单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37491 篇文献，本页显示第 5721 - 5740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5721 | 2025-12-11 |
Protocol to analyze changes in hippocampal neural stem cell quiescence from single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-24, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104226
PMID:41289073
|
研究论文 | 本文提出了一种从单细胞RNA测序数据中分析小鼠海马神经干细胞静息状态变化的计算协议 | 通过计算协议克服了区分静息神经干细胞与星形胶质细胞以及增殖神经干细胞与祖细胞的挑战 | NA | 分析扰动如何影响神经干细胞静息深度 | 小鼠海马神经干细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5722 | 2025-12-11 |
Periductal Fibroblast Density Defines Lymphocyte Exclusion via a CD44-Dependent Stromal Checkpoint in Pancreatic Cancer
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.23.593868
PMID:38853982
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌中，导管周围成纤维细胞密度通过CD44依赖性基质检查点调控淋巴细胞排斥的机制 | 首次将癌症相关成纤维细胞分层的导管空间结构确立为PDAC中免疫排斥的基本决定因素，并识别出可靶向的“基质检查点” | 研究主要基于治疗初治患者样本，未涉及治疗后或晚期疾病阶段的动态变化 | 探究胰腺导管腺癌中纤维化对基质-导管结构和免疫细胞定位的影响 | 胰腺导管腺癌患者样本，包括恶性PDAC上皮导管区域 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 成像质谱流式技术、多重免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 图像、测序数据 | 来自三个独立队列的治疗初治患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5723 | 2025-12-11 |
Circulating Cathepsin D Exacerbates Injury-Induced Brain Damage by Promoting Neutrophil Infiltration Into the Brain
2025-Nov-04, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.043416
PMID:41147378
|
研究论文 | 本研究探讨了循环中的组织蛋白酶D（CTSD）如何通过上调脑内皮VCAM-1表达促进中性粒细胞浸润，从而加剧创伤性和缺血性脑损伤 | 首次揭示了循环中的非酶原型CTSD（pro-CTSD）通过激活脑内皮细胞上调VCAM-1表达，促进中性粒细胞向脑部迁移的新机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证；单细胞RNA测序样本量有限，可能未完全捕捉所有细胞类型的变化 | 探究循环CTSD对脑损伤后炎症反应的影响及其分子机制 | 转基因hCTSDhi小鼠（高循环CTSD水平）、CTSDMono敲除小鼠（低血浆CTSD水平）、创伤性和缺血性脑损伤模型 | 神经科学 | 脑损伤（创伤性脑损伤、缺血性脑损伤） | 单细胞RNA测序、转基因动物模型、行为学测试 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、行为学数据 | 两组转基因小鼠群体，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5724 | 2025-12-11 |
Emergence of endothelial subtypes and role of cell cycle control in arterial-venous specification during embryonic vascular development
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116368
PMID:41066228
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和Fucci胚胎模型，揭示了细胞周期控制在胚胎血管发育早期动静脉分化中的关键作用 | 首次在胚胎发育早期（血流出现前后）系统揭示内皮细胞亚型出现与细胞周期状态的关联，并证明细胞周期抑制剂p27在动静脉分化中的关键调控作用 | 研究主要聚焦于小鼠胚胎早期发育阶段（E8.0-E9.5），后期发育阶段和其他物种的验证仍需进一步探索 | 探究细胞周期控制在胚胎血管发育过程中动静脉分化中的作用机制 | 小鼠胚胎内皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，Fucci荧光报告系统，成像分析 | NA | RNA测序数据，成像数据 | E8.0、E8.5、E9.5三个时间点的胚胎内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5725 | 2025-12-11 |
A universal and cost-efficient sample labeling approach for multiplexed single-cell RNA-seq based on recombinant HUH-endonuclease-agglutinin tagging
2025-Oct-28, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.10.004
PMID:41167558
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为HEATag的通用细胞膜标记方法，用于多路复用单细胞RNA测序，以降低成本并提高效率 | 结合鸭环病毒HUH内切酶和小麦胚芽凝集素，实现高效、序列特异性的单链DNA标记，适用于多种物种和细胞状态 | NA | 开发一种成本效益高且可扩展的样本标记方法，以促进高通量单细胞研究 | 新鲜或固定细胞的细胞膜 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单链DNA标记数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5726 | 2025-12-11 |
Transcriptome Analysis Identified SPP1-Positive Monocytes as a Key in Extracellular Matrix Formation in Thrombi
2025-Oct-07, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.044299
PMID:41025474
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析发现SPP1阳性单核细胞在血栓细胞外基质形成中起关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出SPP1高表达的单核细胞/巨噬细胞亚群，并揭示其在血栓成熟过程中的核心作用 | 样本量较小（3个血栓用于RNA表达比较），且主要基于脑血栓和肺动脉血栓数据，可能不适用于所有血栓类型 | 探究血栓成熟的详细机制，特别是细胞外基质形成的关键因素 | 人类血栓样本（来自脑血管和肺动脉） | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | RNA表达数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 3个血栓用于RNA表达比较，66个血栓用于免疫组织化学验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5727 | 2025-12-11 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.12.623125
PMID:39605504
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了疟原虫在按蚊中肠内的关键发育阶段转变及蚊虫-寄生虫相互作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序与共聚焦显微镜技术，系统解析了疟原虫在蚊媒中肠内的发育轨迹和细胞互作网络，并发现转录因子SIP2对子孢子感染人肝细胞的关键作用 | 研究主要基于实验室培养的蚊虫-寄生虫体系，虽验证了部分野外来源寄生虫，但自然条件下的复杂互作机制仍需进一步探索 | 阐明疟原虫在按蚊体内的发育生物学机制及蚊虫-寄生虫相互作用 | 恶性疟原虫与按蚊的相互作用体系 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，功能分析 | NA | 单细胞转录组数据，显微成像数据 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫与蚊虫细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5728 | 2025-12-11 |
The immune landscape of pediatric (extra)cranial solid tumors: A systematic review and integration of immunohistochemistry and single-cell RNA sequencing data
2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2025.115708
PMID:40857838
|
系统综述 | 本文通过整合免疫组化和单细胞RNA测序数据，系统性地综述了儿童（颅）外实体瘤的免疫微环境特征 | 首次系统性地整合了免疫组化和单细胞/单核RNA测序数据，对儿童实体瘤的免疫景观进行了全面分析，并创建了公开可用的交互式热图图谱 | 纳入研究的方法学存在异质性，且部分肿瘤类型的数据仅来自单一技术 | 阐明儿童（颅）外实体瘤的独特免疫微环境，以指导针对儿童癌症的免疫治疗策略的开发与选择 | 儿童脑肿瘤和颅外实体瘤 | 数字病理学 | 儿童实体瘤 | 免疫组化，单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 图像，测序数据 | 共73项研究，包含2187个肿瘤样本（IHC）和272个肿瘤样本（sc/snSeq） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5729 | 2025-12-11 |
Identification of conserved gene expression changes across common glomerular diseases by spatial transcriptomics
2025-Sep, Journal of nephrology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s40620-025-02233-5
PMID:40067649
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，分析了多种肾小球疾病中肾小球特异性基因表达谱，以识别共同的基因表达变化 | 首次利用空间转录组学技术系统比较多种肾小球疾病中的基因表达变化，识别出35个一致下调的差异表达基因，并揭示了与DNA结合转录因子活性相关的分子功能 | 研究样本量有限，仅包括五种肾小球疾病类型，且未涵盖所有可能的疾病亚型，可能影响结果的普遍性 | 探索肾小球疾病中共同的基因表达通路，以揭示潜在的分子机制 | 肾小球疾病患者和健康肾脏捐赠者的肾活检标本 | 数字病理学 | 肾小球疾病 | 空间转录组学，免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | 包括肾小球疾病患者和健康捐赠者，具体样本数未明确说明，但涉及五种疾病类型 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler用于空间转录组分析，配置了疾病代表性肾小球区域兴趣点 |
| 5730 | 2025-12-11 |
Recent developments in omics studies and artificial intelligence in depression and suicide
2025-Aug-11, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-025-03497-y
PMID:40790016
|
综述 | 本文系统综述了与抑郁症和自杀相关的转录组学、非编码RNA和人工智能领域的最新进展 | 整合了高通量测序技术、多组学数据与人工智能方法，探讨了空间转录组学等新研究途径，并提出了未来研究方向 | NA | 寻找抑郁症和自杀的新分子通路、有效生物标志物和药物靶点，以提供有效的诊断、预后和治疗方案 | 重度抑郁症患者、自杀相关样本（血液样本、人尸检脑组织）以及各种动物模型 | 自然语言处理, 机器学习 | 抑郁症 | 高通量测序技术, 全基因组分析 | NA | 组学数据（转录组、表观基因组、蛋白质组） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5731 | 2025-12-11 |
Diminished SUV3 expression and its functional implications in the IFN-enriched monocyte subset of childhood Sjögren's disease
2025-Jul-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf193
PMID:40268748
|
研究论文 | 本研究探讨了儿童干燥综合征中单核细胞IFN富集亚群SUV3表达降低的分子和功能意义，揭示了mt-dsRNA介导的PKR激活导致固有免疫功能缺陷的新机制 | 首次在儿童干燥综合征的IFN富集单核细胞亚群中发现SUV3表达降低，并阐明其通过mt-dsRNA在胞质中积累激活PKR，进而导致线粒体功能障碍和炎症特征的新致病机制 | 研究主要基于体外细胞模型和患者样本分析，缺乏体内动物模型验证；样本量相对有限；机制研究集中在PKR通路，可能存在其他未被探索的调控途径 | 探究儿童干燥综合征中单核细胞亚群SUV3表达降低的分子机制及其对固有免疫功能的影响 | 儿童干燥综合征患者的CD14+单核细胞（特别是IFN富集亚群）及单核细胞系 | 单细胞组学与免疫学 | 自身免疫性疾病（儿童干燥综合征） | 单细胞RNA测序，fCLIP-qPCR，透射电子显微镜，体外功能实验（氧化应激、ATP产生、迁移和吞噬作用测定） | 基因敲低细胞模型 | 单细胞转录组数据，免疫沉淀数据，显微镜图像，功能测定数据 | 儿童干燥综合征患者与对照的单核细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5732 | 2025-12-11 |
CrebA regulation of secretory capacity: Genome-wide transcription profiling coupled with in vivo DNA binding studies
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.12.659381
PMID:40667345
|
研究论文 | 本文通过DNA结合实验、表达分析和单细胞RNA测序，揭示了果蝇CrebA转录因子通过直接调控分泌通路组分基因来增强胚胎唾液腺分泌能力的机制，并探讨了其与哺乳动物同源蛋白的保守功能 | 结合全基因组转录谱分析和体内DNA结合研究，首次在单细胞水平上系统探索CrebA结合与基因调控的关系，并比较了不同方法在识别靶基因上的差异 | CrebA结合大量基因但仅调控部分，功能结合与非功能结合的区分机制尚不明确；CrebA是否在所有果蝇胚胎组织中驱动SPCG表达或调控其他组织特异性功能仍需进一步研究 | 探究果蝇CrebA转录因子在增强分泌能力中的作用机制及其与基因调控的关联 | 果蝇胚胎唾液腺及多种组织中的CrebA转录因子及其靶基因 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、DNA结合实验、表达分析、结合位点诱变 | NA | RNA序列数据、DNA结合数据 | 野生型和CrebA缺失型果蝇胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5733 | 2025-12-11 |
Spatiotemporal Single-Cell Analysis Reveals T Cell Clonal Dynamics and Phenotypic Plasticity in Human Graft-versus-Host Disease
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.24.655962
PMID:40501545
|
研究论文 | 本研究通过时空单细胞分析揭示了人类移植物抗宿主病中T细胞克隆动态和表型可塑性 | 开发了新型计算工具DecompTCR用于纵向TCR分析，并结合多组学技术揭示了GVHD中T细胞克隆扩增与疾病严重性的关联 | 样本量相对较小（27例患者），且主要关注肠道组织，可能未全面覆盖其他器官的免疫反应 | 解析异基因造血细胞移植后急性移植物抗宿主病的T细胞介导病理机制 | 27例异基因造血细胞移植受者的血液和肠道组织样本 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA/TCR测序、空间转录组学、混合淋巴细胞反应克隆指纹识别、TCR克隆分型 | NA | 单细胞RNA-seq数据、TCR序列数据、空间转录组数据 | 27例异基因造血细胞移植受者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5734 | 2025-12-11 |
Lysozyme modulates inflammatory responses to exacerbate the severity of rheumatoid arthritis
2025-Apr-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114427
PMID:40056513
|
研究论文 | 本研究探讨了溶菌酶（LYZ）在类风湿关节炎（RA）中的作用机制，发现LYZ在早期RA患者中高表达并通过调节炎症通路加剧疾病进展 | 首次通过血浆蛋白质组学和滑膜液单细胞测序分析，结合基因敲除小鼠模型和细胞实验，系统揭示了LYZ在RA中的促炎作用及其作为早期诊断生物标志物或治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，人类样本验证有限，且未深入探讨LYZ在其他关节炎类型中的特异性 | 探究LYZ在RA发病机制中的作用，寻找新的治疗靶点或早期诊断生物标志物 | 早期RA患者血浆和滑膜液样本、Lyz1条件性敲除小鼠、MH7A细胞系（人滑膜成纤维细胞样细胞） | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 血浆蛋白质组学、单细胞测序、RNA测序（RNA-Seq） | CAIA小鼠模型（胶原抗体诱导关节炎） | 蛋白质组数据、单细胞测序数据、RNA测序数据 | 未明确样本数量，涉及早期RA患者血浆和滑膜液、Lyz1 cKO小鼠、MH7A细胞 | NA | 单细胞测序, RNA测序 | NA | NA |
| 5735 | 2025-12-11 |
Mechanisms and strategies of immunosenescence effects on non-small cell lung cancer (NSCLC) treatment: A comprehensive analysis and future directions
2025-Feb, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2025.01.001
PMID:39793777
|
综述 | 本文全面分析了免疫衰老对非小细胞肺癌（NSCLC）治疗的影响机制及策略，并探讨了未来研究方向 | 系统整合了免疫衰老的分子、细胞和遗传机制，并探讨了其在NSCLC肿瘤微环境中的作用，以及如何利用新兴技术（如单细胞测序和CRISPR-Cas9）作为治疗靶点 | 作为一篇综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献进行分析，可能缺乏对最新临床数据的即时覆盖 | 分析免疫衰老对NSCLC治疗的影响，并探索优化老年患者免疫治疗的策略 | 非小细胞肺癌（NSCLC）及其与免疫衰老相关的免疫细胞（如T细胞、B细胞、NK细胞和巨噬细胞） | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序、CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5736 | 2025-12-11 |
Bypassing cisplatin resistance in Nrf2 hyperactivated head and neck cancer through effective PI3Kinase targeting
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.10.632413
PMID:39868226
|
研究论文 | 本研究评估了PI3K抑制剂在绕过Nrf2介导的顺铂耐药性中的疗效，通过体外和体内实验验证了gedatolisib在头颈鳞状细胞癌模型中的抗肿瘤活性 | 首次揭示PI3K-AKT-mTOR通路在Nrf2驱动的顺铂耐药头颈鳞状细胞癌中的关键作用，并证明PI3K抑制剂gedatolisib能通过激活自噬、衰老和破坏脂肪酸代谢来恢复耐药细胞对顺铂的敏感性 | 研究主要基于临床前模型（包括免疫缺陷和人源化小鼠模型），尚未进行临床试验验证 | 评估PI3K抑制剂在克服头颈鳞状细胞癌中Nrf2介导的顺铂耐药性的疗效 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）细胞系和动物模型 | 肿瘤学 | 头颈鳞状细胞癌 | 转录组学、代谢组学、信号通路分析、shRNA筛选、空间转录组学 | 动物模型（皮下、原位和转移性异种移植模型） | 基因表达数据、代谢数据、信号通路数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及多种体外和体内模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5737 | 2025-12-11 |
MEF2C is a Potential Prognostic Biomarker and is Correlated with Immune Infiltrates in Lung Adenocarcinoma
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了MEF2C在肺腺癌中的表达、预后价值及其与免疫浸润的关联 | 首次系统性地研究了MEF2C在泛癌及肺腺癌中的表达模式，并揭示了其与免疫细胞浸润、免疫检查点基因、肿瘤突变负荷及药物敏感性的相关性 | 研究主要基于TCGA数据库的生物信息学分析，实验验证部分相对有限，需要更多体内外实验进一步证实 | 探究MEF2C在肺腺癌中的生物学功能、预后价值及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者样本、肺腺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、qRT-PCR | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | TCGA数据库中的肺腺癌样本及多种癌症样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5738 | 2025-12-11 |
Multiple Machine Learning Models, Molecular Subtyping and Singlecell Analysis Identify PANoptosis-related Core Genes and their Association with Subtypes in Crohn's Disease
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究首次构建了克罗恩病（CD）的PANoptosis特征，并探讨了其与疾病亚型及免疫机制的关系 | 首次将PANoptosis与克罗恩病关联，并利用多种机器学习算法和单细胞分析构建了PANoptosis特征基因签名 | 未明确说明样本来源的具体平台细节，且研究基于现有数据集，可能需要进一步实验验证 | 探究PANoptosis在克罗恩病中的作用机制及其与疾病亚型的关联 | 克罗恩病患者的数据集 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | LASSO, SVM, 随机森林, 决策树, 高斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5739 | 2025-12-11 |
Analyzing and Validating the Role of Genes Related to Glucagon-like Peptide-1 Signaling in the Prognosis of Pancreatic Cancer
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过分析GLP-1信号相关基因在胰腺癌中的表达和突变，开发了一个基于3个基因的RiskScore模型，用于评估胰腺癌预后，并验证了其预测准确性 | 首次将GLP-1信号通路基因与胰腺癌预后模型结合，开发了一个独立的RiskScore模型，并通过单细胞RNA-seq和免疫浸润分析揭示了其生物学机制 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证模型的普适性和临床应用价值 | 开发一个可靠的基于GLP-1信号的预后工具，以指导胰腺癌的治疗 | 胰腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | LASSO回归, Cox回归, RiskScore模型, nomogram模型 | RNA-seq数据 | 来自UCSCXena和GEO数据库的胰腺癌患者样本，包括GSE156405队列用于单细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5740 | 2025-12-11 |
Machine Learning-based Gene Biomarker Identification for Improving Prognosis and Therapy in Hepatocellular Carcinoma
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过整合基因表达数据、机器学习算法、肿瘤微环境分析和药物敏感性分析，识别了肝细胞癌（HCC）的七个关键基因生物标志物，并开发了HCC预后相关指数（HPRI）以改善预后和治疗指导 | 结合101种统计模型的机器学习算法筛选关键基因，并首次开发基于这些基因的HPRI指数，同时通过单细胞测序分析揭示基因在恶性细胞和成纤维细胞中的表达模式 | 研究依赖于公开数据库（ICGC、GEO、TCGA）的回顾性数据，未进行前瞻性临床验证，且样本异质性可能影响结果的普适性 | 识别肝细胞癌的分子生物标志物以改善预后预测和治疗指导 | 肝细胞癌患者及其基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序分析、Cox回归分析、差异表达分析 | 机器学习算法（包括101种统计模型） | 基因表达数据和临床病理信息 | 多个队列（来自ICGC、GEO、TCGA数据库），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |