单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 38991 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-04-28 |
Bulliform cells: anatomical, physiological, genetic, and computational perspectives on plants' drought adaptation
2026-Mar-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04984-2
PMID:41857245
|
review | 本综述从解剖学、生理学、遗传学和计算学角度综合探讨了泡状细胞在植物干旱适应中的作用 | 提出了多组学、系统生物学和AI驱动建模的综合框架，用于预测泡状细胞行为以优化作物抗逆性 | 对泡状细胞在复合非生物胁迫下的响应机制以及水分保持与叶片热调节之间的生理权衡的理解仍存在显著知识空白 | 整合泡状细胞的结构、功能和调控知识，推动抗胁迫作物品种的开发 | 泡状细胞（禾本科叶片上的特化表皮运动细胞） | machine learning | NA | 单细胞转录组学、全基因组关联分析、QTL定位 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | 高分辨率成像、单细胞转录组学技术 |
| 562 | 2026-04-28 |
Translation of scRNA-seq to a clinical blood test for infection diagnostics
2026-Feb, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2026.2647154
PMID:41918251
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评论 | 该文章探讨了将单细胞RNA测序转化为临床血液检测用于感染诊断的前景，并介绍了一种新型的单细胞类型特异性比例基生物标志物方法 | 引入了一种名为DIRECT LS-TA的单核细胞特异性基因表达比例基生物标志物方法，无需细胞分选即可可靠量化单细胞类型特异性基因表达，且成本低于单细胞RNA测序 | 文章未提供DIRECT LS-TA方法的详细验证数据或大规模临床试验结果，其临床实用性尚需进一步验证 | 开发一种适用于临床实验室的单细胞类型特异性基因表达检测方法，用于改善发热患者的感染诊断 | 发热患者的外周血单核细胞基因表达 | 机器学习 | 感染性疾病 | 无 | 无 | 基因表达数据 | 无 | 无 | 单细胞RNA测序 | 无 | 无 |
| 563 | 2026-04-28 |
Resolving tooth development at single-cell resolution: advancing dental regeneration
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1785805
PMID:41909121
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综述 | 该文章综述了单细胞转录组学在小鼠和人类牙齿发育中的应用，为牙齿再生提供了理论和策略基础 | 通过单细胞分辨率解析牙齿发育过程，揭示了细胞异质性、谱系轨迹和分子信号网络，为牙科再生提供了新见解 | 未明确提及具体局限性 | 总结单细胞转录组学在牙齿发育研究中的进展，并探讨其在牙齿再生中的应用 | 小鼠和人类牙齿发育的细胞和分子机制 | 数字病理学 | 牙科疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 564 | 2026-04-28 |
Integrative pan-cancer analysis of dipeptidyl peptidase 4 with clinical and in vitro validation in prostate cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1616889
PMID:41909664
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研究论文 | 对二肽基肽酶4在泛癌中的综合生物信息学分析，并在前列腺癌中进行临床和体外验证 | 首次对DPP4进行泛癌水平的综合分析，结合转录组、基因组、免疫基因组及单细胞测序等多维度数据，并利用药物处理实验验证其在前列腺癌中的表达变化 | 未明确提及局限性，但样本量有限（仅97例前列腺癌患者），且仅使用两种前列腺癌细胞系进行体外验证 | 探究二肽基肽酶4在泛癌中的表达模式、免疫调节功能及预后价值，重点验证其在前列腺癌中的作用 | 多种癌症类型的肿瘤组织及前列腺癌患者队列（n=97）的临床样本，以及22Rv1和C4-2前列腺癌细胞系 | 机器学习, 生物信息学 | 前列腺癌, 肺癌, ……（泛癌分析涵盖多种癌症） | qPCR, 免疫组化, 单细胞测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 转录组数据, 基因组数据, 单细胞数据, 图像（免疫组化） | 97例前列腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 565 | 2026-04-28 |
Amplification cycles through innate lymphoid cells at the onset of lupus nephritis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1756560
PMID:41909692
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研究论文 | 基于狼疮易感小鼠的单细胞转录组数据，构建数学模型描述狼疮肾炎中先天免疫细胞的早期动态，揭示先天性淋巴细胞在炎症放大中的作用 | 提出可扩展的数学框架分析免疫细胞相互作用动态，将先天性淋巴细胞作为自身抗体存在下炎症过程的放大器，并通过模型分析揭示正反馈回路、自发炎症事件及环境刺激的影响 | 未提及具体局限性 | 理解狼疮肾炎发病早期的细胞和分子机制，建立定量模型评估疾病严重程度并预测生物治疗反应 | 狼疮易感NZB/W F1小鼠的先天免疫细胞（包括组织相关先天性淋巴细胞和血管相关自然杀伤细胞） | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序 | 细胞间相互作用数学模型 | 单细胞转录组数据 | 狼疮易感NZB/W F1小鼠（具体样本量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 566 | 2026-04-28 |
Organoid-microglia system for modeling the immune microenvironment of the brain and retina
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1747589
PMID:41909700
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综述 | 本文总结了将小胶质细胞整合到神经类器官中的策略，并探讨了其在模拟脑和视网膜免疫微环境中的应用 | 系统总结了共分化和移植等将小胶质细胞整合入神经类器官的方法，并介绍了芯片上器官、空间转录组学和多组学等新兴技术如何增强模型生理相关性 | 未明确指出具体限制，但作为综述，可能缺乏原始实验数据验证 | 探讨用于研究神经免疫相互作用的类器官-小胶质细胞模型的建立和应用 | 脑和视网膜类器官以及小胶质细胞 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍、阿尔茨海默病 | NA | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 567 | 2026-04-28 |
Venous endothelial remodeling mediated by MARCKS promotes angiogenesis and tumor progression in hepatocellular carcinoma: insights from single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1734982
PMID:41909714
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示MARCKS介导的静脉内皮重塑促进肝细胞癌的血管生成和肿瘤进展 | 首次鉴定静脉内皮细胞为肝细胞癌肿瘤血管生成的关键启动子，并基于静脉内皮细胞富集基因构建预后风险模型（VERS），发现MARCKS是潜在治疗靶点 | NA | 理解肝细胞癌内皮细胞异质性，识别肿瘤血管生成的关键调控因子，以改进抗血管生成治疗策略 | 肝细胞癌微环境中的内皮细胞 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 568 | 2026-04-28 |
Molecular mechanism of Danshen injection in treating endometrial fibrosis induced by intrauterine adhesions via the LAMC2-CD44-TGF-β1-SMAD2/3 signaling pathway
2026, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2026.1794215
PMID:42037995
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研究论文 | 本研究探讨丹参注射液通过LAMC2-CD44-TGF-β1-SMAD2/3信号通路治疗宫腔粘连引起的子宫内膜纤维化的分子机制 | 首次阐明丹参注射液通过调控LAMC2-CD44-TGF-β1-SMAD2/3信号通路减轻子宫内膜纤维化，并结合单细胞RNA测序揭示细胞组成和细胞间通讯的变化 | 仅使用动物模型和体外细胞实验，缺乏临床样本验证；未明确丹参注射液的具体活性成分及其直接靶点 | 揭示丹参注射液治疗宫腔粘连导致的子宫内膜纤维化的分子机制 | 宫腔粘连大鼠模型及LPS刺激的子宫成纤维细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠模型样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 569 | 2026-04-28 |
Therapeutic Targeting of Oxidative Phosphorylation in Microsatellite Instability-High Gastric Cancer
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.127225
PMID:42038020
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了微卫星不稳定型胃癌中氧化磷酸化代谢增强的现象，并识别出五个潜在的治疗靶点基因 | 首次在单细胞分辨率下揭示MSI胃癌相较于GS亚型具有增强的氧化磷酸化代谢特征，并利用LASSO回归筛选出五个关键基因，在PDX模型中验证其与肿瘤生长和ATP水平的相关性 | 文章未说明样本量大小及外部验证数据集的多样性，且PDX模型可能无法完全模拟人类肿瘤微环境 | 探究MSI与GS亚型胃癌在肿瘤微环境，特别是代谢重编程方面的差异 | MSI和GS亚型胃癌患者及PDX模型中的肿瘤组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，但包括GS和MSI亚型患者样本及TCGA数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 570 | 2026-04-28 |
An integrated bulk and single-cell transcriptomic analysis reveals stemness-driven immune regulation and therapeutic vulnerability in colorectal cancer
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.132694
PMID:42038026
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研究论文 | 通过整合型转录组分析揭示结直肠癌中干性驱动的免疫调控和治疗脆弱性 | 首次整合批量转录组和单细胞RNA-seq数据，建立基于干性的风险模型，揭示肿瘤干性对免疫调控和治疗反应的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 571 | 2026-04-28 |
Construction of an early diagnostic model for pulmonary hypertension based on aging-related signature genes and identification of potential therapeutic targets
2025-Dec-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28921-7
PMID:41461777
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研究论文 | 基于衰老相关特征基因构建肺动脉高压早期诊断模型并识别潜在治疗靶点 | 首次基于衰老相关基因通过LASSO回归、随机森林和支持向量机三种机器学习方法筛选特征基因，构建高精度诊断列线图，并识别TUL-XXI039作为多靶点潜在治疗化合物 | 研究基于公开数据集和体外模型，需要在更大规模临床样本和体内模型中进行验证 | 开发肺动脉高压的早期诊断生物标志物和基于衰老的靶向治疗策略 | 肺动脉高压患者转录组数据及肺动脉平滑肌细胞体外缺氧模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组分析、单细胞RNA测序、qPCR、分子对接 | LASSO回归、随机森林、支持向量机、列线图 | 基因表达数据 | 多个公开数据集，包括训练队列和独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 572 | 2026-04-28 |
Multi-omics analysis reveals shared diagnostic and therapeutic targets in endometriosis and recurrent implantation failure
2025-Dec-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28877-8
PMID:41462508
|
研究论文 | 通过多组学数据分析揭示子宫内膜异位症和反复植入失败中共有的诊断和治疗靶点 | 首次通过多组学数据分析，识别出与子宫内膜容受性相关的15个枢纽基因，并验证其在子宫内膜异位症和反复植入失败中的诊断潜力 | 未提及具体局限性 | 阐明影响子宫内膜异位症和反复植入失败中子宫内膜容受性的共享分子机制 | 子宫内膜异位症和反复植入失败患者 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症, 反复植入失败 | 多组学分析, 加权基因共表达网络分析, 单细胞测序分析, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 573 | 2026-04-28 |
Exploring the expression and prognostic roles of LAD1 in lung adenocarcinoma
2025-Dec-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-33277-z
PMID:41423496
|
研究论文 | 探索LAD1在肺腺癌中的表达和预后作用 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据全面分析LAD1在肺腺癌中的表达模式和预后价值，并通过实验验证LAD1敲低对细胞迁移和侵袭的影响 | 样本量有限，缺乏LAD1在肺腺癌中作用机制的深入分子生物学验证 | 鉴定肺腺癌的新型生物标志物并理解其潜在机制 | 肺腺癌患者肿瘤组织、相邻正常组织以及A549细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组化染色、siRNA敲低实验 | 列线图模型 | 单细胞基因表达数据、批量基因表达数据、临床病理数据 | 10名肺腺癌患者（scRNA-seq），36名肺腺癌患者（免疫组化） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 574 | 2026-04-28 |
A novel zinc finger protein gene signature for prognostic prediction, tumor microenvironment characterization, and therapeutic response in uterine corpus endometrial carcinoma
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28415-6
PMID:41309884
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研究论文 | 利用锌指蛋白基因构建风险评分模型，用于子宫内膜癌的预后预测、肿瘤微环境表征及治疗反应评估 | 首次系统利用锌指蛋白基因确定子宫内膜癌患者的预后结局，并建立风险评分模型 | 基于公开数据库分析，缺乏独立外部验证队列及前瞻性临床验证 | 开发基于锌指蛋白基因的预后预测模型，评估其在子宫内膜癌中的临床应用价值 | 子宫内膜癌患者 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序、数据非依赖采集定量蛋白质组学分析 | LASSO回归、Cox比例风险回归模型 | 转录组数据、单细胞测序数据、临床数据 | 未明确说明具体样本数量（来自TCGA和GEO数据库的子宫内膜癌样本） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 575 | 2026-04-28 |
Lactylation-related gene signatures define immune heterogeneity and provide diagnostic biomarkers for periodontitis
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30213-z
PMID:41310117
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研究论文 | 通过系统分析牙周炎患者与健康对照的基因表达数据集和单细胞RNA测序数据，鉴定乳酸化相关基因特征，揭示免疫异质性并建立诊断标志物 | 首次系统性地将蛋白质乳酸化修饰与牙周炎的免疫微环境联系起来，通过多级整合分析（包括批量基因表达、单细胞RNA测序和机器学习）识别核心诊断标志物EAF1、NEFL和VIM，并揭示乳酸化相关基因在免疫重塑中的作用 | 数据来源于公开数据集，可能受限于样本大小和异质性；需要更大规模的临床验证来确认诊断标志物的普适性；乳酸化修饰的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究乳酸化相关基因在牙周炎免疫异质性中的作用及其作为诊断标志物的潜力 | 牙周炎患者与健康对照者的牙龈组织和外周血单核细胞 | 机器学习 | 牙周炎 | 基因表达微阵列、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | LASSO回归、随机森林、极限梯度提升 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | GSE10334和GSE16134两个基因表达数据集，以及来自牙周炎患者和健康对照的外周血单核细胞单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 576 | 2026-04-28 |
Cross-species identification of conserved cell-type specific mechanisms during early placenta development in ruminants
2025-Nov-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29895-2
PMID:41298965
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研究论文 | 整合绵羊和牛早期胎盘发育的单细胞RNA测序数据，跨物种鉴定保守的细胞类型特异性机制 | 首次通过跨物种单细胞转录组分析，揭示反刍动物早期胎盘中上皮-间充质转化作为保守关键过程，并发现牛特有的两种滋养层细胞亚群 | 仅依赖已发表的scRNA-seq数据，可能缺少动态时间点或空间信息；未对EMT进行功能验证实验 | 阐明反刍动物早期胎盘发育中保守的细胞类型特异性机制 | 绵羊和牛的早期胎盘组织 | 数字病理学 | 妊娠失败 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 整合绵羊和牛的scRNA-seq数据，具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 577 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA sequencing revealed the association between proximal tubular epithelial cells and renal interstitial cells in chronic kidney disease progression
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28988-2
PMID:41286490
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示近端肾小管上皮细胞与肾间质细胞在慢性肾病进展中的关联 | 首次鉴定出位于S1节段的受损近端肾小管上皮细胞亚群PT_5，并阐明其通过多种配体-受体对与巨噬细胞、成纤维细胞及免疫细胞协同作用，驱动慢性肾病进展的新机制 | 尚需进一步验证PT_5在人体组织中的存在及其与特定间质细胞协调促进疾病进展的分子机制 | 研究受损近端肾小管上皮细胞在慢性肾病发生中的特征及其与间质细胞的协同机制 | 通过腺嘌呤饮食诱导的慢性肾病小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 共使用0.2%腺嘌呤饮食喂养2周、4周和8周的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 578 | 2026-04-28 |
Senescence-related gene signatures in Crohn's disease: integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29727-3
PMID:41286494
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研究论文 | 本研究整合批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，识别与克罗恩病相关的衰老基因特征 | 首次系统性地结合批量与单细胞RNA测序技术，揭示五个衰老相关枢纽基因（STAT1、S100A11、FILIP1L、F3和HPS5）在克罗恩病中的潜在作用及其与免疫浸润的关联 | 未详细说明样本量大小及独立外部数据集的具体来源，可能限制结果的普适性 | 探讨衰老相关基因在克罗恩病中的具体作用及其对预后的影响 | 克罗恩病患者肠道组织样本及小鼠模型 | 计算生物学 | 克罗恩病 | RNA-seq | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 579 | 2026-04-28 |
LRP12 promotes gastric cancer progression through AKT/mTOR signaling and M2 macrophage-mediated immunosuppression
2025-Nov-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28503-7
PMID:41276539
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研究论文 | LRP12通过AKT/mTOR信号通路和M2巨噬细胞介导的免疫抑制促进胃癌进展 | 首次鉴定LRP12为炎症相关预后标志物，并揭示其通过激活AKT/mTOR通路和诱导M2巨噬细胞极化参与胃癌免疫抑制微环境调控 | 研究主要基于公共数据集和体外实验，缺乏大规模临床验证及体内免疫微环境动态分析 | 鉴定胃癌中与炎症反应相关的预后生物标志物并阐明其调节肿瘤免疫微环境的机制 | 胃癌细胞系及患者组织样本 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞转录组测序、多重免疫荧光、免疫组化、Western blot、异种移植模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织图像 | 公共数据集及内部队列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 580 | 2026-04-28 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Neutrophil Clusters Associated with Autoimmune Neuroinflammation
2025-Nov-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8012709/v1
PMID:41333423
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示与自身免疫性神经炎症相关的中性粒细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序技术，在实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中揭示了中性粒细胞的异质性及其在脑靶向自身免疫炎症中的致病性，并发现Saa3/SAA1作为潜在的生物标志物和治疗靶点 | 研究基于小鼠模型，其向人类多发性硬化症的转化应用需要进一步验证 | 阐明中性粒细胞在自身免疫性神经炎症中的致病机制及寻找潜在生物标志物和治疗靶点 | 中性粒细胞，特别是髓系细胞和中性粒细胞中SOCS3缺陷的小鼠模型 | 免疫学与神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠小脑和脊髓的中性粒细胞，包括初始状态和实验性自身免疫性脑脊髓炎模型，以及人类多发性硬化症患者血浆样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |