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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-06-07 |
Network Hypoactivity in ALG13-CDG: Disrupted Developmental Pathways and E/I Imbalance as Early Drivers of Neurological Features in CDG
2026-Jan-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15020147
PMID:41597222
|
研究论文 | 本研究通过诱导多能干细胞来源的人脑类器官模型，揭示了ALG13-CDG中脑特异性低糖基化导致神经发育通路紊乱和兴奋/抑制失衡，进而引发皮层网络功能异常的机制 | 首次整合多组学与电生理分析，阐明ALG13-CDG中脑特异性低糖基化导致早期网络低活性、神经成熟时序错位及代偿性过度兴奋的病理机制 | 未明确说明 | 探究ALG13-CDG中脑特异性低糖基化对神经发育和皮层网络功能障碍的影响 | ALG13-CDG患者来源的诱导多能干细胞分化的人脑类器官 | 数字病理学 | 遗传性疾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 糖蛋白组学, N-聚糖成像, 脂质组学, 代谢组学, 微电极阵列记录 | 类器官 | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 电生理数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 562 | 2026-06-07 |
Integrative Network Analysis of Single-Cell RNA Findings and a Priori Knowledge Highlights Gene Regulators in Multiple Myeloma Progression
2026-Jan-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020793
PMID:41596441
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序结果与先验知识，揭示多发性骨髓瘤进展中的基因调控因子 | 首次将单细胞RNA测序数据与多发性骨髓瘤的先验生物学知识整合，构建合成基因网络图谱，并利用综合影响力指标识别跨疾病阶段的关键调控因子 | 未明确说明，但可能涉及样本量有限或验证不足 | 揭示多发性骨髓瘤从无症状前驱阶段进展为活动性疾病的关键调控因子 | 多发性骨髓瘤患者的CD138浆细胞 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 563 | 2026-06-07 |
Integrated Analyses Identify CDH2 as a Hub Gene Associated with Cisplatin Resistance and Prognosis in Ovarian Cancer
2026-Jan-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020713
PMID:41596365
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研究论文 | 通过整合分析识别出CDH2是与卵巢癌顺铂耐药和预后相关的枢纽基因 | 首次利用转录组数据构建加权基因共表达网络并鉴定出CDH2为与顺铂耐药相关的关键基因，结合单细胞RNA-seq数据验证其在耐药肿瘤细胞亚群中的富集，并通过虚拟筛选识别潜在FDA批准药物 | 主要基于公共数据库和体外实验验证，缺乏大规模临床队列前瞻性验证；CDH2作为耐药标志物的具体分子机制仍需进一步阐明 | 识别与卵巢癌顺铂耐药和预后相关的候选生物标志物并探索其潜在机制 | 卵巢癌顺铂耐药相关的基因表达和免疫微环境特征 | 生物信息学, 数字病理学 | 卵巢癌 | 加权基因共表达网络分析, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, 免疫组化, 虚拟筛选 | 加权基因共表达网络模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | GSE73935数据集（转录组数据）；GSE211956数据集（临床单细胞RNA-seq数据）；A2780/CP70细胞系；顺铂耐药组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 564 | 2026-06-07 |
S2potAE: multimodal spatial spot autoencoder integrating image and transcriptomic features for deconvolution
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag020
PMID:41619214
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研究论文 | 提出S²potAE框架，整合基因表达、空间坐标和组织学图像特征，实现空间转录组斑点的细胞类型去卷积 | 创新性地融合多级特征聚合策略，包括基于图的空间编码器和组织学图像感知嵌入，并引入辅助病理分类任务增强生物学相关性和模型可解释性 | 未明确提及其他局限性，可能依赖高质量的图像和转录组数据，且对复杂组织类型的适应性有待进一步验证 | 解决空间转录组数据处理中颗粒度差异、批次效应和空间异质性导致的细胞类型比例推断难题 | 人类乳腺癌、小鼠大脑前部和人类背外侧前额叶皮层组织 | 机器学习 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 自编码器 | 图像、基因表达数据、空间坐标 | 多个模拟和真实数据集，包括人类乳腺癌、小鼠大脑前部和人类背外侧前额叶皮层样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 565 | 2026-06-07 |
PathCLAST: pathway-augmented contrastive learning with attention for interpretable spatial transcriptomics
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag029
PMID:41627343
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研究论文 | PathCLAST是一种结合通路图与组织病理学图像的对比学习框架，用于空间转录组数据的可解释性分析 | 首次通过双模态对比学习整合基因表达、组织病理学图像和通路图，实现基于通路级别的注意力机制的可解释性空间域识别 | 未提及具体局限性，但可能受限于公共数据集的标注质量及计算资源需求 | 开发能同时利用通路结构和空间匹配组织病理学的空间域识别方法，以提升准确性和生物学可解释性 | 空间转录组数据中的基因表达、组织病理学图像及通路图 | 数字病理学 | 肿瘤（未指定具体类型） | 空间转录组学、对比学习、图神经网络 | 对比学习模型（PathCLAST） | 空间转录组表达数据、组织病理学图像、通路图 | 多个公共数据集（未量化具体样本数） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 566 | 2026-06-07 |
Plant bZIPs in Root Environmental Adaptation: From Single-Cell Expression Atlas to Functional Insights
2026-Jan-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020568
PMID:41596219
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综述 | 本文综述了植物bZIP转录因子在根系环境适应中的作用，从单细胞表达图谱到功能见解 | 整合单细胞RNA测序数据与功能遗传学，揭示了bZIP转录因子在根系细胞中的详细表达模式及其调控网络 | 未提及具体局限性 | 全面概述bZIP转录因子在植物根系环境适应中的功能和调控机制 | 植物bZIP转录因子及其在根系中的表达和功能 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 567 | 2026-06-07 |
Chronic Kidney Disease in Metabolic Disease: Regulation of SGLT2 and Transcriptomic-Epigenetic Effects of Its Pharmacological Inhibition
2026-Jan-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020589
PMID:41596241
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综述 | 探讨SGLT2在代谢性疾病相关慢性肾病中的表达调控及其药物抑制的转录组与表观遗传效应 | 整合SGLT2表达调控、表观遗传机制及单细胞转录组数据，提出SGLT2抑制剂通过恢复能量稳态缓解代谢应激的模型 | 仅有一项人类单细胞RNA测序研究直接关联SGLT2i治疗与肾小管代谢重编程，数据来源有限 | 阐明SGLT2在健康与代谢疾病中的表达调控机制及其药理抑制的转录组与表观遗传后果 | SGLT2表达、肾小管细胞、代谢疾病相关慢性肾病 | NA | 慢性肾病、代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 人类单细胞RNA测序研究（具体样本量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 568 | 2026-06-07 |
Estimates of molecular convergence reveal multiple genes with adaptive variation across teleost fish
2026-Jan-03, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag015
PMID:41604226
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研究论文 | 通过对硬骨鱼类143个染色体级基因组的无监督分析，发现89个编码蛋白基因家族存在趋同进化，并整合多组学数据评估其功能影响 | 首次在硬骨鱼类中利用无监督方法大规模检测趋同进化信号，并联合单细胞转录组和基因扰动实验揭示趋同基因的多效性 | 未具体说明局限性 | 揭示硬骨鱼类适应性进化的分子基础 | 硬骨鱼类的蛋白编码基因家族 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 无监督方法 | 基因组序列、基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 143个染色体级基因组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 569 | 2026-06-07 |
Molecular Mechanisms of DBNL in Heart Failure: From Macrophage Immunometabolism to Therapeutic Implications
2026-Jan-02, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69756
PMID:41553874
|
研究论文 | 利用多组学方法整合孟德尔随机化和单细胞RNA测序，探讨DBNL在心力衰竭中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过多组学整合分析揭示DBNL在心脏巨噬细胞免疫代谢和促纤维化通路中的动态调控作用，并预测吡啶酸作为DBNL潜在调节剂 | 治疗相关性仅基于计算预测，缺乏额外的实验验证和临床前研究来证实DBNL作为治疗靶点的临床疗效 | 寻找心力衰竭的潜在生物标志物和治疗靶点，阐明DBNL在心力衰竭进展中的作用机制 | 心脏巨噬细胞中的DBNL基因表达及其在心力衰竭病理条件下的调控 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 570 | 2026-06-07 |
Itaconate-Related Gene Signatures as Prognostic Markers in Colon Cancer: Insights From Transcriptomic and Spatial Analysis
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/7928082
PMID:41523911
|
研究论文 | 基于转录组和空间分析，首次全面研究衣康酸及Hallmark通路相关基因在结肠癌中的表达、生物学作用和预后价值 | 首次结合批量转录组、单细胞转录组和空间转录组数据，系统分析衣康酸相关基因标志物在结肠癌中的预后作用，并构建优于传统临床特征和已有模型的预后预测模型 | 仅基于公开数据库（TCGA和GEO），需进一步在更大规模、多中心临床样本中验证 | 开发结肠癌的衣康酸相关基因预后标志物，为精准预后和分层治疗提供理论依据 | 结肠癌患者（TCGA数据库448例训练集，GEO数据库1473例验证集） | 计算机视觉 | 结肠癌 | 批量转录组、单细胞转录组、空间转录组、组织微阵列 | 弹性网络（alpha=0.2） | 转录组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、组织微阵列数据 | 448例训练集，1473例验证集（共7个GEO数据集） | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 571 | 2026-06-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Correlation Between Immune Cell Composition and Gene Expression in Cervical Cancer
2026-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70998
PMID:41588920
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序分析揭示宫颈癌中免疫细胞组成与基因表达之间的相关性 | 首次通过单细胞RNA测序全面描绘宫颈癌肿瘤微环境中免疫细胞亚群分布模式，并系统分析关键基因如TNFRSF18与免疫细胞比例的关系 | 样本量可能有限，未明确说明；具体免疫细胞亚群功能验证及因果关系尚需进一步实验 | 探讨基于单细胞RNA测序数据的宫颈癌患者免疫细胞亚群分布模式及其与特定基因表达的相关性 | 宫颈癌患者单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 572 | 2026-06-07 |
Evaluation of the causal effects of PFOS on atherosclerosis and its potential toxicological mechanisms: Integrated Mendelian randomization and network toxicology analysis
2026-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119618
PMID:41601048
|
研究论文 | 结合孟德尔随机化和网络毒理学分析，评估全氟辛烷磺酸对动脉粥样硬化的因果效应及其潜在毒理学机制 | 首次将孟德尔随机化分析与网络毒理学相结合，系统探究PFOS与AS的因果关系及潜在毒理机制 | 数据主要来自公共数据库，可能无法完全反映实际暴露水平和人群异质性 | 阐明PFOS对动脉粥样硬化的因果关系及其毒理学机制，为心血管毒性评估和疾病防治提供科学依据 | 全氟辛烷磺酸与动脉粥样硬化之间的因果关系及潜在毒理学机制 | 机器学习 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化分析、网络毒理学、单细胞RNA测序、分子对接 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用单细胞RNA测序分析动脉粥样硬化斑块中不同细胞亚群的核心靶基因表达 |
| 573 | 2026-06-07 |
Combining multi-omics analysis and network toxicology to explore the role and underlying mechanisms of an environmental pollutant in gastric cancer: A study of Diisononyl Phthalate
2026-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119645
PMID:41601071
|
研究论文 | 通过整合多组学分析与网络毒理学，探究环境污染物邻苯二甲酸二异壬酯在胃癌中的作用及分子机制 | 首次结合计算毒理学、网络毒理学与多组学分析揭示DINP对胃癌的潜在致癌机制，并构建基于四个核心基因的预后风险模型 | DINP的急性细胞毒性较弱，需要进一步验证其长期暴露效应及体内实验数据 | 阐明环境污染物DINP与胃癌之间的分子关联机制 | DINP、胃癌细胞系（AGS）、TCGA-STAD队列样本 | 计算毒理学、网络毒理学、多组学分析 | 胃癌 | 网络毒理学、单细胞RNA测序、qRT-PCR、分子对接 | 预后风险模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | TCGA-STAD队列、AGS细胞系实验数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 574 | 2026-06-07 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Prostate Cancer: Unraveling Mechanisms and Therapeutic Implications
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.073265
PMID:41613792
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综述 | 全面总结前列腺癌中癌症相关成纤维细胞的起源、异质性、功能及治疗意义 | 整合单细胞和空间转录组学的最新进展，提供理解CAF生物学的整体框架，并强调基质重编程作为辅助治疗的可能性 | 未明确说明局限性 | 揭示CAF在前列腺癌中的生物学机制及潜在的靶向治疗策略 | 前列腺癌中的癌症相关成纤维细胞 | NA | 前列腺癌 | 空间转录组学, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组, 空间转录组学 | NA | NA |
| 575 | 2026-06-07 |
From Laser Microdissection to Spatial Glycomics: Lectin Microarray Protocols for Tissue Glycome Mapping with High-End Scanners
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5154-4_3
PMID:41629708
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研究论文 | 提出了将激光显微切割与凝集素微阵列结合的方法，用于福尔马林固定石蜡包埋组织的空间糖组学分析 | 利用高灵敏度倏逝场荧光扫描仪GSR2300提升检测灵敏度并降低背景噪声，实现微尺度组织区域的精确、可重复糖组学分析 | 可能受限于凝集素微阵列的抗体特异性和组织样本的复杂性，需要进一步验证跨平台通用性 | 开发并优化激光显微切割整合凝集素微阵列的工作流程，实现组织糖组图谱的空间解析 | 福尔马林固定石蜡包埋组织样本 | 计算机视觉 | NA | 激光显微切割，凝集素微阵列，荧光扫描 | NA | 图像 | 微米级组织区域（约0.1 mm²区域，5 μm厚度） | NA | 空间糖组学 | GSR2300 | 高端倏逝场荧光扫描仪GSR2300 |
| 576 | 2026-06-07 |
Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for the treatment of chronic active Epstein-Barr virus infection
2026 Jan-Dec, Cell transplantation
IF:3.2Q2
DOI:10.1177/09636897251414206
PMID:41618712
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综述 | 探讨异基因造血干细胞移植治疗慢性活动性EB病毒感染的现状与未来方向 | 通过单细胞测序和嵌合体研究证实EB病毒感染造血干细胞是CAEBV的“种子”细胞，强调allo-HSCT是唯一能根除病毒库并恢复免疫的治愈性疗法 | 移植时机、供者匹配、预处理强度及移植相关并发症对长期预后有显著影响，临床决策需高度个体化 | 为CAEBV患者提供基于allo-HSCT的综合治疗策略，并展望未来降低移植死亡率及改善生存结局的途径 | 慢性活动性EB病毒感染患者 | 机器学习 | EB病毒感染 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 577 | 2026-06-07 |
B3GNT6-Linked Multimodal Signatures Integrate Tissue Morphology and PTM-Related Transcriptomics to Stratify Tumor
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.134004
PMID:42212317
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研究论文 | 开发了一种基于翻译后修饰（PTM）的多模态框架，整合组织形态学和转录组学数据，用于结肠腺癌的预后分层和机制分析 | 首次将PTM相关的转录组学与组织病理形态特征通过自编码器潜在空间融合，构建多模态风险模型，并识别出B3GNT6作为关键预后因子和潜在治疗靶点 | 单中心TCGA数据验证，缺乏独立大型外部队列验证；多模态融合依赖于特定数据集和特征选择方法，泛化性待验证 | 开发基于PTM的多模态预后分层模型并解析结肠腺癌的分子机制 | 结肠腺癌（COAD）患者 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA-seq, 空间转录组学, 自编码器 | 自编码器 | 图像, 文本 | TCGA-COAD队列（训练集+验证集），单细胞RNA-seq GSE132465，空间转录组GSE225857 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 578 | 2026-06-07 |
Pathogenomic analysis reveals clinically relevant epithelial-mesenchymal plasticity in esophageal squamous cell carcinoma
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.125381
PMID:41608573
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研究论文 | 通过整合病理图像、批量RNA测序、单细胞和空间转录组学数据，揭示了食管鳞状细胞癌中与临床相关的上皮间质可塑性 | 首次揭示上皮间质转化在食管鳞状细胞癌中的三种宏观状态及其空间分布，并通过病理图像深度学习模型预测基因空间表达分布，提出靶向干预新策略 | 未明确提及研究局限性，但可能涉及样本量有限或模型临床验证不充分 | 研究食管鳞状细胞癌中上皮间质转化的机制、异质性及临床诊断与干预策略 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织样本及相关基因、细胞类型 | 数字病理学 | 食管癌 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 深度学习模型（基于病理图像） | 病理图像、批量RNA测序数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，可能涉及多个ESCC患者样本 | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 579 | 2026-06-07 |
Targeting CDC42 Protects Mitochondrial Function through KLF2/HIF-1α/PINK1 Signaling in Acute Kidney Injury
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.125930
PMID:41608633
|
研究论文 | 本研究揭示CDC42通过KLF2/HIF-1α/PINK1信号通路保护线粒体功能在急性肾损伤中的作用 | 首次发现CDC42在急性肾损伤中的关键作用，并阐明其通过KLF2/HIF-1α/PINK1转录级联调控线粒体自噬和氧化应激的新机制 | 未明确提及具体局限性，可能包括临床转化验证不足或样本量有限 | 探索CDC42在急性肾损伤中的功能及其分子机制，为治疗提供新靶点 | 肾小管上皮细胞（RTECs）及小鼠急性肾损伤模型（顺铂和缺血再灌注诱导） | 机器学习 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），转录组分析，ChIP实验，双荧光素酶报告基因实验 | NA | 单细胞基因表达数据，转录组数据 | 人类scRNA-seq数据集（未具体说明数量）；小鼠模型（顺铂和缺血再灌注诱导组） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 580 | 2026-06-07 |
Identification of non-cardiomyocytes marker genes in patients with diabetes and cardiomyopathy through single-cell analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0351057
PMID:42247398
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研究论文 | 通过单细胞分析识别糖尿病和心肌病患者的非心肌细胞标志基因 | 首次通过单细胞RNA测序系统揭示非心肌细胞（如NK细胞、平滑肌细胞）在糖尿病性心肌病中的代谢异质性和细胞间通讯网络，并发现PTPRC作为潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 探索非心肌细胞在糖尿病性心肌病中的代谢、炎症和纤维化机制，以发现新的治疗靶点 | 2型糖尿病合并心肌病患者的心脏组织非心肌细胞 | 单细胞分析 | 糖尿病性心肌病 | 单细胞RNA测序 | 无 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量（数据来自GEO数据库） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |