单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 41493 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-07-08 |
Inhibition of the p38/JNK MAPK pathway mediated by circadian rhythm genes: Study of the mechanism of Linggan Wuwei Jiangxin decoction in the treatment of COPD
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121349
PMID:41672117
|
研究论文 | 探讨苓甘五味姜辛汤通过调控昼夜节律基因抑制p38/JNK MAPK通路治疗慢性阻塞性肺疾病的机制 | 首次结合代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序、WGCNA、机器学习算法及分子动力学模拟，系统揭示了苓甘五味姜辛汤通过调节昼夜节律基因Bmal1和Per2抑制p38/JNK MAPK通路从而缓解COPD炎症的分子机制 | 主要基于大鼠模型和细胞实验验证，缺乏临床患者样本验证；未深入探讨其他潜在活性成分的协同作用 | 阐明苓甘五味姜辛汤防治慢性阻塞性肺疾病的分子作用机制 | 慢性阻塞性肺疾病大鼠模型及CS和LPS刺激的BEAS-2B细胞模型 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | UPLC-MS/MS, 代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, Western blotting, RT-PCR, ELISA | WGCNA, 机器学习算法 | 代谢组学数据、转录组学数据、单细胞RNA测序数据、分子对接数据 | 大鼠模型和BEAS-2B细胞系，具体样本量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 562 | 2026-07-08 |
Single-cell and bulk omics uncover fibroblast heterogeneity and HSPH1 as a key driver in Barrett's esophagus to esophageal adenocarcinoma progression
2026-May-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04319-x
PMID:42108450
|
研究论文 | 该研究整合了单细胞RNA测序与批量转录组数据，揭示了食管腺癌从巴雷特食管进展过程中成纤维细胞的异质性，并确定HSPH1为关键驱动因子 | 首次通过单细胞与批量组学整合分析揭示了成纤维细胞异质性在BE向EAC进展中的作用，并鉴定出HSPH1作为关键预后标志物和治疗靶点 | 未明确说明研究局限性 | 探究食管腺癌从巴雷特食管进展的分子机制，识别诊断生物标志物和治疗靶点 | 食管腺癌和巴雷特食管患者的组织样本及细胞系 | 机器学习 | 食管腺癌, 巴雷特食管 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫组织化学, 体外功能实验 | 多重机器学习算法, 共识聚类, 配体-受体分析 | 基因表达数据, 免疫组化图像 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 563 | 2026-07-08 |
Histone deacetylases and cell-cycle regulators orchestrate cell-identity transitions during Arabidopsis root regeneration
2026-05-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.03.013
PMID:41889170
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序、ATAC测序、成像和突变体分析，描述了拟南芥根再生过程中细胞重编程的轨迹 | 揭示了组蛋白去乙酰化酶HDA9和HDA19在早期再生中关闭旧细胞身份和抑制应激反应的作用，以及DOF转录因子OBP1和SMR蛋白调控细胞分裂速率以促进新身份获取的机制 | 未明确说明 | 探究拟南芥根再生过程中细胞身份转变的机制 | 拟南芥根再生过程中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据，染色质可及性数据，图像 | 未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和单细胞ATAC测序 |
| 564 | 2026-07-08 |
Bispecific T-cell Engager (CD3 × EGFR)-Based Triplet Therapy Unlocks CD40/CD40L Crosstalk to Revert Immunosuppression in Third-Generation EGFR-Tyrosine Kinase Inhibitor-Refractory NSCLC
2026-May, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2026.103607
PMID:41672197
|
研究论文 | 该研究提出一种基于双特异性T细胞衔接器（CD3×EGFR）的三联疗法，通过激活CD40/CD40L通路逆转免疫抑制，以克服第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌 | 首次将双特异性T细胞衔接器、组蛋白去乙酰化酶抑制剂和4-1BB激动剂联合应用，通过CD40-CD40L轴重新编程肿瘤微环境，解决T细胞衔接器在免疫抑制微环境中的局限性 | 样本量有限且主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证；部分耐药机制尚未明确；三联疗法的长期效果和安全性需评估 | 开发新型三联疗法以恢复T细胞抗肿瘤活性，解决第三代EGFR-TKI耐药后免疫抑制问题 | 第三代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌患者样本及人源化NOG-EXL小鼠模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非小细胞肺癌患者临床样本及人源化小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序平台 |
| 565 | 2026-07-08 |
Acinar Metaplastic Cells Generate Semi-Homogeneous Niches and Interact With Immune Cells
2026-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.12.014
PMID:41758082
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了胰腺腺泡化生细胞在半均匀生态位中的分布及其与免疫细胞的相互作用 | 首次发现化生细胞在病变中非随机分布，相同类型细胞倾向于聚集，并揭示了特定化生细胞亚型与免疫抑制性中性粒细胞和巨噬细胞的密切互作 | 未明确说明，但可能包括样本量有限或机制验证不足 | 探索胰腺腺泡化生细胞的异质性分布、细胞间相互作用及其与基质和免疫细胞的交叉对话 | 小鼠和人类的胰腺组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、苏木精-伊红染色 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、组织图像 | 小鼠和人类样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 566 | 2026-07-08 |
Activation of the Integrin αV-YAP-CTGF Axis in Liver Sinusoidal Endothelial Cells Promotes Liver Fibrogenesis, Leading to Portal Hypertension and Liver Carcinogenesis in Congestive Hepatopathy
2026-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.11.014
PMID:41758081
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了肝窦内皮细胞中整合素αV-YAP-CTGF轴在淤血性肝病中促进肝纤维化、门静脉高压和肝癌发生的机制 | 首次阐明肝窦内皮细胞中的整合素αV-YAP-CTGF轴在淤血性肝病纤维化中的上游作用，并发现CTGF在内皮细胞中的表达可诱发肝星状细胞的胶原上调 | 研究主要基于小鼠模型和少量临床样本，可能无法完全反映人类疾病的长期过程，且空间转录组学的分辨率有限 | 阐明淤血性肝病的分子机制，重点关注肝窦内皮细胞的作用 | 小鼠肝脏和人类Fontan相关肝病患者的肝脏样本 | 数字病理学 | 肝硬化， 肝癌 | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（部分下腔静脉结扎）和人类Fontan相关肝病患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和10x Visium空间转录组学 |
| 567 | 2026-07-08 |
Trans-Phylum Single Cell Orthology Reveals Conserved Ovarian Cell States Between Sea Urchin and Human
2026-05-01, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag105
PMID:42037535
|
研究论文 | 通过跨门类单细胞同源性分析，揭示海胆与人类卵巢细胞状态的保守性 | 首次整合海胆成年卵巢与人类胎儿及成年卵巢单细胞RNA-seq数据集，利用SAMap分析证明跨物种卵巢细胞状态和基因表达的高度保守性 | 未明确说明，但可能包括物种间比较的局限性及数据整合方法的技术限制 | 比较海胆与人类卵巢的细胞状态，探索生殖策略差异及其对生殖衰老治疗的启示 | 海胆成年卵巢与人类胎儿和成年卵巢的单细胞RNA-seq数据 | 单细胞转录组学 | 生殖衰老 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 海胆成年卵巢样本；人类胎儿和成年卵巢样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 568 | 2026-07-08 |
Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity and limits of marker-based assessment in retinal ganglion cell-enriched organoid cultures
2026-Apr-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01488-3
PMID:42062849
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示视网膜神经节细胞富集类器官培养中的细胞异质性和基于标记物评估的局限性 | 首次利用单细胞RNA测序全面表征视网膜神经节细胞富集类器官培养的细胞组成，发现基于标记物评估可能高估RGC身份，并揭示了部分特化的RGC状态和非目标细胞群 | 样本间存在显著变异，且未完全确定功能性RGC亚型的规范程度 | 评估视网膜神经节细胞富集类器官培养的细胞组成和发育保真度 | 人类多能干细胞来源的视网膜类器官衍生的视网膜神经节细胞富集培养物 | 单细胞基因组学 | 视网膜神经疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 4个样本，共73,642个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 569 | 2026-07-08 |
Single-cell transcriptomics brings stroke thrombi into cellular and molecular focus: A commentary on "characterizing stroke clots using single-cell sequencing"
2026-Apr-10, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X261437925
PMID:41958358
|
评论 | 本文评论了Renedo等人利用单细胞RNA测序对人类缺血性卒中血栓进行表征的研究，揭示了血栓并非惰性栓塞物质，而是具有结构化免疫活性的微环境 | 强调单细胞转录组学为卒中血栓研究带来细胞和分子层面的新视角，指出血栓保留病因特异性细胞和功能特征 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 评论单细胞转录组学在卒中血栓研究中的应用价值 | 人类缺血性卒中血栓样本 | 单细胞转录组学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 570 | 2026-07-08 |
Targeting HSPB1 inhibits tumor growth and abrogates Treg-mediated tumor immunosuppression
2026-Apr-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116333
PMID:41671620
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq、TCGA WGCNA和空间转录组学，鉴定HSPB1为结直肠癌中调控Treg/CD8+ T细胞比例的关键因子，并证明靶向HSPB1可抑制肿瘤生长并解除Treg介导的免疫抑制 | 首次发现HSPB1通过CCL20-CCR6轴调控Treg募集，从而维持肿瘤免疫抑制微环境，并验证其双重抗肿瘤作用 | 研究主要基于小鼠皮下肿瘤模型和体外实验，缺乏临床样本验证及HSPB1抑制剂的长期安全性数据 | 探究结直肠癌中Treg/CD8+ T细胞比例失衡的分子调控机制 | 结直肠癌肿瘤细胞、Treg细胞、CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑, 多重流式细胞术, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 结直肠癌患者肿瘤样本（具体数量未明确）以及MC38和SW480细胞系 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学 |
| 571 | 2026-07-08 |
Fibroblast Activation Protein Promotes Thoracic Aortic Dissection via PLAUR/ITGB1-Mediated Pro-inflammatory Macrophage Polarization
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514786
PMID:41674342
|
研究论文 | 本研究揭示成纤维细胞激活蛋白通过非酶促机制促进胸主动脉夹层，涉及FAP/PLAUR/ITGB1/FAK信号轴介导的成纤维细胞-巨噬细胞互作与促炎性巨噬细胞极化 | 首次发现FAP通过非酶促位点直接结合巨噬细胞PLAUR，激活ITGB1/FAK通路诱导促炎性巨噬细胞极化，而非依靠其酶活性驱动TAD进展 | 未提及研究局限性，但可能包括动物模型与人类TAD的差异、β-氨基丙腈诱导模型的局限性 | 阐明成纤维细胞激活蛋白在胸主动脉夹层发病机制中的生物学功能及分子机制 | 人类TAD标本、β-氨基丙腈诱导的TAD小鼠模型、全身性和成纤维细胞特异性Fap基因敲除小鼠 | 机器学习 | 心血管疾病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 表面等离子共振, 免疫共沉淀 | NA | 图像， 文本 | 人类TAD标本及小鼠模型，具体样本量未提及 | NA | 批量RNA-seq， 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 572 | 2026-07-08 |
Single-Cell Analysis of Chemotherapy-induced Remodeling Reveals CD276-driven Basal-like Chemoresistance in Pancreatic Cancer
2026-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.043
PMID:41701125
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析化疗前后配对样本，揭示了胰腺导管腺癌中由CD276驱动的基底样化疗耐药机制 | 首次在单细胞分辨率下描绘化疗重塑肿瘤细胞可塑性和微环境的动态过程，并发现CD276/B7-H3作为双重功能免疫检查点驱动化疗耐药 | 临床样本量相对有限（28例），主要发现需在更大队列中验证 | 探究化疗如何重塑胰腺导管腺癌的肿瘤细胞可塑性和肿瘤微环境以影响临床结局 | 接受白蛋白紫杉醇联合吉西他滨化疗的胰腺导管腺癌患者的配对治疗前后肿瘤活检组织和外周血单核细胞 | digital pathology | pancreatic cancer | single-cell RNA sequencing, multiplex immunofluorescence, spatial transcriptomics, CRISPR-Cas9 knockout | NA | single-cell transcriptomic data, spatial transcriptomic data, immunofluorescence images | 28例胰腺癌患者的配对治疗前后肿瘤活检组织和外周血单核细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium HD | 10x Chromium单细胞测序，10x Visium HD空间转录组学（2微米分辨率） |
| 573 | 2026-07-08 |
Overcoming CXCR4-Mediated T-Cell Exclusion Potentiates Antitumor Cytotoxicity in Fibrolamellar Carcinoma
2026-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.10.006
PMID:41701126
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序等技术揭示纤维板层癌中CXCR4介导的T细胞排斥机制，并发现联合阻断CXCR4和PD-1可增强抗肿瘤细胞毒性 | 首次在纤维板层癌中阐明CXCL12+肌成纤维细胞与CXCR4+淋巴细胞之间的相互作用是T细胞排斥的关键机制，并利用人类肿瘤切片培养系统验证联合免疫治疗策略 | 研究主要基于体外模型和小样本量，尚需体内实验和更大规模临床验证 | 探索纤维板层癌对免疫治疗响应有限的潜在机制，并开发有效的联合免疫治疗策略 | 纤维板层癌患者的肿瘤组织和相邻非肿瘤肝组织 | 数字病理学 | 纤维板层癌 | 单核RNA测序、多重免疫组织化学、活体成像、单细胞测序、空间蛋白质组学 | NA | 测序数据、图像数据 | 纤维板层癌患者样本（具体数量未在摘要中提及） | 10x Genomics | 单核RNA测序 | 10x Chromium | 高通量单核RNA测序系统 |
| 574 | 2026-07-08 |
miRNA regulation in brain tissue space: the 3'UTR perspective
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080850.125
PMID:41672779
|
综述 | 探讨微RNA在脑组织空间中的调控作用，重点关注3'非翻译区视角 | 首次系统讨论空间转录组学中同时量化miRNA及其靶标3'UTR的局限性，并提出未来研究方向 | 目前尚无方法能在空间上同时量化miRNA与3'UTR，且空间上3'UTR异构体变异研究不足 | 总结miRNA介导的基因调控在神经发育和神经元功能中的作用，并梳理空间量化miRNA和3'UTR的实验与计算方法 | 脑组织中miRNA及其靶标3'UTR在空间上的调控机制 | 自然语言处理 | NA | 空间转录组学 | NA | RNA表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 575 | 2026-07-08 |
LncRNA NEAT1 promotes immunosuppression in gastric cancer under endoplasmic reticulum stress by maintaining the M6A methylation of SEMA3A in CAFs
2026-Mar-04, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02613-w
PMID:41782001
|
研究论文 | 揭示内质网应激下lncRNA NEAT1通过维持CAFs中SEMA3A的m6A甲基化促进胃癌免疫抑制的机制 | 首次阐明内质网应激条件下癌症相关成纤维细胞中lncRNA NEAT1/METTL3/SEMA3A轴在胃癌免疫抑制中的作用，并开发靶向αvβ3的阳离子脂质体递送siNEAT1联合抗PD1治疗策略 | 未提及明显局限性 | 探究内质网应激下癌症相关成纤维细胞在胃癌免疫抑制中的作用机制，并开发联合免疫治疗策略 | 胃癌组织、癌症相关成纤维细胞、外泌体、T细胞 | 计算机视觉 | 胃癌 | 质谱、转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组测序、RNA pull-down、RIP-qPCR、流式细胞术、ELISA | NA | 质谱数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 576 | 2026-07-08 |
Integrated Single-Cell analysis Reveals molecular correlation of maternal-to-zygotic transition between human and pig embryo
2026-Mar-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07904-w
PMID:41782053
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据，揭示人类和猪胚胎从母体到合子转变过程中的分子相关性 | 首次系统性比较人类和猪胚胎早期发育中母体-合子转变的分子特征，发现核心转录因子和染色质重塑相关基因在物种间的共性与差异 | 采样点有限，仅覆盖卵母细胞到桑椹胚阶段，未能涵盖后续发育阶段；且物种间比较可能受样本量差异影响 | 阐明人类和猪胚胎早期发育中母体-合子转变的分子调控机制及其物种特异性 | 人类和猪胚胎，从卵母细胞到桑椹胚的发育阶段 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | Seurat, Monocle3, SCENIC | 单细胞转录组数据 | 139个人类和猪的样本（卵母细胞到桑椹胚阶段） | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序数据使用Illumina NovaSeq平台生成 |
| 577 | 2026-07-08 |
RASIP1-positive TECs in pancreatic adenocarcinoma: a potential novel type of endothelial cells correlated with "hot" tumors
2026-Mar-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40948-y
PMID:41781479
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与空间转录组学，鉴定胰腺癌中RASIP1阳性内皮细胞为一种新型内皮细胞亚群，其与“热”肿瘤特征相关并通过ERK信号调控免疫微环境 | 首次发现并表征胰腺癌中RASIP1阳性内皮细胞作为独特的内皮亚群，揭示其通过调节白细胞跨内皮迁移和ICAM1信号促进T细胞浸润的机制 | 研究主要基于转录组测序和体外实验，缺乏体内动物模型验证RASIP1靶向治疗的抗肿瘤效果 | 探究胰腺癌中内皮细胞在调控免疫细胞浸润和肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 胰腺导管腺癌组织样本及RASIP1阳性肿瘤内皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、组织病理图像 | 人类胰腺癌组织样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序结合GEPIA分析和空间转录组学 |
| 578 | 2026-07-08 |
Reshaping the colorectal cancer immune microenvironment: insights from single-cell and spatial omics
2026-Mar-04, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04245-y
PMID:41782022
|
综述 | 利用单细胞和空间组学技术揭示结直肠癌免疫微环境的重塑机制 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学数据，定义结直肠癌肿瘤微环境中的空间生态位和相互作用网络，并总结新的免疫治疗策略 | 未提及 | 综述单细胞RNA测序和空间转录组学在结直肠癌免疫微环境研究中的应用，总结细胞异质性、空间生态位和功能相互作用 | 结直肠癌肿瘤微环境中的免疫细胞、基质细胞和细胞外基质 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 579 | 2026-07-08 |
Protective role of early Tnfsf15 upregulation in limiting glomerular injury and proteinuria in experimental Alport Syndrome
2026-Mar, Journal of pharmacological sciences
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jphs.2026.01.005
PMID:41672640
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示Tnfsf15在Alport综合征早期上调对肾小球损伤和蛋白尿的保护作用 | 首次在Alport综合征小鼠模型中利用单细胞RNA测序鉴定出Tnfsf15在疾病早期（蛋白尿和结构异常出现前）即上调，并通过基因敲除实验证实其具有保护作用 | 未提及，但可能限于动物模型研究，结论是否适用于人类尚需验证 | 探究Alport综合征早期肾小球内的分子变化及Tnfsf15的功能 | Col4a5 G5X Alport小鼠模型 | 单细胞转录组学 | Alport综合征（肾脏疾病） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 两个时间点（5周龄和8周龄）的小鼠肾小球样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序 |
| 580 | 2026-07-08 |
SpaJoint: a transfer learning method for spatial transcriptomics deconvolution
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag158
PMID:41955028
|
研究论文 | 提出了一种基于迁移学习的空间转录组学解卷积方法SpaJoint，有效整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，实现细胞类型空间分布的高精度预测 | 首次将迁移学习应用于空间转录组解卷积，通过考虑不同空间位置间的空间相关性，实现了出色的细胞类型组成预测和空间区域识别性能 | NA | 开发一种高效、稳健的空间转录组解卷积方法，以解析组织内不同细胞类型的空间分布 | 空间转录组和单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 迁移学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |