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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 5681 - 5700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5681 | 2026-01-01 |
Identifying and validating hypoxia- and metabolism-related hub genes and cell communication in atherosclerosis
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1680482
PMID:41458991
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和生物信息学分析，识别并验证了与动脉粥样硬化相关的缺氧和代谢枢纽基因及其细胞通讯机制 | 整合单细胞测序数据、缺氧相关基因和代谢相关基因，首次系统性地识别了动脉粥样硬化中的DE-MH-RGs，并通过多种分析方法验证了枢纽基因的诊断潜力和治疗靶点 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析，缺乏实验验证，且样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 揭示动脉粥样硬化中缺氧和代谢相关基因的调控机制，识别潜在的诊断标志物和治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者和正常对照的基因表达数据，包括单细胞测序数据和AS相关数据集 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，基因表达分析，功能富集分析，蛋白互作网络分析 | LASSO逻辑回归，GSEA，GSVA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 基于公共数据集GSE100927和GSE159677，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5682 | 2026-01-01 |
Celline: a flexible tool for one-step retrieval and integrative analysis of public single-cell RNA sequencing data
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1684227
PMID:41458999
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研究论文 | 本文介绍了Celline，一个用于一站式检索和整合分析公共单细胞RNA测序数据的灵活工具 | 开发了一个端到端的Python包，通过单行命令自动从多个公共存储库检索原始scRNA-seq数据，并利用大语言模型提取元数据，整合了多种现有工具进行质量控制、细胞类型注释、批次校正和轨迹推断 | NA | 为研究人员提供一个无缝检索、预处理、整合和分析公共单细胞RNA测序数据的解决方案 | 公共单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 2个小鼠大脑皮层数据集（胚胎期14.5天和18天） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5683 | 2026-01-01 |
Characteristics of CD103+CD8+ T cells in the spleen of Plasmodium yoelii NSM-infected mice
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1668438
PMID:41459157
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研究论文 | 本研究通过构建疟原虫感染小鼠模型，利用单细胞RNA测序和流式细胞术分析了脾脏中CD103+CD8+ T细胞的特性及其在感染过程中的变化 | 首次在疟原虫感染模型中系统描述了脾脏CD103+CD8+ T细胞的表型和功能特征，并发现转录因子LEF1可能通过结合Itgae启动子序列调控CD103表达 | 研究仅在小鼠模型中进行，未在人类样本中验证；机制研究主要基于生物信息学预测和报告基因实验，缺乏体内功能验证 | 探究疟原虫感染过程中脾脏CD103+CD8+ T细胞的特性及其功能意义 | C57BL/6小鼠脾脏中的CD45+细胞，特别是CD103+CD8+ T细胞亚群 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、qPCR、双荧光素酶报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、基因表达数据 | 未明确样本数量，使用C57BL/6小鼠构建感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5684 | 2026-01-01 |
Clustering Analysis of Multiple Omics Data Types Identifies Cancer Patients With Consistent Survival Outcomes
2025, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251394107
PMID:41459353
|
研究论文 | 本研究通过聚类分析多种组学数据类型，识别出具有一致生存结果的癌症患者 | 比较不同组学数据层聚类结果在捕获生存相关患者群组方面的一致性，并识别出跨组学数据一致聚类的患者群组及其与生存结果的关联 | 研究基于TCGA数据，可能受样本量和数据质量的限制，且未验证聚类结果在独立队列中的可重复性 | 评估不同组学数据类型聚类分析在癌症分层中的一致性及其与患者生存结果的关系 | TCGA中20种癌症类型的患者 | 机器学习 | 癌症 | miRNA表达分析、基因表达分析、DNA甲基化分析 | 聚类分析 | miRNA表达数据、基因表达数据、DNA甲基化数据 | TCGA中20种癌症类型的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5685 | 2026-01-01 |
Integrated analysis of the relationship between metabolic pathways and immune infiltration in rheumatoid arthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1679356
PMID:41459480
|
研究论文 | 本研究通过整合分析RNA-Seq数据和临床信息，探讨了类风湿关节炎中代谢通路与免疫浸润之间的关系，并构建了诊断模型 | 首次系统性地整合了代谢通路活性、免疫细胞浸润和共表达网络分析，识别出连接代谢重编程与免疫失调的关键枢纽基因，并利用LASSO模型构建了具有诊断潜力的工具 | 研究主要基于公开数据库的回顾性数据，部分发现（如COX7C的作用）仍需更多实验验证，且样本来源和异质性可能影响结果的普适性 | 阐明类风湿关节炎中代谢通路与免疫浸润之间的相互作用关系，并开发基于关键基因的诊断模型 | 类风湿关节炎患者与健康对照的RNA-Seq数据、临床信息以及单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | RNA-Seq, scRNA-seq, WGCNA, LASSO逻辑回归 | LASSO逻辑回归模型 | 基因表达数据（RNA-Seq, scRNA-seq）、临床数据 | 来自GEO数据库的多个独立数据集（具体样本数量未在摘要中明确说明） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5686 | 2026-01-01 |
Tertiary lymphoid structure drives allograft rejection via IFN-γ-JAK-STAT-dependent atypical memory B cell differentiation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728290
PMID:41459486
|
研究论文 | 本研究通过深度学习病理组学模型和单细胞RNA测序分析，揭示了三级淋巴结构通过IFN-γ-JAK-STAT通路驱动非典型记忆B细胞分化，从而介导移植物排斥的免疫机制 | 首次发现三级淋巴结构通过IFN-γ-JAK-STAT依赖的非典型记忆B细胞分化途径驱动移植物排斥，并开发了预测排斥反应的深度学习病理组学模型 | 研究主要基于回顾性队列和动物模型，需要前瞻性临床研究验证治疗靶点的有效性 | 探究三级淋巴结构在肝移植排斥反应中的病理作用、功能和形成机制 | 儿童活体肝移植后的肝活检组织、小鼠原位肝移植模型 | 数字病理学 | 肝移植排斥 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 深度学习, 生物信息学分析 | 深度学习病理组学模型 | 组织图像, 基因表达谱, 单细胞转录组数据 | 590例肝活检样本（来自三个转录组数据库）和11例单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5687 | 2026-01-01 |
IL-33 and IL-3 synergistically induce CD25 expression on human basophils without functional IL-2 signaling: a potential marker of severe COVID-19
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1718240
PMID:41459501
|
研究论文 | 本文研究了IL-33和IL-3协同诱导人嗜碱性粒细胞表达CD25的机制，并探讨其在严重COVID-19中的潜在生物标志物作用 | 首次揭示IL-33与IL-3协同上调嗜碱性粒细胞CD25表达，但缺乏功能性IL-2信号传导，并发现CD25可能作为严重COVID-19的潜在生物标志物 | 研究主要基于体外实验，体内验证不足；单细胞RNA测序数据分析为公开数据，未进行独立验证 | 探究嗜碱性粒细胞CD25表达的调控机制及其在炎症和COVID-19中的生物学意义 | 人嗜碱性粒细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公开的COVID-19患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5688 | 2026-01-01 |
TMEM106A mediates atherosclerosis progression through macrophage-centered immune responses and chemokine signaling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1681645
PMID:41459498
|
研究论文 | 本研究揭示了跨膜蛋白TMEM106A通过调控巨噬细胞介导的免疫反应和趋化因子信号通路，促进动脉粥样硬化进展 | 首次系统性地将TMEM106A鉴定为动脉粥样硬化的关键介质，并通过多组学分析和实验验证阐明了其在巨噬细胞中的特异性功能和分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，人类样本验证有限；TMEM106A的具体下游信号网络仍需进一步探索 | 阐明TMEM106A在动脉粥样硬化发病机制中的作用及其临床相关性 | 动脉粥样硬化患者样本、ApoE-/-小鼠模型、RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学与分子生物学 | 心血管疾病 | 转录组学分析、单细胞RNA-seq、免疫浸润分析、细胞间通讯分析、基因沉默 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 多个公共数据集（GSE43292, GSE100927, GSE28829, GSE159677）及ApoE-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5689 | 2026-01-01 |
Integrative bulk and single-cell transcriptome analyses reveal integrated stress response-related biomarkers in periodontitis with experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1705047
PMID:41459503
|
研究论文 | 本研究通过整合批量与单细胞转录组分析，揭示了牙周炎中与整合应激反应相关的生物标志物 | 首次整合批量与单细胞RNA测序数据，识别出BTG2、DERL3、FOS、HSPA13和YOD1作为牙周炎的新型生物标志物，并确定T细胞为关键细胞类型 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，实验验证仅限于RT-qPCR，缺乏更深入的体内功能验证 | 探究整合应激反应相关生物标志物在牙周炎发病机制中的作用 | 牙周炎相关的转录组数据及候选生物标志物 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5690 | 2026-01-01 |
Macrophage polarization: molecular mechanisms, disease implications, and targeted therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1732718
PMID:41459510
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞极化的分子机制、疾病意义及靶向治疗策略 | 超越经典的M1/M2二分法，强调极化状态的连续性和动态性，并整合代谢重编程、表观遗传机制及新兴治疗策略 | 临床转化面临脱靶效应、递送效率低、微环境依赖性等挑战 | 探讨巨噬细胞极化的分子基础及其在疾病中的作用，并综述靶向治疗策略 | 巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞组学、空间转录组学、计算建模、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5691 | 2026-01-01 |
Single-cell and bulk transcriptomics reveal a CD8+ T-cell gene signature predicting prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1685541
PMID:41459519
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，建立了一个CD8⁺ T细胞相关的预后特征，用于预测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的生存和CAR-T疗法疗效 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据分析DLBCL中CD8⁺ T细胞的异质性，并构建了一个基于CD8⁺ T细胞基因的预后模型，该模型能有效分层患者风险并预测CAR-T治疗反应 | 研究样本量相对有限（单细胞数据来自29个样本），且为回顾性分析，需要进一步的前瞻性验证 | 揭示DLBCL中CD8⁺ T细胞的异质性，并开发一个预后基因特征以预测患者生存和治疗反应 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者样本中的CD8⁺ T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO回归, 多变量Cox分析 | 转录组数据 | 单细胞数据来自29个样本（28名个体），包括DLBCL和反应性淋巴结/扁桃体样本；批量RNA-seq数据集未指定具体样本数 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5692 | 2026-01-01 |
Identification and validation of biomarkers related to centrosome replication in ulcerative colitis based on bulk transcriptome, single-cell RNA sequencing and experiments
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1627926
PMID:41459538
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研究论文 | 本研究通过整合批量转录组、单细胞RNA测序和实验验证，识别并验证了与溃疡性结肠炎中中心体复制相关的六个生物标志物 | 首次结合批量转录组、单细胞RNA测序和多种机器学习算法，系统性地识别并验证了与中心体扩增相关的基因在溃疡性结肠炎中的生物标志物作用 | 研究主要依赖于公共数据库数据，样本来源可能有限；实验验证部分可能未涵盖所有已识别的生物标志物 | 探究中心体扩增相关基因在溃疡性结肠炎进展中的相关性并识别潜在生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者样本与对照样本 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫组织化学 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5693 | 2026-01-01 |
Macrophage activation of the TREM2-DAP12-SYK pathway shapes the adipose tissue microenvironment in obesity and unveils the therapeutic potential of natural compounds egcg and SMRR
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1694985
PMID:41459526
|
研究论文 | 本研究通过整合批量转录组学和单细胞RNA-seq数据，揭示了肥胖中脂肪组织微环境的巨噬细胞异质性，并发现TREM2-DAP12-SYK通路在肥胖相关巨噬细胞状态中的关键作用，同时评估了天然化合物EGCG和SMRR的治疗潜力 | 整合批量与单细胞转录组数据识别BMI相关基因模块和巨噬细胞调控程序，揭示TREM2-DAP12-SYK轴在肥胖相关巨噬细胞状态中的核心功能障碍，并首次评估天然化合物EGCG和SMRR通过重新激活该通路缓解肥胖的疗效 | 研究主要基于转录组数据，功能验证和机制细节需进一步实验确认，且动物模型结果向人类转化的有效性有待验证 | 阐明肥胖中脂肪组织免疫代谢失衡的关键驱动因素，并开发靶向干预策略 | 人类脂肪组织样本（批量转录组n=434，单细胞RNA-seq 24个样本）和高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型 | 数字病理学 | 肥胖 | 批量转录组学，单细胞RNA-seq | 细胞特异性网络，亚型特异性基因调控网络，伪时间轨迹分析，细胞间通讯分析，分子对接 | 转录组数据 | 批量转录组434个样本，单细胞RNA-seq 24个脂肪组织样本共194,608个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5694 | 2026-01-01 |
Deep learning-aided inter-species-comparison reveals shared and distinct molecular patterns in cynomolgus monkey and humans following non-specific T cell activation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1603716
PMID:41459534
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据和深度学习技术，比较了食蟹猴与人类在非特异性T细胞激活后的免疫反应分子模式 | 开发了一个整合变分自编码器、细胞间通讯、差异基因表达和通路富集分析的跨物种时间序列分析计算框架 | 仅使用了两个生物学重复，样本量较小；研究仅关注了PBMCs，未涉及组织特异性免疫反应 | 比较食蟹猴与人类在免疫激活后的共享和差异分子特征，以改进临床前动物模型向人类条件的转化 | 食蟹猴和健康人类的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 单细胞转录组数据 | 两个物种各两个生物学重复，在基线、刺激后0小时、6小时和24小时四个时间点采样 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5695 | 2026-01-01 |
Construction of a prognostic model for colorectal cancer liver metastasis based on single-cell transcriptomics and regulation of the MIF pathway
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1588514
PMID:41127012
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组学数据，构建了结直肠癌肝转移的预后模型，并探讨了MIF通路在转移过程中的调控作用 | 结合单细胞转录组学与批量RNA-seq数据，识别了结直肠癌肝转移过程中上皮细胞的关键基因表达变化，并构建了一个新的预后风险模型 | 研究数据主要来源于公共数据库（GEO和TCGA），需要进一步的独立队列和实验验证来确认模型的普适性 | 构建结直肠癌肝转移的预后模型并阐明MIF通路在转移中的作用机制 | 结直肠癌患者样本（含肝转移） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 预后风险模型 | 转录组数据 | 来自GEO和TCGA数据库的结直肠癌样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5696 | 2026-01-01 |
Correction: Construction of a prognostic model for colorectal cancer liver metastasis based on single-cell transcriptomics and regulation of the MIF pathway
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1731870
PMID:41473439
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correction | 本文是对一篇关于基于单细胞转录组学构建结直肠癌肝转移预后模型及调控MIF通路研究的文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | 结直肠癌肝转移 | 单细胞转录组学 | 预后模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5697 | 2026-01-01 |
Longitudinal multi-functional analysis identified responses of T cells, B cells, and monocytes as hallmarks of immunotherapy tolerance in patients with merkel cell carcinoma
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0293922
PMID:37983224
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了默克尔细胞癌患者外周血中免疫细胞的动态变化，揭示了免疫治疗耐受的机制 | 采用纵向多组学方法，结合单细胞RNA测序和批量RNA数据验证，识别了T细胞耗竭、B细胞失调和单细胞亚群变化作为免疫逃逸的关键标志 | 样本量较小（仅基于四名患者的时间点数据），且主要依赖外周血分析，可能未完全反映肿瘤微环境的变化 | 探究默克尔细胞癌患者免疫治疗耐受的细胞机制和免疫逃逸条件 | 默克尔细胞癌患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌（默克尔细胞癌） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四名患者的外周血样本，采集自四个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5698 | 2026-01-01 |
High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria
2021-01-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03408
PMID:33301291
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研究论文 | 本文介绍了一种基于纳米液滴散射光的高通量、无标记细菌检测方法，适用于革兰氏阳性和阴性细菌 | 开发了无需基因修饰或化学标记的高通量无标记细菌检测技术，利用纳米液滴散射光测量实现细菌增殖的可靠检测 | 未在摘要中明确说明具体局限性 | 开发适用于临床、研究和工业领域多种细菌菌株的高通量微液滴分析技术 | 未修饰的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 | 微生物分析技术 | NA | 液滴微流控技术、散射光测量 | NA | 光学信号数据（散射光、荧光） | NA | NA | 液滴微流控 | NA | 纳米液滴封装系统 |
| 5699 | 2025-12-31 |
Breaking barriers: epithelial-mesenchymal transition role in melanoma invasion and resistance
2026-Feb-01, Melanoma research
IF:1.5Q4
DOI:10.1097/CMR.0000000000001068
PMID:41222312
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综述 | 本综述探讨了上皮-间质转化（EMT）在黑色素瘤侵袭和耐药中的核心作用 | 详细阐述了EMT在黑色素瘤中的分子机制，包括转录因子、信号通路、表观遗传和非编码RNA调控，并强调了EMT与肿瘤微环境的相互作用及作为预后生物标志物的潜力 | 存在EMT异质性和临床前模型不足的局限性 | 阐明EMT在黑色素瘤进展、转移和耐药中的角色，以推动治疗策略发展 | 黑色素瘤细胞及其EMT过程 | NA | 黑色素瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞分析, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5700 | 2025-12-31 |
Revealing Inhibition of Gastric Cancer Occurrence and Metastasis by GPX3 Through Single-Cell Transcriptomics and Organoid Multimodal Technologies
2026-Jan, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70057
PMID:41118587
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合类器官多模态技术，揭示了GPX3在抑制胃癌发生和转移中的作用 | 首次结合单细胞转录组分析和类器官模型，系统性地揭示了GPX3作为胃癌转移的潜在抑制因子及其在体内外实验中的功能验证 | 样本量相对较小（3个原发肿瘤、1个癌旁组织、6个转移样本），且主要基于公共数据集GSE163558进行分析 | 阐明驱动胃癌转移的关键因子，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 胃癌细胞、患者来源的胃癌类器官、裸鼠肝转移模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10个样本（3个原发GC、1个癌旁、6个GC转移样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |