单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
5701	2024-12-01	Wogonin mitigates microglia-mediated synaptic over-pruning and cognitive impairment following epilepsy 2024-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.156222 PMID:39547095	研究论文	研究黄酮类化合物Wogonin对癫痫后微胶质细胞介导的突触过度修剪和认知障碍的影响	首次探讨了Wogonin通过AKT/FoxO1通路抑制微胶质细胞的炎症反应和突触吞噬作用，从而减轻癫痫后的突触过度修剪和认知障碍	研究仅在动物模型上进行，尚未在人类中验证其效果	探讨Wogonin对癫痫后微胶质细胞介导的突触修剪和认知功能的影响	癫痫小鼠模型及其认知功能	神经科学	癫痫	单细胞测序	NA	图像	使用Pilocarpine诱导的癫痫小鼠模型，样本量为未知
5702	2024-12-01	Single-cell dissection reveals immunosuppressive F13A1+ macrophage as a hallmark for multiple primary lung cancers 2024-Dec, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70091 PMID:39601163	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了多发性原发性肺癌（MPLC）和单发性原发性肺癌（SPLC）的肿瘤及邻近组织，揭示了MPLC中特异性富集的免疫抑制性F13A1+巨噬细胞亚型	发现了MPLC中特异性富集的免疫抑制性F13A1+巨噬细胞亚型，并揭示了其在塑造免疫抑制性肿瘤微环境和促进肿瘤生长中的作用	NA	探讨多发性原发性肺癌（MPLC）与单发性原发性肺癌（SPLC）之间的分子机制差异	多发性原发性肺癌（MPLC）和单发性原发性肺癌（SPLC）的肿瘤及邻近组织	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	MPLC和SPLC患者的肿瘤及邻近组织样本
5703	2024-12-01	Granzyme K+CD8+ T cells interact with fibroblasts to promote neutrophilic inflammation in nasal polyps 2024-Nov-29, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54685-1 PMID:39614076	研究论文	研究了鼻息肉中GZMK+CD8+ T细胞与成纤维细胞的相互作用，揭示了其促进中性粒细胞炎症的机制	首次发现GZMK+CD8+ T细胞通过表达CXCR4与CXCL12分泌的成纤维细胞相互作用，诱导后者产生中性粒细胞趋化因子，从而促进中性粒细胞炎症	研究仅限于鼻息肉和相关炎症疾病，未探讨其他疾病中的潜在作用	探讨鼻息肉中中性粒细胞炎症的机制	GZMK+CD8+ T细胞与成纤维细胞的相互作用	免疫学	鼻窦炎	单细胞分析、空间转录组学、T细胞受体测序	NA	细胞	未明确提及具体样本数量
5704	2024-12-01	Single-cell multiomics reveals simvastatin inhibits pan-cancer epithelial-mesenchymal transition via the MEK/ERK pathway in XBP1+ mast cells 2024-Nov-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-80858-5 PMID:39604504	研究论文	研究通过单细胞多组学分析，揭示辛伐他汀通过MEK/ERK通路抑制泛癌种上皮-间质转化（EMT）在XBP1+肥大细胞中的作用	首次揭示辛伐他汀通过抑制XBP1+肥大细胞中的MEK/ERK信号通路，逆转泛癌种中的EMT过程	研究主要基于体外实验验证，缺乏体内实验数据支持	探讨肥大细胞在肿瘤微环境中的作用及其在系统治疗中的潜在靶点	肥大细胞及其在泛癌种转移中的作用	数字病理学	泛癌种	单细胞测序	WGCNA和12种机器学习算法	单细胞数据	泛癌种转移的单细胞测序数据
5705	2024-12-01	BOP1: A pivotal prognostic biomarker in clear cell renal cell carcinoma uncovered through integrated bulk and single-cell sequencing 2024-Nov-28, Asian journal of surgery IF:3.5Q1 DOI:10.1016/j.asjsur.2024.10.159 PMID:39613603	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
5706	2024-12-01	Advancing toward a unified eosinophil signature from transcriptional profiling 2024-Nov-27, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiae188 PMID:39213186	研究论文	本文总结了先前在血液和组织中对小鼠和人类嗜酸性粒细胞进行的转录组研究，并讨论了各种方法的优缺点	本文提出了一个统一的嗜酸性粒细胞转录特征，并讨论了未来研究的机会和知识空白	本文主要总结了现有研究，未提供新的实验数据	旨在推进嗜酸性粒细胞生物学研究，并促进跨研究比较	小鼠和人类的嗜酸性粒细胞	NA	NA	单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列	NA	转录组数据	涉及小鼠和人类样本，具体数量未提及
5707	2024-12-01	Functional profiling of murine glioma models highlights targetable immune evasion phenotypes 2024-Nov-27, Acta neuropathologica IF:9.3Q1 DOI:10.1007/s00401-024-02831-w PMID:39592459	研究论文	研究通过功能基因筛选和单细胞转录组学分析，揭示了小鼠胶质瘤模型中的免疫逃逸机制	通过CRISPR基因编辑和机器学习方法，识别了三种关键的癌症内在逃逸机制，并发现了与人类胶质母细胞瘤相似的依赖性	研究主要基于小鼠模型，需要进一步验证在人类患者中的适用性	探讨小鼠胶质瘤模型中的免疫逃逸机制，并寻找潜在的治疗靶点	小鼠胶质瘤模型GL261和CT2A，以及人类胶质母细胞瘤	数字病理学	脑癌	CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、机器学习	机器学习	基因数据、转录组数据	两个小鼠胶质瘤模型（GL261和CT2A），多种免疫细胞（细胞毒性T细胞、自然杀伤细胞、巨噬细胞）
5708	2024-12-01	Sele-targeted siRNA liposome nanoparticles inhibit pathological scars formation via blocking the cross-talk between monocyte and endothelial cells: a preclinical study based on a novel mice scar model 2024-Nov-27, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1 DOI:10.1186/s12951-024-03003-4 PMID:39593088	研究论文	研究开发了一种新型小鼠瘢痕模型，并通过RNA测序和单细胞测序分析，揭示了机械张力和慢性炎症在病理性瘢痕形成中的关键作用，同时开发了靶向E-选择素（Sele）的siRNA脂质体纳米颗粒（LNPs），有效抑制了瘢痕形成	首次开发了一种新型小鼠瘢痕模型（Retroflex Scar Model, RSM），并利用该模型揭示了机械张力和慢性炎症在病理性瘢痕形成中的关键作用，同时开发了靶向E-选择素的siRNA脂质体纳米颗粒（LNPs），为预防病理性瘢痕提供了新的治疗策略	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证其有效性和安全性	探讨病理性瘢痕形成机制，并开发新的治疗策略	小鼠瘢痕模型、E-选择素（Sele）、siRNA脂质体纳米颗粒（LNPs）	NA	创伤和烧伤并发症	RNA测序、单细胞测序、Western blotting、免疫荧光、共免疫沉淀	NA	RNA、蛋白质	小鼠模型、人类病理性瘢痕（Keloid）样本
5709	2024-12-01	Single-cell transcriptome analysis reveals CD34 as a marker of human sinoatrial node pacemaker cardiomyocytes 2024-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54337-4 PMID:39604360	研究论文	本文通过单细胞转录组分析揭示了CD34作为人类窦房结起搏心肌细胞的标志物	首次报道了CD34作为窦房结起搏细胞的细胞表面标志物，并展示了其在干细胞分化培养中对窦房结细胞的富集作用	NA	揭示人类窦房结的细胞和分子组成，特别是寻找窦房结起搏细胞的细胞表面标志物	人类窦房结起搏心肌细胞及其标志物	数字病理学	心血管疾病	单细胞/单核RNA测序	NA	转录组数据	胎儿和人类多能干细胞衍生的窦房结细胞
5710	2024-12-01	SLC2A3 promotes head and neck squamous cancer developing through negatively regulating CD8+ T cell in tumor microenvironment 2024-11-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-79417-9 PMID:39604419	研究论文	研究探讨了SLC2A3在头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中的作用及其对肿瘤微环境中CD8+ T细胞的影响	首次揭示了SLC2A3在HNSC中的预后意义及其通过抑制CD8+ T细胞促进肿瘤发展的机制	研究主要基于TCGA数据库和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证	探讨SLC2A3在头颈部鳞状细胞癌中的预后意义及其对肿瘤微环境中免疫细胞的影响	SLC2A3基因、CD8+ T细胞、头颈部鳞状细胞癌患者	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序、磁激活细胞分选、流式细胞术、基因集富集分析、Western blot	NA	基因表达数据、单细胞数据	504名头颈部鳞状细胞癌患者
5711	2024-12-01	Single-cell RNA sequencing reveals multiple immune cell subpopulations promote the formation of abnormal bone microenvironment in osteoporosis 2024-11-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-80993-z PMID:39604551	研究论文	本文通过单细胞RNA测序揭示了多种免疫细胞亚群在骨质疏松症中异常骨微环境形成中的作用	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨质疏松症中多种免疫细胞亚群及其在异常骨微环境形成中的作用	研究仅限于单细胞RNA测序数据分析，缺乏体内实验验证	识别促进骨质疏松症发展的免疫细胞亚群，为新疗法的开发提供基础	骨质疏松症中的免疫细胞亚群及其在异常骨微环境形成中的作用	数字病理学	骨质疏松症	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个样本
5712	2024-12-01	Proximal tubule cell maturation rate and function are controlled by PPARα signaling in kidney organoids 2024-Nov-27, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-07069-6 PMID:39604738	研究论文	研究了PPARα信号在肾脏类器官中近端小管细胞成熟率和功能中的作用	揭示了PPARα信号在近端小管细胞成熟中的关键作用，并提出了一种促进近端小管细胞成熟的方法	NA	探索肾脏类器官中近端小管细胞的成熟机制，并开发促进其成熟的方法	人多能干细胞衍生的肾脏类器官中的近端小管细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	时间序列的肾脏类器官样本
5713	2024-12-01	Interleukin-1β modulates lymphoid differentiation of Flt3-positive multipotent progenitors after transplantation 2024-Nov-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114890 PMID:39425929	研究论文	研究探讨了IL-1β在移植后调节Flt3阳性多能祖细胞淋巴分化中的作用	首次揭示了IL-1β在促进B淋巴生成中的未被认识的功能，并强调了IL-1β在调节MPP细胞命运动态中的潜在作用	NA	研究IL-1β在移植后调节多能祖细胞淋巴分化中的机制	Flt3阳性多能祖细胞（MPPs）及其淋巴分化	NA	NA	单细胞RNA测序（RNA-seq）	NA	RNA	小鼠多能祖细胞（MPPs）
5714	2024-12-01	scRNA-seq revealed transcriptional signatures of human umbilical cord primitive stem cells and their germ lineage origin regulated by imprinted genes 2024-11-26, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-79810-4 PMID:39587190	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示了人类脐带原始干细胞及其生殖系起源的转录特征，这些特征受印记基因调控	首次通过单细胞RNA测序技术展示了从脐带血中纯化的人类VSELs的分子特征，并发现其与小鼠骨髓来源的VSELs具有相似的转录特征	研究仅限于脐带血中的VSELs，未涉及其他组织来源的VSELs	探讨人类脐带原始干细胞及其生殖系起源的转录特征及其受印记基因调控的机制	人类脐带血中的VSELs及其转录特征	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	脐带血中的VSELs样本
5715	2024-12-01	Spatial transcriptomics reveals substantial heterogeneity in triple-negative breast cancer with potential clinical implications 2024-Nov-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54145-w PMID:39592577	研究论文	研究使用空间转录组学技术分析了三阴性乳腺癌的肿瘤组织结构和细胞组成	首次结合组织形态学和空间转录组学对三阴性乳腺癌的肿瘤微环境进行深入分析，并识别出与疾病预后和免疫治疗反应相关的基因特征	NA	探讨三阴性乳腺癌的空间异质性及其临床意义	NA	数字病理学	乳腺癌	空间转录组学	NA	基因表达数据	92名患者
5716	2024-12-01	Spatially organized tumor-stroma boundary determines the efficacy of immunotherapy in colorectal cancer patients 2024-Nov-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54710-3 PMID:39592630	研究论文	研究通过整合空间增强分辨率组学测序、单细胞RNA测序和多重成像分析，探讨了结直肠癌患者中肿瘤-基质边界的空间组织与免疫治疗效果的关系	首次揭示了肿瘤-基质边界的空间组织和免疫状态与免疫检查点阻断疗法反应的关联，并提出了通过重编程肿瘤-基质边界来增强免疫治疗效果的可能性	NA	探讨结直肠癌患者中肿瘤微环境的空间组织与免疫治疗效果的关系	结直肠癌患者的肿瘤微环境	数字病理学	结直肠癌	空间增强分辨率组学测序、单细胞RNA测序、多重成像分析	NA	空间图谱	治疗前和接受免疫检查点阻断疗法的结直肠癌患者
5717	2024-12-01	The immune landscape of murine skeletal muscle regeneration and aging 2024-Nov-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114975 PMID:39541212	研究论文	本文研究了小鼠骨骼肌再生和衰老过程中的免疫景观	揭示了骨骼肌内免疫群体的意外复杂性和功能异质性，并发现衰老过程中髓系和淋巴系细胞的重塑	NA	探讨免疫衰老对骨骼肌再生能力下降的贡献	小鼠骨骼肌再生和衰老过程中的免疫环境	NA	NA	单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学分析和功能检测	NA	单细胞RNA数据	NA
5718	2024-12-01	Leveraging CAR macrophages targeting c-Met for precision immunotherapy in pancreatic cancer: insights from single-cell multi-omics 2024-Nov-26, Molecular medicine (Cambridge, Mass.) DOI:10.1186/s10020-024-00996-4 PMID:39592929	研究论文	本研究利用单细胞多组学技术，探索了一种针对胰腺癌的新型免疫治疗策略，通过工程化CAR巨噬细胞靶向c-Met蛋白，以消除癌症干细胞并抑制肿瘤血管生成	本研究首次利用单细胞多组学技术，开发了靶向c-Met的CAR巨噬细胞，用于胰腺癌的精准免疫治疗	本研究主要在体外和小鼠模型中进行，尚未在临床试验中验证其疗效	探索针对胰腺癌的新型免疫治疗策略，特别是通过靶向癌症干细胞和肿瘤血管生成	胰腺癌组织中的癌症干细胞和肿瘤血管生成	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA数据	胰腺癌组织样本和小鼠模型
5719	2024-12-01	Integrated analyses of multi-omic data derived from paired primary lung cancer and brain metastasis reveal the metabolic vulnerability as a novel therapeutic target 2024-Nov-26, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-024-01410-8 PMID:39593114	研究论文	本文通过综合分析来自154名患者的配对和未配对的原发性肺癌和脑转移瘤的多组学数据，揭示了线粒体特异性代谢在肺癌脑转移瘤中的激活和肿瘤免疫微环境的抑制，并提出了一种基于合理机制的联合治疗策略	本文首次揭示了肺癌脑转移瘤中线粒体特异性代谢的激活和肿瘤免疫微环境的抑制，并提出了一种新的治疗靶点——氧化磷酸化	本文的研究结果主要基于体外实验和动物模型，尚未在临床试验中验证	深入理解肺癌脑转移瘤的分子机制和肿瘤微环境，开发新的治疗策略	原发性肺癌和脑转移瘤的多组学数据	数字病理学	肺癌	基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和单细胞RNA测序	NA	多组学数据	154名患者的配对和未配对的原发性肺癌和脑转移瘤样本
5720	2024-12-01	TET2 promotes tumor antigen presentation and T cell IFN-γ, which is enhanced by vitamin C 2024-Nov-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.175098 PMID:39388288	研究论文	本文研究了TET2基因在肿瘤抗原呈递和T细胞IFN-γ中的作用，并探讨了维生素C对其增强效果	首次揭示了TET2在肿瘤抗原呈递中的额外功能，并证明了维生素C对此功能的增强作用	NA	探讨TET2在肿瘤免疫中的作用及其与维生素C的关系	TET2基因、维生素C、肿瘤抗原呈递、T细胞IFN-γ	NA	NA	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	RNA	B16-OVA黑色素瘤肿瘤样本及患者肿瘤样本