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当前共找到 40869 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-06-19 |
FGF receptors mediate cellular senescence in the cystic fibrosis airway epithelium
2024-06-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174888
PMID:38916962
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研究论文 | 该研究揭示了FGFR/MAPK p38信号通路在囊性纤维化气道上皮细胞衰老中的作用，并发现抑制FGFR可减轻细胞衰老并改善黏液纤毛清除功能 | 首次阐明成纤维细胞生长因子受体（FGFR）特别是FGFR4通过MAPK p38信号介导囊性纤维化气道上皮细胞衰老，并提出靶向衰老作为治疗策略 | 未明确说明，但可能涉及体外模型与体内情况的差异以及样本量限制 | 探究囊性纤维化气道上皮细胞衰老的分子机制及其对黏液纤毛清除功能的影响 | 囊性纤维化患者的气道上皮细胞、非囊性纤维化对照、CF支气管上皮细胞系和Cftr基因敲除大鼠 | 机器学习 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自非CF和CF捐献者的原代支气管上皮细胞、CF支气管上皮细胞系及Cftr敲除大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 562 | 2026-06-19 |
Tissue module discovery in single-cell-resolution spatial transcriptomics data via cell-cell interaction-aware cell embedding
2024-06-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.05.001
PMID:38823396
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研究论文 | 提出一种深度学习方法SPACE，通过细胞间相互作用感知的细胞嵌入，从单细胞分辨率空间转录组数据中识别细胞类型和发现组织模块 | 通过细胞嵌入同时捕获基因表达谱和空间邻域相互作用，自动发现具有可辨别边界和均匀细胞类型分布的组织模块（细胞社区），并输出与生理过程相关的特征性近端细胞-细胞相互作用网络 | 未提及具体局限性 | 开发计算方法以揭示单细胞如何在空间中组织并发挥组织特异性功能 | 单细胞分辨率空间转录组数据中的细胞和组织模块 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 深度学习（SPACE） | 单细胞分辨率空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 563 | 2026-06-19 |
Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning
2024-05-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.04.006
PMID:38754367
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研究论文 | 提出Polaris分析流程，通过弱监督深度学习实现基于图像的空间转录组学中单分子斑点的精确检测 | 结合深度学习模型进行细胞分割和斑点检测，并利用概率基因解码器准确量化单细胞基因表达，提供统一的现成解决方案 | 未明确提及但可能依赖于训练数据的质量和多样性，以及在不同实验条件下的泛化能力 | 开发一个准确、自动化的分析流程，用于基于图像的空间转录组学数据，减少手动调整的复杂性 | 基于图像的空间转录组学数据，包括MERFISH、seqFISH和ISS实验 | 计算机视觉, 深度学习 | 不适用 | MERFISH, seqFISH, 原位RNA测序 | 深度学习（弱监督学习） | 图像 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 564 | 2026-06-19 |
Reconstructing developmental trajectories using latent dynamical systems and time-resolved transcriptomics
2024-05-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.04.004
PMID:38754365
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研究论文 | 提出一种利用潜伏动力系统和时间分辨转录组学重建发育轨迹的框架，包括优化的代谢标记方法sci-FATE2和计算模型VelvetVAE及VelvetSDE | 首次结合代谢标记优化方法sci-FATE2与两阶段动力系统框架（VelvetVAE和VelvetSDE），实现从单细胞快照数据到动态生成模型的转变，超越现有工具的性能 | NA | 开发能够从单细胞转录组快照数据重建细胞命运决定动态轨迹的方法 | 分化为神经管身份的45,000个小鼠胚胎干细胞 | 机器学习 | NA | 代谢标记，单细胞RNA-seq | 变分自编码器（VAE），神经随机微分方程（nSDE） | 单细胞转录组数据 | 45,000个胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，代谢标记 | sci-FATE2 | NA |
| 565 | 2026-06-19 |
Epigenetic dysregulation in Alzheimer's disease peripheral immunity
2024-04-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.013
PMID:38340719
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研究论文 | 利用单细胞测序方法探究阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传和转录变化 | 首次揭示了阿尔茨海默病外周免疫细胞中开放染色质的显著变化，并发现了新的AD特异性RELA转录因子结合位点和与散发性AD风险相关的差异可及染色质区域 | 未提及具体限制 | 探究阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传和转录改变 | 阿尔茨海默病患者的外周免疫细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序，转座酶可及染色质分析，RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 566 | 2026-06-19 |
Mechanisms of sex differences in Alzheimer's disease
2024-04-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.024
PMID:38402606
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病中性别差异的机制，探讨了女性患病风险更高的生物学原因 | 综合单细胞RNA测序、代谢组学和多组学分析等先进技术，系统阐述了性激素和性染色体与炎症、代谢及自噬等疾病机制的相互作用 | 未提及具体的研究设计或实验验证，仅基于已有文献总结 | 阐明阿尔茨海默病中性别差异的潜在生物学机制 | 阿尔茨海默病中的男性和女性患者 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，代谢组学，多组学分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 567 | 2026-06-19 |
Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.03.556122
PMID:37732188
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研究论文 | 提出Polaris分析流程，利用弱监督深度学习实现图像空间转录组学中准确的单分子点检测 | 将深度学习模型用于细胞分割和点检测，结合概率基因解码器，提供统一的一键式解决方案，适用于MERSFISH、seqFISH或ISS实验 | NA | 开发准确分析图像空间转录组数据的统一流程 | 图像空间转录组数据中的单分子和单细胞基因表达 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 568 | 2026-06-19 |
DiSignAtlas: an atlas of human and mouse disease signatures based on bulk and single-cell transcriptomics
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad961
PMID:37930831
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研究论文 | DiSignAtlas是一个整合人类和小鼠多种疾病转录组特征的综合数据库，提供基于批量与单细胞测序数据的疾病分子标志物资源 | 首次构建覆盖1836种疾病类型、包含181434个转录组图谱和10306个比较数据集的大型跨物种疾病特征数据库，并整合单细胞RNA测序数据与多维度分析工具 | 未提及数据库的更新频率及用户自定义分析功能的支持程度 | 构建全面的人类和小鼠疾病转录组特征资源库，支持生物标志物发现与转化研究 | 人类和小鼠的1836种非冗余疾病类型的转录组数据 | 生物信息学 | 多疾病类型 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 181434个转录组图谱，包括328个单细胞RNA测序数据集，包含疾病组与对照组 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 569 | 2026-06-19 |
SCAN: Spatiotemporal Cloud Atlas for Neural cells
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad895
PMID:37930842
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研究论文 | 构建了一个名为SCAN的神经网络细胞时空云图谱数据库，整合并分析了神经系统的高质量单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 首次系统整合了超过1000万个细胞的神经系统中单细胞RNA测序和空间转录组数据，覆盖900多个物种并包含100多种神经系统疾病数据，创建了交互式数据库SCAN | 未提及 | 构建神经系统的时空云图谱数据库，以促进神经科学研究和神经系统疾病诊断策略开发 | 神经系统的单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病、帕金森病、唐氏综合征 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 10679684个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 570 | 2026-06-19 |
Thrombospondin-1 promotes fibro-adipogenic stromal expansion and contractile dysfunction of the diaphragm in obesity
2023-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.17.553733
PMID:37645822
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研究论文 | 本文研究了肥胖状态下血小板反应蛋白-1促进膈肌纤维脂肪基质扩张和收缩功能障碍的机制 | 首次揭示THBS1是肥胖诱导的膈肌基质重塑和收缩功能障碍的必要介质，并发现THBS1敲除小鼠能抵抗肥胖引起的膈肌脂肪沉积和收缩力下降 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的验证尚需进一步研究 | 探讨THBS1在肥胖引起的膈肌功能障碍中的作用及其分子机制 | 饮食诱导肥胖小鼠的膈肌组织及细胞 | 机器学习和数字病理学 | 肥胖相关呼吸功能障碍 | bulk和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 野生型和THBS1敲除小鼠的膈肌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 571 | 2026-06-19 |
Transcriptomic landscapes of effective and failed liver regeneration in humans
2023-Apr, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100683
PMID:36950091
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research paper | 探索人类肝脏再生过程中有效和失败时的转录组景观 | 首次利用人类生物样本库系统评估肝脏再生早期转录变化，并揭示功能失调再生中DUSP4降低与过度炎症反应的关系，挑战了现有动物模型概念 | 未提及具体限制，但可能包括样本量较小、临床风险因素的模拟模型与人类实际情况的差异 | 系统评估人类肝脏再生过程中的早期转录变化，并探究功能失调肝脏再生中这些过程的差异 | 接受肝切除手术患者的血液和组织样本 | machine learning | 肝脏疾病 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 154名患者的血液样本和46名患者的术中组织样本，其中21名患者用于RNA测序 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 572 | 2026-06-19 |
Single-cell nucleic acid profiling in droplets (SNAPD) enables high-throughput analysis of heterogeneous cell populations
2021-10-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab577
PMID:34233007
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研究论文 | 介绍了一种名为SNAPD的液滴单细胞核酸分析方法，用于高通量分析异质细胞群体 | 开发了SNAPD技术，能够在液滴中分析单个细胞的RNA标志物，通过分子逻辑电路对细胞进行分类，每小时可分析超过10万个细胞 | 未提及具体局限性 | 开发一种快速、简单、高通量的单细胞分析方法，基于RNA标志物对细胞样本进行计数和分类 | 哺乳动物单细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞核酸分析，液滴微流控 | NA | 单细胞RNA表达数据 | 超过10万个细胞（每小时） | NA | 单细胞RNA分析 | NA | 微流控芯片液滴系统 |
| 573 | 2026-06-19 |
Type I Interferon signaling controls the accumulation and transcriptomes of monocytes in the aged lung
2021-10, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13470
PMID:34547174
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研究论文 | 研究发现衰老导致肺部干扰素信号增强和单核细胞浸润，并通过单细胞RNA测序鉴定出一种依赖I型干扰素信号的新型单核细胞亚群 | 首次通过scRNA-seq鉴定出衰老肺部中一种依赖I型干扰素信号的新型单核细胞亚群（MO-ifn），该亚群表达的IFNAR1上调且转录组变化更显著 | 未详细说明抗IFNAR1抗体治疗的长期效果及潜在副作用，也未探讨其他免疫细胞类型在衰老肺部炎症中的作用 | 研究衰老过程中肺部免疫细胞机制，特别是I型干扰素信号对单核细胞积累和转录组的影响 | 衰老小鼠肺部的单核细胞及I型干扰素信号通路 | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，但涉及年轻与年老小鼠的肺部组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 574 | 2026-06-19 |
Th1 polarization defines the synovial fluid T cell compartment in oligoarticular juvenile idiopathic arthritis
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.149185
PMID:34403374
|
研究论文 | 通过免疫表型分析、转录组测序和表观遗传学方法，揭示少关节型幼年特发性关节炎滑液中T细胞以Th1极化为特征，而Th17细胞并未富集 | 首次在单细胞水平揭示少关节型JIA滑液中Th1极化涵盖Treg细胞，且这些Th1样Treg仍保持调节功能和表观遗传特征，挑战了传统认为Treg在炎症环境中功能不稳定的观点 | 未提及具体限制 | 阐明少关节型幼年特发性关节炎滑液中T细胞免疫应答的特征 | 少关节型幼年特发性关节炎患者的滑液T细胞（CD4+、CD8+、γδ T细胞及Treg细胞） | 免疫学 | 幼年特发性关节炎 | 流式细胞术、批量RNA测序、单细胞RNA测序、DNA甲基化分析、Treg抑制实验 | NA | RNA测序数据、甲基化数据、流式细胞术数据 | 未明确说明样本量（涉及少关节型JIA患者滑液样本） | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 575 | 2026-06-19 |
IFN-γ is essential for alveolar macrophage-driven pulmonary inflammation in macrophage activation syndrome
2021-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147593
PMID:34314387
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研究论文 | 探讨IFN-γ在巨噬细胞活化综合征肺泡巨噬细胞介导的肺部炎症中的关键作用 | 首次在TLR9小鼠模型中明确IFN-γ驱动MAS相关肺部炎症的机制，并发现复发MAS可重置肺泡巨噬细胞极化状态 | 基于小鼠模型，可能无法完全模拟人类SJIA-LD的复杂性 | 阐明MAS模型中肺部炎症的免疫病理机制 | TLR9小鼠MAS模型中的肺部炎症和肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 巨噬细胞活化综合征、全身性幼年特发性关节炎相关肺病 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 576 | 2026-06-18 |
Single-cell transcriptomic analysis unveils dysregulated macrophage-podocyte crosstalk in membranous nephropathy
2026 Aug-Sep, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.106958
PMID:42025748
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示膜性肾病中巨噬细胞-足细胞交互失调 | 整合阳离子牛血清白蛋白诱导的小鼠膜性肾病模型与单细胞RNA测序，绘制肾脏细胞图谱，发现巨噬细胞-足细胞轴失衡（Spp1-整合素信号增强和胶原IV稳态信号减弱）是肾小球损伤的关键驱动因素 | 主要基于小鼠模型，人体样本验证有限 | 阐明膜性肾病中细胞网络驱动损伤的机制 | 阳离子牛血清白蛋白诱导的膜性肾病小鼠模型肾脏细胞 | 机器学习和生物信息学 | 膜性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 577 | 2026-06-18 |
From tarsal anatomy to tear-film homeostasis: A history-informed review of the meibomian gland in ocular surface biology
2026-Aug, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.111052
PMID:42119841
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综述 | 回顾从解剖学到泪膜稳态的睑板腺研究历史，阐述其在眼表生物学中的核心作用及其功能障碍（MGD）的现代概念 | 提出“认识激活”作为分析术语，系统梳理睑板腺从解剖识别到因果疾病关联、量化测量和诊断框架整合的历史过程，并展望基于细胞状态、脂质相、免疫和计算表型的未来分类方向 | 未提及具体限制 | 综述睑板腺研究的历史演变，解释其从解剖结构到眼表疾病关键因素的转变，并为未来MGD分类提供历史视角 | 睑板腺及其功能障碍（MGD） | 眼科及眼表生物学 | 干眼症（蒸发过强型干眼）相关眼表疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、类器官模型、人工智能图像分析、干细胞/再生研究 | NA | 文本（历史文献综述） | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 578 | 2026-06-18 |
Deep Structure-Enhanced Cell Clustering Model for Single-Cell RNA Sequencing Data
2026-Aug, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666261453098
PMID:42261796
|
研究论文 | 提出一种名为scDSEC的深度结构增强细胞聚类模型，用于单细胞RNA测序数据 | 通过整合细胞内部特征和外部结构语义，并采用逐层增强策略来学习增强的细胞表示，以解决表示学习不充分的问题 | 文中未明确提及局限性 | 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类性能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 579 | 2026-06-18 |
Characterization of T-Cell Ubiquitination in Melanoma and Development of a Risk Signature Using Single-Cell and Bulk RNA-Seq
2026-Jul, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70139
PMID:42012139
|
research paper | 利用单细胞和 bulk RNA-seq 数据，开发黑色素瘤中与泛素化相关基因的风险特征，并探究其与免疫微环境的关系 | 整合单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据，首次构建了基于六个泛素化相关基因的预后风险特征，揭示了URGs通过调节免疫细胞浸润影响黑色素瘤预后的新机制 | 未提及明确的局限性 | 开发基于泛素化相关基因的预后风险特征，并探讨其在黑色素瘤免疫调控中的作用 | 皮肤黑色素瘤患者 | machine learning | melanoma | RNA-seq, scRNA-seq | Cox regression | gene expression data | 未明确说明样本量，使用scRNA-seq和bulk RNA-seq数据 | NA | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 580 | 2026-06-18 |
MelOD: The Melanoma Omics Dashboard for Multimodal Data Exploration
2026-Jul, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.70101
PMID:42304720
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research paper | 介绍了一个名为MelOD的免费网络交互式平台，整合了16项黑色素瘤研究的多模态数据，并提供可视化分析工具 | 首次将来自多个黑色素瘤研究的批量转录组、单细胞RNA-seq和蛋白质组数据整合到一个用户友好的网络平台中，支持实时假设生成和跨研究验证 | 仅整合了预处理的公开数据，可能遗漏最新研究；依赖RShiny性能和网络条件 | 降低多组学黑色素瘤研究门槛，促进免疫治疗反应探索和跨研究验证 | 黑色素瘤患者的多组学数据（包括转录组、单细胞和蛋白质组） | machine learning | melanoma | NA | NA | transcriptomics, single-cell RNA-seq, proteomics | 整合16项研究数据，具体样本量未明确 | NA | bulk transcriptomics, single-cell RNA-seq, proteomics | NA | NA |