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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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5661 | 2025-10-06 |
CACIMAR: cross-species analysis of cell identities, markers, regulations, and interactions using single-cell RNA sequencing data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae283
PMID:38856169
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研究论文 | 开发了名为CACIMAR的工具,用于跨物种分析单细胞RNA测序数据中的细胞身份、标记基因、调控网络和细胞间相互作用 | 基于保守特征的加权和模型开发了多种保守性评分,能够同时分析细胞类型、调控网络和细胞间相互作用的保守性 | NA | 开发跨物种单细胞RNA测序数据分析工具,揭示细胞和分子层面的进化保守性 | 小鼠、斑马鱼和鸡的视网膜再生单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权和模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5662 | 2025-10-06 |
Microglial polarization pathways and therapeutic drugs targeting activated microglia in traumatic brain injury
2026-01-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00810
PMID:39665832
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综述 | 本文综述了创伤性脑损伤中小胶质细胞的极化通路及靶向活化小胶质细胞的治疗药物 | 系统阐明TLR4/NF-κB、MAPK、JAK/STAT、PI3K/Akt、Notch和HMGB1等小胶质细胞极化通路,并综述基于这些通路的药物和细胞替代治疗新策略 | 药物和间充质干细胞治疗策略仍存在诸多挑战需要解决 | 探讨创伤性脑损伤中小胶质细胞的极化机制及靶向治疗策略 | 小胶质细胞及其在创伤性脑损伤中的极化过程 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5663 | 2025-10-06 |
Changes in border-associated macrophages after stroke: Single-cell sequencing analysis
2026-01-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01092
PMID:39927762
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研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示脑卒中后边界相关巨噬细胞的动态变化及其在神经炎症中的作用 | 首次对脑卒中后边界相关巨噬细胞进行全面的单细胞转录组分析,发现Stat3信号通路激活并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据库数据,人类样本验证不足 | 探究脑卒中后边界相关巨噬细胞的转录变化及其在神经炎症中的作用机制 | 小鼠边界相关巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | pySCENIC, CellChat | 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的两个数据集(GSE174574和GSE225948) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
5664 | 2025-10-06 |
Progress in single-cell sequencing of retinal vein occlusion or ischemic hypoxic retinopathy
2025-Aug, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110436
PMID:40414336
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变研究中的最新进展 | 整合了单核RNA测序、空间转录组学和多组学方法,增强对视网膜反应的空间和时间图谱绘制 | 样本保存、视网膜细胞类型注释和跨物种翻译等挑战尚未完全解决 | 探讨单细胞测序技术在视网膜血管疾病研究中的应用进展 | 视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变 | 数字病理学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
5665 | 2025-10-06 |
Targeting SPP1+ macrophages via the SPP1-CD44 axis reveals a key mechanism of immune suppression and tumor progression in ovarian cancer
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114906
PMID:40446696
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析发现SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴驱动卵巢癌免疫抑制和T细胞耗竭 | 首次识别SPP1+TAM亚群在卵巢癌中的关键作用,揭示SPP1-CD44轴是免疫抑制的主要介质,并发现尼洛替尼作为潜在SPP1抑制剂 | 研究主要基于单细胞测序数据分析,需要更多临床验证 | 探究卵巢癌肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞介导免疫抑制的分子机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本和Jurkat细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞测序,分子对接,分子动力学模拟,功能验证实验 | NA | 单细胞测序数据,实验数据 | 六个HGSOC单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5666 | 2025-10-06 |
Mefunidone treats pulmonary fibrosis by targeting SDH to regulate fibro-promoting macrophages
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114971
PMID:40449267
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研究论文 | 本研究揭示美氟尼酮通过靶向琥珀酸脱氢酶调控促纤维化巨噬细胞表型治疗肺纤维化的新机制 | 首次发现美氟尼酮通过结合并抑制SDH活性减少琥珀酸生成,进而抑制MMP12+CCL2+促纤维化巨噬细胞转化 | 研究主要基于博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型,临床转化价值需进一步验证 | 阐明美氟尼酮治疗肺纤维化的分子靶点及作用机制 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型及巨噬细胞 | 单细胞测序 | 肺纤维化 | 单细胞测序,组织病理学检查,体外验证 | 动物疾病模型 | 单细胞测序数据,组织病理图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5667 | 2025-10-06 |
Multi-omics identifies OSM-OSMR as a key receptor-ligand in the tumor environment of endometrial adenocarcinoma
2025-Jul-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114933
PMID:40450916
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现OSM-OSMR是子宫内膜腺癌肿瘤微环境中的关键受体-配体对,并构建了七基因预后模型 | 首次系统识别OSM-OSMR在子宫内膜腺癌中的关键作用,并建立基于随机生存森林的七基因预后特征模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索肿瘤细胞与其他细胞间的配体-受体关系并构建预后模型 | 子宫内膜腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 子宫内膜腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,批量RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据,临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
5668 | 2025-10-06 |
Phillyrin for sepsis-related acute lung injury: A potential strategy suppressing GSK-3β
2025-Jul, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.04.017
PMID:40359720
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研究论文 | 本研究探讨连翘酯苷通过抑制GSK-3β信号通路缓解脓毒症相关急性肺损伤的机制 | 首次通过多组学分析发现连翘酯苷与GSK-3β的稳定结合,并系统阐明其通过调控巨噬细胞极化改善急性肺损伤的作用机制 | 机制研究主要聚焦于GSK-3β信号通路,可能存在其他未被发现的调控途径 | 阐明连翘酯苷治疗脓毒症相关急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征的分子机制 | 巨噬细胞、斑马鱼、小鼠模型 | 分子药理学 | 急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征 | 分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化分析、单细胞测序、体内外实验验证 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、分子模拟数据 | 从公共数据库筛选8331个ALI/ARDS相关靶基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5669 | 2025-10-06 |
The glia-immune network: Astrocytes and oligodendrocytes as microglial co-ordinators in health and disease
2025-Jun-10, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287015
PMID:40492604
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综述 | 探讨星形胶质细胞和少突胶质细胞作为小胶质细胞协调者在中枢神经系统免疫网络中的作用 | 提出胶质细胞特异性免疫样网络概念,强调大胶质细胞在中枢神经系统免疫信号传导中的主动协调作用 | NA | 阐明大胶质细胞来源的免疫信号传导及其在健康和疾病中的相关性 | 中枢神经系统胶质细胞(小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞) | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5670 | 2025-10-06 |
Tumor microenvironment heterogeneity and progression mechanisms in intrahepatic cholangiocarcinoma: A study based on single-cell and spatial transcriptomic sequencing
2025-Jun-09, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001423
PMID:40489753
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研究论文 | 基于单细胞和空间转录组测序研究肝内胆管癌肿瘤微环境异质性及进展机制 | 首次通过单细胞和空间转录组技术系统解析ICC肿瘤微环境异质性,发现ASPH作为侵袭亚型标志物及MHC-II介导的免疫逃逸新机制 | 样本量有限(单细胞测序12例,空间转录组4例),需更大队列验证 | 探究肝内胆管癌肿瘤微环境异质性及肿瘤进展机制 | 肝内胆管癌患者肿瘤组织、类器官和小鼠模型 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, RNA-seq, 多重免疫荧光 | 类器官模型, 小鼠模型 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, RNA-seq数据, 图像数据 | 训练队列:12例初治ICC样本(单细胞测序)+4例ICC样本(空间转录组);验证队列:87例ICC肿瘤样本(RNA-seq) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
5671 | 2025-10-06 |
KRT5high TP63-expressing urothelial basal cells act as a driver to bladder urothelium regeneration in rabbit
2025-Jun-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04417-z
PMID:40483513
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定KRT5high TP63表达基底细胞作为膀胱尿路上皮再生的驱动细胞,并开发了基于胶囊血管床的膀胱组织工程策略 | 首次在兔模型中证实KRT5high TP63表达基底细胞具有干细胞特性,能够分化为中间层和表层伞状细胞,并建立了基于胶囊血管床的尿路上皮组织工程新方法 | 研究仅在兔模型中进行,尚未在更高等动物或人体验证;样本量未明确说明 | 探索膀胱尿路上皮再生的细胞机制并开发组织工程修复策略 | 兔膀胱尿路上皮基底细胞 | 组织工程 | 膀胱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5672 | 2025-10-06 |
Heterogeneous characteristics of γδ T cells in peripheral blood of diffuse large B-cell lymphoma
2025-Jun-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00795-x
PMID:40483533
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者外周血中γδ T细胞的异质性特征及其与预后的关联 | 首次在DLBCL患者外周血中系统鉴定出6个功能各异的γδ T细胞亚群,并发现TIGIT+ γδ T细胞亚群与不良预后显著相关 | 样本量较小(6例患者和3例健康个体),需要在更大队列中验证研究结果 | 阐明DLBCL患者外周血中γδ T细胞的异质性及其临床相关性 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和健康个体的外周血样本 | 单细胞基因组学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 共识聚类, 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 9个血液样本(6例DLBCL患者和3例健康个体) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5673 | 2025-10-06 |
Cholangiocytes contribute to hepatocyte regeneration after partial liver injury during growth spurt in zebrafish
2025-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60334-y
PMID:40480975
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研究论文 | 本研究通过建立斑马鱼部分肝损伤模型,揭示了在快速生长期胆管细胞通过转分化为肝细胞参与肝脏再生的机制 | 首次在快速生长期动物模型中证明胆管细胞是新生肝细胞的主要来源,并发现mTORC1信号通路调控胆管细胞可塑性 | 研究仅限于斑马鱼模型,尚未在哺乳动物中验证 | 探究快速生长期肝脏再生的细胞来源和分子机制 | 斑马鱼肝脏 | 发育生物学 | 肝损伤 | 单细胞转录组测序,谱系追踪,基因组编辑 | NA | 基因表达数据,谱系追踪数据 | 斑马鱼部分肝损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5674 | 2025-10-06 |
RAN potentiates nuclear export of phosphorylated AMPK, reshaping lipid metabolism and impairing immune efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Jun-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00977-8
PMID:40481101
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研究论文 | 本研究探讨RAN通过调节磷酸化AMPK核输出影响脂质代谢,从而削弱肺腺癌免疫治疗效果的机制 | 首次揭示RAN通过调控p-AMPK核输出重塑脂质代谢并影响免疫治疗效果的分子机制 | 样本量较小(n=15),需要更大规模研究验证 | 探索肺腺癌免疫治疗反应差异的代谢机制 | 肺腺癌患者和细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5675 | 2025-10-06 |
Identification of immune-associated genes and single-cell sequencing analysis in diagnosing Behçet's disease
2025-Jun-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05086-x
PMID:40481130
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研究论文 | 通过批量测序和单细胞测序分析白塞病的免疫景观并鉴定新的诊断生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下探索单核细胞在白塞病发生发展中的作用,并通过机器学习筛选出5个新的潜在诊断标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据,实验验证仅限于小鼠模型 | 识别白塞病的免疫相关基因并开发诊断方法 | 白塞病患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 白塞病 | 批量测序,单细胞测序,qRT-PCR | LASSO | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的白塞病数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
5676 | 2025-10-06 |
BNT162b2 COVID-19 vaccination elicits the expansion of CD16+CD8+ T cells endowed with natural killer cell features
2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.024
PMID:39894227
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研究论文 | 本研究揭示了BNT162b2 mRNA疫苗接种可诱导具有自然杀伤细胞特征的CD16+CD8+ T细胞扩增 | 首次发现mRNA疫苗能诱导产生兼具适应性免疫和天然免疫特征的CD16+CD8+ T细胞亚群 | 样本量较小(30名健康个体),未评估长期免疫持久性 | 表征BNT162b2 mRNA疫苗接种后出现的非常规T细胞亚群 | 接受两剂BNT162b2 mRNA疫苗的健康人类个体 | 免疫学 | COVID-19 | 多参数流式细胞术,单细胞转录组分析 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据 | 30名健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5677 | 2025-10-06 |
Kinesin family member 4 a drives Cancer stem cell characteristics in breast Cancer: Insights from scRNA-Seq and experimental validation
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144308
PMID:40383330
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据识别乳腺癌癌症干细胞标志基因,并验证KIF4A在癌症干细胞特性中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合实验验证揭示KIF4A是乳腺癌癌症干细胞特性的关键调控因子 | 研究主要基于公共数据集和有限实验验证,需要进一步临床样本验证 | 识别乳腺癌癌症干细胞标志基因并验证其功能 | 乳腺癌细胞系和裸鼠模型 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | GSE180286单细胞数据集和TCGA乳腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
5678 | 2025-10-06 |
Integrative genome-wide association studies, proteome-wide Mendelian randomization, and single-cell RNA sequencing identify interleukin-6 receptor protein as a therapeutic target in aortic aneurysm
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144380
PMID:40409638
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研究论文 | 本研究通过整合基因组关联研究、蛋白质组孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别白细胞介素-6受体蛋白作为主动脉瘤的潜在治疗靶点 | 首次将GWAS、PW-MR和单细胞RNA测序整合应用于主动脉瘤研究,发现IL6R在疾病机制中的关键作用 | 靶向IL6R的药物可能存在副作用需要进一步评估 | 识别主动脉瘤的新生物标志物和治疗靶点 | 主动脉瘤患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 心血管疾病 | GWAS, PW-MR, 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型, 多性状共定位分析 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 8125例AA患者和381,977例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
5679 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals an anti-tumor neutrophil subgroup in microwave thermochemotherapy-treated lip cancer
2025-05-13, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-025-00366-8
PMID:40360503
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示微波热化疗治疗唇癌中抗肿瘤中性粒细胞亚群的作用机制 | 首次发现微波热化疗通过增强血液灌注诱导抗肿瘤中性粒细胞(N1-TANs)浸润,并鉴定MX2作为N1-TANs标志物,开发了基于H&E图像的深度学习预测模型 | 研究样本量有限,机制验证主要基于转录组数据,需要进一步实验验证 | 探究微波热化疗治疗唇鳞状细胞癌的免疫调节机制 | 唇鳞状细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞和肿瘤微环境 | 数字病理 | 唇癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, H&E染色图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
5680 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing systematically analyzed the mechanism of Emdogain on the restoration of delayed replantation periodontal membrane
2025-04-17, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00345-5
PMID:40246878
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序系统分析Emdogain在延迟再植牙周膜修复中的作用机制 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示EMD通过调控Vtn+成纤维细胞、促进骨生成和血管生成通路的作用机制 | 研究仅基于大鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究Emdogain促进延迟再植牙周膜修复的细胞和分子机制 | 大鼠延迟牙齿再植模型 | 单细胞测序 | 牙周病 | 单细胞RNA测序,micro-CT,HE染色,TRAP染色,免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,影像数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |