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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5741 | 2025-10-06 |
Intercellular communication after myocardial infarction: Macrophage as the centerpiece
2025-Jul, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2025.102757
PMID:40320153
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综述 | 本文总结了心肌梗死后巨噬细胞亚群的动态变化及其介导的细胞间通讯机制 | 聚焦乳酸化修饰对巨噬细胞亚群转化和细胞通讯的调控作用,提出以巨噬细胞为中心的新型靶向治疗策略 | NA | 阐明心肌梗死后巨噬细胞介导的细胞间通讯机制及其治疗潜力 | 心肌梗死后的巨噬细胞及其与心肌细胞、中性粒细胞、成纤维细胞、内皮细胞等心脏细胞的相互作用 | 病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5742 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analyses provide insights into the tumor microenvironment heterogeneity and invasion phenotype in retinoblastoma
2025-Jul, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156009
PMID:40378583
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示视网膜母细胞瘤肿瘤微环境异质性及其与侵袭表型的关联 | 首次系统描绘视网膜母细胞瘤肿瘤微环境异质性景观,揭示TAMs和星形胶质细胞样细胞特定亚群与肿瘤侵袭的潜在关联 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;机制研究仍需进一步实验证实 | 探究视网膜母细胞瘤肿瘤微环境异质性及其在肿瘤侵袭中的作用机制 | 视网膜母细胞瘤肿瘤微环境中的各类细胞 | 单细胞组学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 微阵列数据分析 | CellChat, Monocle, CIBERSORT | 单细胞转录组数据, 微阵列数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5743 | 2025-10-06 |
Crosstalk between kidney and bones: New perspective for modulating osteoporosis
2025-Jul, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2025.102776
PMID:40389172
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综述 | 探讨肾脏与骨骼之间的相互作用机制及其在骨质疏松症中的临床意义 | 从多器官互作角度提出骨质疏松研究新视角,整合分子生物学到临床证据 | NA | 建立更复杂的体外模型基础并提出潜在治疗策略 | 肾脏与骨骼的相互作用机制 | NA | 骨质疏松症 | 细胞共培养、器官芯片、单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
5744 | 2025-10-06 |
stDGAC: A novel identifying spatial domains method via graph attention contrastive network for spatial transcriptomics data
2025-Jul, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110280
PMID:40403639
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研究论文 | 提出了一种名为stDGAC的新型空间域识别方法,通过图注意力对比网络分析空间转录组数据 | 联合使用去噪自编码器和图注意力对比网络,能够聚合空间上下文邻域信息并获得更鲁棒的表征 | NA | 更准确地识别空间转录组数据中的空间域 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 去噪自编码器, 图注意力对比网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5745 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data with artificial intelligence to decipher the role of tumor-infiltrating lymphocytes in tumor immunotherapy
2025-Jul, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156035
PMID:40435910
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综述 | 本文综述了人工智能在肿瘤浸润淋巴细胞评估中的应用进展及其临床价值 | 整合多组学数据与人工智能技术,系统阐述AI在TILs自动识别、定量分析、亚群识别和空间分布模式研究中的创新应用 | NA | 阐明肿瘤浸润淋巴细胞在肿瘤免疫治疗中的作用及其预后价值 | 肿瘤浸润淋巴细胞 | 医学影像分析 | 肿瘤 | 单细胞测序,多重免疫荧光,空间转录组学,多模态方法 | CNN | 图像 | NA | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
5746 | 2025-10-06 |
Multi-omic analyses of the development of obesity-related depression linked to the gut microbe Anaerotruncus colihominis and its metabolite glutamate
2025-Jun-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2025.04.010
PMID:40274437
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肠道微生物Anaerotruncus colihominis及其代谢产物谷氨酸在肥胖相关抑郁症发展中的关键作用 | 首次发现A. colihominis通过谷氨酸代谢影响肠脑轴,并鉴定Efnb2-Ephb2相互作用在细胞通讯中的关键作用 | 研究主要基于动物模型,临床样本量有限,需要更大规模的人群研究验证 | 探索肥胖相关抑郁症的肠道微生物机制 | 肥胖相关抑郁症患者、高脂饮食小鼠、无菌小鼠 | 微生物组学 | 肥胖相关抑郁症 | 单细胞RNA测序, 粪便微生物移植, 多组学分析 | NA | 微生物组数据, 转录组数据, 代谢组数据 | 临床患者队列和高脂饮食小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5747 | 2025-10-06 |
Integrating Ambient Ionization Mass Spectrometry Imaging and Spatial Transcriptomics on the Same Cancer Tissues to Identify RNA-Metabolite Correlations
2025-Jun-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202502028
PMID:40216587
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研究论文 | 开发了一种在同一组织切片上整合空间代谢组学和空间转录组学的新方法 | 首次在同一组织切片上结合DESI-MSI空间代谢组学和Visium空间转录组学,避免了连续切片间的变异性问题 | 仅在人乳腺癌和肺癌组织中进行了验证,尚未在其他癌症类型或更大样本中测试 | 识别癌症组织中RNA与代谢物的空间相关性 | 人乳腺癌和肺癌组织 | 空间多组学 | 乳腺癌,肺癌 | 解吸电喷雾电离质谱成像,空间转录组学 | NA | 质谱成像数据,转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学,空间代谢组学 | Visium | Visium空间转录组学 |
5748 | 2025-10-06 |
Unlocking novel T cell-based immunotherapy for hepatocellular carcinoma through neoantigen-driven T cell receptor isolation
2025-Jun-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334148
PMID:39832892
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌患者肿瘤组织、肝灌洗液和淋巴结中的T细胞反应,探索新抗原反应性T细胞的特征及其在免疫治疗中的应用潜力 | 首次系统比较了肝细胞癌不同解剖部位(肿瘤组织、肝灌洗液和引流淋巴结)中新抗原反应性T细胞的功能特征,并成功分离出表达4-1BB的新抗原反应性T细胞进行TCR测序 | 研究样本量较小(仅7名患者),且仅限于晚期肝细胞癌患者 | 评估肝细胞癌患者中新抗原驱动的T细胞反应,探索免疫治疗新策略 | 晚期肝细胞癌患者的肿瘤组织、肝灌洗液和肝引流淋巴结中的T细胞 | 免疫肿瘤学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,共培养实验,生物信息学分析 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,序列数据 | 7名晚期肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5749 | 2025-10-06 |
Glucocorticoid receptor suppresses GATA6-mediated RNA polymerase II pause release to modulate classical subtype identity in pancreatic cancer
2025-Jun-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334374
PMID:39884837
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研究论文 | 本研究揭示了糖皮质激素受体通过抑制GATA6介导的RNA聚合酶II暂停释放来调控胰腺癌经典亚型身份的分子机制 | 首次发现GR激动剂通过与GATA6相互作用抑制经典转录程序,揭示了GATA6通过启动子近端暂停释放调控亚型特异性转录的新机制 | NA | 揭示控制胰腺癌亚型身份的转录调控机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的经典和基底亚型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, HiChIP, PRO-seq, dCas9基因编辑 | NA | 基因组学数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 染色质可及性分析 | NA | NA |
5750 | 2025-10-06 |
An erythroid-biased FOShi hematopoietic multipotent progenitor subpopulation contributes to adaptation to chronic hypoxia
2025-Jun-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.03.010
PMID:40220764
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了一种促红细胞生成的FOShi多能祖细胞亚群,揭示了其在慢性缺氧适应中的关键作用及潜在治疗策略 | 首次发现具有干扰素信号响应特征的促红细胞生成多能祖细胞亚群(FOS MPP),并揭示其通过维持红系基因低甲基化实现缺氧记忆功能 | 研究仅基于小鼠高海拔红细胞增多症模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探索慢性缺氧适应的细胞和分子机制 | 小鼠造血干细胞和祖细胞(HSPCs)及红细胞 | 单细胞基因组学 | 高海拔红细胞增多症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠造血干细胞、祖细胞和红细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5751 | 2025-10-06 |
3D reconstruction of a human Carnegie stage 9 embryo provides a snapshot of early body plan formation
2025-Jun-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.04.007
PMID:40345192
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研究论文 | 利用空间转录组学对Carnegie stage 9人类胚胎进行3D重建,揭示早期身体计划形成的转录组和空间复杂性 | 首次通过空间转录组学对完整CS9人类胚胎进行详细分析,识别了后脑发育的两个不同轨迹、峡部组织者的精确定位以及神经中胚层祖细胞的双层结构 | 仅分析单个胚胎样本,可能无法代表所有CS9胚胎的发育变异 | 研究人类早期胚胎发育过程中的身体计划形成机制 | Carnegie stage 9人类胚胎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,3D重建 | NA | 空间转录组数据,图像数据 | 1个人类胚胎,75个横切面冷冻切片 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
5752 | 2025-10-06 |
Transmembrane emp24 domain-containing protein 3 promotes the malignant progression of glioma by regulating the ZBTB7A signaling axis
2025-Jun-05, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00274-7
PMID:40471367
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研究论文 | 本研究揭示TMED3通过调控ZBTB7A信号轴促进胶质母细胞瘤恶性进展的机制 | 首次系统阐明TMED3在胶质母细胞瘤中的致癌作用及其通过ZBTB7A信号轴调控的分子机制 | TMED3与ZBTB7A相互作用的具体分子机制仍需进一步探索 | 探索胶质母细胞瘤的新治疗靶点 | 胶质母细胞瘤组织和细胞系 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,免疫共沉淀,体外实验,体内实验 | NA | 基因表达数据,实验数据 | TCGA数据库样本和实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5753 | 2025-10-06 |
Multi-omics exploration of CAV1+ tumor epithelial subcelltype in oral squamous cell carcinoma and its impact on the immune microenvironment
2025-Jun-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02843-2
PMID:40471478
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研究论文 | 通过多组学方法探索口腔鳞状细胞癌中CAV1+肿瘤上皮亚型的特征及其对免疫微环境的影响 | 首次在OSCC中鉴定出CAV1+上皮亚型,揭示其通过NECTIN1-CD96信号网络与T细胞相互作用导致免疫逃逸的新机制 | 研究基于单细胞和空间转录组数据,需要进一步实验验证机制 | 揭示口腔鳞癌肿瘤上皮细胞亚型特征及其在肿瘤进展中的作用 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者样本 | 数字病理 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
5754 | 2025-10-06 |
Muscle stem cells in Duchenne muscular dystrophy exhibit molecular impairments and altered cell fate trajectories impacting regenerative capacity
2025-Jun-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07755-1
PMID:40473604
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了杜氏肌营养不良症中卫星细胞的分子损伤和细胞命运轨迹改变 | 首次在单细胞水平系统揭示DMD卫星细胞的转录组异常和分化能力受损机制,并发现诱导自噬可挽救DMD祖细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型,人类DMD患者样本验证尚需进一步研究 | 探究杜氏肌营养不良症中卫星细胞功能障碍的分子机制 | 杜氏肌营养不良症小鼠模型(mdx和D2-mdx)中的肌肉卫星细胞 | 单细胞生物学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | mdx和D2-mdx DMD小鼠模型的卫星细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5755 | 2025-10-06 |
Machine learning and multi-omics analysis reveal key regulators of proneural-mesenchymal transition in glioblastoma
2025-Jun-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-04862-z
PMID:40473799
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研究论文 | 通过机器学习和多组学分析揭示胶质母细胞瘤中前神经-间质转化的关键调控因子 | 首次系统识别17个PMT相关基因,发现这些基因主要在免疫细胞和血管中表达而非肿瘤细胞 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步实验验证 | 探索胶质母细胞瘤前神经-间质转化的分子机制 | 胶质母细胞瘤患者组织和细胞亚群 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 蛋白质组学, 单细胞转录组分析 | Lasso, Cox, Step算法 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据 | 胶质母细胞瘤患者数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
5756 | 2025-10-06 |
Multi-omics analyses reveal interactions between GREM1+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in gastric cancer
2025-Jun-05, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00967-w
PMID:40473882
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研究论文 | 通过多组学分析揭示胃癌中GREM1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞间的相互作用 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA测序和空间转录组学系统解析胃癌微环境中GREM1+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞的相互作用网络 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步功能实验验证相互作用的分子机制 | 探究胃癌肿瘤微环境中细胞间相互作用的特征及其临床意义 | 胃癌组织样本及其微环境中的细胞组成 | 数字病理学 | 胃癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化染色 | NA | 转录组数据, 空间定位数据, 免疫组化图像 | 12个独立胃癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
5757 | 2025-10-06 |
Dissecting the tumor microenvironment in primary breast angiosarcoma: insights from single-cell RNA sequencing
2025-Jun-05, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-02022-9
PMID:40474296
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析原发性乳腺血管肉瘤肿瘤微环境的细胞异质性和关键信号通路 | 首次在原发性乳腺血管肉瘤中应用单细胞RNA测序技术系统解析肿瘤微环境,发现CXCL12-CXCR4轴的关键作用 | 样本量较小(仅3例患者),需要更大规模研究验证发现 | 阐明原发性乳腺血管肉瘤的肿瘤微环境特征,寻找潜在治疗靶点 | 原发性乳腺血管肉瘤和浸润性乳腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 血管肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据 | 3例患者(1例双侧原发性乳腺血管肉瘤,2例浸润性乳腺癌),共31,771个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5758 | 2025-10-06 |
ICOSL, OX40L, and CD30L control persistence of asthmatic CD4 tissue-resident memory CD4 T cells
2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1097
PMID:39921040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别控制哮喘CD4组织驻留记忆T细胞持续存在的共刺激分子,并验证其联合抑制的治疗潜力 | 首次发现ICOSL、OX40L和CD30L共刺激分子联合抑制可持久减少肺组织驻留记忆T细胞数量和活性 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证 | 探索控制哮喘记忆CD4 T细胞再活化的共刺激分子及其治疗价值 | 哮喘患者和小鼠模型的肺CD4 T细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类哮喘患者和小鼠模型的肺CD4 T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5759 | 2025-10-06 |
Injury and obesity differentially and synergistically induce dysregulation of synovial immune cells in osteoarthritis
2025-Jun, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.03.001
PMID:40188009
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了关节损伤和肥胖对骨关节炎滑膜免疫细胞的差异性和协同性调控作用 | 首次系统比较了关节损伤和肥胖两种主要风险因素对滑膜免疫细胞组成的独立和协同影响,揭示了肥胖动物在关节损伤后促炎单核细胞来源巨噬细胞的异常增多 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探究关节损伤和肥胖对骨关节炎滑膜免疫细胞表型的影响机制 | 小鼠膝关节囊中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组学,免疫分型,转基因小鼠模型,遗传命运图谱 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫表型数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5760 | 2025-05-10 |
Insights and perspectives on the role of APOC1 inhibition in modulating immunotherapy outcomes in HCC: Commentary on Inhibition of APOC1 promotes the transformation of M2 into M1 macrophages via the ferroptosis pathway and enhances anti-PD1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma based on single-cell RNA sequencing
2025-Jun, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103564
PMID:40339430
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |