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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5761 | 2025-10-06 |
Machine learning for the identification of neoantigen-reactive CD8 + T cells in gastrointestinal cancer using single-cell sequencing
2024-Jul, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02737-0
PMID:38849478
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研究论文 | 开发了一种基于单细胞测序的机器学习模型,用于识别胃肠道癌症中的新抗原反应性CD8+T细胞 | 首次结合单细胞转录组数据开发26基因机器学习模型识别新抗原反应性T细胞,相比传统方法更高效 | NA | 开发快速识别新抗原反应性T细胞及其T细胞受体的方法 | 胃肠道癌症患者的肿瘤浸润淋巴细胞 | 机器学习 | 胃肠道癌症 | 单细胞测序,空间转录组学,多重免疫组织化学 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组织化学数据 | 数千个肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
5762 | 2025-10-06 |
Stromal Cell Isolation from Hematopoietic Organs
2024-01-26, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66231
PMID:38345255
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研究论文 | 本文提供了从造血器官中分离高质量基质细胞的逐步操作方案 | 建立了适用于小鼠和人类胸腺以及小鼠骨骼和骨髓的基质细胞分离标准化流程,并讨论了影响单细胞测序兼容性的关键因素 | 主要关注基质细胞分离技术,未涉及具体生物学机制研究 | 开发优化的基质细胞分离方法以支持高质量单细胞多组学研究 | 小鼠和人类造血器官(胸腺、骨骼、骨髓)中的基质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞多组学测序,FACS分析/分选 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
5763 | 2025-10-06 |
Feasibility of whole RNA sequencing from single-cell mRNA amplification
2013, Genetics research international
DOI:10.1155/2013/724124
PMID:24455282
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研究论文 | 评估单细胞RNA测序技术在单细胞水平进行全RNA测序的可行性 | 开发了单细胞RNA-seq技术,证明其检测基因数量(6767个基因)显著高于差异显示方法(288个文库),并能检测基因剪接事件 | 灵敏度为76%,特异性为55%,存在部分基因表达缺失(2/8个基因) | 验证单细胞RNA测序技术在基因组医学中的应用可行性 | 单细胞样本 | 基因组学 | 肿瘤和遗传疾病 | RNA-seq, Q-rtPCR, 差异显示 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5764 | 2025-10-06 |
Olaparib and Radiotherapy Induce Type I Interferon- and CD8+ T Cell-Dependent Sensitization to Immunotherapy in Pancreatic Cancer
2025-Jun-04, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0210
PMID:39688341
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研究论文 | 本研究探讨了PARP抑制剂奥拉帕尼联合放疗通过诱导I型干扰素和CD8+ T细胞依赖性机制增强胰腺癌对免疫治疗的敏感性 | 首次揭示奥拉帕尼通过增强放疗诱导的I型干扰素产生,重塑肿瘤微环境,促进CD8+ T细胞应答,从而克服胰腺癌对免疫治疗的耐药性 | 研究主要基于免疫活性小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究PARP抑制剂奥拉帕尼联合放疗增强胰腺癌免疫治疗敏感性的机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,免疫细胞表型数据 | 免疫活性小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5765 | 2025-10-06 |
Activity-dependent development of the body's touch receptors
2025-Jun-04, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.04.015
PMID:40381613
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研究论文 | 本研究揭示了机械刺激诱发的神经元活动在触觉感受器早期发育中的关键作用 | 首次证明机械敏感性离子通道Piezo2和电压门控钠通道Na1.6通过调控神经元活动参与触觉感受器终末器官的形成 | 研究主要关注早期发育阶段,对成年期触觉感受器维持机制探讨不足 | 探究神经元活动在体表触觉感受器发育过程中的作用机制 | 体感神经元及其机械感受终末器官 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 基因敲除, 电生理记录 | NA | 基因表达数据, 电生理数据, 形态学数据 | Piezo2基因敲除小鼠和Scn8a条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5766 | 2025-10-06 |
CTSE inhibits anti-tumor T cell response by promoting des-γ-carboxy prothrombin releasing in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07753-3
PMID:40467555
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研究论文 | 本研究揭示组织蛋白酶E通过促进异常凝血酶原释放抑制抗肿瘤T细胞反应的机制 | 首次发现CTSE通过上调泛醌信号通路促进DCP释放进而诱导T细胞凋亡的新机制 | 研究主要基于公共数据库分析和体外实验,需要更多临床样本验证 | 探究肝细胞癌中CTSE对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 肝细胞癌细胞和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5767 | 2025-10-06 |
SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy
2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0701
PMID:39976545
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研究论文 | 本文揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用,促使其从膜上移位,从而增强突变p53与KRAS的致癌协同作用 | 首次阐明SMURF2通过识别GAP17-1的PPLP基序介导其膜移位,促进突变KRAS持续激活的分子机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床样本验证仍需扩大 | 探究突变p53与KRAS在胰腺癌中协同作用的分子机制 | 胰腺癌细胞系、小鼠模型及临床样本 | 分子生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、组织芯片 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 多个胰腺癌小鼠模型及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5768 | 2025-10-06 |
Enhancer Extrachromosomal Circular DNA ANKRD28 Elicits Drug Resistance via POU2F2-Mediated Transcriptional Network in Multiple Myeloma
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415695
PMID:40167268
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研究论文 | 本研究揭示了增强子型染色体外环状DNA ANKRD28通过POU2F2介导的转录网络在多发性骨髓瘤中引发耐药性的新机制 | 首次发现非编码区eccDNA作为增强子参与肿瘤耐药,阐明了eccANKRD28-POU2F2转录网络在MM耐药中的关键作用 | 研究样本量有限,机制研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索多发性骨髓瘤耐药机制,特别关注增强子型eccDNA在其中的作用 | 多发性骨髓瘤患者血清样本、VRd耐药MM细胞系 | 表观遗传学 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序, H3K27ac ChIP-seq, scRNA-seq, scATAC-seq, CUT&Tag, CRISPR/Cas9 | NA | 基因组数据, 表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | 供体和MM患者血清样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
5769 | 2025-10-06 |
Glycolysis-Derived Lactate Induces ACSL4 Expression and Lactylation to Activate Ferroptosis during Intervertebral Disc Degeneration
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416149
PMID:40171826
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研究论文 | 本研究揭示糖酵解来源的乳酸通过促进组蛋白H3K18乳酰化和ACSL4蛋白乳酰化激活铁死亡,导致椎间盘退变 | 首次发现乳酸通过组蛋白乳酰化和蛋白乳酰化双重机制调控ACSL4表达并激活铁死亡的新通路 | NA | 探究椎间盘退变过程中代谢重编程与髓核细胞功能异常的关系 | 髓核细胞 | 细胞生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5770 | 2025-10-06 |
Inhibiting the Histone Demethylase Kdm4a Restrains Cardiac Fibrosis After Myocardial Infarction by Promoting Autophagy in Premature Senescent Fibroblasts
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414830
PMID:40231733
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去甲基化酶Kdm4a通过调控Trim44表达影响早衰成纤维细胞自噬,从而促进心肌梗死后心脏纤维化的机制 | 首次发现Kdm4a在心肌梗死后早衰成纤维细胞中的关键作用,阐明其通过表观遗传调控Trim44表达影响自噬的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在临床患者中验证 | 探究早衰成纤维细胞在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及Kdm4a的调控机制 | 心肌梗死后早衰成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | scRNA-seq, ChIP-seq, ChIP-PCR, 免疫染色, 功能获得和缺失实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 染色质免疫沉淀数据, 分子生物学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5771 | 2025-10-06 |
Exploring the Latent Information in Spatial Transcriptomics Data via Multi-View Graph Convolutional Network Based on Implicit Contrastive Learning
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413545
PMID:40304359
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研究论文 | 提出基于隐式对比学习的多视图图卷积网络框架STMIGCL,用于提升空间转录组数据的空间域识别精度 | 结合多视图图卷积网络与隐式对比学习,通过潜在空间对比增强和注意力机制自适应整合不同视图 | 未明确说明方法在处理极复杂组织微环境时的适用性限制 | 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性 | 空间转录组数据中的基因表达和空间坐标信息 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图卷积网络, 对比学习, 注意力机制 | 基因表达数据, 空间坐标数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5772 | 2025-10-06 |
MRAS: Master Regulator Analysis of Alternative Splicing
2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414493
PMID:40323145
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研究论文 | 介绍了一种名为MRAS的计算方法,用于识别在剪接调控网络中起关键作用的剪接因子 | 开发了首个专门用于识别剪接调控网络中顶层主调控因子的计算方法 | 未提及方法的具体验证过程和性能评估指标 | 识别导致剪接紊乱和表型变异的关键剪接调控因子 | 剪接调控网络和剪接因子 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 计算分析方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5773 | 2025-10-06 |
Immune-epithelial-stromal networks define the cellular ecosystem of the small intestine in celiac disease
2025-Jun, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02146-2
PMID:40328997
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示乳糜泻小肠中免疫-上皮-基质细胞网络的改变 | 首次整合单细胞转录组学和空间转录组学系统描绘乳糜泻的细胞生态系统,发现持续存在的免疫-上皮'疤痕'和特异性淋巴聚集结构 | 样本量相对有限(35名参与者),组织来源仅限于活检样本 | 阐明乳糜泻中驱动肠道损伤的免疫-上皮-基质细胞相互作用机制 | 乳糜泻患者小肠活检样本中的免疫细胞、实质细胞和上皮细胞 | 空间转录组学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 35名参与者,86,442个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
5774 | 2025-10-06 |
Efficacy and biomarker analysis of neoadjuvant disitamab vedotin (RC48-ADC) combined immunotherapy in patients with muscle-invasive bladder cancer: A multi-center real-world study
2025-Jun, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70033
PMID:40469503
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研究论文 | 评估新辅助抗体偶联药物disitamab vedotin联合免疫治疗在肌层浸润性膀胱癌患者中的疗效并探索预测生物标志物 | 首次在真实世界研究中评估RC48-ADC联合免疫治疗的疗效,并通过单细胞RNA测序识别出HER2和HSPA1A联合检测作为潜在疗效预测策略 | 样本量有限,特别是单细胞测序仅包含11个样本,且为真实世界研究缺乏随机对照 | 评估新辅助RC48-ADC联合免疫治疗的疗效并探索预测生物标志物 | 肌层浸润性膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 102例患者(疗效评估),11例样本(单细胞测序) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5775 | 2025-10-06 |
A multi-centered prospective birth cohort study in Western China
2025-Jun, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70049
PMID:40469506
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研究论文 | 介绍中国西部出生队列研究的设计、实施和初步数据收集情况 | 在中国西部多民族、多海拔地区建立的大规模前瞻性出生队列,整合了多种先进的多组学测量技术 | NA | 探索基因-环境相互作用、生命早期健康决定因素和长期疾病风险 | 中国西部五个省份的15,093名孕妇及其后代 | 队列研究 | 母婴健康 | 多组学测量,包括基因组学、蛋白质组学、外泌体分析、代谢组学、空间转录组学、单细胞RNA测序、培养组学、宏基因组学和病毒组学分析 | NA | 医疗记录、问卷、生物样本 | 15,093名孕妇,收集了超过220,000份医疗记录、80,000份问卷和12种不同类型的生物样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5776 | 2025-10-06 |
Peripheral blood immune landscape and NXPE3 as a novel biomarker for hypertensive intracerebral hemorrhage risk prediction and targeted therapy
2025-Jun, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70030
PMID:40469509
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研究论文 | 通过多组学技术分析脑出血患者的免疫失调机制,并发现NXPE3作为新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次将NXPE3鉴定为高血压性脑出血的风险预测生物标志物和潜在治疗靶点,并验证了二氢麦角胺对其的结合作用 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探索脑出血的免疫失调机制并开发风险预测模型和治疗策略 | 脑出血患者和高血压患者 | 生物信息学 | 脑出血 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 分子对接, 模拟计算 | 多机器学习框架 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
5777 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of multi-omics single-cell data using the single-cell analyst
2025-Jun, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70038
PMID:40469516
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研究论文 | 介绍了一个用于多组学单细胞数据分析的网页平台single-cell analyst | 开发了用户友好的网页平台,支持六种单细胞组学数据类型,无需编程技能即可进行综合分析 | NA | 为计算能力有限的研究人员提供易于使用的多组学单细胞数据分析工具 | 多组学单细胞数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞免疫分析, 单细胞拷贝数变异分析, 飞行时间质谱流式细胞术, 流式细胞术, 空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞免疫分析, 单细胞拷贝数变异分析, 飞行时间质谱流式细胞术, 流式细胞术, 空间转录组学 | single-cell analyst | 基于网页的分析平台,支持在线和离线模式,包含20多种交互式分析工具 |
5778 | 2025-10-06 |
Inhaled PAMAM-based nano-formulation prolonged lung retention for alleviating pulmonary inflammation of COPD
2025-Jun, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.101845
PMID:40469693
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研究论文 | 本研究开发了一种基于PAMAM树状大分子的纳米复合物G4-IAA,通过吸入给药延长药物在肺部的滞留时间,用于缓解COPD的肺部炎症 | 创新性地将吲哚乙酸与第四代PAMAM树状大分子通过主客体相互作用形成纳米复合物,显著提高了药物溶解度和肺部滞留时间 | 研究仅在COPD小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发一种能够延长肺部药物滞留时间的纳米制剂,用于治疗慢性阻塞性肺疾病 | COPD小鼠模型和呼吸道上皮细胞 | 纳米医学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞测序,纳米制剂技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5779 | 2025-10-06 |
Macrophage-derived IL-15 imprints peritoneal TRM-like CD8 T cells in cirrhosis and spontaneous bacterial peritonitis
2025-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101381
PMID:40470117
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研究论文 | 本研究探讨肝硬化患者腹膜CD8 T细胞的组织驻留记忆样特征及其在自发性细菌性腹膜炎中的免疫调控机制 | 首次揭示巨噬细胞来源的IL-15通过旁观者激活方式塑造腹膜TRM样CD8 T细胞,并在富含可溶性检查点的腹水环境中维持细胞毒性功能 | 样本来源仅限于肝硬化患者,未纳入其他疾病对照;研究主要关注CD8 T细胞,其他免疫细胞亚群的作用未深入探讨 | 阐明肝硬化患者腹膜CD8 T细胞的TRM样特征及其在腹膜免疫中的作用机制 | 87例失代偿期肝硬化患者的腹膜CD8 T细胞,其中30例伴发自发性细菌性腹膜炎 | 免疫学 | 肝硬化 | 质谱流式细胞术,流式细胞术,RT-qPCR,单细胞RNA测序,体外培养,细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,细胞因子浓度数据 | 87例患者(30例SBP患者),80例患者腹水样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5780 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals the multi-step process of cellular senescence
2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102042
PMID:40476058
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示细胞衰老的多步骤过程 | 整合单细胞轨迹分析和转录因子动态变化,解码复制性衰老过程中阶段特异性分子特征 | 仅使用公开可用的HUVEC细胞数据,未在其他细胞类型或体内环境中验证 | 阐明细胞衰老的渐进转变机制 | 人脐静脉内皮细胞(HUVEC) | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Monocle 3, SCENIC | 单细胞转录组数据 | 公开可用的HUVEC复制性衰老数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |