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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-11-30 |
Proximity-based proteomics (BioID) uncovers the Rho GTPase interactome in kidney podocytes
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1625950
PMID:41306285
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研究论文 | 本研究通过邻近标记技术绘制了肾足细胞中Rho GTPases的相互作用网络 | 首次在足细胞中系统绘制RhoA、Rac1和Cdc42的相互作用组,发现约50%的相互作用是足细胞特有的,并鉴定出KIAA1522作为新型Cdc42效应子和ARHGEF12作为关键RhoA调节因子 | NA | 揭示肾足细胞中Rho GTPases的信号网络及其在足细胞损伤中的作用机制 | 人类肾足细胞、HEK293细胞、HeLa细胞、斑马鱼模型 | 蛋白质组学 | 肾脏疾病 | 邻近依赖性生物素标记(BioID)、单细胞RNA测序、基因敲除 | NA | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据 | NA | NA | 邻近标记蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 562 | 2025-11-30 |
A metabolic-radioimmune signature predicts therapy response and immune reprogramming in non-small cell lung cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1693277
PMID:41306526
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据建立基于放射抵抗相关代谢基因的预后特征,用于预测非小细胞肺癌的放疗反应和免疫治疗疗效 | 首次系统描绘放疗诱导的肿瘤微环境代谢重编程全景图,并构建具有预后预测价值的放射抵抗相关代谢基因特征 | 研究主要基于回顾性数据分析,需要更多前瞻性临床研究验证 | 优化非小细胞肺癌治疗分层和放射增敏剂发现 | 非小细胞肺癌肿瘤细胞、免疫细胞和肿瘤引流淋巴结 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 分子对接, qRT-PCR, 蛋白质印迹 | Cox回归模型, WGCNA, 诺莫图 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA放疗队列和独立放射免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 563 | 2025-11-30 |
Targeting Matrix Metalloproteinase-9 to Alleviate T Cell Exhaustion and Improve Sepsis Prognosis
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0996
PMID:41306770
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研究论文 | 本研究通过构建分子互作扰动网络,首次揭示脓毒症免疫异质性的网络生物学基础,并确定单核细胞来源的MMP9是驱动CD4 T细胞功能障碍的关键调节因子 | 首次构建脓毒症免疫异质性的分子互作扰动网络,发现MMP9通过双重机制调控T细胞耗竭,并验证选择性MMP9抑制剂可逆转T细胞功能障碍 | NA | 阐明脓毒症免疫异质性的分子机制并寻找有效治疗靶点 | 人类外周血样本和免疫细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,功能验证 | NA | 转录组数据,蛋白质数据,功能实验数据 | 1,862例人类外周血样本,超过450,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 564 | 2025-11-30 |
Ocular surface health and disease: insight from single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1683167
PMID:41306916
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在眼表组织健康与疾病研究中的原理、应用及局限性 | 首次系统总结scRNA-seq在眼表组织细胞多样性解析和疾病机制研究中的综合应用 | 技术本身存在检测灵敏度限制和细胞捕获偏差,且眼表组织样本获取难度较大 | 探讨单细胞RNA测序技术在眼表组织研究和疾病机制解析中的应用价值 | 眼表组织(角膜、睑板腺、结膜、泪腺)及相关疾病 | 单细胞组学 | 眼表疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 565 | 2025-11-30 |
Multi-omics reveals that NOTCH1 promotes cervical cancer progression and reduces radiosensitivity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1703032
PMID:41306984
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了NOTCH1在促进宫颈癌进展和降低放疗敏感性中的作用机制 | 首次从单细胞水平揭示NOTCH1在宫颈癌恶性细胞中的表达特征及其通过MIF配体-受体通路影响浆细胞分化的新机制 | NA | 阐明NOTCH1在宫颈癌进展和放疗抵抗中的分子机制 | 宫颈癌组织和细胞系 | 生物医学 | 宫颈癌 | 单细胞测序,cDNA微阵列,高通量测序,免疫组织化学 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 566 | 2025-11-30 |
The Role of Vitamin D Metabolism-Related Genes in Recurrent Pregnancy Loss and Their Immune Microenvironmental Changes
2025, Journal of multidisciplinary healthcare
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/JMDH.S541670
PMID:41307047
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析揭示了维生素D代谢相关基因DOCK11和ETV2在复发性流产中的作用机制 | 首次将维生素D代谢基因与复发性流产的免疫微环境变化联系起来,并发现DOCK11和ETV2作为新型生物标志物 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床验证 | 阐明维生素D代谢在复发性流产发生中的潜在机制 | 复发性流产患者的基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 复发性流产 | 转录组测序, RT-qPCR, Western blotting, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习, 孟德尔随机化 | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 567 | 2025-11-30 |
Multi-omics integration in disease research
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.012
PMID:41314746
|
综述 | 本章重点阐述多组学整合在理解阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化等神经退行性疾病生物学机制中的价值 | 通过整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据,结合单细胞测序、空间转录组学等高通量工具,重建连接遗传风险、基因调控、蛋白质功能障碍和代谢失衡的分子网络 | 面临数据异质性和标准化有限的挑战 | 推进神经退行性疾病研究中的个性化策略 | 阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化(ALS)等神经退行性疾病 | 多组学整合 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序,空间转录组学,质谱分析,基因组学,转录组学,蛋白质组学,代谢组学 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据,代谢组数据,神经影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 568 | 2025-11-30 |
Precision medicine in neurodegenerative diseases: From research to clinical practice
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.006
PMID:41314744
|
综述 | 本章概述精准医学如何重塑神经退行性疾病的认知、诊断和治疗方式 | 整合基因治疗、药物基因组学和个性化生活方式策略,并引入单细胞转录组学、数字孪生等未来工具 | 存在试验设计、数据整合、不平等获取和监管障碍等应用挑战 | 推动精准医学在神经退行性疾病领域从研究向临床实践转化 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和亨廷顿病等神经退行性疾病患者 | 精准医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、成像技术、数字工具、生物标志物分析 | 数字孪生 | 遗传数据、分子数据、生物标志物、临床特征、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 569 | 2025-11-30 |
Desmosome mutations impact the tumor microenvironment to promote melanoma proliferation
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.19.558457
PMID:37786690
|
研究论文 | 本研究揭示了桥粒基因突变通过影响肿瘤微环境促进黑色素瘤增殖的新机制 | 首次发现桥粒基因在人类癌症中的高频突变,并阐明其通过改变角质形成细胞的微环境促进黑色素瘤增殖 | 研究主要基于原发黑色素瘤样本,未在转移性黑色素瘤中观察到相同现象 | 探究桥粒基因突变在黑色素瘤发生发展中的作用机制 | 人类黑色素瘤样本、角质形成细胞与黑色素瘤细胞共培养体系 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、蛋白质免疫荧光、基因敲低、细胞共培养 | 细胞共培养模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据、细胞增殖数据 | 未明确样本数量的人类黑色素瘤活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 570 | 2025-11-29 |
The tumor microenvironment in lung cancer: Heterogeneity, therapeutic resistance and emerging treatment strategies (Review)
2026-Jan, International journal of oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.3892/ijo.2025.5824
PMID:41312736
|
综述 | 本文全面分析肺癌肿瘤微环境的异质性及其在治疗抵抗中的作用,并探讨针对TME的新兴治疗策略 | 整合多组学数据和空间转录组学推动TME导向的个体化治疗策略发展 | NA | 探讨肺癌肿瘤微环境在治疗抵抗中的作用机制及靶向治疗策略 | 肺癌肿瘤微环境(包括免疫细胞、基质成分、细胞外基质和生物活性分子) | 肿瘤学 | 肺癌 | 多组学分析、空间转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 571 | 2025-11-29 |
Single-Cell Atlas of Aging Human Skin Reveals FOSB-Related Transcriptional Programs and Druggable Targets
2025-Dec, Journal of cosmetic dermatology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jocd.70569
PMID:41293818
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类皮肤衰老图谱,揭示FOSB相关转录程序和可药物靶点 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示人类皮肤衰老的转录调控网络,发现FOSB作为关键衰老相关转录因子 | 样本数量有限,仅比较年轻和老年组,缺乏中间年龄段数据 | 研究人类皮肤衰老的细胞类型特异性转录调控机制和潜在治疗靶点 | 年轻和老年人皮肤细胞 | 单细胞基因组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年人类皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 572 | 2025-11-29 |
Molecular landscape of the mouse adrenal gland and adjacent adipose tissue by spatial transcriptomics
2025-Nov-28, Folia histochemica et cytobiologica
IF:1.7Q4
DOI:10.5603/fhc.108988
PMID:41311243
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术构建了成年雄性小鼠肾上腺及其周围脂肪组织的高分辨率分子图谱 | 首次提供了成年雄性小鼠肾上腺的空间分辨转录组参考图谱,揭示了肾上腺分区、更新和区室间相互作用的细胞和分子框架 | 研究仅使用CD1 IGS雄性小鼠,未涉及其他品系或雌性动物 | 解析肾上腺分区和皮质更新的分子机制 | 成年CD1 IGS雄性小鼠的肾上腺及周围脂肪组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 无监督聚类、差异基因表达分析、细胞类型反卷积、伪时间轨迹推断 | 空间转录组数据 | 成年CD1 IGS雄性小鼠肾上腺组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium CytAssist平台 |
| 573 | 2025-11-29 |
Antibody Generation Using Cancer-Derived Small Extracellular Vesicles (sEVs): A Platform for Targeted Cancer Therapy and Potential Personalized Applications
2025-Nov-28, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506918
PMID:41311345
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研究论文 | 开发了一种利用癌症来源的小细胞外囊泡生成肿瘤靶向单克隆抗体的新方法,并验证其在靶向癌症治疗中的效果 | 首次使用癌症来源的小细胞外囊泡作为免疫原生成肿瘤靶向抗体,并将这些抗体修饰到载药T细胞囊泡上实现靶向治疗 | 研究仅使用卵巢癌细胞系OVCAR-8,尚未在其他癌症类型中验证 | 开发更有效的肿瘤靶向配体以提高实体瘤药物递送效率 | 人卵巢癌细胞系OVCAR-8、小鼠模型 | 靶向治疗 | 卵巢癌 | 杂交瘤技术、RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、成像数据 | OVCAR-8肿瘤荷瘤小鼠 | NA | 空间转录组学,RNA测序 | NA | NA |
| 574 | 2025-11-29 |
Multi-omics approaches including single-cell analysis and machine learning were used to identify the roles of telomere-related genes in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Nov-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04047-0
PMID:41313509
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研究论文 | 通过多组学方法和机器学习识别端粒相关基因在食管鳞状细胞癌中的预后价值 | 首次系统分析端粒相关基因在ESCC中的表达模式,结合单细胞分析和三种机器学习算法构建预后风险模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究验证 | 开发食管鳞状细胞癌的预后预测模型并探索肿瘤免疫微环境异质性 | 食管鳞状细胞癌患者 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,机器学习,定量实时PCR | LASSO回归,支持向量机,随机森林 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床信息 | 来自TCGA和GEO数据库的ESCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 575 | 2025-11-29 |
Decoding epithelial-T cell interactions in colorectal cancer through single-cell and spatial transcriptomics
2025-Nov-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04083-w
PMID:41313518
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学数据,揭示结直肠癌中上皮细胞与T细胞相互作用的时空特征 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学系统解析结直肠癌上皮-T细胞相互作用的时空架构 | 样本量相对有限(36例患者),需更大队列验证发现 | 解析结直肠癌肿瘤微环境中上皮细胞与T细胞的相互作用机制 | 36例结直肠癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Seurat, Harmony, CytoTRACE, Slingshot, CellChat, CellTrek | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 36例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 576 | 2025-11-29 |
Integrated Aerobic Exercise and Multisensory Environment Training for Age-related Cognitive Decline via Hippocampal-prefrontal Neural Circuit Modulation
2025-Nov-28, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05302-9
PMID:41313574
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研究论文 | 本研究开发了一种结合有氧运动和多感官环境训练的新型干预方法,通过调节海马-前额叶神经回路改善年龄相关认知衰退 | 首次将有氧运动与多感官环境训练相结合,并揭示了海马-前额叶神经回路在此过程中的关键作用机制 | 研究仅使用老年小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索联合训练改善年龄相关认知衰退的神经机制 | 老年小鼠 | 神经科学 | 老年性疾病 | 神经回路追踪、化学遗传学、单细胞测序 | 动物模型 | 神经活动数据、基因表达数据 | 老年小鼠群体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 577 | 2025-11-29 |
Multiplexed Transcriptomics for Screening Drug Combinations and Defining the Mechanism of Action of HCC Therapeutics at Single-Cell Resolution
2025-Nov-27, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70148
PMID:41308634
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研究论文 | 本研究利用高通量单核测序平台筛选肝癌治疗药物组合,并通过单细胞转录组学分析揭示HY组合通过诱导铁死亡抑制肿瘤细胞增殖的机制 | 首次将高通量单细胞筛选与机制解析相结合,在单细胞分辨率下系统评估药物组合对肝癌细胞的影响并发现JUN是关键调控因子 | 研究主要聚焦于HY药物组合,其他潜在有效组合可能需要进一步探索 | 筛选抗肝癌药物组合并阐明其作用机制 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单核测序,单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | snHH-seq | 高通量高灵敏度单核测序平台 |
| 578 | 2025-11-29 |
Retinoic Acid Reprograms Mast Cells Toward a Proinflammatory State to Enhance Antitumor Immunity
2025-Nov-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509340
PMID:41309490
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了肥大细胞在肿瘤微环境中的异质性,并发现视黄酸信号通过RARα-CIITA通路驱动肥大细胞向促炎状态重编程 | 首次系统鉴定促炎性肥大细胞亚群,揭示视黄酸-RARα-CIITA信号轴在肥大细胞重编程中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据,功能验证需要进一步实验支持 | 探究肥大细胞在肿瘤免疫中的分子特征和功能多样性 | 人类十种癌症类型中的肥大细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 十种癌症类型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 579 | 2025-11-29 |
Construction of a Multitissue Cell Atlas Reveals Cell-Type-Specific Regulation of Molecular and Complex Phenotypes in Pigs
2025-Nov-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504961
PMID:41309493
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研究论文 | 构建了猪多组织细胞图谱,揭示细胞类型特异性调控对分子和复杂表型的影响 | 首次在猪中构建大规模单细胞转录组图谱,发现细胞类型特异性eQTL与复杂性状的关联,并揭示猪人类同源基因对人类复杂表型的遗传力富集 | 仅基于19个组织的样本,可能未覆盖所有猪组织类型;样本数量相对有限 | 系统解析猪组织细胞异质性和细胞类型特异性调控机制 | 猪多组织细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA-seq数据 | 229,268个高质量细胞核来自19个组织,3,921个批量RNA-seq样本来自17个匹配组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 580 | 2025-11-29 |
scPER: A Rigorous Computational Approach to Determine Cellular Subtypes in Tumors Aligned With Cancer Phenotypes From Total RNA Sequencing
2025-Nov-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514502
PMID:41309494
|
研究论文 | 开发了一种名为scPER的计算方法,通过整合单细胞RNA测序数据来估计肿瘤微环境细胞组成并识别与表型相关的细胞亚群 | 结合对抗自编码器和极端梯度提升技术,能够从混杂因素中分离真实信号,在细胞比例估计方面优于现有多种方法 | NA | 开发一种严谨的计算方法来确定与癌症表型一致的肿瘤细胞亚型 | 肿瘤微环境中的细胞组成和表型相关细胞亚群 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,总RNA测序 | 对抗自编码器,极端梯度提升 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |