单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 29970 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-07-21 |
Spatial Multiomics Toward Understanding Neurological Systems
2025-Jun, Journal of mass spectrometry : JMS
IF:1.9Q2
DOI:10.1002/jms.5143
PMID:40360168
|
research paper | 该论文探讨了空间多组学技术在理解神经系统动态生物过程中的应用 | 结合代谢组学、转录组学和蛋白质组学，提供更全面的分子景观研究 | 样本制备优化、分子完整性保持以及跨组学数据整合仍存在挑战 | 通过多模态成像技术增强对神经系统和复杂疾病的理解 | 大脑中的细胞类型及其相互作用 | digital pathology | Alzheimer's disease, autism spectrum disorder | mass spectrometry imaging, spatial transcriptomics, spatial proteomics | NA | image, omics data | NA |
| 562 | 2025-07-21 |
Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.20.594981
PMID:38826475
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研究论文 | 利用单细胞转录组学数据，通过细胞类型特异性网络分析，识别与人类骨矿物质密度GWAS关联相关的潜在基因 | 结合单细胞转录组学数据与GWAS结果，识别出21个网络驱动基因，这些基因可能通过间充质细胞分化调控骨矿物质密度 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 解析骨矿物质密度GWAS关联的遗传变异，识别潜在的致病基因 | 多样性远交系小鼠的骨髓基质细胞在成骨条件下的单细胞转录组数据 | 基因组学 | 骨质疏松症 | scRNA-seq, eQTL/sQTL分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多样性远交系小鼠的骨髓基质细胞 |
| 563 | 2025-07-21 |
BCLAF1 restrains stress responses in hematopoietic stem cells to support expansion and repopulation
2025-May-29, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014916
PMID:40435510
|
研究论文 | 本文研究了BCLAF1在造血干细胞（HSC）应激反应中的调控作用及其对HSC扩张和再植能力的影响 | 首次揭示了BCLAF1作为转录调节因子在限制HSC应激反应中的新功能，以保护HSC在胚胎发育和干细胞移植后的再植功能 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类HSC中的适用性尚需进一步验证 | 探究BCLAF1在HSC扩张和再植能力中的调控机制 | 小鼠胎儿和成年造血干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠基因敲除模型 | 基因表达数据 | NA |
| 564 | 2025-07-21 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101260
PMID:40215972
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研究论文 | 利用单细胞测序技术研究CAR信号传导，揭示驱动体内持久性的因素 | 首次系统性地研究了不同ICD架构如何通过单细胞测序在分子水平上指导T细胞功能 | 研究发现的持久性信号特征在实体瘤中不适用 | 解码CAR信号传导的设计原则，优化下一代ICD架构的体内功能 | 工程化T细胞及其表达的嵌合抗原受体（CARs） | 单细胞分析 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 565 | 2025-07-21 |
Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels
2025-May-15, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322100
PMID:40371469
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research paper | 本研究探讨了TRPV4通道在收集淋巴管收缩功能调控中的作用及其在淋巴系统疾病中的病理生理学意义 | 揭示了TRPV4表达髓系细胞（包括LYVE1+巨噬细胞）与淋巴肌细胞或淋巴内皮细胞之间相互作用介导的淋巴收缩失调新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本分析相对有限 | 阐明TRPV4通道在淋巴管功能调控中的分子机制及其在淋巴系统疾病中的作用 | 小鼠收集淋巴管及乳腺癌相关淋巴水肿患者活检组织 | 分子生物学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序、Cre-loxP基因敲除、共聚焦显微镜、离体淋巴管功能实验 | Trpv4fx/fx转基因小鼠模型 | 基因表达数据、显微成像数据、功能实验数据 | 小鼠模型及乳腺癌相关淋巴水肿患者活检样本 |
| 566 | 2025-07-21 |
Identification of maize genes that condition early systemic infection of sugarcane mosaic virus through single-cell transcriptomics
2025-May-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101297
PMID:40045576
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研究论文 | 通过单细胞转录组学技术，研究甘蔗花叶病毒（SCMV）早期系统性感染玉米时，病毒积累与细胞内基因表达变化的共变异模式 | 首次利用单细胞RNA测序技术解析SCMV早期系统性感染过程中玉米细胞的基因表达变化，并鉴定出多个潜在的抗病毒或促病毒因子 | 研究仅关注早期感染阶段（症状出现前），未涉及感染后期或不同环境条件下的宿主-病毒互作 | 揭示植物病毒早期系统性感染的分子机制及宿主基因调控网络 | 甘蔗花叶病毒（SCMV）感染的玉米叶片细胞 | 植物病理学 | 植物病毒感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | SCMV感染的玉米叶片细胞（未明确样本数量） |
| 567 | 2025-07-21 |
Genetics- and age-driven neuroimmune and disc changes underscore herniation susceptibility and pain-associated behaviors in SM/J mice
2025-Apr-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado6847
PMID:40267183
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研究论文 | 该研究通过SM/J小鼠模型探讨了遗传背景和老化对自发性椎间盘突出易感性及疼痛相关行为的影响 | 首次在野生型小鼠中建立了自发性椎间盘突出的病理模型，并揭示了神经免疫和椎间盘变化的分子机制 | 研究仅使用SM/J小鼠这一特定品系，结果可能不适用于其他遗传背景的小鼠或人类 | 探究遗传和年龄因素对椎间盘突出易感性及疼痛行为的分子机制 | SM/J小鼠的腰椎间盘、背根神经节和脊髓组织 | 神经生物学 | 椎间盘疾病 | 转录组学分析、飞行时间细胞计数、单细胞RNA测序 | SM/J小鼠模型 | 基因表达数据、细胞计数数据 | 未明确说明具体数量，但涉及SM/J小鼠的多组织分析 |
| 568 | 2025-07-21 |
3D spatial transcriptomics reveals the molecular structure of input and output pathways in the mouse olfactory bulb
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639192
PMID:40060607
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研究论文 | 利用3D空间转录组学技术重建小鼠嗅球的解剖和分子组织，揭示其对称性结构 | 首次提供了嗅球的全面分子图谱，揭示了其分子结构如何由上皮基因表达程序指导 | 研究仅针对小鼠嗅球，未涉及其他物种或脑区 | 理解嗅球的分子和结构对称性及其与感觉输入和皮层输出通路的关系 | 小鼠嗅球的分子和结构组织 | 神经科学 | NA | 3D空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 近一千个分子上不同的肾小球 |
| 569 | 2025-07-21 |
Accessing genetically defined cell types in the superior colliculus with transgenic mouse lines
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112194
PMID:40212591
|
研究论文 | 本文通过转基因小鼠品系研究了上丘中具有遗传定义的细胞类型 | 利用单细胞转录组学数据验证了形态学和转录组学神经元类型的相关性，并确定了用于遗传靶向上丘神经元类型的有用品系 | 部分测试小鼠中未观察到Cre或荧光表达与特定转录组神经元类型的对应关系 | 研究上丘中不同神经元亚型的功能 | 转基因小鼠品系中的上丘神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 10个转基因小鼠品系 |
| 570 | 2025-07-21 |
Altered baseline immunological state and impaired immune response to SARS-CoV-2 mRNA vaccination in lung transplant recipients
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102050
PMID:40187358
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了肺移植受者在基线状态和接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后的免疫状态，并与健康对照组进行了比较 | 揭示了肺移植受者基线免疫状态与严重COVID-19和败血症相似的免疫特征，并发现这些特征与疫苗反应受损相关 | 研究样本仅限于肺移植受者，可能不适用于其他器官移植患者 | 评估肺移植受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗的免疫反应及其基线免疫状态 | 肺移植受者和健康对照者 | 免疫学 | COVID-19 | 多组学方法，单细胞RNA测序 | NA | 生物标志物数据，单细胞RNA测序数据 | 肺移植受者和健康对照者（具体数量未提及） |
| 571 | 2025-07-21 |
Comparative analysis of nuclei isolation methods for brain single-nucleus RNA sequencing
2025-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.25.645306
PMID:40196571
|
研究论文 | 比较分析用于大脑单核RNA测序的核分离方法 | 首次系统比较了三种不同机制的核分离方法对核完整性和后续数据质量的影响 | 研究仅针对大脑组织，未涵盖其他组织类型 | 评估不同核分离方法对单核RNA测序数据质量的影响 | 大脑组织中的细胞核 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 三种不同核分离方法处理的脑组织样本 |
| 572 | 2025-03-22 |
Spatial Transcriptomics Reveals Differential Inflammatory Pathways in Discoid Lupus Erythematosus and Lichen Planus
2025-Mar-18, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.02.148
PMID:40113031
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 573 | 2025-07-21 |
Integrated 'omics analysis reveals human milk oligosaccharide biosynthesis programs in human lactocytes
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643803
PMID:40166160
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和特定HMO浓度测量，揭示了人类乳腺细胞中母乳寡糖（HMO）的生物合成程序 | 鉴定了已知HMO合成基因在乳腺上皮细胞亚群中的差异表达模式，并提名了几个与HMO浓度变化相关的候选基因，同时发现了可能调控HMO生物合成基因表达的新基因模式和转录因子 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据和有限的HMO浓度测量，未进行实验验证 | 揭示人类乳腺细胞中HMO的生物合成途径 | 人类乳腺细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 |
| 574 | 2025-07-21 |
SUV39H1 maintains cancer stem cell chromatin state and properties in glioblastoma
2025-Mar-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186344
PMID:40059829
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research paper | 该研究揭示了SUV39H1在维持胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）染色质状态和特性中的关键作用，并探讨了其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现SUV39H1通过超级增强子介导的激活在GSCs中高表达，并证明其调控G2/M细胞周期进程、干细胞维持和细胞死亡通路 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞（GSCs） | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq、全细胞RNA-seq、ATAC-seq | 患者来源的异种移植模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了患者来源的GSCs和异种移植模型 |
| 575 | 2025-07-21 |
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration for comprehensive human reference atlas
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.637075
PMID:40093094
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研究论文 | 本文系统评估了单细胞多模态数据整合方法在构建全面人类参考图谱中的应用 | 开发了可解释的机器学习工具scOMM，并系统评估了数据整合策略，发现水平整合和垂直整合对细胞类型识别的不同影响 | 研究主要聚焦于肾脏皮层组织，在其他复杂组织中的适用性有待验证 | 评估单细胞多模态数据整合方法在构建人类参考图谱中的效果 | 肾脏皮层组织的单细胞数据 | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq | scOMM (机器学习工具) | 单细胞多模态组学数据 | 19名捐赠者的119,744个高质量核/细胞 |
| 576 | 2025-07-21 |
Microglial Responses to Alzheimer's Disease Pathology: Insights From "Omics" Studies
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24666
PMID:39760224
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综述 | 本文综述了关于小胶质细胞对阿尔茨海默病病理反应的'组学'研究方法和发现 | 综合应用多种组学技术揭示小胶质细胞在阿尔茨海默病中的异质性和分子模式变化 | 主要基于小鼠模型研究，人类组织研究数据有限 | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 小胶质细胞在阿尔茨海默病中的反应 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、脂质组学、代谢组学 | NA | 组学数据 | NA |
| 577 | 2025-07-21 |
An international perspective on the future of systemic sclerosis research
2025-Mar, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-024-01217-2
PMID:39953141
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review | 本文探讨了系统性硬化症（SSc）研究的未来国际视角，强调了该疾病的复杂性、当前研究的局限性以及新兴技术带来的机遇 | 综述了单细胞RNA测序、下一代测序、空间生物学等新兴技术在SSc研究中的应用潜力，以及全球合作和标准化协议的重要性 | 疾病分类、临床异质性以及缺乏可靠的生物标志物和动物模型是当前研究的主要挑战 | 推动系统性硬化症的诊断、治疗和护理方面的突破 | 系统性硬化症（SSc）患者 | 医学研究 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序、下一代测序、空间生物学、转录组学、基因组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组分析、人工智能 | NA | 分子生物学数据、临床数据 | NA |
| 578 | 2025-07-21 |
Transcriptomic responses of lung mesenchymal cells during pneumonia
2025-Feb-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177084
PMID:39998887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了肺炎期间肺间充质细胞的转录组反应 | 首次全面描述了肺炎期间不同类型肺间充质细胞的转录组变化，揭示了这些细胞的共同反应和特异性反应 | 研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类尚需验证 | 阐明肺间充质细胞在肺炎期间的免疫活动 | 小鼠肺间充质细胞 | 单细胞转录组学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 来自不同处理组(naive、pneumonic、resolved)的小鼠肺间充质细胞 |
| 579 | 2025-07-21 |
Multiple Myeloma Insights from Single-Cell Analysis: Clonal Evolution, the Microenvironment, Therapy Evasion, and Clinical Implications
2025-Feb-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17040653
PMID:40002248
|
综述 | 本文综述了多发性骨髓瘤（MM）的复杂性及异质性，探讨了克隆进化、肿瘤微环境、治疗逃逸机制及其临床意义 | 利用单细胞技术（如单细胞转录组学、基因组学和多组学）深入解析MM的细胞水平异质性，识别罕见细胞群和耐药机制 | 单细胞技术成本高、数据复杂，且临床应用中存在生物信息学标准化和伦理问题 | 增强对MM进展机制的理解，优化个性化治疗策略并改善患者预后 | 多发性骨髓瘤（MM）及其微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学、单细胞基因组学、多组学 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 580 | 2025-07-21 |
Suppressing recurrence in Sonic Hedgehog subgroup medulloblastoma using the OLIG2 inhibitor CT-179
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54861-3
PMID:39904981
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research paper | 研究OLIG2抑制剂CT-179在抑制Sonic Hedgehog亚型髓母细胞瘤复发中的治疗潜力 | 首次证实CT-179通过破坏OLIG2二聚化、磷酸化和DNA结合，改变肿瘤细胞周期动力学，增加分化和凋亡，从而延长生存期并增强放疗效果 | 未明确提及研究样本量是否足够大，以及是否涵盖所有SHH-MB亚型 | 开发针对SHH亚型髓母细胞瘤中OLIG2+肿瘤干细胞的特异性治疗方案 | SHH-MB移植器官样体、PDX和GEM SHH-MB模型 | 肿瘤治疗 | 髓母细胞瘤 | scRNA-seq | PDX和GEM模型 | 转录组数据 | NA |