单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
5701	2024-12-28	Identification of a seven-gene prognostic model for renal cell carcinoma associated with CD8+T lymphocyte cell 2024-Oct-04, Medicine IF:1.3Q2 DOI:10.1097/MD.0000000000039938 PMID:39465721	研究论文	本研究通过分析肾细胞癌（RCC）中CD8+ T淋巴细胞相关的基因特征，构建了一个七基因预后模型	首次构建了一个与CD8+ T淋巴细胞相关的七基因预后模型，用于肾细胞癌患者的风险分层	研究数据主要来源于The Cancer Genome Atlas，可能缺乏多样性和广泛性	构建一个与CD8+ T淋巴细胞相关的肾细胞癌预后模型	肾细胞癌患者	生物信息学	肾细胞癌	加权基因共表达网络分析、基因本体富集分析、京都基因与基因组百科全书信号通路分析、单细胞测序	LASSO回归、单变量和多变量Cox回归	基因表达数据	来自The Cancer Genome Atlas的肾细胞癌患者数据
5702	2024-12-28	Genetic Implication of Prenatal GABAergic and Cholinergic Neuron Development in Susceptibility to Schizophrenia 2024-08-27, Schizophrenia bulletin IF:5.3Q1 DOI:10.1093/schbul/sbae083 PMID:38869145	研究论文	本研究探讨了孕期GABA能和胆碱能神经元发育在精神分裂症易感性中的遗传影响	结合大规模全基因组关联研究和单细胞RNA测序数据，揭示了精神分裂症遗传风险在特定神经元群体中的富集	研究主要基于预测的调控基因组序列，需要进一步实验验证	探讨孕期神经元发育在精神分裂症遗传风险中的作用	人类胚胎期的神经节隆起（GE）细胞群体	遗传学	精神分裂症	单细胞RNA测序，单核ATAC测序（snATAC-Seq）	NA	基因组数据，单细胞RNA测序数据	NA
5703	2024-12-28	Unraveling the Prefrontal Cortex-Basolateral Amygdala Pathway's Role on Schizophrenia's Cognitive Impairments: A Multimodal Study in Patients and Mouse Models 2024-07-27, Schizophrenia bulletin IF:5.3Q1 DOI:10.1093/schbul/sbae063 PMID:38811350	研究论文	本研究通过多模态技术探讨了前额叶皮层-基底外侧杏仁核通路在精神分裂症相关认知障碍中的作用	揭示了mPFC-BLA通路在精神分裂症认知障碍中的关键作用，并提出了血液外泌体mRNA作为非侵入性生物标志物的潜力	研究主要依赖于小鼠模型，临床样本的验证仍需进一步扩大	探讨前额叶皮层-基底外侧杏仁核通路在精神分裂症相关认知障碍中的作用	精神分裂症患者和小鼠模型	神经科学	精神分裂症	磁共振成像、单细胞RNA测序、光遗传学	小鼠模型	临床量表、影像数据、基因表达数据	精神分裂症患者和小鼠模型
5704	2024-12-28	A New Graph Autoencoder-Based Consensus-Guided Model for scRNA-seq Cell Type Detection 2024-02, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2022.3190289 PMID:35857730	研究论文	本文提出了一种基于图自编码器的共识引导模型（scGAC），用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）中的细胞类型检测	提出了一种新的基于图自编码器（GAE）的共识引导模型（scGAC），通过迭代学习相似性矩阵来整合最终的一致性相似性矩阵，从而提高细胞类型识别的准确性	未提及具体的数据集或实验结果的局限性	提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性	单细胞RNA测序数据	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	图自编码器（GAE）	单细胞RNA测序数据	NA
5705	2024-12-28	An update review of the application of single-cell RNA sequencing in pregnancy-related diseases 2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2024.1415173 PMID:39717096	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在妊娠相关疾病中的应用	提供了scRNA-seq技术在人类胎盘研究中的最新进展，特别是在正常妊娠和妊娠相关疾病中的应用	讨论了scRNA-seq技术在生殖领域中的局限性和未来展望	更新产科医生对scRNA-seq技术在妊娠并发症中的理解，以帮助诊断和治疗这些疾病	人类胎盘，特别是在正常妊娠和妊娠相关疾病中的细胞	生物信息学	妊娠相关疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
5706	2024-12-28	Exposure to Nanoplastics Cause Caudal Vein Plexus Damage and Hematopoietic Dysfunction by Oxidative Stress Response in Zebrafish (Danio rerio) 2024, International journal of nanomedicine IF:6.6Q1 DOI:10.2147/IJN.S485091 PMID:39723177	研究论文	本研究探讨了纳米塑料对斑马鱼尾静脉丛发育和造血功能的负面影响及其机制	首次揭示了纳米塑料通过氧化应激反应导致斑马鱼尾静脉丛损伤和造血功能障碍的分子机制	研究仅基于斑马鱼胚胎模型，未涉及其他生物或人类细胞模型	探究纳米塑料对斑马鱼早期造血器官发育的影响	斑马鱼胚胎	环境毒理学	NA	荧光显微镜、RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR	NA	基因表达数据、显微镜图像	斑马鱼胚胎
5707	2024-12-28	Integration of bulk/scRNA-seq and multiple machine learning algorithms identifies PIM1 as a biomarker associated with cuproptosis and ferroptosis in abdominal aortic aneurysm 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1486209 PMID:39723205	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和多种机器学习算法，识别出与腹主动脉瘤中铁死亡和铜死亡相关的生物标志物PIM1	首次通过整合单细胞RNA测序和多种机器学习算法，识别出与腹主动脉瘤中铁死亡和铜死亡相关的生物标志物PIM1	研究主要依赖于生物信息学分析和机器学习模型，实验验证部分相对有限	识别与腹主动脉瘤中铁死亡和铜死亡相关的生物标志物	腹主动脉瘤	生物信息学	心血管疾病	scRNA-seq, bulk RNA-seq, RT-qPCR, western blot	LASSO, REF, RF, SVM	RNA-seq数据	三个小鼠模型的scRNA-seq数据集和一个人类PBMC的bulk RNA-seq数据集
5708	2024-12-28	Migrasome regulator TSPAN4 shapes the suppressive tumor immune microenvironment in pan-cancer 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1419420 PMID:39723210	研究论文	本文探讨了TSPAN4在多种癌症中的表达及其对肿瘤免疫抑制微环境的影响	首次揭示了TSPAN4作为迁移体调节因子在泛癌症中塑造免疫抑制肿瘤微环境的关键作用	TSPAN4在癌症中的具体机制仍需进一步实验验证	研究TSPAN4在癌症中的表达及其对肿瘤免疫微环境的影响	多种癌症类型，特别是胶质瘤	癌症研究	泛癌症	RNA-seq, scRNA-seq	NA	基因表达数据	TCGA Pan-Cancer (PANCAN) 和 TCGA TARGET GTEx 数据集
5709	2024-12-28	Multi-omics in exploring the pathophysiology of diabetic retinopathy 2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2024.1500474 PMID:39723239	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）及其他多组学技术在糖尿病视网膜病变（DR）研究中的重要作用	通过整合scRNA-seq与转录组学、遗传关联研究及多组学分析，揭示了DR发病机制的新见解，并识别了新的生物标志物、易感基因和潜在治疗靶点	尽管多组学技术提供了丰富的数据，但其在DR研究中的应用仍处于早期阶段，需要更多的验证和临床转化研究	探索糖尿病视网膜病变的病理生理机制	糖尿病视网膜病变（DR）	数字病理学	糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多组学分析	NA	转录组数据、代谢组数据	NA
5710	2024-12-28	Immune cells lacking Y chromosome show dysregulation of autosomal gene expression 2021-Apr, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-021-03822-w PMID:33837451	研究论文	本文研究了Y染色体缺失（LOY）对白细胞中常染色体基因表达的影响	揭示了LOY在不同白细胞亚群中的广泛转录效应，挑战了Y染色体作为“遗传荒地”的观点	LOY与疾病风险增加的具体机制仍需进一步研究	探讨LOY对白细胞基因表达的影响及其与疾病风险的关联	白细胞	基因组学	阿尔茨海默病, 前列腺癌	DNA分析, RNA测序	NA	DNA, RNA	NA
5711	2024-12-26	Profiling cell identity and tissue architecture with single-cell and spatial transcriptomics 2025-Jan, Nature reviews. Molecular cell biology DOI:10.1038/s41580-024-00768-2 PMID:39169166	综述	本文综述了单细胞转录组学和空间转录组学在细胞身份和组织结构分析中的最新进展、挑战和前景	讨论了深度学习（包括基础模型）在单细胞和空间转录组数据分析中的应用，并展望了这些技术在生物研究和临床转化中的未来	未具体提及研究的局限性	探讨单细胞和空间转录组学在细胞状态和多细胞邻域识别与表征中的应用	健康与疾病组织中的细胞多样性和基因表达动态	生物信息学	肿瘤生物学	单细胞转录组学、空间转录组学	深度学习、基础模型	转录组数据	数百至数百万个细胞的靶向转录组和全转录组数据
5712	2024-12-26	Trem2/Tyrobp Signaling Protects Against Aortic Dissection and Rupture by Inhibiting Macrophage Activation in Mice 2025-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321429 PMID:39508103	研究论文	本研究探讨了Trem2/Tyrobp信号通路在小鼠主动脉夹层（AD）发展中的作用，发现其通过抑制巨噬细胞激活来保护主动脉免受夹层和破裂	首次揭示了Trem2/Tyrobp信号通路在主动脉夹层中的保护作用，并提出了通过增强该信号通路来预防和治疗主动脉夹层的新策略	研究主要基于小鼠模型，未来需要进一步研究Trem2/Tyrobp在人类主动脉夹层中的作用	探讨Trem2/Tyrobp信号通路在主动脉夹层发展中的作用及其潜在机制	小鼠主动脉夹层模型	心血管疾病	主动脉夹层	转录组分析、单细胞RNA测序、免疫荧光染色、定量实时聚合酶链反应	Tyrobp敲除小鼠、Trem2敲除小鼠	基因表达数据、RNA测序数据	小鼠模型
5713	2024-12-26	Guided monocyte fate to FRβ/CD163+ S1 macrophage antagonises atopic dermatitis via fibroblastic matrices in mouse hypodermis 2024-Dec-25, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-024-05543-2 PMID:39720957	研究论文	本文通过单细胞转录组学和流式细胞术研究了巨噬细胞在特应性皮炎中的状态变化，揭示了调控单核细胞获得S1身份的机制，并展示了通过外源性层粘连蛋白211促进单核细胞向S1巨噬细胞分化以缓解皮炎的效果	揭示了特应性皮炎中巨噬细胞S1亚型耗竭的机制，并首次展示了通过外源性层粘连蛋白211促进单核细胞向S1巨噬细胞分化以缓解皮炎的新方法	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	研究巨噬细胞在特应性皮炎中的状态变化及其调控机制，探索通过干预巨噬细胞分化缓解皮炎的可能性	小鼠皮肤中的巨噬细胞和单核细胞	免疫学	特应性皮炎	单细胞转录组学、流式细胞术	NA	基因表达数据、细胞表型数据	NA
5714	2024-12-26	Single cell profiling of hematopoietic stem cell transplant recipients reveals TGF-β1 and IL-2 confer immunoregulatory functions to NK cells 2024-Dec-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111416 PMID:39720529	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了在造血干细胞移植受者中，TGF-β1和IL-2如何赋予NK细胞免疫调节功能	首次定义了在造血干细胞移植后，CD56NK细胞群体与急性移植物抗宿主病（GVHD）保护之间的关联，并阐明了IL-2和TGF-β1联合作用在促进NK细胞调节表型中的角色	诱导的调节性NK细胞表型不稳定，暴露于不同细胞因子后会失去分泌TGF-β1的能力	研究造血干细胞移植后NK细胞的免疫调节功能	造血干细胞移植受者的NK细胞	免疫学	移植物抗宿主病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	造血干细胞移植受者的NK细胞样本
5715	2024-12-26	Myeloperoxidase and Thyrotropin-Releasing Hormone Within Leukaemia Stem Cells Increased Chemosensitivity in Acute Myeloid Leukaemia 2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70306 PMID:39720891	研究论文	本研究探讨了白血病干细胞（LSCs）中的髓过氧化物酶（MPO）和促甲状腺激素释放激素（TRH）在急性髓性白血病（AML）化疗敏感性中的作用	首次在LSCs中识别出MPO和TRH作为AML化疗敏感性的潜在生物标志物，并发现其与患者无复发生存率和总生存率的显著相关性	样本量较小（20名患者），且仅涉及接受'7+3'诱导治疗的患者，可能限制结果的普遍性	识别LSCs中能预测AML化疗敏感性的生物标志物	急性髓性白血病（AML）患者	生物医学研究	白血病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	20名新诊断的AML患者
5716	2024-12-26	Single-Cell RNA-Seq Reveals Injuries in Aortic Dissection and Identifies PDGF Signalling Pathway as a Potential Therapeutic Target 2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70293 PMID:39720896	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了主动脉夹层中的细胞异质性及相关损伤，并识别出PDGF信号通路作为潜在的治疗靶点	首次应用单细胞RNA测序技术全面解析主动脉夹层的细胞异质性，并发现PDGF信号通路在疾病中的关键作用	样本量较小，且未进行长期随访以验证治疗靶点的临床效果	揭示主动脉夹层的细胞异质性及分子机制，探索潜在治疗靶点	主动脉夹层患者及非主动脉夹层供体的主动脉细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	主动脉夹层患者及非主动脉夹层供体的主动脉细胞
5717	2024-12-26	Single-cell profiling uncovers synovial fibroblast subpopulations associated with chondrocyte injury in osteoarthritis 2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2024.1479909 PMID:39720254	研究论文	本研究通过单细胞测序分析揭示了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞损伤之间的相互作用和关联	首次通过单细胞测序技术详细分析了骨关节炎中滑膜成纤维细胞亚群与软骨细胞之间的相互作用，并识别了具有修复和保护作用的CILP+成纤维细胞以及可能加剧软骨损伤的POSTN+成纤维细胞	研究主要基于单细胞测序数据，缺乏体内实验验证，且样本量未明确说明	阐明骨关节炎中滑膜细胞与软骨细胞之间的相互作用和关联，以深化对骨关节炎发病机制的理解	骨关节炎患者的滑膜细胞和软骨细胞	单细胞测序	骨关节炎	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	NA
5718	2024-12-25	The role of the haematopoietic stem cell niche in development and ageing 2025-Jan, Nature reviews. Molecular cell biology DOI:10.1038/s41580-024-00770-8 PMID:39256623	综述	本文综述了造血干细胞（HSC）及其前体细胞（HSPC）在发育和衰老过程中与骨髓微环境（niche）的相互作用	本文通过单细胞转录组学和显微镜技术，揭示了HSC在发育过程中与不同niche的相互作用，并探讨了这些相互作用在衰老过程中的变化及其对造血疾病的影响	本文主要为综述性质，未提供具体实验数据或模型	探讨HSC与niche在发育和衰老过程中的相互作用，为改善自体HSC疗法和移植提供理论基础	造血干细胞（HSC）及其前体细胞（HSPC）与骨髓微环境（niche）的相互作用	NA	NA	单细胞转录组学、显微镜技术	NA	NA	NA
5719	2024-12-25	Hepatocellular carcinoma hosts cholinergic neural cells and tumoral hepatocytes harboring targetable muscarinic receptors 2025-Jan, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101245 PMID:39717507	研究论文	本文研究了肝细胞癌中胆碱能神经细胞的存在及其对肿瘤肝细胞中可靶向毒蕈碱受体的影响	首次在人类肝细胞癌中发现密集的DCX+、synaptophysin+、NeuN+、VAChT+、TH-、CD31-、CD45-簇，并通过单细胞RNA测序数据独立验证	研究主要基于法国肝脏生物库的数据和TCGA等数据集，可能存在样本多样性不足的问题	探索肝细胞癌中胆碱能神经过程的作用，并评估现有神经药物在肝细胞癌研究中的应用潜力	肝细胞癌中的胆碱能神经细胞和肿瘤肝细胞中的毒蕈碱受体	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	基因组数据	包括来自法国肝脏生物库的肝肿瘤样本、TCGA数据集、其他数据集以及欧洲验证队列
5720	2024-12-25	Interplay between Netrin-1 and Norrin controls arteriovenous zonation of blood-retina barrier integrity 2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2408674121 PMID:39693351	研究论文	研究探讨了Netrin-1和Norrin信号通路在控制视网膜屏障完整性中的相互作用	首次揭示了Netrin-1/Unc5b和Norrin/Lrp5信号通路在视网膜屏障中的区室化基因表达调控机制	研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步验证在人类中的适用性	探讨Netrin-1和Norrin信号通路在视网膜屏障完整性中的作用	视网膜屏障的完整性和基因表达调控	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用出生后视网膜屏障功能性小鼠视网膜内皮细胞进行单细胞RNA测序，识别了超过100个视网膜屏障相关基因