑肌泡沫细胞扩增的机制 | 首次通过细胞特异性基因敲除和转基因小鼠模型,揭示ADAMTS7通过AP-1/PU.1/CD36调控轴促进平滑肌细胞泡沫细胞形成,从而加剧动脉粥样硬化 | 未详细说明在人类组织中的验证情况,也未探讨其他血管细胞类型(如成纤维细胞)的潜在作用 | 阐明ADAMTS7在动脉粥样硬化中细胞特异性的促动脉粥样硬化机制 | 人类颈动脉粥样硬化斑块组织、平滑肌细胞和内皮细胞特异性基因敲除及转基因小鼠 | 心血管疾病、基因调控 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、RNA测序、转座酶可及染色质测序 | 条件性基因敲除小鼠模型、转基因小鼠模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 人类颈动脉粥样硬化样本(具体数量未说明)、小鼠模型(涉及平滑肌细胞和内皮细胞特异性基因操作) | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序、转座酶可及染色质测序 | NA | NA |
| 580 | 2026-06-07 |
MAP4K2 suppresses antitumor immunity in a pancreatic cancer model by promoting Treg differentiation
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196379
PMID:41615953
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研究论文 | 该研究发现MAP4K2通过促进Treg细胞分化抑制胰腺癌模型中的抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示了MAP4K2通过与DDX39B相互作用、磷酸化DDX39B并诱导其核转位,进而促进Foxp3 RNA剪接和Treg分化的新机制 | 未明确说明研究局限性 | 探究MAP4K2在免疫调节中的体内作用及其对胰腺癌抗肿瘤免疫的影响 | T细胞特异性Map4k2条件性敲除小鼠、Treg特异性Map4k2缺失小鼠、过继转移嵌合小鼠和胰腺癌患者 | 机器学习和生物信息学 | 胰腺癌 | scRNA-seq, 质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据 | T细胞特异性Map4k2条件性敲除小鼠、Treg特异性Map4k2缺失小鼠、过继转移嵌合小鼠及胰腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |