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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5701 | 2025-12-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular diversity and gene expression dynamics in maize root development
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1666531
PMID:41393869
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了玉米根尖发育过程中的细胞多样性和基因表达动态 | 首次在玉米根尖中应用单细胞RNA测序技术,构建了高分辨率的转录图谱,并发现了与拟南芥和水稻不同的激素相关基因表达模式 | 研究仅针对玉米根尖组织,未涵盖整个根系系统;单细胞测序技术本身存在技术噪音和细胞捕获偏差 | 阐明玉米根发育在单细胞分辨率下的分子基础 | 玉米根尖组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5702 | 2025-12-18 |
Single-cell RNA-seq reveals breast cancer heterogeneity and identifies TCP1 as a therapeutic target in breast cancer
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20451
PMID:41394417
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析乳腺癌异质性,识别出TCP1作为潜在治疗靶点 | 通过单细胞RNA测序高分辨率解析乳腺癌肿瘤微环境异质性,首次发现KRT17阳性亚群与患者生存相关,并验证TCP1在乳腺癌细胞迁移和侵袭中的关键作用 | 样本量相对有限(68例),且主要基于回顾性分析,需要进一步前瞻性研究验证 | 解析乳腺癌肿瘤异质性并识别新的治疗靶点 | 乳腺癌患者肿瘤样本(68例)及乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),拷贝数变异推断(inferCNV) | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 68例乳腺癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5703 | 2025-12-18 |
Single-cell profiling identifies heterogeneity of the immune microenvironment in healthy, primary and lymph node metastatic BC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1690992
PMID:41394809
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫组化数据,揭示了乳腺癌及其淋巴结转移灶中肿瘤内皮细胞的异质性,并发现了两种新的肿瘤富集内皮细胞亚型(EC4和EC5)及其与免疫微环境的相互作用 | 首次在乳腺癌中鉴定出两种先前未被表征的、肿瘤富集的内皮细胞亚型(EC4和EC5),揭示了它们亚型特异性的功能适应和预后意义,并阐明了这些新内皮细胞亚群与免疫细胞(特别是CD8+T细胞和巨噬细胞)之间新颖且亚型特异性的通讯机制 | 研究样本量相对有限(约12个样本,98,000个细胞),且主要关注乳腺癌,结论在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 阐明乳腺癌及其淋巴结转移灶中肿瘤内皮细胞的异质性、功能及其与肿瘤免疫微环境的相互作用,以发现新的治疗靶点 | 来自原发性乳腺癌肿瘤、ER阳性淋巴结转移灶和健康组织的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,图像数据 | 约12个样本,共98,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 5704 | 2025-12-18 |
Efferocytosis-induced metabolic shift in bone macrophages drives lactate production and modulates inflammation and osteoclastogenesis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1650465
PMID:41394808
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了骨髓来源巨噬细胞在吞噬凋亡成骨细胞后,其代谢向糖酵解转变并产生乳酸,进而调节骨微环境中的炎症和破骨细胞生成 | 首次在单细胞水平上表征了骨微环境中执行胞葬作用的巨噬细胞亚群,并阐明了其代谢重编程(向糖酵解转变)及产生的乳酸在调节骨稳态中的关键作用 | 研究主要基于体外骨髓来源巨噬细胞模型,体内骨微环境的复杂性和其他细胞类型的相互作用可能未被完全涵盖 | 探究巨噬细胞在清除凋亡成骨细胞(胞葬作用)后发生的代谢改变及其对骨微环境(炎症和骨重塑)的调控作用 | 骨髓来源巨噬细胞、凋亡的成骨细胞、破骨细胞 | 单细胞组学 | 骨代谢疾病 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,代谢组学分析,乳酸ELISA | NA | 单细胞转录组数据,代谢物数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5705 | 2025-12-18 |
Unveiling the novel value of TREM1 in the proneural-mesenchymal transition of glioma via tumor-associated macrophages
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662351
PMID:41394801
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研究论文 | 本研究揭示了TREM1在胶质母细胞瘤肿瘤相关巨噬细胞中介导前神经-间质转化(PMT)的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序结合TCGA数据分析,将TREM1鉴定为肿瘤相关巨噬细胞中驱动胶质母细胞瘤PMT的关键生物标志物,并阐明了其通过TLR4/PI3K/AKT/mTOR信号通路发挥作用的机制 | 样本量相对较小(7名患者),且体内实验仅使用了腹腔给药模型,需要更大规模的临床验证和更多给药途径的探索 | 探究TREM1在胶质母细胞瘤肿瘤相关巨噬细胞中介导前神经-间质转化的作用机制及治疗潜力 | 胶质母细胞瘤患者样本(肿瘤相关巨噬细胞和恶性细胞) | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, mRNA测序, 共培养系统, 体内给药实验 | LASSO-Cox回归, 加权基因共表达网络分析 | 单细胞RNA测序数据, mRNA测序数据 | 7名胶质母细胞瘤患者的24,366个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5706 | 2025-12-18 |
Integrated multi-omics elucidates PRNP knockdown-mediated chemosensitization to gemcitabine in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1667835
PMID:41394830
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了PRNP基因在胰腺导管腺癌中对吉西他滨耐药的关键调控作用及其通过EMT和铁死亡的双重机制 | 首次系统性地将PRNP基因鉴定为PDAC吉西他滨耐药的关键调控因子,并阐明其通过促进EMT和抑制铁死亡的双重作用机制,同时利用单细胞和空间转录组学揭示了其在化疗后特定CAF亚群中的富集与免疫抑制微环境的关联 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,临床验证尚不充分,且PRNP靶向治疗策略的实际临床转化效果有待进一步评估 | 系统研究胰腺导管腺癌中吉西他滨耐药的机制并识别新的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞系、小鼠模型和临床患者数据 | 生物信息学与多组学整合分析 | 胰腺癌 | 微阵列、转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习算法 | 多组学数据(包括转录组、蛋白质组、单细胞和空间转录组数据) | 涉及胰腺癌细胞系、小鼠模型和临床患者数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5707 | 2025-12-18 |
Single-cell transcriptomics reveals pathogen interactions and T cell reprogramming in HIV and Mycobacterium tuberculosis co-infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680538
PMID:41394852
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了HIV与结核分枝杆菌共感染中病原体相互作用及T细胞重编程的机制 | 通过单细胞RNA测序结合有向无环图推断伪时间轨迹,首次系统描绘了从健康到HIV感染再到共感染的免疫细胞动态变化,并识别了Th1/Th17失衡及MHC-I偏向的T细胞信号重配置 | 研究样本来自未治疗早期状态,可能无法完全反映疾病进展或治疗后的免疫变化,且样本量相对有限 | 探究HIV与结核分枝杆菌共感染中病原体相互作用及宿主免疫重塑的机制 | 健康对照、HIV单感染及HIV-Mtb共感染参与者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | HIV感染与结核病共感染 | 单细胞RNA测序 | 有向无环图 | 单细胞转录组数据 | 健康对照、HIV单感染及HIV-Mtb共感染参与者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5708 | 2025-12-18 |
Mechanistic Study of CD90-Positive Synovial Fibroblasts in the Invasion and Recurrence of Pigmented Villonodular Synovitis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S549953
PMID:41394900
|
研究论文 | 本研究通过整合RNA测序和微阵列分析,探讨了色素沉着绒毛结节性滑膜炎中CD90阳性滑膜成纤维细胞在侵袭和复发中的作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序数据识别了PVNS滑膜中CD90+PDPN+滑膜成纤维细胞亚群,并揭示了其在炎症因子分泌、骨降解和侵袭特性中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证CD90+PDPN+细胞作为治疗靶点的有效性 | 阐明色素沉着绒毛结节性滑膜炎的发病机制,特别是滑膜成纤维细胞在疾病侵袭和复发中的作用 | 色素沉着绒毛结节性滑膜炎患者的滑膜组织,以及与骨关节炎滑膜组织的对比 | 数字病理学 | 色素沉着绒毛结节性滑膜炎 | RNA测序, 微阵列分析, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色, 免疫荧光染色, Western blot, 流式细胞术, Transwell迁移侵袭实验, 伤口愈合实验 | CIBERSORT算法, GSEA分析, KEGG通路富集分析 | 基因表达谱数据, 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 | 来自GSE3698、GSE175626和GSE176133数据库的PVNS和骨关节炎滑膜样本 | NA | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5709 | 2025-12-18 |
Machine Learning and Mendelian Randomization Identify Allergic Rhinitis as Nasopharyngeal Carcinoma Risk Factor With Validated Potential Candidate Biomarkers
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/2281787
PMID:41395113
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学和孟德尔随机化方法,全面绘制了鼻咽癌的细胞异质性图谱,并确立了过敏性鼻炎与鼻咽癌发病之间的潜在因果关系 | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,揭示了过敏性鼻炎作为鼻咽癌风险因素的因果联系,并识别了遗传验证的分子通路 | 研究样本量有限,且主要基于遗传关联分析,需进一步实验验证因果机制 | 探究过敏性鼻炎与鼻咽癌之间的因果关系及分子机制 | 鼻咽癌组织及邻近正常组织样本 | 机器学习 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | NA | 转录组数据, 遗传变异数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5710 | 2025-12-18 |
Single-Cell Profiling Identifies Reward Behavior-Related Neurons and Alterations in the Ventral Tegmental Area Based on Arvcf-Knockout Mouse Model
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1030
PMID:41395251
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学、神经蛋白质组学和多重免疫荧光成像技术,基于Arvcf敲除小鼠模型,揭示了腹侧被盖区(VTA)中与奖励行为相关的神经元亚群及其在尼古丁诱导奖励中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下,结合Arvcf敲除小鼠模型和尼古丁暴露,识别出VTA中一种谷氨酸能-多巴胺能组合神经元亚群,并发现其通过Wnt信号通路与多巴胺能神经元通信,在尼古丁诱导的奖励学习中起关键调节作用 | 研究基于小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证;单细胞测序技术可能无法捕获所有神经元类型的完整转录组信息 | 探究Arvcf基因敲除对VTA神经元亚群的影响,以及这些亚群在奖励行为(特别是尼古丁诱导的奖励)中的分子和功能角色 | 野生型和Arvcf敲除小鼠的腹侧被盖区(VTA)神经元,包括经尼古丁处理和非处理的样本 | 神经科学 | 成瘾行为 | 单核RNA测序(snRNA-seq)、神经蛋白质组学、多重免疫荧光成像、代谢物检测 | Arvcf敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、成像数据 | 96,240个细胞,来自野生型和Arvcf敲除小鼠,有或无尼古丁处理 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 5711 | 2025-12-18 |
Modifications of lipid pathways restrict SARS-CoV-2 propagation in human induced pluripotent stem cell-derived 3D airway organoids
2024-06, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.08.005
PMID:37557954
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞衍生的3D气道类器官,揭示了脂质代谢途径的修饰如何通过影响ACE2受体的细胞内定位来限制SARS-CoV-2的传播 | 首次在模拟人类呼吸道生理的iPSC-AOs模型中,系统阐明了脂质代谢修饰(如他汀类药物)通过重定位ACE2受体来抑制多种SARS-CoV-2变异株进入和复制的机制 | 研究主要基于体外类器官模型,其在完全模拟体内复杂免疫环境和全身代谢相互作用方面存在局限 | 阐明脂质代谢修饰影响SARS-CoV-2感染的分子机制,探索针对宿主代谢的抗病毒替代策略 | 人诱导多能干细胞衍生的气道类器官(iPSC-AOs)及SARS-CoV-2病毒(包括野生型、Alpha、Delta、Omicron变异株) | 干细胞与类器官研究 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(ScRNAseq)、免疫荧光染色、生物信息学分析、假病毒实验 | 3D类器官模型 | 单细胞转录组数据、显微图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5712 | 2025-12-17 |
Spatial single-cell proteomics landscape decodes the tumor microenvironmental ecosystem of intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001283
PMID:39999448
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研究论文 | 本研究利用人工智能辅助的空间多组学技术,生成了肝内胆管癌(iCCA)的全面空间图谱,揭示了肿瘤微环境(TME)的空间特征与患者预后和免疫治疗的关系 | 首次结合空间多组学(包括成像质谱流式、空间蛋白质组学、空间转录组学等)和深度学习系统,解析iCCA的空间TME生态系统,识别出与预后相关的空间拓扑结构和亚型 | 空间转录组学样本量较小(n=4),部分数据依赖公共数据库,可能影响结果的普遍性 | 阐明iCCA肿瘤微环境的空间特征,以改善患者预后预测和个性化治疗策略 | 肝内胆管癌(iCCA)患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 成像质谱流式、空间蛋白质组学、空间转录组学、多重免疫荧光、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、bulk蛋白质组学 | 深度学习系统 | 图像、蛋白质组数据、转录组数据 | 超过106万个细胞,包括155个内部成像质谱流式样本、155个内部空间蛋白质组学样本、4个内部空间转录组学样本、20个内部多重免疫荧光样本、9个内部和34个公共单细胞RNA测序样本、244个公共bulk RNA测序样本、110个内部和214个公共bulk蛋白质组学样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, bulk蛋白质组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 5713 | 2025-12-17 |
Application of CTC-derived spheroid for drug screening toward personalized treatment in patients with breast cancer
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102573
PMID:41151488
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研究论文 | 本研究建立了一种基于循环肿瘤细胞(CTCs)衍生的球体药物筛选工作流程,用于乳腺癌的个性化治疗 | 利用微流控平台从血液中分离CTCs并培养成球体进行药物筛选,结合激素受体表达、基因组突变谱和空间转录组学分析,克服了组织依赖性类器官模型的局限性 | 样本量较小(34例新诊断患者,其中13例进行药物筛选),且部分患者未接受建议的治疗 | 开发一种临床可行的、基于液体活检的工作流程,用于乳腺癌的个性化药物筛选和治疗指导 | 新诊断和复发转移的乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微流控分离、球体培养、药物敏感性测试、基因组测序、空间转录组学 | NA | 细胞计数、药物反应数据、基因表达谱、空间转录组数据 | 34例新诊断乳腺癌患者,其中13例复发患者进行CTC球体药物筛选 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium in situ 空间转录组分析平台 |
| 5714 | 2025-12-17 |
A Glycerophospholipid Metabolism-Based Prognostic Model Guides Osteosarcoma Therapy
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102572
PMID:41172875
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研究论文 | 本研究基于甘油磷脂代谢构建了一个预后模型,用于指导骨肉瘤的治疗策略 | 整合了批量转录组和单细胞RNA-seq数据,首次量化了骨肉瘤中的甘油磷脂代谢活性,并构建了一个优于42个已发表特征的预后模型 | 样本量相对有限,且模型在外部验证中的表现未明确说明 | 探究甘油磷脂代谢在骨肉瘤进展、免疫和治疗中的作用,并构建预后模型 | 骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Lasso-Cox模型 | 转录组数据 | TARGET队列85例,GEO队列124例,单细胞RNA-seq数据6个骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5715 | 2025-12-17 |
Magrolimab (Hu5F9-G4) promotes macrophage M1 polarization and is associated with enhanced autophagy in colorectal cancer
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102598
PMID:41218551
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞免疫检查点抑制剂Hu5F9-G4(Magrolimab)在结直肠癌中通过促进M2d向M1极化、抑制肿瘤进展并影响自噬通路所展现的治疗潜力 | 首次揭示了Hu5F9-G4在结直肠癌中通过促进巨噬细胞M1极化并增强自噬发挥抗肿瘤作用的机制,并鉴定出CDKN1A和MAP1LC3B作为潜在的自噬相关治疗靶点 | 研究样本量有限(73例),且临床前模型结果需在更大规模临床试验中进一步验证 | 探究巨噬细胞免疫检查点抑制剂Hu5F9-G4对结直肠癌免疫微环境、巨噬细胞行为及肿瘤进展的影响,以确定潜在治疗靶点 | 结直肠癌组织样本、体外培养的巨噬细胞与CRC细胞、荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析、生物信息学分析、临床验证 | NA | 转录组数据、临床数据、实验观测数据 | 73例CRC样本、体外细胞实验、小鼠体内实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5716 | 2025-12-17 |
Development of a single-cell derived MDSCs signature score for prognostic risk stratification and therapeutic decision guidance in breast cancer
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102605
PMID:41252877
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于单细胞来源的MDSCs特征评分系统,用于乳腺癌的预后风险分层和治疗决策指导 | 首次系统性地表征了乳腺癌中新的MDSCs基因特征,并建立了一个具有多方面临床转化能力的MDSCs相关标记评分框架 | NA | 开发用于乳腺癌预后风险分层和治疗决策指导的MDSCs特征评分系统 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 整合了单细胞数据集GSE161529和GSE176078,识别了12,767个MDSCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5717 | 2025-12-17 |
Single-cell RNA sequencing analysis identified GARP-expressing myeloid cells that deteriorate postinfarct myocardial remodeling
2026-Jan-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00595.2025
PMID:41264320
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,鉴定出一种表达GARP的髓系细胞群(GEM细胞),并揭示了其在心肌梗死后通过调节中性粒细胞浸润和心肌细胞凋亡来恶化心脏重塑的作用机制 | 首次通过靶向单细胞RNA测序技术鉴定出表达GARP的髓系细胞群(GEM细胞),并阐明其来源于心脏驻留的纤维细胞,通过GARP/TGF-β轴调控中性粒细胞浸润和心肌细胞凋亡,从而恶化心肌梗死后心脏重塑 | 研究主要基于小鼠模型,虽然人类Visium数据提示GARP+CD11b+细胞存在于梗死心肌中,但GEM细胞在人类心肌梗死中的具体功能和临床相关性仍需进一步验证 | 阐明心肌梗死后心脏重塑的调控机制,特别是髓系细胞在其中的具体作用 | 小鼠心肌梗死模型中的髓系细胞(特别是GARP表达髓系细胞)以及人类心肌梗死患者的心肌组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),空间转录组学(Visium) | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 用于scRNA-Seq的10x Chromium单细胞平台,以及用于空间转录组学分析的10x Visium平台 |
| 5718 | 2025-12-17 |
Multi-omics analysis reveals the heterogeneity and interactions among stromal and tumor cells in gastric cancer
2026-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102614
PMID:41275708
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学等多组学分析,揭示了胃癌中癌症相关成纤维细胞和平滑肌细胞的异质性及其与恶性上皮细胞的相互作用 | 首次在胃癌中系统描绘了CAFs和SMCs的异质性谱系,并通过轨迹推断、调控网络分析和空间映射揭示了肿瘤-基质间的不对称信号串扰 | 研究结果需要进一步的实验验证,特别是配体-受体对和空间决定因素的功能验证 | 探究胃癌肿瘤微环境中基质细胞的异质性及其与肿瘤细胞的相互作用,以识别潜在的治疗靶点 | 胃癌组织中的癌症相关成纤维细胞、平滑肌细胞和恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 轨迹推断, 调控网络分析, 配体-受体相互作用建模 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5719 | 2025-12-17 |
Multi-omics characterization of autophagy-related molecular features in intrahepatic cholestasis of pregnancy†
2025-Dec-16, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf184
PMID:40796229
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研究论文 | 本研究通过多组学方法系统表征了妊娠期肝内胆汁淤积症中自噬相关的分子特征 | 首次结合非靶向脂质组学、单细胞RNA测序和RNA测序数据,全面揭示ICP中自噬相关脂质、细胞和基因表达变化,并验证了TNFSF10作为潜在治疗靶点 | 样本量未在摘要中明确说明,可能限制结果的普遍性 | 探究自噬在妊娠期肝内胆汁淤积症发病机制中的作用 | 胎盘组织、细胞模型和动物模型 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 非靶向脂质组学, scRNA-seq, RNA-seq | NA | 脂质组数据, 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5720 | 2025-12-17 |
The Spatially Resolved Kidney Transcriptome Signatures in Rat Models of Trauma-Induced Acute Kidney Injury
2025-Dec-15, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001045
PMID:41396698
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研究论文 | 本研究利用大鼠模型,通过bulk和空间转录组学技术,揭示了创伤诱导急性肾损伤中出血性休克和横纹肌溶解的个体及协同作用机制 | 首次在临床相关大鼠模型中结合bulk和空间转录组学,成功将小鼠空间转录组探针应用于大鼠肾脏组织,实现了成本效益高且区域特异性的基因表达分析 | 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的直接适用性需进一步验证 | 阐明创伤诱导急性肾损伤的分子机制,以识别新型生物标志物和治疗策略 | 大鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | bulk转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |