单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5681 - 5700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 5681 | 2025-10-06 |
Generation of a fluorescent hESC reporter line (Kle033-A-1) for the isolation of distinct midbrain progenitor cell types
2024-12, Stem cell research
IF:0.8Q4
DOI:10.1016/j.scr.2024.103523
PMID:39383604
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术构建了荧光标记的人胚胎干细胞报告系，用于分离中脑多巴胺能前体细胞 | 首次利用CRISPR/Cas9技术构建特异性荧光报告细胞系，实现两种中脑多巴胺能前体细胞（Rgl1和ProgM）的分离 | NA | 开发帕金森病细胞替代疗法的精确策略 | 人胚胎干细胞、中脑多巴胺能前体细胞 | 干细胞研究 | 帕金森病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5682 | 2025-10-06 |
Multi-sample non-negative spatial factorization
2024-Nov-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.01.599554
PMID:39005356
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研究论文 | 提出多样本非负空间因子分解(mNSF)框架，用于分析多样本空间转录组数据 | 将单样本空间因子分解(NSF)扩展到多样本数据集，无需空间对齐，包含样本特异性空间相关性建模 | 未明确说明具体的数据规模限制和计算复杂度 | 开发多样本空间转录组数据分析方法 | 多样本空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非负空间因子分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5683 | 2025-10-06 |
VisualZoneR: A computational protocol to identify compartmental zones from single-cell spatial transcriptomics using R
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103196
PMID:39067026
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研究论文 | 介绍一种基于R语言的VisualZoneR计算协议，用于从单细胞空间转录组数据中识别区室化区域 | 开发了专门用于分析Visium和Visium HD空间转录组数据的R语言工具，能够识别从健康组织到转移区域的不同区室 | NA | 建立从单细胞空间转录组数据中识别区室化区域的计算方法 | 肝脏组织，包括健康肝组织和转移区域 | 空间转录组学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium, Visium HD | 10x Visium空间转录组技术 |
| 5684 | 2025-10-06 |
Protocol for analysis of single-cell sequencing data by Seqtometry
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103209
PMID:39096493
|
研究论文 | 介绍用于单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据分析的Seqtometry分析平台协议 | 提出基于基因特征高级评分的Seqtometry分析平台，可直接通过生物学可解释维度识别和表征特定细胞 | NA | 开发单细胞测序数据分析协议 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 5685 | 2025-10-06 |
Protocol to achieve high-resolution single-cell transcriptomics of cardiomyocytes in multiple species
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103194
PMID:39096494
|
研究论文 | 提供从多种物种中获取心肌细胞高分辨率单细胞转录组测序的详细实验方案 | 开发了适用于稀有心肌细胞群体（如再生/分裂细胞）的scRNA-seq方案，支持跨物种应用 | NA | 建立高质量单细胞转录组测序的实验流程 | 小鼠和斑马鱼心脏以及诱导多能干细胞中的心肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5686 | 2025-10-06 |
Protocol to study the immune profile of syngeneic mouse tumor models
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103139
PMID:38878286
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研究论文 | 本文提供了一个用于研究同源小鼠肿瘤模型免疫特征的实验方案 | 整合了流式细胞术和单细胞RNA测序等多种技术来全面表征肿瘤微环境的免疫特征 | NA | 建立标准化流程来研究小鼠肿瘤模型的免疫特征 | 荷瘤小鼠的肿瘤组织和免疫相关器官 | 数字病理学 | 肿瘤 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 单细胞悬液制备 | NA | 单细胞数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5687 | 2025-10-06 |
Protocol for preparing mammalian skin samples encompassing hair follicles for spatial transcriptomics
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103254
PMID:39146191
|
方法论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学的哺乳动物皮肤样本制备方案，特别关注包含毛囊的样本 | 针对皮肤组织空间转录组学分析的挑战，开发了专门的样本制备流程 | 仅提供实验方案，未包含实际应用数据验证 | 建立适用于皮肤组织空间转录组学分析的标准化样本制备方法 | 哺乳动物皮肤组织样本，特别是包含毛囊的区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5688 | 2025-10-06 |
Somatic epigenetic drift during shoot branching: a cell lineage-based model
2024-Aug-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae091
PMID:38809088
|
研究论文 | 提出基于细胞谱系的模型研究植物分枝过程中的体细胞表观遗传漂变 | 首次形式化分离分生组织模型中细胞随机采样过程，揭示分枝过程中细胞谱系混合现象 | 理论模型需要实验验证，未考虑环境因素对表观遗传的影响 | 研究植物分枝过程中体细胞表观遗传变异的积累机制 | 植物顶端分生组织细胞 | 计算生物学 | NA | 理论建模 | 细胞谱系模型 | 理论模拟数据 | NA | NA | 单细胞测序，批量测序 | NA | NA |
| 5689 | 2025-10-06 |
Sample collection protocol for single-cell RNA sequencing of functionally identified neuronal populations in vivo
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103135
PMID:38875113
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研究论文 | 介绍一种在体功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序样本收集协议 | 结合病毒传递的活性依赖性标记工具(CaMPARI2)和虚拟现实环境，实现在体功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序 | NA | 开发功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序样本收集方法 | 小鼠神经元群体 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选(FACS) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5690 | 2025-10-06 |
Enhancing Vasculogenesis in Dental Pulp Development: DPSCs-ECs Communication via FN1-ITGA5 Signaling
2024-05, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10695-6
PMID:38418738
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了牙髓干细胞与血管内皮细胞通过FN1-ITGA5信号通路促进牙髓发育过程中血管生成的新机制 | 首次发现牙髓干细胞通过FN1-ITGA5信号通路与血管内皮细胞进行细胞间通讯，促进牙髓血管生成 | 研究主要基于体外实验和动物模型，临床转化仍需进一步验证 | 探索牙髓发育过程中血管形成的调控机制 | 牙髓干细胞(DPSCs)和血管内皮细胞(ECs) | 组织工程与再生医学 | 牙科疾病 | 单细胞测序, 免疫组织化学, Western blot, RT-PCR, 细胞增殖检测, 划痕实验, 管形成实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 发育期和成熟期牙髓样本，小鼠动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5691 | 2025-10-06 |
Identification and validation of an immunotherapeutic signature for colon cancer based on the regulatory patterns of ferroptosis and their association with the tumor microenvironment
2024-04, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119698
PMID:38387508
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研究论文 | 本研究基于铁死亡调控模式构建了结肠癌免疫治疗特征，并验证其与肿瘤微环境的关联 | 首次系统识别结肠癌中铁死亡的三种调控模式，构建FRG-score量化体系，发现APOL6作为铁死亡相关药物敏感靶点 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 开发基于铁死亡调控模式的结肠癌免疫治疗特征 | 结肠癌样本和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 1623个结肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5692 | 2025-10-06 |
Genetically supported causality between gut microbiota, prefrontal cortex and depression: insights from multiple Mendelian randomization, multi-omics analysis, and network pharmacology
2025-Oct-01, Journal of affective disorders
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jad.2025.119458
PMID:40419156
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研究论文 | 通过多组学分析和网络药理学方法研究肠道菌群与前额叶皮层在抑郁症中的因果关系 | 首次整合孟德尔随机化、多组学分析和网络药理学方法，系统阐明肠道菌群通过前额叶皮层影响抑郁症的因果机制 | 研究主要基于欧洲人群的GWAS数据，结果可能受人群异质性限制 | 探究肠道菌群与前额叶皮层在抑郁症发生发展中的因果关系和生物学机制 | 人类基因组数据、脑影像表型、抑郁症患者前额叶组织样本、CUMS诱导的小鼠模型 | 生物信息学 | 抑郁症 | 全基因组关联分析(GWAS)、孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序、RT-qPCR、免疫荧光分析、分子对接 | NA | 基因组数据、脑影像数据、基因表达数据 | GM数据(n=5959)、抑郁症数据(43,280病例,329,192对照)、脑影像表型数据(n=33,224) | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5693 | 2025-10-06 |
Endothelial Nrf2 deficiency promotes atherosclerotic lesion formation by shaping a proinflammatory niche
2025-Aug-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123725
PMID:40404122
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型证明内皮细胞Nrf2缺失通过诱导炎症特性和改变血管细胞通讯促进动脉粥样硬化形成 | 首次在单细胞水平揭示内皮Nrf2缺失通过改变内皮细胞转录组和细胞间通讯促进动脉粥样硬化的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究内皮细胞特异性Nrf2缺失在动脉粥样硬化形成中的作用机制 | Nrf2Cdh5tKO基因敲除小鼠和对照Nrf2flox/flox小鼠 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 组织学分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 基因工程小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5694 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and metabolomics reveal the potential role of ASRGL1 in metabolic reprogramming and invasion of nasopharyngeal carcinoma cells
2025-08, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106788
PMID:40320045
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和代谢组学分析揭示了ASRGL1在鼻咽癌细胞代谢重编程和侵袭中的潜在作用 | 首次在鼻咽癌中系统研究ASRGL1的表达特征和功能，发现其通过影响氨基酸代谢促进肿瘤侵袭 | 研究主要基于公共数据集和细胞系实验，缺乏体内实验验证 | 探究ASRGL1在鼻咽癌进展中的具体作用和机制 | 鼻咽癌细胞系C666-1和公共单细胞测序数据集 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, GC-MS, siRNA干扰, 细胞功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 细胞实验数据 | 公共数据集GSE150430和C666-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 5695 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional profiling reveals cellular senescence and inflammatory persistence as key features of type 1 diabetes partial remission
2025-Jul, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.16384
PMID:40183401
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析1型糖尿病部分缓解期的免疫机制 | 首次在单细胞水平揭示1型糖尿病部分缓解期存在细胞衰老和持续性炎症反应的特征 | 样本量相对有限，主要关注单核细胞亚群 | 探究1型糖尿病部分缓解期的免疫机制 | 健康对照、新诊断1型糖尿病患者和部分缓解期患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断、转录网络重建 | 单细胞转录组数据 | 健康对照、新诊断T1D患者和PR期患者的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5696 | 2025-10-06 |
CD44 Deficiency Induces Combinatory NRF2 Inhibition and Endoplasmic Reticulum Stress-Associated Dyserythropoiesis
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500228R
PMID:40488748
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研究论文 | 本研究揭示了CD44缺失通过抑制NRF2通路和诱导内质网应激导致红细胞生成异常的作用机制 | 首次阐明CD44在终末红细胞生成中通过调控PI3K/AKT/NRF2和p62/NRF2通路维持氧化还原稳态和蛋白质稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类红细胞生成中的验证尚不充分 | 探究CD44在红细胞生成中的具体功能和分子机制 | CD44基因敲除小鼠、红细胞前体细胞、小鼠胎肝细胞 | 分子生物学 | 溶血性贫血 | 单细胞测序、基因敲除、体外红细胞分化实验 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | CD44KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5697 | 2025-10-06 |
Loss of ARNTL Enhances ER Stress and Apoptosis in CKD Through Disruption of NRF2 Signaling
2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403398RRR
PMID:40489010
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研究论文 | 本研究揭示了ARNTL通过调控NRF2信号通路在慢性肾病中抑制内质网应激和细胞凋亡的保护机制 | 首次发现ARNTL直接结合NRF2启动子区域并通过蛋白互作调控NRF2激活，在慢性肾病中形成关键保护轴 | 研究主要基于细胞模型和动物模型，临床转化价值需要进一步验证 | 探索慢性肾病中内质网应激导致肾小管细胞凋亡的分子机制 | 慢性肾病患者的肾脏组织、CKD模型小鼠、HK2人肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 慢性肾病 | 单细胞测序, 蛋白互作分析, 启动子结合实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白水平数据, 单细胞测序数据 | CKD患者和模型小鼠的肾脏组织样本，HK2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5698 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal Functional and Spatial Heterogeneity of Atrial and Ventricular Cardiomyocytes in the Heart
2025-Jun-09, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01443-3
PMID:40488964
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示心脏中房性和室性心肌细胞的功能与空间异质性 | 首次结合单细胞RNA测序与空间定位技术，系统解析心肌细胞亚群的空间分布特征及细胞间通讯网络 | 研究基于分离的心脏细胞，可能丢失部分原生组织环境信息 | 阐明房性和室性心肌细胞的空间分布模式及其在能量代谢、泵功能和调节功能中的特异性作用 | 心脏组织中的房性心肌细胞(aCM)和室性心肌细胞(vCM) | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, PCA分析, t-SNE聚类, 配体-受体相互作用分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5699 | 2025-10-06 |
A spatially organized Cd24a+/Pax9+ stem cell core governs postnatal tooth establishment
2025-Jun-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu5653
PMID:40479070
|
研究论文 | 本研究揭示了Cd24a+/Pax9+干细胞核心在出生后牙齿建立过程中的空间组织与功能 | 首次发现并表征了空间组织的Cd24a+/Pax9+干细胞核心在哺乳动物牙齿发育中的关键作用 | NA | 探究出生后牙齿建立过程中干细胞的空间组织与发育机制 | 小鼠和人类牙齿组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,CUT&Tag,空间图谱 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5700 | 2025-10-06 |
Cathepsin C correlates with M2 macrophage infiltration and regulates the tumor growth and metastasis in non-small cell lung cancer
2025-Jun-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14341-3
PMID:40474091
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研究论文 | 本研究探讨组织蛋白酶C在非小细胞肺癌中的作用机制及其与M2巨噬细胞浸润的关系 | 首次通过单细胞测序揭示CTSC在非小细胞肺癌免疫微环境中的表达特征，并证实其与M2巨噬细胞浸润的正相关性 | 未明确CTSC调控M2巨噬细胞浸润的具体分子机制 | 阐明CTSC在非小细胞肺癌进展和转移中的调控作用 | 非小细胞肺癌细胞系、临床患者组织样本 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 基因集富集分析, 细胞功能实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床数据 | 临床非小细胞肺癌队列组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |