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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5761 | 2025-10-06 |
Multi-omics exploration of CAV1+ tumor epithelial subcelltype in oral squamous cell carcinoma and its impact on the immune microenvironment
2025-Jun-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02843-2
PMID:40471478
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研究论文 | 通过多组学方法探索口腔鳞状细胞癌中CAV1+肿瘤上皮亚型的特征及其对免疫微环境的影响 | 首次在OSCC中鉴定出CAV1+上皮亚型,揭示其通过NECTIN1-CD96信号网络与T细胞相互作用导致免疫逃逸的新机制 | 研究基于单细胞和空间转录组数据,需要进一步实验验证机制 | 揭示口腔鳞癌肿瘤上皮细胞亚型特征及其在肿瘤进展中的作用 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者样本 | 数字病理 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
5762 | 2025-10-06 |
Muscle stem cells in Duchenne muscular dystrophy exhibit molecular impairments and altered cell fate trajectories impacting regenerative capacity
2025-Jun-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07755-1
PMID:40473604
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了杜氏肌营养不良症中卫星细胞的分子损伤和细胞命运轨迹改变 | 首次在单细胞水平系统揭示DMD卫星细胞的转录组异常和分化能力受损机制,并发现诱导自噬可挽救DMD祖细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型,人类DMD患者样本验证尚需进一步研究 | 探究杜氏肌营养不良症中卫星细胞功能障碍的分子机制 | 杜氏肌营养不良症小鼠模型(mdx和D2-mdx)中的肌肉卫星细胞 | 单细胞生物学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | mdx和D2-mdx DMD小鼠模型的卫星细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5763 | 2025-10-06 |
Machine learning and multi-omics analysis reveal key regulators of proneural-mesenchymal transition in glioblastoma
2025-Jun-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-04862-z
PMID:40473799
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研究论文 | 通过机器学习和多组学分析揭示胶质母细胞瘤中前神经-间质转化的关键调控因子 | 首次系统识别17个PMT相关基因,发现这些基因主要在免疫细胞和血管中表达而非肿瘤细胞 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步实验验证 | 探索胶质母细胞瘤前神经-间质转化的分子机制 | 胶质母细胞瘤患者组织和细胞亚群 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 蛋白质组学, 单细胞转录组分析 | Lasso, Cox, Step算法 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据 | 胶质母细胞瘤患者数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
5764 | 2025-10-06 |
Multi-omics analyses reveal interactions between GREM1+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in gastric cancer
2025-Jun-05, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00967-w
PMID:40473882
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研究论文 | 通过多组学分析揭示胃癌中GREM1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞间的相互作用 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA测序和空间转录组学系统解析胃癌微环境中GREM1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞的相互作用网络 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步功能实验验证相互作用的分子机制 | 探究胃癌肿瘤微环境中细胞间相互作用的特征及其临床意义 | 胃癌组织样本及其微环境中的细胞组成 | 数字病理学 | 胃癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化染色 | NA | 转录组数据, 空间定位数据, 免疫组化图像 | 12个独立胃癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
5765 | 2025-10-06 |
Dissecting the tumor microenvironment in primary breast angiosarcoma: insights from single-cell RNA sequencing
2025-Jun-05, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-02022-9
PMID:40474296
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析原发性乳腺血管肉瘤肿瘤微环境的细胞异质性和关键信号通路 | 首次在原发性乳腺血管肉瘤中应用单细胞RNA测序技术系统解析肿瘤微环境,发现CXCL12-CXCR4轴的关键作用 | 样本量较小(仅3例患者),需要更大规模研究验证发现 | 阐明原发性乳腺血管肉瘤的肿瘤微环境特征,寻找潜在治疗靶点 | 原发性乳腺血管肉瘤和浸润性乳腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 血管肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据 | 3例患者(1例双侧原发性乳腺血管肉瘤,2例浸润性乳腺癌),共31,771个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5766 | 2025-10-06 |
ICOSL, OX40L, and CD30L control persistence of asthmatic CD4 tissue-resident memory CD4 T cells
2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1097
PMID:39921040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别控制哮喘CD4组织驻留记忆T细胞持续存在的共刺激分子,并验证其联合抑制的治疗潜力 | 首次发现ICOSL、OX40L和CD30L共刺激分子联合抑制可持久减少肺组织驻留记忆T细胞数量和活性 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证 | 探索控制哮喘记忆CD4 T细胞再活化的共刺激分子及其治疗价值 | 哮喘患者和小鼠模型的肺CD4 T细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类哮喘患者和小鼠模型的肺CD4 T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5767 | 2025-10-06 |
Injury and obesity differentially and synergistically induce dysregulation of synovial immune cells in osteoarthritis
2025-Jun, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.03.001
PMID:40188009
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了关节损伤和肥胖对骨关节炎滑膜免疫细胞的差异性和协同性调控作用 | 首次系统比较了关节损伤和肥胖两种主要风险因素对滑膜免疫细胞组成的独立和协同影响,揭示了肥胖动物在关节损伤后促炎单核细胞来源巨噬细胞的异常增多 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探究关节损伤和肥胖对骨关节炎滑膜免疫细胞表型的影响机制 | 小鼠膝关节囊中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组学,免疫分型,转基因小鼠模型,遗传命运图谱 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫表型数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5768 | 2025-05-10 |
Insights and perspectives on the role of APOC1 inhibition in modulating immunotherapy outcomes in HCC: Commentary on Inhibition of APOC1 promotes the transformation of M2 into M1 macrophages via the ferroptosis pathway and enhances anti-PD1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma based on single-cell RNA sequencing
2025-Jun, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103564
PMID:40339430
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
5769 | 2025-10-06 |
Identification of MAGE-A10 specific T cell receptor promising in immunotherapy of hepatocellular carcinoma
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144243
PMID:40379175
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术鉴定出针对肝癌特异性抗原MAGE-A10的T细胞受体,为肝癌免疫治疗提供新策略 | 首次通过单细胞RNA测序和TCR测序结合GLIPH2算法,在肝癌中鉴定出特异性识别MAGE-A10抗原的T细胞受体 | 研究样本量有限,需要进一步临床验证 | 开发针对肝癌的TCR-T免疫治疗方法 | 肝癌患者样本和MAGE-A10特异性T细胞受体 | 免疫治疗 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, TCR测序, GLIPH2聚类分析, NetMHCpan, DLpTCR | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 肝癌患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
5770 | 2025-10-06 |
Case report: single-cell transcriptome sequencing reveals the clonal origin of mature plasmacytoid dendritic cell proliferation in early T-cell precursor lymphoblastic leukemia
2025-May, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06301-5
PMID:40085211
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病例报告 | 通过单细胞转录组测序揭示早期T细胞前体淋巴细胞白血病中成熟浆细胞样树突状细胞增殖的克隆起源 | 首次在淋巴系统恶性肿瘤中发现MPDCP,并通过单细胞RNA测序技术揭示T-ALL原始细胞与pDCs之间的转录连续性 | 仅为单个病例报告,需要进一步研究确认发现并探索临床意义 | 探讨MPDCP在淋巴系统恶性肿瘤中的存在及其与淋巴细胞分化的潜在联系 | 一名69岁男性早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病伴MPDCP患者 | 单细胞测序分析 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5771 | 2025-10-06 |
Identification of molecular clusters and a risk prognosis model for diffuse large B-cell lymphoma based on lactate metabolism-related genes
2025-May, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06321-1
PMID:40186663
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研究论文 | 基于乳酸代谢相关基因构建弥漫性大B细胞淋巴瘤分子分型和风险预后模型 | 首次基于乳酸代谢相关基因构建DLBCL预后模型,发现高风险患者具有不良临床特征、侵袭性免疫微环境和治疗反应差的特点 | 使用公共数据集进行分析,需要进一步实验验证 | 探索乳酸代谢相关基因与DLBCL预后及免疫微环境的关联 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和细胞系 | 生物信息学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,Cox回归,LASSO回归 | 风险预后模型,列线图 | 基因表达数据,临床数据 | 来自GSE10846和GSE87371数据集的样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
5772 | 2025-10-06 |
M-band wavelet-based multi-view clustering of cells
2025-May, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013060
PMID:40408513
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研究论文 | 提出基于M-band小波的单细胞RNA测序多视图聚类方法WMC | 首次将M-band小波分析与UMAP结合应用于scRNA-seq数据,能够发现稀有细胞类型并进行多视图聚类 | NA | 开发新的单细胞RNA测序数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小波分析, UMAP, 多视图聚类 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5773 | 2025-10-06 |
Ectopic Expansion of Pulmonary Vasculature in Fibrotic Lung Disease and Lung Adenocarcinoma Marked by Proangiogenic COL15A1+ Endothelial Cells
2025-Apr, Pulmonary circulation
IF:2.2Q3
DOI:10.1002/pul2.70102
PMID:40463493
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据比较多种间质性肺疾病和肺癌中的血管内皮细胞群体,发现表达COL15A1的支气管源性内皮细胞在肺纤维化和肺癌中异常扩张 | 首次在多种间质性肺疾病和肺癌中鉴定出表达COL15A1的支气管源性内皮细胞亚群的异常扩张 | 样本量有限,特别是NSCLC组仅8例样本,需要进一步功能验证研究 | 比较不同肺疾病中血管内皮细胞群体的特征,识别共同的血管重塑模式 | 人肺组织标本中的血管内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 肺纤维化,肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 186例肺组织标本(健康59例,ILD 97例,COPD 22例,NSCLC 8例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5774 | 2025-10-06 |
Machine learning for the identification of neoantigen-reactive CD8 + T cells in gastrointestinal cancer using single-cell sequencing
2024-Jul, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02737-0
PMID:38849478
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研究论文 | 开发了一种基于单细胞测序的机器学习模型,用于识别胃肠道癌症中的新抗原反应性CD8+T细胞 | 首次结合单细胞转录组数据开发26基因机器学习模型识别新抗原反应性T细胞,相比传统方法更高效 | NA | 开发快速识别新抗原反应性T细胞及其T细胞受体的方法 | 胃肠道癌症患者的肿瘤浸润淋巴细胞 | 机器学习 | 胃肠道癌症 | 单细胞测序,空间转录组学,多重免疫组织化学 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组织化学数据 | 数千个肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
5775 | 2025-10-06 |
Stromal Cell Isolation from Hematopoietic Organs
2024-01-26, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66231
PMID:38345255
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研究论文 | 本文提供了从造血器官中分离高质量基质细胞的逐步操作方案 | 建立了适用于小鼠和人类胸腺以及小鼠骨骼和骨髓的基质细胞分离标准化流程,并讨论了影响单细胞测序兼容性的关键因素 | 主要关注基质细胞分离技术,未涉及具体生物学机制研究 | 开发优化的基质细胞分离方法以支持高质量单细胞多组学研究 | 小鼠和人类造血器官(胸腺、骨骼、骨髓)中的基质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞多组学测序,FACS分析/分选 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
5776 | 2025-10-06 |
Feasibility of whole RNA sequencing from single-cell mRNA amplification
2013, Genetics research international
DOI:10.1155/2013/724124
PMID:24455282
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研究论文 | 评估单细胞RNA测序技术在单细胞水平进行全RNA测序的可行性 | 开发了单细胞RNA-seq技术,证明其检测基因数量(6767个基因)显著高于差异显示方法(288个文库),并能检测基因剪接事件 | 灵敏度为76%,特异性为55%,存在部分基因表达缺失(2/8个基因) | 验证单细胞RNA测序技术在基因组医学中的应用可行性 | 单细胞样本 | 基因组学 | 肿瘤和遗传疾病 | RNA-seq, Q-rtPCR, 差异显示 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5777 | 2025-10-06 |
Olaparib and Radiotherapy Induce Type I Interferon- and CD8+ T Cell-Dependent Sensitization to Immunotherapy in Pancreatic Cancer
2025-Jun-04, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0210
PMID:39688341
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研究论文 | 本研究探讨了PARP抑制剂奥拉帕尼联合放疗通过诱导I型干扰素和CD8+ T细胞依赖性机制增强胰腺癌对免疫治疗的敏感性 | 首次揭示奥拉帕尼通过增强放疗诱导的I型干扰素产生,重塑肿瘤微环境,促进CD8+ T细胞应答,从而克服胰腺癌对免疫治疗的耐药性 | 研究主要基于免疫活性小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究PARP抑制剂奥拉帕尼联合放疗增强胰腺癌免疫治疗敏感性的机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,免疫细胞表型数据 | 免疫活性小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5778 | 2025-10-06 |
Activity-dependent development of the body's touch receptors
2025-Jun-04, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.04.015
PMID:40381613
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研究论文 | 本研究揭示了机械刺激诱发的神经元活动在触觉感受器早期发育中的关键作用 | 首次证明机械敏感性离子通道Piezo2和电压门控钠通道Na1.6通过调控神经元活动参与触觉感受器终末器官的形成 | 研究主要关注早期发育阶段,对成年期触觉感受器维持机制探讨不足 | 探究神经元活动在体表触觉感受器发育过程中的作用机制 | 体感神经元及其机械感受终末器官 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 基因敲除, 电生理记录 | NA | 基因表达数据, 电生理数据, 形态学数据 | Piezo2基因敲除小鼠和Scn8a条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5779 | 2025-10-06 |
CTSE inhibits anti-tumor T cell response by promoting des-γ-carboxy prothrombin releasing in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07753-3
PMID:40467555
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研究论文 | 本研究揭示组织蛋白酶E通过促进异常凝血酶原释放抑制抗肿瘤T细胞反应的机制 | 首次发现CTSE通过上调泛醌信号通路促进DCP释放进而诱导T细胞凋亡的新机制 | 研究主要基于公共数据库分析和体外实验,需要更多临床样本验证 | 探究肝细胞癌中CTSE对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 肝细胞癌细胞和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5780 | 2025-10-06 |
SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy
2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0701
PMID:39976545
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研究论文 | 本文揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用,促使其从膜上移位,从而增强突变p53与KRAS的致癌协同作用 | 首次阐明SMURF2通过识别GAP17-1的PPLP基序介导其膜移位,促进突变KRAS持续激活的分子机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床样本验证仍需扩大 | 探究突变p53与KRAS在胰腺癌中协同作用的分子机制 | 胰腺癌细胞系、小鼠模型及临床样本 | 分子生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、组织芯片 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 多个胰腺癌小鼠模型及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |